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• 林奈的“双名法” Binomial nomenclature • 三名法 • 学名的其他知识
一个微生物学工作者必须牢记常用常见的微生物学名
微生物的命名原则
• 规定与常识:
• 属名应大写首字母、单数、通常是拉丁字的名词,用来描述微生物的主要特 征,如形态、生理特征等
• 种的加词代表一个种的次要特征,首字小写,是拉丁字的形容词,来补充说明 微生物的次要特征,如颜色、形状、用途
• 缩写:B. subtilis 或 Bac. Subtilis
• Bacillus sp. 表示尚未定种名的芽孢杆菌(芽孢杆菌的某一种) Bacillus spp.表示一批尚未定名的芽孢杆菌(若干芽孢杆菌)
• 菌株 (品系)表示由一个独立的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一 切后代
• Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶) • B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶)
• 亚种(subspecies,简称“subsp.”,排成正体字)
• 变种(variety,简称“var.”,排成正体字)
• Candida lipolytica (Harrison) Diddens et lodder Var.,lipolytica 母解脂变种
表示解脂假丝酵
新种的命名
• 新种: • 在实际工作中获得并鉴定了一个新种(sp.nov.或nov.sp.,是species nova 的缩写) • 按照法则命名发表时,应在其学名后附上“sp.nov.”符号,排成正体字。
2.学名=属名+种名+菌株(用字母、符号等字形表示)
• 表示菌株的符号:
• 随意的或研究机构的名称缩写;
• 如“BF”为“北纺”,即北京纺织工业局科学研究所 • Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶) • B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶)
• 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出的。
• 所有生物存在一个共同祖先,由它分三条进化路线,就形成了三个原界: • 古细菌原界(Archae bacteria),包括产甲烷细菌、极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌; • 真细菌原界(Eubacteria),包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物; • 真核生物原界(Eucaryotes),包括原生生物、真菌、动物和植物。
第二节 微生物在自然界的地位
• 生物的界级分类学说:是在认识发展过程中存在的对生物分类的不 同阶段的不同观点。
• 二界→ 三界→四界→五界→六界→三原界
(1753) (1860) (1956) (1969) (1949) (1978)
• 五界系统包括动物界、植物界、原生生物界(原生动物、单细胞藻 类、粘菌)、真菌界以及原核生物界。
• 谷氨酸发酵新菌种 • Corynebacterium pekinense sp.nov.AS1.299 (北京棒杆菌AS1.299,新种) • C.crenatum sp.nov.AS1.542(钝齿棒杆菌AS1.542,新种)
• 新种发表前,模式菌株的培养物就应存放在一个永久性的菌种保藏机构,并允许人 们从中获得该菌种。
• 1.学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人和鲜明定名年份
• 大肠埃希氏菌
Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919
• 两歧双歧杆菌
Bifidobacterium bifidum (Tissier)Orla-Jensen 1924
• 提出了内共生学说,主要是Margulis的贡献
三原界系统示意图
第三节 各大类微生物的分类系统纲要
• 一、原核微生物分类系统纲要
• 伯杰氏手册
• 二、真菌分类系统纲要
亚种/变种的命名——“三名法”
学名=属名 + 种名 + subsp.或var. + 亚种(或变种)的加词
排成斜体 排成正体,但可省略 排成斜体
• Saccharomyces cerevisiae Hansen ellipsoideus (Hansen) Dekker
• 汉斯酿酒酵母的椭圆形变种,原来由Hansen定名,后来Dekker将其划为椭圆变种
• 菌种保藏机构的缩写
• 如“AS”为Academia Sinica(中国科学院),“ATCC”即American Type Culture Collection(美国模式菌种保藏中心)
双名法的实例
3.学名=属名+sp.(或spp.)
• 只鉴定到属名,对具体的种不能肯定
• 枯草芽孢杆菌 Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872
• 六界系统在五界系统的基础上增加一个病毒界。
R.H.Whittaker的五界系统示意图
原生生物界 原核Байду номын сангаас物界
六界系统表解
原生动物、单细胞藻类、粘菌
细菌(真细菌和古生菌)、放线菌、蓝细菌、支 原体、立克次氏体、衣原体
真菌界 植物界 动物界 病毒界
酵母菌、霉菌、蕈菌 病毒、亚病毒(类病毒、拟病毒、朊病毒)
江南大学微生物学综合PPT10
第一节 通用分类单元
• 一、种以上的系统分类单元 • 二、学名 • 三、几个概念
二、微生物的学名
• 俗名(Common name,Vernacular name)
• 结核杆菌 • 红色面包霉 • 绿脓杆菌 • 学名(Scientific Name) • 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis) • 粗糙脉胞菌(Neurospora crassa) • 铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa)
• 学名:为了便于交流和避免混淆,根据一个统一的命名法则,给每种微 生物取一个为大家公认的科学用名。
微生物的命名原则
• 学名(Scientific Name, Scientific nomenclature ) 菌种的科学名称,是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认, 并通用的名称。
• 由拉丁词或拉丁化的词组成菌种的学名
一个微生物学工作者必须牢记常用常见的微生物学名
微生物的命名原则
• 规定与常识:
• 属名应大写首字母、单数、通常是拉丁字的名词,用来描述微生物的主要特 征,如形态、生理特征等
• 种的加词代表一个种的次要特征,首字小写,是拉丁字的形容词,来补充说明 微生物的次要特征,如颜色、形状、用途
• 缩写:B. subtilis 或 Bac. Subtilis
• Bacillus sp. 表示尚未定种名的芽孢杆菌(芽孢杆菌的某一种) Bacillus spp.表示一批尚未定名的芽孢杆菌(若干芽孢杆菌)
• 菌株 (品系)表示由一个独立的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一 切后代
• Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶) • B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶)
• 亚种(subspecies,简称“subsp.”,排成正体字)
• 变种(variety,简称“var.”,排成正体字)
• Candida lipolytica (Harrison) Diddens et lodder Var.,lipolytica 母解脂变种
表示解脂假丝酵
新种的命名
• 新种: • 在实际工作中获得并鉴定了一个新种(sp.nov.或nov.sp.,是species nova 的缩写) • 按照法则命名发表时,应在其学名后附上“sp.nov.”符号,排成正体字。
2.学名=属名+种名+菌株(用字母、符号等字形表示)
• 表示菌株的符号:
• 随意的或研究机构的名称缩写;
• 如“BF”为“北纺”,即北京纺织工业局科学研究所 • Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶) • B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶)
• 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出的。
• 所有生物存在一个共同祖先,由它分三条进化路线,就形成了三个原界: • 古细菌原界(Archae bacteria),包括产甲烷细菌、极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌; • 真细菌原界(Eubacteria),包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物; • 真核生物原界(Eucaryotes),包括原生生物、真菌、动物和植物。
第二节 微生物在自然界的地位
• 生物的界级分类学说:是在认识发展过程中存在的对生物分类的不 同阶段的不同观点。
• 二界→ 三界→四界→五界→六界→三原界
(1753) (1860) (1956) (1969) (1949) (1978)
• 五界系统包括动物界、植物界、原生生物界(原生动物、单细胞藻 类、粘菌)、真菌界以及原核生物界。
• 谷氨酸发酵新菌种 • Corynebacterium pekinense sp.nov.AS1.299 (北京棒杆菌AS1.299,新种) • C.crenatum sp.nov.AS1.542(钝齿棒杆菌AS1.542,新种)
• 新种发表前,模式菌株的培养物就应存放在一个永久性的菌种保藏机构,并允许人 们从中获得该菌种。
• 1.学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人和鲜明定名年份
• 大肠埃希氏菌
Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919
• 两歧双歧杆菌
Bifidobacterium bifidum (Tissier)Orla-Jensen 1924
• 提出了内共生学说,主要是Margulis的贡献
三原界系统示意图
第三节 各大类微生物的分类系统纲要
• 一、原核微生物分类系统纲要
• 伯杰氏手册
• 二、真菌分类系统纲要
亚种/变种的命名——“三名法”
学名=属名 + 种名 + subsp.或var. + 亚种(或变种)的加词
排成斜体 排成正体,但可省略 排成斜体
• Saccharomyces cerevisiae Hansen ellipsoideus (Hansen) Dekker
• 汉斯酿酒酵母的椭圆形变种,原来由Hansen定名,后来Dekker将其划为椭圆变种
• 菌种保藏机构的缩写
• 如“AS”为Academia Sinica(中国科学院),“ATCC”即American Type Culture Collection(美国模式菌种保藏中心)
双名法的实例
3.学名=属名+sp.(或spp.)
• 只鉴定到属名,对具体的种不能肯定
• 枯草芽孢杆菌 Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872
• 六界系统在五界系统的基础上增加一个病毒界。
R.H.Whittaker的五界系统示意图
原生生物界 原核Байду номын сангаас物界
六界系统表解
原生动物、单细胞藻类、粘菌
细菌(真细菌和古生菌)、放线菌、蓝细菌、支 原体、立克次氏体、衣原体
真菌界 植物界 动物界 病毒界
酵母菌、霉菌、蕈菌 病毒、亚病毒(类病毒、拟病毒、朊病毒)
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第一节 通用分类单元
• 一、种以上的系统分类单元 • 二、学名 • 三、几个概念
二、微生物的学名
• 俗名(Common name,Vernacular name)
• 结核杆菌 • 红色面包霉 • 绿脓杆菌 • 学名(Scientific Name) • 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis) • 粗糙脉胞菌(Neurospora crassa) • 铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa)
• 学名:为了便于交流和避免混淆,根据一个统一的命名法则,给每种微 生物取一个为大家公认的科学用名。
微生物的命名原则
• 学名(Scientific Name, Scientific nomenclature ) 菌种的科学名称,是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认, 并通用的名称。
• 由拉丁词或拉丁化的词组成菌种的学名