生物化学与分子生物学常考名词解释总结归纳
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蛋白质的二级结构是指多肽链的主链骨架中若干肽单位,各自沿一定的轴盘旋或折叠,并以氢键为次级键而形成有规则的构象,如α螺旋β折叠β转角等。
肽单位:肽键是构成在分子的基本化学键,肽键与相邻的原子所组成的基团,成为肽
单位或肽平面。
结构域是位于超二级结构和三级结构间的一个层次。结构域是在蛋白质的三级结构内
的独立折叠单元,其通常都是几个超二级结构单元的组合。在较大的蛋白质分子中,
由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,进一步折叠形成一个或多个相对独立的致
密的三维实体,即结构域。
超二级结构又称模块或膜序是指在多肽内顺序上相邻的二级结构常常在空间折叠中靠近,彼此相互作用,形成有规则的二级结构聚集体。
三级结构具有二级结构、超二级结构或结构域的一条多肽链,由于其序列上相隔较远
的氨基酸残基侧链的相互作用,而进行范围更广泛的盘曲与折叠,形成包括主、测链
在内的空间排列,这种在一条多肽链中所有原子和基团在三维空间的整体排布称为三
级结构。
一级结构蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序,以及二硫键的位置。
四级结构多亚基蛋白质分子中各个具有三级结构的多肽链,以适当的方式聚合所形成
的蛋白质的三维结构。
增色效应增色效应或高色效应。由于DNA变性引起的光吸收增加称增色效应,也就是
变性后 DNA 溶液的紫外吸收作用增强的效应。
固定化酶不溶于水的酶。是用物理的或化学的方法使酶与水不溶性大分子载体结合或
把酶包埋在水不溶性凝胶或半透膜的微囊体中制成的。
脂肪酸的β氧化饱和脂肪酸在一系列酶的作用下,羧基端的β位C原子发生氧化,C链在α位C原子与β位C原子间发生断裂,每次生成一个乙酰CoA和较原来少两个C单位的脂肪酸,这个不断重复进行的脂肪酸氧化过程称为脂肪酸的β氧化。
脂肪酸的β-氧化基本过程:丁酰CoA经最后一次β氧化:生成2分子乙酰CoA 。故
每次β氧化1分子脂酰CoA生成1分子FADH2,1分子NADH+H+,1分子乙酰CoA,通过呼吸链氧化前者生成2分子ATP,后者生成3分子ATP。
尿素循环肝脏是动物生成尿素的主要器官,由于精氨酸酶的作用使精氨酸水解为鸟氨
酸及尿素。精氨酸在释放了尿素后产生的鸟氨酸,和氨甲酰磷酸反应产生瓜氨酸,瓜
氨酸又和天冬氨酸反应生成精氨基琥珀酸,精氨基琥珀酸为酶裂解,产物为精氨酸及
延胡索酸。由于精氨酸水解在尿素生成后又重新反复生成,故称尿素循环。
操纵子指启动基因、终止基因和一系列紧密连锁的结构基因的总称。原核生物大多数
基因表达调控是通过操纵子机制实现的。操纵子通常由 2个以上的编码序列与启动序列、操纵序列以及其他调节序列在基因组中成簇串联组成。启动序列是RNA聚合酶结合并起动转录的特异DNA序列。多种原核基因启动序列特定区域内,通常在转录起始点上游-10及-35区域存在一些相似序列,称为共有序列。大肠杆菌及一些细菌启动序
列的共有序列在-10区域是TATAAT,又称Pribnow盒,在-35区域为 TTGACA。这些
共有序列中的任一碱基突变或变异都会影响RNA聚合酶与启动序列的结合及转录起始。因此,共有序列决定启动序列的转录活性大小。操纵序列是原核阻遏蛋白的结合位点。当操纵序列结合阻遏蛋白时会阻碍RNA聚合酶与启动序列的结合,或使RNA聚合酶
不能沿DNA向前移动,阻遏转录,介导负性调节。原核操纵子调节序列中还有一种特异DNA序列可结合激活蛋白,使转录激活,介导正性调节。
氧化磷酸化是物质在体内氧化时释放的能量供给ADP与无机磷合成ATP的偶联反应。主要在线粒体中进行。
单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多
态性。
分子伴侣存在于原核生物和真核生物细胞质以及细胞器中可协助新生肽链正确折叠的
一类蛋白质。
回文结构:双链DNA中含有的二个结构相同、方向相反的序列称为反向重复序列,也
称为回文结构,每条单链以任一方向阅读时都与另一条链的序列是一致的,例如
5'GGTACC3' 3'CCATGG5'.
同工酶来源于同一种系、机体或细胞的同一种酶具有不同的形式。催化同一化学反应
而化学组成不同的一组酶。产生同工酶的主要原因是在进化过程中基因发生变异,而
其变异程度尚不足以成为一个新酶。
拓扑异构酶DNA拓扑异构酶是存在于细胞核内的一类酶,他们能够催化DNA链的
断裂和结合,从而控制DNA的拓扑状态。
主要存在两种哺乳动物拓扑异构酶。DNA拓扑异构酶I通过形成短暂的单链裂解-结合循环,催化DNA复制的拓扑异构状态的变化;相反,拓扑异构酶II通过引起瞬间双
链酶桥的断裂,然后打通和再封闭,以改变DNA的拓扑状态
密码子兼并性除了甲硫氨酸和色氨酸外,每一个氨基酸都至少有两个密码子。这样可以在一定程度内,使氨基酸序列不会因为某一个碱基被意外替换而导致氨基酸错误。
由3个相邻的核苷酸组成的信使核糖核酸(mRNA)基本编码单位。有64种密码子,其
中有61种氨基酸密码子(包括起始密码子)及3个终止密码子,由它们决定多肽链的氨
基酸种类和排列顺序的特异性以及翻译的起始和终止。
特点:①.遗传密码子是三联体密码:一个密码子由信使核糖核酸上相邻的三个碱基组
成②密码子具有通用性:不同的生物密码子基本相同,即共用一套密码子③遗传密码
子无逗号:两个密码子间没有标点符号,密码子与密码子之间没有任何不编码的核苷酸,读码必须按照一定的读码框架,从正确的起点开始,一个不漏地一直读到终止信
号④遗传密码子不重叠,在多核苷酸链上任何两个相邻的密码子不共用任何核苷酸⑤
密码子具有简并性:除了甲硫氨酸和色氨酸外,每一个氨基酸都至少有两个密码子。
这样可以在一定程度内,使氨基酸序列不会因为某一个碱基被意外替换而导致氨基酸
错误⑥密码子阅读与翻译具有一定的方向性:从5'端到3'端⑦有起始密码子和终止密
码子,起始密码子有两种,一种是甲硫氨酸(AUG),一种是缬氨酸(GUG),而终
止密码子(有3个,分别是UAA、UAG、UGA)没有相应的转运核糖核酸(tRNA)
存在,只供释放因子识别来事先翻译的终止。在信使RNA中,碱基代码A代表腺嘌呤,G代表鸟嘌呤,C代表胞嘧啶,U代表尿嘧啶
一碳单位就是指具有一个碳原子的基团。指某些氨基酸分解代谢过程中产生含有一个
碳原子的基团,包括甲基、亚甲基、甲烯基、甲炔基、甲酚基及亚氨甲基等。一碳单
位具有以下下两个特点:1.不能在生物体内以游离形式存在;2.必须以四氢叶酸为载体。能生成一碳单位的氨基酸有:丝氨酸、色氨酸、组氨酸、甘氨酸。另外蛋氨酸(甲硫氨酸)可通过S-腺苷甲硫氨酸(SAM)提供“活性甲基”(一碳单位),因此蛋
氨酸也可生成一碳单位。