差异蛋白和显著差异蛋白

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实验室常用的两种检测尿白蛋白方法比较及临床意义

实验室常用的两种检测尿白蛋白方法比较及临床意义

实验室常用的两种检测尿白蛋白方法比较及临床意义陈榕方【摘要】目的:探讨尿蛋白干化学定性与免疫比浊法检测尿白蛋白的准确性及临床价值进行一系列的分析.方法:干化学法应用仪器希森美康UF1000尿液分析仪,其原理为双波长反射侧光法、免疫比浊法应用仪器为贝克曼IMMAGE-800特定蛋白分析仪,抽取2017年3月~2018年3月天津市泰达医院内分泌科及肾内科糖尿病患者520例作为糖尿病肾病早期组和晚期组,并抽取同时间段的健康体检者420例为对照组,比较三个组别的尿蛋白干化学定性阳性率及免疫比浊法检测阳性率.结果:520例肾病组尿检者中:免疫比浊法检测呈阳性的例数为410例,阳性率为78.84%;尿蛋白干化学定性阳性患者为308例,阳性率为59.23%.420例健康体检者中:免疫比浊法检测为阳性的患者例数为72例,占17.14%;干化学法检测出尿蛋白定性弱阳性患者32例,阳性率为7.62%.在DN早期组与DN晚期组的检测结果比较分析,随着病程增加,免疫比浊法检测mALB的含量及阳性率呈持续上升趋势,差异具有显著性(P<0.05).结论:由于两种检测方法的原理、影响因素的不同,其检测结果也存在差异.免疫比浊法更准确.【期刊名称】《中国医疗器械信息》【年(卷),期】2018(024)022【总页数】3页(P17-18,64)【关键词】尿蛋白;方法学;免疫比浊法;干化学法;尿微量白蛋白;糖尿病肾病【作者】陈榕方【作者单位】天津市泰达医院检验科天津 300457【正文语种】中文【中图分类】R446.1糖尿病作为一种慢性疾病,继发性肾脏损害是其常见并发症,尿中蛋白质的发现是初期肾脏损害最有价值的指标之一。

随着我国生活水平的不断提高,糖尿病患病人数也在飞速增长,临床实验室尿蛋白的检测、筛查也显得尤为重要。

为明确实验室常用检测方法学的一致性,对DN早期及DN晚期病人分别使用干化学法与免疫比浊法检测尿液中的白蛋白,并将其结果进行对比分析。

SerpinA1在大肠癌中的表达及意义

SerpinA1在大肠癌中的表达及意义

SerpinA1在大肠癌中的表达及意义乔璐;张晓静;王海;高申;何成彦;黄丽红【摘要】目的探究SerpinA1蛋白在大肠癌及癌旁健康组织的表达差异,评估其作为大肠癌生物标志物的潜力和应用价值.方法将20例DukesB期大肠癌患者的肿瘤标本经二维液相色谱-质谱联用法分析,得到大肠癌组织及癌旁健康组织表达差异显著的25个蛋白,并用免疫印迹验证SerpinA1蛋白的准确性.结果质谱鉴定后显示,Serpi-nA1蛋白的表达水平在癌组织中明显高于癌旁健康组织,并在免疫印迹实验中得到证实.结论 SerpinA1有可能成为新的大肠癌候选肿瘤标志物.%Objective To research the expression status of SerpinA1 in colorectal cancer tissues and adjacent normal tissues.Methods Two-dimensional Liquid Chromatography-Mass Spectrometry analyzes samples of 20 patients with colorectal carcinoma,finding differentially expressed protein and selected SerpinA1.Then the result of SerpinA1 was i-dentified byWesternblot.Results Verification by mass spectrometer reveals that SerpinA1 express importantly higher in colorectal cancer tissues than adjacent normal tissues,with result verified the accurateness by westernblot.Conclusion The increase of SerpinA1 expression may well have a closely relationship with colorectal cancer.【期刊名称】《中国实验诊断学》【年(卷),期】2017(021)012【总页数】4页(P2053-2056)【关键词】SerpinA1;大肠癌;二维液相色谱-质谱联用法;免疫印迹【作者】乔璐;张晓静;王海;高申;何成彦;黄丽红【作者单位】吉林大学中日联谊医院检验科,吉林长春 130033;吉林大学中日联谊医院检验科,吉林长春 130033;吉林大学中日联谊医院检验科,吉林长春 130033;吉林大学中日联谊医院检验科,吉林长春 130033;吉林大学中日联谊医院检验科,吉林长春 130033;吉林大学中日联谊医院老年病科,吉林长春 130033【正文语种】中文【中图分类】R735.3大肠癌(CRC)是指产生于回盲部至肛门的恶性病变,包括结直肠癌和肛管癌,是目前癌症死亡的第二大原因[1]。

蛋白组学分析

蛋白组学分析

“蛋白组学分析”资料合集目录一、卵巢癌早期诊断标志物的蛋白组学分析及GRP二、基于iTRAQ技术炎症刺激下成骨细胞分化相关蛋白组学分析及药靶蛋白Elp2功能初步研究三、子宫内膜异位症差异蛋白组学分析四、卵巢癌早期诊断标志物的蛋白组学分析及GRP五、麦胚球蛋白组学分析及其对肠道微生物区系的影响研究六、人脐带间充质干细胞来源外泌体的提取、鉴定和蛋白组学分析卵巢癌早期诊断标志物的蛋白组学分析及GRP卵巢癌是女性生殖系统常见的恶性肿瘤之一,早期诊断对于提高治愈率和生存率具有重要意义。

近年来,随着蛋白质组学技术的发展,越来越多的研究开始关注卵巢癌早期诊断的蛋白质标志物。

其中,GRP (Glycosylation-Related Protein)是一种与肿瘤发生发展密切相关的蛋白质,其在卵巢癌中的表达和作用备受关注。

蛋白质组学是研究蛋白质表达、修饰和功能的学科,对于发现新的疾病标志物具有重要作用。

在卵巢癌的研究中,通过蛋白质组学技术可以对肿瘤组织或血清中的蛋白质进行全面分析,筛选出与肿瘤发生发展相关的蛋白质标志物。

其中,GRP是一种与糖基化相关的蛋白质,其在卵巢癌中的表达水平可能与肿瘤的恶性程度和预后有关。

GRP是一类糖基化相关的蛋白质,参与了细胞信号转导、细胞黏附和肿瘤转移等过程。

在卵巢癌中,GRP的表达水平可能会发生变化,影响肿瘤细胞的增殖、分化和转移。

研究表明,GRP在卵巢癌组织中的表达水平与肿瘤的分期和病理分级呈正相关,提示GRP可能成为卵巢癌早期诊断的标志物之一。

目前,针对GRP在卵巢癌早期诊断中的应用已经开展了一些研究。

例如,有研究采用ELISA方法检测了卵巢癌患者血清中GRP的含量,并与健康人群进行了比较。

结果表明,卵巢癌患者血清中GRP的含量明显高于健康人群,提示GRP可以作为卵巢癌早期诊断的血清学标志物。

还有研究发现,通过检测卵巢癌组织中GRP的表达水平,可以预测患者的预后和复发风险。

虽然GRP在卵巢癌早期诊断中具有一定的应用前景,但仍需要进一步的研究来验证其敏感性和特异性。

DIA方法蛋白质组学分析差异蛋白

DIA方法蛋白质组学分析差异蛋白

百泰派克生物科技
DIA方法蛋白质组学分析差异蛋白
蛋白质组学差异蛋白分析就是对不同处理条件或不同时期/状态下表达水平存在显著差异的蛋白质进行比较,寻找有意义的差异蛋白,为揭示机体响应外界变化的生理分子机制提供了理论依据。

差异蛋白质分析建立在蛋白质含量水平上,已知的各蛋白质组分的含量是进行差异蛋白分析的前提。

DIA是一种质谱数据采集方式,可以最大限度的采集所有离子的碎片信息,对蛋白质进行高通量、高精确度的定量鉴定。

基于DIA方法进行的蛋白质组学差异分析可以对复杂的、大规模混合蛋白样本进行精确的定量,从而筛选有意义的表达水平存在显著差异的蛋白质,对机体的代谢通路和代谢调控进行动态监测,揭示机体的生理病理机制以及对内外界环境变化产生反应的本质规律。

百泰派克生物科技采用AB SCIEX Triple-TOF 5600 plus高分辨质谱系统结合nanoLC-MS/MS纳升色谱,基于DIA技术提供高分辨率、高精确度的蛋白质组学差异分析一站式服务技术包裹,您只需要将您的样品寄给我们,我们会负责项目后续所有事宜,包括蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析,欢迎免费咨询。

差异蛋白质组学在作物遗传育种中的应用前景

差异蛋白质组学在作物遗传育种中的应用前景

质组 学的研 究及 其在 作 物遗传 育 种 中的应 用 前景进
’ t
行 了介 绍 。
关键词 :差异 蛋 白质组 学 ;双 向 电泳 ; 生物质
谱 技 术
随着人 类基 因组计 划 的完成 ,生命科 学 的重 心 已逐 渐转 向了蛋 白质组 学研 究 ,进 入 了 “ 基 因组 后 时代 ” 。蛋 白质 组 的概 念 最早 是在 1 9 9 4年 的 电泳会
称 为多肽 质 量指 纹 分析 。此 方法 操 作简 便 ,灵敏 度 高 ,是 目前较 常 用 的蛋 白质 鉴定 方 法 。但 电喷雾 电
且 样 品制 备 过程 中出现 的错 误 在后 续 的步 骤 中很 难 弥 补 。 因此 ,应 根据 实 验 目的对 样 品铝 备 程 序进 行 0
反 复摸 索 , 以获得 最 佳方 法 。 11 .. 等 电聚 焦 电 泳 ( o lc i fc s g I F 。 蛋 2 i e t c o u i ,E ) s e r n 白质 是兼 性 分 子 ,依 环 境 p 的不 同而 携 带 不 同的 H 电荷 或 不带 电荷 。等 电点是 蛋 白质 净 电荷 为零 时的 p 9 HI 1 。等 电聚 焦 就 是 在 有 电场 和 p 梯 度 存 在 的情 H 况 下 ,蛋 白质 分 子会 向净 电荷 为 零 的 p 处 移 动 , H
较常 用 的就是双 向 电泳 与质谱 连用 。 1 双 向凝胶 电泳 技 术 。双 向凝 胶 电泳 技 术 是 目 . 1 前分 离细 胞或 组 织 中复杂 蛋 白质混 合物 的核心 技 术
【 4 ]

双 向 电泳技术 是在 1 7 9 5年 由 O’F r l最 早 建 ar l e
立 的[ 5 ] 第 一 向为等 电聚 焦 电泳 ,根据 蛋 白质 的 。其

质谱数据的差异蛋白阈值

质谱数据的差异蛋白阈值

质谱数据的差异蛋白阈值1.引言1.1 概述在这篇长文中,我们将探讨质谱数据的差异蛋白阈值。

质谱数据分析在生物学和药物研发等领域中扮演着至关重要的角色。

通过质谱技术,我们可以获取样本中蛋白质的丰度和结构信息,进而揭示关键蛋白质的变化和功能。

差异蛋白作为研究的重要对象之一,其变化信息与疾病发生和发展密切相关。

然而,在质谱数据中,蛋白质丰度的差异往往受到许多因素的影响,包括实验误差和样本的生物学变异等。

为了准确地鉴定和分析差异蛋白,我们需要设定一个合适的阈值。

差异蛋白阈值是对质谱数据进行筛选和过滤的依据,用于确定哪些蛋白质是具有显著差异的。

确定差异蛋白阈值并不是一个简单的任务,需要考虑到实验设计、统计学原理和实际应用等多个因素。

在本文中,我们将介绍一些常见的差异蛋白阈值确定方法,包括统计学方法、假设检验和机器学习算法等。

同时,我们还将讨论差异蛋白阈值的应用与意义,包括在生物学研究中如何解读和利用差异蛋白的信息。

通过本文的阅读,读者将能够了解质谱数据的差异蛋白阈值的重要性和应用价值,以及一些常见的阈值确定方法。

希望本文能够对读者在质谱数据分析领域有所帮助,并为后续研究提供一些参考和指导。

1.2 文章结构文章结构在本文中,将按照以下结构进行展开研究。

首先,在引言部分我们将对质谱数据的差异蛋白阈值进行概述,阐明其研究的背景和重要性。

接着,我们将进入正文部分,首先介绍质谱数据分析的重要性,探讨为什么质谱数据分析对于生物学和医学研究非常重要。

随后,我们将重点阐述差异蛋白的鉴定与分析方法,包括质谱数据的采集和处理、差异蛋白的筛选和统计分析等内容,以帮助读者更好地理解差异蛋白的发现和鉴定过程。

最后,在结论部分,我们将讨论差异蛋白阈值的确定方法,包括常见的统计方法和实验验证方法,并探讨其在差异蛋白研究中的应用与意义,以期为相关研究提供一定的参考。

通过以上结构的安排,我们旨在全面介绍差异蛋白阈值的研究现状和方法应用,并为读者提供一个清晰的研究框架,助力他们深入了解和探索质谱数据的差异蛋白阈值相关内容。

不同分期胃腺癌及癌旁组织蛋白质表达谱的研究

不同分期胃腺癌及癌旁组织蛋白质表达谱的研究

不同分期胃腺癌及癌旁组织蛋白质表达谱的研究褚美芬;陈毓;郭剑民;吴怡春【摘要】目的建立Ⅱ、Ⅳ期胃腺癌及癌旁胃组织的蛋白质表达谱并分析其表达的差异.方法从胃腺癌Ⅱ期和Ⅳ期患者各3例提取胃癌组织(CalⅠ和CalⅤ)及胃旁组织(PⅡ和PⅣ)中总蛋白,采用双向凝胶电泳获得CalⅠ、CaⅤ、PⅡ、PⅣ胃组织蛋白质表达谱,通过基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)对主要差异蛋白进行分析.结果PⅡ与CalⅠ之间蛋白质表达有显著差异(达2.0倍以上)的蛋白点有28个,CalⅠ 3个蛋白点表达上调,25个蛋白点表达下调;PⅣ与CalⅤ之间蛋白质表达有显著差异(达2.0倍以上)的蛋白点有25个,CalⅤ这些蛋白点表达均下调.使用MALDI-TOF/TOF质谱成功鉴定到8个蛋白点在CaⅡ和CalⅤ中的表达与PⅡ、PⅣ均有显著差异,分别是谷胱甘肽巯基转移酶、内质网蛋白ERP29、SH3P、蛋白质膜联蛋白A4、肝脏型脂肪酸结合蛋白、磷酸丙糖异构酶、Transgelin和磷脂酰乙醇结合蛋白,这些蛋白大多与细胞增殖、细胞凋亡及信号转导相关.结论不同分期胃癌与其癌旁组织之间存在蛋白质表达差异,有助于从分子水平了解胃癌的发病机制,探索新的胃癌相关标志物和基因治疗靶点.【期刊名称】《浙江医学》【年(卷),期】2015(037)019【总页数】5页(P1573-1577)【关键词】胃腺癌;蛋白质组学;双向凝胶电泳;MALDI-TOF/TOF【作者】褚美芬;陈毓;郭剑民;吴怡春【作者单位】310053杭州,浙江医学高等专科学校检验系;310053杭州,浙江医学高等专科学校检验系;浙江省肿瘤医院腹部外科;310053杭州,浙江医学高等专科学校检验系【正文语种】中文【 Abstract】 Objective To analyze protein profiles in gastric carcinoma with different stages. Methods The total proteins were extracted from specimens of gastric carcinoma TNM stage II and VI(CaII,CaIV)and corresponding pericancerous gastric tissue(PII,PIV).The proteins were separated by two-dimensional gel electrophoresis(2-DE)and analyzed by laser desorption ionization time of flight mass spectrometry(MALDI-TOF/TOF). Results There were 28 significantly spots between PII and CaII(>2.0),among which 3 spots were up-regulated and 25 spots were down-regulated in CaII;25 significantly spots were found between PIV and CaIV(>2.0),all of which were down-regulated in CaIV.Eight spots in gastric carcinoma tissue were identified by MALDI TOF/TOF mass spectrometry.Glutathione S-transferase,ERP29,SH3P,Annexin A4,liver fatty acid binding protein,triosephosphate isomerase isoform 2,transgelin and phosphatidylethanolamine-binding protein 1 were identified in both CaII and CaIV,compared with the corresponding pericancerous tissue. Conclusion Protein expressions are different between gastric cancer tissue and the corresponding pericancerous tissue.胃癌是消化系统最常见的恶性肿瘤之一[1]。

利用iTRAQ定量蛋白质组学筛选与DAI相关的生物标志物

利用iTRAQ定量蛋白质组学筛选与DAI相关的生物标志物

iTRAQ定量蛋白质组学筛选与DAI相关的生物标志物Itraq定量蛋白质组学技术和生物信息学分析鉴定大鼠弥漫性轴索损伤的血浆标志物题目:Identification of plasma biomarkers for diffuse axonal injury in rats byiTRAQ-coupled LC–MS/MS and bioinformatics analysis期刊:Brain Research Bulletin影响因子:3.440合作技术:iTRAQ研究背景DAI(弥漫性轴索损伤)是一种严重且复杂的脑损伤,目前临床上没有相关可靠的生物标志物帮助其进行早期DAI诊断。

因此,作者建立了DAI大鼠模型,并利用iTRAQ定量蛋白质组学技术筛选与DAI相关的血浆生物标志物,该研究既有助于DAI临床诊断的发展,也对DAI潜在分子机制有了进一步了解。

研究内容结果1. 大鼠脑组织病理学检查作者采用HE染色法和Bielschowsky神经纤维银染法对构建的DAI大鼠模型(1h、6h、1d、3d、7d)进行脑组织病理学检查,结果显示对照组脑组织样本未发生任何类型的病理改变,模型组的胼胝体中则观察到不同程度的轴突肿胀、紊乱、断开及轴缩球(图1)。

这些结果证实,研究中使用的大鼠样本适合于进行iTRAQ的定量蛋白质组学分析以鉴定大鼠中的DAI生物标志物。

图1 大脑组织样本HE染色(A-F)和Bielschowsky神经纤维银染色(G-L)结果2. DAI大鼠模型蛋白质组学结果在对血浆样品进行iTRAQ蛋白质组学分析中,共鉴定到374个蛋白质,其中共有58个显著差异蛋白(FC > 1.5,p-values<0.05),和对照组相比,不同时期的模型组中差异蛋白数目如图2。

针对这些差异蛋白,作者进行了GO功能分析和KEGG Pathway分析(图3)。

根据58个差异蛋白的层次聚类分析结果,在3d和7d中的蛋白质丰度发生显著改变(图4A)。

尿微量白蛋白的临床检测的注意事项

尿微量白蛋白的临床检测的注意事项

尿微量白蛋白的临床检测的注意事项欧阳嵘目前,我国患糖尿病、高血压、心脑血管病的人数日益增多。

随着病程的发展,肾脏受累的可能性与受累的程度也不断上升。

通常情况下血尿素和血肌酐的测定值正常时并不能排除肾脏的受损, 而尿常规蛋白测定结果为阳性时,肾脏的损伤往往已达到不可恢复的阶段,尿微量白蛋白() 的测定已越来越多地用做肾组织损伤的早期诊断指标,其临床意义也已日益为临床医生所重视。

若在发生微量白蛋白尿的这一阶段积极有效地控制血糖、降压、降脂、减少蛋白摄入量、改善生活方式,仍有希望阻止病情向大量蛋白尿发展或延缓其发展速度,同时也能减少心血管事件的发生[1-2]。

但在临床实际操作中,尿微量白蛋白的测定亦有很多需要注意的相关事项,值得我们临床医生去关注。

1、尿微量白蛋白的定义1982年等发现1型糖尿病时尿总蛋白在参考范围内,而尿白蛋白排泄却增加,由此提出了“微量白蛋白尿”的概念,并把它作为糖尿病早期肾损害一个敏感指标[3]。

其特征是尿白蛋白浓度为20-200或白蛋白排泄率20-200μ(或30-30024小时),或白蛋白/肌酐比率30-300每克肌酐)。

此时尿常规试纸条检测蛋白为阴性。

尿常规试纸条检测蛋白为阳性时白蛋白浓度已大于200(或白蛋白排泄率大于200μ),称为大量白蛋白尿。

因尿蛋白浓度受主客观因素影响比较大,故临床上更多采用白蛋白排泄率或尿白蛋白/肌酐比率来表示尿白蛋白的值。

国际上多采用白蛋白排泄率表示尿中白蛋白的排出量。

2、尿微量白蛋白发生的机理白蛋白()占血浆总蛋白量的60%,分子量为69,是一种带有负电荷的大分子蛋白。

正常情况下在肾小球滤过膜上有许多小孔起机械屏障作用,膜孔直径为5.5,限制大分子物质(如血细胞和大分子蛋白质)的滤过。

在滤过膜上还存在着带负电荷糖蛋白和硫酸乙酰肝素,这些带负电荷的结构形成了滤过膜的电子学屏障,限制了带负电荷的分子滤过。

血浆白蛋白分子量69 ,且由于其带负电荷,所以正常情况下只有极少部分能滤过,经肾小球滤过的蛋白质几乎全部被近曲小管以主动方式重吸收,因此最后随着尿液而排出的白蛋白只有极少量。

使用生物大数据技术分析蛋白质表达差异的方法

使用生物大数据技术分析蛋白质表达差异的方法

使用生物大数据技术分析蛋白质表达差异的方法随着生物技术的不断发展,生物大数据技术在生命科学领域的应用越来越广泛。

其中,分析蛋白质表达差异的方法成为了研究生物过程和疾病发生机制的重要手段。

通过比较不同条件下的蛋白质表达水平,我们可以揭示生物行为的差异和相关的调控机制。

本文将介绍几种常用的生物大数据技术,包括基于转录组学的方法、质谱技术和蛋白质亚细胞定位方法,用于分析蛋白质表达差异。

一、基于转录组学的方法1. RNA测序(RNA-seq)RNA测序技术通常用于测量基因的转录水平,并且也可以用来反映蛋白质的表达差异。

该技术通过将RNA转化为cDNA,然后对其进行测序,最后通过计算序列的数量来评估基因的表达水平。

通过RNA测序,我们可以获得详细的转录组信息,包括不同样本之间的差异表达基因。

同时,借助基因组注释信息,我们可以了解差异表达基因的功能、通路以及调控机制。

2. 微阵列微阵列技术是早期较为常用的转录组学方法之一。

它通过探针对RNA样本进行杂交,然后通过检测杂交信号强度来判断基因的表达水平。

微阵列技术可以同时检测大量的基因,但是受到设计探针的限制,可能会漏检一些基因。

此外,由于需要事先设计芯片,导致其灵活性较低。

二、质谱技术质谱技术是用于分析蛋白质及其他生物大分子的方法。

在分析蛋白质表达差异时,质谱技术提供了一种高通量、高灵敏度的手段。

1. 二维凝胶电泳(2-DE)二维凝胶电泳是一种将蛋白质在pH和分子量两个维度上进行分离的方法。

通过将样本中的蛋白质先进行等电点聚焦分离,然后再进行SDS-PAGE分离,最终形成蛋白斑点图谱。

通过比较不同条件下的斑点密度、形状和位置等,可以分析蛋白质表达差异及其调控机制。

2. 蛋白质组学蛋白质组学是指对组织或细胞中所有蛋白质的全面研究。

它包括蛋白质的鉴定和定量分析。

利用质谱技术,我们可以进行蛋白质组学研究,通过比较不同样本中的蛋白质谱图,找出表达差异显著的蛋白质,进一步分析其功能和调控机制。

德州驴乳清蛋白差异蛋白质组学研究

德州驴乳清蛋白差异蛋白质组学研究

第39卷第2期遗传育种与繁殖1 doi:10.3969/j.issn.2095-3887.20l9.02.001遗传育种与繁殖德州驴乳清蛋白差异蛋白质组学研究张新浩,李海静,刘景辉,杨莉,嵇传良,赵付伟(国家胶类中药工程技术研究中心,东阿阿胶股份有限公司,山东聊城252200)摘要:驴奶的营养成分比例与母乳相近,是牛奶的最佳替代乳品。

为研究影响驴产奶量的分子机制,采用非标记质谱法对不同产奶量德州驴的乳清蛋白进行了定量分析。

结果表明:德州驴奶共鉴定出216个乳清蛋白,其中19个在高产样本中存在显著差异(!<0.05);在这些蛋白质中,有16个上 调,3个下调。

对差异表达蛋白(DEP-)生物信息学分析表明,大多数DEP-参与了内质网蛋白合成、雌激素信号通路、孕酮介导卵母细胞成熟和PI3K-A kt信号通路。

文章首次对高产驴和低产驴奶样中乳清蛋白质谱进行分析,并确定了与德州驴产奶量性状相关的分子机制的候选蛋白质,为高产 奶驴的 了标记。

关键词:德州驴;产奶量;蛋白质组学;分子机制中图分类号:S822.2 文献标志码:A文章编号:2095-3887(2019)02-0001-05Study of Differential Proteomics of Dezhou Donkey Whey ProteinsZhang Xinhao,Li Haijing,Liu Jinghui,Yang L i,Ji Chuanliang,Zhao Fuwei(National Engineering Research Center for Gelatin-based TC M,Dong’e E’jiao Co.,Ltd,Liaocheng,Shandang252200,China)Abstract:Donkey milk has a similar proportion of nutrients to breast milk and is the best substitute for milk.In this study, label-free mass spectrometry analysis was conducted to quantitatively identify the whey proteins expressed in Dezhou donkey of different milk yields.Results revealed that a total of 216 whey proteins were identified,and19 of them showed significant differences in high-m ilk-yield samples.Of these proteins,16 were upregulated and+ were downregulated.Differentially expressed proteins(DEPs)were subjected to intensive bioinformatic analysis.The majority of DEPs participated in protein processing in endoplasmic reticulum,estrogen signaling pathway,progesterone-mediated oocyte maturation,and PI3K-A k t signaling pathway.This study analyzed the whey protein profile of high milk yield donkey and low milk yield donkey and to identify candidate proteins that related to the molecular mechanism of the yield traits of Dezhou donkey.This study provided the biomarkers for the selection of high-milk-yielding donkey.Keywords:Dezhou donkey;milk yield;proteomics;molecular mechanism驴奶的营养成分比例与母乳相近,对患牛奶蛋白 过敏或食物不耐受的婴儿致敏性较低[1]。

蛋白质组学筛选差异蛋白

蛋白质组学筛选差异蛋白

百泰派克生物科技
蛋白质组学筛选差异蛋白
蛋白质组学筛选差异蛋白就是差异蛋白组学研究的主要内容,差异蛋白组学就是在组学水平上研究不同状态或不同处理条件下表达水平存在显著差异的蛋白质,以研究生物体在不同条件下的反应机制,是研究和认识生命活动本质的一个有效途径。

差异蛋白质组学在一定程度上揭示了生命活动变化的分子机理,在疾病的诊断、发生、病程和疗效监测上有着重要意义,也广泛应用于作物育种工程和基因工程产物鉴定等。

液相色谱串联质谱技术是差异蛋白质组学研究中常用的分析手段之一,液相色谱将蛋白质中的不同成分进行分离,质谱则可对蛋白质的分子质量和序列等进行精确鉴定。

液相色谱结合质谱技术可以对蛋白质进行定性和定量检测,从而实现差异蛋白质组学的分析。

百泰派克生物科技采用高通量质谱平台提供高效快速的差异蛋白组学分析技术服务,包括差异蛋白的筛选、差异蛋白质定性和相对/绝对定量分析等,欢迎免费咨询。

蛋白组学筛选差异蛋白

蛋白组学筛选差异蛋白

蛋白组学筛选差异蛋白
蛋白组学是通过对生物体内蛋白质的研究来揭示其生物学功能
及其与疾病之间的关系。

在蛋白组学研究中,筛选差异蛋白是非常重要的一步。

差异蛋白指的是在两组或多组样品中,表达量或修饰状态存在显著差异的蛋白质。

通过筛选差异蛋白,我们可以了解不同生理状态或疾病状态下蛋白质表达的变化情况,从而为疾病的诊断、治疗和预防提供重要的信息。

蛋白组学筛选差异蛋白的方法主要包括两维凝胶电泳、质谱分析、蛋白芯片等。

这些方法都具有高通量、高灵敏度、高分辨率等优点,可以同时分析大量的蛋白质样品,并发现微小的蛋白质表达差异。

差异蛋白鉴定的过程需要经过蛋白质提取、样品制备、蛋白质分离、质谱分析等多个环节。

其中,样品制备和蛋白质分离是影响差异蛋白鉴定结果的关键步骤。

因此,合理的样品处理和蛋白质分离方法对于差异蛋白的筛选至关重要。

总之,蛋白组学筛选差异蛋白是一项复杂而重要的工作。

通过这项工作,我们可以发现新的生物标志物、生物过程及其调控机制,为疾病的早期诊断、疾病发生机制的研究以及新药研发提供重要的理论基础及实验依据。

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差异蛋白的概念

差异蛋白的概念

差异蛋白的概念差异蛋白是指在不同生理状态或疾病状态下,相同生物体或细胞中表达水平有所不同的蛋白质。

它们是生物学研究中非常重要的一类蛋白质,能够反映生物体或细胞的生理、病理状态以及各种环境因素对蛋白质产生的影响。

差异蛋白具有丰富的功能,其变化与生物体的正常发育、生长、繁殖以及疾病的产生和发展密切相关。

差异蛋白的产生可以由多种因素引起。

首先,生物体在不同的生理阶段或发育过程中,蛋白质的表达水平会有明显的差异。

例如,人体在胚胎发育过程中,细胞会发挥不同的功能,不同的组织器官会表达不同的蛋白质,这些差异蛋白在胚胎分化和组织形成中起到关键作用。

此外,差异蛋白在不同组织器官中的表达也会有所不同,这是因为不同组织器官对蛋白质的需求和功能不同。

其次,外界环境因素也能够导致差异蛋白的产生。

例如,温度、光照、干旱、盐碱等环境因素的变化都会影响生物体或细胞内的基因表达水平,进而导致特定蛋白的表达上调或下调。

这种差异蛋白的产生可以被视为生物体对环境适应能力的一种反应。

第三,疾病状态是导致差异蛋白产生的另一个主要因素。

不同疾病的发生和发展常伴随着一系列蛋白质的异常表达。

通过研究差异蛋白,可以更好地了解疾病的发生机制,寻找治疗疾病的靶点和标志物。

差异蛋白的表达水平可以通过多种方法进行检测。

常用的方法包括基因芯片、质谱分析、蛋白质电泳、免疫印迹等。

通过这些方法,可以对不同样本中的蛋白质进行定性和定量分析,找出在不同生理或病理状态下表达水平发生变化的差异蛋白。

差异蛋白的研究对于理解生物体的生命周期、疾病发生机制以及发展新型治疗方法具有重要意义。

首先,差异蛋白的发现可以帮助我们了解不同组织器官、细胞类型之间的异同,揭示其在生物体发育、功能维持和疾病发展中的作用。

例如,在心脏细胞中发现的差异蛋白可以为心脏病的治疗提供新的靶点和策略。

此外,差异蛋白的研究也为个性化医学提供了重要参考。

不同个体或不同病人对同一药物的反应差异很大,很大程度上是由于其体内差异蛋白的存在与表达水平不同。

差异蛋白筛选条件_概述说明以及解释

差异蛋白筛选条件_概述说明以及解释

差异蛋白筛选条件概述说明以及解释1. 引言1.1 概述差异蛋白筛选是一种通过比较不同条件下的蛋白质组学数据,寻找并鉴定出在生物学或疾病过程中表达发生变化的蛋白质的方法。

差异蛋白质可能在不同细胞状态、组织类型或疾病状态下表达量发生显著变化,这些差异蛋白质的发现对于理解生物学过程、揭示疾病机制以及发现新的治疗靶点具有重要意义。

1.2 文章结构本文将首先对差异蛋白筛选条件进行概述和说明,介绍其定义、重要性以及应用领域。

接着,我们将详细解释常见的差异蛋白筛选条件,包括组织来源选择、样本处理方法选择和分析技术选择。

在此基础上,我们将进一步阐述差异蛋白筛选条件的关键要点,如生物学重现性和统计学显著性要求、样本量和样品质量要求以及实验设计和对照组设置要求。

最后,我们将总结差异蛋白筛选条件的要点,并讨论可能存在的局限性,并展望未来该领域的发展方向。

1.3 目的本文的主要目的是提供对差异蛋白筛选条件进行全面概述和解释,帮助读者理解差异蛋白筛选方法的基本原理和操作步骤。

通过了解不同条件下蛋白质表达变化的判定标准和技术选择,读者将能更好地设计和实施差异蛋白筛选实验,并正确解读实验结果。

此外,我们还将讨论差异蛋白筛选方法存在的局限性,并探讨未来改进和拓展该领域的方向。

2. 差异蛋白筛选条件的概述2.1 差异蛋白筛选的定义差异蛋白筛选是一种通过比较不同生物样本中蛋白质表达水平的方法,以确定差异表达的蛋白质。

它可以帮助我们理解不同生物状态之间的差异以及相关生物过程的调控机制。

2.2 差异蛋白筛选的重要性差异蛋白筛选在生命科学研究中具有重要作用。

通过发现和鉴定差异表达蛋白质,我们可以深入了解细胞信号转导、代谢途径、疾病机制等方面的差异及其调控机制。

这有助于识别潜在的生物标志物,开发新型药物靶点,并促进个性化医学等领域的发展。

2.3 差异蛋白筛选的应用领域差异蛋白筛选已广泛应用于多个领域。

在分子生物学和细胞生物学研究中,通过比较正常和疾病组织或细胞系的差异表达蛋白质,可以揭示疾病的发生机制和进展过程。

琥珀酰化修饰位点及相关差异蛋白表达

琥珀酰化修饰位点及相关差异蛋白表达

琥珀酰化修饰位点及相关差异蛋白表达全文共四篇示例,供读者参考第一篇示例:琥珀酰化修饰是一种常见的蛋白修饰方式,它通过将琥酮酸基团(succinyl)连接到蛋白质的特定位点上,从而改变蛋白的功能和稳定性。

琥珀酰化修饰在细胞生物学和生物化学研究中被广泛应用,可以促进蛋白质的转运、降解和相互作用等生物学过程。

不同蛋白质的琥珀酰化修饰位点是多样的,这种差异性可以影响蛋白质的结构和功能。

近年来,通过大规模蛋白组学和基因组学研究发现了许多琥珀酰化修饰位点及其相关的差异蛋白表达。

这些研究揭示了琥珀酰化修饰在细胞和疾病发生中的重要作用,为开发新的治疗方法和药物靶点提供了重要线索。

在一项最新的研究中,科学家发现了一种新的琥珀酰化修饰位点,它位于蛋白质的激活区域,可以影响蛋白激活和信号传导的速度。

通过比较正常细胞和癌细胞中该位点的琥珀酰化修饰水平,研究人员发现癌细胞中的琥珀酰化修饰水平显著高于正常细胞,这可能是导致癌细胞异常增殖和生长的原因之一。

研究人员还发现了一种激素受体蛋白在糖尿病患者中的琥珀酰化修饰位点,这种修饰可以影响激素受体与激素结合的亲和力,导致患者患上糖尿病后对激素反应不佳。

通过分析不同治疗方法对该位点的影响,研究人员成功找到了一种新的治疗糖尿病的途径,为临床治疗提供了重要的指导和参考。

除了在疾病诊断和治疗中的应用外,琥珀酰化修饰位点还在蛋白质结构和功能研究中起着重要作用。

通过对特定蛋白质修饰位点的结构和功能分析,科学家可以揭示蛋白质的功能区域和生物过程中的关键作用。

这对于新药研发和疾病机制研究具有重要意义,可以为相关领域的进一步研究提供重要线索和指导。

第二篇示例:琥珀酰化修饰是一种重要的蛋白后修饰方式,它可以改变蛋白的功能、稳定性和亚细胞定位。

在这种修饰中,琥珀酰化位点在蛋白上被修饰为琥珀酰基,进而导致蛋白的生物学功能发生改变。

近年来,越来越多的研究表明,琥珀酰化修饰在细胞信号传导、代谢调控、细胞周期等多个生物过程中发挥着重要作用。

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差异蛋白和显著差异蛋白
1.引言
1.1 概述
在生物学研究领域,蛋白质是组成细胞的重要分子之一,扮演着许多关键功能的角色。

不同的细胞类型、生物体以及病理条件下,蛋白质的表达水平和组成会发生变化。

这些变化常常与细胞或生物体的功能和疾病发生密切关联。

差异蛋白(Differentially expressed proteins)是指在不同条件下(例如,不同组织、生长阶段、病理状态等)中表达水平有显著变化的蛋白质。

研究差异蛋白可以揭示不同条件下蛋白质的变化模式,从而帮助我们理解细胞的功能以及生物体的响应机制。

而显著差异蛋白(Significantly differentially expressed proteins)是在差异蛋白的基础上经过统计学分析得出的具有显著差异表达的蛋白质。

统计学分析通常通过比较两个或多个组之间的蛋白质表达水平,并运用适当的假设检验方法来确定差异的显著性。

显著差异蛋白的发现可以帮助我们筛选出真正与条件变化相关的蛋白质,提供更具有生物学重要性的信息。

通过研究差异蛋白和显著差异蛋白,我们可以探索细胞和生物体在不同条件下的调控机制、代谢通路的变化以及疾病的发生机理。

这些研究对于深入了解生物体的生理和病理过程,以及寻找新的生物标记物和药物靶点具有重要意义。

在接下来的正文部分,我们将详细介绍差异蛋白和显著差异蛋白的研究方法、应用领域以及相关的统计学分析方法。

同时,我们还将探讨差异蛋白和显著差异蛋白在癌症研究、新药研发以及生物工程领域的应用前景。

最后,在结论部分,我们将总结差异蛋白和显著差异蛋白的研究进展,并展望未来的发展方向。

通过对差异蛋白和显著差异蛋白的深入研究,我们将更好地理解生物体的功能和调控机制,为生物学研究以及相关领域的应用提供更深入的探索和发展。

1.2 文章结构
文章结构部分的内容可以包括以下内容:
文章结构部分通常用于介绍整篇文章的组织结构和主要内容安排。

对于这篇文章,可以简要介绍正文部分的各个主题或章节,并说明每个主题或章节的内容和意义。

例如:
文章结构
本文主要分为三个部分:引言、正文和结论。

在引言部分,我们将首先概述差异蛋白和显著差异蛋白的定义和背景,引出这个研究领域的重要性和研究的必要性。

接着,我们将介绍文章的结构和主要内容安排。

在正文部分,我们将详细讨论差异蛋白和显著差异蛋白的概念、特征以及相关研究方法。

首先,我们将介绍差异蛋白的定义和分类,并探讨其在生物学中的重要作用和意义。

然后,我们将详细介绍显著差异蛋白的概念和检测方法,并探讨其在蛋白质组学研究中的应用。

最后,我们将讨论差异蛋白和显著差异蛋白的研究进展和未来发展方向。

在结论部分,我们将对整篇文章的主要内容进行总结和归纳,并给出我们对差异蛋白和显著差异蛋白研究的展望和建议。

通过合理地安排文章结构,读者可以清晰地了解到本文的内容和脉络,有助于他们更好地理解和阅读整篇文章。

同时,文章结构的清晰性和条理性也是评估一篇文章质量的重要标准之一。

1.3 目的
本文的目的是探讨差异蛋白和显著差异蛋白的概念、特点以及其在生物学研究中的重要性和应用。

通过对差异蛋白和显著差异蛋白的深入了解,我们可以更好地理解生物体内蛋白质表达的变化和调控机制,揭示不同生理或病理状态下的蛋白质变化规律,有助于研究和识别与疾病相关的潜在生物标志物,进一步推动医学和生物学领域的研究进展。

具体而言,本文将展开以下几个方面的内容:
首先,我们将介绍差异蛋白的概念和特点。

差异蛋白是指在不同样本或条件下表达量存在明显差异的蛋白质。

我们将探讨差异蛋白的来源、检测方法以及其在生物学研究中的意义。

其次,我们将重点讨论显著差异蛋白的概念和特点。

显著差异蛋白是指差异蛋白中具有统计学显著性的蛋白质。

我们将介绍常用的统计分析方法,如t检验、方差分析等,用于鉴定显著差异蛋白,并探讨其在研究中的应用。

接下来,我们将探讨差异蛋白和显著差异蛋白在生物学研究中的重要性。

差异蛋白和显著差异蛋白在疾病诊断、生物标志物发现以及药物研发等方面具有重要的应用价值。

我们将介绍相关研究案例,并阐述其对生物学研究的促进作用。

最后,我们将总结本文的主要内容,并展望差异蛋白和显著差异蛋白在未来的研究和应用前景。

我们希望通过本文的阐述,能够增加读者对差异蛋白和显著差异蛋白的了解,并为相关研究提供一定的参考和借鉴。

2.正文
3.结论。

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