克隆基因的表达
外源基因原核系统克隆表达的基本流程
外源基因原核系统克隆表达的基本流程
外源基因原核系统克隆表达的基本流程如下:
1. 设计引物:根据外源基因的序列,设计引物,其中至少包括一个启动子和一个终止子。
2. 基因克隆:使用PCR或其他克隆技术,将外源基因与载体DNA连接起来,形成重组质粒。
3. 转化:将重组质粒转化到适当的宿主细胞中,如大肠杆菌。
4. 筛选:通过选择性培养基或其他筛选方法,筛选出带有重组质粒的转化菌落。
5. 培养:将筛选出的转化菌落进行扩增培养,在适当的培养条件下培养细菌。
6. 表达:在培养过程中,外源基因会被宿主细胞转录和翻译,产生目标蛋白质。
7. 提取:收集细菌培养物,利用细胞破裂或其他细胞提取方法,提取目标蛋白质。
8. 纯化:通过各种纯化技术,如柱层析、电泳等,纯化目标蛋白质。
9. 鉴定:利用各种方法,如SDS-PAGE、Western blot等,对
目标蛋白质进行鉴定和定量分析。
10. 应用:利用纯化的目标蛋白质进行后续的研究或应用,如
功能鉴定、结构分析、抗原制备等。
这是一个基本的流程,根据不同的实验目的和具体情况,可能还会涉及到一些其他的步骤和操作。
基因克隆的原理
基因克隆的原理基因克隆是一种重要的生物技术手段,可以通过复制和传递DNA 分子,实现对特定基因的扩增和增殖。
基因克隆的原理是利用DNA 重组技术,将所需基因的DNA片段插入到载体DNA上,然后将重组的DNA转化到宿主细胞中进行复制和表达。
基因克隆的过程可以分为DNA分离、DNA切割、DNA连接和DNA转化等几个步骤。
需要从源生物体中提取目标基因所在的DNA。
DNA分离是基因克隆的第一步,通常使用细菌或真菌等生物作为DNA的来源。
提取DNA的方法有很多种,常见的有碱裂解法和酚氯仿法等。
这些方法能够将DNA从细胞中释放出来,获得纯净的DNA溶液。
接下来,通过DNA酶切割技术将目标基因从DNA中剪切出来。
DNA酶切割是基因克隆的关键步骤,通过使用特定的限制性内切酶,可以将DNA分子切割成特定的碎片。
限制性内切酶能够识别特定的DNA序列,并在特定的酶切位点上切割DNA,产生具有粘性末端的DNA片段。
然后,将目标基因与载体DNA进行连接。
载体是一种能够自我复制的DNA分子,可以将目标基因插入到载体中进行复制和表达。
常用的载体有质粒、噬菌体和人工染色体等。
连接的方法有多种,常见的是使用DNA连接酶将目标基因与载体DNA连接起来。
连接后的DNA分子称为重组DNA。
将重组DNA转化到宿主细胞中。
转化是指将重组DNA导入到宿主细胞中,使其能够进行复制和表达。
常用的转化方法有热激法、电穿孔法和化学法等。
转化后,宿主细胞将能够复制和表达重组DNA 中的目标基因。
基因克隆技术的应用非常广泛。
通过基因克隆,可以获得大量目标基因的DNA,用于研究基因的结构和功能,以及开发新的药物和治疗方法。
此外,基因克隆还可以用于制备重组蛋白、产生转基因生物和进行基因治疗等领域。
总结起来,基因克隆的原理是利用DNA重组技术将目标基因插入到载体DNA中,然后将重组DNA转化到宿主细胞中进行复制和表达。
基因克隆技术的应用非常广泛,对于研究基因和开发生物技术具有重要意义。
基因克隆和表达技术及其应用研究
基因克隆和表达技术及其应用研究在现代生物技术领域,基因克隆和表达技术被广泛应用于生物医药、农业生产、环境保护等多个领域,是一项重要的研究方向。
本文将介绍基因克隆和表达技术的原理、工具和应用,旨在深入探讨该技术在现代生物科技领域中的应用价值。
一、基因克隆的原理与工具基因克隆是指将目标DNA片段放入载体中,通过复制和传递,获得大量相同的DNA分子的过程。
基因克隆需要用到一系列工具和分子生物学技术。
其基本的步骤包括:DNA提取、限制酶切割、连接和转化等。
DNA提取是指从细胞中获取目标DNA,一般从细胞核中提取DNA样品。
限制酶切割是一种利用特定的限制酶将DNA切割成不同长度的碎片的技术。
连接是指将目标DNA片段与载体DNA进行配对,在适当的连接条件下会形成一个大的DNA分子,也称作重组DNA。
最后的转化是将重组DNA重新引入一个宿主细胞,使其进行繁殖。
这些步骤组成了一个典型的基因克隆工作流程。
在基因克隆中,一些关键工具也是必不可少的。
例如,限制酶和DNA连接酶是进行酶切和连接的酶类;载体是将目标DNA载入的载体分子。
当然,在实验设计过程中,也需要考虑到多种子序列的选择,以获得最优的结果。
二、基因表达技术基因表达技术是指将克隆好的基因转录和翻译为蛋白质的过程。
基因表达技术所涉及的核心部分主要为转染和转录。
转染是指将载体转化到目标细胞中的过程。
转染可以分为多次批量的直接转染和、转染载体的两种方式。
对于细胞质和细胞核分离的情况,病毒载体或质粒载体也可以被用来介导转录。
质粒载体在转录的时候需要被移入到细胞的核中,由此促进了 DNA 受体和 RNA聚合酶之间的相互作用。
另一种重要的基因表达技术是转录,也称作转录调节。
转录调节可以分为两类:正调节和负调节。
正调节是指通过上调特定基因的表达、促进特定转录的过程;负调节是指通过下调特定基因的表达、抑制特定转录的过程。
转录调节受到多种因素的影响,例如转录因子和超融合酶等分子的运作。
克隆基因的表达
(2)-35区与-10区之间的距离
这两个保守区间的距离越是接近于17bp,启 动子的活性就越强。
2.翻译起始序列对表达效率的影响 (1)SD序列
SD序列与16SrRNA分子之间的碱基互补程 度,可明显影响mRNA的翻译速度,当序列 为5‘-GGAGG-3’,可与16SrRNA3’端完 全互补,翻译效率最高;而当该序列发生 单碱基突变时,翻译效率会下降30倍。
特定的时间顺序发生,称之为基因表达的 时间特异性。
• 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶 段特异性。
(二)空间特异性 • 在个体生长全过程,某种基因产物在个体
按不同组织空间顺序出现,称之为基因表 达的空间特异性
• 基因表达伴随时间顺序所表现出得这种分 布差异,实际上是由细胞在器官的分布决 定的,所以空间特异性又称细胞或组织特 异性
七、原核表达体系
表达体系的建立包括表达载体的构建、受体细胞的 建立及表达产物的分离、纯化等技术 步骤: 获得目的基因-准备表达载体-将目的基因插入表 达载体中(测序验证)-转化表达宿主菌-诱导 靶蛋白的表达-表达蛋白的分析-扩增、纯化、 进一步检测
(一)获得目的基因
1.对外源目的基因的要求
原核生物缺乏真核生物转录后的加工系统; 同时也缺乏真核生物翻译后的加工系统, 所以目的基因不应具有5’端非编码区以及内 含子结构,只编码成熟的蛋白质或多肽
当需要宿主大量生长时,抑制载体质粒的复制。
当宿主大量生长后,再诱导载体质粒的复制,增 加拷贝数。
6.提高表达产物的稳定性
防止被宿主的酶降解 (1)设计成融合蛋白
基因克隆与表达及功能鉴定研究
基因克隆与表达及功能鉴定研究在现代生命科学领域中,基因克隆与表达以及功能鉴定是非常重要的研究方向之一,它涉及到许多生物医学、农业、工业和环境等领域的研究和实际应用。
本文将从基因克隆与表达的基本原理、方法、技术和应用,以及功能鉴定的原理、方法、技术和应用等方面进行探讨。
一、基因克隆与表达基因克隆是指通过分子生物学技术,将含有某个或某些特定基因的DNA序列从一个大的DNA分子(如染色体)中分离出来,然后插入到特定的载体DNA中,形成重组DNA分子的过程。
基因表达是指基因信息的转录和翻译过程,将基因的DNA序列转录成RNA分子,然后翻译成蛋白质分子的过程。
基因表达是生物体形成和发展的基础,也是生命活动的重要表现形式。
1. 基因克隆原理基因克隆的主要原理是利用限制酶、DNA连接酶、DNA聚合酶以及质粒或噬菌体等DNA载体的特性,将特定DNA序列插入到载体DNA中,形成重组DNA分子。
限制酶是一种能够识别、切割DNA分子特定序列的酶,其识别序列具有一定的特异性。
DNA连接酶是一种能够连接两个DNA分子的酶,常用的有T4 DNA连接酶和快速连接酶等。
DNA聚合酶是一种能够在DNA模板上合成互补链的酶,其作用是在重组DNA分子中完成互补链的合成。
2. 基因克隆方法基因克隆的主要方法有限制性片段长度多态性(RFLP)分析、聚合酶链式反应(PCR)克隆、原核表达克隆和真核表达克隆等。
RFLP分析是一种利用限制酶对DNA序列进行切割,并根据不同的RFLP位点进行区分的方法,其主要应用于基因型鉴定和进化研究等领域。
PCR克隆是一种利用PCR技术扩增目标基因或DNA片段,并将扩增产物克隆到载体DNA中的方法,其主要应用于基因检测、DNA测序和分子克隆等领域。
原核表达克隆是一种利用质粒或噬菌体等原核生物作为DNA载体,将外源基因转入细菌或古细菌等原核生物细胞中,通过蛋白质表达实现基因功能研究的方法。
真核表达克隆是一种利用真核生物(如哺乳动物、鸟类、昆虫、线虫等)作为DNA载体,将外源基因转入具有表达能力的真核细胞中,通过蛋白质表达实现基因功能研究的方法。
基因的克隆与表达课件
----TAC -----TTG GAC CTT AAG GAT CCA---
DNA序列
AAT CGG AAG AAT TCA GAC CTA GGT TTA GCC TTC TTA AGT CTG GCT CCA
基因的克隆与表达课件
位相载体----含有3种读码框的系列载体
基因的克隆与表达课件
优点: • 表达效率高 • 产物稳定 • 易鉴定:融合蛋白分子量大,电泳可
➢基因克隆(gene cloning) ➢基因表达(gene expression)
-原核基因表达 -真核基因表达
基因的克隆与表达课件
基因克 隆 Gene Cloning
基因的克隆与表达课件
➢概述 ➢克隆载体 ➢受体细胞 ➢体外重组的策略 ➢基因克隆工作流程
基因的克隆与表达课件
一、概述
• 确定了遗传信息的携带者,即基因的盆 子载体是DNA而不是蛋白质
基因的克隆与表达课件
(二)体外重组 连接体系的建立: • 温度:粘末端连接:12-18℃
平末端连接:室温(低于30℃) • DNA量:载体分子数/目的基因分子数
=1:1-3 • 酶量:平端连接时需加大酶量
基因的克隆与表达课件
(三)转化—Cacl2法、电击法
(四)重组子的筛选及鉴定
1、筛选:平板法(抗生素、蓝白斑)
基因的克隆与表达课件
二.原核生物基因结构和表达特点
基因的克隆与表达课件
• 原核生物染色体DNA是裸露的环形 DNA,其转录和翻译是偶联的连续 进行。
• 原核生物形成多顺反子mRNA: mRNA在合成过程中和多个核糖体 结合,翻译形成多条肽链。
基因的克隆与表达课件
3、一般不含内含子(intron),没有转 录及翻译后加工系统
基因工程中的基因克隆与基因表达实验总结
基因工程中的基因克隆与基因表达实验总结基因工程作为一门新兴的交叉学科,已经广泛应用于生物医学、农业、环境保护等领域。
其中,基因克隆和基因表达实验是基因工程的核心技术,对于研究基因功能和开发新药已经起到了重要作用。
本文将对基因工程中的基因克隆和基因表达实验进行总结,并探讨其在科学研究和应用中的前景。
一、基因克隆实验基因克隆是通过重组DNA技术,将感兴趣的基因从一个生物体中复制并插入到另一个生物体中的过程。
它是研究基因功能、生物制药和转基因等领域的基础。
基因克隆实验主要包括以下几个步骤:1. DNA提取与限制性内切酶切割:通过提取DNA样品,使用限制性内切酶切割将目标基因和载体DNA切割成相应片段。
2. 基因插入:将目标基因与载体DNA片段进行连接,常用的方法是使用DNA连接酶将两者黏合。
3. 转化与筛选:将连接后的DNA转入到宿主细胞中,使其成为转基因细胞。
通过选择性培养基进行筛选,可以获得拥有目标基因的转基因细胞。
通过基因克隆实验,我们可以获得不同生物体的目标基因,并进行后续的研究和应用。
例如,通过将某种植物的耐旱基因克隆到其他作物中,可以提高作物的抗旱能力,增加农作物产量。
二、基因表达实验基因表达实验是将目标基因在宿主细胞中进行转录和翻译,产生具有特定功能的蛋白质的过程。
基因表达实验是研究基因功能和制备重组蛋白等领域的重要手段。
基因表达实验主要包括以下几个步骤:1. 选择合适的表达系统:根据需要表达的蛋白质的性质和规模,选择合适的表达系统。
常用的表达系统包括细菌、酵母、哺乳动物细胞等。
2. 构建表达载体:将目标基因插入到表达载体中,通常使用限制性内切酶和DNA连接酶进行连接,并通过测序确保插入正确。
3. 细胞转染:将构建好的表达载体导入到宿主细胞中。
不同表达系统有不同的转染方法,如细菌的化学转型、酵母的电转染等。
4. 表达和纯化:经过一定时间的培养,宿主细胞会表达目标基因,合成目标蛋白质。
可以通过蛋白质纯化技术,如亲和层析、凝胶电泳等手段获得纯度较高的目标蛋白质。
基因克隆与表达
基因克隆与表达基因克隆与表达是生物学领域中重要的技术手段和研究方法。
通过基因克隆和表达,科学家能够研究特定基因的功能、调控机制以及其在生物体内的作用,这对于深入了解生物体的生理过程和疾病发生机制具有重要意义。
本文将介绍基因克隆与表达的原理、方法以及应用。
一、基因克隆基因克隆是将特定基因从一个生物体中分离并复制到另一个载体中的过程。
这个过程主要涉及DNA的分离、复制和连接。
常用的基因克隆技术包括PCR、限制性内切酶切割、琼脂糖凝胶电泳和基因插入等。
1. PCR聚合酶链反应(PCR)是一种强大的基因扩增技术。
它通过不断地重复某一特定区域的DNA序列,使其得以大规模复制。
PCR可以在短时间内合成大量目标DNA片段,为基因克隆提供了充足的材料。
2. 限制性内切酶切割限制性内切酶可以识别并切割特定的DNA序列。
通过选择合适的限制性内切酶,可以实现将目标基因从源DNA中切割下来,为下一步的基因克隆做好准备。
3. 琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分离技术。
通过将DNA样品加入琼脂糖凝胶槽中,并施加电场,DNA片段会根据其大小在凝胶中迁移。
凝胶电泳可以帮助科学家分离和纯化目标基因。
4. 基因插入基因插入是将目标基因连接到载体上的过程。
载体可以是质粒、病毒或者人工染色体等。
通过连接酶的作用,目标基因与载体可以稳定地结合在一起。
二、基因表达基因表达指特定基因通过转录和翻译过程转化为蛋白质的过程。
从基因克隆到基因表达,可以分为以下几个步骤:转染或转化、筛选和检测。
1. 转染或转化转染是指将外源DNA导入到动物细胞中的过程,而转化是将外源DNA导入到细菌细胞中的过程。
转染和转化可以通过多种方法实现,如化学法、电穿孔法和基因枪法等。
2. 筛选筛选是为了确定是否成功将目标基因表达在宿主细胞中而进行的步骤。
常见的筛选方法包括荧光筛选和克隆筛选。
荧光筛选利用荧光蛋白标记目标基因,观察细胞是否出现荧光信号。
克隆筛选则利用选择性培养基,筛选出含有目标基因的克隆。
基因工程7克隆基因的表达概述
7.3.1.2 终止子
提供转录停止信号的DNA序列称为终 止子,它可被RNA聚合酶识别并停止合成 mRNA。通常终止信号是一小段DNA片段 ,它的RNA转录本上碱基对可自身相互配 对形成柄-环结构。
强启动子是能维持高频率转录的启动子 ,通常控制那些细胞需要其大量转译产物的 基因转录;而弱启动子具有相对较低的转录 效率,指导那些仅需要其少量转译产物的基 因转录。
利用基因工程技术,可将由弱启动子所 控制的基因放在强启动子的下游,从而获得 高效表达。
两个保守区之间的DNA对启动子的功能 也有影响,各启动子都需要一些最适的间隙 ,通常认为间隙为17 bp的启动子功能较强。
(1) 能识别和除去外源基因中的内含子,加工 形成成熟的mRNA,即带内含子的天然基因是 可以利用的;
(2) 真核细胞将表达的蛋白糖基化,而大肠杆 菌表达的蛋白是无糖基化的,糖基化对某些表 达蛋白的免疫原性影响很大。
真核细胞作宿主表达系统尚存在以下几个问 题:
(1) 转化真核细胞的效率低; (2) 表达效率不够高; (3) 细胞培养(动植物) 工艺较复杂,成本高; (4) 选择标记及选择系统较少。
2. 影响mRNA转译效果的因素:
(1) SD序列与反SD序列的互补程度:互补程 度高,则表达强。
(2) SD序列与AUG之间的间隔距离(spacer), 使用不同的启动子,表达不同的基因,其 最佳间隔不一样。
(3) –20 bp到+13 bp这一段序列中不要有二级 结构(发卡结构)。
(4) 连接在SD序列后面的4个碱基的改变,会 对转译效率发生很大的影响,如果这个区 域由4个A组成,其转译作用最为有效;而 当其被4个C或G替代,则转译效率仅为最高 值的25~50%。
《基因克隆与表达》课件
2 留下问题和展望
引发学生对基因克隆与表达的思考和问题,并展望该领域的未来发展。
什么是基因克隆与表达
解读基因克隆与表达的定义, 了解其在基因研究中的作用。
基因克隆和表达的重要 性
探讨基因克隆与表达在科学 研究和应用中的重要价值。
课程大纲介绍本课程的内容和学习 Nhomakorabea 标,为后续的学习做好准备。
基因克隆
基因克隆是获取目标基因及其背后的DNA片段的过程。PCR、限制性酶切和连接反应是基因克隆中常用的关键 技术。
2 重组蛋白表达
探讨重组蛋白表达的步骤以及在基因工程和生物医药领域中的可行表达体系选择。
3 基因治疗
介绍基因治疗的原理和在疾病治疗中的应用前景。
结论
在基因研究和应用中,基因克隆和表达起着至关重要的作用。通过了解相关技术和应用,我们可 以更好地理解基因的功能和探索其在生物科学中的潜力。
1 基因克隆和表达的重要性再强调
PC R
探讨聚合酶链式反应(PCR)在 基因克隆中的原理、步骤和应 用。
限制性酶切
介绍限制性酶切的原理及其在 基因克隆中的应用。
连接反应
讨论连接反应在基因克隆中的 原理、步骤和应用。
基因表达
基因表达是指利用转化和重组蛋白表达系统来实现基因功能研究和基因治疗的过程。
1 转化
深入解析转化的原理、步骤和转化后的检测方法。
《基因克隆与表达》PPT 课件
这是一份专业的《基因克隆与表达》PPT课件,将带你深入了解基因克隆和表 达的重要性以及相关技术。通过本课件,你将掌握基因克隆和表达的关键步 骤和应用。
简介
基因克隆与表达是研究基因结构和功能的重要方法。本课程将介绍基因克隆与表达的基本概念、原理和技术, 并探讨其在生物科学研究和应用中的重要性。
基因克隆与表达的研究方法
基因克隆与表达的研究方法基因克隆和表达是生命科学中重要的研究方法,它们在基因工程、药物研发、癌症治疗等领域发挥着重要作用。
在克隆和表达一个基因之前,需要先建立一个可重复的实验方法,以确保实验结果的准确性和可靠性。
本文将介绍基因克隆和表达的一些通用方法和技术。
1. PCR扩增PCR扩增是一种常用的克隆方法,它可以在短时间内高效地扩增DNA序列。
这种方法需要一对引物,在PCR反应中引物定向扩增目标序列。
PCR反应需要一个DNA模板、引物和聚合酶,在合适的反应条件和温度下进行。
PCR扩增后的产物可以纯化、酶切、克隆到表达载体上。
2. 限制性内切酶消化限制性内切酶消化是一种分子生物学技术,可以将DNA分子切成不同的长度,并生成暴露的粘性末端。
这样的末端可以与其他的DNA分子的互补末端连接起来,从而实现DNA的克隆。
在DNA克隆中,选择合适的限制性内切酶可以实现目标DNA序列的克隆。
3. 匀浆凝胶电泳匀浆凝胶电泳是一种检测DNA大小的技术,它可以用于确认PCR扩增产物的大小,鉴定DNA克隆的有效性以及纯化DNA等。
在匀浆凝胶电泳中,DNA样品被负载到凝胶上,并在电场作用下迁移。
根据DNA分子大小的不同,可以通过在凝胶上形成特定的DNA带和条带,从而检测DNA分子的大小。
4. 蛋白表达的研究方法蛋白表达是生命科学研究中重要的实验方法,可以获得对生命过程和重要分子的深入了解。
在蛋白表达中,需要克隆一个给定的基因到一个特定的表达载体上。
表达载体中包含能够转录和翻译蛋白质所需的所有元件。
在表达系统中,可以使用细胞培养、原核生物、真核生物等不同的宿主来表达蛋白。
5. 功能分析的研究方法在获得基因克隆和表达蛋白之后,需要通过功能分析进一步了解目标基因和蛋白的生物学功能。
在功能分析中,常用的方法包括基因敲除、蛋白互作、基因组学、蛋白质修饰等。
通过这些方法,可以深入研究生物学体系的信号传导、调节机制、发育和疾病机制等问题。
分子生物学:基因克隆及克隆基因的表达
Bam HⅠ GGATCC CCTAGG
Bg lⅡ AGATCT TCTAGA
互连后?
GCCTAG+
GATCC G
ATCTAG+GATCTA
Ⅱ型限制性内切酶具有一些共性和特性:
5. 不同的酶可以识别同一个序列 同工异源酶(isoschizomer)或同裂酶 能识别同一序列(切割位点可同或不同)但来源不同的两种酶。
6. 水浴槽
8. 电泳系统
分子克隆常用的有毒试剂
1. 溴化乙锭: (Ethidium bromide,EB)用来染DNA和RNA的染料, 是一种致癌物 质;它是DNA突变的诱变剂,可以嵌入DNA,使DNA发生突变,致癌。 有累积 效应,不要直接接触,但是要注意通过呼吸摄入,故此环境要通风。EB可以被 皮肤吸收。做实验的时候一定要带手套。但是,只要按照标准的操作使不会有问 题的。严禁随便丢弃。因为EB是强致癌性,而且易挥发,挥发至空气中,危害 很大。
2. DEPC:DEPC即二乙基焦碳酸酯(diethylprocarbonate),可灭活各种蛋白质, 是RNA酶的强抑制剂;DEPC是一种潜在的致癌物质,在操作中应尽量在通风的 条件下进行,并避免接触皮肤。DEPC毒性并不是很强,但吸入的毒性是最强的, 使用时戴口罩。不小心占到手上注意立即冲洗。
3.苯酚:苯酚又名酚或石碳酸,为高毒类原浆毒物,对人体危害严重。它的浓溶液 对皮肤有强烈的腐蚀性,苯酚所致的急性中毒常常造成死亡。 4. 氯仿:三氯甲烷,侵入途径:吸入、食入、经皮吸收。健康危害:主要作用 于中枢神经系统,具有麻醉作用,对心、肝、肾有损害。吸入或经皮肤吸收引起 急性中毒,初期有头痛、头晕、恶心、呕吐、兴奋、皮肤粘膜有刺激症状,以后 呈现精神紊乱、呼吸表浅、反向消失、昏迷等,重者发生呼吸麻痹、心室纤维性 颤动、并可有肝、肾损害。误服中毒时,胃有烧灼感、伴恶心、呕吐、腹痛、腹 泻以后出现麻醉症状。慢性中毒:主要引起肝脏损害,此外还有消化不良、乏力、 头痛、失眠等症状,少数有肾损害。 5. 十二烷基硫酸钠(SDS):提取质粒使用的溶液II中含有SDS,对粘膜和上呼 吸道有刺激作用,对眼和皮肤有刺激作用。可引起呼吸系统过敏性反应。。 6. 其它常用的试剂如强酸强碱都有很强的腐蚀性。
基因克隆与表达
基因表达的检测方法
Northern blot:检测mRNA的方法,可用于检测基因的表达水平。
RT-PCR:通过逆转录和PCR技术,检测特定基因的表达水平。
Western blot:检测蛋白质的方法,可用于检测基因的表达产物。 免疫荧光技术:通过抗体与目标蛋白质的结合,利用荧光标记技术进行 检测。
基因克隆与表达的研究流程
同的后代。
克隆技术可以用 于繁殖动物、植 物和微生物,以 及用于生产转基 因生物和基因治
疗。
克隆技术的主要 步骤包括获取供 体细胞的DNA、 将DNA植入受 体细胞、培养产 生的胚胎并使其 发育成新个体。
克隆技术的优点 包括可以快速繁 殖具有优良性状 的动物和植物, 以及可以用于基 因治疗和药物生
产等领域。
生物安全:基因 克隆与表达技术 可用于检测和预 防生物威胁,如 生物武器和病原 体的传播,保障 公共安全。
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克隆技术的应用:克隆技术在医学、农业、生物技术等领域具有广泛的应用价值,例如 用于生产转基因动物、研究动物模型、繁殖濒危物种等。
克隆技术的分类
胚胎干细胞克隆技术 核移植克隆技术 转基因克隆技术 基因克隆技术
克隆技术的应用
添加项标题
克隆动物:通过基因克隆技术可以繁殖出具有相同基因的动物, 用于医学研究、药物筛选和动物模型建立等。
03 基因表达的调控
基因表达的概述
基因表达的定义:基因表达是指基因经过转录和翻译,将遗传信息传递给蛋白质的过程。
基因表达的调控方式:包括转录水平的调控、转录后的调控和翻译水平的调控。
基因表达的调控机制:包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等。
基因表达的生物学意义:基因表达调控对于生物体的生长发育、代谢和环境适应性等方 面具有重要意义。目的基因的获取:通过基因、PCR、基因合成等方法获取目的基因
基因工程中的基因克隆与表达
基因工程中的基因克隆与表达基因工程是一门涉及分子生物学、遗传学、生物化学等多个学科的综合性科学。
其中,基因克隆和基因表达是基因工程研究的两个重要方面。
本文将就基因克隆和基因表达的原理、方法及应用进行探讨。
一、基因克隆1.原理基因克隆是指将目标基因从其天然基因组或其他来源中分离出来,并将其插入到另一个载体(如质粒)中,使其能够在宿主细胞内复制和表达。
基因克隆的原理是基于DNA序列特异性杂交的方法,利用限制性内切酶切割目标DNA和载体DNA,然后将它们黏合在一起,形成重组DNA。
通过转形或感染,使重组DNA 进入宿主细胞内,并复制和表达。
2.方法基因克隆的方法主要有限制性酶切与黏合(RE-Mediated Ligation)、PCR(聚合酶链反应)、TA克隆和基因文库等。
限制性酶切与黏合是一种常用的基因克隆方法。
该方法利用限制性内切酶切割DNA,然后通过T4 DNA连接酶黏合在一起。
这种方法操作简单、效率高,但存在限制内切酶的局限性,无法应用于不同酶切位点的DNA。
PCR是用于复制DNA片段的重要方法,也可以用于基因克隆。
PCR方法可以在不使用限制酶的情况下,从任何源提取DNA片段,扩增需要的基因段,并使用酶切和连接技术插入到载体中。
TA克隆是指用于从PCR产物中克隆DNA的一种方法。
该方法利用了Taq聚合酶不完全特异性合成3'-末端斜伸的性质,使产生的末端序列与T自带的A进行互补配对,从而使PCR产物能够被直接连接到TA克隆载体上。
基因文库是一种重要的基因克隆技术,可以将许多目标基因同时克隆入同一载体中。
基因文库分为cDNA文库和基因组文库。
通过荧光筛选或选择性培养,可以从文库中筛选出感兴趣的基因。
3.应用基因克隆技术广泛应用于基因工程、疫苗制备、药物研发、作物改良、动物遗传改良、环境污染治理等领域。
例如,利用基因克隆技术可以创造出超级细菌、工业用酶、新型药物、高产优质作物等。
二、基因表达1.原理基因表达是指基因通过转录和翻译的过程,将DNA序列转化为蛋白质的过程。
分子生物学 基因克隆及克隆基因的表达
Bam HⅠ GGATCC CCTAGG
Bg lⅡ AGATCT TCTAGA
互连后?
GCCTAG+
GATCC G
A
+GATCT
TCTAG
ALOGO
Ⅱ型限制性内切酶具有一些共性和特性:
5. 不同的酶可以识别同一个序列 同工异源酶(isoschizomer)或同裂酶 能识别同一序列(切割位点可同或不同)但来源不同的两种酶。
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聚合酶链式反应
Polymerase Chain Reaction, PCR
体外高效特异性的扩增目的DNA片段
LOGO
LOGO
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LOGO
LOGO
PCR的基本原理
• PCR反应条件 • PCR过程 • PCR的特点
1
2
3
高温变性 低温退火 适温延伸
94
温
度 72
(℃)
55
22
DNA 2
3’
3’
5’
上游引物、5’ 引物、Sense primer
PCR反应扩增的就是一对引物之间的DNA片段,PCR反应 成功扩增的关键在于引物的正确设计。
引物设计的总原则——提高引物与模板结合的特异性。
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PCR引物设计的基本原则: 1.引物与模板的序列要紧密互补。 2.引物自身、引物之间不应存在互补序列。 3.引物不能在模板的非目的位点引发PCR。
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分子生物学关键的技术突破: DNA重组技术
1972年, 世界上第一个重组DNA分子诞生
1980年, 获诺贝尔化学奖
猿猴病毒DNA
噬菌体DNA
限制性内切酶
限制性内切酶
DNA连接酶 重组DNA分子
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第五章克隆基因的表达基因表达(gene expression)是指储存遗传信息的基因经过一系列步骤表现出其生物功能的整个过程。
典型的基因表达是基因经过转录、翻译,产生有生物活性的蛋白质的过程。
基因的表达主要涉及到两个过程:转录和翻译。
思考:基因表达与克隆基因表达的异同? 从表达的对象、过程、场所等方面考虑。
第一节影响外源基因表达的因素利用基因工程技术高水平表达各种外源蛋白质,无论在理论研究还是实际应用上都是十分重要的。
因此,如何使外源基因在宿主细胞中高效表达,成为基因工程中的关键问题。
应该指出,现在基因工程所涉及的受体细胞多种多样,从细菌到高等动植物细胞,乃至动、植物个体;而所涉及到的基因也是成千上万,各不相同,这种差别使得对特定基因的表达研究就有其特定的个性。
影响外源基因高效表达的各种因素:1. 外源基因的表达效率①启动子的强弱。
有效的转录起始是外源基因能否在宿主细胞中高效表达的关键步骤之一,也可以说,转录起始的速率是基因表达的主要限速步骤。
因此,选择强的可调控启动子及相关的调控序列,是组建一个高效表达载体首先要考虑的问题。
最理想的可调控启动子应该是:在发酵的早期阶段表达载体的启动子被紧紧地阻遏,这样可以避免出现表达载体不稳定,细胞生长缓慢或由于产物表达而引起细胞死亡等问题。
当细胞数目达到一定的密度,通过多种诱导(如温度、药物等)使阻遏物失活,RNA聚合酶快速起始转录。
②核糖体结合位点的有效性。
SD 序列是指原核细胞mRNA 5`端非翻译区同16S rRNA 3` 端的互补序列。
按统计学的原则,一般SD 序列至少含AGGAGG 序列中的4 个碱基。
SD 序列的存在对原核细胞mRNA 翻译起始至关重要。
③SD 序列和起始密码子AUG 的间距。
AUG 是最首选的起始密码子,GUG、UUG、AUU 和AUA有时也用作起始密码子,但非最佳选择。
另外,SD 序列与起始密码子之间的距离以9±3 为适宜。
④密码子组成。
尽量避免使用罕用密码子如:AGG、AGA(Arg)、CUA(Leu)等。
2. 表达质粒的拷贝数和稳定性多数情况下,目标基因的扩增程度同基因表达成正比,所以基因扩增为提高外源基因的表达水平提供了一个方便的方法。
对于原核和酵母表达体系而言,选择高拷贝数的质粒,以其为基础,组建表达载体。
表达载体的稳定性是维持基因表达的必需条件,而表达载体的稳定性不但同表达载体自身特性有关,也与受体细胞的特性密切相关。
所以在实际运用时,要充分考虑两方面的因素而确定好的表达系统。
利用选择压力、尽量减少表达载体的大小、通过建立可整合到染色体中去的载体等待方式,可以增加表达质粒的稳定性。
3.表达产物的稳定性①组建融合基因,产生融合蛋白。
融合蛋白的载体部分通过构象的改变,使外源蛋白不被选择性降解。
这种通过产生融合蛋白表达外源基因,特别是相对分子质量较小的多肽或蛋白编码的基因,尤为合适。
②产生可分泌的蛋白。
如将外源基因表达产物分泌到大肠杆菌细胞的周质或直接分泌到培养基。
③外源蛋白可以在宿主细胞中以包涵体形式表达,这种不溶性的沉淀复合物可以抵抗宿主细胞中蛋白水解酶的降解,也便于纯化。
④选用蛋白酶缺陷型大肠杆菌为宿主细胞,有可能减弱表达产物的降解。
⑤采用位点特异性突变的方法,改变真核蛋白二硫键的位置,从而增加蛋白质的稳定性。
4. 工程菌的培养条件由于细菌在100L以上的发酵罐中的生长代谢活动与实验室条件下200mL摇瓶中的生长代谢活动存在很大差异,在进行工业化生产时,工程菌株大规模培养的优化设计和控制对外源基因的高效表达至关重要。
优化发酵过程既包括工艺方面的因素也包括生物学方面的因素。
工艺方面的因素如选择合适的发酵系统或生物反应器,目前应用较多的有罐式搅拌反应器、鼓泡反应器和气升式反应器等。
生物学方面的因素包括多方面,首先是与细菌生长密切相关的条件或因素,如发酵系统中的溶氧、pH 值、温度和培养基的成分等,这些条件的改变都会影响细菌的生长及基因表达产物的稳定性。
生物因素的第二方面是对外源基因表达条件的优化。
在发酵罐内工程菌生长到一定的阶段后,开始诱导外源基因的表达,诱导的方式包括添加特异性诱导物和改变培养温度等。
使外源基因在特异的时空进行表达不仅有利于细胞的生长代谢,而且能提高表达产物的产率。
生物因素的第三方面是提高外源基因表达产物的总量。
外源基因表达产物的总量取决于外源基因表达水平和菌体浓度。
在保持单个细胞基因表达水平不变的前提下,提高菌体密度可望提高外源蛋白质合成的总量。
5.细胞的代谢负荷外源基因在细菌中高效表达,必然影响宿主的生长和代谢,而细胞代谢的损伤,又必然影响外源基因的表达。
合理地调节好宿主细胞的代谢负荷与外源基因高效表达的关系,是提高外源基因表达水平不可缺少的一个环节。
第二节外源基因在原核细胞中的表达系统外源基因在原核细胞中表达是基因工程操作中最初取得成功的途径。
1 原核生物基因表达的特点同所有的生命过程一样,外源基因在原核细胞中的表达包括两个主要过程:即DNA转录成mRNA和mRNA翻译成蛋白质。
与真核细胞相比,原核细胞的表达有以下特点:①原核生物只有一种RNA 聚合酶(真核细胞有三种)识别原核细胞的启动子,催化所有RNA 的合成。
②原核生物的表达是以操纵子为单位的。
操纵子是数个相关的结构基因及其调控区的结合,是一个基因表达的协同单位。
调控区主要分为三个部分:操纵基因(operator)、启动子(promotor)及其他有调控功能的部位。
③由于原核生物无核膜,所以转录与翻译是偶联的,也是连续进行的。
原核生物染色体DNA是裸露的环形DNA,转录成mRNA 后,可直接在胞浆中与核糖体结合翻译形成蛋白质。
在翻译过程中,mRNA可与一定数目的核糖体结合形成多核糖体(Polyribosome)。
两个核糖体之间有一定长度的间隔,为裸露的mRNA。
每个核糖体可独立完成一条肽链的合成,即这种多核糖体可以同时在一条mRNA 链上合成多条肽链,大大提高了翻译效率。
在双链DNA 分子中,只有一条链转录成mRNA,这条链称为有意义链(sense strand),该基因的另一条链则称反意义链(antisense strand)。
在含有许多基因的DNA 双链中,每个基因的有意义链并不是在同一条DNA 链上。
也就是说,一条链上既具有某些基因的有意义链,也含有另外一些基因的反意义链。
由于mRNA 聚合酶是沿着DNA 链的3’→5’方向移动,DNA 链与合成的RNA链有反平行关系,所以mRNA 链的合成方向是5’→3’,mRNA 上的信息的阅读是从多核苷酸链5'末端向3’末端进行。
从转录和翻译的方向也可看出,在原核生物细胞内当mRNA的合成还没有完成时,蛋白质或多肤的翻译就己经开始了。
④原核基因一般不含有内含子(intron),在原核细胞中缺乏真核细胞的转录后加工系统。
因此当克隆的含有内含子的真核基因在原核细胞中转录成mRNA 前体后,其中内含子部分不能被切除。
⑤原核生物基因的控制主要在转录水平,这种控制要比对基因产物的直接控制要慢。
对RNA 合成的控制有两种方式,一是起始控制(启动子控制),二是终止控制(衰减子控制)。
⑥在大肠杆菌mRNA的核糖体结合位点上,含有一个转译起始密码子及同16S核糖体RNA 3'末端碱基互补的序列,即SD 序列,而真核基因则缺乏此序列。
从上述特点可以看到,欲将外源基因在真核细胞中表达,必须考虑表达载体、外源基因的性质、原核细胞的启动子和SD 序列、阅读框架及宿主菌调控系统等基本条件,也就是说必须满足以下条件:⑴通过表达载体将外源基因导入宿主菌,并指导宿主菌的酶系统合成外源蛋白;⑵外源基因不能带有间隔顺序(内含子),因而必须用cDNA 或全化学合成基因,而不能用基因组DNA(genomic DNA);⑶必须利用原核细胞的强启动子和SD序列等调控元件控制外源基因的表达;⑷外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读框架(open reading frame);⑸利用宿主细胞的调控系统,调节外源基因的表达,防止外源基因的表达对宿主菌的毒害。
2 原核生物作为受体细胞具备的特点外源基因表达系统泛指目的基因与表达载体重组后,导入合适的受体细胞,并能在其中有效表达,产生目的基因产物(目的蛋白)。
由此可知,外源基因表达系统由基因表达载体和相应的受体细胞两部分组成。
基因表达系统有原核生物基因表达系统和真核生物基因表达系统。
目前应用最广泛的是原核生物基因表达系统,如大肠杆菌表达系统、芽胞杆菌表达系统等。
原核生物作为基因表达系统的受体细胞具有如下的特点:①原核生物大多数为单细胞异养,生长快,代谢易于控制,可通过发酵迅速获得大量基因表达产物。
②基因组结构简单,便于基因操作和分析。
③多数原核生物细胞内含有质粒或噬菌体,便于构建相应的表达载体。
④生理代谢途径及基因表达调控机制比较清楚。
⑤不具备真核生物的蛋白质加工系统,表达产物无特定的空间构象。
⑥内源蛋白酶会降解表达的外源蛋白,造成表达产物的不稳定性。
近年来,真核生物基因表达系统发展很快,真核生物如酵母菌、植物细胞、昆虫细胞和哺乳动物细胞等也被广泛用作基因表达系统的受体细胞,并构建了一系列相应的表达载体。
要使外源基因在细胞中高效表达,构建的表达载体必须具备基因表达的基本条件,这些条件包括外源基因在细胞中的拷贝数、基因转录的水平、mRNA 翻译的速率等。
大肠杆菌是一种革兰氏阴性细胞,其遗传背景清楚,目标基因表达的水平高,培养周期短,目前大多数外源基因都是以大肠杆菌为受体系统进行表达的,它是目前为止应用最广泛的基因。
3 在大肠杆菌中高效表达目的基因的策略大肠杆菌表达系统是目前应用最广泛的表达系统,由于待表达的外源基因结构具有多样性,尤其是真核生物基因的结构与大肠杆菌基因结构之间存在较大的差异,因而在构建表达系统时必须具体情况具体分析。
一般来说,高效表达外源基因必须考虑以下基本原则:①优化表达载体的设计。
为了提高外源基因的表达效率,在构建表达载体时对决定转录起始的启动子和决定mRNA 翻译的SD序列进行优化。
具体方法包括组合强启动子和强终止子;增加SD 序列中与核糖体16S rRNA 互补配对的碱基因序列,使SD 序列中6~8 个碱基与核糖体16S rRNA 的碱基完全配对;根据待表达外源基因的不同情况调整SD 序列与起始密码子ATG 之间的距离及碱基的种类;防止核糖体结合位点附近序列转录后形成“茎环”二级结构。
②提高稀有密码子tRNA 的表达作用。
多数密码子具有简并性,而不同基因使用密码子的频率不相同。
大肠杆菌基因对某些密码子的使用表现了较大的偏爱性,在几个同义密码中往往只有一个或两个被频繁地使用。
如编码Pro 的密码子包括CCG、CCC、CCU 和CCA 等,而其中的表达系统。