蛋白酶专一性酶切位点地影响因素分析报告
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蛋白酶专一性酶切位点的影响因素分析
摘要:生物活性肽(bioactive peptides)是具有特殊生理功能的肽。酶法水解蛋白质广泛用于制备生物活性肽,但酶解法存在目标肽得率低、副产物过多的缺点。蛋白酶和蛋白质的选择是关键步骤,局部构象、三维结构、实验条件以及其它偶然因素也会影响蛋白水解酶的酶切效果。本文综述了温度、pH值、温度和pH值共同作用、金属离子对酶切位点的影响,旨在为研究酶切规律、制备高得率活性肽提供理论基础。
关键词:生物活性肽;蛋白酶;水解条件;酶切位点
Influencing Factors Analysis of Protease Specific
Cleavage Sites
Abstract:Bioactive peptides are fragments with specific amino acid sequences that exert a positive physiological influence on the body. Many reported Bioactive peptides are produced by enzymatic hydrolysis,but there are disadvantages of by-product and low yield.The choice of protease and protein source is a key step,and many factors such as local conformation,tertiary structure, experimental conditions and causal interference can influence the protease hydyolysis.This article presents the influencing fators,temperature,pH values,temperature combined pH values and metal ions included,to provide theoretical basis for enzymatic law analysis and higher yield bioactive peptides production.
Key words:bioactive peptides;protease;hydrolysis conditions;protease cleavage sites
1.前言
生物活性肽(bioactive peptides)是具有特殊生理功能的肽,是氨基酸以不同组成和排列方式构成的不同肽类的总称(氨基酸数目一般小于100)。生物活性肽有的是天然存在的,如谷胱甘肽、催产素、加压素、舒缓激肽、部分抗菌肽等,有的生物活性肽是以非活性的状态存在于某些蛋白质中,当用特定的蛋白酶水解后被释放出来,才成为有特定生理活性的肽。同种蛋白质经不同的蛋白酶酶解后,可以产生具有不同氨基酸序列、不同生理功能的生物活性肽,如大豆蛋白、
卵清白蛋白、牛乳蛋白、酪蛋白经不同的蛋白酶酶解可以产生具有降血压、抗氧化、防病、祛病、增强人体免疫力、促消化吸收等不同生理作用的肽[1]。由于生物活性肽在药物、保健品等领域具有广阔的应用前景,因此对生物活性肽的研究与开发具有重要意义。
2.生物活性肽的制备
为了研究生物活性肽的结构与功能,开发相关药物或保健品等,需大量制备生物活性肽。目前,获得生物活性肽的主要途径有以下3种:①直接分离提取;
②化学合成或重组DNA技术;③体外水解蛋白质[1]。
天然生物活性肽分布很广泛,目前已经从动物、植物、微生物及部分海洋生物中直接分离出多种生物活性肽。天然生物活性肽通常具有高效、低毒、无污染等特点[2]。化学合成法有固相与液相两种方式,其基本原理几乎一样。化学合成法发展较早,也比较成熟。重组DNA法一旦建立好系统,就可以大量地重复性生产所要的活性肽。然而,这些制备方法存在一定的局限性。生物活性肽在生物体内的含量一般是微量的,如谷胱甘肽、催产素等,而且目前从天然生物体中分离纯化获得活性肽的工艺还不是很完善。化学法合成仍有许多缺点,包括①消旋化现象;②侧链官能团需要保护;③整体效率低;④使用大量的有毒溶剂,且成本高昂。因此化学合成法多半用在实验室,或是高价肽的生产上。重组DNA技术在基因的表达与产品回收上仍有问题,同时该法生产的活性肽种类也有限制,不能生产酰胺肽,也不适合制备短链肽[3]。
酶法水解由于反应较温和、对蛋白质营养价值破坏小、使用的试剂毒性较低、反应具有空间立体性、产物没有消旋化现象、反应位点具有方向性、无异味等优越性,在现阶段被广泛用于制备生物活性肽。生物活性肽具有促进矿物质吸收、抑制细菌、抗高血压、抗氧化、抗疲劳、神经调节、免疫调节等生理活性,而这些功能是原蛋白质或其组成氨基酸不具备的,且许多活性肽的组成氨基酸不一定是必需氨基酸,选择合适蛋白酶水解把其有生物活性肽链片段释放出来,从而制备出具有各种各样生理功能的生物活性肽。这就为更充分的利用蛋白质资源,特别是为那些原本认为生物效价不高的蛋白质资源提供了新的机遇[4]。
迄今,获得生物活性肽的大量研究主要集中在蛋白质水解酶和蛋白质的筛选以及酶解条件的优化上,通过改善水解工艺,进一步提高生物活性肽得率。随着
生物信息学的发展及生物活性肽研究的不断深入,越来越多的蛋白质一级结构及活性肽的氨基酸序列得到阐明,免疫学的发展使得蛋白酶的酶切位点也越来越明确,这为从原料蛋白质中寻找已知氨基酸组成序列的生物活性肽提供了基础。研究表明,具有特定生物活性的肽具有相似的结构特征,而其活性与肽的理化性质相关。因此,根据活性肽的氨基酸组成结构信息和不同蛋白酶的水解位点特异性可以利用计算机使用特定酶模拟定向的释放活性肽,如黎观红等(2003)利用Access数据库软件建立了一个生物活性肽数据库,利用自编程序可用来寻找蛋白质中潜在的生物活性肽从该蛋白质中释放出来的适宜的酶。陈征松等(2007)建立了活性肽搜寻与蛋白模拟水解数据库,实现了蛋白质用单酶或者复酶的模拟水解。Vanessa Vermeirssen等(2004)建立蛋白质数据库并进行了实验,取得初步成果。
但酶法制备活性肽过程中一个具有挑战性的问题是,在蛋白质酶切过程中,会出现漏切位点和非专一性酶切位点,最终无法保证绝对把蛋白质酶切为常规的肽段,造成许多不必要的产物生成。这是利用蛋白酶催化合成活性肽最明显的副作用。对于常用的酶解来说,局部构象、三维结构、实验条件、酶切位点附近的其它氨基酸以及其它偶然因素都会影响蛋白水解酶的酶切效果[5]。因此,研究蛋白质的酶切位点的影响因素,分析蛋白质的酶切规律,对制备高纯度、高产率的目标活性肽以及进一步研究其活性与结构的关系,具有重要意义。
3.蛋白酶和蛋白质的选择
蛋白酶的选择是酶法制备活性肽的关键步骤。在酶的筛选过程中,应以原料蛋白的组成和酶的专一性为参考,也可根据目标活性肽的结构特点进行选择或通过酶工程来生产特定酶[6]。根据水解方式不同可将目前常用蛋白酶分为以下2类[7]:
(1)内切酶:作用于蛋白质分子内部肽键。包括动物蛋白酶,如胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、胃蛋白酶等;植物蛋白酶,如木瓜蛋白酶、菠萝蛋白酶、无花果蛋白酶等;以及微生物来源蛋白酶,如丹麦Novo公司生产的碱性蛋白酶Alcalase、复合蛋白酶Protamex、中性蛋白酶Neutrase等。
(2)外切酶:作用于蛋白质或多肽分子氨基或羧基末端的肽键,生成游离氨基酸,其中作用于氨基末端的称为氨肽酶,作用于羧基末端的称为羧肽酶。外