蛋白质组学题库(参考资料)
蛋白质组学蛋白质组学试卷(练习题库)(2023版)
蛋白质组学蛋白质组学试卷(练习题库)1、自由流电泳分离蛋白质的机理及其优缺点。
2、质谱仪的组成及其主要技术指标。
3、蛋白质组学定量分析方法的主要原理。
4、请列举预测蛋白质相互作用的方法。
5、系统生物学研究的主要流程是什么？6、试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究，并分析其优缺点。
7、 Proteome（蛋白质组）8、 Proteomics（蛋白质组学）9、 Mass Spectrometer（质谱仪）10、 Post translational modification(蛋白质翻译后修饰)11、 De novo sequencing(从头测序)12、 Tandem mass spectrometry(串联质谱)13、 Peptide mass fingerprint(肽指纹谱)14、 Peptide sequence tag 肽序列标签15、 Post-source decay(源后衰变)16、 Neutral loss scan 中性丢失扫描17、 Matrix-assisted laser desorption/ionization基质辅助激光解18、论述蛋白质组学与基因组学的区别和联系。
19、简述与传统的分离技术相比较，PF-2D的优点。
20、多反应监测的英文缩写？（）21、下列哪一个不是质谱的离子化模式？（）22、质谱分析是根据（）对样品进行分析。
23、质谱仪的构造包括（）。
24、以下不属于质量分析器的是（）。
25、分辨率指，当两个质谱峰的峰高相等，而其谷高相当于峰高的（），这两个峰可以分开。
26、以下哪个质量分析器的检测上限最高（）。
27、电子轰击电离主要用于检测（）。
28、电喷雾电离源主要用于检测（）。
29、 MALDI的中文意思是指（）。
30、质谱仪的进样系统包括（）。
31、 MALDI是用于（）的离子化方法。
32、飞行时间质量分析器是利用具有相同能量的带电荷粒子，由于（）的差异而具有不同的速度，通过相同的漂移距离33、要想得到较多的碎片离子，应采用下面哪种离子源（）。
蛋白质组学蛋白质组学考试卷模拟考试题
《蛋白质组学》考试时间：120分钟 考试总分：100分遵守考场纪律，维护知识尊严，杜绝违纪行为，确保考试结果公正。
1、自由流电泳分离蛋白质的机理及其优缺点。
（ ）2、质谱仪的组成及其主要技术指标。
（ ）3、蛋白质组学定量分析方法的主要原理。
（ ）4、请列举预测蛋白质相互作用的方法。
（ ）5、系统生物学研究的主要流程是什么？（ ）姓名：________________ 班级：________________ 学号：________________--------------------密----------------------------------封 ----------------------------------------------线-------------------------6、试述如何应用2D-PAGE进行差异蛋白质组学的研究，并分析其优缺点。
（）7、Proteome（蛋白质组）（）8、Proteomics（蛋白质组学）（）9、Mass Spectrometer（质谱仪）（）10、Post translational modification(蛋白质翻译后修饰)（）11、De novo sequencing(从头测序)（）12、Tandem mass spectrometry(串联质谱)（）13、Peptide mass fingerprint(肽指纹谱)（）14、Peptide sequence tag 肽序列标签（）15、Post-source decay(源后衰变)（）16、Neutral loss scan 中性丢失扫描（）17、Matrix-assisted laser desorption/ionization基质辅助激光解吸电离技术 (MALDI)（）18、论述蛋白质组学与基因组学的区别和联系。
（）19、简述与传统的分离技术相比较，PF-2D的优点。
（）20、多反应监测的英文缩写？（）（）A.TICB.XICC.MRMD.EMS21、下列哪一个不是质谱的离子化模式？（）（）A.电喷雾B.基体辅助激光解吸C.大气压化学电离D.飞行时间22、质谱分析是根据（）对样品进行分析。
蛋白质组学期末答案
2013——2014第一学期蛋白质组学试题一名词解释（6分题，共30分）1. 基因组：生物细胞中的全部基因。
蛋白质组：生物细胞中由全套基因编码控制的蛋白质2. 基因组学：是研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。
提供基因组信息以及相关数据系统利用，试图解决生物，医学，和工业领域的重大问题。
蛋白质组学：研究蛋白质组中蛋白质表达与功能变化的科学。
可视为分子生物学的大规模筛选技术，目的在于归类细胞中的蛋白质的整体分布，鉴定并分析感兴趣的个别蛋白，最终阐明它们的关系与功能。
3. 质谱：被分析样品经离子化，成为分子离子及其碎片，后利用离子在电场或磁场中的运动性质，把离子按其质量与所带电荷比（m/z）的大小依次排列并记录下来成为质量波谱，称为质谱。
质谱分析：是通过对样品分子的离子质量和强度进行测定来分析样品成分和结构的一种分析方法。
4. MALDI与ESIMALDI：即基质辅助激光解吸电离，在波长为775-1250nm的真空紫外光辐射下光致电离和解吸作用使生物分子电离为分子离子和含有结构信息的碎片。
ESI：即电喷雾电离，采用强静电场（3-5kV），以喷雾形式使液体样品形成高度荷电的雾状小液滴，小液滴经过反复的溶剂挥发-液滴分裂后，产生多种质子化离子。
两者均属于软电离技术。
5. SDS-PAGE：聚丙烯酰胺凝胶电泳（PAGE），在聚丙烯酰胺凝胶系统中加入十二烷基硫酸钠（SDS）构成SDS-PAGE系统用于分离蛋白质，蛋白电泳迁移率取决于其分子量，而与形状及所带电荷无关。
2-D：即双向凝胶电泳，根据蛋白质的等电点和分子质量的差异使之在二相平面上分开是目前使用最广泛的蛋白质组学分离技术。
二简答题（6分题，共30分）1 简述CHIP技术的原理被剪切，与所研究蛋白相关的DNA片断被选择性免疫沉淀；相关DNA 片断被纯化，顺序被测定。
2 简述ICAT技术的原理ICATS是一种蛋白质组学定量研究常见方法，ICAT试剂结构，包括3个部分，SH反应集团， biotin标签，同位素其原理是来源不同处理的蛋白质分别用重型ICAT试剂和轻型ICAT试剂标记，标记后等量混合，胰蛋白酶酶切，亲和纯化得到ICAT标记的多肽，质谱分析，依据MS质谱峰图强度进行定量，MS/MS鉴定肽段。
蛋白常见问题考核试题
蛋白常见问题考核试题1.蛋白组学DIA和DDA扫描模式以下说法正确的是A、DDA扫描是数据依赖性采集模式，DIA是数据非依赖性采集模式(正确答案)B、DDA是在一级质谱的每个时间窗口进行检测循环时选择性采集信号相对较强的肤段离子（top20）进入二级质谱碎裂。
(正确答案)C、DIA是将质谱整个全扫描范围分为若千个窗口，然后对每个窗口中的所有离子进行检测、碎裂，从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的信息(正确答案)D、DIA采集数据稳定性高，数据可追溯，适合大样本量研究，并且DIA 鉴定的蛋白数量同等时长下比DDA要多(正确答案)2.蛋白组标记定量和非标记定量说法正确的是A、标记定量是利用多体外标记技术，将蛋白酶解后的肤段添加上标签，可以对一个样本添加一个标签，这样带有不同标签的样本可以被混合上机。
用于降低质谱稳定性带来的系统误差(正确答案)B、非标记定量是不添加标签标记的蛋白质组学，所以样本需要单个上机检测，大样本量时通常采用在样本间穿插OC样本的方式，看整个实验过程中仪器的稳定性。
(正确答案)C、标记定量可以鉴定特异性表达蛋白D、非标记定量对样本要求不需要统一性，即使不同组织也可以一批上机检测(正确答案)3.关于Astral DIA蛋白组以下说法正确的是A、Astral DIA蛋白组是经典DIA蛋白组技术，仪器性能空前提升，具有以往DIA 蛋白组的所有特性，并且更为强大(正确答案)B、Astral DIA在样本检测通量，蛋白鉴定深度以及仪器稳定性上都具有空前的提升(正确答案)C、Astral DIA主推180SPD(正确答案)D、Astral DIA所说的180SPD、60SPD是指每天可以上机检测的样本数，也就是指的是上机时长，所以60SPD的时长其实是14.4min4.4D DIA和Astral DIA以下说法错误的是A、同一样本，Astral DIA在8min梯度下鉴定的蛋白数量比4D DIA在48min梯度下鉴定的蛋白数量要少(正确答案)B、由于4DDIA新增了离子淌度的维度，可以鉴定同分异构体，所以4DDIA是目前蛋白组学检测上最先进的仪器(正确答案)C、目前主推Astral DIA 180SPD ,客户要求可以推荐4DDIA5.Astral DIA由于没有离子淌度分离，所以定性没有4D DIA精确 [判断题]对错(正确答案)6.以下属于非标记的蛋白质组学的是bel free(正确答案)B.TMTC.DIA(正确答案)D.4D-DIA(正确答案)7.血清、血浆做蛋白质组推荐按项目去除（建库后对建库的样本去高丰度）还是按样本（不建库，单个样本去高丰度）去除，为什么？A.客户无特殊倾向，推荐按项目去除B.客户无特殊倾向，选按样本去除(正确答案)C.按项目去除，可以得到更多的蛋白质和更好的检出效果D.按样本去除，可以得到更多的蛋白质和更好的检出效果(正确答案)8.需要去除高丰度蛋白的样品类型有A.血清(正确答案)B.血浆(正确答案)C.脑脊液(正确答案)D.乳制品(正确答案)E.痰液9.关于美吉NGP优势正确的是A.美吉配备赛默飞官方推荐用于astral 蛋白组采集的全套工作站，保障样本质谱采集无忧；(正确答案)B.美吉配备深度定制蛋白质组学前处理自动工作站，保障样本制备无忧；(正确答案)C.美吉自主研发蛋白质组学交互式云分析平台,蛋白组学项目全面采用云交付,包括DIA, LFQ和TMT等专属云分析流程,涵盖七大分析模块,包含50+分析内容，全面解析蛋白组数据。
蛋白质组学复习题
蛋白质组：一种细胞、组织或完整的生物体所拥有的全套蛋白质蛋白质组学：应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴学科，即研究细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同，对相关蛋白质进行分类和鉴定。
更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能F-2D-DIGE荧光差异显示双向凝胶电泳在传统双向凝胶电泳基础上发展起来的定量分析凝胶上蛋白质点的新方法具体操作步骤：首先将待比较的两种样品提取的总蛋白分别与两种不同的荧光标记试剂（Cy2, C y3或Cy5）进行共价标记，然后将不同荧光染料标记的两种待比较的蛋白质样品等量混合，上样进行双向电泳，2D凝胶在成像仪上用两种不同波长激发，并将两种样品的荧光图谱显示成像，用2D分析软件进行定量分析。
将显示有明显差异的蛋白点切下后进行鉴定分析，从而确定差异表达的蛋白质PF-2D:以蛋白质组或复杂的蛋白质混合物为分离对象，通过一维色谱聚焦（即将复杂蛋白质混合物按蛋白质的等电点差异进行分离）和二维无孔硅胶反相HPLC分离色谱（即按蛋白质的疏水性差异进行分离）模式进行分级分离，软件将液相色谱的分离图转换为双向电泳形式，一维为等电聚焦结果，二维为分子量分离结果，为蛋白质组学研究提供了一个创新的技术平台。
从头测序（Do novo sequencing）:不使用来自蛋白质数据库的信息，直接解释串联质谱数据的方法和技术通过20种氨基酸残基的质量等信息以及主要类型离子谱峰间的质荷比（M/Z）差值来构造序列。
这类蛋白质鉴定方法就称为蛋白质的从头测序。
Tandem mass spectrometry串联质谱:由2台质谱仪经1个碰撞室串联而成。
首先利用第一台质谱仪选择特殊离子，在进入第二台质谱仪之前，先进入碰撞室与加入其中的气体（氮气或氦气）产生碰撞形成各种离子，再利用第二台质谱仪依各离子的质核比不同而分离，形成第二次质谱，可作为离子结构判断的依据肽质量指纹图谱（peptide mass fingerprint）PMF:指特定的蛋白酶对蛋白质进行酶解后的质谱分析得到一套多肽质量图谱，这种特性就象指纹一样，每种蛋白都具有特定的质量肽谱。
蛋白质组学考试试题
蛋白质组学考试试题一、选择题（每题 3 分，共 30 分）1、以下哪种技术不是蛋白质组学研究中常用的分离技术？（）A 双向凝胶电泳B 高效液相色谱C 质谱分析D 亲和层析2、蛋白质组学研究的核心内容是（）A 蛋白质的表达水平B 蛋白质的修饰C 蛋白质之间的相互作用D 以上都是3、在质谱分析中，用于测定蛋白质分子量的是（）A 飞行时间质谱B 离子阱质谱C 四级杆质谱D 以上都可以4、蛋白质组学研究中，用于定量蛋白质表达水平的方法是（）A 同位素标记相对和绝对定量技术（iTRAQ）B 双向凝胶电泳定量C 质谱定量D 以上都是5、以下哪种蛋白质修饰不属于翻译后修饰？（）A 磷酸化B 甲基化C 乙酰化D 转录6、蛋白质组学研究中，样品制备的关键步骤不包括（）A 细胞破碎B 蛋白质提取C 蛋白质消化D 蛋白质结晶7、用于研究蛋白质相互作用的技术有（）A 酵母双杂交B 免疫共沉淀C 荧光共振能量转移D 以上都是8、以下关于蛋白质组学数据分析的说法错误的是（）A 需要对大量的数据进行处理和筛选B 可以使用生物信息学工具进行分析C 数据分析的结果可以直接得出结论，无需验证D 数据的质量控制很重要9、蛋白质组学在以下哪个领域有重要应用？（）A 疾病诊断B 药物研发C 农业科学D 以上都是10、以下哪种不是蛋白质组学研究中的样品来源？（）A 组织B 细胞C 血液D 无机物二、填空题（每题 3 分，共 30 分）1、蛋白质组学是指研究一个细胞、组织或生物体在特定条件下所表达的＿_________________ 及其＿________________ 的学科。
2、双向凝胶电泳的第一向是＿________________ ，第二向是＿________________ 。
3、质谱分析中，离子源的作用是将样品分子＿________________ 成离子。
4、蛋白质组学研究中的定量方法主要包括基于＿________________ 的定量和基于＿________________ 的定量。
蛋白质组学题库
蛋白质组学题库1. 什么是蛋白质组学？蛋白质组学是研究生物体中所有蛋白质的总体组成、结构、功能及其相互作用的科学。
它是一个综合性的学科，涉及到生物学、化学、生物信息学等多个领域。
通过蛋白质组学的研究，可以深入了解蛋白质在细胞内的功能、信号传导、疾病发生机制等方面的信息。
2. 蛋白质组学的研究方法有哪些？蛋白质组学研究包括蛋白质的分离、鉴定和功能研究等内容。
以下是常用的蛋白质组学研究方法：•二维凝胶电泳（2-DE）：通过电泳技术将蛋白质分离成一维和二维等凝胶上的斑点，然后进行染色和鉴定，以研究蛋白质的分子量、等电点等信息。
•质谱分析：通过质谱仪对蛋白质进行离子化，得到蛋白质的质量-电荷比，进而得到蛋白质的分子量和结构等信息。
•蛋白质芯片：利用微阵列技术，在固定的载玻片上固定大量的蛋白质，然后与样品中的蛋白质相互作用，以研究蛋白质的相互作用和功能。
•液相色谱-质谱联用：结合液相色谱和质谱的方法，可以对复杂的蛋白质样品进行分离和鉴定。
•蛋白质酶解：通过特定酶对蛋白质进行酶解，得到蛋白质的酶解产物，然后进行质谱分析，以研究蛋白质的序列和结构等信息。
3. 蛋白质组学在生物学研究中的应用蛋白质组学在生物学研究中有广泛的应用。
以下是蛋白质组学在生物学研究中的几个重要应用领域：•蛋白质组学在疾病研究中的应用：通过研究健康和疾病状态下蛋白质的组成和表达水平等差异，可以发现与疾病相关的蛋白质标志物，为疾病的诊断和治疗提供依据。
•蛋白质相互作用的研究：蛋白质组学可以通过研究蛋白质之间的相互作用来揭示细胞内复杂的信号传导网络，进而深入了解细胞的功能和调控机制。
•蛋白质翻译后修饰的研究：蛋白质组学可以对蛋白质的翻译后修饰进行高通量的鉴定和分析，揭示蛋白质的功能和调控方式。
•蛋白质组学在药物研发中的应用：通过蛋白质组学的研究，可以鉴定药物靶点和药物的作用机制，为药物研发提供重要的信息和策略。
4. 蛋白质组学研究的挑战和发展趋势蛋白质组学研究面临许多挑战，例如样品的复杂性、蛋白质的低丰度、高通量数据的处理和分析等问题。
遗传编码与蛋白质组学考试试题
遗传编码与蛋白质组学考试试题一、选择题1. DNA分子中碱基在遗传信息传递中起到了重要的作用。
下列选项中，正确描述碱基的是：A. Adenine和Thymine、Guanine和Cytosine是碱基间的配对B. DNA中的碱基组合是Adenine和Thymine、Guanine和CytosineC. RNA中的碱基组合是Adenine和Uracil、Guanine和CytosineD. DNA和RNA中的碱基组合是Adenine和Cytosine、Guanine和Thymine2. 在遗传编码中，一连串的三个碱基被称为一个密码子。
下列选项中，描述正确的是：A. 一种氨基酸只能由一个特定的密码子编码B. 不同的氨基酸可以由不同的密码子编码C. 所有氨基酸都可以由同一个密码子编码D. 每个氨基酸都有多个密码子编码3. 下列哪个选项正确描述了蛋白质合成中的转录过程？A. DNA转录为RNA，RNA经过翻译形成蛋白质B. RNA转录为DNA，DNA经过翻译形成蛋白质C. RNA转录为蛋白质，蛋白质合成完成后转录为DNAD. DNA转录为蛋白质，蛋白质合成完成后转录为RNA4. 在蛋白质组学研究中，常用的分析技术是：A. 聚合酶链反应（PCR）B. 原位杂交技术（ISH）C. 质谱分析（MS）D. 显微镜检查5. 下列哪个技术常用于研究蛋白质组学中的蛋白质结构与功能？A. 基因组学B. 转录组学C. 二维凝胶电泳（2-DE）D. 基因编辑技术二、简答题1. 什么是遗传编码？简要描述遗传编码的过程。
2. 解释DNA和RNA中碱基的差异。
3. 请解释转录和翻译在蛋白质合成中的作用。
4. 简述质谱分析在蛋白质组学研究中的应用。
5. 请解释二维凝胶电泳技术在蛋白质组学研究中的意义。
三、论述题1. 通过遗传编码的研究，科学家们可以了解到DNA在蛋白质合成中起到的重要作用，请论述DNA的功能和意义。
2. 蛋白质组学研究的发展对于人类健康以及疾病的诊断和治疗有着重要意义，请详细论述蛋白质组学在医学领域的应用和前景。
硕士研究生蛋白质组学试题
重庆医科大学2010级硕士研究生《蛋白质组学》试题姓名：学号：所在大班：专业：得分：交卷时间：2010.1.10 交卷地点：东大楼810房间交卷方式：各大班科代表收集并按学号顺序整理后上交一、解释（共25分）1、MALDI TOF MS（10分）2、亚细胞蛋白质组学（5分）3、免疫共沉淀（5分）4、激光共聚焦扫描显微技术（5分）二、问答题（共75分）1、简述2DE的原理及该技术的特点（10分）。
2、简述血浆/血清蛋白质组研究中需要着重注意的问题（11分）。
3、简述药物蛋白质组学定义及主要研究领域。
试举例说明其在药物靶点的发现和确认中的应用（12分）。
4、将文献Proteome Analysis of Hepatocellular Carcinoma by Two-dimensional Difference Gel Electrophoresis（Fuchu He et al，Molecular & Cellular Proteomics 6:1798-1808, 2007）中的ABSTRACT翻译成中文（10分）。
5、简述目前的蛋白质组学技术在医学研究中的优势和不足（12分）。
6、简述神经蛋白质组学研究标本的种类及其优缺点（10分）。
7、简述Laser capture microdissection (LCM) technology并举例说明其在蛋白组学研究中的应用价值（10分）。
MALDI TOF MS即基质辅助激光解析离子化/飞行时间质谱，是近年来发展起来的一种新型的软电离生物质谱，仪器主要由两部分组成：基质辅助激光解析电离离子源（MALDI）和飞行时间质量分析器（TOF）。
MALDI的原理是利用一定波长的激光脉冲，在极短的时间间隔内，对含被测样品靶物的一个微小区域提供高能量，从固相直接获得离子的电离方法。
因此它是一种软电离技术，适用于混合物及生物大分子的测定，并特别适用于对热敏感化合物或不会发化合物的离子化。
蛋白质的生物合成习题与参考答案
第十五章蛋白质生物合成、填空题: 1 .三联体密码子共有64 个，其中终止密码子共有3个，分别为 UAA 、 UAG 、 UGA 。
2 •密码子的基本特点有四个分别为从5无间断性、 简并性 、 变偶性 、 通用性 。
3•次黄嘌呤具有广泛的配对能力，它可与 U 、 C 、 A 三个碱基配对，因此当它出现在反密码子中时，会使反密码子具有最大限度的阅读能力。
4. 原核生物核糖体为70 S ,其中大亚基为 50 S ,小亚基为 30 S ;而真核生物核糖体为 80 S ,大亚基为 60 S ,小亚基为 40 S 。
甲硫甲硫5 .原核起始tRNA ，可表示为 tRNA f __________ ，而起始氨酰tRNA 表示为_f Met-tRNA f _______________ ;真核生物起始tRNA 可表示为 tRNA L 甲硫_，而起始氨酰-tRNA 表示为Met-tRNA f 二_。
6•肽链延伸过程需要进位、转肽、移位三步循环往复，每循环一次肽链延长1个氨 基酸残基，原核生物中循环的第一步需要 EF-Tu 和 EF-Ts 延伸因子；第三步需要EF-G延伸因子。
7.原核生物mRNA 分子中在距起始密码子上游约10个核苷酸的地方往往有一段富含 嘌吟 碱基的序列称为Shine-Dalgrano 序列，它可与16S-rRNA 3'— 端核苷酸序列互补。
&氨酰-tRNA 的结构通式可表示为：OIItRNA — O — C — CH — RINH 2,与氨基酸键联的核苷酸是A （腺嘌呤核苷酸） 。
9.氨酰-tRNA 合成酶对氨基酸和相应 tRNA 都具有较高专一性，此酶促反应过程中由 ATP 水解提供能量。
10•肽链合成的终止阶段， _____ RFi ____ 因子和 _____ RF 2 ___ 因子能识别终止密码子，以终止肽链延伸， 而 ___ RF3 ___ 因子虽不能识别任何终止密码子，但能协助肽链释放。
蛋白质组学试题整理 - 副本
蛋白质组学相关试题及答案1…Proteome(蛋白质组)：由一个细胞或者组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质，称为蛋白质组。
Proteomics(蛋白质组学)：指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴学科，即研究细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同，对相关蛋白质进行分类和鉴定。
更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能.2…. Mass Spectrometer（质谱仪）：质谱仪是一个用来测量单个分子质量的仪器，但实际上质谱仪提供的是分子的质量与电荷比（m/z or m/e）。
分离和检测不同同位素的仪器。
即根据带电粒子在电磁场中能够偏转的原理，按物质原子、分子或分子碎片的质量差异进行分离和检测物质组成的一类仪器。
质谱仪最重要的应用是分离同位素并测定它们的原子质量及相对丰度。
3. Proteome sample holographic preparation（蛋白组样品的全息制备）：（1）keep protein information（2）adapted to separation and identification methods（3）different samples,different extraction.蛋白质样品制备是蛋白质组研究的第一步，也是最关键的一步。
因为这一步会影响蛋白质产量、生物学活性、结构完整性。
因此要用最小的力量使细胞达到最大破坏程度同时保持蛋白质的完整性。
原则是，保持蛋白质的所有信息；选择合适的分离和鉴定方法；对于不同的样品要用不同的提取方法。
4.Post translational modification(蛋白质翻译后修饰)肽链合成的结束，并不一定意味着具有正常生理功能的蛋白质分子已经生成。
已知很多蛋白质在肽链合成后还需经过一定的加工（processing）或修饰，由几条肽链构成的蛋白质和带有辅基的蛋白质，其各个亚单位必须互相聚合才能成为完整的蛋白质分子。
基因组学与蛋白质组学复习题
2.3 遗传作图的方法
连锁分析是遗传作图的基础：1905，Bateson，Saunder和
Punnett；1911年Morgan揭示了连锁分析的意义 在同一条染色体上的基因间表现出遗传连锁(Genetic linkage) ，因为它们都是在同一条长的DNA分子上
和基因组不同，转录组是高度动态的，当细胞受 到侵犯时，甚至当细胞处于正常的生理活动如复 制、分裂时，基因的转录情况也会变化很大。 与基因组不同，转录组的定义中包含了时间和空 间的限定。甚至同一细胞在不同的生长时期及生 长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。 研究转录组的一个重要方法就是利用基因芯片技 术检测有机体基因组中基因的表达。从基因组 DNA转录出mRNA是蛋白合成的第一步，细胞所处 环境改变或受到侵犯时其形态和生理状况都会发 生改变，这些都是由于基因表达的不同引起的。
转录组学（transcriptomics）的概念
------是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的 情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组 学是从RNA水平研究基因表达的情况。 转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的 总和，也称为表达谱。 知道基因何时何地以及何种程度的表达对于理解 基因的活动和生理作用是至关重要的，基因表达 是研究细胞表型和功能的一个重要手段。
2-DE技术的缺点
极酸、极碱性蛋白质，疏水性蛋白质，极大 蛋白质、极小蛋白质以及低丰度蛋白质用此 种技术难于有效分离。 胶内酶解过程费时、费力，难于与质谱联用 实现自动化。
常见显色方法比较
（五）质谱分析
样品分子离子化后，根据不同离子间质荷比 （m/z）的差异来分离并确定分子量
离子化
m/z
质谱
定性 定量
一、基因表达的相关概念 基因表达(gene expression)：指细胞在生命过程中， 把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译，转变
蛋白质组学答案终稿
1，基因组：一个细胞或病毒所包含的全部基因。
2，蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出。
定义：蛋白质组是由一个细胞，一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应的蛋白质。
是一个整体概念。
3，蛋白质组学：是一门以全面的蛋白质性质研究(如表达水平、转录修饰、相互作用等)为基础，在蛋白质水平对疾病机理、细胞模式、功能联系等方面进行探索的科学，包括表达蛋白质组学，细胞谱蛋白质组学以3，等电聚焦：分离两性分子，特别是分离蛋白质的一种技术。
根据在一个电场的影响下这些两性分子在ph梯度上的分布情况进行分离等电聚焦技术：在一个pH梯度和外加电场下，蛋白质有移向pH梯度中使其净电荷为零的点的倾向。
（带正电荷移向阴极，带负电荷移向阳极）。
IEF可以基于极微小的电荷差异而分离蛋白，具有高分辨率。
4，负染就是用重金属盐（如磷钨酸、醋酸双氧铀）对铺展在载网上的样品进行染色；吸去染料，样品干燥后，样品凹陷处铺了一薄层重金属盐，而凸的出地方则没有染料沉积，从而出现负染效果（图2-15），分辨力可达1.5nm左右5，质谱（又叫质谱法）是一种与光谱并列的谱学方法，通常意义上是指广泛应用于各个学科领域中通过制备、分离、检测气相离子来鉴定化合物的一种专门技术。
质谱分析是一种测量离子荷质比（电荷-质量比）的分析方法，其基本原理是使试样中各组分在离子源中发生电离，生成不同荷质比的带正电荷的离子，经加速电场的作用，形成离子束，进入质量分析器。
在质量分析器中，再利用电场和磁场使发生相反的速度色散，将它们分别聚焦而得到质谱图，从而确定其质量。
7，分子离子峰：子受电子束轰击后失去一个电子而生成的离子M+成为分子离子。
在质谱图中，由M+所形成的峰称为分子离子峰。
7.碎片离子峰当电子轰击的能量超过分子离子电离所需要的能量（50~70eV）时，可能使分子离子的化学键进一步断裂，产生质量数较低的碎片，称为碎片离子。
在质谱图上出现相应的峰，称为碎片离子峰。
生物化学-蛋白质习题-考研资料汇总
1. 生物化学操作程序：你的第一次蛋白纯化，这是一个参与三羧酸循环的酶——柠檬酸合成酶，位于线粒体基质。
按照以下操作程序进行各步纯化，在你的工作中，更有经验的学生就每步方案的合理性对你提出问题，请给予回答。
（a）你从附近的屠宰场取回了20kg牛心。
运输中将其放在冰上。
用高速搅拌机将牛心组织在含0.2mol/L蔗糖、pH7.2的缓冲液中破碎成匀浆。
为什么使用牛心组织，为什么如此大量？保持组织低温并悬浮于0.2mol/L蔗糖、pH7.2的缓冲液的目的是什么？当被匀浆时，组织发生了什么变化？（b）你将浓稠不透明的组织匀浆进行了一系列不同的离心，这将起什么作用？（c）你对含有大多数完整线粒体的上清继续进行纯化。
接着你溶胀线粒体，话的仍不透明但比匀浆稀得多的裂解液，主要由线粒体膜和内含物组成。
向裂解液中加入高溶解度的硫酸铵盐至一定比例。
离心后将上清倒入另一容器，弃去沉淀。
向清澈了许多的溶液中再加入一定量的硫酸盐，再次离心，但这次保留沉淀，因为其中含有目的蛋白质。
两步加盐的合理性在哪里？（d）你将含有线粒体蛋白质的硫酸铵沉淀溶解，并对大量缓冲液（pH7.2）透析过夜，为什么透析液里不含硫酸铵？为什么使用缓冲液而不是水？（e）你将透析液上大小合适的排阻层析住。
按照方案，手机了第一个蛋白组分，弃去后面从柱上洗脱的成分，紫外光（280nm）吸收法检测蛋白质。
收集第一个洗脱成分的指示告诉了你这个蛋白质的什么性质？为什么280nm紫外光吸收是检测收集组分中的蛋白质的好办法？（f）你将（e）中收集的成分上阳离子交换柱层析。
弃去开始的穿过液后，加入pH较高些的洗脱液，收集立即洗脱下来的蛋白质成分。
解释你的做法。
（g）此时获得的蛋白质溶液虽然略带粉色，但以相当清澈，蛋白质量减少了很多。
取小量样品做等电聚焦凝胶电泳，染色后显现三条锐带。
根据纯化方案，你所噶你选哪个区的蛋白质的pI是 5.6，但你想对纯度做进一步分析，因此切下pI5.6的条带做SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。
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参考答案 （1）酵母双杂交系统（yeast two-hybird system）：是利 用杂交基因通过激活报道基因的表达探测蛋白-蛋白的相互 作用。真核生物转录因子具有DNA结合结构域（BD）和转 录激活结构域（AD）,这两个结构域分开时仍分别具有功能， 但不能激活转录，只有它们以适当途径在空间上较为接近时， 才能重新具有转录因子活性，并激活报道基因表达。 （2）免疫共沉淀（IP）：基本原理是抗原和抗体之间专一性 地相互作用而沉淀，从而保留下来，其是一种经典的检测蛋 白质相互作用的方法。其实验过程比较简单，裂解细胞后， 加入抗体，抗原被沉淀下来后洗涤，去除非特异性结合，再 分析复合体。抗体可以是单克隆，也可以使多克隆。 （3）蛋白质芯片（protein chip）：蛋白质芯片可以用来大 规模筛选蛋白质之间的相互作用，将一个蛋白质芯片与荧光 标记的探针蛋白孵育，洗脱非特异性结合的蛋白后，可以通 过扫描芯片上的荧光点来检测稳定的相互作用蛋白点。
8. 研究蛋白质相互作用可以采用 、 、 等方法。 （北京大学2019试题） 14. 蛋白质双向电泳（2-DE）是根据蛋白质分子量大小和 的不同来分离蛋白质的技术。（中山大学2019试题） 5. 蛋白质芯片技术基本上是基于（ ）方法中的原理。（深 圳大学2009试题；中科院上海生命科学研究所2019试题） A Northern blot B Western blot C Southern blot D Eastern blot 10. 用来研究蛋白质-蛋白质间相互作用的实验技术是（ ）。 （中国科学院2019试题） A 酵母双杂交技术 B 原位杂交技术 C RACE技术 D SAGE 技术 25. 免疫沉淀法（immunoprecipitation）一般用于分离 （ ）。（中山大学2019试题） A DNA B RNA C 蛋白质 D 脂类
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下列哪一个不是质谱的离子化模式？(((---)))
D
电喷雾
基体辅助激光解吸
大气压化学电离
飞行时间
41
质谱分析是一种测量离子(((---)))的分析方法
C
质量
电荷数
质荷比
结构
42
下列哪一个不是按质谱的离子源对质谱分类？(((---)))
D
电喷雾质谱
基体辅助激光解吸质谱
快原子轰击质谱
四级杆质
43
下列哪一个不是按质谱的质量分析器对质谱分类？(((---)))
B
傅里叶变换质谱
电喷雾质谱
飞行时间质谱
四级杆质谱
44
下列哪一个不属于质谱的基本结构？(((---)))
B
离子源
液相系统
质量分析器
检测器
45
下列哪一个不属于有机质谱？(((---)))
D
基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪
傅立叶变换质谱仪
液相色谱-飞行时间质谱仪
电感耦合等离子体质谱仪
46
下列哪一个不属于质谱的软电离形式？(((---)))
不带电荷的气态分子
带电荷的固态分子
不带电荷的固态分子
22
分析肽段时，以下哪种离子源灵敏度最高？
D
CI
ESI
microESI
nanoESI
23
MALDI通常产生带几个电荷的离子？
A
1
2
3
>3
24
下列哪个不属于质量分析器的类型？
B
TOF
MALDI
Quadrupoles
Ion Traps
25
下列说法不正确的是
Q2中常用氩气或氮气
是高分辨质谱
32
下列哪个不是离子碎裂方式？
D
CID
ECD
ETD
ESI
33
下列哪种离子碎裂方式只适用于MALDI？
A
PSD
CID
ECD
ETD
34
下列说法正确的是：
A
MALDI通常产生单电荷的离子
飞行时间质谱提高加速电压，可使离子的飞行时间缩短，仪器分辨率提高
iTRAQ属于代谢标记
RP-HPLC是基于电荷差异进行分离的
B
四级离子阱可直接在阱中使样品电离，也可使用外部离子源。
TOF只能与MALDI联用
在飞行时间质谱中，质量越大的离子飞行速度越小，到达检测器所需的时间越长。
飞行时间质谱提高其加速电压，仪器分辨率下降。
26
关于飞行时间质谱，下列说法正确的是：
C
增加漂移管的长度，会使离子的飞行时间增加，仪器分辨率下降。
提高加速电压，可使离子的飞行时间缩短，仪器分辨率提高。
B
电喷雾电离
电子轰击电离
大气压化学电离
大气压光电离
47
下列哪一个是由于库仑爆炸使化合物发生电离？(((---)))
A
电喷雾电离
电子轰击电离
大气压化学电离
A
质荷比
质量
速度
以上均不是
18
要想得到较多的碎片离子，应采用下面哪种离子源
A
EI
APCI
ESI
MALDI
19
质谱(MS)主要用于测定化合物中的
C
官能团
共轭系统
分子量
质子数
20
分子离子峰，其质量数与化合物的分子量
A
相等
小于分子量
大于分子量
大于或小于分子量
21
质谱仪可以分析何种状态的分子？
A
带电荷的气态分子
35
下列说法不正确的是：
B
飞行时间质谱提高其加速电压，仪器分辨率下降
电泳分离法只能在蛋白质非变性条件下进行分离
磷酸化的Thr可能会发生中性丢失，失去一个H3PO4，产生-98 Da质量差
1A
质谱仪分析的是带电荷的固态分子
飞行时间质谱提高其加速电压，仪器分辨率下降
飞行时间
傅里叶变换
电喷雾
6
分子量越大，质谱对其分离能力越(((---)))
B
强
弱
与分子量无关
7
质谱图以(((---)))
A
棒状图
折线图
钟形图
直线图
8
在质谱图中被称为基峰的是(((---)))
A
强度最大的离子峰
质荷比最大的峰
强度最小的峰
一定是奇电子峰
9
分辨率指，当两个质谱峰的峰高相等，而其谷高相当于峰高的(((---)))，这两个峰可以分开。
题目
答案
A
B
C
D
1
多反应监测的英文缩写？
C
TIC
XIC
MRM
EMS
2
下列哪一个不是质谱的离子化模式？
C
电喷雾
基体辅助激光解吸;
大气压化学电离
飞行时间
3
质谱分析是根据(((---)))对样品进行分析
C
分子量
电荷数
质荷比
结构
4
质谱仪的构造包括
D
离子源
质量分析器
检测器
以上都是
5
以下不属于质量分析器的是
D
四级杆
质量越大的离子飞行速度越小，到达检测器所需的时间越长。
只能与MALDI联用。
27
关于四级质量分析器，下列说法错误的是：
C
四级质量分析器实际上是一个质量过滤器。
四级分析器可以自身串联，构成串联质谱。
四级分析器不能与其他质量分析器串联使用。
四级分析器可以与其他质量分析器串联使用。
28
以下哪种质量分析器出现的最晚？
Ion Traps和FT-ICR两种质量分析器不需要与任何其他质量分析器串联，自身即可进行质谱/质谱操作
FAB是离子化方式的一种
37
下列说法不正确的是：
C
MALDI适合于固态的样品
.MALDI主要生产1价的离子
MALDI可以直接和液相色谱联用
TOF是一种常见的高分辨质量分析器
38
下列说法不正确的是：
B
5%
10%
15%
20%
10
以下哪个质量分析器的检测上限最高(((---)))
C
四级杆
磁偏转式
飞行时间
离子阱
11
电子轰击电离主要用于检测(((---)))
B
固体样品
气体样品
液体样品
以上三种均可
12
电喷雾电离源主要用于检测
C
固体样品
气体样品
液体样品
以上三种均可
13
MALDI的中文意思是指
D
电喷雾电离源
C
TOF
Ion Traps
Orbitrap
FT-ICR
29
下列哪个不属于离子化方式？
D
EI
MALDI
FAB
FT-ICR
30
下列哪种质谱不能直接与液相系统连用？
A
MALDI-TOF
Q-TOF
Ion Trap
Orbitrap
31
关于三重四级杆质谱下列说法不正确的是：
D
可以进行产物离子扫描
具有中性丢失扫描功能
电子轰击电离
化学电离
基质辅助激光解吸电离
14
质谱仪的性能指标包括
D
扫描时间
分辨率
检测质量范围
以上三个都是
15
质谱仪的进样系统包括
D
直接进样
气相色谱
液相色谱
以上都正确
16
MALDI是用于(((---)))的离子化方法
D
极性物质
热不稳定物质
小分子
大分子
17
飞行时间质量分析器是利用具有相同能量的带电荷粒子，由于(((---)))的差异而具有不同的速度，通过相同的漂移距离所用的时间不同而被分离
C
离子阱的分辨率比TOF要低
离子阱的优势是可以把离子存储起来从而提高了灵敏度
离子阱质谱不能和HPLC进行直接偶联
Q-TOF可以和ESI和MALDI离子源进行偶联
39
下列说法不正确的是：
A
Q-TOFs不能和HPLC进行直接偶联
三重四级杆可以进行中性丢失扫描
三重四级杆可以进行多反应监测扫描
三重四级杆只能和ESI进行偶联