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标准终点RTPCR

标准终点RTPCR

标准终点RTPCR实时荧光定量PCR(real-time PCR)是一种高灵敏度、高特异性的核酸检测技术,广泛应用于基因表达分析、病原微生物检测、遗传疾病诊断等领域。

在实时荧光定量PCR技术中,终点PCR是一种常用的PCR方法,它可以通过检测PCR反应终点的荧光信号来定量目标DNA或RNA的含量。

本文将介绍标准终点RTPCR的原理、方法和应用。

1. 原理。

标准终点RTPCR是一种半定量PCR技术,其原理是利用DNA或RNA模板,在PCR反应体系中进行多轮扩增,通过检测PCR反应终点的荧光信号来定量目标DNA或RNA的含量。

在PCR反应中,每一轮循环都会产生指数级增加的DNA或RNA产物,同时伴随着荧光信号的累积。

当PCR反应达到饱和时,荧光信号会呈指数级增加,最终趋于平稳。

通过检测PCR反应终点的荧光信号强度,可以确定起始模板的含量,从而实现对目标DNA或RNA的定量分析。

2. 方法。

标准终点RTPCR的方法包括PCR反应体系的准备、PCR程序的设置、荧光信号的检测和数据分析等步骤。

首先,需要准备PCR反应体系,包括模板DNA或RNA、引物、荧光探针、聚合酶等。

然后,设置PCR程序,包括预变性、PCR扩增和荧光信号采集等步骤。

在PCR扩增过程中,荧光信号会随着PCR产物的累积而增加,直至达到饱和。

最后,通过荧光检测仪器采集PCR反应终点的荧光信号,并进行数据分析,得出目标DNA或RNA的定量结果。

3. 应用。

标准终点RTPCR技术在科学研究和临床诊断中具有广泛的应用价值。

在基因表达分析中,可以利用标准终点RTPCR技术对特定基因的表达水平进行定量分析,从而揭示基因调控网络和信号转导通路。

在病原微生物检测中,可以利用标准终点RTPCR技术对病原微生物的核酸进行定量检测,实现对病原微生物的快速、准确的诊断。

在遗传疾病诊断中,可以利用标准终点RTPCR技术对患者的遗传物质进行定量分析,为临床诊断和治疗提供依据。

rtpcr原理

rtpcr原理

rtpcr原理RT-PCR原理。

RT-PCR全称为逆转录聚合酶链式反应,是一种用于检测RNA的技术。

它结合了逆转录和聚合酶链式反应的步骤,可以将RNA转录成cDNA,然后进行扩增和检测。

这种技术在分子生物学和医学诊断中得到了广泛的应用,尤其在病毒检测和基因表达分析方面有着重要的作用。

RT-PCR的原理主要分为三个步骤,逆转录、PCR扩增和检测。

首先是逆转录,即将RNA转录成cDNA。

这一步骤需要逆转录酶和引物,逆转录酶能够将RNA模板转录成cDNA,引物则是用来引导逆转录酶的合成。

在逆转录的过程中,引物将与RNA模板结合,逆转录酶将在引物的引导下合成cDNA链。

这样就得到了cDNA模板,为后续的PCR扩增提供了基础。

接下来是PCR扩增,即利用聚合酶链式反应对cDNA进行扩增。

在PCR反应中,需要两种引物,分别是前向引物和反向引物。

这两种引物将在PCR反应中与cDNA模板配对,聚合酶将在引物的引导下合成新的DNA链。

通过多轮的PCR反应,可以将目标DNA序列扩增到可检测的水平。

PCR扩增是RT-PCR技术的关键步骤,它能够快速、高效地扩增目标DNA序列,为后续的检测提供了充分的材料。

最后是检测,即对扩增后的DNA进行检测分析。

常用的检测方法包括凝胶电泳、实时荧光定量PCR和测序等。

凝胶电泳是一种常规的检测方法,通过电泳将扩增后的DNA分离并观察。

实时荧光定量PCR则是一种高灵敏度和高特异性的检测方法,可以实时监测PCR反应过程中的荧光信号,从而定量分析目标DNA的含量。

而测序则是一种直接测定DNA序列的方法,可以准确地确定目标DNA的碱基序列。

这些检测方法可以根据实际需求进行选择,以满足不同的研究和临床应用。

总的来说,RT-PCR技术通过逆转录、PCR扩增和检测三个步骤,实现了对RNA的检测和分析。

它具有高灵敏度、高特异性和高效性的特点,可以广泛应用于基因表达分析、病毒检测、肿瘤诊断等领域。

随着生物技术的不断发展,RT-PCR技术也在不断完善和改进,为科研和临床诊断提供了强大的工具和支持。

RT-PCR

RT-PCR

RT-PCR原理:
提取组织或细胞中的总RNA,以其中的 mRNA作为模板,采用OligodT或随机引物 利用逆转录酶反转录成cDNA。
再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目 的基因或检测基因表达。
RT-PCR实验步骤
1,RNA提取;
2,RT;RNA-DNA
3,PCR
1.RNA的提取
RNA的提取其实原理很简单:通过变性剂破碎 细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提 RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,最后溶解。
逆转录-聚合酶链反应
Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR
RT-PCR简介
RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶 链式扩增(PCR)相结合的技术。 首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA 为模板,扩增合成目的片段。作为模板的RNA可以是 总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。
RT-PCR用途
RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,
检测细胞中基因表达水平; 直接克隆特定基因的cDNA序列; 分析基因的转录产物; 获取目的基因; 合成cDNA探针。
真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从 DNA PCR得到我们需要的基因呢?
因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为 内含子 (intron),真正编码蛋白的区段是被这些内含子隔开的, 这些编码区叫做外显子(exon)。 真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接, 去掉这些非编码区,才形成成熟的mRNA,由mRNA再 翻译成蛋白质。
Figure. DNA Contamination in RNA.
适用于具有PolyA尾巴的mRNA。(原核生物的RNA、 真核生物的 rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴。)由于 Oligo dT Oligo dT要结合到PolyA 尾巴上,所以对RNA样品的 质量要求较高。

rt pcr原理

rt pcr原理

rt pcr原理RT-PCR原理RT-PCR是一种广泛应用于分子生物学和医学诊断领域的实验技术,其全称为反转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)。

本文将详细介绍RT-PCR的原理。

一、反转录(Reverse Transcription)1. 反转录的概念反转录是指将RNA模板上的信息逆向转录成为DNA序列。

在RT-PCR中,反转录是制备cDNA(complementary DNA)模板的关键步骤。

cDNA是由RNA模板逆向合成的双链DNA,它可以作为PCR 扩增的模板。

2. 反转录过程反转录过程由三个主要部分组成:RNA逆向转录、RNA降解、cDNA 合成。

首先,需要使用反转录酶将RNA模板逆向转录为单链cDNA;然后通过碱基切除和填充,将单链cDNA变为双链cDNA;最后使用RNase H或其他酶降解RNA模板,得到纯净的cDNA。

二、聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)1. PCR的概念聚合酶链式反应是一种体外扩增核酸序列的技术。

它可以在短时间内从微量样品中扩增出大量特定的DNA序列。

2. PCR过程PCR过程由三个主要步骤组成:变性、退火、延伸。

首先,将DNA 双链分离为两条单链,即变性;然后引入引物(primers),使其与目标序列的两端互相补合,形成一个模板-引物复合体;最后,使用DNA聚合酶在引物的作用下延伸新链。

三、RT-PCR原理1. RT-PCR的概念RT-PCR是一种结合反转录和聚合酶链式反应技术的方法,用于从RNA模板中扩增特定的DNA序列。

它可以将RNA转录为cDNA,并通过PCR扩增cDNA。

2. RT-PCR过程RT-PCR过程由四个主要步骤组成:反转录、初步扩增、二次扩增、检测。

首先进行反转录反应,将RNA逆向转录为cDNA;然后进行初步扩增,使用特定引物扩增目标序列;接着进行二次扩增,使用内部引物对初步扩增产物进行进一步扩增;最后进行检测,确定是否存在目标序列。

RT-PCR百度百科

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概念RT-PCR 为反转录RCR(reverse transcription PCR)和实时PCR(real time PCR)共同的缩写。

逆转录PCR,或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。

在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。

由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”,由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成。

随后,DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖RNA 的DNA聚合酶完成,随每个循环倍增,即通常的PCR。

原先的RNA模板被RNA酶H降解,留下互补DNA。

RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。

RT-P CR广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。

(检测基因表达的方法,参见Northern Blot法。

)RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。

为了与逆转录PCR相区别,通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative P CR)。

实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内D NA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。

real time PCR 的定量使用萤光色素,目前有二种方法。

一种是在ds DNA中插入特异的萤光色素;另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种萤光探针(probe)。

real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合,能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。

这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR(quantitative RT-PCR)”[编辑本段]PCR技术相关试剂A液:变性液B液:醋酸钠溶液C液:酚/氯仿/异戊醇混合液(50:49:1)D液:异丙醇E液:75%乙醇F液:DEPC处理的灭菌去离子水G液:RNA酶抑制剂H液:反转录反应液I液:反转录酶J液:PCR反应液K液:Taq DNA聚合酶(0.5u/µl)L液:矿物油M液:50倍TAE电泳缓冲液N液:溴化乙锭溶液0液:上样缓冲液[编辑本段]PCR各步骤的目的(一)预变性:破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。

real-time pcr名词解释

real-time pcr名词解释

real-time pcr名词解释
外文名【Real-time Quantitative polymerase chain reaction】
中文名【实时荧光定量多聚核苷酸链式反应】
中文简称【实时荧光定量PCR】
外文简称【RT PCR】
【实时荧光定量PCR技术】,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

实时荧光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。

通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。

·
Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。

由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。

【技术原理】
将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman 探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光,随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增而变化荧光信号强度,求得Ct值,同时利用数个已知模板浓度的标准品作对照,即可得出待测标本目的基因的拷贝数。

RT-PCR技术(ZYR)

RT-PCR技术(ZYR)


3、确认RNA的质量
检测RNA溶液的吸光度: OD260/OD280=1.8-2.0 RNA的电泳图谱: 28S和18S条带明亮、清晰、指条带 边缘清晰,并且28S的亮度在18S条 带的两倍以上。

二、反转录

单管一步法
反转录和PCR反应在一个管子中完成 , 得到的全部cDNA产物都一起经PCR扩 增 ,灵敏度更高,但是容易相互干扰 。
一、抽提RNA

1、防止RNA酶污染
180℃的高温下干烤6hr以上; 0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗; 去污剂洗涤,双蒸水冲洗; 溶液皆用0.1% DEPC水配置,试剂 应为新开封或RNA专用; 操作人员戴手套; 器械专用。


2、材料的准备
组织及细胞最好为新鲜的,或者在 -RT-PCR技术
简介

RT- PCR即逆转录PCR,是将RNA的 逆转录(RT)和cDNA的聚合酶链式 扩增反应(PCR)相结合的技术。首 先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成 目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用 途广泛,可用于检测细胞中基因表达 水平,细胞中RNA病毒的含量和直接 克隆 特定基因的cDNA序列。

两步法
反转录和P CR分开做,PCR取反转录 反应产物的1/10进行,更为灵活而且 严谨,但是灵敏度不如前者高。
三、PCR

1、参照基因 PCR
参照基因一般选择看家基因(长表达、高表 达量 的基因),常用18S、β-actin、 bubulin、GAPDH,其中ACTIN最为普遍; 参照基因与目的基因在同一个管子内进行 PCR反应的情况下,称之为内参; 参照基因与目的基因在不同管子内反应成为 外参; 由于内参可能与目的基因竞争模板及酶,或 造成其它干扰,外参的应用较为普遍。

rt-pcr 探针原理

rt-pcr 探针原理

rt-pcr 探针原理
RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)探针原理是一种基于实时荧光检测的核酸扩增技术,用于定量分析目标RNA分子。

其原理如下:
1. 首先,从目标组织或细胞中提取总RNA,然后通过逆转录酶将RNA 转化为cDNA。

2. 采用特定引物和探针进行PCR扩增。

探针是一种荧光标记的DNA 分子,能够与目标cDNA序列特异性地结合。

3. 在PCR反应过程中,荧光探针与目标cDNA结合,随着扩增产物的形成,探针的荧光强度逐渐增强。

4. 通过实时监测扩增过程中荧光信号的变化,可以计算出目标分子的拷贝数。

荧光信号的强度与目标RNA分子的数量成正比,从而实现对RNA分子的定量分析。

5. 利用特定的软件和数据分析,可以得到目标RNA分子的相对表达量,从而分析不同样本之间基因表达的差异。

RT-PCR探针原理具有高度敏感性和特异性,广泛应用于基因表达研
究、病毒载量检测、突变检测等领域。

需要注意的是,RT-PCR实验过程中需要严格控制实验条件,以确保结果的准确性和可重复性。

rtpcr原理

rtpcr原理

rtpcr原理实时定量聚合反转转录聚合酶链式反应(RT-PCR)是一种广泛应用于分子生物学研究中的技术,用于检测和定量测量特定基因的RNA水平。

它通过转录反转录酶(reverse transcriptase)将RNA转录成互补的DNA(cDNA),然后用聚合酶链式反应(PCR)扩增cDNA的特定片段。

RT-PCR的原理基于酶的活性和互补配对原则。

首先,转录反转录酶通过互补配对原则,在RNA模板上合成一个cDNA链。

转录反转录酶可以结合RNA的末端,并使用RNA作为模板来逆转录合成cDNA链。

这个cDNA链是RNA的互补链,其中T(胸腺嘧啶)替代了RNA的U(尿嘧啶)。

一旦获得了cDNA链,PCR可以用于放大感兴趣的基因片段。

PCR包括一系列的循环反应,每个循环包括三个主要步骤:变性,引物结合和延伸。

在变性步骤中,PCR反应体系被加热到高温,使DNA双链分离为两条单链DNA。

然后引物结合步骤中,引物(片段特异性的DNA小分子)与目标片段的互补序列结合。

最后,在延伸步骤中,DNA聚合酶在引物的引导下,以DNA模板合成一个新的DNA链,产生一份新的DNA分子。

这个放大循环可以进行多个周期,每个周期都会产生两倍数量的目标DNA,因此可以快速且指数级地扩增目标基因的数量。

扩增后的DNA序列可以通过凝胶电泳或其他适当的方法进行检测和定量。

总的来说,RT-PCR通过将RNA转录成cDNA,并通过PCR 技术进行扩增,可以快速、准确地检测和定量目标基因的RNA水平。

它在生物医学研究、疾病诊断和药物研发等领域具有广泛的应用。

荧光定量rt-pcr法

荧光定量rt-pcr法

荧光定量rt-pcr法
荧光定量RT-PCR法是基于实时荧光PCR技术的一种分子生物学方法,可以在PCR反应过程中实时检测靶基因的扩增情况。

并且,该技术还可以量化靶基因的表达水平并计算出
扩增产物的相对丰度,常用于研究基因表达的差异、病原微生物检测和药物研究等领域。

荧光定量RT-PCR法的基本原理是将DNA模板、引物和荧光探针等反应物混合,通过PCR循环放大检测靶基因的扩增情况。

同时,荧光探针会针对扩增过程中特定的DNA序列,在扩增过程中实时释放荧光信号,被激光器反射和检测器捕获并传输到计算机上,计算机
软件将荧光信号转化为数字图像,进而通过数据分析进行扩增曲线、相对丰度等指标的计算。

荧光定量RT-PCR法具有灵敏度高、特异性好、操作简便、准确可靠等优点,同时还可以同时检测多个靶基因,因此成为当前分子生物学研究的重要手段。

反转录PCR

反转录PCR

反转录PCR (RT—PCR, Reversed Transcript PCR)1 原理RT—PCR是一种将cDNA合成与PCR技术结合分析基因表达的快速灵敏的方法,主要用于对表达信息进行检测或定量分析,还可以用来检测基因表达差异而不必构建cDNA文库克隆cDNA。

RT-PCR的模板可以为总RNA或poly(A) 选择性RNA。

逆转录反应可以使用逆转录酶,以随机引物、oligo(dT)或基因特异性的引物(GSP)起始。

在实际应用中,RT—PCR又常常分为一步法RT—PCR和两步法RT—PCR。

2 实验流程3 特点一步法RT—PCR反应更加快速、灵敏,操作简便,污染率低,RNA二级结构减少,并且因为聚合酶有校正活性,从而降低了PCR反应的错配率。

而在两步法中,反应的精确度高,人为的误差相对较小,并且由于在第一步中将RNA反转录为cDNA,从而更易于保存。

另外,两步法的整个过程比一步法更节省费用。

传统检测方法的样品用量一般在ug级,而在RT—PCR检测系统中样品用量陡降至pg级。

这就在很大程度上降低了实验操作的难度,特别是mRNA样品制备的过程得以简化。

4 应用对基因转录产物进行定性与定量的检测,相对传统的检测方法,如Northern杂交、斑点杂交(RNA dot)等而言,RT—PCR的精确度更高,且样品用量显著减少。

利用RT—PCR 对难检测的基因进行相应的检测与研究更易获得成功。

另外,还能同时分析多个差别基因的转录。

在植物方面,RT—PCR常常用于研究环境胁迫对植物基因表达的影响,以及在特定的环境或生长阶段中植物体不同部位基因表达的差异性。

对基因转录中剪切与拼接的检测:如果RT—PCR引物确定了mRNA片段,根据其是否包含某个外显子,将产生两种差别DNA片段,进而在凝胶电泳图谱上显示出迁移率不同的条带。

因为转座子涉及到特定的DNA序列及转座酶识别位点,用RT—PCR方法可以较精确地研究转座过程的分子机制。

RT-PCR与realtime pcr

RT-PCR与realtime pcr

Real-time PCR中文译作“实时聚合酶链反应”,是一种最新发展的定量PCR技术。

该技术借助于荧光信号来检测PCR产物,一方面提高了灵敏度,另一方面还可以做到PCR每循环一次就收集一个数据,建立实时扩增曲线,准确地确定CT值,从而根据CT值确定起始DNA拷贝数,做到了真正意义上的DNA定量,较以往常用的终点定量的方法更加准确。

根据所使用的技术不同,荧光定量PCR 又可以分为TaqMan探针和SYBR Green I荧光染料两种方法。

Real-time PCR 所采用的专用PCR仪能够自动在每个循环的特定阶段对反应体系的荧光强度进行检测,实时的记录荧光强度的改变,从而对样品的浓度进行精确的定量。

RT-PCR是Reverse transcription PCR的简称,中文译作“逆转录聚合酶链反应”,是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。

首先经反转录酶的作用从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。

RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。

作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。

无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组DNA的污染。

用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT及基因特异性引物中的一种。

对于短的不具有发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可。

Real time RT-PCR是将Real time-PCR的方法用于RT-PCR中,目的也是为了对样品浓度进行精确控制。

RT-PCR和Real time-PCR是没有必然联系的,两种技术可以一起使用,就是Real time RT-PCR;也可以单独使用。

就是名称有点绕,逆转录PCR先出现,所以占用了RT-PCR这个简写,等Real time-PCR技术出现后,本来按照惯例,简写也是RT-PCR,但为了与逆转录PCR相区别,还是写成Real time-PCR。

rt_qpcr与rt_pcr的区别

rt_qpcr与rt_pcr的区别

rt qpcr与rt pcr的区别1. 引言随着科技的不断发展,PCR技术已成为生物学研究中不可或缺的工具之一。

在PCR 技术的基础上,有很多不同的变种被开发出来以满足不同的研究需求。

其中,rt qpcr和rt pcr是两种常用于RNA分析的技术。

2. rt pcrrt pcr全称为逆转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction),是一种利用暴露在细胞质中的RNA作为模板,经由逆转录酶(Reverse Transcriptase)将RNA逆转录合成cDNA,然后再进行聚合酶链式反应扩增的技术。

rt pcr的主要步骤包括:1.RNA逆转录:利用逆转录酶将RNA转录为cDNA,通常使用寡聚核苷酸引物(oligo(dT))作为逆转录引物。

2.cDNA扩增:将逆转录得到的cDNA通过PCR技术进行扩增,需要设计特异性引物来扩增感兴趣的目标序列。

3.产品检测:通过聚丙烯酰胺凝胶电泳、实时荧光PCR等方法检测PCR产物。

rt pcr适用于研究RNA的表达水平,例如研究基因转录水平的变化、检测细胞裂解液中的病毒RNA等。

在研究环节中,需要逆转录酶和dna聚合酶。

3. rt qpcrrt qpcr全称为逆转录实时定量聚合酶链式反应(Reverse Transcription Quantitative Polymerase Chain Reaction),是在rt pcr的基础上结合了实时荧光技术的一种技术。

rt qpcr主要步骤包括:1.RNA逆转录:同rt pcr一样,利用逆转录酶将RNA转录为cDNA。

2.实时检测:在PCR反应过程中,通过荧光探针的结合与释放来检测产物的实时累积情况,常见的探针有TaqMan探针、SYBR Green探针等。

3.数据分析:根据PCR反应的实时荧光信号,可以通过标准曲线法或比较Ct法来定量分析目标序列的表达水平。

rt-pcr生物化学名词解释

rt-pcr生物化学名词解释

rt-pcr生物化学名词解释
RT-PCR是实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time Polymerase Chain Reaction)的缩写,是一种用于检测和定量DNA
或RNA的技术。

这种技术结合了PCR和荧光探针技术,能够在PCR
反应进行的同时实时监测DNA或RNA的扩增过程。

RT-PCR的原理是
利用DNA聚合酶酶在适当的温度下复制DNA或RNA片段,然后通过
荧光信号的累积来实时监测扩增过程。

这种技术可以用于检测病原体、基因表达分析、疾病诊断等领域,具有高灵敏度、高特异性和
高准确性的特点。

RT-PCR的步骤包括,提取RNA或DNA样本、反转录(RT)将RNA转化为cDNA(如果是RT-PCR)、PCR扩增、实时荧光信号监测
和数据分析。

这些步骤需要精确的实验操作和严格的质量控制,以
确保结果的准确性和可靠性。

RT-PCR在医学、生物学、遗传学和疾病研究等领域具有广泛的
应用。

例如,在病毒性疾病的诊断中,RT-PCR可以检测病毒的RNA,帮助医生确认病毒感染。

在基因表达分析中,科研人员可以利用
RT-PCR来定量特定基因的表达水平,从而研究基因调控和信号通路。

总之,RT-PCR作为一种重要的分子生物学技术,对于科学研究和临床诊断具有重要意义。

rt pcr原理

rt pcr原理

rt pcr原理
RT-PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)是
一种常用的分子生物学技术,用于检测RNA分子的存在和浓度。

其原理基于聚合酶链式反应(PCR)和逆转录(RT)两
个步骤的结合。

首先,逆转录步骤将RNA转录成相应的DNA分子。

这一步
骤使用逆转录酶将特定的RNA模板转录成互补的DNA链,
生成称为cDNA的复制的DNA。

逆转录酶会在上述反应中合
成新的DNA链,并在合成的DNA链上加上一些特殊的引物
序列。

接下来,PCR步骤用于扩增目标DNA片段。

PCR反应通过转
录酶链式反应引发DNA的扩增。

反应液中的DNA片段会被PCR引物引导,并在加入热稳定的聚合酶的情况下,经历一
系列的循环性变性、退火和延伸,从而扩增起始 DNA区域。

这些循环热压的步骤会导致指数级别的DNA增加,从而产生
大量特定DNA片段。

扩增反应进行完毕后,可以采用多种方法来检测扩增产物。

最常见的方法是使用凝胶电泳,将扩增产物根据大小进行分离并观察。

此外,还可以使用DNA染料或探针等,在实验室条件
下观察和量化。

总的来说,RT-PCR技术通过结合逆转录和PCR两个步骤,
可以将RNA分子转录成DNA,并对目标DNA片段进行扩增。

这一技术在基因表达分析、病毒检测和遗传研究等领域得到了广泛应用。

rt-pcr的基本原理及应用

rt-pcr的基本原理及应用

RT-PCR的基本原理及应用1. 介绍逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)是一种广泛应用于分子生物学研究中的技术方法。

它结合了逆转录和聚合酶链式反应(PCR)两种关键技术,能够在研究中快速、高效地扩增目标DNA片段。

本文将介绍RT-PCR的基本原理及其在生物学、医学和遗传学等领域中的应用。

2. RT-PCR的基本原理RT-PCR主要包含以下步骤: - 逆转录:使用反转录酶将RNA转录为互补的DNA模板。

反转录酶在逆转录过程中合成互补的DNA链,使得RNA转变为DNA 模板。

- 聚合酶链式反应:使用DNA聚合酶通过不断的复制和扩增DNA模板来合成目标DNA片段。

聚合酶链式反应通过两个引物将目标序列夹在中间,然后利用DNA聚合酶将这两个引物的序列逐渐复制扩增,产生大量的目标DNA片段。

3. RT-PCR的应用场景RT-PCR在科学研究和医学诊断中有着广泛的应用,以下是一些常见的应用场景:3.1 基因表达分析RT-PCR可以用来检测和分析基因的表达水平,通过测量特定基因的mRNA水平来了解该基因在细胞或组织中的表达情况。

这种方法可以帮助研究人员深入了解细胞信号传导、疾病发展以及药物治疗的效果等。

3.2 病原体检测RT-PCR在病原体检测中具有高度的敏感性和特异性,可以用于快速准确地检测病原体的存在。

例如,在流行病学研究中,RT-PCR可以用来检测病毒、细菌或真菌感染,从而帮助医生选择最佳的治疗方法。

3.3 遗传疾病筛查许多遗传性疾病可以通过RT-PCR来进行筛查和诊断。

通过检测具有特定基因突变的人体细胞中的mRNA,医生可以确定是否存在特定遗传突变,从而帮助确定疾病的风险和预后。

3.4 癌症诊断和监测癌症细胞通常会表达特定的基因表达模式,这些模式可以通过RT-PCR来检测和分析。

通过分析癌细胞中特定基因的表达水平,医生可以帮助诊断和监测癌症的类型、进展和治疗效果。

4. RT-PCR的优势和局限性4.1 优势•高灵敏度:RT-PCR可以检测到非常低浓度的目标DNA或RNA,具有高度的灵敏度。

分析 Rt-PCR

分析 Rt-PCR

分析 Rt-PCRPCR 全称聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),指利用 Taq 和/或 Pfu 核酸酶惊醒的体外特异性扩增某特定核算序列Rt-PCR 一般指反转录 PCR (Reverse Transcription PCR)其实就是将 PCR 与反转录结合,这样就可以获得多克隆的某一特异的RNA 片段(通常是 mRNA)。

首先将提取的 RNA 逆转录为 cDNA ,之后与常规 PCR 全都。

引物与常规 PCR 没有太大不同(序列特异性引物或随机引物)有时候会用 mRNA 的特异性引物 Oligo dT(针对 mRNA 的标志性 poly - A 尾)。

通常Rt-PCR 是为了分析细胞中蛋白质表达状况,会以细胞中自然表达的 beta-actin 作为内参分析蛋白质表达状况(beta-actin 认为是管家基因,在同种细胞中表达恒定)qPCR 指荧光实时定量 PCR (Quantitative real-time PCR),有时也会被称作实时/定量 PCR (Rt-PCR)。

qPCR 使用一种特别的探针—— Taqman 探针,其结构为一个 RNA 探针,两端分别加上一个发光基团 R 和一个吸光基团 Q 。

而且 qPCR 不使用 Taq 聚合酶,由于 Taq 缺乏其他 DNA 聚合酶拥有的 5 - 3 外切酶结构域及其即时矫正机制。

简洁说,就是rt和q都是常规PCR的变种。

此时R与Q同在探针上,距离较近,R产生的荧光被Q汲取,所以不显出荧光;当互补链DNA合成时,DNA聚合酶向下游移动,其5 - 3外切酶结构域就会切割探针,依次释放出R和Q。

自由的R与Q距离较远,相互之间没有互作,所以不会影响R的荧光。

定义新参数Ct值(Cycle threshold,循环阈值):每个反应管内的荧光信号到达设定阈值时所经受的循环数。

阈值通常设定为3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍(为什么这么设定?可能只是商定俗成吧我不了解)。

RTPCR具体步骤

RTPCR具体步骤

RTPCR具体步骤RT-PCR(逆转录聚合酶链反应)是一种用于检测和测量特定RNA分子在样本或样本中的表达水平的实验技术。

下面是RT-PCR的具体步骤:1.提取RNA:首先从样本(可以是细胞或组织)中提取RNA。

这可以通过商业RNA提取试剂盒或经典的酚-氯仿提取法来完成。

提取的RNA可能含有DNA杂质,因此可以使用DNA酶I来去除DNA。

2.逆转录反应:将提取的RNA转录成互补的DNA(cDNA)的过程称为逆转录。

逆转录反应的目的是将RNA转录成cDNA,并将其中的信息保存下来,以便后续PCR反应中进行扩增。

逆转录反应通常在逆转录酶(例如M-MLV反转录酶)和随后使用的引物的存在下进行。

需要引物来诱导逆转录酶在RNA模板上合成第一链cDNA。

3.PCR反应:PCR是一种将特定DNA片段扩增到大量可检测水平的技术。

在RT-PCR中,PCR反应用于扩增从RNA转录的cDNA片段。

PCR反应需要一对引物,这对引物应是特异性的,可以选择性地放大感兴趣的RNA分子。

PCR反应通常包含DNA模板,引物,dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)和DNA聚合酶。

PCR反应包括一系列循环,每个循环都包括一定的时间和温度在一定的时间内。

4.聚合酶链反应:在PCR反应中,DNA聚合酶在每一个循环中以DNA末端为模板合成互补的DNA链。

每个循环包括退火,延伸和变性步骤。

在退火步骤中,引物结合到DNA模板上。

在延伸步骤中,DNA聚合酶合成新的DNA链,并以它们作为模板进一步合成更多的DNA链。

在变性步骤中,PCR反应的温度被升高以分离DNA链。

5.检测与分析:PCR反应产生的扩增产物可以通过凝胶电泳或其他检测方法进行分析。

凝胶电泳可以分离不同大小的DNA片段,并且扩增产物的相对量可以通过定量PCR(qPCR)进行测量。

qPCR使用荧光信号来检测PCR产物的积累,并通过与标准曲线相比较来确定特定的RNA分子在样本中的表达水平。

6.数据分析:通过分析PCR产物的相对量,可以根据比较样品之间的扩增产物浓度来确定特定RNA分子在样本中的表达水平。

RTPCR

RTPCR
DNA-杂 R化 N双 A 链
单 链 DNA 双 链 DNA
聚合酶链式反应--PCR
一种将微量的目的DNA片段在体外快速、大量扩增 的技术。以目的DNA(待扩增DNA)分子为模板,一 对分别与模板3’末端互补的寡核苷酸片段为引物,在 DNA聚合酶的作用下,按照半保留复制的机制沿着模 板链延伸直至完成2条新DNA链的合成。不断重复这 一过程,即可使目的DNA片段得到扩增。
PCR 反应的条件
• 预变性: 94℃,2-10min • 变性:94℃, 30s, 模板DNA变性成为单链 • 退火:Tm-5℃,30s,引物与模板DNA结合 • 延伸:72℃,DNA聚合酶催化DNA合成
时间与待扩增片段长度有关, <1Kb,1min;>1Kb,延长时间 重复25-30cycle.
一步法 反应条件
四、RT-PCR应用
1.检测细胞中基因表达水平。 2.检测细胞中RNA病毒的含量。 3.直接克隆特定基因的cDNA序列。
THANKS
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世界触手可及
7500r/min 离心5min 。 7. 弃上清液,室温干燥15min. 8. 向干燥过的沉淀物中加入200μl DEPC 处理水溶解沉淀
物,于-20 ℃保存备用。
四、反转录反应(以TianGen试剂盒为例)
1. 配制gDNA去除反应体系混合液:5×gDNA Buffer 2μl;Total RNA;RNase-Free ddH2O补足到10μl。彻底混匀,简短离心, 并置于42℃孵育3min,然后放置于冰上。 2. 配制反转录反应体系混合液,10×Fast RT buffer 2μl;RT Enzyme Mix 1μl;FQ-RT Primer Mix 2μl;RNase-Free ddH2O补 足到10μl。 3. 将反转录反应中的Mix加到gDNA去除步骤的反应液中,充分 混匀。 4. 于42℃孵育15min。 5. 95℃孵育3min后,将管插入冰中,-20℃保存备用。
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概念
RT-PCR 为反转录RCR(reverse transcription PCR)和实时PCR(real time PCR)共同的缩写。

逆转录PCR,或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。

在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。

由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”,由依赖RNA的DNA聚合酶(逆转录酶)来完成。

随后,DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖RNA 的DNA聚合酶完成,随每个循环倍增,即通常的PCR。

原先的RNA模板被RNA酶H降解,留下互补DNA。

RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术,可以检测很低拷贝数的RNA。

RT-P CR广泛应用于遗传病的诊断,并且可以用于定量监测某种RNA的含量。

(检测基因表达的方法,参见Northern Blot法。


RT-PCR有时候也会指代实时PCR(real-time PCR)。

为了与逆转录PCR相区别,通常被写作“定量PCR”(quantitative PCR)或者RTQ-PCR(real-time quantitative P CR)。

实时PCR(real-time PCR),属于定量PCR(Q-PCR)的一种,以一定时间内D NA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。

real time PCR 的定量使用萤光色素,目前有二种方法。

一种是在ds DNA中插入特异的萤光色素;另一种使用一种能与增幅DNA序列中特定寡核酸序列相结合的一种萤光探针(probe)。

real time PCR 与reverse transcription PCR 相结合,能用微量的RNA来找出特定时间、细胞、组织内的特别表达的遗传基因。

这两种RT PCR的组合又被称之为“定量RT-PCR(quantitative RT-PCR)”
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PCR技术相关试剂
A液:变性液
B液:醋酸钠溶液
C液:酚/氯仿/异戊醇混合液(50:49:1)
D液:异丙醇
E液:75%乙醇
F液:DEPC处理的灭菌去离子水
G液:RNA酶抑制剂
H液:反转录反应液
I液:反转录酶
J液:PCR反应液
K液:Taq DNA聚合酶(0.5u/&micro;l)
L液:矿物油
M液:50倍TAE电泳缓冲液
N液:溴化乙锭溶液
0液:上样缓冲液
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PCR各步骤的目的
(一)预变性:
破坏DNA中可能存在的较难破坏的二级结构。

使DNA充分变性,减少DNA 复杂结构对扩增的影响,以利于引物更好的和模板结合,特别是对于基因组来源的D NA模板,最好不要吝啬这个步骤。

此外,在一些使用热启动Taq酶的反应中,还可激活Taq酶,从而使PCR反应得以顺利进行。

(二)变性--退火--延伸循环:
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至5 5℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;
③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP
为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板D NA 链互补的半保留复制链。

(三)用PCR仪扩增时,(变性.退火,延伸)循环完成后,继续72度延伸了10分钟的原因:
1.延伸时间取决于待扩增DNA片段的长度。

(当然是在反应体系一定的条件下)例如,使用taqDNA聚合酶,72度时的碱基掺入率为35-100bp/s,因此延伸速率为1kb/min。

2.根据延伸速率推得,扩增1kb以内的dna片段1min即可,而3-4kb则需要3-4min,依次照推。

通常在最后一轮要适当的将延伸时间延长至4-10min,这样做是使pcr反应完全以提高扩增产量。

3.继续72度延伸了10分钟除了可以使pcr反应完全以提高扩增产量外,还有一个作用是:在用普通taq酶进行PCR扩增时在产物末端加A尾的作用,可以直接用于TA克隆的进行。

扩展阅读:
1./question/52500058.html?si=3
2./blog/bio/guohui/1061.htm
3./blog/bio/pinus/1136.htm
4./wiki/%E3%83%AA%E3%82%A2%E3%83%AB%E3%8 2%BF%E3%82%A4%E3%83%A0PCR。

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