ImageJ软件给图片添加标尺
如何在ImageJ中设置比例尺
如何在ImageJ中设置比例尺
吴旧生(浙江大学,浙江杭州)
前面曾写过利用imageJ进行灰度和长度测量的教程,从浏览和下载的量来看,还是有较多人对此感兴趣,并有部分人来信要求提供比例尺的测量方法。
测量方法如下:
1)打开ImageJ,从文件菜单中打开一要分析的照片或图片(这里假设图片内置比例尺)。
不带比例尺的图片的方法要复杂一些,准备另外撰文说明。
2)利用直线工作点击比例尺的起点,拖动至比例尺的终点松开鼠标。
3)从analysis菜单下选择measure 命令。
取得图片上的内置比例尺的长度(像素值)。
测量结果显示比例的像素值为73.5像素。
4)根据比例尺的像素值和已知长度设置比例尺。
在analysis菜单下选择set scale进行比例尺设置。
在distance in pixels后面填入刚才获得的像素值,在known distance后面填入已知长度(如上图的360,Unit of length后面填上已知长度的单位(上例中是m)。
选定
Global前面的复选框,则比例尺可以多张图像中分享。
设置完毕,点OK搞定。
5)利用比例尺进行长度测量。
选择曲线工具,沿地图上的西湖周边设点,对合后选择analysis菜单下measure命令,结果西湖一周约9407米。
6)。
imagej粒度分析
1、打开imagej软件
2、File——open,打开图片
3、设置阈值。
Image——adjust——threshold——若分析内容为空洞,则点击一次apply;若
分析内容为凸起,则点击两次apply。
使要分析的部位变为深色。
4、进行标尺设定。
Analyse——setscale,软件会自动判断图中标尺中像素个数,在known
distance中设定自己图片标尺的长度,并且将unit of length中的单位设定为自己标尺的单位。
如图,known distance设为5,unit of length设为μm。
5、分析并输出结果。
Analyze——analyze particles,在show中选取outlines,并点选display
result和exclude on edges,或可根据自己的需要选择不同选项。
最后点击ok,即可得到
结果,可把结果复制到excel中分析。
6、设置输出选项。
在analyze—analyze measurements
中设置输出选项,得到自己想要的结果。
比如周长、面
积、灰度值等。
imagej的使用方法
imagej的使用方法
ImageJ是一款功能强大的图像处理软件,可以帮助用户轻松地进行图像的测量、分析、编辑等操作。
本文将指导用户如何使用ImageJ来处理图像。
首先,用户需要下载ImageJ软件,然后将图像导入ImageJ中。
用户可以选择从本地文件夹中导入图像,也可以从网络中导入图像,比如URL、FTP等。
接下来,用户可以通过ImageJ的图像处理功能对图像进行处理。
用户可以根据自己的需要调整图像的亮度、对比度、饱和度等参数。
此外,ImageJ还支持用户对图像进行滤镜处理、裁剪、旋转和缩放等操作。
同时,ImageJ还支持用户对图像进行测量和分析。
用户可以通过ImageJ的测量工具来测量图像中的面积、长度和角度等信息。
此外,ImageJ还拥有强大的图像分析功能,可以帮助用户分析图像中的细节信息,提取出图像中的特征和目标。
最后,用户可以通过ImageJ对图像进行编辑。
ImageJ提供了大量的编辑工具,可以帮助用户轻松添加文字、图标、标签等内容,以增加图像的可读性。
总之,ImageJ是一款强大的图像处理软件,可以帮助用户轻松地
进行图像的测量、分析、编辑等操作。
通过本文的指导,用户可以轻松地使用ImageJ来处理图像。
imagej教程
(二片拖入imagej。imagej能识别鼠标所 在位置的像素点坐标。记下标尺上单位长度所对应的像素点 距离。此标尺中1405个像素点距离对应100 um。
(2)设置281个像素点对应20 um。
(3)将需要设置标 尺的金相照片拖入软 件。点开Scale Bar对 话框。
imagej软件对金相照片加标尺和碳化物统计
报告人:马凯
目录
(一)Imagej软件介绍 (二)Imagej软件给金相照片加标 尺
(三)Imagej软件统计第二相
(一)imagej软件介绍
• ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除 了基本的图像操作,比如缩放,旋转, 扭 曲,平滑处理外,ImageJ还能进行图片的 区域和像素统计,间距,角度计算,能创 建柱状图和剖面图,进行傅里叶变换。
(4)在ScaleBar对话框里设置需要的标尺长 度,位置,颜色等。
(5)将已经设置好 标尺的金相照片导 出。
对比度高的第二项统计
(1)将要统计第二相的金相照片拖入imagej。
M42一次淬火三次回火后500×金相照片
(2)将金相照片转换成8-bit格式。
(2)调节碳化物和基体的对比度,以尽量清 晰准确显现碳化物的轮廓为止。
(3)点击Analyze Particles选项,出现右侧对 话框。输入要统计的碳化物的尺寸范围。
(4)结果依次碳化物数目、面积大小,平均 尺寸,面积分数。这里面积单位是平方微米, 如果没有Set Scale,面积以像素点为单位。
ImageJ基础操作:给图片添加文字和标注
ImageJ基础操作:给图片添加文字和标注对图片添加标注和文字是科研图片处理中一个非常基础的操作,Image J也可以进行这方面的处理。
01利用描边和填充添加在绘制好选区(几乎只会用到箭头工具)之后选择:Edit-Draw (描边,快捷键Ctrl+D),使用事先设定好的颜色和粗细进行绘制;也可以填充设定好的颜色Edit-Fill(填充,快捷键Ctrl+F)。
文字工具也是如此,在输入文字之后,选择Edit-Draw,可以盖印到原来图片上。
如果要修改颜色、字体、粗细等绘图属性,可以选择Edit-Option-Colors/Fonts/Line Width…进行修改。
当然,其中一些选区工具如Arrow T ools(箭头工具)可以直接双击该工具修改其绘图属性。
颜色的修改还可以双击工具栏中的Color Picker(拾色器)来修改:当然,Fiji也提供简单的绘图工具,包括Pencil Tool(铅笔工具)、Paintbrush T ool(画笔工具)、Flood Fill Tool(填充工具)和Overlay Brush T ool(浮层画笔工具),可以直接或者以Overlay的形式在图片上面进行涂鸦,但是科研图片处理中基本用不到。
每个工具都可以双击进行属性修改。
02 利用ROI Manager添加也可以将标注(文字和箭头等)以选区的形式保存到选区管理器(ROI Manager)里面,勾选Show All,然后利用拼合图层(Flatten)来盖印生成新的图片。
注意:会新生成一个添加了标注的图片。
03 利用Overlay图层添加在利用选区工具和文字工具做好标注之后,还可以使用Image-Overlay-Add Selection(快捷键是Ctrl+B),来建立Overlay图层,最后直接导出成非tif格式图片,获得标注后的图片。
或者建立Overlay图层之后,利用ROI Manager的拼合图层(Flatten)在本图层盖印,再导出成各种位图格式。
ImageJ软件给图片添加标尺
用Image J软件给图片加标尺Image J是著名的免费图像分析软件。
首先打开图片(点击图1中Open按钮)图1然后点击图2中set scale设置相关参数。
图2原图片实际像素及大小用Photoshop中看出(图3所示)。
像素为1360×1024,大小为23.99×18.06 cm。
由于对拍摄实物进行了640倍放大,计算出1360像素对应拍摄实物的长度为(23.99×10000/640μm)。
然后计算一个像素对应长度。
如图4所示设置参数,设置参数为3.60像素对应1.00微米,然后点上Global,有效数字与图4中相同,点OK。
具体数据仔细计算后得到,这里只是简单说明。
图3图4 然后点击图5所示,设置标尺格式。
图5图6表示设定参数后最终所得效果,可以随心设定标尺长度,颜色,字体大小,位置等,点OK确定。
然后按图7另存为想要的格式(一般Jpeg或Tiff即可)就可。
图6 图7仅供个人用于学习、研究;不得用于商业用途。
For personal use only in study and research; not for commercial use.Nur für den pers?nlichen für Studien, Forschung, zu kommerziellen Zwecken verwendet werden.Pour l 'étude et la recherche uniquement à des fins personnelles; pas à des fins commerciales.обучения,для исследований и не должны которые используются толькодля людей,использоватьсявкоммерческихцелях.以下无正文仅供个人用于学习、研究;不得用于商业用途。
ImageJ给照片加标尺
用Image J软件给图片加标尺
Set Scale 【设置像素数长度与实际长度的对应关系】设置比例尺
Scale Bar 【沿用Set Scale的比例关系和长度单位】加入标尺
P=aRM
a- 希望标注的实际尺寸大小(如100um)
P- 照片分辨率(尺寸的单位要和a一致)
M- 放大倍数
照片分辨率有的软件提取不正确,需要注意。
怎样确定像素与单位长度的比例关系
在照片上没有刻度的情况下,确定标尺长度与像素的关系你必须至少知道以下信息:
1. 拍摄照片时的实际放大倍率M。
2. 照片的分辨率R (像素/英寸)。
假设在R (像素/英寸)分辨率条件下照片上的标尺长度b(宏观的,毫米或厘米)代表实际大小a(微观的,微米或纳米),那么:M=b/a,
另外,标尺长度b是有P个像素组成的,那么R=P/b, =>P=aRM.根据以上的关系你可以给照片确定一个合适的标尺长度。
注意:计算的过程中量纲要一致。
最新imagej教程PPT课件
3. Vddq部分電路:
3
3 .3 V C
12V 2 .2 K
1 10
U2 2A 7621 4 36K
15
Q 1A 2
16 1
C
C C 8 .2 K
5
G -T Y P E Q E T
2. 當G-TYPEDET為低電平時,U22的4Pin為1.24V,使U22的3Pin
電位為3.4V左右.這時Q1的VDS電壓降為3.3V-1.5V=1.8V.相當于
一個串聯穩壓電路.
VDDQ= R1+R2 *1.24=(1+R1/R2)1.24=1.5V R2
三.Fat-Tire架构
★北橋(815) U97
2. 2. PCI擴展槽 PCI作為一种擴展槽,主要用于插聲卡,网 卡,SCSI卡等.DIMM槽作為內存插槽,可以提供64位線寬的 數据,常見的SDRAM有66MHZ,83MHZ,100MHZ和133MHZ, 另外還有72線和30線的內存插槽和72線只能提供32位線 寬的數据,現已被淘汰.
主板上主要的時鐘頻率:(FBB)
功能:1.連接CPU与高速外設,如System,Memory, AGP,Display,Cach 2. 緩沖二級外設為CPU的連接,使二級外設与CPU的速度匹配.
815 IC 主要有以下几個功能接口:
1. CPU Interface:
a. 64 根數据線;
b. 32根地址線; c. 22 根控制線.
(3)点击Analyze Particles选项,出现右侧对 话框。输入要统计的碳化物的尺寸范围。
使用ImageJ给图片加尺度
使用ImageJ给图片加尺度在科学研究和图像处理中,给图片加上尺度是一个常见的任务,这可以帮助我们更好地理解和分析图像中的对象大小。
ImageJ是一款免费的图像处理软件,它提供了丰富的功能和插件,可以轻松地将尺度添加到图片上。
以下是使用ImageJ给图片加尺度的简单步骤:2. 打开图片:启动ImageJ软件后,点击菜单栏中的 "File",然后选择 "Open..." 或 "Import..." 选项来打开你想要加尺度的图片。
你也可以直接拖拽图片到ImageJ的窗口中。
3. 添加尺度:在ImageJ的窗口中,点击菜单栏中的"Analyze",然后选择 "Set Scale..." 选项。
在弹出的对话框中,输入尺度的实际长度(比如1mm)和单位(比如mm),然后点击 "OK"。
你也可以选择其他选项,比如尺度条的样式和位置等。
4. 应用尺度:在 "Set Scale..." 对话框关闭后,选择 "Analyze"菜单中的 "Show Info" 选项。
在图片的左上角,你将看到已经添加了尺度的图片。
你还可以点击图片上方的 "IJ" 按钮,选择 "label",来显示尺度的数值。
5. 保存图片:在进行尺度处理之后,如果需要保存图片,请点击菜单栏中的 "File",然后选择 "Save As..." 或 "Export..." 来保存处理后的图片。
这些是使用ImageJ给图片加尺度的简单步骤。
通过这些步骤,你可以轻松地在你的图片中添加尺度,以帮助你更准确地分析和理解图像的内容。
它对于科学研究、医学影像学、生物学实验等领域都非常有用。
老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)
老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)今天我们继续来聊一聊ImageJ的高阶使用技巧。
问题三、为什么总是全部圈起来的灰度值,有没有大神指导呢求助!本问题涉及免疫印迹(Western Blot)分析,提问者不能分别得到每个条带的值。
灰度值0为纯黑,255为纯白,灰度值与光密度值(OD值)的关系如下图所示:以灰度来统计WB条带的话,无条带的纯白255左右,条带越黑着色越深灰度值反而越小,这与我们的认知不符。
步骤:1. File -> Open -> 打开需要分析的WB条带。
2. Image –> Type -> 8-bit, 将图像转换为8-bit的灰度图片;Image-> Invert,黑白反转,得到如下图片:3. Analyze -> Calibrate, 校正光密度值Function中选择Uncalibrated OD,左下方Global calibration,勾选表示有多张图片打开时对所有图片进行此操作。
否则只对当前图片进行此操作。
4. 在工具栏中选择矩形工具——Rectangular, 最左边的为矩形工具,选择条带:键盘上按数字1,弹出如下提示框:点Yes,键盘上按数字3,得到如下:5. 工具栏中选择直线工具——Straight,下图最右边的为直线工具,按住Shift键使用直线工具画竖线将步骤4的峰进行分割:6. 选择魔棒工具——Wand tool,分别点击分割好的峰,即可得到结果,保存结果(File -> Save as…)即可:7. WB统计分析一般将对照组标准化为100%或1,上述结果6个条带前3个为对照组。
在Excel中,先计算对照组3个的平均值(AVERAGE(B2:B4)):然后所有B列的数值除以对照组平均值,此时对照组的均值为1:8. 将所得数据放入Graphpad prism绘图即可:拓展:弯曲的WB条带应如何使用ImageJ拉直?1. 使用Segmented line沿着倾斜条带画间断线段:2. 双击Segmented line,设置线段的宽度至包含所有条带:3. 点击菜单栏Edit -> Selection-> Straighten,倾斜的WB条带即可拉直:问题四、如何统计SEM图片小球数量?步骤:1. 打开ImageJ软件,File -> Open打开SEM图片。
使用ImageJ对照片进行标尺处理
使用ImageJ对照片进行标尺处理
1. 打开ImageJ软件,并导入需要处理的照片。
点击菜单栏的“文件”(File),选择“打开”(Open),然后选择要处理的照片文件。
2. 在工具栏中选择“直线选择工具”(Straight Line Selection Tool)。
这个工具用于画出标尺线。
3. 在照片上点击并拖动鼠标,绘制出一条标尺线。
确保标尺线与物体的边界对齐,以便准确测量尺寸或距离。
4. 单击菜单栏的“分析”(Analyse),选择“设置标尺”(Set Scale)。
在弹出的对话框中,输入物体实际尺寸或使用已知的标准单位进行设置。
例如,如果标尺线的长度为10厘米,则在“已知距离”(Known Distance)字段中输入10,并选择合适的单位(如“厘米”)。
5. 在同一个对话框中,选择标尺线的起点和终点,并输入其对应的实际距离。
点击“OK”按钮,完成标尺设置。
6. 可以进行进一步的测量或编辑,如测量其他物体尺寸或距离,添加文字或箭头标注等。
7. 完成标尺处理后,保存处理后的照片。
点击菜单栏的“文件”(File),选择“保存”(Save),然后选择保存文件格式和路径。
注意事项:
- 在绘制标尺线时,要确保图像缩放比例一致,以便准确测量。
- 如果是处理多个照片,可以使用批处理功能来自动处理大批
量的图片。
以上是使用ImageJ对照片进行标尺处理的简要步骤。
通过这
些步骤,您可以方便地对照片进行标尺处理,以满足不同应用场景
的需求。
面积计算步骤
如何利用ImageJ计算面积
1.首先需确认图片类型为“8-bit”,方法:“image---type---8-bit”;
2.设定标尺:选择直线工具(主工具栏straight line),对照拍照时的标
尺画出一根同样长度的线。
如果需要精确,可以在按straight line 后,按键盘上的“箭头”增大图像进行标示。
打开主菜单的analyze–>set scale,在打开的窗口中设置known distance为标尺长度,在unit of length输入单位,如nm(默认是cm),点上“global”,按“确定”。
在下面可以看到具体的像素单位比例。
3.若目标颗粒与背景衬度差明显,可通过“process---binary---make
binary”设置阈值(threshold),以区分目标物和背景;若目标物与背景差别不大,或背景复杂,可通过freehand selections手动描绘出目标物区域范围,具体看第4项;
4.利用“freehand selections”确定目标物边界:
5.分析并输出结果:analyze---analyze particles,在show中选取
outlines,并点选display result和exclude on edges,或可根据需要选择不同选项;最后点击ok,即可得到结果。
键盘上的“m”可作为快捷键,一按即可弹出results。
6.设置输出选项:在analyze---analyze measurements中设置输出选项,
比如周长、面积、灰度值等自己想要的结果。
三种作图软件给图片加标尺的方法
三种作图软件给图片加标尺的方法图片上标尺的意义在于展示出图片上的一定距离实际代表的距离,日常所用的加标尺的软件无非PS、Image J和Image pro plus这几种。
11. PS添加标尺a. 打开一张需要加标尺的图片,点击左侧工具栏中的矩形工具b. 使用矩形工具画一个矩形,填充颜色选择黑色,并使用文字工具写出实际代表的距离12. Image J添加标尺a. 打开图片(这里,我们选择同一张图片),点击直线工具,在图片右下角画出长度一定的直线b. 点击Analyze,选择Set Scale, 直线的距离为120 pixels,已知距离是1cm,Unit of length为cm,Global对所有后续打开图片有效,否则只对当前图片有效,点击OK。
Scale为120 pixels/cmc. 点击Analyze,T ools,选择Scale Bard. 在此可以选择需要添加的标尺的长度Width in mm,Height in pixels 调节标尺的高度,Font size调节显示字样的大小,Color显示标尺颜色,标尺的背景Background一般选择None,Location选择标尺添加的位置,点击OK。
13. Image pro plus 6.0添加标尺a. 打开一张图片,点击Measure,Calibration,Spatial,出现如下界面b. 点击New,然后点击第一个Image,出现如图所示,可以拖曳左上角的标尺到合适的位置,想要的长度,在Scaling中填写具体标尺的长度,比如20,点击OKc. 单位填入μm,点击Apply。
d. 点击Spatial Calibration,选择刚刚校正的标尺信息e. 点击Marker,之前已经设置单位为μm,Marker length选择为20 unit,Style有两种选择一种是将标尺添加到图片上,保存以后会在图片中保留。
下面可以选择标尺的不同风格,可根据需要自行选择,点击OK。
ImageJ给照片加标尺
ImageJ给照片加标尺
即实际大小与标尺长度的比例关系等于放大倍数。
在Image J软件中,可以通过Set Scale功能设置像素与实际长度的对应关系,然后再用Scale Bar功能添加标尺。
需要注意的是,照片的分辨率可能会影响标尺长度的提取,因此要确保分辨率正确无误。
在没有刻度的情况下,确定标尺长度与像素的关系需要知道拍摄照片时的实际放大倍率和照片的分辨率。
假设在照片上标尺长度b代表实际大小a,那么放大倍数M等于标尺长度与实际大小的比例关系。
在Image J软件中,可以利用Set Scale 功能设置像素与实际长度的对应关系,然后再用Scale Bar功能添加标尺。
需要注意的是,照片的分辨率可能会影响标尺长度的提取,因此要确保分辨率正确无误。
为了给图片加标尺,我们需要使用Image J软件中的Set Scale和Scale Bar功能。
首先,通过Set Scale功能设置像素与实际长度的对应关系,然后再用Scale Bar功能添加标尺。
在确定像素与单位长度的比例关系时,需要知道拍摄照片时的实
际放大倍率和照片的分辨率。
需要注意的是,照片的分辨率可能会影响标尺长度的提取,因此要确保分辨率正确无误。
同时,标尺长度与实际大小的比例关系等于放大倍数,这也是我们确定比例关系的重要信息。
使用ImageJ给照片添加刻度尺
使用ImageJ给照片添加刻度尺步骤一:安装和启动ImageJ安装完成后,启动ImageJ软件。
步骤二:导入照片在ImageJ软件界面上,你会看到一个菜单栏和一个工具栏。
点击菜单栏上的 "File",然后选择 "Open",从你的计算机中导入你想要编辑的照片。
步骤三:选择刻度工具在工具栏上,你会看到一系列不同的工具。
我们需要选择刻度工具来添加刻度尺。
点击工具栏上的 "Straight Line Tool"(直线工具),然后将鼠标放在照片上想要添加刻度尺的位置。
步骤四:测量刻度尺使用直线工具在照片上绘制一条与实际刻度长度相对应的直线。
然后,点击菜单栏上的 "Analyze",选择 "Set Scale"(设定刻度),进入测量刻度尺的界面。
在测量刻度尺的界面中,输入刻度长度和相应的单位。
同时,确保 "Global"(全局)选项被选中,并点击 "OK" (确定)按钮。
步骤五:添加刻度尺回到照片上,在直线工具下拉菜单中,选择 "Segmented Line Tool"(分段线条工具)。
然后,点击照片上的刻度线的两个端点来绘制出完整的刻度尺。
步骤六:保存和导出照片当刻度尺添加完成后,点击菜单栏上的 "File",然后选择"Save"(保存),将图片保存在你的计算机上。
如果你想将照片导出为其他格式,点击菜单栏上的 "File",然后选择 "Save As"(另存为),选择导出格式,并点击 "Save"(保存)按钮。
注意:为了保持图像质量,请尽量选择无损压缩格式如PNG 或TIFF进行保存。
以上就是使用ImageJ给照片添加刻度尺的步骤。
希望本文对你有所帮助!。
imagej计算划痕方法
imagej计算划痕方法
在ImageJ中,您可以使用以下步骤计算划痕宽度:
1. 首先打开需要分析的划痕图片。
2. 然后选择“Analyze”菜单,在下拉菜单中选择“Set Scale”。
在弹出的对话框中输入已知的实际距离,例如划痕的实际宽度,并选择适当的单位。
点击“OK”按钮应用标尺校正。
3. 接下来,选择“Analyze”菜单,在下拉菜单中选择“Plot Profile”。
沿着划痕的方向拖动十字标尺,生成一个划痕宽度的分布图。
4. 在生成的划痕宽度分布图中,您可以看到每个像素点的宽度值。
通过这些值,您可以计算出划痕的平均宽度。
通过以上步骤,您可以在ImageJ中准确地计算出划痕的宽度。
请注意,您需要提前了解划痕的实际宽度以便进行标尺校正。
论文中的图片添加标尺
用ImageJ软件给图片添加标尺我们在论文中的插入的图片由于受到篇幅限制,一般直接拍摄的图片太大需要缩小处理,太小的标尺就会看不清,如图1中所示的红色标尺已经看不清了,此时我们需要在图中添加一个较大的标尺。
如果已知图片拍摄的放大倍数,可以直接使用ImageJ(可点击直接下载)软件进行处理,如果不清楚已知放大倍数,在这里我又用了一个附加的软件小飞尺(可点击直接下载)。
图1下面来具体介绍如添加标尺:首先将需要添加标尺的图片打开(图2、3,这里的放大倍数已知)图2图3如图4、图5,设置相关参数,原图片的实际尺寸及像素可用Photoshop中看出(图5左),像素为1280x960,大小是12.7x9.53cm。
由于对拍摄实物进行了2000倍的放大,计算1280像素对应拍摄实物的实际大小是(12.7X10000/2000μm)。
然后计算单位长度对应的像素数,这里仅给出计算结果,即实物每μm对应的像素数为20.157,因此在图5右中设置值为20.157,其他选项设置如图所示,单击ok。
图4图5然后设置标尺格式,图6、图7。
图7为最后的结果,最后将图片重新保存。
图6图7若不记得放大倍数的图片也可以,用类似的方法得到近似结果:使用ImageJ加标尺的关键是确定单位长度对应的像素数,不清楚放大倍数可以用小飞尺软件来测量单位长度的像素数。
如图8所示,测量了图片中微观尺寸20μm对应的像素数约为200,由于图片在这里的显示是50%,所以原始图片微观20μm对应的像素应该是400,即每μm对应约20个像素(和上面计算的20.157有误差)。
结下了的步骤和已知放大倍数和宏观大小的方法相同。
图8。
老司机带你解锁ImageJ长度分析
老司机带你解锁ImageJ长度分析ImageJ分析长度一般方法最常见的长度分析为直线的长度分析,在ImageJ新建线段长短、粗细不一的图片:分析步骤:1、点击Analyze -> Set Measurements进入测量参数界面,选择Bounding rectangle参数,Area与Limit to threshold,点击OK:2、Image -> Adjust -> Threshold选中五个不同的形状,红色代表选中:3、Analyze -> AnalyzeParticles分析粒子,选择Display results、Add to Manager,点击OK:得到测量结果,Width为各形状长度:此外对于简单的长度测量还可以使用手动测量的方法,选择Straight直线工具沿着形状绘制直线后点击Analyze -> Measure进行测量形状1长度,与前述方法相同所得长度一致,均为97:扩展:非直线的手动长度计算,以拟南芥初生根长度分析为例。
步骤:1、使用ImageJ软件打开待分析图片:2、选择工具栏Segmented line工具,手动确定锚点追踪主根长度:这样追踪的主根长度不够平滑,可使用Edit-> Selection -> Fit Spline进行处理后点击Analyze ->Measure进行测量。
对于Fit Spline处理的效果可见下图,右侧是原始折线,左侧为Fit Spline处理后的效果:ImageJ计算植物根系长度以2016年Front Plant Sci文献【1】中的拟南芥初生根(primary root)长度分析为例给大家分享使用ImageJ计算曲线长度。
分析步骤:1、ImageJ软件(FiJi版本ImageJ 1.52 t)File -> Open打开示例图片(为RGB格式图片)。
Process -> Enhance Contrast增强对比度,默认Saturated pixels 0.3%:左侧为原图,右为Enhance Contrast处理效果:2、Image -> Type -> HSB Stack将RGB格式图片转换为HSB 格式,即H(hues)表示色相,S(saturation)表示饱和度,B (brightness)表示亮度H。
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Pour l ' é tude et la recherche uniquement
à des fins personnelles; pas
à des fins commerciales.
только длял юдейко, торыиес пользуюдтлсяоя б ученияссл, едоваин нией д олжны
использоваться
в коммерческих целях.
以下无正文
图3
图4 然后点击图 5 所示,设置标尺格式。
图5
图 6 表示设定参数后最终所得效果,可以随心设定标尺长度,颜色,字体大小, 位置等,点 OK确定。然后按图 7 另存为想要的格式(一般 Jpeg 或 Tiff 即可) 就可。
图6 图7
仅供个人用于学习、研究;不得用于商业用途。
For personal use only in study and research; not for commercial use.
For personal use only in study and research; not for commercial use.
Nur f ü r den pers?nlichen f
ü r Studien, Forschung, zu kommerziellen Zwecken verwendet werden.
Nur f ü r den pers?nlichen f
ü ellen Zwecken verwendet werden.
Pour l ' é tude et la recherche uniquement
à des fins personnelles; pas
用 Image J 软件给图片加标尺
Image J 是著名的免费图像分析软件。首先打开图片(点击图 1 中 Open按钮)
图1 然后点击图 2 中 set scale 设置相关参数。
图2 原图片实际像素及大小用 Photoshop 中看出(图 3 所示)。像素为 1360×1024, 大小为 23.99 ×18.06 cm 。由于对拍摄实物进行了 640 倍放大,计算出 1360 像 素对应拍摄实物的长度为( 23.99 × 10000/640 μm)。然后计算一个像素对应长 度。如图 4 所示设置参数,设置参数为 3.60 像素对应 1.00 微米 , 然后点上 Global , 有效数字与图 4 中相同,点 OK。具体数据仔细计算后得到,这里只是简单说明。
à des fins commerciales.
только длял юдейко, торыиес пользуюдтлсяоя б ученияссл, едоваин нией д олжны
использоваться
в коммерческих целях.
以下无正文
仅供个人用于学习、研究;不得用于商业用途。