生理系统建模 第二章 生理系统建模、仿真概述
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• 利用已有的认识来构造一个与原系统结构相似 的数学模型,则模型中的每一变量将对应于原 系统中的一个生理量,同时模型中的各个参量 也具有较为明确的生理意义。这种由一组具有 生理意义的参变量所构成的数学模型则称为参 数模型。
• 因为参数模型中的各参量都对应于相应的生理 参量,故参数模型中的各参数的取值一般需要 通过生理实验来测定。
2.生理系统的研究方法
a.动物实验:对于人体生 理学研究而言采用动物实 验可以看作是动物模型。
• 一般而言,动物实验方法存在三个方面的局限性:
• 1)动物模型往往与人体差异较大,如何将其所得 的结论推广至人体是一个难题,在某些方面,其 可信度和价值也值得怀疑;
• 2)由于实验动物存在个体差异,活体实验要得到 具有统计规律的结论,需要进行大量的重复性实 验,往往要耗费大量的人力物力;
Ljung(1978)也给出如下定义:“系统辨识有 三个要素——数据、模型类和准则,即根据某一 准则,利用实测数据,在模型类中选取一个拟合 得最好的模型”
辨识的基本步骤为:
①先验知识和建模目的的依据。 先验知识指关于系统运动规律、数据以及其他方面 的已有知识。这些知识对选择模型结构、设计实验 和决定辨识方法等都有重要作用。用于不同目的的 模型可能会有很大差别。
建模关系主要研究实际系统与模型之间关系,它 通过对实际系统的观测和检测,在忽略次要因素及不 可检测变量的基础上,用数学的方法进行描述,从而 获得实际系统的简化近似模型。
仿真关系主要研究计算机的程序实现与模型之间 的关系,其程序能为计算机所接受并在计算机上运行。
第二章 生理系统建模、仿真概述
一 、建模与仿真的概念 二 、生理系统研究的发展 三 、生理系统的建模与仿真
黑箱是指对所研究的系统的内部构造和机理一无所知, 仅仅能从外部的可观测量,如系统的输入与输出来考 察系统。
• 如果还部分地知道系统内部的结构等信息,则此系统 称为灰箱;若对系统的信息完全掌握时,则该系统就 称之为白箱。对于生理系统,可以说有的是知之甚少, 有的是还不完全了解,因而,这些问题的研究就属于 黑箱或灰箱问题。
1.系统仿真 2.建模与仿真 3.仿真模型的实验 4.意义 四、 生理系统建模中常用的工程方法
三、 生理系统的建模与仿真
1. 系统仿真 2. 建模与仿真 3. 仿真模型的实验 4. 意义
(一)、系统仿真
• 系统仿真方法已经普遍为许多领域所采用,并 已显现出许多其他实验手段所无法比拟的优越 性,主要反映在以下几个方面:
•根据所建立模型的不同,系统仿真相应 的分成两大类,即物理仿真和数学仿真。 数学仿真由于往往都是借助于计算机实 现的,因此又称为计算机仿真。
心脏模型的计算机仿真
膝关节模型的计算机仿真
• 建立生理系统数学模型的方法主要有如下两种: • 1)黑箱方法 • 2)推导方法
• 1)黑箱方法 • 所谓黑箱方法,是科学方法论中的一个重要概念。
• 作为数学模型,一个黑箱问题实际上就是构造 一个联系输入与输出的传递函数,黑箱问题由
三部分组成:输入X(s),输出Y(s)和黑箱系统的 传递函数H(s),这三者间的关系如下:
•
Y(s)=H(s)X(s)
• 由此可见,对于黑箱,其数学模型即为满足某 一特定输入输出关系的传递函数。那么,欲建 立某一系统的黑箱模型,则需要获得该系统的 输入与输出的信息。这两方面信息的获取常常 通过对实际系统施加某种刺激并同时记录下系 统的响应而实现的。
• 这三点精辟地指出了建模与仿真方法的特色。从 某种意义上说,在建立模型时并不苛求与其原型 的等同性,相反,往往依所研究的目的将实际条 件理想化,将具体事物抽象化,同时还常常对一 个复杂的系统进行一系列的简化以适应解决问题 的需要。
• 正是由于在建立模型过程中所采用的理想化、 抽象化、简单化等手段,一般而言,模型是难 于全面地反映其所描述的客观事物的,而仅仅 能在有限的角度反映事物的某些特征。
• 生理系统仿真主要应用于三个方面的研究中:
• (1)用于研究人体系统的生理机制;
• (2)用于研究人体系统的病理机制及其诊治 方法;
• (3)用于研究在超常环境下生理系统的变化 及防护办法。
第二章 生理系统建模、仿真概述
一 、建模与仿真的概念 二 、生理系统研究的发展 三 、生理系统的建模与仿真
• 此时.刺激信号即为系统的输入函数X(s),而 系统在此刺激下的响应则为系统的输出函数 Y(s)。
• 2)推导方法 • 推导方法适用于那些内部结构和机理已部
分地被人们所认识的系统。那么,就可根据该 系统的物理化学过程以及解剖学与生物学知识, 用分析的方法推导出描述系统功能和特性的模 型。
• 推导方法首先要确定生理系统在解剖构成上的 划分,而系统的划分是以被研究的系统功能为 原则,将那些与这些功能有关的划入系统内, 否则,则应划到系统之外。
• (1)建立一个仿真模型; • (2)运行仿真模型进行仿真实验。
• 仿真模型与数学模型不同,数学模型仅仅是系 统的一种数学描述,对于连续系统而言,就是 一组数学方程式。为了可以利用计算机来进行 仿真实验,则需要将这些数学方程式转化为计 算机算法,并将其用计算机语言编制出程序, 这种用计算机程序所表述的模型一般不完全等 同于原来的数学模型,但应该是一种很好的近 似,并称之为仿真模型。
1.系统仿真 2.建模与仿真 3.仿真模型的实验 4.意义 四、 生理系统建模中常用的工程方法
一、 系统及其仿真与建模的 基本概念
1.建模与仿真
建模与仿真是指构造现实世界实际系统的模型和 在计算机上进行仿真的有关复杂活动
主要包括实际系统、模型和计算机三个基本部分, 同时考虑三个基本部分之间的关系,即建模关系和仿 真关系.
• 例如,当采用一个直流电机推动容水胶囊向外 挤出水流作为心脏泵血的物理模型时,则一经 开动电机,此模拟系统即开始运转,因为这种 运转是模仿真实心脏的收缩泵血活动的,故称 之为仿真。
• 然而一个数学模型建立后,与物理模型不同, 尚不能直接进行仿真实验。正如我们前面提到 的,数学模型的仿真一般要借助计算机来实现。 这将包含两个方面的内容:
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二、 生理系统研究的发展
1. 研究策略:
a.分析归纳:从分析的角度发展了像细 胞生物学,分子生物学以 及量子生物学.
b.综合演绎:从综合的角度发展了像系 统论,生物控制论等学 科, 从整体的观念研究生物系统 .
实验方法的不足之处,称为生理学研究的第三 种研究方法。
• 生理系统的建模与仿真方法,即是为了研究、 分析生理系统而建立的一个与真实系统具有某 种相似性的模型,然后利用这一模型对生理系 统进行一系列实验。这种在模型上进行实验的 过程就称为系统仿真。
第二章 生理系统建模、仿真概述
一 、建模与仿真的概念 二 、生理系统研究的发展 三 、生理系统的建模与仿真
• 当所选的计算方法较复杂,步长较小,则所获 得结果可能误差很小,但会导致计算量的增加 而仿真时间的拖延。
• 因此,仿真实验应当综合考虑硬件环境、系统 的稳定性、计算精度、仿真时间等因素,要求 选择折衷方案。
(4) 生理系统仿真的意义
• 正是由于仿真实验方法的上述优势,同时 也由于生理系统自身的错综复杂机制以及无扰 动在体实验手段的缺乏,在生理系统的研究中, 建立模型和系统仿真的方法已成为基本的预研 手段,并已应用于几乎人体的各个生理系统的 研究中,发挥着重要的作用。
• 在求解这类方程时,不可避免的会遇到积分 运算,过程比较繁琐。然而,利用拉普拉斯变换 (以下简记拉氏变换)将微分方程从时域变换到频 域时,求解过程可以变为解代数方程,从而使问 题得以简化。
2.系统辨识
系统辨识是研究如何用实验研究分析的办法 来建立待求系统数学模型的一门学科。
Zadeh(1962)指出:“系统辨识是在输入和输 出数据的基础上,从一类模型中确定一个与 所观测系统等价的模型”。
• 那么,仿真模型在计ห้องสมุดไป่ตู้机上的运行则形成了仿 真实验。因此,计算机仿真与原型系统之间经 历了两个基本过程,即建立数学模型,而后再 建立仿真模型。
• 建立了仿真模型后,即可利用计算机进行仿真 实验。
• 仿真实验存在三方面的问题:系统的稳定性, 计算精度和计算速度。
• 仿真的稳定性和计算精度与仿真实验所选择的 数值计算方法、步长的选择有关,当步长选得 较大时,仿真实验的计算速度较快,但可能导 致系统失去稳定性,计算精度降低。
• (1)可实现时空的伸缩: • 因为仿真尺度和时间不一定等同于实际的时空
尺度,故可实现时空的伸缩。例如,可在几小 时内仿真实验出数百年中的事件,亦可在实验 室内对宇宙空间进行仿真实验。因此,系统仿 真常常用来进行预测。
• (2)可实现极端条件下的实验: • 在现有的实验技术水平上,有些极端条件下的真
• 由于模型是基于某一真实系统而构造的,因此, 在模型空间所得出的问题的解就与真实空间同 一问题的解有必然的联系。
• 当采用数学模型来刻画生理系统中的定量关系 时,数学表达式中的各个参数代表系统的固有 特性。
• 例如血流中的阻尼系数表征血液的粘稠度。由 医学上可知,当人体内的固有特性发生变化时, 则对应于各种病症。例如当血管弹性系数下降 时则对应于动脉硬化。因此,当一个模型中的 参数变化时,就相当于构造了种种病例,而这 种参数的改变对于软件形式的数学模型而言, 可以说是轻而易举的。
(二)建模与仿真
模型是对相应的真实对象和真实关系中那些有 用的和令人感兴趣的特性的抽象,是对系统某些本 质方面的描述。模型是为了产生行为数据的一组指 令,它可以用数学公式、图、表等形式表示。
构造一个真实系统的模型,在模型上进行实验 是系统分析、研究十分有效的手段。
• 一个模型的建立往往蕴含着下列三层意思:(1) 理想化;(2)抽象化;(3)简单化。
• 与黑箱模型相比,参数模型的生理意义较为明 确,但其建立要求对系统有足够的认识和必要 的实验手段。当然,采用参数模型进行仿真实 验一般可获得较多的关于系统的信息,并可较 好地与实际生理病理现象相对应。
(3)仿真模型的实验
• 建立研究对象的模型是为了进行仿真实验。若 所建立的是实体的物理模型,则将模型运转起 来即可进行仿真实验。
• 3)受到实验技术条件和实验手段的限制,如一些 极端条件或实验周期过长等因素的限制。
b.人体实验:即在人体上进行直接测量 和实验;
•临床实验虽然不存在动物实验 的第一个局限性,但其余两条 仍然存在,而且,由于受伦理 道德的限制,许多实验不能直 接在人体上进行。
c.生理系统的建模与仿真
• 生理学研究的第三种方法: • 生理系统的建模与仿真的方法弥补了上述传统
实系统实验是无法进行的,
• 例如电力系统故障检测系统的实验,以及许多生 理实验都是无法进行的,而运用模型来进行的仿 真实验则不受这些实际条件的限制,可以随意地 考察系统在各种极端条件下的可能反应。
• (3)可作为预研手段为真实系统运行奠定基础:
• 例如在对生理系统的研究中,可通过进行大量的 仿真实验找出系统变化的规律性,然后再进行少 数活体实验进行验证,这样既可节约大量实验经 费,缩短实验周期,又可减少危险性和提高效率。
第二章 生理系统建模、仿真概述
第二章 生理系统建模、仿真概述
一 、建模与仿真的概念 二 、生理系统研究的发展 三 、生理系统的建模与仿真
1.系统仿真 2.建模与仿真 3.仿真模型的实验 4.意义 四、 生理系统建模中常用的工程方法
第二章 生理系统建模、仿真概述
一 、建模与仿真的概念 二 、生理系统研究的发展 三 、生理系统的建模与仿真
1.系统仿真 2.建模与仿真 3.仿真模型的实验 4.意义 四、 生理系统建模中常用的工程方法
四、 生理系统建模中常用的工程方法
1.用频域法(拉普拉斯变换)解线性微分方程 2.系统辨识 3.房室分析
1.用频域法(拉普拉斯变换)解线性微分方程
• 分析各种系统时,有许多数学方法,其中基 于系统中各元素的物理过程而比较方便的推导出 的数学表达式就是微分方程(组)。这种表达物理 过程的微分方程总是以时间 t 为自变量,因此, 也称为系统的时域表达。