端粒酶活性检测方法
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端粒酶活性检测方法
1.端粒重复序列延伸法
端粒酶在体外可以以其自身RNA的模板区为模板,在适
宜的寡核苷酸链的末端添加6个碱基的重复序列,用聚丙烯酰胺(PAGE)凝胶电泳可显示6个碱基差异的梯带。1994年Kim建立了基于PCR基础上的端粒重复序列扩增法(Telom—eric Repeat Amplification Protoc01.TRAP)。首先合成一个18nt的TS做上游引物,端粒酶结合TS末端的GTT并合成AGGGT]rAG,然后每经过一次转位合成一个GGTTAG的6碱基重复序列,端粒酶灭活后,加入一个24nt的CX做下游引物,经过多次变性-退火-延伸,扩增端粒酶延伸产物。1994年Kim 创建了该方法,它与DNA聚合酶分析方法相似,如;把核酸提取物、代表脊椎动物端粒重复序列的单链DNA前体(T1’AGGG)4和放射标记的磷酸脱氧核糖一起孵育,然后通过放射自显影检测凝胶上新添加的DNA重复序列。此方法是最早建立的方法,它稳定性好。其缺点是,需要样本量大,敏感性差,检测时间长,不适合临床标本的大量检测,检测时需同位素量较大。此法已基本被淘汰
2.TRAP法及其改进(关键是我们有没有PCR扩增机、电泳自
显影及图像分析)
其基本原理是利用CHAPS去污剂提取端
粒酶后,将反应体系中下游引物CX(5’-(CCATTA)
3CCCTAA-3’]用石蜡层与其他反应隔开,在石蜡层
上利用端粒酶的逆转录酶活性在非端粒核酸.TS(5’.AACCGTCGAGCAGAGTT-3’)引物3’末端合成端粒重
复序列,然后将反应产物进行PCR扩增,石蜡层在
高温时溶化,CX(引物加入到反应体系中,反应体系中含有(a-32P)dGTP或(a-32P)CTP。由于端粒酶每
合成一个TTAGGG就需要RNA模板重新定位,因
此,反应产物在聚丙烯酰胺凝胶电泳上显示为相隔
6bp的梯状条带,TRAP法由于利用PcR技术对端粒
酶合成的端粒DNA进行扩增,因此能从104个正常
细胞中检出混杂在其中的一个肿瘤细胞,这大大提
高了检测的敏感性、速度和效果。此方法较可靠,目
前应用最多。但TRAP方法的缺点在于:①电泳结
果与端粒酶活性程度呈非线性相关,使得测定端粒
酶相对活性较困难;8h至两天,时间太长
改进法一:TRAP银染法
们利用银离子与DNA结合的原理,把TrAP反应物在聚丙烯酰胺凝胶电泳后进行银染显示梯状条带,此方法的结果与同位素TRAP方法一样可靠、灵敏。
法二:接近闪烁分析法
为了解决聚丙烯酰胺凝胶电泳操作繁琐等问题,有人利用接近闪烁分析技术,在96孔板上进行.TRAP操作,使大规模筛
选临床标本成为可能,其基本原理是将CX引物.5’
端用生物紊标记,2∽i[Me-3H]TTP取代[a一32P]dGTP,
PcR扩增31个循环,吸取反应物与链霉抗生素蛋白
包被的液态微球相混合,由于生物素3H标记的反应
产物与微球相结合,因此当其接近反应发生器时,能
激发含有3H的核酸液闪,从而产生信号,并由液闪
计数仪计数,未结合3H标记的游离核酸其能量被吸
收在分析缓冲液中,不能激发液闪,故不会干扰实验结果。
法三:TRAP—ELISA法(TRAP—ELISA试剂盒)
先扩增,引物TS含生物素,扩增产物与包被有亲和素的微孔板结合,并与含地高辛标记的探针杂交,酶标记抗地高辛抗体与之结合而显色,酶标仪测定结果,根据颜色的深浅进行半定量分析。
TrAP的几种方法的具体步骤我也有,但比较复杂,不好写出来,字母混乱很难复制的。而且改进方法也很多,我就以后再讨论用哪种改进方法(肯定是用改进方法了,其他的现在淘汰了)吧。现在先应付答辩吧,如果有PCR,就讲TRAP法好了。