Linux环境下MPI并行编程与算法实现研究

收稿日期：２００４一０３．２５ 作者简介：曾志峰（１９６３一），女，湖南怀化人，副教授，主要研究方向为并行与分布式计算、网络安全技术。
万方数据
·６２·
航空计算技术
第３４卷第２期
ＩＮＴ等），这些与语言中的数据类型相对应。ＭＰＩ除了 不同的进程通过这一调用得知在给定的通信域中一
可以发送或接收连续的数据之外，还可以处理不连续 的数据，如多维向量或类Ｃ语言中的结构数据类型。
下，可以实现计算和通信的重叠。基于阻塞和非阻塞 的机制，ＭＰＩ提供了具有以下语义的４种通信模式：标 准通信模式、缓存通信模式、同步通信模式、就绪通信
万方数据
２００４年６月
曾志峰：“ｎｕ】【环境下ＭＰＩ并行编程与算法实现研究
·６３·
模式。对于非标准通信模式，只有发送操作，没有相 应的接收操作，一般用标准接收操作代替。
１ ＭＰＩ组成
ＭＰＩ是一种消息传递编程模型并可以被广泛使用 的编写消息传递程序的标准。它由一组库函数组成， 在ＦｏｒｔｒａＩｌ或Ｃ的基础上扩展为一种并行程序设计语 言。严格来说，ＭＰｌ只是一个库，提供了应用程序的编 程接口，方便Ｆｏｒｔｒａｎ７７／９０或Ｃ／Ｃ＋＋等编程语言直 接对这些库例程或函数进行调用，实现进程间通信。 １．１ ＭＰＩ数据类型
程序的最后一条可执行语句。
２．２点对点通信模式
３）获取当前进程标识：ＭＰＩ—ＣＯＭＭ—ＲＡＮＫ
（ｃｏｍｍ，ｍｋ）返回调用进程在给定的通信域中的进程
标识号，有了这一标识号，不同的进程就可以将自身
在点对点通信中，ＭＰＩ提供了两类发送和接收机 制：阻塞和非阻塞。阻塞发送完成的数据已经拷贝出 发送缓冲区，即发送缓冲区可以重新分配使用，阻塞
１）数据移动 ａ）广播（ＭＰＩ—ＢＣＡＳＴ）：标识为ｒｏｏｔ的进程向通 信域内所有进程（含自身）发送相同消息； ｂ）收集（ＭＰＩ—ＧＡＴＨＥＲ）：标识为ｒｏｏｔ的进程（含 自身）从ｎ个进程中的每一处接收一个私人化的消 息，这ｎ个消息以排序的次序结合在一起存入ｍｏｔ进 程的接收缓冲区中； ｃ）散射：（ＭＰＩ—ＳＣＡＴＴＥＲ）散射操作与收集操作 相反，ｍｏｔ进程向ｎ个进程中的每一个（包括自身）发 送一个私人化的消息。对于所有非ｍｏｔ进程，消息发 送缓冲区被忽略； ｄ）组收集（ＭＰＩ—ＡＬＬＧＡＴＨＥＲ）：相当于通信域内 每个进程作为ｍｏｔ进程执行一次收集调用操作，既每 个进程都收集到了其他进程的数据。
调用，它完成ＭＰＩ程序所有的初始化工作，也是ＭＰＩ 之间的一种主从或依赖关系。并行算法是并行计算
程序的第一条可执行语句。
的核心，用ＭＰＩ实现并行算法，这两种基本模式基本
２）ＭＰＩ结束：ＭＰＩ—ＦＩＮＡｕｚＥ（）是ＭＰＩ程序的最 上可以表达用户的要求，对于复杂的并行算法，在ＭＰＩ
后一个调用，它结束ＭＰＩ程序的运行。也是所有ＭＰＩ 中都可以转换成这两种基本模式的组合或嵌套。
２８７个调用接口，但ＭＰＩ所有的通信功能可以用它的 一或二者的组合。并行程序设计的两种基本模式可
６个基本调用来实现，也就是说可以用这６个基本调 概括出程序各个部分的关系。对等模式中程序的各
用来完成基本的消息传递并行编程。
个部分地位相同，功能和代码基本一致，只是处理的
１）ＭＰＩ初始化：ＭＰＩ－ＩＮ ｎ．（）是ＭＰＩ程序的第一个 数据或对象不同。而主从模式体现出程序通信进程
为了支持异构环境和易于编程，ＭＰＩ定义了精确 的数据类型参数而不使用字节计数，以数据类型为单 位指定消息的长度，这样可以独立于具体的实现，并 且更接近于用户的观点瞄Ｊ。对于Ｃ和Ｆ０ｒｔｒａＪｌ。ＭＰＩ均 预定义了一组数据类型（如ＭＰＩＪＮＴ、ＭＰＩ—ＤＯｕＢＬＥ 等）和一些附加的数据类型（如ＭＰＩ—ＬＯＮＧ—ＬＯＮＧ一
ｅ）全交换（ＭＰＩ—ＡＩＪ肿ＡＬＬ）：每个进程向通信域
内ｎ个进程的每一个（包括自身），发送一个私人化的
消息。 ２）聚集 ａ）规约（ＭＰＩ—ＲＥＤｕＣＥ）：将组内所有的进程输
入缓冲区中的数据按给定的操作ＯＰ进行运算，并将 起始结果返回到ｒ００ｔ进程的接收缓冲区中。ＯＰ为规 约操作符，ＭＰＩ预定义了求最大值、求和等规约操作。
共有多少个进程在并行执行。
５）消息发送：ＭＰＩ—ＳＥＮＤ（ｂｕｆ，ｃｏｕｎｔ，ｄａｔ８呻ｅ，
为了发送不连续的数据，ＭＰＩ定义了打包（ｐａｃｋ）与解 包（ｕｎｐａｃｋ）操作，在发送前显式地把数据包装到一个
ｄｅｓｔ，ｔａｇ，ｃｏｍｍ）：ＭＰＩ—ＳＥＮＤ将发送缓冲区ｂｕｆ中的
ｃｏｕｎｔ个ｄａｔ８帅ｅ数据类型的数据发送到目的进程
为了提供给用户一个良好的并行编程环境，很多 厂商开发了有自己特色的支持平台，如ＩＢＭ公司的 ＥＵＩ、Ｉｎｔｅｌ的Ｎｘ、橡树岭的ＰＶＭ等，这些平台都是开 发出各自专有的消息传递包或消息传递库，提供了相 似的功能，并且在特定的平台上具有优越的性能，缺 点是在应用程序一级上互不兼容，可移植性很差。基 于机群系统的并行编程环境的特点是一个消息传递 模型，各个并行执行的程序之间通过传递消息来交换 信息、协调同步。消息传递是相对于进程问通信方式 而言的，而且与具体并行机存储模式无关，任何支持 进程间通信的并行机，均可支持消息传递并行程序设 计。为了开发一个高效标准具有可移植性的消息传 递库，１９９２年由ＩＢＭ、Ｉｎｔｅｌ公司、Ｐａｒａｓｏｆｔ等开发商、
所谓组通信是指涉及到一个特定组内所有进程 都参加全局的数据处理和通信操作。组通信由哪些 进程参加以及组通信的上下文，都是该组通信调用的 通信域限定的。组通信一般实现三个功能：通信、同 步、计算：通信功能主要完成组内数据的传输，同步功 能组内所有进程在特定的点上取得一致，计算功能要 对给定的数据完成一定的操作。组通信操作基本可 以分成三个类型：数据移动、聚集、同步。
ｕｎｕ】【机群环境下用ＭＰＩ实现复杂的并行算法是简单的，并且能取得较好的性能。
关键词：消息传递模型；ＭＰＩ；通信模式；并行编程
中图分类号：ＴＰ３１１．１
文献标识码：Ａ
文章编号：１６７１－６５４ｘ（２００４）０２．００６１．０４
引言
以高性能计算平台支撑的大规模并行计算已经 成为计算领域瞩目的焦点。在基于共享内存与分布 内存的并行计算机群等硬件环境下可以求解一大类 复杂的科学与工程计算问题，并行计算编程技术的进 步也使得并行计算已经开始渗透并普及到各个领域 和方面。一个并行处理系统主要由并行平台（操作系 统和硬件）与并行编程和求解应用问题的算法构成。 并行编程又包括并行语言和其他工具、源程序、编译 程序（包括预处理器、汇编程序和连接程序）、自然并 行代码等运行时间支持和其他库。所有这些操作系 统实用程序、程序设计语言、编译器以及运行时间库 等环境工具构成了并行编程环境。
其释放。用户也可以在原有通信域的基础上，定义新 的通信域。通信域为库和通信模式提供了一种重要
２ ＭＰＩ并行编程
的封装机制。
２．１ ＭＰＩ并行编程模式
１．３ ＭＰＩ调用接口
ＭＰＩ具有两种最基本的并行程序设计模式：对等
ＭＰＩ—ｌ提供了１２８个调用接口，ＭＰＩ一２提供了 模式和主从模式，大部分并行程序都是这两种模式之
ＧＭＰ等研究机构和Ｅｄｉｎｂｕｒｇｈ等大学成立了ＭＰＩ论 坛。ＭＰＩ论坛于１９９４和１９９７年分别推出了ＭＰＩ一１ 和ＭＰＩ一２标准，提供了一个适合进程间进行标准消 息传递的并行程序设计平台。目前ＭＰＩ已经发展成 为应用最广泛的并行程序设计平台，几乎被所有并行 计算环境（共享和分布式存储并行机、ＭＰＰ、机群系统 等）和流行的多进程操作系统（ｕＮⅨ、Ｌｉｎｕｘ、ｗｉｎｄｏｗｓ） 所支持，基于它开发的应用程序具有最佳的可移植 性、功能强大、效率高等多种优点。本文侧重介绍基 于ｕｎｕ）【的ＭＰＩ编程环境ＭＰＩＣＨ及其在Ｐｃ集群计算 机系统中进行ＭＰＩ并行编程的主要方法。
城。ＭＰＩ是一种消息传递编程模型并可以被广泛使用的编写消息传递程序的标准，已扩展为一种
优秀的并行程序设计语言。该文简要介绍了有关并行编程的基本概念与方法，深入讨论了ＭＰＩ并
行鳊程环境与并行编程模式，对ＭＰＩ并行性进行了分析。蛤出了Ｌｉｎ峨环境下ＭＰＩ编程环境的配置
方法，最后结合一个实例详细描述了用ＭＰＩ实现并行算法的方法。通过对实验程序的结果分析。在
第３４卷第２期 ２００４年６月
航空计算技术
Ａｅｒｏｎａｕｔｉｃａｌ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ ７ｒｅｃｈｎｉｑｕｅＶ０．３４ Ｎｏ．２ Ｊｕｎ．２００４
“ｎｕｘ环境下ＭＰＩ并行编程与算法实现研究
曾志峰
（怀化学院计算机系，湖南怀化４１８００８）
摘要：并行计算实现求解一些复杂的问题，并行编程技术的进步使得并行计算逐步应用到很多领
和其他的进程区别开来，实现各进程的并行和协作。 指定的通信域内每个进程分配一个独立的进程标识
接受的完成意味着接收数据已经拷贝到接收缓冲区， 即接收方已可以使用；非阻塞操作在必要的硬件支持
序号，例如有ｎ个进程，则其标识为Ｏ—ｎ一１。 ４）通信域包含的进程数：ＭＰＩ—ｃＯＭＭ—ｓＩｚＥ
（ｃｏｍｍ，ｓｉｚｅ）返回给定通信域中所包括的进程的个数，
６）消息接收：ＭＰＩ—ＲＥＣＶ（ｂ、ｌｆ，ｃｏｕｎｔ，ｄａｔａｔｙｐｅ， ｓｏｕｒｃｅ，ｔａｇ，ｃｏｍｍ．ｓｔａｔｕｓ）从指定的进程８０ｕｒｃｅ接收消 息，并且该消息的数据类型和消息标识和本接收进程 指定的ｄａｔａ呻＿ｅ和“喀相一致，接收到的消息所包含的 数据元素的个数最多不能超过ｃｏｕＩｌｔ。ｓｔａｔｕｓ是一个返 回状态变量，它保存了发送数据进程的标识、接收消 息的大小数量、标志、接收操作返回的错误代码等信 息。接收到的消息的源地址、标志以及数量都可以从 变量ｓ￡ａｔｕｓ中获取，如在Ｃ语言中，通过对ｓｔａｔｕｓ．ＭＰＩ— ＳＯＵＲＣＥ，ｓｔａｔｕｓ．ＭＰＩ—ＴＡＧ，ｓｔａｔｕｓ．ＭＰＩ—ＥＲＲＯＲ弓Ｉ用， 可以得到返回状态中所包含的发送数据进程的标识， 发送数据使用的ｔａｇ标识和本接收操作返回的错误代 码。
ｂ）扫描（ＭＰＩ—ｓｃＡＮ）：扫描操作要求每一个进程 对排在它前面的进程进行规约操作，结果存人自身的 输出缓冲区。