组蛋白甲基化、磷酸化乙酰化检测实验
组蛋白修饰测定原理
组蛋白修饰测定原理
组蛋白修饰测定原理是通过特定的实验方法和技术手段,研究和分析组蛋白分子上的修饰模式和修饰类型的过程。
组蛋白是细胞核内重要的蛋白质成分,组成染色质的基本单位,对基因的表达和染色质的结构与功能调控起着关键作用。
组蛋白修饰是指在组蛋白分子上的一系列化学修饰,包括甲基化、乙酰化、磷酸化等等。
这些修饰可以改变组蛋白和DNA之间
的相互作用,影响基因的表达和染色质的结构。
因此,研究组蛋白修饰具有重要的生物学意义。
组蛋白修饰的测定原理主要包括两个方面:一是选择适当的实验方法和技术手段,用于检测组蛋白修饰的存在和类型,例如染色质免疫共沉淀(ChIP)、质谱分析等;二是利用特异的
抗体或探针来特异性地检测组蛋白的修饰状态,这些抗体或探针经常与特定的组蛋白修饰发生相互作用,从而实现对组蛋白修饰的检测和分析。
在进行组蛋白修饰的测定过程中,需要注意以下几点。
首先,选择适当的细胞或组织样本,以确保获得准确的修饰信息。
其次,进行适当的实验处理和操作,以保证实验结果的可靠性和重复性。
最后,选择适当的数据分析方法和统计学手段,对实验结果进行定量分析和解释。
总之,组蛋白修饰测定原理是通过特定的实验方法和技术手段,研究和分析组蛋白分子上的修饰模式和修饰类型的过程,为我
们深入了解基因表达和染色质功能调控提供了重要的工具和依据。
(完整版)组蛋白甲基化、磷酸化乙酰化检测实验
组蛋白甲基化/磷酸化/乙酰化检测实验
实验技术服务简介:
本检测包括甲基化组蛋白H3K4、甲基化组蛋白H3K9、甲基化组蛋白H3K27、组蛋白H3磷酸化(Ser10)检测、组蛋白H3磷酸化(Ser28)检测、组蛋白H3乙酰化检测、组蛋白H4乙酰化检测等。
【晶莱生物】
本方法基于特异性抗体检测组蛋白各组分,通过比色定量的方法得出各组分的含量。
实验周期:10-12个工作日内完成,重复检测优惠。
客户注意事项
1、抗体:
事先咨询晶莱生物,明确抗体种属以及是否有该抗体可使用,如无可由双方协商而定,客户自己购买提供或我公司代购;
2、标本收集与保存:
组织样品:新鲜组织放入液氮或-70度保存,组织不少于100mg(约绿豆大小);培养细胞:通过细胞计数取不少于2000000个细胞于EP管,加入0.5ml生理盐水或蛋白保护剂,混匀后保存于冰箱(-70℃,避免反复冻融);
血液细胞标本:以抗凝管保存血样或以淋巴细胞分离液分离细胞后加入0.5ml 生理盐水或蛋白保护剂,保存(-70℃可长期保存,避免反复冻融)
血清或细胞培养液标本:离心去掉杂质后取上清入EP管,保存(以上4℃可保存15-20天,-70℃可长期保存,避免反复冻融)
3、样本运输:
可选以下任何的一种方式寄送标本
组织样本、细胞样本以干冰运输或加入蛋白保护剂后加冰袋运输;
细胞样本也可以直接快件寄送培养瓶(密封保证不污染,培养液不漏出,细胞不要长得太满,50%左右,灌满培养液);
血清或上清液直接加冰袋寄送(密封保证液体不漏出,视路途远近2-3天可到达)。
组蛋白修饰及其功能(乙酰化,甲基化,磷酸化等)-于凯讲解学习
表观遗传学(epigentics)是研究不改变DNA序列而由于其外 部修饰引起的基因开放与否的学科,涉及的主要机制有DNA甲基 化、组蛋白修饰、基因印记、RNA干扰等。其中研究得最多是 DNA甲基化和组蛋白乙酰化、组蛋白甲基化,这些修饰与活化或 失活染色质的结构形成相关。
染色质是由许多核小体组成的,大部分真核生物中有5种富含 碱性氨基酸的组蛋白,即H1,H2A,H2B,H3和H4。H2A,H2B, H3和H4各2个分子构成的8聚体是核小体的核心部分,H1的作用是 与线形 DNA结合以帮助后者形成高级结构。
组蛋白翻译完成后,其氨基尾巴会发生多种共价修饰,如乙 酰化、甲基化、磷酸化,泛素化和ADP核糖基化等,这些修饰都 是可逆性修饰,这些修饰共同构成了“组蛋白密码”。
1. 组蛋白乙酰化
核心组蛋白乙酰化反应多发生在核心组蛋白 N端碱性氨基 酸集中区的特定 Lys 残基。组蛋白乙酰化由组蛋白乙酰转移酶 (histone acetyltransferase,HAT)和组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)协调进行。HAT通过将乙酰辅酶 A 的乙酰 基转移到 Lys 的NH+,中和掉一个正电荷。 HDAC使组蛋白去乙 酰化,与带负电荷的DNA紧密结合,染色质致密卷曲,基因的 转录受到抑制。
2. 组蛋白的甲基化
组蛋白甲基化是由组蛋白甲基化转移酶(histone methyl transferase,HMT)完成的。甲基化可发生在组 蛋白的赖氨酸和精氨酸残基上,而且赖氨酸残基能够 发生单、双、三甲基化,而精氨酸残基能够单、双甲 基化,这些不同程度的甲基化极大地增加了组蛋白修 饰和调节基因表达的复杂性。
局部乙酰化举例
当DNA与核小体尚未解开缠绕时,转录激活因子如糖皮质激素受体可以和DNA上相应 的反应元件(GRE)结合。当结合至GRE之后,糖皮质激素募集共激活因子如CBP到染色 体上的靶转录基因区。此时,共激活因子利用HAT活性使得结合在DNA启动子区域的核心 组蛋白乙酰化,进而使DNA与组蛋白结合减弱,核小体释放,转录因子和RNA聚合酶可以 与DNA上特异的启动子结合,启动靶基因的转录。
组蛋白的甲基化和乙酰化
组蛋白的甲基化和乙酰化组蛋白是一种存在于细胞核中的蛋白质,它在维持染色体结构和功能中起着重要的作用。
组蛋白的甲基化和乙酰化是两种常见的修饰方式,对基因表达和细胞功能具有重要调控作用。
甲基化是指在组蛋白上加上一个甲基(CH3)基团的化学修饰过程。
这个过程由一系列酶催化,并且可以在不同的位点上进行。
甲基化可以起到两种不同的作用:一种是直接影响DNA的结构,抑制基因的转录和表达;另一种是通过与其他蛋白质结合,招募特定的蛋白复合物来调节染色体的结构和功能。
甲基化的位点和程度可以决定基因的启动或关闭,从而影响细胞的发育和分化。
乙酰化是指在组蛋白上加上一个乙酰基(CH3CO)基团的修饰过程。
乙酰化主要发生在组蛋白的氨基酸残基上,特别是赖氨酸残基。
乙酰化可以通过增加组蛋白的正电荷来改变其电荷性质,从而影响染色体的结构和功能。
乙酰化还可以提供特定的结合位点,招募其他蛋白质结合并调节基因的表达。
乙酰化的位点和程度也可以决定基因的启动或关闭,从而影响细胞的功能和命运。
组蛋白的甲基化和乙酰化在细胞中是高度动态的过程,可以受到内外环境的调控。
甲基化和乙酰化的酶活性可以受到DNA序列、细胞因子和信号通路的调控。
这些修饰可以在细胞分裂、细胞分化和细胞应激等过程中发生变化,从而影响基因的表达和细胞的功能。
甲基化和乙酰化在遗传学、表观遗传学和癌症研究中具有重要意义。
通过研究组蛋白的甲基化和乙酰化状态,可以揭示基因组的结构和功能,理解基因调控的机制。
甲基化和乙酰化的异常可以导致基因的异常表达和细胞功能的异常,进而导致疾病的发生和发展。
因此,研究组蛋白的甲基化和乙酰化对于深入了解生物学和疾病机制具有重要意义。
组蛋白的甲基化和乙酰化是细胞基因表达和功能调控的重要机制。
这些修饰可以通过改变染色体的结构和功能来影响基因的表达和细胞的命运。
研究组蛋白的甲基化和乙酰化状态对于理解生物学和疾病机制具有重要意义,有望为疾病的诊断和治疗提供新的靶点和策略。
精子发生过程中组蛋白甲基化和乙酰化
c r mo o e p ii g a d s c e su i ae t e r g t n b t a s d a e i h y o c e t t d e p e so f me o ho s m a r n u c s f l b v ln s g e a i u lo me it s h g l r h s a e x r si n o i — n o r
s e ma o o i t pema o y e , o mai n o a l i p r t s a d m au ai n o e a o o . tfa u e t g — n p r t g n a i o s r t c t s f r t fh p o d s e ma i , n t r to fs r t z a I e t r ssa e a d n o d pm t si—p cfc g n x r s in mi t n i t i ii n , n eh so e p o a n r s i n T ee i e ei d f- e t s e i e ee p e so , t i a d me o i d v so s a d t it n - r t mi e t s i o c c h n t a i o . h p g n t mo i c i c t n p a sa ai ly n i o t n l i t c mb n to , o ai n o e s n p o e l o lx sse h o t o e in o mp ra t o e i me o i r o r n ce i ai n f r t f h y a t n ma mp e , it r r ma i c h so , m o t c c d
组蛋白的甲基化和乙酰化
组蛋白的甲基化和乙酰化组蛋白是一类含有大量赖氨酸和苏氨酸的蛋白质,它是染色质的基本单位。
组蛋白的修饰在细胞的生命活动中起到重要的调控作用。
其中,甲基化和乙酰化是最为常见和重要的修饰方式。
本文将分别介绍组蛋白的甲基化和乙酰化,并阐述它们在细胞功能和疾病发生中的作用。
一、组蛋白的甲基化甲基化是指在组蛋白的赖氨酸残基上加上一个甲基基团。
该修饰方式通常发生在赖氨酸的氮原子上。
甲基化修饰可以通过甲基转移酶来实现,其中最为重要的甲基转移酶是组蛋白甲基转移酶(PRMT)。
甲基化修饰可以在组蛋白的不同位置进行,如赖氨酸的侧链上、赖氨酸的氨基端和羧基端等。
甲基化修饰可以对染色质结构和功能产生重要影响。
首先,甲基化修饰可以改变染色质的结构,使其更加紧密,从而影响DNA的可及性和基因的表达。
其次,甲基化修饰可以参与转录调控,影响基因的启动子活性和转录因子的结合。
此外,甲基化修饰还可以参与染色质的重塑和DNA修复等生命活动过程。
甲基化修饰在细胞功能和疾病发生中具有重要作用。
例如,甲基化异常与多种疾病的发生密切相关,如肿瘤、心血管疾病和神经系统疾病等。
甲基化异常可以导致基因的过度沉默或过度激活,从而破坏细胞的正常功能。
因此,研究甲基化修饰在疾病中的作用机制,对于疾病的早期诊断和治疗具有重要意义。
二、组蛋白的乙酰化乙酰化是指在组蛋白的赖氨酸残基上加上一个乙酰基团。
乙酰化修饰通常发生在赖氨酸的氨基端上。
乙酰化修饰可以通过乙酰转移酶来实现,其中最为重要的乙酰转移酶是组蛋白乙酰转移酶(HAT)。
乙酰化修饰可以在组蛋白的不同位置进行,如赖氨酸的侧链上、赖氨酸的氨基端和羧基端等。
乙酰化修饰可以对染色质结构和功能产生重要影响。
首先,乙酰化修饰可以使组蛋白的正电荷减少,从而减弱组蛋白与DNA之间的静电相互作用,使染色质更松散,增加DNA的可及性和基因的表达。
其次,乙酰化修饰可以提供转录因子结合位点,促进转录因子的结合,从而增强基因的转录活性。
组蛋白修饰的研究方法
组蛋白修饰的研究方法一、背景许多组蛋白的各种翻译后修饰(PTM (即甲基化,乙酰化,泛素化和SUM 化)发生在赖氨酸位点。
虽然在被覆盖的组蛋白折叠域内发现了少数的修饰位点,但是翻译后修饰在柔韧的N-末端尾部区域却是相当普遍的。
许多组蛋白修饰能够调节染色质结构中重要的功能性变化,并通过直接地改变染色质结构/动态变化或通过招募组蛋白修饰蛋白和/ 或核小体改构复合体来实现。
组蛋白翻译后修饰已经被发现能影响许多基于染色质的反应,包括转录,异染色质的基因沉默和基因组稳定性。
由于能影响到整个转录程序,与基因表达相关的修饰尤其具有特殊意义。
在多种体外模型中,组蛋白翻译后修饰代谢途径的缺陷与基因表达失调有关。
这在某些情况下也与人类疾病相关,并已在免疫缺陷和各种人类癌症中得到验证。
因此, 组蛋白标志物是如何被调节的以及如何影响PTM特异性结合蛋白的相互作用将继续成为重大的研究领域。
确定组蛋白翻译后修饰的功能往往涉及到研究修饰的丰度和结合伴侣。
这里所描述的方法将对这些方面进行总结,其中包括了详述组蛋白纯化方法、制备位点特异性修饰的重组组蛋白、基于多肽的PTM结合蛋白表征体系以及染色质免疫共沉淀样品不同分析手段的实验方案的总结。
二、组蛋白修饰的研究方法①细胞裂解通过免疫印迹来检测组蛋白修饰时可以用经SDSLaem m样品缓冲液提取得到的全细胞裂解液。
对于动物细胞株而言,离心得到的细胞可以直接在样品缓冲液中重悬并煮过后上样;然而需要注意的是,一些实验方案中还会推荐在提取步骤后对样品进行超声处理。
除了碱性预处理步骤是可选的以外,真菌蛋白提取物可以用同样的方式来进行准备。
然而, 如果实验上必须尽量减少样品处理时间的话该步骤是可以省略的。
只要注明该步骤的省略以及后续实验样品均以同样方式处理即可。
提取之后再通过离心除去样品中的不溶性组分,将可溶性的全细胞提取物留在上清中。
②组蛋白富集在一些实际应用中,有必要检测富集有组蛋白的组分或纯化的组蛋白;富集的样品可以是分离得到的细胞核或者是染色质的粗提取物。
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组蛋白密码学说的完善: 1. 更好地开发新药。研究组蛋白密码对药物开发具有战略
意义,多种组蛋白修饰酶已成为相关疾病治疗的靶目标。比如,组蛋白去乙酰酶
(HDACs)抑制剂已应用于临床治疗多种肿瘤; 2. 深入探讨遗传调控和表观遗传调控相互作用的网络与不同生物学表型之间的关系;
3. 在控制真核基因选择性表达的网络体系内进一步深入理解染色质结构、调控序列以
②组蛋白的N末端尾巴可与参与维持染色质高级结构的多种蛋白质相互作用,更加稳定了核
小体的结构。而组蛋白乙酰化却减弱了上述作用,阻碍了核小体装配成规则的高级结构(如 螺线管);
③组蛋白乙酰基转移酶(HAT)对相关转录因子或活化因子进行乙酰化修饰以调节基因的表
达。如 CBP/P300对P53的乙酰化可增强其特异性 DNA结合能力、转录激活能力,并延长其 半衰期。
组蛋白乙酰化调节转录的机制
组蛋白乙酰化引起染色质结构改变及基因转录活性变化的至少包括以下几个方面: ①组蛋白尾部赖氨酸残基的乙酰化能够使组蛋白携带正电荷量减少,降低其与带负电荷的 DNA链的亲和性,导致局部 DNA与组蛋白八聚体解开缠绕,从而促使参与转录调控的各种 蛋白因子与DNA特异序列结合,进而发挥转录调控作用;
及调控蛋白之间交互作用的内在机制; 4. 建立基因表达的调控网络数据库及其分析系统。总之,随着越来越多组蛋白核心结
构区域和修饰方式的确定,组蛋白密码在基因调控过程中的作用会越来越明确。
局部乙酰化举例
当DNA与核小体尚未解开缠绕时,转录激活因子如糖皮质激素受体可以和DNA上相应 的反应元件(GRE)结合。当结合至GRE之后,糖皮质激素募集共激活因子如CBP到染色
体上的靶转录基因区。此时,共激活因子利用HAT活性使得结合在DNA启动子区域的核心
组蛋白的主要修饰类型
组蛋白的主要修饰类型组蛋白是一种存在于细胞核中的蛋白质,具有调控基因表达和维持染色体结构的重要功能。
组蛋白的修饰是指对其进行化学修饰,通过改变组蛋白的结构和功能,从而影响染色体的结构和基因的表达。
组蛋白的主要修饰类型包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等。
本文将分别介绍这些主要修饰类型及其在基因表达调控中的作用。
一、甲基化甲基化是指在组蛋白上添加甲基基团。
甲基化通常发生在组蛋白N 端的赖氨酸残基上,也可以发生在其他氨基酸残基上。
甲基化可以通过甲基转移酶催化完成。
甲基化可以影响染色体的结构和基因的表达。
在某些情况下,甲基化可以抑制基因的转录,从而起到基因沉默的作用;在另一些情况下,甲基化可以促进基因的转录,起到激活基因的作用。
二、乙酰化乙酰化是指在组蛋白上添加乙酰基团。
乙酰化通常发生在组蛋白的赖氨酸残基上,通过组蛋白乙酰转移酶催化完成。
乙酰化可以改变组蛋白的电荷性质,从而影响其与DNA的结合能力,进而影响基因的转录激活。
此外,乙酰化还可以增加组蛋白的稳定性,促进染色质的松弛,从而有利于基因的转录。
三、磷酸化磷酸化是指在组蛋白上添加磷酸基团。
磷酸化通常发生在组蛋白的丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基上,通过激酶催化完成。
磷酸化可以改变组蛋白的结构和功能,从而影响染色体的结构和基因的表达。
在某些情况下,磷酸化可以促进染色质的松弛,增加基因的转录活性;在另一些情况下,磷酸化可以抑制基因的转录。
四、泛素化泛素化是指在组蛋白上添加泛素基团。
泛素化通常发生在组蛋白的赖氨酸残基上,通过泛素连接酶催化完成。
泛素化可以标记组蛋白,促使其被降解或参与细胞过程。
泛素化还可以影响组蛋白的相互作用和结构,从而影响染色体的结构和基因的表达。
组蛋白的甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化是其主要的修饰类型。
这些修饰可以改变组蛋白的结构和功能,从而影响染色体的结构和基因的表达。
通过对这些修饰的研究,可以更好地理解基因表达调控的机制,并为相关疾病的治疗提供新的思路和方法。
基于表观遗传学修饰鉴定的研究方法
基于表观遗传学修饰鉴定的研究方法表观遗传学是近年来兴起的一个新兴领域,它研究的是影响基因表达的非遗传因素。
表观遗传学修饰可以在个体生命周期中随着时间和环境的变化而发生变化,它与环境因素的交互作用非常密切。
因此,表观遗传学修饰成为了一种重要的研究方法,可以用于生命科学、医学和环境科学中的各种应用。
表观遗传学修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA及其他的表观修饰。
DNA甲基化是一种影响基因表达的重要修饰方式,它指的是DNA上的甲基基团的添加,可以改变DNA的结构,并且影响到基因的转录和翻译。
组蛋白修饰包括甲基化、磷酸化、乙酰化等方式,通过改变组蛋白的化学性质来影响基因表达。
非编码RNA表示与蛋白质编码无关的RNA分子,其中包括微小RNA、长链非编码RNA等,它们可以通过调节转录和翻译水平来影响基因表达。
其他表观修饰包括DNA甲基去除修饰、组蛋白重塑、核体蛋白修饰、RNA剪接等方式,它们也可以影响基因表达。
表观遗传学修饰与疾病之间的关系已经成为研究的热点之一。
一些疾病如癌症、心血管疾病、精神障碍等都与表观遗传学修饰有关。
例如,DNA甲基化水平异常可以导致某些基因的表达失调,进而导致肿瘤的发生。
组蛋白修饰的变化也可以促进或抑制某些基因的表达,从而影响疾病的发生。
非编码RNA也被发现在肿瘤、心血管疾病、神经系统疾病中有重要作用,这些RNA可以通过调节基因表达、蛋白质互作、细胞周期等方式来影响疾病的发生。
因此,对表观遗传学修饰的研究可以为疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。
表观遗传学修饰的研究方法也在不断发展,其中基于高通量测序技术的修饰鉴定成为了研究的重要手段。
这种方法可以测定某个组织或细胞的整个表观遗传学修饰谱系,包括了DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等各种方式。
这种技术可以同时测定样本中的几百万个位点,从而获得全局的表观遗传学修饰谱系。
通过对正常样本和疾病样本的比较,可以找到其中的差异,从而发现和疾病相关的表观遗传学修饰标记。
组蛋白修饰与染色质结构变化的关系研究
组蛋白修饰与染色质结构变化的关系研究人类细胞的DNA由长链的核苷酸组成,若要将其塞进一个微小的细胞核内,需要将其缠绕成小尺寸的染色体。
然而,染色体在不同的细胞状态下,会呈现出不同的结构和功能,其中最重要的因素之一就是染色质。
染色质是由DNA和蛋白质组成的,而蛋白质对于染色质的活性和三维结构起到至关重要的作用,其中组蛋白修饰就是实现这一目的的重要调节机制之一。
组蛋白是染色质蛋白质中最主要的一类蛋白,它在染色体的结构和功能中发挥着重要的作用。
组蛋白修饰是通过对组蛋白分子进行修饰来影响其功能和染色质结构的一种调节机制。
这些修饰包括乙酰化、甲基化、磷酸化等多种方式。
不同的修饰方式对组蛋白分子的结构和活性产生不同的影响,从而对染色质结构和功能产生重要影响。
乙酰化乙酰化是一种重要的组蛋白修饰方式,它可以通过改变染色质纤维上的正电荷,影响染色质结构和功能。
组蛋白中所含有的赖氨酸残基,由于其带有正电荷,常会与DNA上的糖基结合形成离子键,从而使DNA捆绑到组蛋白蛋白质上。
而当这些残基被乙酰化时,它们就会失去正电荷,减少与DNA的结合,导致染色质的松弛,从而促进转录和基因的表达。
同时,乙酰化还可以影响染色质的结构稳定性。
研究表明,乙酰化使组蛋白分子之间的非共价键数量减少,从而降低染色质纤维的稳定性和结构紧密度,进一步改变染色质的结构和功能。
甲基化甲基化是一种常见的组蛋白修饰方式,它通过改变组蛋白分子上的甲基残基的状态,影响其参与DNA复制和修复过程的活性。
组蛋白的甲基化通常会导致染色质结构的紧密化和机械刚度的提高。
此外,甲基化还可以影响组蛋白的化学反应性、稳定性和亲疏水性,从而进一步影响染色质的结构和功能。
研究表明,甲基化水平的变化与一系列疾病和癌症的发生息息相关。
妊娠期酒精摄入可导致子宫颈癌、宫颈内膜癌和乳腺癌等的发生。
此外,许多化学物质也被证明在体内引起DNA甲基化,从而促进癌症细胞的生成。
磷酸化磷酸化是一种对组蛋白分子的磷酸基进行修饰,是由多种蛋白激酶调控的重要信号转导途径之一。
组蛋白修饰测定原理
组蛋白修饰测定原理组蛋白修饰是指对组成染色质的蛋白质进行化学修饰的过程。
这些化学修饰可以改变染色质的结构和功能,从而调控基因表达。
组蛋白修饰是一种重要的表观遗传调控机制,对于细胞的生物学过程和发育调控具有重要作用。
组蛋白修饰包括甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化等多种修饰方式。
这些修饰方式可以结合不同的氨基酸残基(如赖氨酸、组氨酸、丝氨酸等)进行,形成多种不同的修饰模式和修饰组合。
这些修饰模式和组合在细胞中形成一个复杂的修饰图谱,被称为组蛋白修饰图谱。
组蛋白修饰的测定原理主要基于免疫学技术,例如免疫印迹、免疫组织化学、免疫沉淀等。
下面以免疫印迹为例,介绍组蛋白修饰的测定原理。
免疫印迹是一种通过特异性抗体与目标蛋白质结合,然后通过反应染色剂来检测目标蛋白质的方法。
在组蛋白修饰的研究中,通过免疫印迹可以检测特定组蛋白修饰的存在和丰度。
在进行免疫印迹分析之前,首先需要提取细胞核或整个细胞的蛋白质。
然后将提取的蛋白质样品进行电泳分离,一般采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)。
电泳分离的目的是将蛋白质根据大小分离开来,以方便后续的免疫反应。
分离完成后,将电泳胶中的蛋白质转移到一个固定在膜上的胶膜上。
这一步骤称为蛋白质的转印。
一般使用半湿式或全湿式转印装置来完成转印过程。
转印完成后,需要用某种染料(如Ponceau S红染剂)进行蛋白质的可视化来检查转印的效果,以确保蛋白质成功地转移到了膜上。
接下来,在蛋白质转印膜上进行免疫反应。
首先,将转印膜浸泡在一种称为阻塞缓冲液中,以防止非特异性的抗体结合。
然后,加入特异性的一抗抗体,它可以与目标蛋白质中的特定修饰结合。
一抗抗体与膜上的目标蛋白质结合后,可以通过洗涤过程去除非特异性的抗体。
在去除非特异性抗体后,加入与一抗抗体结合的二抗抗体。
该二抗抗体被标记有特定的荧光素或酶,使其能够被检测出来。
一般常用的是辣根过氧化物酶(HRP)或碱性磷酸酶(AP)标记的二抗抗体。
组蛋白修饰及其功能(乙酰化,甲基化,磷酸化等)-于凯资料
组蛋白修饰的生物学意义
尤其是组蛋白乙酰化、甲基化修饰能为相关调控蛋白提供其在组蛋白上的附着位点,改变染色质结 构和活性。一般来说,组蛋白乙酰化能选择性的使某些染色质区域的结构从紧密变得松散,开放某 些基因的转录,增强其表达水平。而组蛋白甲基化既可抑制也可增强基因表达。乙酰化修饰和甲基 化修饰往往是相互排斥的。在细胞有丝分裂和凋亡过程中,磷酸化修饰能调控组蛋白共价修饰间的关系
组蛋白的其他修饰方式 相对而言,组蛋白的甲基化修饰方式是最稳定的,所以最适合作为稳定的表观遗传信息。而 乙酰化修饰具有较高的动态,另外还有其他不稳定的修饰方式,如磷酸化、腺苷酸化、泛素 化、ADP核糖基化等等。这些修饰更为灵活的影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式 的组合发挥其调控功能。
组蛋白修饰及其功能(乙酰化,甲基化,磷酸化 等)-于凯
组蛋白乙酰化调节转录的机制
组蛋白乙酰化引起染色质结构改变及基因转录活性变化的至少包括以下几个方面: ①组蛋白尾部赖氨酸残基的乙酰化能够使组蛋白携带正电荷量减少,降低其与带负电荷的 DNA链的亲和性,导致局部 DNA与组蛋白八聚体解开缠绕,从而促使参与转录调控的各种 蛋白因子与DNA特异序列结合,进而发挥转录调控作用; ②组蛋白的N末端尾巴可与参与维持染色质高级结构的多种蛋白质相互作用,更加稳定了核 小体的结构。而组蛋白乙酰化却减弱了上述作用,阻碍了核小体装配成规则的高级结构(如 螺线管); ③组蛋白乙酰基转移酶(HAT)对相关转录因子或活化因子进行乙酰化修饰以调节基因的表 达。如 CBP/P300对P53的乙酰化可增强其特异性 DNA结合能力、转录激活能力,并延长其 半衰期。
2. 组蛋白的甲基化
组蛋白甲基化是由组蛋白甲基化转移酶(histone methyl transferase,HMT)完成的。甲基化可发生在组 蛋白的赖氨酸和精氨酸残基上,而且赖氨酸残基能够 发生单、双、三甲基化,而精氨酸残基能够单、双甲 基化,这些不同程度的甲基化极大地增加了组蛋白修 饰和调节基因表达的复杂性。
组蛋白修饰及其功能(乙酰化,甲基化,磷酸化等)-于凯
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1. 组蛋白乙酰化
核心组蛋白乙酰化反应多发生在核心组蛋白 N端碱性氨基 酸集中区的特定 Lys 残基。组蛋白乙酰化由组蛋白乙酰转移酶 (histone acetyltransferase,HAT)和组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDAC)协调进行。HAT通过将乙酰辅酶 A 的乙酰 基转移到 Lys 的NH+,中和掉一个正电荷。 HDAC使组蛋白去 乙酰化,与带负电荷的DNA紧密结合,染色质致密卷曲,基因 的转录受到抑制。
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3. 组蛋白的磷酸化
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组蛋白共价修饰间的关系
组蛋白的其他修饰方式 相对而言,组蛋白的甲基化修饰方式是最稳定的,所以最适合作为稳定的表观遗传信息。而 乙酰化修饰具有较高的动态,另外还有其他不稳定的修饰方式,如磷酸化、腺苷酸化、泛素 化、ADP核糖基化等等。这些修饰更为灵活的影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式 的组合发挥其调控功能。
通常,异染色质结构域组蛋白呈低乙酰化,常染色质结构 域组蛋白呈高乙酰化。
酵母组蛋白乙酰化与去乙酰化的调节
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组蛋白乙酰化调节转录的机制
组蛋白乙酰化引起染色质结构改变及基因转录活性变化的至少包括以下几个方面: ①组蛋白尾部赖氨酸残基的乙酰化能够使组蛋白携带正电荷量减少,降低其与带负电荷的 DNA链的亲和性,导致局部 DNA与组蛋白八聚体解开缠绕,从而促使参与转录调控的各种 蛋白因子与DNA特异序列结合,进而发挥转录调控作用; ②组蛋白的N末端尾巴可与参与维持染色质高级结构的多种蛋白质相互作用,更加稳定了核 小体的结构。而组蛋白乙酰化却减弱了上述作用,阻碍了核小体装配成规则的高级结构(如 螺线管); ③组蛋白乙酰基转移酶(HAT)对相关转录因子或活化因子进行乙酰化修饰以调节基因的表 达。如 CBP/P300对P53的乙酰化可增强其特异性 DNA结合能力、转录激活能力,并延长其 半衰期。
组蛋白的甲基化和乙酰化
组蛋白的甲基化和乙酰化组蛋白是核糖体的重要组成部分,它们在调控基因表达方面发挥着重要作用。
在基因表达的调控中,组蛋白翻译为不同的表型组织。
而组蛋白的甲基化和乙酰化,则是调控基因表达过程中最为关键的步骤之一。
一、组蛋白的基本结构和功能组蛋白是核糖体中基本的结构单位,它由一对碱性蛋白(H2A、H2B)和一个非碱性蛋白二聚体(H3、H4)组成。
组蛋白作为核染色质和细胞核结构的基本元素,对于基因的表达调控发挥着重要的作用。
二、组蛋白的甲基化组蛋白甲基化是一种表观遗传调控;也就是说,这种调控方式并不影响DNA序列的变化。
实际上,组蛋白甲基化主要发生在胜肽链N端的丝氨酸上。
甲基化的胜肽链具有不同的功能。
其中,甲基化的胜肽链可以诱导染色质从紧密排列到松散排列;也就是说,它可以预示着基因的表达状态。
此外,甲基化的胜肽链还能激活或抑制基因的表达。
组蛋白甲基化通常是由酶类催化的。
其中最常见的酶是DNA甲基化酶,它依赖SAM(酸腺苷甲硫氨酸)与甲基转移酶作用,催化组蛋白N端丝氨酸的甲基化。
有许多的酶可以依靠甲基化状态来调控基因表达。
例如,HDACs(组蛋白去乙酰酶)和HATs(组蛋白乙酰化酶),这些酶可以移除或添加特定的甲基化。
三、组蛋白的乙酰化组蛋白的乙酰化是另一个重要的表观遗传调控方式。
在这种调控方式下,酰化酶可以在组蛋白上添加乙酰基。
这种化学修饰可以使组蛋白从紧密周旋向松散调制;因此,基因表达水平得以升高。
组蛋白乙酰化酶可以分为两类:HATs和SIRTs。
前者是组蛋白添加乙酰化酶,后者则是组蛋白去乙酰酶。
当出现组蛋白丝氨酸的乙酰化时,这些化学修饰可以吸引一些组蛋白转录。
这些转录因子将基因的表达水平提高到最大值。
同样,基因表达调将会被HDACs去掉,这将会降低基因表达水平;同样,SIRTs是转录因子减少表达的方式。
四、结论组蛋白的甲基化和乙酰化分别是两种不同的表观遗传调控方式。
通过这两种调控方式,组蛋白调控了基因表达,解释了许多不同的性状表达,例如器官形式、性别特征等。
组蛋白提取 组蛋白修饰位点检测
组蛋白提取组蛋白修饰位点检测
组蛋白提取和修饰位点检测是现代生物学和生物化学领域中非
常重要的技术和方法。
组蛋白是一种蛋白质,它与DNA相互作用,
调控基因的表达。
组蛋白提取是指从细胞或组织中提取出组蛋白的
过程,这一步是研究组蛋白功能和结构的重要基础。
而组蛋白修饰
位点检测则是指在组蛋白中特定的修饰位点,如乙酰化、甲基化等
修饰的检测和分析。
在实验室中,组蛋白提取通常通过细胞裂解、超声破碎等方法
获得。
提取出的组蛋白可以用于后续的实验,如质谱分析、免疫沉
淀等。
通过这些实验,可以了解组蛋白在细胞中的定位、结构和功能。
而组蛋白修饰位点检测则是利用生物化学和生物信息学的方法,对组蛋白中的特定修饰位点进行鉴定和分析。
这些修饰可以影响组
蛋白的功能,进而调控基因的表达。
组蛋白提取和修饰位点检测在基础科学研究和临床医学中都有
重要应用。
在癌症研究中,科学家们可以通过检测组蛋白的修饰位
点来了解肿瘤细胞的表观遗传学变化,从而发现新的治疗靶点。
在
药物研发中,组蛋白提取和修饰位点检测也可以帮助科学家们评估
药物对基因表达的影响,从而设计更有效的药物。
总之,组蛋白提取和修饰位点检测是生物学研究中不可或缺的重要技术,它们为我们揭示了细胞内基因表达调控的奥秘,为疾病治疗和药物研发提供了重要的理论和实验基础。
随着技术的不断进步,相信这些方法将会在未来发挥更加重要的作用。
组蛋白修饰及其功能(乙酰化,甲基化,磷酸化等)PPT演示幻灯片
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组蛋白修饰的生物学意义
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尤其是组蛋白乙酰化、甲基化修饰能为相关调控蛋白提供其在组蛋白上的附着位点,改变染色质结 构和活性。一般来说,组蛋白乙酰化能选择性的使某些染色质区域的结构从紧密变得松散,开放某 些基因的转录,增强其表达水平。而组蛋白甲基化既可抑制也可增强基因表达。乙酰化修饰和甲基 化修饰往往是相互排斥的。在细胞有丝分裂和凋亡过程中,磷酸化修饰能调控蛋白质复合体向染色 质集结。
组蛋白修饰及其功能
表观遗传学(epigentics)是研究不改变DNA序列而由于其外 部修饰引起的基因开放与否的学科,涉及的主要机制有DNA甲基 化、组蛋白修饰、基因印记、RNA干扰等。其中研究得最多是 DNA甲基化和组蛋白乙酰化、组蛋白甲基化,这些修饰与活化或 失活染色质的结构形成相关。
染色质是由许多核小体组成的,大部分真核生物中有5种富含 碱性氨基酸的组蛋白,即H1,H2A,H2B,H3和H4。H2A,H2B, H3和H4各2个分子构成的8聚体是核小体的核心部分,H1的作用是 与线形 DNA结合以帮助后者形成高级结构。
研究表明,组蛋白精氨酸甲基化是一种相对动态 的标记,精氨酸甲基化与基因激活相关,而H3和H4精 氨酸的甲基化丢失与基因沉默相关。相反,赖氨酸甲 基化似乎是基因表达调控中一种
1. H3-K9甲基化与异染色质的形成:人们曾针对异染色质的形成提出过一个模型:首先组蛋白 脱乙酰酶使H3中的K9、K14脱乙酰化,然后Suv39h1或Clr4对H32K9进行甲基化,H32K9的甲基 化再影响DNA的甲基化,随后甲基化的H32K9做为一个结合位点招募HP1或Swi6蛋白的定位, 最后HP1/Swi6通过它们的shadow染色质结合区域定位在C末端,进而形成异染色质的多聚体。 2. H32K9甲基化对常染色体中基因表达调控的影响: 3. 组蛋白其他位点上发生甲基化与基因表达的关系:大量实验表明H32K9甲基化的功能与基 因沉默有关,但其它位点甲基化可能存在激活转录作用。 4. 组蛋白甲基化与DNA甲基化:H32K9的甲基化可以直接或间接影响DNA 的甲基化,DNA 甲基化可能是组蛋白甲基化的间接结果
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组蛋白甲基化/磷酸化/乙酰化检测实验
实验技术服务简介:
本检测包括甲基化组蛋白H3K4、甲基化组蛋白H3K9、甲基化组蛋白H3K27、组蛋白H3磷酸化(Ser10)检测、组蛋白H3磷酸化(Ser28)检测、组蛋白H3乙酰化检测、组蛋白H4乙酰化检测等。
【晶莱生物】
本方法基于特异性抗体检测组蛋白各组分,通过比色定量的方法得出各组分的含量。
实验周期:10-12个工作日内完成,重复检测优惠。
客户注意事项
1、抗体:
事先咨询晶莱生物,明确抗体种属以及是否有该抗体可使用,如无可由双方协商而定,客户自己购买提供或我公司代购;
2、标本收集与保存:
组织样品:新鲜组织放入液氮或-70度保存,组织不少于100mg(约绿豆大小);培养细胞:通过细胞计数取不少于2000000个细胞于EP管,加入0.5ml生理盐水或蛋白保护剂,混匀后保存于冰箱(-70℃,避免反复冻融);
血液细胞标本:以抗凝管保存血样或以淋巴细胞分离液分离细胞后加入0.5ml 生理盐水或蛋白保护剂,保存(-70℃可长期保存,避免反复冻融)
血清或细胞培养液标本:离心去掉杂质后取上清入EP管,保存(以上4℃可保存15-20天,-70℃可长期保存,避免反复冻融)
3、样本运输:
可选以下任何的一种方式寄送标本
组织样本、细胞样本以干冰运输或加入蛋白保护剂后加冰袋运输;
细胞样本也可以直接快件寄送培养瓶(密封保证不污染,培养液不漏出,细胞不要长得太满,50%左右,灌满培养液);
血清或上清液直接加冰袋寄送(密封保证液体不漏出,视路途远近2-3天可到达)。