第四章 基因克隆载体1
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染色体整合在一起. 3)在宿主细胞或受体细胞中自我复制或随整合
的受体细胞染色体DNA一起复制. 4)外源基因能在受体细胞中表达. 5)克隆载体进入细胞后有可供选择标记
2 克隆载体的分类
2.1 按构建克隆载体DNA的来源分类
a)质粒载体:大肠杆菌质粒载体,枯草杆菌质粒载体, 酵母质粒载体,农杆菌质粒载体,蓝细菌质粒载体
3、Con区:接合转移编码区,该区存在着与细菌间接 合转移的有关基因(tra),调控Ti质粒在 农杆菌之间的转移。
4、Ori区:复制起始区
3) 农杆菌Ti质粒载体的构建
双质粒系统介导外源基因整合的流程
第三节 噬菌体衍生的克隆载体
1 λ噬菌体克隆载体
1.1λ噬菌体的一般特性 λ噬菌体的组成
结构:外壳蛋白 DNA
E)抗性基因:抗菌素抗性基因,Apr,Tcr. F)产毒素基因:大肠杆菌素基因(Col-质粒). G)降解基因:降解重金属、有机物和农药等.
H) 致瘤基因:诱导某些组织形成肿瘤,如Ti质粒,Ri质粒.
2 质粒载体的构建
2.1 质粒构建的基本要求
1)构建的质粒载体能转化受体细胞,并在其中进行 松弛型复制.
3 几种常见的质粒载体
1)pBR322:
2)pUC18-19:含有pBR322的Apr基因和复制的起始 点,部分缺失的Lac操纵子片段,并在Lac Z’区组
装了MCS.
3)pGEM-T TA克隆载体(promega Co.)
4)pGEX系列融合蛋白表达载体(Pharmacia Co.)
5)
体:pGEX-2T,pGEX-3X d)真核(Eukaryotic)表达载体:pSVK3,pBPV e)转录(TranscHale Waihona Puke Baiduiption)载体:pSL1190 f)普通载体(General vector):pBR322,pUC18
第二节 质粒克隆载体
1 质粒载体的一般特性
1)质粒的组成与构型
质 粒 (plasmid) 是 一种存在于宿主细 胞中染色体外裸露 的双链DNA分子.
b) λ基因组DNA上有多种限制酶识别位点. c) λ噬菌体包装DNA的大小为原λDNA长度的
75-105%( 38-54 kb).
λ噬菌体的溶菌和溶原繁殖方式
1.2 λ基因组DNA的结构
1.3 λ噬菌体载体构建的策略
a)去除部分限制酶识别位点 b)去除非必需区DNA J-N;P-Q c)插入可供选择的标记基因
细胞内:超螺旋环状共价双链DNA分子 细胞外:超螺旋、开环,线形
双螺旋共价闭合 环(超螺旋)
开环双螺旋 (一个裂口)
线状双螺旋 (两个裂口)
质粒载体的特性
质粒DNA分子的大小: 细菌质粒的大小相差较大,小 的仅不足1kb,大的可达数百kb.
不相容性(Incompatible):两种类似的但又不同 的质粒不能存在于同一细胞中.
B)Rep基因:在质粒的复制过程中,Replication基因会指令宿 主细胞合成一种调节蛋白,促进质粒的复制.
C)Inc基因:决定两种亲缘关系相近的两种质粒不能存在于同 一宿主细胞中.
D)Tra基因:指令宿主细胞合成菌毛(Pilus)和细胞表面物, 促使宿主细胞与受体细胞表面结合,遗传物质的转移.
e)染色体和质粒DNA兼有的载体(Chrosmid vector) 基因整合平台系统;YAC克隆载体
2.2 按克隆载体的用途分类
a)cDNA克隆载体:λgt11,pT7T3, b)原核(Prokaryotic)表达载体:pKK223-3 c)原核基因融合(Prokaryotic gene fusion)载
pET-28 系列融 合蛋白 表达载 体
6) 真 核 表 达 载 体
7)启动子活性分析载体pAc-GFP1-1
8)Ti质粒载体
1、T-DNA区:转移DNA,农杆菌侵染细胞时,从Ti质 粒上切割下来转移到植物细胞上的一段DNA
2、Vir区:毒区,激活T-DNA转移。与T-DNA区相邻, 共占Ti质粒DNA的1/3。
第四章 基因克隆载体
第一节 基因克隆载体的特点与分类
1 基因克隆载体的含义及特点
含义:能够把外源DNA片段带入受体细胞并进行稳定遗 传的DNA或RNA分子.
Foreign gene
MCS
Marker
基因克隆载体的特点
特点:1)具备与外源DNA片段连接和重组的克隆位点. 2)进入受体细胞后能稳定存在于细胞质中或与
* 选择松弛型质粒复制起始子(Ori)
2) 构建的质粒载体含有克隆外源DNA的位点(MCS) 3) 构建的质粒载体含有选择标记基因(Apr,Tcr,Kmr) 4) 构建的质粒载体分子量小,转化效率高,插入外源片
段较大.
2.2 质粒构建的策略
1. 选择合适的出发质粒; 2. 正确获得构建质粒载体的元件; 3. 组装合适的选择标记基因; 4. 选择合适的启动子。
形态:头部 尾部
λ噬菌体的电子显微镜照片
λ基因组DNA的特点
a) 在噬菌体内呈线性双链DNA分子(48502bp) 在两端各有12个碱基组成的5’单链互补粘 性末端(Cohesive end ),进入宿主细胞后, 粘性末端连接形成环状分子(Cos位点). 5’-GGGCGGCGACCTXX…XXG-3’ XX…XXCCCCGCCGCTGGA-5’
b)噬菌体载体:双链DNA噬菌体载体λ;单链DNA噬菌 体载体,M13,T3,T7
c) 病 毒 载 体 : 植 物 病 毒 载 体 CaMV ( 花 椰 菜 花 斑 病 病 毒);动物病毒载体 SV40(猿猴空泡病毒)
d)质粒和噬菌体DNA兼有的载体:Phasmid 载体(含有 f1 噬菌体的ori);Cosmid 载体(含有λDNA的Cos 区)
可转移性:质粒可通过接合作用等方式转移到新的 宿主细胞中.
复制性:质粒DNA分子只在宿主细胞内进行单向复制, 其复制受质粒本身和宿主细胞遗传系统的双重控制, 质粒提供复制的起始位点和核苷酸的序列.
质粒上的相关基因
A)COP因子:决定质粒的拷贝数,在质粒的复制过程中指令细 胞合成阻物,当质粒复制到一定的拷贝时,阻物的量也积 累到足以阻止质粒的复制.
外源片段的整合及体外组装
2. Cosmid克隆载体
2.1 Cosmid载体的特点 a)兼有λ噬菌体和质粒载体的特点. 含有λ噬菌体Cos位点(可进行体外包装)和 细菌质粒载体的复制子(选择标记, 可在细 菌中保存和大量复制). b)可插入大片段外源DNA.
的受体细胞染色体DNA一起复制. 4)外源基因能在受体细胞中表达. 5)克隆载体进入细胞后有可供选择标记
2 克隆载体的分类
2.1 按构建克隆载体DNA的来源分类
a)质粒载体:大肠杆菌质粒载体,枯草杆菌质粒载体, 酵母质粒载体,农杆菌质粒载体,蓝细菌质粒载体
3、Con区:接合转移编码区,该区存在着与细菌间接 合转移的有关基因(tra),调控Ti质粒在 农杆菌之间的转移。
4、Ori区:复制起始区
3) 农杆菌Ti质粒载体的构建
双质粒系统介导外源基因整合的流程
第三节 噬菌体衍生的克隆载体
1 λ噬菌体克隆载体
1.1λ噬菌体的一般特性 λ噬菌体的组成
结构:外壳蛋白 DNA
E)抗性基因:抗菌素抗性基因,Apr,Tcr. F)产毒素基因:大肠杆菌素基因(Col-质粒). G)降解基因:降解重金属、有机物和农药等.
H) 致瘤基因:诱导某些组织形成肿瘤,如Ti质粒,Ri质粒.
2 质粒载体的构建
2.1 质粒构建的基本要求
1)构建的质粒载体能转化受体细胞,并在其中进行 松弛型复制.
3 几种常见的质粒载体
1)pBR322:
2)pUC18-19:含有pBR322的Apr基因和复制的起始 点,部分缺失的Lac操纵子片段,并在Lac Z’区组
装了MCS.
3)pGEM-T TA克隆载体(promega Co.)
4)pGEX系列融合蛋白表达载体(Pharmacia Co.)
5)
体:pGEX-2T,pGEX-3X d)真核(Eukaryotic)表达载体:pSVK3,pBPV e)转录(TranscHale Waihona Puke Baiduiption)载体:pSL1190 f)普通载体(General vector):pBR322,pUC18
第二节 质粒克隆载体
1 质粒载体的一般特性
1)质粒的组成与构型
质 粒 (plasmid) 是 一种存在于宿主细 胞中染色体外裸露 的双链DNA分子.
b) λ基因组DNA上有多种限制酶识别位点. c) λ噬菌体包装DNA的大小为原λDNA长度的
75-105%( 38-54 kb).
λ噬菌体的溶菌和溶原繁殖方式
1.2 λ基因组DNA的结构
1.3 λ噬菌体载体构建的策略
a)去除部分限制酶识别位点 b)去除非必需区DNA J-N;P-Q c)插入可供选择的标记基因
细胞内:超螺旋环状共价双链DNA分子 细胞外:超螺旋、开环,线形
双螺旋共价闭合 环(超螺旋)
开环双螺旋 (一个裂口)
线状双螺旋 (两个裂口)
质粒载体的特性
质粒DNA分子的大小: 细菌质粒的大小相差较大,小 的仅不足1kb,大的可达数百kb.
不相容性(Incompatible):两种类似的但又不同 的质粒不能存在于同一细胞中.
B)Rep基因:在质粒的复制过程中,Replication基因会指令宿 主细胞合成一种调节蛋白,促进质粒的复制.
C)Inc基因:决定两种亲缘关系相近的两种质粒不能存在于同 一宿主细胞中.
D)Tra基因:指令宿主细胞合成菌毛(Pilus)和细胞表面物, 促使宿主细胞与受体细胞表面结合,遗传物质的转移.
e)染色体和质粒DNA兼有的载体(Chrosmid vector) 基因整合平台系统;YAC克隆载体
2.2 按克隆载体的用途分类
a)cDNA克隆载体:λgt11,pT7T3, b)原核(Prokaryotic)表达载体:pKK223-3 c)原核基因融合(Prokaryotic gene fusion)载
pET-28 系列融 合蛋白 表达载 体
6) 真 核 表 达 载 体
7)启动子活性分析载体pAc-GFP1-1
8)Ti质粒载体
1、T-DNA区:转移DNA,农杆菌侵染细胞时,从Ti质 粒上切割下来转移到植物细胞上的一段DNA
2、Vir区:毒区,激活T-DNA转移。与T-DNA区相邻, 共占Ti质粒DNA的1/3。
第四章 基因克隆载体
第一节 基因克隆载体的特点与分类
1 基因克隆载体的含义及特点
含义:能够把外源DNA片段带入受体细胞并进行稳定遗 传的DNA或RNA分子.
Foreign gene
MCS
Marker
基因克隆载体的特点
特点:1)具备与外源DNA片段连接和重组的克隆位点. 2)进入受体细胞后能稳定存在于细胞质中或与
* 选择松弛型质粒复制起始子(Ori)
2) 构建的质粒载体含有克隆外源DNA的位点(MCS) 3) 构建的质粒载体含有选择标记基因(Apr,Tcr,Kmr) 4) 构建的质粒载体分子量小,转化效率高,插入外源片
段较大.
2.2 质粒构建的策略
1. 选择合适的出发质粒; 2. 正确获得构建质粒载体的元件; 3. 组装合适的选择标记基因; 4. 选择合适的启动子。
形态:头部 尾部
λ噬菌体的电子显微镜照片
λ基因组DNA的特点
a) 在噬菌体内呈线性双链DNA分子(48502bp) 在两端各有12个碱基组成的5’单链互补粘 性末端(Cohesive end ),进入宿主细胞后, 粘性末端连接形成环状分子(Cos位点). 5’-GGGCGGCGACCTXX…XXG-3’ XX…XXCCCCGCCGCTGGA-5’
b)噬菌体载体:双链DNA噬菌体载体λ;单链DNA噬菌 体载体,M13,T3,T7
c) 病 毒 载 体 : 植 物 病 毒 载 体 CaMV ( 花 椰 菜 花 斑 病 病 毒);动物病毒载体 SV40(猿猴空泡病毒)
d)质粒和噬菌体DNA兼有的载体:Phasmid 载体(含有 f1 噬菌体的ori);Cosmid 载体(含有λDNA的Cos 区)
可转移性:质粒可通过接合作用等方式转移到新的 宿主细胞中.
复制性:质粒DNA分子只在宿主细胞内进行单向复制, 其复制受质粒本身和宿主细胞遗传系统的双重控制, 质粒提供复制的起始位点和核苷酸的序列.
质粒上的相关基因
A)COP因子:决定质粒的拷贝数,在质粒的复制过程中指令细 胞合成阻物,当质粒复制到一定的拷贝时,阻物的量也积 累到足以阻止质粒的复制.
外源片段的整合及体外组装
2. Cosmid克隆载体
2.1 Cosmid载体的特点 a)兼有λ噬菌体和质粒载体的特点. 含有λ噬菌体Cos位点(可进行体外包装)和 细菌质粒载体的复制子(选择标记, 可在细 菌中保存和大量复制). b)可插入大片段外源DNA.