基因诊断-肿瘤的分子诊断
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1、直接采用PCR技术进行基因诊断
通过PCR技术扩增特异性的基因,可以确定病原 生物基因是否存在或分析疾病相关的体内基因缺失 或基因突变
2、采用PCR产物的限制性片段长度多态性分析
(PCR-RFLP)
基因突变导致的基因碱基组成和顺序发生改变,会 在基因结构中产生新的限制性内切酶位点或使原有限制 性内切酶位点消失。因此,突变基因经相应的限制性内 切酶水解后,其电泳条带的数量和大小就会发生改变, 根据这些改变可以判断突变是否存在。即限制性片段长 度多态性技术。
PCR-RFLP就是利用PCR技术先将包含待测位点的 DNA片段扩增出来,然后用识别该位点的限制性内切酶 水解,根据限制性片段数量和长度作出诊断。
3、采用PCR结合等位基因特异性寡核苷酸探针杂交技术
等位基因特异性寡核苷酸探针技术(ASO)原理: 针对已知突变位点的基因,可以分别针对已知突变
位点的序列,设计一对寡核苷酸探针,其中一条为野生 型探针,与无突变序列互补,另一个为突变型探针,与 突变序列互补。同时设计探针时,突变碱基应位于探针 的中央,这样在严格控制杂交和洗脱条件下,只有完全 互补的探针保留下来,形成稳定杂交分子,而中央碱基 与靶序列不匹配的探针则被洗脱。
2.基因诊断的特点:
(1)直接检测基因,属病因诊断,针对 性强;
(2)特异性强、灵敏度高:由于基因诊 断采用核酸分子杂交、聚合酶链反应等 技术;
(3)适用范围广:其应用的范围已从原 先局限的遗传性疾病扩大到感染性疾病、 肿瘤、心血管疾病等领域。
基因诊断的评价
• 特异性 • 灵敏度 • 重复性 • 快速 • 经济
(二)基因诊断的基本原理与临床意义
1.基本原理:
通过检测致病基因(包括内源基因与外源基因)的 存在、量的多少,结构变化与否及表达水平是否正常, 以确定被检查者是否存在基因水平的异常变化,以此作 为疾病确诊的依据。
2.临床意义:
•
对有表型出现的疾病作出明确诊断
Leabharlann Baidu
•
早期快速诊断
•
确定个体对疾病的易感性
• 疾病的分期分型、疗效监测、预后判断等
采用PCR结合等位基因特异性寡核苷酸探针杂交技术
PCR/ASO则是采用PCR扩增受检者基因的目标 片段,并与相应的ASO探针杂交,如果受检者DNA扩 增的产物与正常探针杂交,而不与突变探针杂交,表 示受检者不存在突变基因;如果只有突变探针可以杂 交,说明突变基因为纯合子;如果两者都存在,则说 明突变基因为杂合子。
二、基因诊断的常用技术与方法
(一) 基因诊断的常用技术 (二) 基因诊断的基本方法
(一)基因诊断常用技术
1. 核酸分子杂交 2. PCR(聚合酶链式反应) 3. 限制性酶切分析 4. SSCP(单链构象多态性分析) 5. DNA 测序 6. DNA 芯片技术
基因诊断技术分类
1、Molecular hybridization:
对致病性微生物应选用其最保守、最特 异的序列;对突变基因的检测,应用含有突 变位点的序列或待测基因编码的mRNA序 列。
探针的标记物
• 放射性标记物
32P,35S,125I,3H
• 非放射性标记物
❖生物素,地高辛,荧光素, 酶, 金属
Southern blot
NTTNT T
N
1、Southern blot:用于DNA检测,不但能检测出特异
杂交 去除未参与杂交的探针
加入标记核酸探针
检测杂交信号
探针的种类
• DNA 探针:基因组DNA探针;基因探针 • cDNA探针:目前应用最广泛的 • 寡核苷酸探针(Oligonucleotide probes) • RNA 探针:
不同的探针在应用中有各自的特点,但最 重要的是探针的序列选择.而探针序列又是依 据待测核酸序列选择的。
Southern, Northern, dot blot,
2、PCR 3、DNA测序 4、DNA芯片技术
1. 核酸分子杂交
Molecular hybridization
• Southern blot——DNA • Northern blot——RNA • Dot blot, • In Situ Hybridization,
的DNA片段,还能进行定位和测定分子量,可用于基因的 限制性内切酶图谱分析、基因突变分析等。
2、Northern blot:杂交用于RNA检测,能对组织细胞
中的总RNA或mRNA进行定性和定量分析。
3、dot blot:既可检测DNA也或检测RNA,用于基因组
中特定基因及其表达的定性和定量分析。缺点:特异性 较低,不能鉴定所分析的基因分子量。
一、基因诊断概述
(一) 基因诊断的概念与特点 (二) 基因诊断的基本原理与临床意义
(一)基因诊断的概念与特点
1.概念:
指利用分子生物学技术,从DNA或 RNA水平检测基因的存在、分析基因的 结构变异和表达状态,对疾病作出诊断 的方法和过程。
• 基因诊断以DNA和RNA为诊断材料,
•
DNA诊断
•
RNA诊断
核酸杂交的基本原理:
利用核酸变性和复性理论:(1)双链 DNA分子在某些理化因素作用下解旋, 条件恢复后又可恢复其双螺旋结构; (2)具有互补碱基序列的异源核酸单 链之间同样可按碱基互补配对原则通 过氢键结合为双链。
核酸分子杂交的流程示意图
• 待测核酸制备 滤膜上核酸固化
• 制备探针核酸片段
探针标记
4、原位杂交:在组织、细胞和染色体水平作核酸定性
和定量分析,并可定位。
(二)PCR技术是基因诊断的一种基础技术
PCR是在试管内 利用DNA聚合酶 催化的反应反复 进行同一段DNA 片段合成的过程
PCR技术的优点
➢特异性强 ➢灵敏度高 ➢操作简单、省时 ➢对待检原始材料质量要求低 ➢高效率的基因扩增技术
βΑ/βΑ βΑ/βS βS/βS
正常探针 突变探针
4、PCR产物的反相点杂交分析技术
第八 章 基因诊断
Gene Diagnosis
人类疾病的原因
• 内因:
基因结构改变(基因突变)——点突变、 插入、缺失、重排、易位、基因扩增
基因结构多态性 基因表达异常
• 外因:
病原体的侵入
对于疾病的诊断依据:
• 临床表现 • 实验室诊断技术:
细胞学检查 生物化学代谢产物和酶的活性变化检查 免疫学检验 基因诊断