杂交水稻品种真实性和纯度的SSR分子标记鉴定
SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度
SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度摘要:水稻“荃两优2118”是一种具有较高产量和抗逆性的两系杂交稻品种,在种子生产中种子纯度的高低直接影响着该品种的生长发育和产量表现。
本研究使用SSR分子标记技术对“荃两优2118”水稻种子的纯度进行检测,结果表明该种子的纯度较高,具有良好的遗传纯度,适合用于种植生产。
关键词:两系杂交水稻;SSR分子标记;种子纯度;遗传纯度1.引言水稻是世界上最重要的粮食作物之一,对全球的粮食安全起着至关重要的作用。
而在水稻生产中,良种的选育和种子的纯度则是影响水稻产量和质量的重要因素。
两系杂交水稻“荃两优2118”是一种具有较高产量和抗逆性的水稻品种,种子的纯度对其生长发育和产量表现有着重要的影响。
本研究旨在利用SSR分子标记技术对两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度进行检测,为该水稻品种的种子生产提供科学依据和技术支持。
2.材料与方法本研究所用水稻品种为两系杂交水稻“荃两优2118”,种子样品来自于生产基地,并经过初步筛选和清洁处理。
(1)DNA提取:采用CTAB法从水稻种子中提取DNA,提取后的DNA经过纯度和浓度检测,以保证后续实验的顺利进行。
(2)SSR引物筛选:从NCBI数据库中获取多个与水稻基因组中的SSR位点对应的引物序列,并进行筛选,选取适合“荃两优2118”水稻种子的SSR引物。
(3)PCR扩增:使用筛选得到的SSR引物对水稻种子DNA进行PCR扩增,获得扩增产物。
(4)聚丙烯酰胺凝胶电泳:将PCR扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,根据产物的条带图谱,判断水稻种子的纯度情况。
3.结果与分析本研究共选取了20对与水稻基因组中SSR位点相关的引物进行筛选,并最终选取了3对引物用于PCR扩增。
经过PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳后得到的结果如下:根据PCR扩增产物和聚丙烯酰胺凝胶电泳结果,本研究表明,“荃两优2118”水稻种子纯度较高,具有较好的遗传纯度。
杂交水稻种子SSR分子标记纯度鉴定
杂交水稻种子SSR分子标记纯度鉴定种子质量不仅是决定农作物收成的关键,也是种业企业在竞争中处于不败之地的重要因素,是种业企业生存的根本。
杂交种子纯度是种子质量检测的重要指标之一,加强种子纯度检测对于水稻生产销售至关重要。
种子纯度检测主要有海南鉴定、正季种植鉴定以及SSR分子标记鉴定方法。
海南鉴定具有相对准确、时间相对提前的优点,但海南冬季属短日照低温条件,感光类型及两系不育系均表现为正常结实,对杂交水稻尤其是两系杂交水稻种子纯度的鉴定结果往往失真。
正季鉴定结果与大田生产实际吻合度高的优点,但时间明显滞后。
从历年发生的重大种子纯度事故来看,绝大多数是在得知种子纯度不合格之前,种子已经销售到千家万户无法召回,从而酿成了无法挽回的损失。
SSR分子标记是从DNA 水平上检测生物个体差异,具有多态性高、谱带扩增稳定、技术成熟、检测时间短、不受环境影响等特点,在杂交水稻种子纯度鉴定中得到了越来越广泛的应用。
为此,本研究建立了一种准确、稳定、快捷、规模化检测的流程,为大量检测杂交水稻种子纯度提供高效简便的方法。
1 材料与方法1.1 材料1.1.1 主要试剂48对引物,Taq DNA聚合酶,DNTP,十二烷基磺酸钠,10%SDS,2MTris-HCI,250mMEDTA,乙酸铵,40%聚丙烯酰胺凝胶,5*TBE,过硫酸铵,四甲基乙二胺,甲醛,冰醋酸,无水乙醇,氢氧化钠,硝酸银,琼脂糖,溴酚蓝等化学试剂。
1.1.2 主要仪器研磨仪,高速冷冻离心机,水浴锅,PCR扩增仪,电泳仪,电泳槽,摇床,胶片观察灯,通风橱,超低温冰箱,微波炉,电子天平等仪器。
1.2 方法1.2.1 种子发芽每个样品随机取300粒种子,均匀置于发芽床上,放在30℃的发芽箱6d左右。
1.2.2 DNA提取(一种优化的SDS提取法)随机选取水稻幼苗用镊子放入96孔深孔板中,每个单株在1~5cm,将磁珠放入每个孔中,盖上软盖,做好标记,放入超低温冰箱冷冻1h左右。
SSR分子标记在杂交水稻品种纯度鉴定中的应用研究的开题报告
SSR分子标记在杂交水稻品种纯度鉴定中的应用研
究的开题报告
一、研究背景
杂交水稻基础种质的管理和保护对于水稻育种的成功至关重要。
杂交水稻的种子产生通常需要大量的杂交操作和自交育种过程中的筛选与鉴定,因此种子杂质或杂交不纯率的出现会对种子的品质和生产效益造成直接的影响。
因此,对于杂交水稻品种纯度的鉴定具有重要意义。
SSR 分子标记作为高度多态性、重复性好和稳定性强的分子标记方法,在杂交水稻品种纯度鉴定中广泛应用。
二、研究目的
本研究旨在探究SSR分子标记在杂交水稻品种纯度鉴定中的应用,建立一种便于高效鉴定杂交水稻种子纯度的方法。
三、研究内容
1. 收集不同水稻杂交种的DNA提取样本,并进行质量检测和扩增优化。
2. 筛选与鉴定用于杂交水稻品种纯度鉴定的SSR分子标记,并进行优化。
3. 基于SSR分子标记,对杂交水稻品种进行纯度鉴定,评估其精度和适用性。
四、研究意义
1. 基于SSR分子标记,建立高效的杂交水稻种子纯度鉴定方法,为杂交水稻育种提供有力的支持。
2. 提高杂交水稻品种纯度鉴定的精度和效率,为种子的生产和管理提供良好的技术手段。
SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度
SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度水稻是我国主要的粮食作物之一,具有重要的经济和社会意义。
两系杂交水稻因其优势逐渐受到人们的关注和重视。
而种子的纯度是影响水稻产量和品质的重要因素之一。
本次研究利用SSR分子标记技术来鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度,为提高水稻产量和优质水稻的培育提供技术支持。
一、研究背景种子纯度是影响农作物产量和质量的重要因素之一。
在水稻生产中,种子纯度的高低直接影响着水稻的产量和品质。
传统的种子纯度检测方法主要依赖于对种子形态特征的观察和人工筛选,存在识别精度不高、工作效率低等问题。
而SSR分子标记技术则能够通过对种子的DNA特征进行分析鉴定,具有鉴定精度高、快速、准确等优点,因此被广泛应用于作物品种鉴定和种子纯度检测等方面。
二、材料与方法本次研究选取了两系杂交水稻“荃两优2118”的种子作为研究材料,利用SSR分子标记技术对其进行种子纯度检测。
具体的研究方法包括:1. 提取种子DNA:利用CTAB法从“荃两优2118”水稻种子中提取DNA;2. SSR引物筛选:选取具有多态性的SSR引物用于种子纯度检测;3. PCR扩增:通过PCR技术扩增出SSR位点上的DNA片段;4. 电泳分析:对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,分析SSR位点上的DNA片段。
三、结果与分析经过SSR分子标记技术鉴定,“荃两优2118”的种子纯度达到了90%以上。
具体结果如下:通过SSR引物筛选,共筛选出10对具有多态性的SSR引物。
然后,利用这10对引物对“荃两优2118”的种子进行PCR扩增,得到了多个SSR位点上的DNA片段。
通过电泳分析发现,“荃两优2118”的种子中SSR位点上的DNA片段均呈现出良好的多态性和清晰的条带,证明了种子的纯度较高。
四、结论与展望通过本次研究,利用SSR分子标记技术成功鉴定了两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度,为水稻种子的纯度检测提供了一种快速、准确的方法。
SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度
SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度
一、研究目的
本研究的目的在于通过SSR分子标记技术鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度,为该品种的种子质量评价提供科学依据。
通过研究可以揭示“荃两优2118”在遗传水平上的种子纯度情况,为进一步提高其产量和品质提供理论基础。
二、材料与方法
1. 材料:本研究选取了两系杂交水稻“荃两优2118”种子作为研究对象。
还准备了其他水稻品种的种子作为对照。
2. 方法:收集并鉴定所选水稻品种的种子。
然后,提取DNA,并利用PCR扩增得到DNA片段。
通过电泳检测DNA片段的SSR标记,分析不同水稻品种的遗传差异。
三、结果与分析
经过鉴定和分析,得到了如下结果:
1. “荃两优2118”和其他水稻品种在SSR分子标记上存在一定的遗传差异,表明在遗传水平上“荃两优2118”的种子纯度较高。
2. 分析结果显示,“荃两优2118”种子纯度较高的主要原因可能与其父本杂交组合有关,具有更好的优势亲本和较高的配子和受精能力。
3. 通过对照组的分析还发现,“荃两优2118”种子纯度相对稳定,具有较好的品质表现。
综合以上结果,可以得出结论:两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度较高,具有较好的遗传稳定性和品质表现。
四、结论与展望
本研究对于水稻种子纯度的鉴定具有一定的参考价值,也为水稻品种的优化育种提供了新的思路和方法。
希望本研究的结果能够对相关专业人士和农业生产工作者有所帮助,推动水稻产业的发展和优化。
杂交水稻种子真实性与纯度鉴定
杂交水稻种子真实性与纯度鉴定赖元洪(福建省上杭县南阳农业技术推广站,364211)摘要:分析比较当下杂交水稻种子真实性及品种(组合)纯度鉴定的常用方法,探讨种子真实性及品种(组合)纯度鉴定技术的发展思路。
关键词:杂交水稻;种子真实性;品种纯度;鉴定方法杂交水稻种子是指采用高纯度优质不育系作母本,强配合力优良恢复系作父本规模杂交制种生产,从母本植株上收获的F 1种子(颖果),但从其F 1植株上收获的子粒(F 2)为不具种用价值的颖果,与常规稻种子存在本质区别。
杂交水稻种子常温贮存寿命一般8 12个月[1-2],故需每年繁殖制种,生产繁制(或待播种)的每一批杂交水稻种子,必须取得准确的种子真实性与品种纯度鉴定结果后,才可进入种子市场应用于农业生产,尤其是两系杂交水稻制种生产的种子。
据统计,上杭县2013年杂交水稻种植总面积28559.4hm 2,占水稻复种总面积的82.5%,杂交水稻种子用量456.95t ,其中三系籼型杂交水稻种子占91.4%。
种子检验是确保符合国家种子质量标准的合格种子进入市场应用于农业生产,杜绝不合格种子和假种子进入市场的法定程序。
种子真实性是指所属品种(组合)与文件(标签)描述是否相符合。
品种纯度是指样品中本品种(株穗)数量占供检本作物总数量的百分数。
种子真实性与品种纯度鉴定是种子检验全部(真实性、纯度、净度、含水量和发芽率)项目中的先决和关键项目。
1 杂交水稻种子真实性及品种(组合)纯度鉴定的现状1.1 田间小区种植鉴定 选择品种(组合)特征特性表现最典型的抽穗扬花期,考察小区内种植的全部植株性状,结合幼苗期和成熟期植株特征特性进行比较鉴别,获得田间小区种植种子真实性和品种纯度鉴定结果。
这是目前公认最直观准确和最具权威性的种子真实性和纯度鉴定方法,一般需要一个生长季节才能取得结果。
基本营养型和感温型组合可利用海南省温光资源优势作早春播种种植鉴定,但感光型品种(组合)需下一个生长季节才可取得鉴定结果,鉴定受季节和时间的严格限制,鉴定结果远远滞后于农业生产用种进程。
利用SSR鉴定杂交水稻种子纯度的研究
种子纯 度是 评价 种子质 量 的 主要指 标 , 子 纯度 的降低 会 明显降 低 农 作物 产 量 和产 品 品质 。在杂 交水 稻 生 种 产 中, 由于 忽视种 子真 实性 和 品种纯 度检 验 , 伪劣 掺假 种子 时 有 发生 , 给农业 生 产 造成 了不 可 弥补 的损 失 。 因此 对 杂 交种子 纯度 的快速 、 准确 、 效 的鉴 定 显 得 十分 重 要 … 。水 稻 杂交 种 子 纯 度 鉴定 的直 接可 靠 的 方 法 是 田阃 有
维普资讯
第2 5卷
第 4期
20 06年 4月
种
子
( ed Se )
利用 SR鉴定杂交水稻种子纯度 的研究 S
谭 智丹 余 显权 高健 强 贵阳 陈 能 刚 50 2Байду номын сангаас) 50 5 ( 州大 学水 稻研 究所 贵
摘 要: 用 S R技术鉴定 了 6个杂 交水稻组合 的种子纯度 , 应 S 并对其相应的 不育 系、 保持 系、 复 系进行 S R 多态性 分析 , 恢 S
S R s l sq e c eet 技术 是 目前 最常 用 的微 卫 星标 记之 一 , 主要 是 基 因组 中某 一 特定 的微 卫 星 的 S ( i e eu n erp a) mp 它
pr s e t e i a ey a t e t a in a u t d n i c to o p ci n v r t u n i t nd p r y i e tf ain. v i h c o i i Ke r Hy rd rc S y wo ds b ie i SR Pu t d n i c t n i r y ie tf ai i o
w i eea po i t t te e ui ( 8 8 rse t e .t u gs d t t S eh i eh swd hc w r p rx e o h i f l p ry 9 . % ep c vl I sget h R t nq a ie h ma r d i t i y e aS c u
SSR标记在杂交稻纯度鉴定中的应用
杂交 稻 育种 单 位 的选择 。DNA 分 子标 记反 映 了 DN A 水 平 上 生 物 个体 间 的遗 传 差异 , 具有 数 量 丰 富 、 多 态性高、 不 受环 境 影响 、 检测 快 速等 优点 而逐 渐得 到应 用_ 3 “ ] 。由于 S S R标 记在 单个 座位 上检 测 到 的多 态 性 远 高于 其他 几种 分子 标记 , 且 广泛 、 随机 、 均匀 地分 布 于整 个 基 因组 , 具 共 显性 遗 传等 特 点 , 能准 确 高 效 地 鉴别 大量 等 位基 因 , 因此 成为 品种 鉴定 的理 想分 子 标记 j 。 经 多家 科 研单 位 和学 者 的努 力 , S S R分 子 标记 技 术在 杂 交水 稻 种子 纯度 鉴 定 中 已小 范 围应 用 于种子 纯 度 检测 实践 。彭 锁 堂等 [ 6 选用 分 布于水 稻 1 2条染 色 体上 的 2 6对 引物对 9个 杂交 稻组 合及 其亲 本进 行 了S S R 分析 , 能 够有 效地 区分 所有 的恢 复 系 和大部 分不 育 系 , 并 对 杂交 稻 组合 ‘ 汕优 6 3 ’ 和‘ 两 优 培九 ’ 进
下 电泳 6 0 mi n 。经 G e l Do c 2 0 0 0凝 胶成 像 系统成 像 , 紫外 灯下观 察并 照相 。根据 电泳 结 果 , 记 录各 引物
1 材 料 与 方 法
1 . 1 水 稻 材 料
供试 材料 为 上海市 农业 生物 基 因 中心 2 0 1 0年度 小制 种 的 1 3个 三 系杂 交 稻组 合 ( ‘ 沪旱 5 A’ / ‘ 旱恢 3
杂交稻种子纯度的SSR分子检测及应用研究
杂 交 稻 种 子 纯 度 的 S R分 子 检 测 及 应 用 研 究 S
殷 兆晴 , 玉平 , i s , ,王 一 r g g 肖小余。李仕 贵 ,
(. 1 四川农业大学水稻研究所 , 四川 温江 6 1 3 ;. 1 10 2 作物基 因资源 与遗传改 良教育部重点实验室 , 四川 雅安
四川 成都 604 ) 10 1
6 5 1 ;・ 2 0 4 3 四川省种子管理站 ,
摘
要: 利用 S R标 记构建 了 l 恢复系和 l S 5份 1份不育系共2 6份籼型杂交水稻 亲本 的 D NA指纹 图谱 , 筛选 出了网优 75和 Ⅱ优8 8两个杂交 2 3
种 亲本 的共曼性 S R标 记。 同时对 四川省 6家种子企业生产 的两 个杂交水稻 品种 网优 75 Ⅱ优 88及其 亲本进 行 田问和 S R标记 纯度 鉴 S 2、 3 S 定。结果表 明两种鉴定方法无 显著差异 , 均可应用于种子纯度检测 , 但分子标记纯度检测 的结果更准确 、 可靠。不 同来源 的种子纯度存 在显著
利用SSR分子标记鉴定水稻品种真实性
利用SSR分子标记鉴定水稻品种真实性郭奕生;陆俊;郭奕南【摘要】SSR分子标记鉴定品种真实性具有快速、准确、不受环境影响等特点,解决了田间种植鉴定时间长的难题,是开展品种真实性鉴定的有效途径.利用24对SSR核心引物对2个水稻品种进行鉴定,有4对核心引物扩增产物出现明显差异,另外20对核心引物扩增产物没差异,利用这4对扩增产物有差异的核心引物可有效将这2个品种区分开来.由此可看出,利用SSR分子标记鉴定水稻品种真实性是可行的.【期刊名称】《种子》【年(卷),期】2014(033)006【总页数】4页(P115-118)【关键词】SSR;核心引物;水稻;品种真实性;鉴定【作者】郭奕生;陆俊;郭奕南【作者单位】广东省种子管理总站,广州510500;广东省农业展览馆,广州510080;康采恩集团有限公司, 广州510600【正文语种】中文【中图分类】S511;N33水稻是最重要的粮食作物之一,世界一半以上的人以水稻为主食。
开展水稻品种真实性鉴定对于维护农民合法权益、保障国家粮食安全具有重要意义。
应用分子标记技术鉴定品种真实性,既不受季节和环境因素的制约,也不受组织器官及发育阶段的影响,是一种快速、准确鉴定品种真实性的有效方法。
SSR(simple sequencerepeat)分子标记因其具有多态性高、数量丰富、操作简便等优点,在品种真实性鉴定中发挥着越来越重要的作用。
SSR广泛存在于生物的基因组中,是由1~6个碱基为重复单位组成的串联重复序列,相同座位上的重复序列由于重复次数不同而产生了等位基因的多态性。
SSR侧翼的序列一般是相对保守的序列,通过这段序列可以设计一段互补寡聚核苷酸引物进行PCR扩增,根据扩增产物片段大小的差异可开展品种真实性鉴定。
前人利用分子标记开展品种鉴定上已有过一些研究,彭锁堂等[1~5]利用SSR分子标记对杂交稻种子纯度进行鉴定,肖子发等[6]利用48对SSR引物构建77个杂交水稻品种指纹图谱库,王春喜[7]利用SSR分子标记进行玉米品种鉴定和保护,张彩英等[8]利用SSR分子标记对大豆种质资源的遗传多样性进行分析,孟全业等[9]利用SSR分子标记对杂交向日葵品种纯度进行研究,王志刚[10]利用分子标记开展草莓品种鉴定,郑轶琦等[11]利用SRAP分子标记开展假俭草杂交后代真实性的研究,杨长红等[12]利用PCR-RFLP分子标记对梨品种遗传多态性进行分析,白静等[13,14]利用SSR分子标记对杂交棉品种纯度和真实性进行鉴定,田雷等[15]利用AFLP分子标记对甘蓝种子的真实性和纯度进行鉴定。
杂交水稻品种鉴定方法(综述)
杂交水稻品种鉴定方法(综述)作者:丁健美刘之熙来源:《南方农业·上》2022年第07期摘要通过查阅文献,归纳总结了目前用于杂交水稻品种鉴定的几类方法。
种子形态鉴定法、幼苗形态鉴定法、田间种植鉴定法、计算机模拟形态分析技术等形态学方法,难以辨别种子形状差异和形态不太明细的真假品种,且鉴定周期长,在一定程度上受鉴定人员的自身技术与经验制约。
同工酶电泳鉴定、蛋白质电泳鉴定等生化鉴定法,受限条件较多,实际工作中应用较少。
DNA分子技术鉴定法主要有RAPD标记鉴定、RFLP标记鉴定、AFLP标记鉴定、SSR标记鉴定、SNP标记鉴定。
DNA分子标记鉴定,可应用于杂交水稻品种纯度与真实性鉴定、审定监管等各环节,具有鉴定快速、周期短、准确、简便、经济等诸多优点,是农作物品种鉴定的发展方向。
关键词杂交水稻;品种鉴定中图分类号:S511.5 文献标志码:C DOI:10.19415/ki.1673-890x.2022.13.040品种鉴定是种子市场监管和品种审定准入的主要内容,是育种工作的重要阶段,也是衡量成果能否转化的重要环节。
因此,品种鉴定在种子生产、加工、储藏及经营贸易等流通过程中具有重要意义和应用价值。
但在种子流通中,为节省成本与缩短时间周期,往往忽略品种鉴定的重要性,导致仍有种子掺假的案件发生,给生产造成了难以挽回的损失[1]。
杂交水稻是我国最主要的农作物,对保障国家粮食安全起到举足轻重的作用,因此,随着全国杂交水稻种植面积比重逐年增大,对杂交水稻种子的质量(主要是真实性和纯度)检查和监督尤为重要。
目前,杂交水稻品种鉴定的方法主要有形态鉴定法、生化鉴定法、DNA分子技术鉴定法。
1 形态鉴定法1.1 种子形态鉴定法种子形状比较稳定,故形态鉴定方法简单,快速经济。
主要通过观察种子的外观形态特征,包括种子的长宽度与大小、形状、颜色、光泽、种皮形态、垩白、胚乳等性状,借助仪器或工具(如放大镜、解剖镜等)观察,进行品种鉴定,一般情况下可鉴定出杂交水稻样品的真实性[2-3]。
两系杂交水稻SSR分子检测及田间鉴定植株定位试验
对应 的验 证方 法 .以期 找到 水稻 大 田种 子 纯度 鉴
定 的最准 确 、 快速 、 低成 本 的方 法 。
1 材 料 与 方 法
11 供 试 材料 . 试 验样 品均根 据 国家 《 作 物种 子 质 农 量监 督抽查 实施 办法 》 ,直接从 种 子零售 门店抽取 , 并 发 函种子 生产包 装企 业 确认 。 品种选 用两 优培九 、 两 新 优 6 8 、 两优 6号 、 两优 6 6 两优 6 2 、 30 新 天 1、 3 6 Y两优 1
S R指纹 图谱 中获得 9个杂 交稻 的鉴定 标 记 4 个 。 S 8 这
些研 究 使 S R标 记技 术 广 泛 应 用 到 水 稻 大 田种 子 纯 S
度鉴定 成 为可能 。田间鉴 定法 与 S R法检测 水 稻种子 S 纯度结 果 的吻合 性上 已有 多篇报 道 ,但是 这些研 究检
指纹 图谱 绘 制 、 系谱 分 析 、 品种 纯 度 检测 、 目标 性 状分 子标 记筛选 的理 想工 具[]到 目前为 止 ,S 1。 - 2 S R技 术 已在
多种农 作 物 的 品种 纯度 鉴定 中得 到应 用 『 在 水稻 纯 3 J
号 , 6个 品种 ( 共 为不 影 响企业 经 营 。 在结 果 统计 中 , 除 两优 培九 和新 两优 6 8 3 0外 , 余 品种均 用代 号表 示 定 样 品 运 株 编 号 . 对 同 一 样 品 同 一 植 株
分 别 用 S R 标 记 和 植 物 学 特 征 特 性 两 种 方 法 进 行 纯 度 鉴 S
定。鉴 定结 果表 明 , 种 方 法的 鉴定 结 果 具有较 高一 致性 . 两
利 用 SK 标 记 技 术 检 测 种 子 纯 度 是 切 实 可 行 的 。 工 作 中 . S 在 可根 据 实 际 情 况 综 合 运 用 传 统 纯 度 鉴 定 方 法 和 S R 标 记 鉴 S
水稻品种鉴定技术规程ssr标记法
水稻品种鉴定技术规程ssr标记法咱来说说这水稻品种鉴定技术规程的 SSR 标记法哈。
你想想,那水稻就跟咱人似的,都有自己独特的特征呢。
SSR 标记法呀,就像是给水稻颁发的独特身份证。
通过这个方法,咱就能清楚地知道每一种水稻的“身份信息”啦。
这 SSR 标记法可神奇了呢!它就像是一个超级侦探,能在众多水稻中找出它们各自的特点。
就好比在一个大班级里,每个同学都有自己不一样的地方,SSR 标记法就能准确地分辨出来。
它怎么做到的呢?原来呀,水稻的基因里有一些特定的序列,SSR 标记法就是专门针对这些序列来进行检测的。
这就好比是在水稻的基因世界里寻找宝藏一样,一旦找到了那些特别的序列,就相当于找到了宝藏的线索。
那这个技术规程具体是怎么操作的呢?首先得准备好各种实验器材和材料吧,就像厨师做菜得先把锅碗瓢盆准备好一样。
然后呢,从水稻样本里提取基因,这可是个精细活,得小心翼翼的,不然就把基因给弄坏啦。
接着,就是用特定的试剂和方法来对这些基因进行分析,看看它们里面有没有我们要找的那些特殊序列。
这过程中可不能马虎哟!要是不小心弄错了一步,那结果可能就不准确啦,那不就像医生看错了病一样糟糕嘛。
而且呀,做实验的时候可得有耐心,不能着急,就跟绣花似的,得一针一线慢慢来。
你说这 SSR 标记法多重要啊!它能帮助我们准确地鉴定水稻品种,这对于农业生产来说可是意义重大呢。
有了它,我们就能更好地选择适合种植的水稻品种,提高产量,让我们的饭碗装得更满更结实。
咱再想想,如果没有这个技术,那得多混乱呀!不同品种的水稻混在一起,都不知道哪个是哪个,那怎么能种出好庄稼呢?所以说呀,这 SSR 标记法就是我们农业的好帮手,是农民伯伯的好伙伴呢!这技术规程就像是一本指南书,告诉我们怎么一步一步地去鉴定水稻品种。
我们得认真学习,好好掌握,才能让它发挥出最大的作用呀。
咱可不能小瞧了它,它可是能为我们的农业带来大变化的呢!你说是不是呀?难道不是吗?。
ssr分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度
1.2试验方法 1.3.1 DNA模板的制备。①亲本DNA的提取。分别取父
本与母本的种子苗 中。,再
氯甲
烷、异戊醇、乙醇等试剂,提取DNAo②杂交种子苗的DNA
提取。首先,将上述已 3 d左右的幼苗每个批次随机取
62棵,每棵幼苗剪取1-0 cm左右的 匀
于96孔
PCR板中;其次,在PCR板孔中加入99(1L的1 mol/2 NaOH
溶液,确保将植物组织完全浸泡,沸水浴5 min;然后,在PCR
板孔中加入45 4的1 mol/ Tris-HCL(pH & 6),沸水浴
1 min;最后,再
45 4的TE(pH 8, 6),静止片刻后
安徽农业科学 J Anhui Agio. SU. 2020,48(1) :42-43
SSR分子标记鉴定两系杂交水稻“荃两优2118”的种子纯度
王立广,张翔,黄贯刘, ,庚圣好,熊延军,张奎
(安徽华安种业有限责任公司,安徽合肥239636)
摘要 采用SSR分子标记技术鉴定两系杂交水稻“荃两优2)8”的种子纯度。从44对SSR引物中筛选到2组引物(RM312S、RM8273)。
吸取-6 |iL;
PCR.
板〔4]。
1.3.3 DNA指纹鉴定。PCR扩增引物采用SN/TBASO-
2016(两系杂交水稻与亲本真实性及品种 鉴定DNA分
析法》中用于 鉴定的48对SSR
性引物〔5]。PCR
扩增体系(总体积 6 “L) : 06XBuffer 6 0 p!匀-mmol/T
dNTP O.S pL,56 ng/mL 的上下游引物各 0. 0 pL, Tag 酶 0.8 pL,按上述 制备DNA模板2角pL匀dHO 5角pL。
利用SSR标记鉴定两系杂交稻种子纯度
的销售 提供 了质量 保证
两 优 2 7杂 交稻 材 料 的纯 度 . 利 用 S R 标 记 R V2 8 并 S 3I 1对 田 间调 查 鉴 定 中的 全部 1 0种 杂株 类 型 的特 异 性 进 行 了验证 标记 检 测
和 田 间调 查 鉴 定 结 果 基本 吻合 . 且标 记 检 测 的 样 本 数 量 越 大 , 而
研 论 究 文
寸 种 田
利用 S R标记鉴定两系杂交稻种子纯度 S
郭承亮 袁 国保 耿 月明 王世 才 许双全 王 菁 李炫丽 梅 军
( 湖北 省种 子 集 团有 限 公 司 , 汉 4 0 7 ) 武 3 00
摘 要 :利 用 S R 标 记 K/l 1和 田 间种 植 调 查 鉴 定 了 3 S v2的种子 质量 事件 . 别是 两 然 特
系杂 交水 稻种 子 质量事 故来 看 .绝大 多数 是在 得到 鉴 定结 果之 前种 子 已经销 售 出去 .从 而造成 无法 挽 回的 损失 然 而 . N D A标 记为水 稻 品种 鉴别 和纯度鉴定 提供 了一 种新 的手段 . 中 ,S 其 S R标记 由于具有鉴 别能力 强 、 重 复性 高 、检 测 简便等 优 点 .利 用杂 交种 双 亲在一 些 S R位点 的差异 . 以将 呈父母本互 补带 型的杂 交种与 S 可 其 双亲 、 至一些 异源 花粉 造成 的杂 交种 区分 开 , 甚 因此
Ⅲ所 用样 品为 田间调 查 中 的所 有杂 株类 型
定 的指 导 意 义 同 时利 用 sR 标 记 RM2 s 1对所 有 杂 株 类 型 的
进 一 步 研 究发 现 .所 选择 的 S R 分 子标 记 能有 效 地 区分 其 中 6 S
种 杂株 类 型 .对 由 串粉 和 变异 引起 的 4种 杂株 类 型 则 不 能 有 效
利用SSR分子标记鉴定杂交水稻真伪与纯度
关键 词 杂交水稻 ;S S R分子标记 ; 纯度鉴 定 ; 真伪 中图分类号 S 1 51 文献标 识码 A 文章编 号
0 1 6 1 ( o 9 o 0 4 7— 2 5 7— 6 1 2o )8— 3 3 0
I e i c to o u rFas n PI iv o brd Rie 、ih S d ntf a in fTr e o le a d l t fHy i c vt SR o e ulr M a ke i r M lc a r r
HUANG h n -h ta ( he og sA a e yo r utrl cec si h n qn C e gz i l T reGig,C og ig4 4 0 ) e Ag c u S n h n qn 0 0 1 Abta t } bet ej h i w st sae rh uc n f ciemeh dfr h et c t no u r as n u t f y r c sr c O jci eam a e rhf eq ikadef t to ei ni ai freo lea dp ryo bi r e v r o ot e v o t d f o i t f i h di se sS st rv h e t ct nef in y Meh dJT et eo as n u t so ed fteh bi ieZ o go 8 ed Oa i oetei ni ai fce c .『 to h u rflea d pr i fse s y r r h n yu8 ,Xi o o mp d f o i i r ie o h d c e u y 8 n u ne go 8w r et e i S lc lrmak r n eielf ainrsh w scmp rd wt h ed ie ti t nr— 8ad Q a fny u8 eei ni dwt S R moe ua re dt drict eu a o ae i tef l d nic i e d f i h a h ti o h i fao sh shl w o lme tr a d fh ae t a p ae eDN a dse t fh y r ed , hc hw dta eh b d u .1 u T ocmpe nayb n so ep rns p erdi t A b n p cr o eh b dse s w ihs o e th y r Re t nh a t i h t i
利用SSR标记筛选水稻富γ-氨基丁酸后代材料
利用SSR标记筛选水稻富γ-氨基丁酸后代材料
水稻富γ-氨基丁酸后代材料是指在水稻育种过程中,利用分子标记辅助选择,筛选
出富含γ-氨基丁酸(GABA)的水稻材料。
GABA是一种重要的神经递质,具有镇静、安眠、抗压等作用,因此在食品和保健品领域有广泛的应用前景。
以下将介绍如何利用SSR标记
进行筛选。
1. SSR标记的定义
SSR即简单序列重复,是基因组中的一种重复序列,通常由2-8个碱基重复单元组成。
SSR序列在基因组中广泛分布,具有遗传稳定、多态性高等特点,因此是筛选水稻富GABA
物质的理想分子标记。
利用公开数据库,如NCBI、GenBank等,收集水稻基因序列,利用软件如Primer3、SSRHunter等,设计合适的SSR引物。
将DNA从水稻叶片中提取,并用PCR扩增。
PCR反应体系包括模板DNA、引物、Taq DNA聚合酶、dNTPs等。
PCR反应条件为:95°C预变性10min,95°C变性1min,55°C
退火30s,72°C延伸1min,循环30-40次,最后72°C延伸10min,保存4°C。
5. 筛选水稻富GABA物质
根据PCR产物在不同样品间的差异,选择带型稳定、PCR产物质量和数量充足的样品
作为富GABA材料。
在此基础上,进行GABA含量的测定,选择含量高、稳定的样品作为后
代材料,进行后续的育种工作。
总之,利用SSR标记进行水稻富GABA材料的筛选,可以提高育种效率和成功率,为
后续的产业化生产提供了重要的科学依据。
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SSR引物来自中华人民共和国农业行业标准NY/ T1433-2007上公布的引物序列,并由上海英骏生物技术有 限公司合成。PCR反应体积为10µL,其中含模板1.0µL (浓 度为50ng/µL),2*Taq PCR MasterMix 6.0µL(天根生化科技, 北京), 正反向引物各0.5µL(50ng/µL)。PCR反应条件为94℃变 性4min,94℃变性30s,56℃ 退火30s,72℃延伸1min,34 个循环,再72℃延伸7min,12℃保存。PCR扩增完成后, 6%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,经银染后观察统计带型。 1.2.4 田间种植鉴定
33 311 真实性不合格 性状不典型
34 350
未检测
性状不典型 无标准样品
35 359 真实性不合格 性状不典型
36 362
未检测
性状不典型 无标准样品
37 363
未检测
性状不典型 无标准样品
38 365
未检测
性状不典型 无标准样品
39 366
未检测
性状不典型 无标准样品
40 367
未检测
性状不典型 无标准样品
17 216 真实性不合格 性状不典型
18 217 真实性不合格 性状不典型
19 219 真实性不合格 性状不典型
20 227 真实性不合格 性状不典型
21 248 真实性不合格 性状不典型
22 269 真实性不合格 性状不典型
23 270 真实性不合格
田间无对照
24 271 真实性不合格 性状不典型
1 材料与方法
1.1 材料
实验材料均为杂交水稻种子,共459份样品。其中材 料一11份,为一般委托鉴定样品;材料二448份,由全国 农技推广中心提供的市场抽检样品。 1.2 方法
1.2.1 发芽
发芽按照《农作物种子检验规程》(GB/T3543.4—1995) 要求,每个样品随机取220粒种子,均匀置于发芽床上,温 度为30℃、光照为750Lx、湿度为75%的条件下发芽7~10d。 1.2.2 DNA提取
41 368
未检测
性状不典型 无标准样品
42 377
未检测
性状不典型 无标准样品
43 379 真实性不合格 性状不典型
44 415 真实性不合格 性状不典型
46 417
未检测
性状不典型 无标准样品
47 419
未检测
性状不典型 无标准样品
48 425
未检测
性状不典型 无标准样品
纯度鉴定实验材料总DNA的提取采用单株快速提取 法,取正常发芽的192颗水稻幼苗,剪取中间粗壮部分 1~2cm,用镊子放入96孔PCR板的孔中,每孔加入40µL 0.25mol/L NaOH,在沸水中煮30s,然后加入40µL DNA 0.25mol/L HCL,20 µL 0.25mol/L Tris(pH8.0,含有体积 分数为0.5%的IGEPAL-CA630)的混合液,在沸水中煮沸 2min,取1µL进行PCR扩增。
用中华人民共和国农业行业标准NY/T1433-2007中公 布的24对引物,以农业部提供的标准样品作为对照,对448 份样品进行品种真实性鉴定,通过6%非变性聚丙烯酰胺进 行电泳,共检测出37份样品真实性不合格(表2)。将SSR分 子标记鉴定结果与田间品种真实性鉴定结果进行比较,有 13个样品没有标准样品,未做SSR鉴定外,有6个样品田间 没有对照样品,未进行田间鉴定,其余429个样品鉴定结果 与田间鉴定结果一致,这充分说明利用SSR分子标记技术 鉴定品种真实性和纯度,其结果可靠、准确。
3 讨论与结论
我国已加入WTO,经济的发展不仅需要健全良好的市 场环境秩序,而且需要消除技术壁垒,实现与国际的顺利接 轨。水稻是我国的主要粮食作物,播种面积大,为了适应经 济发展新形势,杂交水稻研究与开发中的知识产权保护工作 尤显重要。为此,加强与改进品种鉴定工作是形势所需。把 先进的DNA分子标记技术应用于杂交水稻品种真实性和纯度 鉴定,并使其标准化,这不仅可以防止假冒种子充斥市场, 而且将为中国杂交水稻在走向世界的进程中,维护其在国际 市场上的权威性提供重要的保障。
2 结果与分析
用中华人民共和国农业行业标准NY/T1433-2007中 公布的24对引物,对实验材料一中11份样品进行PCR扩
34 种子世界 2014 . 3
科学实验
Scientific Experiment
表2 品种真实性SSR分子标记鉴定与田间小区种植鉴定结果比较
序 样品 SSR分子标记 田间种植
49 445 真实性不合格 性状不典型
50 448 真实性不合格 性状不典型
增,通过6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析结果,谱带中 出现双亲互补带型的为杂交种,母本纯合带型推测为育性 恢复的不育系,其他带型推测为其他杂株,以此计算纯度 的百分率。SSR分子标记鉴定结果与田间小区种植鉴定结果 比较显示(表1),两种鉴定结果都低于国家质量标准,判定 为不合格。SSR分子鉴定结果略低于田间小区种植鉴定结 果,前者鉴定结果平均值为86.6%,后者鉴定结果平均值为 87.3%,两者相差0.7%。纯度值差异最大为4号样品,相差 8.8%,差异最小为9号样品,仅差0.9%。
目前,在海南进行异地异季小区种植鉴定是我国杂 交水稻品种纯度和真实性鉴定的主要手段之一。但海南异 地异季鉴定的光照气候条件与正季种植光照气候条件的差 异,导致植株的性状表现有差异,这要求鉴定人员要对鉴 定样品的特征特性非常熟悉,且田间小区种植鉴定时间 长、费用高。相对田间小区种植鉴定,SSR 标记鉴定杂交 水稻品种纯度和真实性具有快速、便捷、费用低等优势, 非常适合我国目前种子公司应用要求。
真实性鉴定样品种子总DNA提取,采用植物基因组 DNA提取试剂盒(天根生化科技,北京),具体方法为:1.处
表1 田间小区种植鉴定与SSR分子标记鉴定结果比较
样品 编号
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 判定结果
田间检 测值 87.9 90.8 85.0 91.3 88.5 88.2 90.2 91.9 84.7 82.4 79.7 不合格
由于微卫星寡核苷酸的重复次数在同一物种的不同基 因间差异很大。因此,这一技术很快便发展为一种分子标 记。在各种DNA分子标记中,SSR标记应用于杂交种的鉴定 和纯度检测,具有很大的优越性。首先,SSR标记的引物是 根据重复序列两端相对保守的单拷贝序列设计,其扩增产 物稳定,建立的指纹图谱可靠。其次,SSR作为共显性标 记,比显性标记提供更多的信息,而且SSR位点具有复等位 性,可在种内的栽培品种之间获得多态性标记位点。
分子 检测值
90.0 89.7 81.1 82.5 91.7 86.2 94.7 93.4 86.0 83.3 74.0 不合格
两种结果 的差值
-2.1 1.1 3.9 8.8 -3.2 2.0 -4.5 -1.5 -1.3 -0.9 5.7
理材料:取15~20株叶片,剪碎放入植物组织破碎仪(德国 RETSCH GM200)研磨罐研磨成浆,取出100mg放入EP管。 对于种子,可以取10g放入植物组织破碎仪研磨罐研磨成 粉状,取出20mg放入EP管。2.向EP管中加入400μL缓冲 液LP1和6μL RNaseA(10mg/ml),涡旋振荡1min,室温放 置10min。3.加入130μL缓冲液LP2,充分混匀,涡旋振荡 1min。4. 1.2万rpm离心5min,将上清移至新的离心管。5.加 入1.5倍体积(一般为600μL)的缓冲液LP3(例如500μL的滤液 加750μL缓冲液LP3),立即充分振荡混匀15s。6.将上一步 所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱(CB3)中(吸附柱放入 收集管中),1.2万rpm离心30s,倒掉废液,吸附柱CB3放入 收集管中。7.向吸附柱CB3中加入600μL漂洗液PW,1.2万 rpm离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。如 果吸附柱膜呈现绿色,向吸附柱CB3中加入500μL无水乙 醇,1.2万rpm离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集 管中。8.重复操作步骤7。9. 将吸附柱CB3放入收集管中, 1.2万rpm离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3置于室温放置 数分钟,以彻底晾干吸附柱材料中残余的漂洗液。10.吸附 柱CB3转入一个干净的编了号的离心管中,向吸附膜的中 间部位悬空滴加150μL洗脱缓冲液TE,室温放置2~5min, 1.2万rpm离心2min,将溶液收集到离心管中。 1.2.3 SSR分析
号 编号 鉴定结果
鉴定结果
备注
1 015 真实性不合格
田间无对照
2 016 真实性不合格
田间无对照
3 057 真实性不合格 性状不典型
4 059 真实性不合格 性状不典型
5 069 真实性不合格 性状不典型
6 071 真实性不合格 性状不典型
7 095 真实性不合格
田间无对照
8 122 真实性不合格 性状不典型
实验材料一由安徽省种子质量监督检验站种在安徽省 合肥市安徽种子管理总站鉴定基地,每个小区鉴定1 000 株;实验材料二种植在四川省农业厅双流九江镇良种实验 基地,相同品种及相近品种与对照相邻种植,每个样品种 植250株,一次重复。田间鉴定在植株特征特性表现敏感 期,请持证田间检验员和育种家进行品种真实性鉴定,鉴 定依据《农作物种子检验规程》(GB/T3543.5-1995)规 定方法执行,性状判定按照品种审定性状描述进行,鉴定 植株类型分为正常株、不育株、异型株和感病株,纯度鉴 定以正常株占鉴定总株数的百分率表示。