序列比对BLAST案列分析

相关主题
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

最相似的5个发序布列人的默检认索核号酸序列比对 考入核酸序列
得分最高的序 列,最可能是 查询的序列的 全长,点击
DDBJ查询2)的结果
2)中序列是氨基酸序列,所以 选取Blastp进入蛋白质/氨基酸序该序列为chymosin凝乳酶的一部分 列比考对入界2面)中序列
EMBL
选择核酸查询
检索号
发布默时认间为蛋白质数据库比对 基因名称
相似度发布人 最高的5 个序列 检索号
考入1)中核酸序列
耐心等待 查询核酸序列
匹配率最高 的序列即为 所查询的序 列
EMBL
默认为蛋白质数据库比对
拷贝入2)中氨基酸序列
该序列为chymosin凝乳酶的一部分
DDBJ
基因名称
发布时间
序列比对BLAST案列分析
• 1)运用Blast工具检索一下序列的信息:基因名称、 发布时间、发布人员和与其最相似的5个序列的检 索号
atggggccaa gctactgctc tcctctcttc ctctgtctcc tgctgtgcgg gggcacggag ctgtgctgtg ccctgcctct gtggctcttg cccggtggaa ctgcgaaccc agtgacgtct • 2)综合运用BLAST方法检索以下信息属于什么基因
NCBI
基因名称 拷贝1)中的序列粘贴到对话框
发布时间
核酸比对发布人员 蛋白质/氨基酸比对
匹配率最高最高 先做1)题选择核酸比对
最相似的序列检索号
2)
则2)中序列为Chymosin凝乳酶的一部分
ຫໍສະໝຸດ Baidu
对话框中考入2)中序列
核酸序列比对 蛋白质/氨基酸序列比对
2)中序列选择蛋白质/氨基酸比对
前两个匹配率相等, 名字相同,可任选一 个
的一部分:
MRCLVVLLAA LALSQASGIT RIPLHKGKTL RKALKERGLL EDFLQRQQYA VSSKYSSLGK VAREPLTSYL DSQYFGKIYI
• 首选分析1),2)中的字母组成可知,1)为核酸序列, 2)为氨基酸序列;
• 其次根据个人喜好分别登陆NCBI,EMBL,DDBJ相 关位点进行序列比对(Blast)
相关文档
最新文档