第四章数量性状的遗传
遗传学数量性状的遗传分析
遗传学数量性状的遗传分析
目录
• 引言 • 数量性状遗传基础 • 数量性状遗传分析方法 • 数量性状基因定位 • 数量性状基因组关联分析 • 数量性状基因组编辑与优化
01
引言
研究背景
01
遗传学数量性状是生物体表型特 征中受多个基因和环境因素共同 影响的性状,如身高、体重等。
02
随着分子生物学和基因组学的发 展,遗传学数量性状的遗传分析 已成为遗传学研究的重要领域。
关联分析的软件工具
01
Plink
一款常用的关联分析软件,提供 多种统计分析和可视化工具,用 于处理和分析大规模遗传数据。
02
03
GAPIT
Tassel
基于R语言的关联分析工具包, 提供了丰富的统计方法和可视化 功能,适用于复杂数据分析。
主要用于基因组关联分析的软件, 支持多种数据格式和多种统计模 型,可进行大规模数据分析。
QTL定位的软件工具
QTL Cartographer
基于区间作图法的QTL定位软件,适用于大样本数据 集。
Tassel
综合关联分析和区间作图法的QTL定位软件,具有强 大的数据处理和分析能力。
R/qtl
基于R语言的QTL定位软件,提供了多种统计模型和 可视化工具。
05
数量性状基因组关联分析
关联分析的基本原理
广义遗传力
广义遗传力用于描述数量性状在遗传和环境变异中的贡献,计算公式为加性方差和显性方差占表型方差的比值。
狭义遗传力
狭义遗传力仅考虑基因型对表型变异的贡献,计算公式为加性方差占表型方差的比值。
遗传相关分析
遗传相关系数
用于描述两个数量性状之间的遗传关系,计算公式为两个数量性状的加性方差和显性方差之间的比值 。
第四章数量性状遗传
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吉林农业科技学院 吉林农业科技学院
08 中草药栽培技术 《药用植物遗传育种》 电子教案 药用植物遗传育种》 遗传育种
第5讲
授课日期: 授课日期: 2010 年 月 日 节课 授课题目: 授课题目:第四章 数量性状遗传 教学目的:掌握数量性状的基本概念及其特征,了解数量性状与质量性状的区别,熟悉 教学目的:掌握数量性状的基本概念及其特征,了解数量性状与质量性状的区别, 数量性状的遗传力及其估算。 数量性状的遗传力及其估算。 教学重点: 教学重点:数量性状的遗传力及其应用 教学难点: 教学难点:微效多基因假说。 教 学 进 程 复习提问: 复习提问: 1、连锁遗传? 2、交换值?连锁遗传的机理? 导言: 导言: 新课内容: 新课内容: 第四章 数量性状遗传 一、数量性状与质量性状的概念 1、质量性状 2、数量性状 二、数量性状的特征 1、数量性状可以度量 2、数量性状呈现连续性变异 3、数量性状表现容易受环境的影响 4、数量性状受多基因控制 三、数量性状遗传的基本原理:微效多基因假说 1、决定数量性状的基因数目很多 2、各个基因效应相等 3、等位基因的表现为不完全显性或共显性 4、各基因的作用是累加的 5、数量性状遗传方式仍然服从孟德尔规律 四、数量性状研究的基本统计方法 1、平均数 x x=∑ n 2 2、方差( s 或V ) s2 =
( ∑ x − x) / n − 1
2
教学方 教学方 法及时 间分配 5 多媒体 授 课
讲授 15
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15 20 15
五、群体变异 包括表现型变异、遗传变异、表现型变异。用方差表示。 VP=VG+VE 六、遗传力的估算 (一)遗传力
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数量性状的遗传
例2:上例中A1A1A2A2按加性效应应是80cm,但实 际总效应可能是90cm
数量性状基因座(QTL)
对数量性状有较大影响的基因座称为数量性状基因座 (quantitative trait locus,QTL),它是影响数 量性状的一个染色体片段,而不一定是一个单基因座。
三、通径系数理论
通径系数就是标准化的偏回归系数 。 通径系数的主要优点是能够借图解之助简明地阐明各变量 之间的关系。
(三) 学习数量性状的方法
①统计学思想贯穿数量性状遗传的全部内容; ②确定性与不确定性的矛盾时时体现; ③研究对象在个体与群体间的相互转换; ④遗传与变异的矛盾。
二、数量性状的遗传基础
亲代 极高个体 AABB 中等身高 AA’BB’ 极矮个体 A’A’B’B’
子1代 子2代
AB AB AB’ A’B AABB AABB’ AA’BB
一、数量性状的一般特征 (一)区分性状的依据: 性状是描述性的,还是可以度量的; 性状是呈间断性分布,还是连续性分布; 性状的表现是否容易受到环境的影响; 控制性状的遗传基础是单基因还是多基因。
(二)数量性状的特点: ①数量性状是可以度量的; ②数量性状呈连续性变异; ③数量性状的表现容易受到环境的影响; ④控制数量性状的遗传基础是多基因系统。
数量性状的遗传基础 数量性状的遗传力 数量性状的重复率 数量性状的遗传相关
1.什么是基因突变哪些类型?说明理由?
生物的性状基本上可分为两大类: 质量性状(qualitative trait):变异可以截然区 分为几种明显不同的类型,一般用语言来描述; 数量性状(quantitative trait):个体间性状表 现的差异只能用数量来区别,变异是连续的。
第四章 数量性状遗传
第五章数量性状§1 数量性状的特征一、数量性状的特征:遗传性状分为质量性状和数量性状两类。
质量性状:在可以遗传的性状中,性状在后代的变异中是表现为不连续的变异,在它们之间可以明显的分组,进行频率的统计。
是由一对或少数n对基因所控制的遗传方式一般能符合孟德尔的遗传原则。
例如前几章所讲的豌豆的红花和白花,豆粒的黄色和绿色,家鸡的羽毛的黑白、芦花等,都是彼此差别明显,一般没有中间过渡的类型的性状。
数量性状:性状的变异是呈现连续性的,性状间的变化没有明显的类别,不易分组,是由微效的多基因控制的。
例如:产量,荚的多少、粒的大小,蛋白、脂肪的含量等。
数量性状的特点:1.性状的变化表现为连续的,不易分组进行组内的频率统计。
例如:水和小麦、玉米等植株的高矮。
生育期的长短,产量的高低等性状。
不同品种杂交后F2、F3等后代群体都有广泛的变异的类型,不能明显的求出分离的比例,只能用一定的度量单位进行测量。
2.数量性状极易受环境的影响而发生混淆,使遗传的动态和性质模糊不清。
二、数量性状在遗传中的特点:而数量性状在遗传中的特点又是怎样呢?我们以玉米果穗不同长度的品种的杂交及后代的分布频率来说明此题:P2页表从上面这个典型的数量性状遗传的例子中,可以看出数量性状遗传的主要的特点:1.某一数量性状在杂交中,F1的平均值大约介于两个亲本的平均数之间,呈中间型,但有时倾向于其中的一个亲本。
2.F2个体的平均数与F1的平均数相似。
3.F2出现明显的连续性变异,不容易分组,因而也就不能求出不同组之间的比例,变异的幅度比较大,变异基本上是以平均数为中心的对称的正态分布曲线,即常态分布。
100cm(A1A1A2A2a3a3) × 70cm(a1a1a2a2A3A3)↓F1 A1a1A2a2A3a3 (85cm)↓F2 A1A1A2A2A3A3(130cm):a1a1a2a2a3a3(40cm)4.F2会出现超出双亲的变异的类型:<当双亲不是极端类型时>100天 A×B 80天↓F1 90天→F2:75~110天值得说明的是:数量性状和质量性状之间的划分不是绝对的,同一性状在不同亲本的杂交组合中可以表现不同。
数量性状的遗传
第四章数量性状的遗传目的要求掌握数量性状与质量性状的区分、特征,多基因假说的要点,数量性状表现值的分解,遗传力的概念;了解通径系数概念与意义,基因的非加性效应与加性效应的意义,遗传力公式的推导及计算方法;掌握遗传力的应用。
第一节数量性状的遗传基础生物的性状基本上可分为两大类:质量性状(qualitative trait):变异可以截然区分为几种明显不同的类型,一般用语言来描述;数量性状(quantitative trait):个体间性状表现的差异只能用数量来区别,变异是连续的。
阈性状(threshold trait):表现型呈非连续变异,与质量性状类似,但不是由单基因决定,性状具有一个潜在的连续型变量分布,遗传基础是多基因控制的,与数量性状类似。
一、数量性状的一般特征数量性状的特点:①数量性状是可以度量的;②数量性状呈连续性变异;③数量性状的表现容易受到环境的影响;④控制数量性状的遗传基础是多基因系统。
学习数量性状的方法①统计学思想贯穿数量性状遗传的全部内容;②确定性与不确定性的矛盾时时体现;③研究对象在个体与群体间的相互转换;④遗传与变异的矛盾。
二、数量性状的遗传基础1.多基因假说瑞典遗传学家尼尔迩·埃尔(Nilsson-Ehle)通过对小麦籽粒颜色的遗传研究,提出了数量性状遗传的多基因假说。
多基因假说的要点(1)数量性状是由许多微效基因决定的,每个基因的作用的微效的;(2)基因的作用是相等的,且可以累加、呈现剂量效应,等位基因间通常无显隐关系;(3)基因在世代相传中服从孟德尔定律,即分离规律和自由组合规律,以及连锁交换规律2.基因的非加性效应基因的非加性效应包括显性效应和上位效应。
(1)显性效应由等位基因间相互作用产生的效应。
例1:有两对基因,A1、A2的效应各为20cm,a1、a2的效应名为10cm,基因型A1A1a2a2按加性效应计算其总效应为60cm 。
而在杂合状态下,即A 1a 1A 2a 2同样为两个A 和两个a ,其总效应可能是75cm(2)上位效应或互作效应 由非等位基因之间相互作用产生的效应。
遗传学_ 数量性状遗传_
个体的基因型
✓ 个体性状的表现型数值,称为表现型值,以P表示。 ✓ 表现型值有两部分组成:
一个是基因型所决定的数值,称为基因型值,以G表示; 一个是环境条件引起的变异,用E表示。 ✓ 表现型值、基因型值,和环境变异值三者之间的数量关 系可用以下公式表示:P=G+E
环境条件的影响
✓ 表型变异用表型方差(即总方差)VP表示; ✓ 遗传变异用遗传方差(即基因型方差)VG表示; ✓ 环境变异用环境方差VE表示。 ✓ 三者的数量关系可用下式表示:Vp=VG +VE
三、纯系学说
(三)纯系学说的发展
“ 纯系的纯是相对的、暂时的,绝对的纯系
是不存在的,纯系内继续选择可能是有效的。 纯系繁育过程中,由于突变、天然杂交和机械 混杂等因素必然会导致纯系不纯,产生新的遗 传变异,可能出现更优个体。
“
遗传率及估算方法
一、数量性状变异的表示方法
生物性状 表现的 决定因素
超矮秆表型是由于D18的突变导致。 该种突变体除株高显著降低后,其他 农艺性状与野生型无显著性差异。
小麦粒色简单划分,表现质量性状,单细致 观察,籽粒颜色红到白,表现连续变异,数量性 状的特点。
二 、数量性状的概念及遗传特点
(三)数量性状和质量性状的相对性
生物还有一些性状为阈性性状: 表型呈非连续变异,而其基本物质 的数量呈潜在的连续变异的性状, 即只有超越某一遗传阈值时才出现 的性状,如动植物甚至包括人类的 抗病力、死亡率以及单胎动物的产 仔数等性状。
3 数量性状对环境条件的变化反应敏感。
4 研究方法上,依靠群体,必须用统计方法,对在杂种和后代进行分析。
二 、数量性状的概念及遗传特点
(三)数量性状和质量性状的相对性
数量性状的遗传名词解释
数量性状的遗传名词解释数量性状,是指在自然界或人工条件下产生的各种特征以数量的方式表现出来的遗传性状。
它指的是通过对种群中大量个体进行测量或计量,将结果以数量化的形式呈现出来的遗传特征。
数量性状通常具有连续变异的特征,即在一个种群中存在着一系列不同的表现形式,而不是像离散性状那样只有几个确定的表型。
在数量性状的研究中,有一些重要的遗传名词需要加以解释。
其中包括基因型、表型、遗传方差、环境方差、遗传相关等。
基因型是指个体在基因水平上的遗传组成。
它决定了个体对特定数量性状的表现。
每个数量性状通常由多个基因共同决定,因此基因型的组合将决定这些基因在个体上的表现形式。
表型是指个体在外部表现上的特征。
它受到基因型和环境的共同影响。
数量性状的表型通常呈现连续性变化,这是因为数量性状通常受到多种基因的共同作用,以及环境因素的影响。
例如,人体身高就是一种典型的数量性状,它受到多基因的影响,同时还受到营养、运动等环境因素的调节。
遗传方差是指数量性状中由基因所引起的表型变异程度。
它可以通过研究个体间的表型差异以及表型与基因型之间的关系来估计。
遗传方差的大小反映了数量性状中遗传因素的重要程度。
如果遗传方差较大,说明遗传因素在数量性状的表达中起到了重要作用,反之则说明环境因素的贡献较大。
环境方差是指数量性状中由环境因素所引起的表型变异程度。
环境方差通常通过比较同一种群中不同个体之间的差异来估计。
环境方差的大小表示了环境对数量性状的影响程度。
如果环境方差较大,说明环境因素在数量性状的表达中起到了重要作用,反之则说明遗传因素的贡献较大。
遗传相关是指在同一种群中不同数量性状之间的遗传联系。
它反映了一种或多种数量性状随着基因型的变化而变化的程度。
通过研究数量性状之间的遗传相关,可以了解不同数量性状之间的遗传关系及其对进化和适应的影响。
例如,身高和体重之间的遗传相关可以帮助我们理解这两个数量性状在人类进化中是如何相互影响的。
以上介绍了数量性状的遗传名词解释,包括基因型、表型、遗传方差、环境方差和遗传相关等概念。
数量性状遗传
第四章 数量遗传 Chapter 4 Quantitative Inheritance
第一节 数量性状与多基因假说 第二节 数量性状遗传研究的基本统计方法 第三节 遗传参数的估算及其应用
第一节 数量性状与多基因假说
3:1 一对基因
在一对基因F 的红粒中:1/3与红粒亲本一致、2/3与 一致, 在一对基因F2的红粒中:1/3与红粒亲本一致、2/3与F1一致, 与红粒亲本一致 表现为不完全显性 不完全显性; 表现为不完全显性; 在二对、三对基因时:红色基因表现为重叠作用,但是R基因 在二对、三对基因时:红色基因表现为重叠作用 但是R 重叠作用, 同时表现累加效应 累加效应——F 红粒中表现为一系列颜色梯度, 同时表现累加效应——F2红粒中表现为一系列颜色梯度,每 增加一个R基因籽粒颜色更深一些。 增加一个R基因籽粒颜色更深一些。
Section 5.1 Quantitative Character & Multiple-factor Hypothesis
一、质量性状与数量性状 二、数量性状的遗传方式 三、影响数量性状分布的因素 四、多基因假说
一、质量性状与数量性状
(一)、质量性状的特征 (二)、数量性状的特征 (三)、两类性状划分的相对性 (四)、数量性状的重要性
二、数量性状的遗传方式
(一)、普通小麦籽粒色遗传
尼尔逊·埃尔(Nilson尼尔逊·埃尔(Nilson-Ehle, H. 1909) 种皮颜色:红色(R)、白色(r) 种皮颜色:红色(R)、白色(r)
(二)、玉米果穗长度遗传
(一)、普通小麦籽粒色的遗传
1. 籽粒色的遗传控制。 籽粒色的遗传控制。
动物遗传育种与繁殖---数量性状的遗传
在一个大群体中:固定环境值方差=0 随机环境偏差总和=0
即:P = G + E = A + D + I = A 表型方差 Vp= Vg + Ve
H2(广义遗传力)= VD/Vp h2 (狭义遗传力) = VA/Vp
第四章 数量性状的遗传
第一节 数量性状的遗传基础 3、通径系数理论
单箭头表示因果关系,方向是由因到果; 用双箭头代表平等的相关关系。
X1 Y3
X2
有关变量间关系图解
第四章 数量性状的遗传
第一节 数量性状的遗传基础
3、通径系数理论
X3代表饲养条件,是X1与X2的共同原因,
把它省略了就用一条双箭头代替两条单箭头线。 单箭头线叫做通径,双箭头线叫做相关线。
第四章 数量性状的遗传
第三节 数量性状的重复力 二、重复率的计算
re = MSB – MSW/ MSB+(n-1)MSW 三、重复率的应用 1、验证遗传力估计的正确性 2、确定性状需要度量的次数 3、估计畜禽个体最大生产能力(p79) 4、评定动物的育种值
第四章 数量性状的遗传
第四节 数量性状的遗传相关 一、遗传相关的概念 动物所表现的各种
(2)基因的非加性效应 数量性状的各个基因的效应是累加的。
但是,基因除具有加性效应外,还有非加性效 应。
由等位基因间相互作用产生的效应产生 的效应叫做显性效应。
由非等位基因之间相互作用产生的效应, 叫做上位效应或互作效应。
第四章 数量性状的遗传
第一节 数量性状的遗传基础 2、数量性状的遗传基础
(2)基因的非加性效应 原因:
遗传学-数量性状的遗传分析
三、微效基因表型值的推算
累加作用(每个显性基因的作用以一定的数值与纯隐性亲本 的表型值相加) 纯显性亲本表型值=每个显性基因表型值X纯显性亲本基因数+ 纯隐性亲本表型值 如短穗玉米x=6.6,长穗玉米x=16.8,F2中长、短穗各占群体 的1/16 4n=16,n=2 控制长穗玉米穗长的显性基因为2对(4个). 每个显性基因表型值=纯显亲本表型值-纯隐亲本表型值/纯显 亲本基因数=16.8-6.6/4=2.55 所以,含一个显性基因的玉米穗长:6.6+2.55=9.15cm 含2个显性基因的玉米穗长:6.6+(2×2.55)=11.7cm 依此类推。
狭义遗传率
计算基因的相加效应的方差VA在总的表型方差中所占的百分率。
Aa同AA回交的子代个体为B1,同aa回交的子代个体为B2。 B1的遗传方差的计算 f x fx fx2 AA 1/2 a 1/2a 1/2a2 Aa 1/2 d 1/2d 1/2d2 合计 1 1/2(a+d) 1/2(a2+d2) B1的遗传方差:VB1=1/2(a2+d2) -1/4(a+d)2=1/4(a-d)2 B2的遗传方差的计算 f x fx fx2 Aa 1/2 d 1/2d 1/2d2 aa 1/2 -a -1/2a 1/2a2 合计 1 1/2(d-a) 1/2(a2+d2) B2的遗传方差:VB2=1/2(a2+d2)- 1/4(d-a)2=1/4(a+d)2
例如小麦籽粒颜色两对基因控制的遗传动态 P 红R1R1R2R2 白r1r1r2r2 R1r1R2r2 红 1 4 6 4
F1
F2
1
4R
深红
3R
中深红
第四章家禽数量性状的遗传
肉用性状(meat trait)的遗传
• 生长速度(growing rate) 1. 累积生长(accumulate growing) 2. 绝对生长(absolute growing) 3. 相对生长(relative growing) 早期生长速度h2=0.4-0.5
ห้องสมุดไป่ตู้
蛋用性状(egg trait)的遗传
• 影响产蛋量的因素: 1、性成熟期(sex maturity):又称开产日龄
(age at first egg),指母禽产第一个蛋的日 龄。有时用早熟性(earliness)来描述性 成熟的早晚。 度量方法:个体,见第一个蛋的日龄;群体, 蛋禽为达50%产蛋率的日龄,肉用禽为达 5%产蛋率的日龄。性成熟期的h2=0.3
Growth data came from 27,231 male and female birds submitted to selection and dataset had information on 5 generations of pedigree;
Carcass data came from 9,463 full sibs of broilers from selection, that were processed at the experimental slaughterhouse. Those animals were slaughtered around 42 days of age, from 2019 to 2019.
4、血斑或肉斑(blood spots or meat spots) 种蛋容许率<2%,h2=0.1-0.5 蛋鸡部分性状的遗传力
第四章数量性状遗传说课讲解
二、多基因假说的要点
①数量性状是受许多效应微小的基因控制的━微效多 基因;
②基因的效应相等且可加,故又称累加基因。 ③等位基因缺乏显性; RR>Rr>rr,大写字母仅表
示增效基因,小写字母表示减效。 ④基因的作用受环境影响较大; ⑤多基因往往具有多效性,可以作为修饰基因,修
A中:1/4红粒∶2/4中红粒∶1/4白粒 B中:1/16深红∶4/16红粒;6/16中红;4/16淡红;1/16白粒 C中:1/64极深红∶6/64深红∶15/64红粒∶20/64中 红∶15/64中淡红∶6/64淡红∶1/64白粒
③红色深浅程度的差异与基因数目有关,而与基因 种类无关。
理论解释:
遗传方差 VG
遗传方差 VG
广义遗传率= =
总方差 VP
遗传方差 VG+环境方差VE
用hB2 表示, h2 VG 100%
B
VP
从基因作用来分析,基因型值可进一步分 解为3个部分:
G=A+D+I
A:加性效应,等位基因和非等位基因的累加
效应,可固定的分量。
D:显性效应,等位基因之间的互作效应, 属
A组 P1 红粒×白粒
↓ F1 红粒
↓ F2 3/4红粒
1/4白粒
B组 红粒×白粒
C组 红粒×白粒
↓ 红粒
↓ 红粒
↓
↓
15/16红粒 63/64红粒
1/16白粒 1/64白粒
分析结果表明:
①小麦和燕麦中存在3对与种皮颜色有关、种类不同 但作用相同的基因,这3对基因中的任何一对在单独 分离时都可以产生3∶1的比率,当3对基因同时分离 时,则产生63/64∶1/64的比率; ②上述杂交在F2的红粒中又呈现各种程度的差异, 按红色程度分为:
(遗传与优生)第四章第四节 多基因遗传病
四、脂类代谢病
• 由于某些脂质在代谢中酶遗传性缺陷, 导致相应代谢物在体内沉积过多。 • 从广义上来说,脂类代谢异常包括血浆 脂质(脂蛋白)代谢异常、固醇类激素 代谢异常、神经鞘脂类贮积和粘脂类贮 积。 • 经鞘脂贮积病是由于细胞膜的组成成分---神经鞘脂类化合物代谢障碍所致。
Bye—Bye
!
二、血浆蛋白病
血浆蛋白:血液中含量高、种类多、功能
重要的一类蛋白质,在体内起着物质运输、
凝血和免疫防御等作用。
基因缺陷导致血浆中某种蛋白质缺陷引起
血浆蛋白病。
血友病
血友病:凝血因子遗传性缺乏引起严重凝
血功能障碍的出血性疾病。
甲型(A型,凝血因子VIII缺乏),最高 乙型(B型,凝血因子IX缺乏) 丙型(C型,凝血因子XI缺乏)
三、
常见基因遗传病
• 多基因遗传病: 由多对基因控制的且受环境因素影响 的遗传病。
例:先天畸形、精神分裂病、哮喘、消 化性溃疡、先天性心脏病。
三、
常见基因遗传病
(一)易患性和发病阈值
易患性:多基因遗传病中一个个体在遗传
基础和环境因素共同作用下患某种多基因 遗传病的风险称易患性。
易感性:多基因遗传病中由遗传基础决定
1.白化病
• 是一种常见的先天性皮肤及其附属器官 黑色素缺乏所引起的疾病。
临床表现:皮肤白皙、毛发银白色或淡黄色、畏光 遗传病因:酪氨酸酶基因缺陷。
基因定位:全身性:AR;11q14—q21。 局部性:AD;15p 治疗:避免日晒,用5%对氨基甲酸护肤液涂皮肤暴 露部分,外出戴有色眼镜。
2.苯丙酮尿症
二、糖代谢病
(一)半乳糖血症(galactosemia):AR (案例9-5)
数量性状遗传
不 育 系 繁 殖 区
杂 交 制 种 区
1、数量性状是多对微效基因或多基因的联合效应造成的; 2、多基因中每一对基因对性状表型所产生的效应是微小的, 并且没有显隐性关系; 3、微效基因的效应是相等而且相加的,有效基因越多,性 状表现强度越大;
4、微效基因位于细胞核染色体上。
三、数量性状与质量性状的关系
1、数量性状呈连续变异,受微效多基因控制; 2、质量性状呈现不连续变异,受主基因控制(对性状起决 定作用的基因); 3、无论哪种基因都位于染色体上,因此对性状的控制就有 某些必然联系,同时又有区别; 4、质量性状遵循孟德尔遗传规律,数量性状的遗传是非孟 德尔式遗传(但每对性状仍遵循分离定律)
细胞核雄性不育
细胞质雄性不育
核质互作雄性不育
特征: 雄蕊发育不正常,不能产生有功能的花粉; 雌蕊发育正常,能接受正常花粉而受精结实。 生产上常用: 核质互作雄性不育型
核质互作不育型遗传方式
遗传 基因
胞质基因 胞核基因
N(可育)、S(不育)
RR(可育)、Rr(可育)、rr(不育)
质基因与核基因的6种组合及育性表现和遗传规律。
细胞质遗传:由细胞质基因所控制的遗传现象和遗传
规律。
线粒体、质体(叶绿体、白色体、有色体)
一、细胞质遗传的特点
1、表现母系遗传;
2、遗传方式是非孟德尔式的,杂种后代不 表现一定比例的分离。
二、细胞质遗传的应用
植物雄性 应用: 不育性
N
RR
可育 可育
N
Rr
可育
可育
N
rr
可育
不育
S
RR
S
Rr
S
rr
三系制种程序
《数量性状遗传》课件
遗传模型构建方法
遗传力模型
通过构建遗传力模型,分 析数量性状的遗传变异程 度,并估计遗传力和相关 参数。
遗传相关模型
通过构建遗传相关模型, 分析不同数量性状之间的 遗传相关控制的群体遗传现象, 通过混合模型进行基因型 和环境交互作用的分析。
数量性状遗传在自然界中广泛存在,如人的身高、 体重、智力等都属于数量性状。
数量性状遗传的特点
数量性状遗传具有连续变异的 特点,即在一个群体中,个体 的表现型值可以连续变化。
数量性状遗传受多个基因位点 的影响,这些基因位点通常具 有微效作用,即每个基因位点 对表现型的影响较小。
数量性状遗传还受到环境因素 的影响,环境因素可以影响个 体表现型值的变异范围和分布 。
数量性状遗传在动物育种中的应用
生长速度
通过研究动物生长速度的数量性 状遗传,育种家可以培育出生长 快速的动物品种,提高养殖效益
。
繁殖性能
通过选育具有优良繁殖性能的数 量性状基因,可以提高动物的繁
殖效率,加速品种改良进程。
抗病性
通过研究动物抗病性的数量性状 遗传,育种家可以培育出具有较 强抗病能力的动物品种,降低养
利用新一代测序技术和遗传资源发掘,精细定位和克隆控制数量性状的基因或基因组区域 。
解析数量性状基因的互作网络
研究基因之间的相互作用关系,解析数量性状形成的复杂网络调控机制。
探索表观遗传修饰对数量性状的影响
研究DNA甲基化、组蛋白修饰等表观遗传修饰对数量性状表达的调控作用。
加强数量性状遗传与其他学科的交叉研究
03
数量性状遗传分析方法
统计分析方法
01
02
03
方差分析
通过比较不同群体或处理 组之间的变异程度,确定 数量性状是否受遗传控制 。
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第四章数量性状的遗传
目的要求
掌握数量性状与质量性状的区分、特征,多基因假说的要点,数量性状表现值的分解,遗传力的概念;了解通径系数概念与意义,基因的非加性效应与加性效应的意义,遗传力公式的推导及计算方法;掌握遗传力的应用。
第一节数量性状的遗传基础
生物的性状基本上可分为两大类:
质量性状(qualitative trait):变异可以截然区分为几种明显不同的类型,一般用语言来描述;
数量性状(quantitative trait):个体间性状表现的差异只能用数量来区别,变异是连续的。
阈性状(threshold trait):表现型呈非连续变异,与质量性状类似,但不是由单基因决定,性状具有一个潜在的连续型变量分布,遗传基础是多基因控制的,与数量性状类似。
一、数量性状的一般特征
数量性状的特点:
①数量性状是可以度量的;
②数量性状呈连续性变异;
③数量性状的表现容易受到环境的影响;
④控制数量性状的遗传基础是多基因系统。
学习数量性状的方法
①统计学思想贯穿数量性状遗传的全部内容;
②确定性与不确定性的矛盾时时体现;
③研究对象在个体与群体间的相互转换;
④遗传与变异的矛盾。
二、数量性状的遗传基础
1.多基因假说
瑞典遗传学家尼尔迩·埃尔(Nilsson-Ehle)通过对小麦籽粒颜色的遗传研究,提出了数量性状遗传的多基因假说。
多基因假说的要点
(1)数量性状是由许多微效基因决定的,每个基因的作用的微效的;
(2)基因的作用是相等的,且可以累加、呈现剂量效应,等位基因间通常无显隐关系;(3)基因在世代相传中服从孟德尔定律,即分离规律和自由组合规律,以及连锁交换规律2.基因的非加性效应
基因的非加性效应包括显性效应和上位效应。
(1)显性效应由等位基因间相互作用产生的效应。
例1:有两对基因,A1、A2的效应各为20cm,a1、a2的效应名为10cm,基因型A1A1a2a2
按加性效应计算其总效应为60cm 。
而在杂合状态下,即A 1a 1A 2a 2同样为两个A 和两个a ,其总效应可能是75cm
(2)上位效应或互作效应 由非等位基因之间相互作用产生的效应。
例2:上例中A 1A 1A 2A 2按加性效应应是80cm ,但实际总效应可能是90cm
3.数量性状基因座
对数量性状有较大影响的基因座称为数量性状基因座(quantitative trait locus ,QTL),它是影响数量性状的一个染色体片段,而不一定是一个单基因座。
三、通径系数理论
通径系数就是标准化的偏回归系数 。
通径系数的主要优点是能够借图解之助简明地阐明各变量之间的关系。
两个有关变量之间可有两种关系,一是平行关系,一是因果关系。
具有平行关系的双方不分因果,只是由于两者具有共同原因,或互为因果,因而彼此相关。
X1Y X2X1Y X3
X2
单箭头线叫做通径,双箭头线叫做相关线。
用一个数字来表明每条线的相对重要性,这种数字叫做系数。
相关线的系数就是相关系数,通径的系数叫做通径系数。
通径系数就是标准化回归系数,在多自变量情况下,就是标准化偏回归系数。
Sb y ·x =P y ·x =b y ·x σx /σy
箭头线叫做通径,双箭头线叫做相关线。
用一个数字来表明每条线的相对重要性,这种数字叫做系数。
相关线的系数就是相关系数,通径的系数叫做通径系数。
回归系数b yx =SP/SS X
相关系数
第二节 数量性状的遗传力
一、遗传力的概念
(一)表型值的剖分
P=G+E
P=G+E=A+D+I+E=A+R
R=D+I+E
V p =V G +V E
遗传力:是遗传方差在总表型方差中所占的比率 y x xy xy SS SS SP r =A I D A G E G P =++==+=
H 22称为广义遗传力
狭义遗传力(h 2)
遗传力估计值可以用百分数或者小数来表示
1.数量性状的遗传力估计值介于0~1之间。
2.根据性状遗传力值的大小,可将其大致划分为三等,即0.5以上者为高遗传力;0.2以下者为低遗传力。
3.遗传力估计值只是说明对后代群体某性状的变异来说,遗传与环境两类原因影响的相对重要性。
并不是指该性状能遗传给后代个体的绝对值。
二、遗传力的估算方法
1.由亲仔关系估算遗传力
在家畜育种中,一般用女母回归法来估算遗传力。
h 2=2b op
P 是母亲某性状的表型值,O 是女儿该性状的表型值。
=母亲的变量
在畜群中母畜数大大超过公畜数,所以一般都利用母畜中的子亲回归,即女母回归(b o p )。
为了消除各公畜对畜群影响大小的差异(各公畜的女儿不等),在家畜育种中常以公畜内女母回归(b w (o p ))表示全群的女母回归。
公畜内女母回归和遗传力的计算步骤:
①整理资料。
以女儿的个体表型值为O ,以其母亲的个体表型值为P ;
②分别计算各公畜组的平方和SS p 、SS 0、乘积和SP op ;
③将各组的上述数据总加起来,得到公畜内平方和、公畜内乘积和;
P G V V H =2P
A V V h =22p op op Cov b σ=
N P P O O
Cov op ∑--=))((N P P p ∑-=22)(σ
N AR A N R A A Cov op ∑∑∑+=+=2121)(212∑=0AR A op V Cov 21=22121h V V b P A op ==op
b h 22=∑=P P W SS SS )(∑=OP OP W SP SP )(∑=O O W SS SS )(
计算公畜内女母回归和遗传力:
h 2=2b w(op)
2.半同胞相关法
半同胞就是同父异母或同母异父的兄弟姐妹。
通过对若干公畜(或母畜)的女儿某性状表型
值的产量,用方差分析法可求得组间(公畜或母畜间)方差和组内方差。
h 2=4r H S
组内相关系数即是半同胞相关系数,用r HS 表示
M S S 为公畜间均方,M S w 为公畜内均方,n 为各公畜的女儿数。
利用上式计算出半同胞组内相关系数后,再乘上4,即为该性状的遗传力。
半同胞相关和遗传力的计算步骤如下:
①整理资料。
②分别计算出各组的∑X ,∑X 2和
然后将各种的上述数据总加起来,得到∑∑∑X 、∑∑X 2、∑C X 和∑n ;
③计算平方和、自由度和均方:
S S w =∑∑X 2-∑C X
d f S =S -1
d f W =∑n -S
④ 计算各组的平均同胞数n 0。
⑤计算半同胞相关和遗传力:
h 2=4r HS
3.利用“全同胞—半同胞”混合家系计算遗传力
各公畜加权平均子女数
)()()(p w op w op w SS SP b =
222w S S HS r σσσ+=W S W S HS MS n MS MS MS r )1(-+-=⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛--=∑∑∑i i i n n n S n 2011()n X C X 2∑=()∑∑∑∑-=n X C SS X S 2S S S df SS MS =W W W df SS MS =W S W S HS MS n MS MS MS r )1(0-+-=⎪⎪⎭⎫ ⎝⎛-=∑∑
∑i i i S n n n df n 201
N 为子女总数,n i 为每头母畜子女数,Σn i 为每头公畜子女数 遗传力为:
三、遗传力的应用
1.估计种畜的育种值
2.确定繁育方法
3.确定选择方法
4.应用于综合选择指数的制订
思考题:
1.质量性状与数量性状各有何特点?如何区分?
2.多基因假说的要点是什么?
3.数量性状的遗传机制是什么?
4.如何正确剖分数量性状的表现值?
5.什么是遗传力?如何估算数量性状的遗传力?估算的方法有哪些?
6.数量性状的遗传力有何应用价值? W
S W S I MS n MS MS MS r )1(0-+-=⎥⎥⎦
⎤⎢⎢⎣⎡--+=∑∑∑∑N n N n r i i A 22)(125.0A I r r h =2。