琼脂糖凝胶电泳检测DNA

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dna琼脂糖凝胶电泳实验报告

dna琼脂糖凝胶电泳实验报告

dna琼脂糖凝胶电泳实验报告DNA琼脂糖凝胶电泳实验报告引言:DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学实验技术,用于分离和分析DNA 分子。

本实验旨在通过琼脂糖凝胶电泳技术,对DNA分子进行分离和鉴定,以便更好地了解DNA的结构和功能。

实验材料和方法:实验所需的材料包括琼脂糖凝胶、DNA标准品、DNA样品、缓冲液和电泳仪等。

首先,我们制备了琼脂糖凝胶,然后将DNA标准品和待测DNA样品与DNA加载缓冲液混合。

接下来,将混合液注入琼脂糖凝胶槽中,并进行电泳。

实验结果:经过电泳后,我们观察到琼脂糖凝胶上出现了一系列DNA条带。

根据标准品的条带迁移距离,我们可以推断出待测DNA样品的分子大小。

通过比较待测样品与标准品的条带迁移距离,我们可以进一步确定待测样品中的DNA分子的大小。

讨论:琼脂糖凝胶电泳是一种基于DNA分子大小的分离技术。

在琼脂糖凝胶中,DNA 分子会受到凝胶孔隙的阻碍,较大的DNA分子迁移速度较慢,而较小的DNA分子则迁移速度较快。

通过测量DNA分子的迁移距离,我们可以推断出其分子大小。

在实验中,我们使用了DNA标准品作为参照物,通过标准品的迁移距离,我们可以建立一个标准曲线,从而对待测样品中的DNA分子大小进行估计。

这种方法可以应用于DNA样品的定性和定量分析。

需要注意的是,琼脂糖凝胶电泳实验的结果受到多种因素的影响,如琼脂糖凝胶浓度、电场强度和电泳时间等。

因此,在进行实验时,我们需要控制这些因素,以确保实验结果的准确性和可靠性。

结论:通过DNA琼脂糖凝胶电泳实验,我们成功地分离和鉴定了DNA分子。

这项实验为我们进一步研究DNA的结构和功能提供了基础。

同时,琼脂糖凝胶电泳技术也广泛应用于生物医学研究、法医学和遗传学等领域,为科学研究和医学诊断提供了重要的工具和方法。

总结:DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分离和鉴定技术。

通过电泳实验,我们可以分离不同大小的DNA分子,并通过测量其迁移距离来推断其分子大小。

DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法

DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法

DNA的琼脂糖凝胶电泳DNA实验技术方法琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis)是一种常用的分离和分析DNA分子的技术方法。

本文将对DNA的琼脂糖凝胶电泳实验技术方法进行详细介绍。

1.原理琼脂糖凝胶电泳是一种基于DNA分子大小的分离方法。

DNA分子在电场的作用下,由于带负电荷,会向阳极移动。

由于琼脂糖凝胶的孔径不同,不同大小的DNA分子会被琼脂糖凝胶所阻碍,大分子相对较慢,小分子相对较快地通过凝胶孔隙。

通过电泳,可以将不同大小的DNA分子分离开来,形成一条条带状。

2.实验步骤(1)制备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖加入1×TAE缓冲液中,加热溶解,冷却至约60℃时加入适量的乙溴酸溶液,振荡均匀后倒入电泳槽中,插入梳子形成孔洞。

(2)样品制备:将待测DNA溶解在缓冲液中(常用缓冲液为1×TBE或1×TAE),加入适量的显色剂(如溴化乙锭),混合均匀。

(3)装料和电泳:将样品倒入琼脂糖凝胶的样品槽中,注意避免气泡的产生。

将电泳槽连接电源,接通电源,设定适当的电压(通常为100-150V)进行电泳。

(4)分析结果:电泳结束后,关闭电源,取出凝胶,放入紫外光透射仪中观察凝胶上的DNA带状条带,并进行照相或记录。

3.实验注意事项(1)凝胶制备:凝胶溶液要充分均匀,避免不均匀分布造成的电泳结果不准确。

(2)样品制备:样品在加入缓冲液中时要充分混匀,避免DNA在样品中的不均匀性造成的电泳结果不准确。

(3)电泳条件:电泳条件包括电压、时间、缓冲液等。

较高的电压可以加快电泳速度,但会产生较多的带展平现象。

合适的电压应根据实验需要调整。

(4)结果分析:在紫外光透射仪下观察DNA带状条带时,要小心操作,避免DNA样品受到过长时间的紫外线照射。

4.应用领域琼脂糖凝胶电泳广泛应用于分离和分析DNA分子。

常见的应用领域包括:DNA片段的分子量测定、PCR产物分析、DNA测序结果的验证、突变检测等。

实验三-琼脂糖凝胶电泳检测DNA

实验三-琼脂糖凝胶电泳检测DNA
个磷酸解离,整个分子带正电; pH 8左右时,碱基几乎不解离,而磷酸全部解 离,整个分子带负电。
在碱性环境下,不同的核酸分子由于具有相同的磷酸戊糖结构,几乎具有 相同的电荷密度,其电泳行为线性分子在凝胶中的迁移率与其所含碱基对数目 的对数值成反比。可以近似用于估算分子的大小。
鲁东大学 生命科学学院 School of Life Sciences
思考题
1.影响核酸在琼脂糖凝胶电泳中迁移速率的因素有哪些?
2.电泳中加入Loading buffer的作用是什么?
鲁东大学 生命科学学院 School of Life Sciences
鲁东大学 生命科学学院 School of Life Sciences
8、上样:用加样器吸取样品,轻轻的加入到凝胶的样品孔中。加样量一般10~ 30μl。
9、盖上电泳槽,接通电源,开始电泳。 开始电泳前,再次确认凝胶样品孔处于电场的负极。电泳条件:接通电泳槽与电 泳仪的电源,调节电压100V 30min,当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1-2cm处,停 止电泳。
鲁东大学 生命科学学院 School of Life Sciences
注意事项
1. 倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃ ,否则温度太高会使 凝胶盘变形。 2. 胶一定要凝固好才能拔梳子,方向一定要竖直向上,不要弄坏 点样孔。 3.点样时枪头下伸,点样孔内不能有气泡。 4.EB有毒,切勿用手接触,更不要污染环境,胶勿乱扔,紫外线 照射不宜太久。
鲁东大学 生命科学学院 School of Life Sci Nhomakorabeances
3. 溴化乙锭(EB)是一种吖啶类染料,它在紫外灯照射下能发射荧光,当DNA 样品在琼脂糖凝胶中电泳时,琼脂糖凝胶中的EB就插入DNA分碱基对子中形成 荧光络合物,使DNA发射的荧光增强几十倍,电泳后就可直接紫外灯照射下检 测琼脂糖中的DNA。

琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告

琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告

琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和检测DNA的方法,通过琼脂糖凝胶电泳可以对DNA进行分离和鉴定,广泛应用于分子生物学和遗传学领域。

本实验旨在通过琼脂糖凝胶电泳检测DNA,以便对DNA进行分析和鉴定。

实验材料和方法:1. 实验材料,琼脂糖凝胶、DNA样品、电泳缓冲液、DNA分子量标准品、电泳仪等。

2. 实验方法:a. 制备琼脂糖凝胶,按照说明书将琼脂糖加入电泳缓冲液中,加热至完全溶解后倒入凝胶板中,待凝固后形成琼脂糖凝胶。

b. 加载DNA样品,将待检测的DNA样品与DNA分子量标准品混合后加入琼脂糖凝胶槽中。

c. 进行电泳,将装有琼脂糖凝胶的电泳槽连接至电泳仪,设定合适的电压和时间进行电泳。

d. 染色和观察,电泳结束后,取出琼脂糖凝胶进行染色,并在紫外透射仪下观察DNA条带的分离情况。

实验结果:经过琼脂糖凝胶电泳检测,我们观察到了DNA在琼脂糖凝胶上的分离情况。

通过比对DNA分子量标准品的条带位置,我们可以初步确定待检测DNA的分子量。

同时,根据DNA条带的数量和位置,我们还可以初步判断待检测DNA的纯度和完整性。

实验讨论:琼脂糖凝胶电泳是一种简单而有效的DNA检测方法,通过该方法可以对DNA进行分离和鉴定。

然而,在实际操作中,我们也需要注意一些问题,比如加载样品时要均匀、染色后要及时观察等。

另外,电泳条件的选择也会对实验结果产生影响,需要根据实际情况进行调整。

结论:通过本次实验,我们成功地利用琼脂糖凝胶电泳对DNA进行了检测,初步确定了待检测DNA的分子量、纯度和完整性。

这为我们进一步的DNA分析和研究奠定了基础。

总结:琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA检测方法,通过该方法可以对DNA进行分离和鉴定。

在实际操作中,我们需要严格控制实验条件,以确保实验结果的准确性和可靠性。

希望本次实验结果能对相关研究工作提供一定的参考和帮助。

实验五 琼脂糖凝胶电泳分离DNA

实验五 琼脂糖凝胶电泳分离DNA

2、胶板的制备
①取有机玻璃内槽,洗净,晾干,用橡皮膏将有机玻璃内 槽的两端边缘封好(一定封严,不能留缝隙)。
②将有机玻璃内槽放置于一水平位置,并放好样品梳子。
③将冷却到60℃左右的琼脂糖凝胶液(约40ml),缓缓倒入 有机玻璃内槽,直至有机玻璃板上形成一层均匀的胶面
(注意不要形成气泡)。
④待胶完全凝固后,双手轻用力取出梳子(注意勿使样 品槽破裂),即可见到长方形孔格,取下橡皮膏,放在 电泳槽内。
⑤加入1×TAE电泳缓冲液至电泳槽中,使胶板淹没。
3、点样
①取8μl DNA样品液与2μl 溴酚蓝染液(体积比:4/1) 混合 。
②用微量移液器分别加入 到凝胶板的点样孔内。每 个点样孔加10μl左右。
注意:加样时,移液 器枪头穿过缓冲液小心插 入点样孔,但不要损坏点 样孔,然后缓慢地将样品 推进孔内让其集中沉于孔 底部。
三、材料与试剂
➢ 1、材料:
①提取的叶片总DNA
➢ 2、试剂
① 50×TAE(50倍体积的TAE贮存液)
配100ml 50×TAE:
Tris
24.2g
冰醋酸
5.71ml
0.5mol/L EDTA 10ml(pH8.0)
用前稀释成1×TAE 。
② 凝胶加样缓冲液(6×):
溴酚蓝 0.25%
蔗糖 40%
4、在样品中加入水溶性的阴离子追踪染料(如 溴酚蓝),用以指示样品移动的距离。
七、作业
为什么要在制琼脂糖凝胶时加入溴化乙锭?
相对分子质量不同的DNA分子,移动速度也不同, 所以可将相对分子质量不同或构象不同的DNA分离。
3、0.6~1.4%琼脂 糖凝胶适用于
不同浓度琼脂糖分离DNA分子的 范围

简答琼脂糖凝胶电泳检测核酸dna的原理及加入核酸染料的作用。

简答琼脂糖凝胶电泳检测核酸dna的原理及加入核酸染料的作用。

简答琼脂糖凝胶电泳检测核酸dna的原理及加入核
酸染料的作用。

琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和检测生物大分子的方法,其原理是基于核酸分子在电场力的作用下移动速率的差异实现分离。

其具体步骤包括:将DNA样本混合导入琼脂糖凝胶孔中,然后在电场下进行电泳。

当DNA分子通过胶状基质(琼脂糖)时,分子将被分离成大小不同的带,带的大小反映了各种分子的大小和电荷。

加入核酸染料的作用是帮助观察和识别核酸带。

例如,常用的核酸染料乙溴铵(EtBr)可以与DNA结合并发出荧光信号,从而使分离的DNA带变得更清晰,帮助识别DNA大小和量的区别。

此外,核酸染料还可以通过荧光探测器快速和准确的检测到目标分子,提高检测的灵敏度和可靠性。

DNA的琼脂糖凝胶电泳分析

DNA的琼脂糖凝胶电泳分析
❖ 5、实验结果的观察:在紫外透射仪上观察 电泳带及其位置,DNA存在处应显出桔红 色荧光条带
注意事项
❖ 1、倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃, 否则温度太高会使制胶板变形。
❖ 2、胶一定要凝固好才能拔梳子,方向一定 要垂直向上,不要弄坏点样孔。
❖ 3、点样时枪头下伸,点样孔内不能有气泡, 不要刺穿点样孔。
实验器材与试剂
❖ (一)器材 : 电泳槽 电泳仪 微波炉
❖ (二)试剂
❖ 1、 6×上样缓冲液:0.25%溴酚蓝;0.25% 二甲苯青;30%甘油水溶液。( 由甘油、溴 酚蓝指示剂以及DNA稳定剂按一定比例混合 而成,经去核酸酶处理,适用于DNA样品的 电泳检测,在自然光线下呈现暗红色,与核 酸样品混合后,受样品pH值的影响,通常变 为蓝紫色。其中的溴酚蓝在不同浓度琼脂糖 凝胶和不同电泳缓冲液中的迁移率不同 ,其 迁移位置可作为DNA条带电泳位置的参照 物。)
❖ 2、 50×TAE电泳缓冲液:称取242gTris碱 (即三羟甲基氨基甲烷, Tris为弱碱,在室 温(25℃)下,它的pKa为8.1;根据缓冲理 论,Tris缓冲液的有效缓冲范围在pH7.0到 9.2之间。Tris碱的水溶液pH在10.5左右,一 般加入盐酸以调节pH值至所需值,即可获得 该pH值的缓冲液。但同时应注意温度对于 Tris的pKa的影响 ), ,加H2O800ml,待 完全溶解后,加57.1ml冰乙酸, 100ml0.5mol/LEDAT(pH8.0),用H2O定 容至1000ml。临用前用H2O稀释成1×TAE 电泳缓冲液。
❖ 4、配胶和灌电泳槽需使用同一批缓冲液。 因为pH 或离子强度很小的差别也会在凝胶 前部造成紊乱,影响DNA 片段的泳动。
❖ 5、溴化乙锭见光易分解,应储存在棕色瓶中于 4℃条件下保存。溴化乙锭在紫外灯下放置时间 过长,荧光会猝灭。

琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告

琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告

琼脂糖凝胶电泳检测dna实验报告琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验报告引言:DNA是生物体中的重要遗传物质,通过检测和分析DNA可以揭示生物体的遗传信息。

琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分析方法,本实验旨在通过琼脂糖凝胶电泳技术检测DNA样品的大小和纯度。

实验材料与方法:1. 实验材料:- DNA样品- DNA标准品- TBE缓冲液- 碱基对应的引物- DNA扩增反应体系- 琼脂糖凝胶- DNA电泳仪2. 实验方法:1) 准备琼脂糖凝胶:a. 取适量琼脂糖粉末加入TBE缓冲液中,搅拌均匀。

b. 将混合液加热至溶解,然后冷却至室温。

c. 将琼脂糖凝胶液倒入电泳槽中,插入梳子,待凝固。

2) 准备DNA样品:a. 取DNA样品,加入适量的DNA扩增反应体系。

b. 在PCR仪中进行DNA扩增反应,得到待检测的DNA样品。

3) 进行电泳检测:a. 取一定量的DNA样品和DNA标准品,加入电泳槽中的样品槽。

b. 打开电泳仪,设定适当的电压和时间。

c. 开始电泳,观察DNA在琼脂糖凝胶中的迁移情况。

结果与讨论:通过琼脂糖凝胶电泳检测,我们可以观察到DNA样品在电场作用下在琼脂糖凝胶中的迁移情况。

根据DNA片段的大小,我们可以通过比较DNA样品与DNA标准品的迁移距离,确定DNA样品的大小。

在实验中,我们发现不同大小的DNA片段会以不同的速度迁移,较小的DNA片段迁移速度较快,较大的DNA片段迁移速度较慢。

这是因为琼脂糖凝胶的孔径大小会影响DNA片段的迁移速度,较小的孔径会使DNA片段迁移速度变慢。

此外,我们还可以通过观察琼脂糖凝胶中DNA样品的带状图案来评估DNA样品的纯度。

如果带状图案清晰且无杂带,说明DNA样品较纯;而如果带状图案模糊或有多个杂带,说明DNA样品可能存在杂质或降解。

总结:琼脂糖凝胶电泳是一种常用的DNA分析技术,通过观察DNA片段在琼脂糖凝胶中的迁移情况,我们可以确定DNA样品的大小和纯度。

这种技术在生物学研究和医学诊断中具有重要意义,可以帮助科学家们更好地理解生物体的遗传信息。

DNA质量与浓度的琼脂糖凝胶电泳法测定试验原理

DNA质量与浓度的琼脂糖凝胶电泳法测定试验原理

II. DNA质量和浓度的重要性
了解DNA样品的质量和浓度对于实验结果的准确性和可靠性至关重要,可帮助优化实验条件并确保数据的可 靠性。
III. 准备琼脂糖凝胶
详细介绍准备琼脂糖凝胶的步骤和注意事项,包括浓度选择、缓冲液配制和 凝胶浇注。
Hale Waihona Puke IV. 准备DNA样品描述准备DNA样品的步骤,如提取、纯化和测量DNA,以确保样品的可靠性和准确性。
V. 加载样品到琼脂糖凝胶上
指导将DNA样品加载到琼脂糖凝胶上的步骤,包括样品混合、电泳槽加载和 阳极与阴极的连接。
VI. 跑电泳
详细说明电泳条件的设置和运行,以及电场对DNA分离的影响,包括电压、 电流和电泳时间。
VII. 可视化DNA带
介绍如何使用染料和紫外线照射来可视化DNA在琼脂糖凝胶上的带状图案,并解释带状图案的含义。
DNA质量与浓度的琼脂 糖凝胶电泳法测定试验原 理 介绍琼脂糖凝胶电泳法(Agarose Gel Electrophoresis,AGE)的原理,以
及DNA质量和浓度的重要性。
I. 琼脂糖凝胶电泳法(AGE) 介绍
琼脂糖凝胶电泳法是一种常用的分离和分析DNA的技术,通过电场使DNA按 照大小分子量分离,并可用于检测DNA的纯度和浓度。

琼脂糖凝胶电泳检测DNA

琼脂糖凝胶电泳检测DNA

实验六琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验类型:验证型目的和要求掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法原理琼脂糖凝胶电泳是分离、纯化、鉴定DNA片断的典型方法,其特点为简便、快速。

DNA 片断琼脂糖凝胶电泳的原理与蛋白质的电泳原理基本相同,DNA分子在高于其等电点的pH 溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。

DNA分子在电场中通过介质而泳动,除电荷效应外,凝胶介质还有分子筛效应,与分子大小及构想有关。

对于线形DNA分子,其电场中的迁移率与其分子量的对数值成反比。

在凝胶中加入少量溴化乙锭(有毒!),其分子可插入DNA的碱基之间,形成一种光络合物,在254~365nm波长紫外光照射下,呈现桔红色的荧光,因此可对分离的DNA进行检测。

电泳时以溴酚蓝及二甲苯氰(蓝)作为双色电泳指示剂。

其目的有:①增大样品密度,确保DNA均匀进入样品孔内;②使样品呈现颜色,了解样品泳动情况,使操作更为便利;③以0.5×TBE做电泳液时溴酚蓝的泳动率约与长300bp 的双链DNA相同,二甲苯氰(蓝)则与4bp的DNA相同。

线状DNA片段分离的有效范围与琼脂糖凝胶浓度关系琼脂糖凝胶的百分浓度(%)分离线状DNA分子的有效范围(kb)0.3 60~50.6 20~10.7 10~0.80.9 7~0.51.2 6~0.41.5 4~0.22.0 3~0.1操作方法(1)琼脂糖溶液的制备:配0.7%琼脂糖,在沸水浴中煮沸直到完全溶解;将溶液冷却到约50~60℃,加入溴化乙锭到终浓度为0.5ug/ml。

(2)将琼脂糖溶液倒入电泳支架上,放上梳子,梳子须离开电泳支架底部1mm左右。

待凝胶凝聚后,小心拔去梳子,将支架放入装有电极缓冲液的电泳槽中,电极缓冲液应淹没过胶。

(3)电泳取薄膜,滴加上样缓冲液和DNA样品5~10ul,混匀,用微量移液器加入样品槽中。

点样端朝负极,通电。

电压为10v/cm。

至溴酚蓝移到距边1cm处,取出凝胶,紫外灯下检测。

琼脂糖凝胶电泳检测DNA

琼脂糖凝胶电泳检测DNA

琼脂糖凝胶电泳检测DNA(agarose gel electrophoresis)目的和要求学习和掌握琼脂糖凝胶电泳的原理和基本操作实验原理1. 琼脂糖凝胶电泳是最常用的鉴定DNA的方法,基本原理与蛋白质电泳相似:简便易行,只需少量DNA2. 琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,可形成具有刚性的滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度3. DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时具有电荷效应与分子筛效应,迁移速率与其相对分子质量的对数反相关4. 琼脂糖凝胶中的DNA可利用荧光染料GoodView染色并在在紫外灯照射下观察主要试剂和器材一、试剂50ⅹTAE缓冲液(pH8);凝胶上样缓冲液(0.2%溴酚蓝,50%蔗糖)GoodView (溴化乙锭EB替代物);琼脂糖二、器材电泳仪、水平电泳槽、紫外检测仪基本操作方法1. 琼脂糖凝胶制备:称取0.45g琼脂糖,放入锥形瓶中,加入30ml TAE缓冲液,保鲜膜封口,置微波炉加热至完全澄清透明取出摇匀(琼脂糖浓度为1.5%);待凝胶溶液冷却至50℃(不烫手),加入3ml GoodView (终浓度0.5 g/ml) 2. 凝胶板制备:用制胶器将紫外透光凝胶盘固定好,采用水平仪调整平衡使凝胶盘位于同一水平面;将适宜的梳子垂直架在凝胶盘内槽的一端;将冷却至50℃的琼脂糖凝胶缓缓倒入凝胶盘内槽,厚度适宜(不要有气泡)3. 点样:待凝胶凝固后,小心取出梳齿,将凝胶盘放入电泳槽內,加入足够的TAE 电泳缓冲液,使液面略高出凝胶面;取5微升PCR扩增产物,向其中加入1微升的上样缓冲液,混匀后用移液器将其加入加样孔,记录样品点样次序与点样量4. 电泳:接通电泳槽与电泳仪的电源,调节电压90V,当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1-2cm处,停止电泳5. 观察:在紫外灯下观察凝胶,有DNA处应显出荧光条带,记录电泳结果注意事项:1. 倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃,否则温度太高会使凝胶盘变形2. 胶一定要凝固好才能拔梳子,方向一定要竖直向上,不要弄坏点样孔3. 点样时枪头下伸,点样孔内不能有气泡思考题DNA在电场中的迁移率取决于哪些因素?。

实验二、DNA凝胶电泳

实验二、DNA凝胶电泳
实验室中常规实验,一般用琼脂糖水平凝胶电泳装 置进行DNA电泳。
实验二、DNA凝胶电泳
二、琼脂糖凝胶电泳:
1.DNA分子大小:线性DNA分子在一定琼脂糖浓度内的迁移率与DNA分 子量的对数成反比。
2.琼脂糖浓度:小于0.5kb 的DNA片段所需的凝胶浓度为1.2-1.5%; 分离大于10kb 的DNA片段所需的凝胶浓度为0.3-0.7%; DNA片段大 小在两者之间的所需的凝胶浓度为0.8-1.0%。
3、DNA分子构象:对相同分子量的质粒DNA的三种构象,超 螺旋DNA移动最快,而线状双链DNA移动最慢。
4.电源电压:在低电压时,线性DNA片段的移动速率与所 加电压成正比,但电压增高,不同分子量的DNA片段的移 动速率将以不同幅度增加;片段越大,升高的幅度也越 大。因此电压增高,琼脂糖有效分离范围将缩小。一般 所加电压不得超过5V/cm.
箔或黑纸包裹容器,储于温室即可。 4、DNA分子量标准:
DNA/EcoR I/Hind III: DNA/EcoR I: 21.2, 7.4, 5.8, 5.6, 4.9和 2.5kb。 DNA/ Hind III: 23.1, 9.4, 6.6, 4.4, 2.3, 2.0, 0.56和 0.12kb.
实验二、DNA凝胶电泳
三、试剂: 1、5TBE缓冲液:Tris. 54g, 硼酸27.5g, 加入20ml
的0.5mol/L EDTA(pH8.0), 定溶至1000ml. 2、6上样缓冲液:0.25% 溴酚兰, 40%(w/v)蔗糖水溶液。 3、溴化乙啶(EB)溶液母液:将EB配制成10mg/L,用铝
实验二、DNA凝胶电泳
实验二、DNA凝胶电泳
一、概述
琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离和纯化DNA片段 的标准方法。其中,琼脂糖凝胶分离DNA片段大小范围较 广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的 DNA片段。

琼脂糖凝胶电泳检测质粒dna的原理

琼脂糖凝胶电泳检测质粒dna的原理

琼脂糖凝胶电泳检测质粒dna的原理
1.凝胶的制备:首先,需要制备琼脂糖凝胶。

琼脂糖是一种复合多糖,可以形成凝胶状的基质,用于分离DNA分子。

通常使用琼脂糖粉末加热溶
解在缓冲液中,然后在模具中凝固,形成凝胶板。

2.凝胶孔径选择:根据分析的DNA分子大小范围,选择凝胶孔径。


大的孔径适合分离较大的DNA片段,而较小的孔径适合分离较小的DNA片段。

3.样品预处理:将待检测的质粒DNA样品与DNA加载缓冲液混合,加
热处理使DNA样品变为单链结构,并添加胶载剂,以增加样品在凝胶中的
密度。

4.样品加载:将预处理的样品加载到凝胶的孔中。

通过电极引导,电
场会使DNA从阴极向阳极迁移。

5.电场应用:在凝胶板上施加电场,电场的方向是从阴极向阳极。

DNA负电荷使其朝阳极方向移动,在凝胶中形成DNA迁移带。

6.可视化:当DNA迁移到凝胶中一定距离时,可以通过染色剂(如溴
化乙锭)进一步可视化DNA条带。

溴化乙锭在UV光下发出荧光,使DNA
条带可看见。

7.电泳时间控制:电泳时间是控制DNA迁移的重要参数。

较长电泳时
间可以让DNA片段分离得更好,但也可能导致DNA过度迁移。

8.分析和测量:根据DNA迁移的距离和标准DNA片段的迁移距离,可
以确定每个条带对应的DNA片段大小。

琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA

琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA

琼脂糖凝胶电泳鉴定DNADNA通过实验掌握琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA的原理与方法。

琼脂糖是从海藻中提取出来的一种杂聚多糖,是由D型和L型半乳糖以α-1,3和β-1,4糖苷键相连形成的线状高聚物(如下图所示)。

琼脂糖遇冷水膨胀,溶于热水成溶胶,冷却后成为孔径范围从50nm到大于200nm的凝胶。

琼脂糖凝胶电泳是分离、鉴定和纯化DNA片段最为常用的方法之一,这种方法简便易行。

而且琼脂糖可以灌制成各种形状、大小和孔径,在不同的装置中进行电泳,如果有必要,还能够从凝胶中回收DNA谱带。

琼脂糖凝胶的分离范围较广,选择不同凝胶浓度和装置,从50个碱基对到几兆不同长度的DNA都可以实现分离。

使用电场强度和电泳方向恒定的水平板琼脂糖凝胶电泳的方法,可以很好的分离长度在50-20,000 bp 的DNA片段。

DNA在琼脂糖凝胶中的迁移率受多种因素影响。

例如DNA分子的大小;琼脂糖的浓度;所加电压等等。

DNA片段越长,泳动速度越慢,而且泳动速度与电场强度成正比。

一个给定大小的线性DNA片段,在不同浓度的琼脂糖凝胶中迁移率不同,DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。

用低浓度的荧光染料如溴化乙啶染色后,凝胶中的DNA可以直接被检测出来。

紫外灯下可以直接检测到20pg的双链DNA。

1.水平板电泳槽;灌胶模具及梳齿;电泳仪;55?水浴;沸水浴;微量移液器(1)DNA样品;DNA标准分子量标记物;琼脂糖;1x电泳缓冲液TBE;6x样品缓冲液(2)溴化乙锭:水中加入溴化乙啶,搅拌数小时至溶解。

将配好的10 mg/ml 溴化乙啶溶液装在棕色瓶中,室温保存,使用时稀释至0.5μg/ml。

缓冲溶液配制表缓冲溶液工作溶液储存溶液(每升) TBE 0.5x 5x0.045mol/L Tris-硼酸 54 g Tris 碱0.001mol/L EDTA 27.5g 硼酸20ml 0.5mol/L EDTA (pH8.0)0.2% 溴酚蓝储存温度4? 6x样品缓冲液50% (w/v) 蔗糖水液1. 照厂家说明准备好灌胶模具,置于水平面上(实验操作示意图如下)。

琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA

琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA

琼脂糖凝胶电泳鉴定DNA琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳是用琼脂或琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。

对于分子量较大的样品,如大分子核酸、病毒等,一般可采用孔径较大的琼脂糖凝胶进行电泳分离。

琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广,尤其适于分离大片段DNA。

普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。

琼脂糖凝胶电泳操作流程准备干净的配胶板和电泳槽注意DNA酶污染的仪器可能会降解DNA,造成条带信号弱、模糊甚至缺失的现象。

选择电泳方法一般的核酸检测只需要琼脂糖凝胶电泳就可以;如果需要分辨率高的电泳,特别是只有几个bp的差别应该选择聚丙烯酰胺凝胶电泳;用普通电泳不合适的巨大DNA链应该使用脉冲凝胶电泳。

注意巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。

正确选择凝胶浓度对于琼脂糖凝胶电泳,浓度通常在0.5~2%之间,低浓度的用来进行大片段核酸的电泳,高浓度的用来进行小片段分析。

低浓度胶易碎,小心操作和使用质量好的琼脂糖是解决办法。

注意高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。

适合的电泳缓冲液常用的缓冲液有TAE和TBE,而TBE比TAE有着更好的缓冲能力。

电泳时使用新制的缓冲液可以明显提高电泳效果。

注意电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,PH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。

电泳的合适电压和温度电泳时电压不应该超过20V/cm,电泳温度应该低于30℃,对于巨大的DNA 电泳,温度应该低于15℃。

注意如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。

特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象DNA样品的纯度和状态是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象DNA样品的纯度和状态注意样品中含盐量太高和含杂质蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。

DNA的琼脂糖凝胶电泳

DNA的琼脂糖凝胶电泳

实验目的掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的原理和方法。

一、实验原理DNA分子在pH值高于其等电点的溶液中带负电荷,在电场中向阳极移动。

DNA分子在电场中通过琼脂糖凝胶而泳动,除了电荷效应以外,还有分子筛效应。

由于DNA分子可片段的相对分子质量不同,移动速度也不同,所以可将相对分子质量不同或构象不同的DNA分离。

0.6~1.4%琼脂糖凝胶适用于3*106~11*106相对分子质量的DNA分子或片段的分离,所需DNA样品量为0.5~1.0ug。

琼脂糖凝胶电泳分离后的DNA可用溴化乙啶染色。

溴化乙啶分子可插入DNA双螺旋结构的两个碱基之间,形成一种荧光络合物。

在254nm波长紫外光照射下,呈现橙黄色的荧光。

用溴化乙啶检测DNA,可检出10-9g以上的DNA含量。

二、试剂与器材1、6×上样缓冲液:含0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯青、30%甘油的TBE 缓冲液。

2、5×TBE电泳缓冲液(0.45mol/L Tris-硼酸、0.01mol/L EDTA,PK=8.3)::称取54gTris碱,27.5g硼酸,3.7g EDTA-Na2溶于800ml蒸馏水中,定容至1000ml 使用时用蒸馏水稀释10倍成为0.5×TBE电泳缓冲液。

3丶琼脂糖4、溴化乙锭(EB)10mg/mL:取EB 0.10g,完全溶解于10mL水中,避免温室保存。

5丶DNA分子量标准品(DNA Marker)。

6丶DNA样品液三、操作方法琼脂糖胶液的制备:称取0.6g 琼脂糖,置于锥形瓶中,加入60ml0.5×TBE电泳缓冲液,置于微波炉或水浴中加热融化,取出摇匀即为1%琼脂糖凝胶液。

待凝胶液冷却却至60℃后加入溴化乙锭3μL,使其终浓度为0.5μg/mL。

胶板的制备在制胶槽内插入样品梳,将凝胶液倒入制胶槽中。

待胶凝固后,取出梳子,讲内槽放入电泳槽内,加入0.5×TBE电泳缓冲液至电泳槽中,使其没过凝胶表面1~2mm,排除加样孔中的气泡。

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五、主要事项
1.影响DNA在琼脂糖凝胶中迁移速率的因素: a . DNA分子大小迁移速率U与logN成反比(N为碱基对 数目)。分子大小相等,电荷基本相等(DNA结构重复 性)。分子越大,迁移越慢。等量的空间结构紧密的电 泳快(超螺旋>线性DNA) b. 琼脂糖浓度:logU=logU0 Kr 胶浓度,U为迁移率, U0 为DNA的自由电泳迁移率,为胶浓度,Kr为介质阻 滞系数。不同的凝胶浓度,分辨不同范围的DNA Agarose: 0.5%: 1-30 kb; 0.7%: 0.8-12 kb 1.2%: 0.4-7 kb; 1.5%: 0.2-3 kb
五、主要事项
c. DNA构象:一般迁移速率超螺旋环状 >线状DNA>单链开环。当条件变化时, 情况会相反,还与琼脂糖的浓度、电流强 度、离子强度及EB含量有关。 d. 所加电压:低电压时,线状DNA片段 的迁移速率与所加电压成正比。使分辨效 果好,凝胶上所加电压不应超过5V/cm
五、主要事项
e. 碱基组成与温度:一般影响不大4 -30 ℃
5. 将电泳样品与溴酚蓝混合后将样品依次点入加样孔中;
DNA 5µl + ddH2O 3µl + 溴酚蓝2µl 共10µl于0.5ml tube中 混合后点样; 6. 将制胶板放入电泳槽中,加入电泳液,打开电泳仪,使核酸 样品向正极泳动; 7. 电泳完成后切断电源,取出凝胶,放入0.5 µg/ml的溴化乙 锭(EB)溶液中染色10-15 min,清水漂洗后置于紫外透 射仪上观察电泳结果,并照相记录。
实验10 琼脂糖凝胶电泳检测DNA
一、实验原理
DNA 分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应 和分子筛效应。DNA 分子在高于等电点的pH 溶液
中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨
架在结构上的重复性质,相同数量的双涟DNA 几乎
具有等量 净电荷,因此它们能以同样的速度向正
极方向移动。在一定的电场强度下,DNA 分子的迁 移速度取决于分子筛效应,即DNA 分子本身的大小
2. 溴化乙锭(EB)为致癌剂,操作时应戴 手套,尽量减少台面污染。 3. 电泳指示剂:核酸电泳常用的指示剂有 两种,溴酚蓝(bromophenol blue, Bb)呈 蓝紫色;二甲苯晴(xylene cyanol, Xc)呈 蓝色,它携带的电荷量比溴酚蓝少,在凝 胶中的的迁移率比溴酚蓝慢。
六、思考题
和构型。
一、实验原理
具有不同的相对分子质量的DNA 片段泳动速 度不一样,可进行分离。DNA 分子的迁移速 度与相对分子质量的对数值成反比关系。凝 胶电泳不仅可分离不同相对分子质量的DNA , 也可以分离相对分子质量相同,但构型不同 的DNA 分子。
二、实验仪器
1. 恒温培养箱
2 .琼脂糖凝胶电泳系统
f. 嵌入染料的存在:降低线性DNA迁移率,(不提倡加在 电泳液中)
g. 电泳缓冲液(0.5×TBE)的组成及其离子强度影响 DNA的迁移率,无离子存在时,核酸基本不泳动,离子强 度过大产热厉害,熔化凝胶并导致DNA变性,一般采用 1×TAE,1×TBE,1×TPE(均含EDTA pH8.0)。
五、主要事项

1、DNA在电场中的迁移率取决于哪些因素? 2、琼脂糖凝胶有哪些注意事项?
四、实验步骤
1. 用胶带将洗净、干燥的制胶板的两端封好, 水平放置在工作台上; 2. 调整好梳子的高度; 3. 称取0.24 g琼脂糖于30 ml 0.5×TBE中,在微 波炉中使琼脂糖颗粒完 全溶解,冷却至45-50º C时倒入制胶板中; 4. 凝胶凝固后,小心拔去心机
4 .高压灭菌锅 5 .紫外线透射仪 6 .凝胶成像系统
三、实验试剂
1.Loading dye (0.25%溴酚兰+40%蔗糖水溶液)
10ml需0.025g溴酚兰和4g蔗糖 2.EB:需1g溴化乙锭 3.TBE:5×TBE贮液2L:108g Tris-base、 55g硼酸、40ml 0.5M的EDTA(pH8.0) 需7.4g disodium· 2H2O 4.琼脂糖:30g
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