实验四__人类染色体的识别与核型分析
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实验四人类染色体的识别与核型分析
一、实验目的
1.学习染色体核型的分析方法;
2.了解人类染色体的特征。
二、实验原理
1.染色体组型(核型)是指生物体细胞所有可测定的染色体表型特征的总称。包括:染色体的总数,染色体组的数目,组内染色体基数,每条染色体的形态、长度、着丝粒的位置,随体或次缢痕等。染色体组型是物种特有的染色体信息之一,具有很高的稳定性和再现性。组型分析能进行染色体分组外,还能对染色体的各种特征做出定量和定性的描述,是研究染色体的基本手段之一。利用这一方法可以鉴别染色体结构变异、染色体数目变异,同时也是研究物种的起源、遗传与进化,细胞遗传学,现代分类学的重要手段。
2.人类的单倍体染色体组(n=23)上约有30000-40000个结构基因。平均每条染色体上有上千个基因。各染色体上的基因都有严格的排列顺序,各基因间的毗邻关系也是较为恒定的。人类的24种染色体形成了24个基因连锁群,所以,染色体上发生任何数目异常、甚至是微小的结构变异,都必将导致许多获某些基因的增加或减少,从而产生临床效应。染色体异常常表现为具有多种畸形的综合征,称为染色体综合征,其症状表现为多发畸形、智力低下和生长发育异常,此外还可看到一些特征性皮肤纹理改变。染色体畸变还将导致胎儿死产或流产。染色体病已成为临床上较常见的危害较为严重的病种之一,染色体病的检查、诊断已经成为临床实验室检查的重要内容。
1960年,在美国Denver市召开了第一届国际遗传学会议,讨论并确定正常人核型(karyotype)的基本特点即Denver体制,并成为识别人类各种染色体病的基础。按照Denver 体制,将待测细胞的染色体进行分析和确定是否正常,以及异常特点即为核型分析。人类染色体分组及形态特征见表1。
表1 人类染色体分组及形态特征(非显带标本)
A组:1-3号,可以区分。1号,最大,M,长臂近侧有一次缢痕;2号,较大,SM;3号,较大,比1号染色体段1/3-1/4)。
B组:4-5号,体积较大,SM,短臂相对较短,两者不容易区分。
C组:6-12,X。中等大小,SM,较难区分。6、7、8、11和X染色体的着丝粒略近中央,短臂相对较长,9、10、12染色体的着丝粒偏离中央。9号染色体长臂有较大次缢痕。
X 染色体介于7-8之间,但在非显带标本中难以区分。
D 组:13-14号,中等大小,ST ,均具有随体,但不一定显现或同时显现,随体的大小存在个体的差异。在非显带标本中难以区分13-15号染色体。
E 组:16-18。染色体小。16,M ,长臂近着丝粒处有一次缢痕,其存在使16号染色体的大小存在较大差异;17,SM ,短臂较长;18,SM ,是SM 中最短的一对染色体,短臂较短。在质量较好的标本中,一般可以区分16-18染色体。
F 组:19-20,次小的M 。在非显带标本中难以区分。
G 组:21-22,Y ,最小的ST 。21、22染色体的长度略有差别,但为适应临床上已将Down 综合征沿用为21三体(而显带证明与此综合征相关的是较小的那条染色体)综合征的叫法,巴黎会议(1971)建议,把这最小的一对改称为第21号(而稍大的一对称为22号),而把这较小的这对第21号染色体排在稍大的22号前面。
Y 染色体的特征,无随体,染色体一般比21、22长;两条姊妹染色单体长臂常平行并拢,而21、22则相互叉开;长臂端部常呈现绒毛状,形态不清晰;与其他染色体相比,着色往往较深;着丝粒不明显。
根据Denver 体制规定,正常核型的描述方式为:46,XX ;46,XY 。
3.人们用各种不同的方法,以及用不同的染料处理染色体标本后,使每条染色体上出现明暗相间,或深浅不同带纹的技术称为显带技术(banding technique )。
本世纪70年代以来,显带技术得到了很大发展,且在众多的显带技术中(Q 带、G 带、C 带、R 带、T 带)。G 带是目前被广泛应用的一种带型。染色体标本经胰蛋白酶、NaOH 、柠檬酸盐或尿素等试剂处理后,再用Giemsa 染色,可使每条染色体上显示出深浅交替的横纹,因为它主要是被Giemsa 染料染色后而显带,故称之为G 显带技术,其所显示的带纹分布在整个染色体上。每条染色体都有其较为恒定的带纹特征,所以G 显带后,可以较为准确的识别每条染色体,并可发现染色体上较细微的结构畸变。
三、材料与试剂
人类染色体非显带、显带标本。直尺,剪刀等。
四、实验步骤
1.分析的主要依据
着丝粒指数(%)——短臂占整条染色体的百分比:
%100⨯+q
p p
臂比——长臂与短臂的比值(q/p)。反映着丝粒位置的指标。SAT(随体)
1.0-1.7(M); 1.7-3.0(SM); 3.0-7.0(St); 7.0-(Ot);
相对长度(%)——某条染色体的相对长度为该染色体长度占染色体总长度的百分比。
人类某条染色体的相对长度(%) =该条染色体长度/∑22条染色体长度+X 染色体长 2.分析的主要步骤
① 测量、计算,。 ② 配对 ③ 剪贴
④ 排列——原则:从大到小;短臂向上;着丝粒在一条线上;性染色体单排 ⑤ 画出模式图——(相对比例)原则同上。 3.图像分析方法
20世纪60年代起,人们开始将图像处理技术应用于核型分析中来。目前已实现计算机
自动检测染色体分散良好的中期细胞,并自动完成核型分析。但这样的软件往往价格高昂,一般的单位是不具有的。Abode Photoshop 是一款流行的功能强大的图像处理软件,它比专门的核型分析软件容易获得。用这款软件,可以很容易的完成染色体的排列、测量等工作。程序远较传统方法简单。同时,他还具备传统方法所不具备的诸多功能,诸如去除原照片中的斑点、划痕,调整亮度、对比,对交叉重叠的染色体臂进行修整等,使分析结果比较完美。基本方法如下:
(1)图片获得
将图片输入电脑中。有两种获得图片的方法:一是选择染色体分散良好的有丝分裂中期的细胞,用数码相机进行拍摄(100万像素即可),然后输入电脑;一是按传统方法拍摄,再用300dpi或更高的分辨率将照片扫描进计算机。
(2)图片处理
用剪裁工具(Crop tool)将不需要的部分裁去,调整图像的位置,视情况调整亮度、对比度;去除斑点、划痕等,然后储存图像,名之为“原始图”。在进一步分析前,用橡皮工具(Eraser tool)等将照片中除染色体以外的其他区域擦除干净。然后将图像另存为“核型图”,利用这张背景干净的“核型图”进行核型分析。
(3)图片分析
根据目测,对染色体进行大致归拢。首先将一组染色体中非常明显(如最长、最短,具有随体等)、较易分辨的同源染色体进行配对,归类。其余的染色体可以根据自己的判断,暂且将它们配对。按从长到短的顺序或其他规则,将这些配对的染色体排列起来。然后,测量各条染色体的总长及各臂长度。根据测量结果,再对第一步中“误配”的染色体进行调整。
将染色体大致归类的过程仅需要反复使用套索(Lasso)与自由变形(Free transform)两个工具即可。用套索工具从图中圈选同源染色体,从Edit菜单中选择Free transform,此时被圈选的染色体外出现一个矩形的框,用鼠标按住矩形框的一个角可自由地旋转被圈选中的染色体,使短臂朝上,长臂朝下。而将鼠标伸入矩形框中并按住,则可将选中的染色体拖向任何位置。移动到目的地后,按回车键又可回到套索工具中来。自由变形的快捷键是Ctrl+T,使用此快捷键可省力不少。重复上述过程,将所有同源染色体配成对。在配对过程中,可借助放大工具(zoom tool),看清染色体的细节。
染色体间如存在交叉重叠,我们可以同时处理几个染色体重叠较少的细胞,先用套索工具小心地将叠在上面的染色体圈选、移走,再从另一张照片找到相应的细节,用橡皮图章工具(clone stamp tool)仔细地“克隆”到因“分离”而造成的“断臂”处。注意,克隆前要将两个染色体的尺寸调整成一样大。这样“修补”后的染色体比“嵌合体”式的染色体特征更典型。
视需要在画布中拉一条或几条参考线,选用套索与自由变形两种工具,按核型分析中染色体排列的规则,圈选并拖动配好对的染色体排列,将着丝点排在参考线上。
测量每条染色体的总长与臂长,调整“误配”的染色体。在菜单中选Edit→preference →Guide、Grid&Slice,将其中的Grid line every设为1cm,Subdivision则可视精度需要设为10或其他值,在菜单中选View→Ruler、View→Show→Grid显示标尺与网格,将图像放大到300%左右,根据网格线标示准确测量每条染色体的长度及相应的臂长,并做记录。由此读出的尺寸即是被扫描的原始照片中的染色体的尺寸,虽然显示在屏幕上的染色体要比原始照片中的大。如果一条染色体臂是弯曲的,可按前文叙述的方法圈选并旋转染色体,分段测量。这种测量方法既简便又准确。
算出每条染色体的总长、臂长、臂比等参数。这些参数最为接近的两条染色体为同源染色体。根据这些结果,对目测有误的配对结果进行调整。