琼脂糖凝胶电泳技术的原理和方法
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤DNA的琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,用于分析DNA 的大小和纯度,以及进行DNA分子的分离和纯化。
凝胶电泳实验可以帮助我们确定DNA样本的大小和获得纯化的DNA片段供进一步研究使用。
下面是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的原理和操作步骤。
【原理】DNA琼脂糖凝胶电泳是根据DNA分子在电场中的不同迁移速率来分离大小不同的DNA片段。
琼脂糖凝胶是一种凝胶状物质,其孔隙大小能够将DNA分子限制在一定范围内,较大的DNA分子迁移速率较慢,而较小的DNA分子迁移速率较快。
琼脂糖凝胶通常是在平均浓度为1%至2%之间的范围内制备,以便在不同大小的DNA分子之间提供适当的分辨率。
实验中,DNA样品通过切割酶或PCR等方法获得,样品经过核酸电泳缓冲液稀释,并在琼脂糖凝胶板上进行电泳。
凝胶板两侧连接电源,DNA 的带电粒子将在电场的作用下从负极迁移到正极,迁移过程中形成DNA的“条带”,条带的位置和长度反映了DNA的大小。
通常,DNA条带由荧光染料或核酸染料标记,以便在电泳结束后进行可视化。
【操作步骤】以下是DNA琼脂糖凝胶电泳实验的一般操作步骤:1.制备琼脂糖凝胶板:a.准备琼脂糖粉末和核酸电泳缓冲液(通常为TAE或TBE缓冲液)。
b.按照说明书将琼脂糖粉末溶解于核酸电泳缓冲液中。
c.将溶液加热至沸腾并搅拌,使琼脂糖完全溶解。
d.将溶液倒入预先准备好的电泳仓中,插入梳子或制备好的孔板,使其凝固。
2.样品制备:a.提取DNA样品并测定其浓度。
b. 将DNA样品稀释到适当浓度,通常为10-50 ng/μL。
c. 添加适当的加载缓冲液,通常是一些染料和甘胺酸(glycine)或其他添加剂。
3.DNA加载和电泳:a.打开琼脂糖凝胶仓盖,将DNA样品负载于凝胶孔内。
b.将DNA负载区域和样品标注在电泳仓中,以便在电泳结束后可以准确识别DNA带。
c.关闭盖子,将电泳仓放入电泳设备中。
琼脂糖凝胶电泳-完整整理
基因组分析
分子诊断
用于分离和鉴定基因组DNA片段,如限制 性片段长度多态性分析、基因突变检测等 。
用于检测和鉴定基因突变、病原微生物DNA 等,如聚合酶链式反应(PCR)产物电泳、 单链构象多态性分析等。
基因克隆
测序
用于分离和纯化目的基模板,如末端测 序、全基因组测序等。
达差异。
04 琼脂糖凝胶电泳实验问题 与解决
常见问题
条带弥散
由于点样量过多或电压过高,导致条带弥散。
条带过宽
由于凝胶浓度不合适或样品浓度过高,导致 条带过宽。
条带拖尾
样品中蛋白质降解或核酸酶污染,导致条带 拖尾。
条带不亮
由于染料浓度过低或曝光时间过短,导致条 带不亮。
问题分析
条带弥散
可能是由于点样量过多或电压过高, 导致DNA在凝胶中扩散。
琼脂糖凝胶电泳-完 整整理
目录
CONTENTS
• 琼脂糖凝胶电泳介绍 • 琼脂糖凝胶电泳实验操作 • 琼脂糖凝胶电泳结果分析 • 琼脂糖凝胶电泳实验问题与解决 •凝胶电泳的定义
01
琼脂糖凝胶电泳是指在琼脂糖凝 胶中进行的电泳技术,主要用于 分离、鉴定和纯化DNA片段。
浓度比较
通过条带亮度,比较不同 样品中目标DNA片段的浓 度。
纯度评估
根据条带的亮度与背景噪 音的比例,评估DNA片段 的纯度。
结果应用
基因克隆
01
通过琼脂糖凝胶电泳检测目的基因是否被正确克隆到载体中。
突变分析
02
利用电泳结果判断是否存在基因突变或点突变。
基因表达分析
03
通过比较不同组织或细胞系中目的基因的表达水平,分析其表
01
条带分析
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法
琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法琼脂糖凝胶电泳实验原理和实验方法[实验原理]电泳是现在用于分离和纯化DNA片段的最常用技术。
包含电解质的多孔支持介质----“胶”并把它置于静电场中。
则DNA分子将向阳极移动,这是因为DNA分子沿其双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基。
当DNA长度增加时,来自电场的驱动力和来自凝胶的阻力之间的比率就会降低,不同长度的DNA片段就会表现出不同的迁移率。
因而就可依据DNA分子的大小来使其分离。
该过程通过把示踪染料(Purple Loading Dye)或分子量标准参照物(Ladder)和样品(DNA&RNA)一起进行电泳而得到检测。
分子量标准参照物也可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
琼脂糖凝胶适用于分离大小在0.2-50Kb范围内的DNA片段。
[实验用品]1.琼脂糖 1.0%1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液(TAE),微波炉中火30秒至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时可加入10mg/ml溴化乙锭10μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子(鉴定胶用细密点的梳子;回收胶用粗稀的梳子)的胶膜中在室温下放置30-45min后现进行电泳。
1.5%:琼脂糖1.5g。
2.电泳缓冲液50×TAE Tris 乙酸 Tris 242g 终2 mol/L乙酸57.1ml 终1mol/L0.5M EDTA200ml pH8.0 终100mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释1×TAE。
5×TBE Tris 硼酸 Tris 54g 终445mmol/L硼酸27.5g 终445mmol/L0.5M EDTA20ml pH8.0 终10mmol/LdH2O 补足至1000ml使用时稀释10倍成0.5倍如50ml贮存液+450ml水→500ml工作液。
[实验内容与方法]1.移取适量的琼脂糖(如制备1%的琼脂糖胶液就移1g的琼脂糖溶于100ml TAE缓冲液中)微波炉加热使其溶于TAE缓冲液中。
DNA琼脂糖凝胶电泳原理和操作
DNA琼脂糖凝胶电泳原理和操作【原理】DNA的电泳原理与蛋白质电泳基本相同。
在pH高于其pI时,DNA分子带负电荷。
在直流电场中DNA向正极泳动。
不同的DNA分子因电荷数、构象和分子量大小的不同,在同一电泳系统中的泳动速度有差异,达到分离的目的。
电泳后的凝胶浸泡于溴化乙锭染料中,溴化乙锭分子与DNA分子结合,在紫外线照射下显出荧光,可对DNA进行定性或定量检测。
【操作】1.凝胶板的制备取有机玻璃内槽,洗净、晾干。
用橡皮膏(宽约1cm)将有机玻璃内槽的两端边缘封好(注意,将橡皮膏紧贴在有机玻璃内槽两端边缘,不要留空隙)防止漏胶。
将有机玻璃内槽置于一水平位置,放好样品槽模板(梳子)(图7-1),注意为防止胶漏,梳子不要插到底。
2.灌胶:将溶化的琼脂糖凝胶冷却至约65℃时,小心地将凝胶倒入有机玻璃内槽上,控制灌胶速度,使缓慢地展开,直到整个有机玻璃板表面形成均匀的凝胶层(图7-2),凝胶厚度一般为0.3~0.5cm。
3.室温下放置约1小时,待胶凝固完全后,小心剥去两端的橡皮膏,将铺胶的有机玻璃内槽放在电泳槽中,加入0.5*TBE电泳缓冲液,液面高于凝胶面约0.5cm ,轻轻拔出样品槽模板(梳子),在胶板上即形成相互隔开的样品槽。
4.加样:将样品和上样缓冲液1: 6混匀,用微量加样器将样品分别加入胶板的样品小槽内,(注意:加样时应防止加样器头碰坏凝胶孔壁)。
5.电泳:加样完毕后在靠近样品槽一端连接负极,另一端连接正极,接通电源,开始电泳,为防止样品扩散在样品进胶前可用略高电压,当样品进胶后,应控制电压不高于5V/cm(电压值V/电泳槽两极之间距离cm)。
当染料条带移动到距离凝胶前沿1cm时,停止电泳。
6.染色:将电泳后的胶板小心推进含溴化乙锭(0.5μg/ml)的染色液中,室温下浸泡约30分钟。
7.观测:小心地取出凝胶并用水轻轻冲洗胶表面的溴化乙锭溶液,将凝胶放在紫外灯观察台上,在波长254nm紫外灯下进行观察。
琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶浓度与DNA分子的有效分离范围
胶浓度(%) 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 2.0 线性DNA分子大小(kb) 5~60 1~20 0.8~10 0.5~7 0.4~6 0.2~4 0.1~3
二、仪器设备及材料
1、电泳装置:包括电泳槽(多采用水平方式)、 胶床和梳子三部分组成。 2、稳压电泳仪:电压可变范围0~300~600V, 电流可变范围0~250~500mA。 3、紫外线检测仪:可产生254、302、366nm 3个 波段紫外线,并配备防护眼镜和5mm厚的黑色 有机玻璃防护板。 4、照相机: 5、微波炉: 6、其它:三角烧瓶、量筒、胶带纸、一次性手套等。
3、铺胶:将冷却致60℃的凝胶倒入准备好的胶
床内,凝胶厚度3~5mm。 4、室温下静置1小时左右,凝胶固化。撕去胶床 两端的胶带纸,将带凝胶的胶床置于电泳槽中, 并使样品孔位于电场负极。 5、向电泳槽中加入0.5×TBE电泳缓冲液,以越 过凝胶表面1~2mm为宜。 6、轻轻拔出固定在凝胶中的梳子。 原梳齿处 (样品孔) 即被缓冲液充满,如发现 有气泡,应设法去除。 7、样品准备:向核酸样品中加入约为样品体积 1/6的上样缓冲液,用加样器轻轻混匀。
8、上样:用加样器吸取样品,轻轻的加入到凝 胶的样品孔中。加样量一般10~30μl。
9、盖上电泳槽,接通电源,开始电泳。 开始电泳前,再次确认凝胶样品孔处于电场的负极。 电泳条件:电压1~5v/cm;时间1小时左右。 10、电泳结束后,切断电源,取出凝胶。
11、电泳结果分析: ①紫外检测仪直接观察电源条带; ②摄影记录; ③凝胶成像分析系统处理。
溴化乙锭缺点:
EB是一种强诱变剂,并有中度毒性。 注意:①操作中务必带上防护用手套。 ②如不慎皮肤与溶液接触,应立即用清水彻底冲洗。 ③含溴化乙锭的溶液使用后应进行净化处理,使其 致诱变活性下降为原来的1/200左右,方可丢弃。
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳原理和操作
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳原理和操作血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生化分离和分析技术,主要用于血清中脂蛋白的分析。
其原理是利用琼脂糖凝胶电泳的分离特性,将血清中的脂蛋白按照分子大小进行分离,从而获得脂蛋白的电泳图谱。
琼脂糖凝胶是由琼脂糖溶液制备而成的凝胶。
琼脂糖分子之间通过氢键结合,在溶液中形成网状结构,能够阻碍大分子的迁移,使分子在凝胶中按照分子大小逐渐分离。
根据琼脂糖凝胶的浓度和凝胶体积,可以调整分离脂蛋白的范围和分辨率。
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳的操作步骤如下:1. 样品制备:将要分析的血清样品进行离心,将清除过量脂蛋白颗粒。
取适量样品于离心管中,加入适量凝胶缓冲液,混匀。
2. 制备凝胶:根据所需的凝胶浓度,称取相应质量的琼脂糖溶解于电泳缓冲液中,并加热至溶解。
待溶液温度降至室温后,加入凝胶稳定剂并混匀。
3. 填充凝胶孔:将凝胶溶液倒入电泳池,待凝胶凝固后,用专用的样品载体或者微量移液器将样品填充到凝胶孔中。
注意不要将样品液面超过凝胶表面。
4. 电泳分离:将电泳池连接电源,设定合适的电泳条件,如电压和电流。
在电泳过程中,离子在电场作用下沿着琼脂糖凝胶的移动方向迁移,分离出不同迁移速度的脂蛋白组分。
5. 染色和观察:电泳结束后,取出凝胶,进行染色和观察。
目前常用的染色方法有银染、共伴染色和乳化状胶体金染色等。
在染色后,可以使用分子影像仪或者专用的凝胶分析系统进行图像捕捉和分析。
血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳可以用于分析血清中各种脂蛋白的分布和比例,如低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)、极低密度脂蛋白(VLDL)等。
通过分析脂蛋白的电泳图谱,可以得到脂蛋白的相对含量和分子大小的分布情况,进一步了解脂质代谢的状态以及与某些疾病的关联。
总之,血清脂蛋白琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生化分离和分析技术,主要用于血清脂蛋白的分离和分析。
通过其原理和操作步骤的了解,我们可以更好地利用该技术进行实验和数据解读,为脂质相关疾病的研究提供有力的支持。
实验琼脂糖凝胶电泳的原理和方法
实验琼脂糖凝胶电泳的原理和方法实验琼脂糖凝胶电泳(Agarose gel electrophoresis)是一种常用的分离DNA和RNA分子的技术。
它基于琼脂糖凝胶电泳原理,利用琼脂糖凝胶的孔隙大小和电泳电场的力对DNA和RNA分子进行分离。
琼脂糖是一种高分子多糖,当加热溶解后冷却凝固时,形成一个多孔的凝胶网络。
这个凝胶网络中的孔隙大小是可以调控的,通过改变琼脂糖的浓度可以得到不同孔隙大小的凝胶。
1.制备琼脂糖凝胶:按照实验需要,称取适量琼脂糖加入缓冲液中,搅拌使其溶解,然后加热至溶解。
等溶液冷却至约50℃时,在一个电泳板间夹两块玻璃片或塑料片,将琼脂糖凝胶溶液倒入电泳板中,并将梳子插入凝胶中,让凝胶固化。
2.样品制备:将要检测的DNA或RNA分子提取和纯化,并用缓冲液稀释合适浓度。
添加适量的DNA荧光染料或核酸染色剂,使其在紫外光下可见。
3.样品加载:将样品加入琼脂糖凝胶的凝胶孔口中,注意不要将样品推到凝胶中。
4.电泳分离:将凝胶板放入电泳槽中,加入适量缓冲液,注意保证电泳液中缓冲液位置高于凝胶。
然后将负极电极和正极电极分别连接到电泳槽的两端,开启电源,施加适当电压使DNA或RNA分子在电场力的作用下进行电泳分离。
5.染色和可视化:电泳结束后,取出凝胶板,并用染色剂对DNA或RNA分子进行染色。
染色剂与DNA或RNA结合后,用紫外光照射凝胶,通过相应设备观察凝胶上的条带形成。
实验琼脂糖凝胶电泳的原理是基于DNA和RNA分子在电场下按照大小进行分离的特性。
在电场作用下,DNA或RNA分子荷负性被引向正极(阴极)方向移动。
琼脂糖凝胶的孔隙大小可以根据需要调控,大分子难以通过,小分子易于通过。
因此,DNA或RNA分子根据其大小不同,通过孔隙大小的限制,从而形成条带,完成了对DNA或RNA的分离。
dna琼脂糖凝胶电泳原理
dna琼脂糖凝胶电泳原理DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离、纯化和分析DNA分子的方法。
它基于DNA分子在电场下的迁移速度与其分子大小和形态之间的关系,利用琼脂糖凝胶的孔隙结构来分离DNA分子。
在这篇文章中,我将深入探讨DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、方法和应用,并分享我的个人观点和理解。
一、DNA琼脂糖凝胶电泳的原理DNA分子是生物体内存储遗传信息的重要分子,其大小可在数百至数千碱基对之间。
DNA琼脂糖凝胶电泳是基于电荷分离的原理进行的。
DNA分子在电场中会带有负电荷,因此会受到电场力的作用而迁移。
琼脂糖凝胶是一种多孔性凝胶,可以形成一些微小的孔隙,这些孔隙能够根据DNA分子的大小和形态来筛选DNA分子。
当DNA样品通过琼脂糖凝胶电泳时,较小的DNA分子会迁移更快,而较大的DNA 分子会迁移更慢。
通过对琼脂糖凝胶上DNA分子的分离和检测,我们可以得到DNA分子的大小分布信息,进而进行DNA的纯化、分析和定性等研究。
二、DNA琼脂糖凝胶电泳的方法1. 准备琼脂糖凝胶:我们需要制备一定浓度的琼脂糖溶液,并加热融化。
我们将琼脂糖溶液倒入电泳槽中,在上下两端放置电极,形成一个电场。
2. 准备DNA样品:将需要进行分析的DNA样品与染料混合,使之具有一定的负电荷,并进行预处理,如加热变性。
3. 进行电泳分离:将DNA样品施加在琼脂糖凝胶孔隙上方,开启电源,使电场通过琼脂糖凝胶。
DNA分子会在电场力的作用下从样品孔隙处迁移到相反电极的方向。
迁移的速度与DNA分子的大小和形态有关,较小的DNA分子迁移较快,而较大的DNA分子迁移较慢。
4. 可视化和分析:凝胶电泳结束后,我们可以使用染料或放射性示踪剂来可视化DNA分子的分离结果,如荧光染料或放射性探针。
通过观察凝胶上的DNA条带,我们可以推测DNA分子的大小分布,进而对样品进行纯化、分析和定性等进一步研究。
三、DNA琼脂糖凝胶电泳的应用DNA琼脂糖凝胶电泳技术在分子生物学、遗传学和犯罪学等领域都有广泛的应用。
实验13琼脂糖凝胶电泳的原理和方法
1983年,Schwartz等人根据DNA分子弹性弛豫 时间(外推为零的滞留时间)与DNA分子大小有关的 特性,设计了脉冲电场梯度凝胶,交替采用两个垂 直方向的不均匀电场,使DNA分子在凝胶中不断改 变方向,从而使DNA按分子大小分开。后来,Carle 等改进了电泳技术,并发现周期性的反转换电场 (periodic inversion of the electric field)亦能使大 分子DNA通过电泳分开。电泳系统是由一个水平式 电泳槽和两组独立,彼此垂直的电极组成,一组电 极负极为N,正极为S;另一组负极为W,正极为E 。
不同构型DNA的移动速度次序为:共价闭环 DNA(covalently closed circular,简称cccDNA)>直线 DNA>开环的双链环状DNA。当琼脂糖浓度太高时,环状 DNA(一般为球形)不能进入胶中,相对迁移率为0(Rm=O), 而同等大小的直线双链DNA(刚性棒状)则可以 长轴方向 前进(Rm>O),由此可见,这3种构型的相对迁移率主要 取决于凝胶浓度,但同时,也受到电流强度、缓冲液离 子强度等的影响。
琼脂糖凝胶电泳的 原理和方法
一、电泳方法的分类
按支持物的物理性状不同,区带电泳可为: 滤纸及其他纤维(如醋酸纤维、玻璃纤维、 聚氯乙烯纤维)薄膜电位; 粉末电泳,如纤维素粉、淀粉、玻璃粉电 泳; 凝胶电泳,如琼脂、琼脂糖、硅胶、淀粉 胶、聚丙烯酰胺凝胶等; 丝线电泳,如尼龙丝、人造丝电泳。
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应 和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液 中带负电荷,在电场中向正极移动。在一定的 电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛 效应,即DNA分子本身的大小和构型。
12
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在凝胶中,DNA片段迁移距离(迁移率)与碱 基对的对数成反比,因此通过已知大小的标准 物移动的距离与未知片段的移动距离进行比较, 便可测出未知片段的大小。
琼脂糖凝胶电泳技术的原理和方法
(3)溴化乙锭为扁平状分子,在紫外光照射下发射荧光。EB可与DNA分子形成 EB-DNA复合物,其荧光强度与DNA的含量成正比。据此可判断DNA分子量大小
和粗略估计样品DNA浓度。
三 仪器、材料与试剂
1.质粒样品、酶切样品和PCR样品。 2.凝胶电泳系统和电泳图像分析系统(凝胶成像系统)等。 3.琼脂糖、 1XTAE电泳缓冲液、Goldview、 6X载样缓冲
2.凝胶成像分析系统
3.Marker
一个已知分子质量的 DNA 样品做最对照,用来确定待 测样品的相对分子质量。
4.常用电泳缓冲液
缓冲液
TAE
TBE TPE
缓冲容量 最低 很高
Байду номын сангаас迁移速度 最快
(高10%)
较慢
分辨率
用途
高度复杂DNA混 高分子量高 合物;超螺旋
DNA
低分子量高
价格昂贵,不常 用
5.上样缓冲液
配制多大浓度的琼脂糖凝胶,要根据被检的DNA分子大小来确定。琼 脂糖是一种线性多糖聚合物。浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强。
表1 琼脂糖凝胶的浓度与DNA分子大小的关系
琼脂糖浓度(%) 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 12.0
线型DNA分子的分离范围(Kb) 5~60 1~20 0.8~10 0.5~7 0.9~6 0.2~3 0.1~2
液 ( 6X loading buffer)和DNA分子量标准(Marker ) 等。
1.凝胶电泳系统
美国Bio-rad伯乐 小型水平电泳槽Mini-Sub Cell GT Cell
DYY-6C型 双稳定时电泳仪电源(北 京六一) 输出范围(显示分辨率): 6-600V(1V) 4-400mA (1mA) 240W
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和操作步骤
一、实验目的琼脂糖凝胶电泳是常用的检测核酸的方法,学习DNA琼脂糖凝胶电泳的使用技术,掌握有关的技术和识读电泳图谱的方法.二、实验原理琼脂糖凝胶电泳是常用的用于分离、鉴定DNA、RNA分子混合物的方法,这种电泳方法以琼脂凝胶作为支持物,利用DNA分子在泳动时的电荷效应和分子筛效应,达到分离混合物的目的。
DNA分子在高于其等电点的溶液中带负电,在电场中向阳极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应,即分子本身的大小和构型是主要的影响因素。
DNA分子的迁移速度与其相对分子量成反比。
不同构型的DNA分子的迁移速度不同。
如环形DNA分子样品,其中有三种构型的分子:共价闭合环状的超螺旋分子(cccDNA)、开环分子(ocDNA)、和线形DNA分子(IDNA).这三种不同构型分子进行电泳时的迁移速度大小顺序为:cccDNA>IDNA>ocDNA核酸分子是两性解离分子,pH3。
5是碱基上的氨基解离,而三个磷酸基团中只有一个磷酸解离,所以分子带正电,在电场中向负极泳动;而pH8。
0-8。
3时,碱基几乎不解离,而磷酸基团解离,所以核酸分子带负电,在电场中向正极泳动.不同的核酸分子的电荷密度大致相同,因此对泳动速度影响不大.在中性或碱性时,单链DNA与等长的双链DNA的泳动率大致相同。
影响核酸分子泳动率的因素主要是:1、样品的物理性状即分子的大小、电荷数、颗粒形状和空间构型。
一般而言,电荷密度愈大,泳动率越大。
但是不同核酸分子的电荷密度大致相同,所以对泳动率的影响不明显。
对线形分子来说,分子量的常用对数与泳动率成反比,用此标准样品电泳并测定其泳动率,然后进行DNA分子长度(bp)的负对数——泳动距离作标准曲线图,可以用于测定未知分子的长度大小。
DNA分子的空间构型对泳动率的影响很大,比如质粒分子,泳动率的大小顺序为:cDNA>I DNA>ocDNA但是由于琼脂糖浓度、电场强度、离子强度和溴化乙锭等的影响,会出现相反的情况.2、支持物介质核酸电泳通常使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶两种介质,琼脂糖是一种聚合链线性分子.含有不同浓度的琼脂糖的凝胶构成的分子筛的网孔大小不同,是于分离不同浓度范围的核酸分子。
dna琼脂糖凝胶电泳
DNA琼脂糖凝胶电泳介绍DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物技术实验方法,用于分离DNA分子并确定其大小。
它基于DNA分子的电荷和大小不同,通过应用电场使DNA分子在琼脂糖凝胶中迁移,从而实现分离。
原理DNA琼脂糖凝胶电泳的基本原理是:DNA分子带负电荷,当置于电场中后,电场将使DNA分子向正电极移动。
然而,DNA分子在琼脂糖凝胶中的迁移速度取决于它的大小。
较长的DNA分子由于受阻力较大,迁移速度较慢,而较短的DNA分子迁移速度较快。
因此,琼脂糖凝胶电泳可以将DNA分子根据大小进行分离。
实验步骤1. 样品处理将待测DNA样品与凝胶电泳缓冲溶液混合,并加入负荷样品的染料来增加样品的重量和使其可见。
一般使用表现著名的溴化乙锭(Ethidium Bromide)来染色DNA分子。
2. 准备琼脂糖凝胶制备琼脂糖凝胶液,并根据实验需要将其倒入电泳槽中,并形成一个凝胶。
此过程需要使用琼脂糖凝胶制备缓冲液,一般为Tris–醋酸–EDTA缓冲液,简称TAE缓冲液。
3. 样品加载使用微量吸管或特殊的样品加载微孔将样品加载到琼脂糖凝胶上。
每个微孔能够承载一定量的样品,因此要根据样品的数量进行安排。
通常还会在凝胶上加载一个DNA分子大小标记(Marker)作为参考,以便确定未知样品的大小。
4. 电泳将凝胶放入电泳槽中,并将正负电极接入电源。
通过给定的电流和时间来进行电泳实验。
电流的选择取决于琼脂糖凝胶的密度和样品的大小范围。
5. 可视化和分析凝胶电泳完成后,通过紫外线照射或荧光成像系统来观察结果。
DNA分子在凝胶上能够与染料结合产生发光,从而可在琼脂糖凝胶上看到DNA分子的大小分布。
通过与已知DNA分子大小标记的对比,可以确定未知样品DNA分子的大小。
应用领域1. 分子生物学在分子生物学研究中,DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的手段。
它可以用于检测DNA分子的大小、评估PCR反应的效果、验证基因敲除和插入等分子操作的成功性等。
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理及超详细步骤实验原理:琼脂糖凝胶电泳是利用DNA分子的电荷和大小差异来分离DNA分子的一种方法。
DNA分子在电场作用下,会向阳极移动,移动速度与DNA分子的大小呈反比。
琼脂糖凝胶是一种聚合物,可以形成一种网络结构,在凝胶中进行电泳分离。
DNA分子在凝胶孔隙中相互碰撞,分子大小不同的DNA分子会在不同的速度下向阳极移动,从而实现了DNA分子的分离。
实验步骤:1.实验前的准备:a.制备琼脂糖凝胶:取一定量的琼脂糖粉末加入缓冲液中,加热溶解后冷却至大约50℃左右,倒入琼脂糖凝胶板中,插入梳子,待凝固。
b.缓冲液的制备:根据需要准备TAE缓冲液或TBE缓冲液。
2.DNA样品制备:a.将待测DNA样品加入试管中,用适当的缓冲液稀释样品。
b.使用嵌入剂将DNA样品加入琼脂糖凝胶中,通常将样品加入凝胶中的槽道。
3.凝胶电泳操作:a.将琼脂糖凝胶板放入电泳槽中,加入足够的缓冲液,使凝胶完全浸泡在缓冲液中。
b.将阴极和阳极电极连接到电泳槽中。
c.将样品和一些DNA分子大小标准物质分别加入凝胶中,用以测量DNA的大小。
d.打开电源,设定电流和电压,并进行电泳分离。
4.凝胶染色和成像:a.完成电泳分离后,关闭电源,取出琼脂糖凝胶板。
b.将琼脂糖凝胶板放入DNA染色剂中,染色一段时间后,取出凝胶板。
c.在紫外灯下观察琼脂糖凝胶板,可以看到DNA分子的条带。
5.数据分析:a.使用图像分析软件或标尺对琼脂糖凝胶板上的DNA条带进行测量,得到DNA分子的大小。
b.根据标准物质的条带大小,将待测DNA分子的大小与标准物质进行对比,计算DNA分子的大小。
c.根据DNA条带的强度和大小,可以估算DNA的浓度。
需要注意的是,具体的实验步骤可能因实验设备和试剂的不同而有所差异,所以在进行实验之前最好仔细阅读实验操作手册,并参考实验室老师或资深研究人员的指导。
琼脂糖凝胶电泳技术的原理和方法
琼脂糖凝胶电泳技术的原理和方法一、原理:琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分离和分析生物大分子的方法。
其原理是利用琼脂糖凝胶作为固定相,通过电场作用将待分离物质在凝胶中进行分离。
琼脂糖凝胶是一种具有多孔结构的凝胶介质,可以根据待分离物质的尺寸和电荷特性进行分离。
二、方法:1. 准备琼脂糖凝胶:首先,按照所需的凝胶浓度和体积配制琼脂糖溶液。
然后,在琼脂糖溶液中加入缓冲液,并搅拌均匀。
将混合液倒入凝胶板中,待其凝固后,准备好使用的琼脂糖凝胶。
2. 样品制备:将待分离的样品进行处理,如蛋白质样品可以经过蛋白质提取和纯化步骤,DNA样品可以进行酶切等处理。
3. 样品加载:将处理好的样品加载到琼脂糖凝胶中。
可以使用样品井或样品孔进行加载,确保每个样品均匀地加载到凝胶中。
4. 电泳条件设置:根据待分离物质的特性和需求,设置适当的电泳条件。
包括电场强度、电泳时间和缓冲液pH值等。
5. 电泳分离:将凝胶板放入电泳槽中,连接电源,进行电泳分离。
在电场的作用下,待分离物质会在凝胶中进行迁移,根据其尺寸和电荷特性进行分离。
6. 结果分析:电泳结束后,可以通过染色等方法观察凝胶板上的带状图案。
根据不同的染色方法,可以观察到不同的待分离物质,如蛋白质带、DNA带等。
三、应用:琼脂糖凝胶电泳技术在生物科学研究中具有广泛的应用。
其中,常见的应用有以下几个方面:1. 蛋白质分离与鉴定:可以通过琼脂糖凝胶电泳技术对蛋白质进行分离和鉴定。
蛋白质在电泳过程中根据其分子量的不同而分离成多个带状条带,通过染色或Western blotting等方法可以对目标蛋白质进行定性或定量分析。
2. DNA分析:琼脂糖凝胶电泳技术在DNA分析中也有重要应用。
可以通过电泳分离来检测DNA片段的长度和纯度,如测序片段、PCR产物等。
3. RNA分析:琼脂糖凝胶电泳技术也可以用于RNA的分析。
通过电泳分离可以检测RNA的大小、纯度和相对含量等。
4. 蛋白质-核酸相互作用研究:通过琼脂糖凝胶电泳技术,可以研究蛋白质与核酸之间的相互作用。
DNA琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和方法步骤脂糖凝胶泳是用于分别、定和提DNA 片段的准方法。
脂糖是从脂中提取的一种多糖,具水性,但不荷,是一种很好的泳支持物。
DNA 在碱性条件下〔pH8 0 的冲液〕荷,在中通凝胶介向正极移,不同样 DNA 分子片段由于分子和构型不同样,在中的泳速率液不同样。
溴化乙〔 EB〕可嵌入 DNA分子碱基形成光合物,紫外照射后,可分出不同样的区,到达分别、定分子量,重子的目的。
⋯一、实验目的学习和掌握琼脂糖电泳法判断DNA 的原理和方法。
二、实验原理琼脂糖凝胶电泳是用于分别、判断和提纯DNA 片段的标准方法。
琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。
DNA 在碱性条件下〔的缓冲液〕带负电荷,在电场中经过凝胶介质向正极搬动,不同样DNA 分子片段由于分子和构型不同样,在电场中的泳动速率液不同样。
溴化乙锭〔EB〕可嵌入 DNA 分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同样的区带,到达分别、判断分子量,精选重组子的目的。
三、实验资料实验 14 提取的 DNA 样品,四、器具及药品电泳仪,电泳槽,紫外透射反射仪,恒温水浴锅,微波炉,微量进样器,三羟甲基氨基甲烷,盐酸,醋酸钠, EDTA,琼脂糖,溴酚蓝,溴化乙锭。
五、实验步骤1、安装电泳槽将有机玻璃的电泳凝胶床洗净,晾干,用胶带将两端的张口封好,放在水平的工作台上,插上样品梳。
2、琼脂糖凝胶的制备称取琼脂糖溶解在电泳缓冲液中,〔按的琼脂糖含量,1-25kb 大小的 DNA 用1%的凝胶,20-100kb 的 DNA 用%的凝胶, 200-2000bp 的 DNA 用 %的凝胶〕置微波炉或沸水浴中加热至完好溶化〔不要加热至沸腾〕,取出摇匀。
3、灌胶将冷却到60℃的琼脂糖溶液轻轻倒入电泳槽水平板上。
4、待琼脂糖胶凝固后,在电泳槽内参加电泳缓冲液,尔后拔出梳子。
5、加样将 DNA 样品与加样缓冲液〔 loading buffer 〕按 4: 1 混匀后,用微量移液器将混杂液加到样品槽中,每槽加 10-20μl,记录样品的点样次序和加样量。
琼脂糖凝胶电泳解析DNA与RNA的分子大小与构象
琼脂糖凝胶电泳解析DNA与RNA的分子大小与构象琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物分析技术,可用于解析DNA和RNA的分子大小以及构象。
本文将介绍琼脂糖凝胶电泳的原理和方法,以及其在DNA和RNA分析中的应用。
一、琼脂糖凝胶电泳原理琼脂糖凝胶电泳是一种基于电荷和分子大小的分离技术。
琼脂糖是一种线性多糖,具有高度的凝胶性质。
当琼脂糖与缓冲液混合后,形成一种凝胶状的基质,其中孔隙大小与琼脂糖浓度呈正相关关系。
在琼脂糖凝胶电泳中,DNA或RNA样品首先被加入到琼脂糖基质中,并在电场的作用下进行电泳分离。
由于DNA和RNA是带有负电荷的分子,它们会受到电场的吸引,向阳极迁移。
然而,由于琼脂糖基质的阻滞作用,较大的DNA和RNA分子会受到更大的阻力,迁移速度较慢,而较小的分子则能更快地通过凝胶基质。
二、琼脂糖凝胶电泳方法琼脂糖凝胶电泳可以通过垂直电泳和水平电泳两种方法进行。
1. 垂直电泳:垂直电泳是常用的琼脂糖凝胶电泳方法,主要应用于较长的DNA和RNA分子。
在这种方法中,琼脂糖基质被倒入一个垂直的电泳槽中,样品被注入在最上方的孔隙中。
然后,一定电压被施加在电泳槽的两端,使得DNA和RNA样品向阳极迁移。
2. 水平电泳:水平电泳是用于较短DNA和RNA分子的一种电泳方法。
在这种方法中,琼脂糖基质被倒入一个水平的电泳槽中,样品被加载在琼脂糖基质的一侧。
然后,电场被施加在电泳槽的两端,使得DNA和RNA 样品移动到基质的另一侧。
三、琼脂糖凝胶电泳的应用琼脂糖凝胶电泳是一种广泛应用于DNA和RNA分析的技术。
它可以用于测定DNA和RNA的分子大小、构象以及提取纯化。
1. 分子大小测定:通过琼脂糖凝胶电泳,可以精确测定DNA和RNA的分子大小。
较大的分子将排列在凝胶基质的开始位置附近,而较小的分子则会迁移到凝胶基质的远处。
通过对标准DNA或RNA的运行轨迹进行比较,可以确定样品的分子大小。
2. 分析DNA和RNA构象:琼脂糖凝胶电泳还可以显示DNA和RNA的构象信息。
琼脂糖凝胶电泳实验原理及步骤
实验三琼脂糖凝胶电泳一、实验原理琼脂糖凝胶电泳是分离和纯化DNA 片段的常用技术。
把DNA样品加入到一块包含电解质的多孔支持介质(琼脂糖凝胶)的样品孔中,并置于静电场上。
由于DNA分子的双螺旋骨架两侧带有含负电荷的磷酸根残基,因此在电场中向正极移动。
在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应。
具有不同的相对分子质量的DNA片段泳动速度不一样,因而可依据DNA分子的大小来使其分离。
凝胶电泳不仅可分离不同分子质量的DNA,也可以分离相对分子质量相同,而构型不同的DNA分子。
在电泳过程中可以通过示踪染料或相对分子质量标准参照物和样品一起进行电泳而得到检测。
相对分子质量标准参照物相对可以提供一个用于确定DNA片段大小的标准。
在凝胶中加入少量溴化乙锭(ethidium bromide, EB),其分子可插入DNA的碱基之间,形成一种络合物,在254~365nm波长紫外光照射下,呈桔红色荧光,因此也可对分离的DNA 进行检测。
一般琼脂糖凝胶电泳适用于大小在0.2kb~50kb范围内的DNA片段。
本实验介绍琼脂糖凝胶的制备以及琼脂糖凝胶电泳在DNA片段分离中的应用方法。
二、仪器及试剂1.仪器及耗材:水平电泳槽、电泳仪、凝胶成像分析系统、微波炉、微量移液器、透明胶带、点样板或parafilm、100 ml或250 ml锥形瓶、量筒、吸头等。
2.试剂及配制:50×TAE缓冲液的配制:2 mol/L Tris-乙酸,0.05 mol/L EDTA(pH8.0)配制1000 mlTris 242 g冰乙酸 57.1 ml0.5 mol/L EDTA 100 ml加入600 ml去离子水后搅拌溶解,将溶液定容至1 L后。
高温高压灭菌,室温保存。
walter schaffner 琼脂糖凝胶电泳
Walter Schaffner是一位瑞士的生物学家,他是琼脂糖凝胶电泳技术的发明者之一。
琼脂糖凝胶电泳是一种重要的分离和分析生物大分子的方法,广泛应用于生物化学、分子生物学等领域。
本文将介绍琼脂糖凝胶电泳的原理、方法和应用,并从Walter Schaffner的贡献出发,探讨琼脂糖凝胶电泳在科学研究和生物工程中的重要意义。
一、琼脂糖凝胶电泳的原理1.电泳原理电泳是利用物质在电场中运动的性质进行分离和分析的方法。
当一个带电粒子在电场中运动时,其受到电场力的作用,从而产生电泳迁移。
在琼脂糖凝胶电泳中,琼脂糖凝胶起到了障碍物质迁移的作用,使得分子按照大小和电荷进行分离。
2.琼脂糖凝胶电泳原理琼脂糖凝胶是由聚合物构成的三维网状结构,其孔隙大小可以根据需要调节。
在电场作用下,负电荷的分子沿电场方向向阳极迁移,同时受到凝胶孔隙的阻碍。
大分子受到的阻碍力较大,迁移速度慢,而小分子受到的阻碍力较小,迁移速度快。
在琼脂糖凝胶中,分子根据大小和电荷的不同被分离开来。
二、琼脂糖凝胶电泳的方法及步骤1.制备凝胶首先需要将琼脂糖加入缓冲液中,制备成琼脂糖凝胶。
在制备过程中,需要根据需要调节凝胶的浓度和孔隙大小。
2.样品预处理将待分离的样品进行预处理,通常需要进行蛋白质的变性、还原和煮沸处理,使之具有负电荷,并且保持在凝胶中的形态。
3.装样将样品加载在琼脂糖凝胶的孔隙中,通常使用专门的样品装载器进行操作,确保样品均匀地加载在凝胶中。
4.电泳将装有样品的琼脂糖凝胶板放入电泳槽中,施加电场,进行电泳分离。
根据不同的需求,可以选择垂直电泳或水平电泳。
5.染色及成像电泳结束后,将凝胶进行染色处理,使分离的分子可见。
然后进行成像和分析。
三、琼脂糖凝胶电泳的应用1.在蛋白质分离和分析中的应用琼脂糖凝胶电泳在蛋白质分离和分析中有着广泛的应用。
可以用于蛋白质组学的研究,如分离和鉴定蛋白质混合物中的各种蛋白质,分析蛋白质的分子量和异构体,检测蛋白质的含量等。
琼脂糖凝胶电泳的原理和关键操作
琼脂糖凝胶电泳的原理和关键操作一、原理琼脂糖凝胶电泳是一种常用的生物分子分离和分析技术。
其原理基于琼脂糖凝胶的特性和电泳的原理。
琼脂糖是一种多糖类物质,具有高分子量和黏性。
在电泳过程中,琼脂糖凝胶能够形成一种网状结构,通过这种结构可以筛选分离不同大小和电荷的生物分子。
琼脂糖凝胶电泳是在一定浓度的琼脂糖溶液中进行的。
琼脂糖溶液被加热并冷却后形成凝胶。
凝胶中的孔隙大小与琼脂糖的浓度有关,浓度越高,孔隙越小。
在电泳过程中,样品被加载到琼脂糖凝胶中的孔隙中。
然后,在电场的作用下,样品中的带电分子会向电极方向移动。
由于琼脂糖凝胶的筛选作用,分子的迁移速度将与其大小和电荷有关。
大分子迁移速度较慢,小分子迁移速度较快。
二、关键操作1. 准备琼脂糖凝胶:将适量的琼脂糖加入缓冲液中,加热溶解后冷却形成凝胶。
凝胶的浓度应根据分离物的大小来选择,一般可选用0.5-2%的琼脂糖。
2. 加载样品:将待分析的生物样品加入琼脂糖凝胶中的孔隙中。
可以使用微量吸管或微量注射器等工具,尽量避免产生气泡。
3. 设置电场:将琼脂糖凝胶放置在电泳槽中,并加入适量的缓冲液。
然后,将电泳槽连接到电源上,设置适当的电压和电流。
4. 进行电泳:打开电源,开始进行电泳。
根据需要,可以选择常规电泳或脉冲电泳等不同的电泳方式。
5. 分析结果:根据分子的大小和电荷,不同的分子将在琼脂糖凝胶中以不同的速度迁移。
经过一定时间后,可以停止电泳,取出琼脂糖凝胶进行染色或进一步分析。
通过琼脂糖凝胶电泳,可以实现DNA、RNA、蛋白质等生物分子的分离和定量分析。
在实验室中,琼脂糖凝胶电泳被广泛应用于基因测序、蛋白质分析、病毒检测等领域。
总结:琼脂糖凝胶电泳是一种基于琼脂糖凝胶和电泳原理的生物分子分离和分析技术。
关键操作包括准备琼脂糖凝胶、加载样品、设置电场、进行电泳和分析结果。
该技术在生物学研究和临床诊断中具有重要的应用价值。
dna琼脂糖凝胶电泳原理
dna琼脂糖凝胶电泳原理DNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的分子生物学技术,广泛应用于DNA分离、鉴定和纯化方面。
它是利用DNA分子在电场中的迁移差异,将DNA按照大小进行分离的方法。
本文将介绍DNA琼脂糖凝胶电泳的原理、操作步骤和应用。
DNA琼脂糖凝胶电泳的原理主要由三部分组成:琼脂糖凝胶、电场和DNA分子。
首先,琼脂糖凝胶是一种高分子聚合物,具有三维网孔结构,能够限制DNA在电场中的迁移。
其次,电场是通过两端施加相反电荷,形成电荷差从而产生的带电迁移力。
最后,DNA分子由于其带负电荷特性,会在电场中受到迁移力的作用,从而在琼脂糖凝胶上呈现出不同大小的迁移距离。
整个琼脂糖凝胶电泳操作过程分为几个关键步骤。
首先是制备琼脂糖凝胶,将琼脂糖溶解在缓冲液中并加热,使其溶解均匀。
然后,在电泳槽中注入制备好的稳定琼脂糖溶液,并在其上部留出一个小孔,用于样品孔的填充。
接下来,将待测的DNA样品与DNA标记物混合,分别加入到琼脂糖凝胶孔内。
在加样过程中,需要注意不要在琼脂糖上方产生气泡。
当电源开启后,断续供电,电泳开始进行。
此时,DNA分子会在电场作用下从孔口逐渐迁移进入琼脂糖凝胶内部。
较小的DNA片段迁移速度较快,迁移距离较长,而较大的DNA片段迁移速度较慢,迁移距离较短。
经过适当时间后,关闭电源,取出琼脂糖凝胶进行染色观察。
DNA琼脂糖凝胶电泳在分子生物学研究中有着广泛的应用。
首先,它可以用于DNA分离和纯化。
通过电泳分离DNA片段,可以将特定大小的DNA纯化出来,为后续的实验提供基础。
其次,琼脂糖凝胶电泳可以用于分析DNA复制结果。
通过观察DNA片段的迁移情况,可以了解DNA复制的准确性和效率。
此外,琼脂糖凝胶电泳还可以用于遗传疾病的诊断和基因工程的相关研究。
综上所述,DNA琼脂糖凝胶电泳是一种重要的分子生物学技术,可以用于DNA分离、纯化和分析。
通过掌握其原理和操作步骤,我们能够更好地应用该技术,推动科学研究的进展。
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胶板设计(27人): •每11孔胶板(4人:2样品 +1marker)。
2.加样
5μl质粒DNA+1μl loading buffer 混匀;
15μlPCR 产 物 +3μl loading buffer,混匀;
用于观察的紫外光有3种波长, 一般使用中波紫外光(302nm)。短 波紫外光(254nm)观察效果较好, 但 对 DNA 的 破 环 很 大 。 长 波 紫 外 光 (366nm):回收。
四.实验步骤
1.制备琼脂糖凝 胶(1%) 2.制备凝胶板 3.加样 4.电泳 5.染色 6.结果观察
1.制备凝胶和胶板:
优点
缺点
染色操作简便,快速,室温下 EB是诱变剂,使用时
15-20min;不会使核酸断裂; 一定要戴手套。 EB废
灵敏度高,10ng或更少的DNA 液要经过处理才能丢弃。
即可检出;可以加到样品中或
胶中。
低毒,灵敏度较高的染料;可
以加入样品中。dsDNA呈现绿 价格稍高,灵敏度 较
色荧光,而ssDNA呈红色荧光, 低。背景强烈。
配制多大浓度的琼脂糖凝胶,要根据被检的DNA分子大小来确定。琼 脂糖是一种线性多糖聚合物。浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强。
表1 琼脂糖凝胶的浓度与DNA分子大小的关系
琼脂糖浓度(%) 0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 12.0
线型DNA分子的分离范围(Kb) 5~60 1~20 0.8~10 0.5~7 0.9~6 0.2~3 0.1~2
液 ( 6X loading buffer)和DNA分子量标准(Marker ) 等。
1.凝胶电泳系统
美国Bio-rad伯乐 小型水平电泳槽Mini-Sub Cell GT Cell
DYY-6C型 双稳定时电泳仪电源(北 京六一) 输出范围(显示分辨率): 6-600V(1V) 4-400mA (1mA) 240W
2.凝胶成像分析系统
3.Marker
一个已知分子质量的 DNA 样品做最对照,用来确定待 测样品的相对分子质量。
4.常用电泳缓冲液
缓冲液
TAE
TBE TPE
缓冲容量 最低 很高
迁移速度 最快
(高10%)
较慢
分辨率 高分子量高 低分子量高
用途
高度复杂DNA混 合物;超螺旋 DNA
价格昂贵,不常 用
(3)溴化乙锭为扁平状分子,在紫外光照射下发射荧光。EB可与DNA分子形成 EB-DNA复合物,其荧光强度与DNA的含量成正比。据此可判断DNA分子量大小
和粗略估计样品DNA浓度。
三 仪器、材料与试剂
1.质粒样品、酶切样品和PCR样品。 2.凝胶电泳系统和电泳图像分析系统(凝胶成像系统)等。 3.琼脂糖、 1XTAE电泳缓冲液、Goldview、 6X载样缓冲
实验三 琼脂糖凝胶电泳技术的
原理和方法
主讲教师和实验员:张运峰
一 实验目的
学习琼脂糖凝胶电泳分离DNA的原理和方法 检测碱裂解法提取质粒的结果 检测双酶切法鉴定重组质粒的结果(后续实验) 检测PCR法鉴定质粒的结果(后续实验)
二 实验原理
(1)某物质在电场作用下的迁移速度叫做电泳的速率,电泳的速率与 核酸分子大小和构型有关。
10μl 酶 切 产 物 +2μl loadingbuffer混匀;
5μl DNA Marker(每板胶一孔)
3.电泳
电压3-5V/cm,约80-90V,注意电极方向
4.观察
紫外透射分析仪下观察。
六 实验结果
琼脂糖粉形成琼脂糖凝胶的过程
琼脂糖是由半乳糖及其衍生物构成的中性物质,不带电荷。琼脂糖链依分子内 和分子间氢键及其它力的作用使其互相盘绕形成绳状琼脂糖束,构成大网孔型凝胶。
放映结束 感谢各位的批评指导!
谢 谢!
让我们共同进步
DNA分子在碱性缓冲液中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动。 分子质量越小跑得越快,紧密构型快于松散型开环分子或线性分子,从 而可以分离大小不同的DNA或RNA分子。 (2)琼脂糖是一种线性多糖聚合物,可以形成具有刚性的滤孔,凝胶 孔径的大小决定于琼脂糖的浓度。浓度越高,孔隙越小,其分辨能力 就越强。
琼脂糖单糖分子结构
琼脂糖凝胶结构形成过程
核酸分子大小及琼脂糖的浓度的关系
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于 等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。在一定的电场强度下,DNA 分子的迁移速度取决于分子筛效应,即DNA分子本身的大小和构型。当DNA分子大 小超过20kb时,普通琼脂糖凝胶就很难将它们分开,此时电泳的迁移率不再依赖 于分子大小,因此,应用琼脂糖凝胶电泳分离DNA时,分子大小不宜超过此值。
5.上样缓冲液
电泳指示剂溴酚兰在碱性液体中呈紫兰色,一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖 400组成上样缓冲液。作用: ①增加样品比重,以确保DNA均匀沉入加样孔内。 ②形成肉眼可见的指示带,预测核酸电泳的速度和位置。 ③使样品呈色,使加样操作更方便。
4.常用核酸染料
名称
EB (溴化乙锭)
Gldview
SYBR GenefA。
新型低毒,高灵敏度染料,可 价格昂贵。对小于50
以加入样品中。
bp染色缺失,小于100
的染色效果较差。稳定
性差
花青类染料,毒性很低;最大吸收 重复性较差。能引起
峰为 470nm。具有安全、灵敏、 有机体突变。
经济的特点
溴化乙锭
溴化乙锭( 3,8-二氨基-5-乙基-6苯基菲啶溴盐EB),EB染色(EB可 很好地掺入到双链DNA中),在紫外 光下会发出橙红色的荧光,用于对 DNA进行染色和观察。