实验十三动物组织核酸的分离、鉴定和含量测定

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目前开发了许多商品化的核酸分离柱,试剂盒,可简单、快速地分离得到
纯度很高的DNA或RNA,其分离原理有的是利用核酸的分子量差异,
有的是利用所需分离的核酸的特点将其特异性结合达到分离、回收的
目的。
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DNA和RNA分离的基本原理
根据核糖核蛋白与脱氧核糖核蛋白在一定浓度 的氯化钠溶液中的溶解度不同进行分离,然后 用蛋白质变性沉淀剂去除蛋白,使核酸释放出 来,再利用核酸不溶于乙醇的性质将核酸析出, 达到分离DNA和RNA的目的。
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核酸分离的一般步骤
1.溶解细胞 溶解细胞的方法因样品不同而不同。有的是用十二烷基硫酸 钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)加NaOH,有的是用蛋白酶, 有的用超声波破碎等方法。
2.有机溶剂抽提 利用苯酚提取主要使蛋白质变性沉淀于有机相,而核 酸保留在水相,达到分离核酸的目的。实际上生物样品中含量最多的 就是蛋白质。
动物组织核酸的分离纯化及鉴定
1. 猪肝DNA和RNA的分离 2. 核糖和脱氧核糖的显色实验
3. 核酸的定量和纯度测定
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核酸是一类生物高分子化合物,存在于一切生物体内, 是组成细胞的重要成分。它以与蛋白质结合的形式—— 核蛋白存在于细胞中,是生命的基本物质之一,具有储 存、复制生物体遗传信息的功能,也是蛋白质合成不可 缺少的物质,因此它对于生物体的生长、遗传、变异等 现象起着重要的决定作用。核酸分为两大类——核糖核 酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA) 。
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RNA:将RNA沉淀用2ml蒸馏水溶解, 然后转移至2只试管中,每只1ml。其中 一只试管中加入3ml地衣酚试剂,然后在
沸水中20min,观察颜色反应;另外一只试管 中加入2ml二苯胺试剂,60 ℃条件下反应1h, 观察颜色反应。
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3. 核酸的定量和纯度测定
紫外分光光度法(此法要求核酸纯度很高,1个Abs 相当于50ug/ml双螺旋DNA,除了定量测定以外还可 进行核酸纯度的检测,A260/A280比值,纯的DNA为 1.8,RNA为2.0,样品中含有蛋白质和苯酚时, A260/A280 比值降低。)
定糖法(DNA糖部分为脱氧核糖,RNA糖部分为核 糖,分别可以进行二苯胺显色法和地衣酚显色法)
定磷法(核酸的磷酸部分)
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二苯胺显色法原理
DNA在酸性条件下加热,其嘌呤碱与脱氧核糖间 的糖苷键断裂,生成嘌呤碱、脱氧核糖和脱氧嘧啶 核苷酸,而2-脱氧核糖在酸性环境中加热脱水生成 ω-羟基-γ-酮基戊糖,与二苯胺试剂反应生成蓝色物 质,在595nm波长处有最大吸收。DNA在 40~400μg范围内,光吸收与DNA的浓度成正比。 在反应液中加入少量乙醛,可以提高反应灵敏度。
组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为 β-D2-脱氧核糖;RNA所含的糖则为β-D-核糖。
HOCH2 O OH HH
H
H
OH OH
D-核糖
Ribose
HOCH2 O OH HH
H
H
OH H
D-2-脱氧核糖
Deoxyribose
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1. 猪肝DNA和RNA的分离
核酸分离的原则
核酸存在于多种细胞,因此分离方法复 杂而多样。又因各种DNA、RNA的含量差异, 各种分析方法对核酸的纯度及量的要求有差 异,因此在实验前应对所采用的方法有所了 解和选择。总的说来核酸的分离与纯化是在 溶解细胞的基础上,利用苯酚等有机溶剂抽 提(核酸溶于缓冲液,即水相),分离,纯 化;利用乙醇、丙酮等有机溶剂沉淀,收获。
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DNA:1ml SC溶液溶解DNA,然后转移到 50ml离心管中,用9ml 0.01M NaOH溶液溶解, 4000rpm离心10分钟,上清转移到试管中备 用。各取上述1mlDNA溶液于两个试管中,其 中一个里面加入3ml地衣酚试剂,然后在沸水 中20min,观察颜色反应;另外一只试管中加 入2ml二苯胺试剂,60 ℃条件下反应1h,观 察颜色反应。
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实验方法
A260测定:以H2O作为空白,取上清测A260值后确定稀 释倍数,使A260值在2.0左右(DNA此时的浓度约为 100ug/ml。(由于二苯胺法的测定范围是40400ug/mlDNA,所以DNA浓度如果太小会影响测定结 果)
A280测定: A260/A280比值计算。纯的DNA为1.8,RNA 为2.0。如果样品中混有RNA,则比值大于1.8;如果 样品中混有蛋白质,则比值小于1.8。
3.纯化 为了得到纯的核酸,可用蛋白酶除去蛋白;用RNA酶除去RNA, 得到纯的DNA;用DNA酶除去DNA,得到纯的RNA。
4.沉淀 为了除去分离过程中残留的有机溶剂,常用的方法是加冷乙醇和 盐沉淀核酸,再通过离心回收核酸,然后用80%乙醇洗涤沉淀,除 去多余的盐,以免影响核酸溶解和抑制后续步骤的酶促反应。
核酸完全水解产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖(核糖 或脱氧核糖)和磷酸的混合物。核酸部分水解则产生核 苷和核苷酸。每个核苷分子含一分子碱基和一分子戊糖, 一分子核苷酸部分水解后除产生核苷外,还有一分子磷 酸。核酸的各种水解产物可用层析或电泳等方法分离鉴 定。
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DNA和RNA的结构
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氯仿:纯酚的比重为1.07,有机相和水相有 时很难分开。加入氯仿(比重为1.47)可以 避免这一问题。同时,酚有时会微溶于水。 可以用氯仿将水相中的酚去除。
异戊醇:减少泡沫的产生。 可编辑版
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实验步骤
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2. 核糖和脱氧核糖的显色实验
加热条件下:
D-核糖+浓盐酸+苔黑酚
绿色
D-2-脱氧核糖+酸+二苯胺 蓝紫色
在0.14mol/L的氯化钠溶液中,RNA核蛋白溶解
度大,而DNA核蛋白溶解度小;相反在1mol/L
的氯化钠溶液中,DNA核蛋白的溶解度大,而
RNA核蛋白的溶解度小,从而使DNA和RNA核
蛋白分开。
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酚:氯仿:异戊醇抽提
酚:有效的使蛋白质变性,不能完全的抑制 RNA酶的活性,能溶解带有长poly(A)的RNA 分子。使用前必须用水饱和并用Tris平衡至 pH>7.8,以防止DNA分配到有机相。结晶酚 要在182度下重蒸去除醌类等氧化产物,这些 物质能够引起磷酸二酯键的断裂或促进核酸 交联。纯酚的比重为1.07,有机相和水相有 时很难分开。
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