生物信息学课程论文
生物信息论文
《生物信息学》课程论文题目:应用生物信息学方法对未知序列R-2的性质和结构分析综述院(系)专业生物科学年级姓名学号2.2 理化性质的分析ProtParam在线分析R-2未知序列翻译的蛋白的分子量及等电点。
网址http://www.expasy.ch/tools/protparam.html。
应用signalP4.1在线,分析N端信号肽的切点位置,并判断是否为分泌蛋白。
网址为http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/。
2.3蛋白质家族及同源序列首先应用NCBI的ORF finder确定所属的蛋白质家族类型.应用NCBI Blast 在线查找R-2未知序列翻译的蛋白的同源序列。
并选择感兴趣的若干序列用于同源比对。
2.4 蛋白质二级结构预测及分析应用DNAStar的protean子软件包预测R-2未知序列翻译的蛋白的结构包括:α螺旋、β折叠、无规卷曲及转角。
应用expasy的protscale预测R-2未知序列翻译的蛋白的亲水区及疏水区分布。
网址为/tmp/scores2025.txt使用ExPaSy的SMART服务器分析R-2未知序列翻译的蛋白质的结构功能域。
网址为http://smart.embl-heidelberg.de/第三章结果分析3.1原始序列、开放阅读框及蛋白质序列3.1.1原始序列(R-2序列)ggtatttttgtaccaacacgatgtcgcgccaagcttggatcgagactagtgcactgattgaatgcatttcggagtatgg gaccaaatgttcctttgatactttccaaggactaacaattaatgacatttctactttatctaatttaatgaaccaaatttccgtggcg tcagtgggattcctgaatgacccaagaaccccgcttcaggctatgtcatgtgaatttgttaattttatttcaacggctgaccggc atgcgtacatgctgcaaaagaattggtttgactcagatgtagcgccaaacgttacaacagataatttcatagctacatacatta aacctcggttttcaagaacagtgtctgatgtactgcgccaggttaataattttgccttgcagccaatggaaaatccaaaactga tctccagacaacttggggttctgaaggcttatgatataccgtattcgacaccaattaatccaatggatgtggctagatcgtcag ccaacgtagttggaaacgtgtcacagagaagggctctgtctacacccttgatccaaggggcacagaacgtaactttcatcgt ttctgagtccgataaaatcatttttggaactagatcattaaatcctattgctccgggcaattttcagattaatgtaccaccatggtactcagacctgaacgtagttgacgctaggatttatttcactaatagcttcttaggatgtacaattcaaaatgttcaggtgaacgcg gtcaacggtaacgacccagtcgcaaccattactgtgccgaccgacaacaacccctttatcgtcgatagtgactcagtcgtct cactgtcgctatcgggtggagccattaacgtaactaccgcagttaatttaactgggtatgcgatcgctattgagggtaagttta acatgcaaatgaacgctagcccatcttactataccttgagttcactaacaattcagacaagcgtaatcgatgatttcggattatc cgcatttttggaaccattccgaatcaggttgcgcgcttcaggacagactgaaatttttagtcagtcgatgaacactttgacaga gaatttgattaggcaatatatgccagctaatcaggcggtaaatattgcttttgtatcaccctggtacaggttctcggagcgcgc cagaactattctgacgtttaaccaacccctgctaccatttgcatcccgaaaattgattattagacatttgtgggtcataatgtcttt tattgctgtttttggtaggtattacacagtaaactaaatctggtaatgagtgtgaatgccgacgcactaaccaccagcagtaga ccatctttatatgttagattagtatagcgacgggtgatgacggcaatcaactcaagagttgaggagtatctcaacgtgctgact cacatgccatatactttgcgataatttcatcagtggactgtcgaaattcgaacgaggtacgcttcgcgctggattgaagggag taggaggaaatgctgaaaccggagtgccagtaacaggcgggtcgtgtggtcacaaaaaatgat3.1.2开放阅读框对原始序列,通过DNAstar查找开放阅读框,并翻译成蛋白质。
生物信息学论文
⽣物信息学论⽂⽣物信息学课程论⽂⼀个⽟⽶ Mlo 基因的电⼦克隆与⽣物信息学分析姓名:学号:班级:⽣科2班⼀个⽟⽶ Mlo 基因的电⼦克隆与⽣物信息学分析摘要:Mlo 基因家族在植物抗病⽅⾯有极⼤的优势,但有些 Mlo 基因的功能还未知。
经序列拼接电⼦克隆得到 1 个⽟⽶的 Mlo 基因,采⽤⽣物信息学⽅法预测分析了编码蛋⽩的⼀、⼆、三级结构,并对其功能进⾏了预测。
结果表明:⽟⽶ Mlo 基因编码的蛋⽩有⼀个保守的 DUF1084 结构域,此结构域功能在植物中尚未知。
⽣物信息学分析表明,此蛋⽩很可能是⼀种类似于 G 蛋⽩偶联受体的膜结合转运蛋⽩⽽参与到信号传递过程中。
关键词:⽟⽶;Mlo 基因;电⼦克隆;⽣物信息学植物在长期的⽣物进化中形成了⼀系列复杂⽽严密的防御机制,使⾃⾝免受病原物的侵害[1,2]。
抗病基因是植物防御体系中的最重要组成部分。
Mlo 基因最初在⼤麦中被发现,这类基因在植物中编码⼀个七次跨膜结构域的蛋⽩家族,可能起到与 G 蛋⽩偶联受体(G Protein Coupled Receptor,GPCR)类似的功能。
他们的拓扑结构、亚细胞定位和序列多样化与动物和真菌的 G 蛋⽩偶联受体很相似。
野⽣型 mlo 基因赋予⼤麦对⽩粉菌的⼴谱抗性[3]。
⽩粉病是由⽩粉菌引起的真菌性病害,⽩粉菌能侵染650 多种单⼦叶植物和 9 000 多种双⼦叶植物[4,5]。
⽬前已对拟南芥、⽔稻和杨树中的 Mlo 基因家族有深⼊的研究[6]。
电⼦克隆法是近年来基于表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)和基因组数据库发展起来的基因克隆新型技术[7],具有效率⾼、成本低、对实验条件要求低等特点。
因此可以快速获得⼀些新基因,从⽽使新基因的应⽤成为可能。
挖掘⽟⽶中未知的抗病基因对⽟⽶的抗病育种有很⼤帮助。
本研究以⽟⽶为材料,对其中的⼀个 Mlo 基因进⾏电⼦克隆,并对其进⾏部分⽣物信息学⽅⾯分析,为⽟⽶ Mlo 基因的应⽤及⽟⽶的抗病育种提供理论依据。
生物信息技术论文
生物信息技术论文二十一世纪是生命科学高速发展的时代,生物信息技术对人类的影响之大将不可预料。
下面是小编精心推荐的生物信息技术论文,希望你能有所感触!生物信息技术论文篇一信息技术改变生物教学摘要:随着新课改的不断深入,信息技术与学科课程的整合是当前基础教育改革的一个新视点。
在生物学科的教学中,新教材教学难度增加了,对教师的要求也更高了。
生物教学课本中涉及的图、文、形、像很多,这要求学生在学习过程中发挥主观能动性,去看、去听、去想。
信息技术可以化静为动,化抽象为直观,吸引学生注意,降低理解难度。
信息技术与生物教学整合,可以创新教学模式、增大课堂容量、突出重点、解决难点,可以增强学生学习兴趣,提高教学效果,优化教学过程,培养学生能力。
本文就信息技术与生物课程整合的本质、方法和意义等做了一定的阐述。
关键词:信息技术生物教学课程改革二十一世纪是生命科学高速发展的时代,生命科学对人类的影响之大将不可预料。
生物学是生命科学的基础课程,生物老师在这次教育教学改革中应该积极探索,大胆尝试。
教师在教学中,必须深入研究和恰当地设计、开发、运用信息,从努力实践到积极创新,开发制作适用于课堂教学的优质教育资源,优化课堂教学,力求最大限度地提高教学效率,学生能够应用现代信息技术更好地掌握生物学知识,获取更多的生物学信息。
今天的教师,不能满足于一支粉笔、一张利口,博闻强记、引经据典的传统教学,而应不断努力、不断探索、不断尝试将生物课堂教学与信息技术达到有效整合。
所谓整合就是根据学科教学需要,充分发挥计算机的工具性功能,使计算机溶入学科教学中,从而提高教学质量,促进教学改革,培养具有创造能力和创新精神的中学生。
整合并非是计算机与生物学科的简单结合,也并不能够解决生物教学中的所有问题,而是从实际出发,寻找最佳结合点,突出教学重点,解决难点,探索规律,启发思维,从而提高生物学科的教育教学质量。
但是现在的一些老师和学生对于信息技术与生物学科教学的整合认识存在着很多误区:有的认为直接照搬网络上下载的课件上课就是整合课了;有的认为课堂上只要用了多种电教媒体就是整合课;有的认为在机房上课,网络环境下上课,就是整合课。
生物信息学论文
生物信息学论文生物信息学在现代生物学研究中扮演着至关重要的角色。
它以信息技术为基础,利用计算机和统计学的方法来处理生物学数据,并从中提取有关生物系统和生物过程的有价值信息。
本文将探讨生物信息学在基因组学、蛋白质组学和转录组学领域的应用和挑战。
一、基因组学和生物信息学基因组学是研究生物体基因组的学科。
随着高通量测序技术的不断发展,获取大量基因组数据已经成为可能。
生物信息学通过开发算法和工具来分析基因组数据,以揭示基因组的结构和功能。
例如,生物信息学可以帮助我们鉴定基因组中的基因,寻找编码蛋白质的开放阅读框架(ORFs),并预测非编码RNA。
此外,生物信息学还可以用于比较基因组学研究,以识别不同物种之间的共享与特异的基因序列。
二、蛋白质组学和生物信息学蛋白质组学研究生物体中的蛋白质组成及其功能。
蛋白质是生物活动的重要分子,对于理解生物体内各种生物学过程起着关键作用。
生物信息学在蛋白质组学中具有广泛应用。
通过比对蛋白质序列数据库,生物信息学可以帮助我们识别新的蛋白质,并预测其生物功能。
此外,生物信息学还可以用于分析蛋白质相互作用网络,以揭示蛋白质之间的复杂关系。
三、转录组学和生物信息学转录组学研究生物体中的转录组,即所有mRNA分子的总和。
转录组分析可以帮助我们了解基因组中哪些基因在特定条件下被表达,以及这些表达基因的水平。
生物信息学在转录组学中发挥着重要作用。
通过分析转录组测序数据,生物信息学可以帮助我们识别差异表达基因,以及特定条件下基因的调控机制。
此外,生物信息学还可以用于构建转录因子调控网络,以揭示基因的调控网络关系。
生物信息学的应用和挑战尽管生物信息学在基因组学、蛋白质组学和转录组学中具有广泛的应用,但仍面临一些挑战。
首先,生物信息学需要大量的高质量生物学数据作支持,而这些数据的获取和处理是一项复杂而费时的任务。
其次,生物信息学需要不断发展和改进的算法和工具来处理越来越复杂的生物学数据。
此外,生物信息学还需要更多的跨学科研究和合作,以应对日益增长的生物学挑战。
生物信息 毕业论文
生物信息毕业论文生物信息毕业论文引言:生物信息学是一门蓬勃发展的学科,它将计算机科学与生物学相结合,通过对生物数据的收集、存储、分析和解释,为生物学研究提供了强有力的工具。
本文将探讨生物信息学在生物学领域中的应用和发展,以及其对生物科学的重要意义。
一、生物信息学的定义和发展生物信息学是一门跨学科的学科,它利用计算机科学、数学和统计学的方法来研究生物学问题。
生物信息学的发展可以追溯到上世纪50年代,随着DNA测序技术的突破和计算机技术的进步,生物信息学得以迅速发展。
现如今,生物信息学已成为生物学研究中不可或缺的一部分,其应用范围涵盖了基因组学、蛋白质组学、转录组学等多个领域。
二、生物信息学在基因组学中的应用基因组学是生物信息学的一个重要分支,它研究的是生物体的基因组结构和功能。
生物信息学通过对基因组数据的分析,可以揭示基因之间的相互作用、基因调控网络以及基因与疾病之间的关联。
例如,通过比对人类基因组与其他物种基因组的差异,可以发现与人类疾病相关的基因;通过对基因表达数据的分析,可以识别出与特定疾病相关的信号通路。
这些研究成果对于疾病的早期诊断和治疗提供了重要的依据。
三、生物信息学在蛋白质组学中的应用蛋白质组学是研究生物体内所有蛋白质的组成、结构和功能的学科。
生物信息学在蛋白质质谱数据的处理和分析中发挥着重要作用。
通过生物信息学工具的辅助,可以对大规模的质谱数据进行蛋白质鉴定和定量分析,从而揭示蛋白质在细胞过程中的功能和相互作用。
此外,生物信息学还可以预测蛋白质的结构和功能,并为药物设计提供指导。
四、生物信息学在转录组学中的应用转录组学是研究生物体所有基因的转录产物的学科。
生物信息学通过对转录组数据的分析,可以识别出与特定生物过程相关的基因,揭示基因调控网络的结构和功能。
例如,通过对肿瘤样本的转录组数据分析,可以鉴定出与肿瘤发生和发展相关的基因,并为肿瘤治疗提供新的靶点。
此外,生物信息学还可以预测转录因子结合位点和转录因子调控的信号通路,为基因调控机制的研究提供重要线索。
生物信息学综述论文3900字_生物信息学综述毕业论文范文模板
生物信息学综述论文3900字_生物信息学综述毕业论文范文模板生物信息学综述论文3900字(一):计算机算法在生物信息学中的应用综述论文摘要:在人类基因组计划的推动下,生物信息学得到了人们的广泛关注,并呈现出数量多、计算量大等鲜明特征,因此要求在生物信息学中采用计算机算法,以提高生物信息学处理问题的效率。
以生物信息学中常用的计算机算法为切入点,进一步从基因表达数据分析、基因组序列信息分析、生物序列差异和相似性分析、遗传数据分析以及蛋白质结构与功能预测5个方面,论述了计算机算法在生物信息学中的典型应用。
关键词:生物信息学;基因;计算机算法;数据分析0引言生物信息学(Bioinformatics)作为一门新兴的交叉学科,是随着生命科学和计算机科学的高速发展而出现的。
它通过充分利用生物学、信息学、数学、物理学、统计学以及计算机网络等工具或手段,对大量生物数据信息进行有效的阐明和分析,使之成为具有相应生物意义的生物数据信息。
其涵盖了基因组信息的获取、处理、分配、存储等多个方面,通过对生物信息的比较和分析,从而获取基因编码以及核酸和蛋白质结构功能等信息,是最具活力和发展前景的学科之一。
然而,生物信息学在我国由于起步较晚,加之其自身呈现出的数量多、计算量大等特征,使生物信息学面临着计算瓶颈。
基于此,笔者结合自己的工作实践,对计算机算法在生物信息学中的应用进行探讨,以期为在生物信息学中进行有效的数据挖掘提供理论支持。
1生物信息学中常用的计算机算法算法作为计算机科学的一个重要分支,在计算机科学中居于核心地位。
在信息时代,算法作为解决问题的重要工具之一,其通过输入符合规范的信息,从而在短时间内快速获取所需要的输出,现已在各个领域得到了广泛应用。
在生物信息学中,计算机算法的应用也对生物信息学的发展起着积极推动作用。
生物信息学中常用的计算机算法主要包括以下几种:(1)分治法。
分治法即在解决大的问题实例时,通过将该问题实例分解为具有相同问题的几个小的问题实例,再采用递归方法依次对这些小的问题实例求解,然后将所得的解合并,从而得出大的问题实例的解。
生物信息学进展论文4600字_生物信息学进展毕业论文范文模板
生物信息学进展论文4600字_生物信息学进展毕业论文范文模板生物信息学进展论文4600字(一):FOS蛋白的研究进展及生物信息学分析论文摘要:FOS蛋白作为一类核蛋白转录因子,在调控细胞生长、分裂、增殖、分化乃至程序性死亡等方面具有重要的作用,它的表达影响了许多生命活动和过程,引起了人们的广泛关注,并在学习记忆及射精的标记方面吸引了学者的眼球。
对FOS蛋白的作用进行了综述,并对人、大鼠及小鼠FOS蛋白进行了生物信息学分析,旨在为FOS蛋白在生理学方面的研究提供参考依据。
关键词:FOS蛋白;转录因子;生物信息学FOS是c-fos基因转录产生的成熟mRNA编码的一个核磷蛋白。
c-fos基因是人或动物细胞中固有的正常基因,属于即刻早期应答基因(Immediateearlyre sponsegenes,IEG),FOS作为一类核蛋白转录因子,在调控细胞生长、分裂、增殖、分化乃至程序性死亡等方面具有重要作用。
FOS蛋白和c-fos基因受到广泛的关注,研究不断深入。
本文就FOS蛋白的作用及其在性行为方面的研究进行了论述,对人、大鼠及小鼠的FOS蛋白进行了生物信息学分析。
1FOS蛋白c-fos基因高度保守,属多基因家族,与其同族的还有fos-B,fos-1和fros -2。
c-fos可在多种因素诱导下迅速地表达,其转录激活在5min内即可产生,一般维持15~20min,c-fosmRNA的蓄积在刺激后30~45min可达高峰,半衰期为12min。
FOS蛋白合成后即刻转入细胞核内,一般在刺激后20~90min即可检出,60~90min达峰值,可持续2~5h,半衰期为2h[1]。
2FOS蛋白的作用在原癌基因的研究中对IEG产物的研究提示FOS蛋白可能是神经元被刺激激活的一种标志[2]。
现代学者认为,FOS蛋白参与细胞的正常分化、生长以及学习、记忆等过程,在脑内与皮层、海马、边缘系统、背海马、纹状体内FOS蛋白的表达密切相关[3-7]。
生物信息学导论论文2900字_生物信息学导论毕业论文范文模板
生物信息学导论论文2900字_生物信息学导论毕业论文范文模板生物信息学导论论文2900字(一):运筹学课程在生物信息学专业中的教学探索论文摘要:生物信息学是现代生命科学发展过程中,生物医学与数理科学、计算机技术相结合而形成的新兴前沿交叉学科。
运筹学在生物信息学中有着广泛应用,可为学生后续专业课学习和应用研究提供指导。
文章结合生物信息学专业特点,对于如何提高运筹学在生物信息学专业中的教学质量和培养具有创新能力的生物信息学人才,探讨了运筹学在生物信息学专业教学中的教学目的、教学内容以及教学方法和手段。
关键词:生物信息学;运筹学;教学方法一、前言生物信息学是随着人类基因组计划的完成而兴起的一门前沿交叉学科,在采集、处理、分析各种生物学数据如蛋白质组、代谢组、基因组、转录组所包含的重大生物学意义方面起着重要作用。
运筹学是一门广泛应用于自然科学、社会科学、工程技术生产实践、经济建设及现代化管理的学科,具有很强的实践性和应用性。
运筹学中很多方法已被广泛地运用到生物信息学中,比如基于凸规划问题的支持向量机用于疾病诊断和分类;基于动态规划模型的局部比对和全局比对算法被广泛应用于DNA和蛋白质序列的比对;基于图的最短路径算法则可被用于对生物网络的分析研究等。
因此,运筹学被列为生物信息学专业的专业基础课。
然而目前相关教材大多是为经济管理学编写,很少有专门从生物信息学角度出发编写的运筹学教材,这样书中的例题也都是以管理和经济类为基础。
因此,本文针对生物信息学专业的特色,探讨了运筹学在生物信息学专业中的教学目的、教学内容、教学方法及考核形式,这将有助于提高运筹学在生物信息学专业中的教学质量,有利于培养具有创新和实践能力的生物信息学人才。
二、根据专业的需要确定教学目的和教学内容生物信息学是在现代生命科学发展过程中,生物医学与数理科学、计算机技术相结合而形成的新兴前沿交叉学科,主要研究如何对海量生物医学数据进行获取、加工、存储和分析,进而理解和阐明海量数据中所包含的重大生物学意义和医学价值。
生物信息学论文
生物信息学论文引言生物信息学是生物学和信息科学的交叉学科,通过运用计算机科学和统计学等工具和技术,研究生物学中的大规模生物数据,并解析生物体内的复杂生物过程。
随着高通量测序技术的发展,获得的生物序列数据呈指数级增长,生物信息学在现代生物学研究中发挥着至关重要的作用。
生物信息学的发展生物信息学的概念最早于20世纪60年代提出,当时主要以计算机科学和数学为基础,主要用于DNA和RNA序列的比对和模式发现。
随着DNA测序技术的快速发展,新一代测序技术的应用使得获取基因组和转录组等大规模数据成为可能。
这一技术的革新推动了生物信息学的迅猛发展。
生物信息学在基因组学中的应用生物信息学在基因组学中的应用是目前生物信息学研究的最主要领域之一。
通过生物信息学的方法,可以对基因组进行组装、注释和比较分析。
基因组组装是将高通量测序数据拼接成完整的基因组序列的过程。
基因组注释可以确定基因组中编码蛋白质的基因、非编码RNA以及其他功能元件的位置和功能。
基因组比较分析可以用于研究不同物种之间的基因组演化、鉴定基因家族以及寻找与特定性状相关的基因。
生物信息学在转录组学中的应用转录组学研究关注的是在特定条件下生物体内所有的mRNA分子,它们是基因转录的产物,反映了生物体在特定生理状态下的基因表达情况。
利用生物信息学方法,可以对转录组数据进行质量控制、差异表达分析和功能注释等。
通过差异表达分析可以找出在不同条件下表达量有显著差异的基因,进一步分析可以揭示基因在特定生理过程中的作用。
功能注释则可以将基因与相关的生物过程、通路和功能进行关联,从而深入理解基因的功能和调控机制。
生物信息学在蛋白质组学中的应用蛋白质组学研究关注的是生物体内所有蛋白质分子的组成和功能。
生物信息学在蛋白质组学中的应用主要包括蛋白质序列预测、结构预测和功能注释。
通过生物信息学工具,可以根据蛋白质序列进行结构预测,进而预测蛋白质的功能和相互作用。
蛋白质功能注释则可以将蛋白质与已知的功能数据库进行比对,从而确定其功能和参与的生物过程。
生物信息学论文
生物信息学论文第一篇:生物信息学论文浅谈生物信息学的发展和前景摘要:本文阐述了生物信息学产生的背景,生物学数据库,生物信息学的主要研究内容,与生物信息学关系密切的数学和计算机科学技术领域,生物信息学产业等内容,展望了其未来并提出了若干在我国发展生物信息学的建议。
着重指出,理解大量生物学数据所包括的生物学意义已成为后基因组时代极其重要的课题。
生物信息学的作用将日益重要。
有理由认为,今日生物学数据的巨大积累将导致重大生物学规律的发现。
生物信息学的发展在国内、外基本上都处在起步阶段。
因此,这是我国生物学赶超世界先进水平的一个百年一遇的极好机会。
关键字:生物信息学产生背景发展现状前景随着生物科学技术的迅猛发展,生物信息数据资源的增长呈现爆炸之势,同时计算机运算能力的提高和国际互联网络的发展使得对大规模数据的贮存、处理和传输成为可能,为了快捷方便地对已知生物学信息进行科学的组织、有效的管理和进一步分析利用,一门由生命科学和信息科学等多学科相结合特别是由分子生物学与计算机信息处理技术紧密结合而形成的交叉学科——生物信息学(Bioinformatics)应运而生,并大大推动了相关研究的开展,被誉为“解读生命天书的慧眼”。
一、生物信息学产生的背景生物信息学是80年代未随着人类基因组计划(Human genome project)的启动而兴起的一门新的交叉学科。
它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析,进而达到揭示数据所蕴含的生物学意义的目的。
由于当前生物信息学发展的主要推动力来自分子生物学,生物信息学的研究主要集中于核苷酸和氨基酸序列的存储、分类、检索和分析等方面,所以目前生物信息学可以狭义地定义为:将计算机科学和数学应用于生物大分子信息的获取、加工、存储、分类、检索与分析,以达到理解这些生物大分子信息的生物学意义的交叉学科。
事实上,它是一门理论概念与实践应用并重的学科。
生物信息学的产生发展仅有10年左右的时间---bioinformatics这一名词在1991年左右才在文献中出现,还只是出现在电子出版物的文本中。
生物信息学的论文
生物信息学一、我对生物信息学的认识1、什么是生物信息学生物信息学从事对基因组研究相关生物信息的获取、加工、储存、分配、分析和解释。
包括了两层含义,一是对海量数据的收集、整理与服务,也就是管好这些数据;另一个是从中发现新的规律,也就是用好这些数据。
具体地说,生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头,找到基因组序列中代表蛋白质和RNA基因的编码区;同时,阐明基因组中大量存在的非编码区的信息实质,破译隐藏在DNA序列中的遗传语文规律;在此基础上,归纳、整理与基因组遗传语文信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白质谱的数据,从而认识代谢、发育、分化、进化的规律。
2、、生物信息学的重要性生物信息学不仅仅是一门科学学科,它更是一种重要的研究开发工具。
从科学的角度来讲,它是一门研究生物和生物相关系统中信息内容物和信息流向的综合系统科学,只有通过生物信息学的计算处理,我们才能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细和系统的理解。
从工具的角度来讲,它是今后几乎进行所有生物(医药)研究开发所必需的舵手和动力机,只有基于生物信息学通过对大量已有数据资料的分析处理所提供的理论指导和分析,我们才能选择正确的研发方向,同样,只有选择正确的生物信息学分析方法和手段,我们才能正确处理和评价新的观测数据并得到准确的结论。
可见生物信息学在今后的无论是生物(医药)科研还是开发中都具有广泛而关键的应用价值;而且,由于生物信息学是生物科学与计算科学、物理学、化学和计算机网络技术等密切结合的交叉性学科,使其具有非常强的专业性,这就使得专业的生物(医药)科研或开发机构自身难以胜任它们所必需的生物信息学业务,残酷的市场竞争及其所带来的市场高度专业化分工的趋势,使得专业的生物(医药)开发机构不可能在自身内部解决对生物信息学服务的迫切需求,学术界内的生物(医药)科研机构也是如此,而这种需求,仅靠那些高度分支化和学术化的分散的生物信息学科研机构是远远不能满足的。
生物信息学小论文2200字_生物信息学毕业论文范文模板
生物信息学小论文2200字_生物信息学毕业论文范文模板生物信息学小论文2200字(一):生物信息学人才培养的理论研究论文摘要:本文主要介绍了生物信息学的相关概念及其人才培养要求,根据相关要求分析了当前我国生物信息学人才培养中存在的问题,在文章最后,针对当前生物信息学人才培养中存在的问题提出解决措施。
关键词:生物信息学;人才培养;策略研究20世纪40年代以来,计算机技术飞速发展,如今计算机技术与大数据技术以及人工智能等技术相结合,使得生物信息的获取、分析、存储和传播更为便捷,为生物信息学的发展提供了技术帮助,加之,多组基因排布序列的测序完成以及对基因功能、蛋白质的功能的研究,使得生物信息学的内容获得极大的丰富,并为生物信息学研究提供了更广阔的空间,而为了推动生物信息学的进一步研究和发展,如何培养高素质的生物信息学人才成为了当下亟待解决的重要问题。
一、生物信息学的概念生物信息学是一门发展迅速的生物学分支学科,由生物学、计算机学、信息管理学、应用数学及统计学等多门学科相互交叉而形成,本质是利用计算机技术解决生物学问题,通过信息的处理和整理并加以运用。
而医学生物信息学则是在医学研究和医学治疗中所运用的生物信息学,本文研究的生物信息学人才培养主要是指医学领域对于生物信息学人才的培养。
二、生物信息学人才要求当前我国各大高校都开设了生物信息学课程,将其作为医学教育的基础课程或者选修课程,然而生物信息学作为一门新兴学科,其课程建设仍在探索之中,尚未形成固定的培养方案和培养模式。
根据当前的生物信息学发展,以及相关学者的研究公认生物信息学人才需要达到以下三个方面的要求:首先需要具备丰富的计算机知识,懂得计算机的使用、计算机编程语言、计算机运行框架以及计算机硬件知识;其次,需要具备使用计算机分析、研究和整合生物信息的能力;其次,需要学会在临床研究或者基础研究的过程中掌握发现问题,并通过文献资料以及运用生物信息研究和解决发现的问题的能力,运用生物信息相关的数据为问题的研究提供数据支撑。
生物信息学研究论文3100字_生物信息学研究毕业论文范文模板
生物信息学研究论文3100字_生物信息学研究毕业论文范文模板生物信息学研究论文3100字(一):基于结构生物信息学的白介素17进化及其结构研究论文摘要:目的:基于结构生物信息学的白介素17进化及其结构研究,以为防治许多炎症相关重大疾病提供借鉴。
方法:采用医学研究资料调研分析法,对我院2 019年1月2019年10月收治的狼疮性肾炎、稽留流产、阿尔茨海默病、左右半结腸癌等疾病患者,就白介素17受体基因进行研究,具体方法应用基因组学、生物信息学,序列比对和注释后,就其进化和结构进行研究。
结果:Recombinant HumanIL-17通过SDS-PAGE,银染色和Coomassie?Blue染色定量光密度法显示,纯度>95%。
通过LAL方法,每1微克蛋白质的内毒素水平<0.01EU。
辅助T细胞的细胞增殖测定中测量中,为此作用的ED50为0.06-0.24ng/mL。
即细胞因子转运蛋白至机体关联的高浓度区细胞因子生物学效应;与mCK-R相应成竞争性配体,抑制mCK-R介导生物学效用明显。
结论:IL-17的进化及其结构在狼疮性肾炎、稽留流产、阿尔茨海默病、左右半结肠癌等疾病等疾病的防治中效果和表达较为明显,可作为疾病防治领域的科研依据加以重视。
关键词:白介素17;进化;结构;结构生物信息学白介素17是最初源于鲤科鱼类最具代表性的二个物种—鲤和草鱼IL17受体基因家族的起源进化,无论是基因组学和生物信息学的研究方法,均证实了在鲤和草鱼中分别注释得到9个和5个IL17受体基因家族成员;与四足动物相比,大多数硬骨鱼类中IL17受体基因没有明显增多。
两类物种除在IL17RB和IL17受体基因家族成员在不同组织中全基因组复制后不同基因拷贝的功能发生了分化。
本研究旨在基于结构生物信息学的白介素17进化及其结构研究,以为防治许多炎症相关重大疾病提供借鉴,具体内容分析如下:1资料和方法1.1一般资料采用医学研究资料调研分析法,对我院2019年1月2019年10月收治的狼疮性肾炎、稽留流产、阿尔茨海默病、左右半结肠癌等疾病患者,就白介素17受体基因进行研究,具体方法应用基因组学、生物信息学,序列比对和注释后,就其进化和结构进行研究。
《生物信息学的基础》论文
写一篇《生物信息学的基础》论文《生物信息学的基础》生物信息学是一门专门研究生命科学的交叉学科,融合了生物学、计算机科学、数学和统计学。
它的主要目的是探讨如何从大量的生物数据中寻找模式、推断概念、识别关系以及构建建模。
在过去的几十年里,由于生物技术的飞速发展,生物信息学的重要性也随之提升,它在临床医学、药物研发、疾病预测、农作物进化、植物系统发育等领域都发挥了不可或缺的作用。
生物信息学的基本原理涉及到了探索和抽取基因组、RNA、蛋白质和代谢过程中的隐含信息,并利用生物统计学、数学建模和分析方法以及计算机技术构建生物模型以获得科学的结论。
为了全面掌握生物信息学,学习者需要学习有关的基础知识,主要包括数据库知识、计算机科学方法、基因组学与系统生物学技术、生物信息技术等。
首先要学习的是数据库知识。
目前,有许多专业的生物数据库,如NCBI,GeneBank,Species360等,这些数据库收集了全球各领域的生物数据,包括基因组、蛋白质组学分析、生物进化分析和转录组学分析等。
了解这些数据库的结构和功能将有助于研究者更好的理解生物数据,更加高效的获取生物信息。
接下来就是计算机科学的方法。
生物信息学需要使用大量的计算机科学方法才能处理大量的数据,包括算法、编码技术、数据库管理、网络安全等。
理解这些计算机科学方法,会有助于研究者更好的处理生物数据,提升生物信息学工作效率。
再者,学习者还应该掌握基因组学与系统生物学技术,了解基因组序列如何被组装、怎样应用分子进化和遗传学分析方法、如何构建哺乳动物的基因组结构、如何应用系统进化方法追踪疾病的发展等等。
此外,还应学习相关的转录组、蛋白质组学和其他生物信息学技术。
最后,学习者也应该掌握相关的生物统计学与建模技术,包括统计棒图、箱线图、R语言、SAS、Statistica等,以及Matlab、Python等编程语言,以便于他们能够运用相关的统计方法分析生物数据,推断出更多的有用信息。
生物信息学论文
生物信息学论文生物信息学是一门研究基因组和生物大数据的学科,它在生物学和信息学之间建立了桥梁。
通过整合和分析大量的生物学数据,可以揭示生物体内复杂的分子网络和基因组特征,进而揭示生物体的生物学功能和代谢途径。
在本文中,我将综述生物信息学在基因组学和蛋白质组学研究中的应用,并讨论其在生命科学研究中的潜在应用。
生物信息学在基因组学研究中扮演着重要的角色。
随着高通量测序技术的发展,我们可以迅速获取到大量的基因组数据。
这些数据包括DNA序列、基因表达水平和甲基化水平等。
通过生物信息学的方法,我们可以对这些数据进行整合和分析,从而更好地理解基因组的结构和功能。
首先,生物信息学可以用于基因组测序数据的分析。
例如,我们可以使用序列比对算法对测序技术产生的测序数据进行整合和比对。
这样可以鉴定出基因组中的基因和其他功能区域,进而理解基因组的结构和功能。
此外,生物信息学还可以对基因组中不同区域的特征进行分析,例如基因的组织模式和启动子的结构等。
其次,生物信息学可以用于基因表达数据的分析。
基因表达数据可以告诉我们在不同条件下哪些基因被激活或抑制。
通过生物信息学的方法,我们可以对基因表达数据进行聚类和差异分析,从而鉴定出在不同条件下表达水平显著变化的基因。
这样可以揭示出与特定生物过程或环境适应相关的基因。
除了基因组学研究,生物信息学还在蛋白质组学研究中发挥着重要的作用。
蛋白质是生物体内最重要的功能分子之一,因此了解蛋白质的结构和功能对于理解生物学过程至关重要。
生物信息学可以通过蛋白质序列和结构的比对、模拟和预测来推断蛋白质的功能和相互作用网络。
这样可以为进一步的实验设计和理解蛋白质的功能提供重要线索。
总结起来,生物信息学在基因组学和蛋白质组学研究中起着关键的作用。
通过整合和分析大量的生物学数据,我们可以更好地理解基因组和蛋白质的结构、功能和相互作用网络。
这将有助于我们揭示生物体的生物学功能和代谢途径,进而为疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。
生物信息学论文 (2)
生物信息学论文引言生物信息学是一门集合了生物学、计算机科学和统计学等多个学科的综合性科学领域。
它通过对生物学数据的分析和解释,推动了生物学研究的进展,使我们能够更好地理解生物系统的功能和复杂性。
在本论文中,我们将介绍生物信息学的概念、应用以及未来的发展方向。
生物信息学的概念与发展生物信息学是一门通过计算机科学和统计学的方法来研究生物学问题的学科。
生物信息学能够处理生物学中产生的大量数据,并从中提取和分析有用的信息。
它涉及到DNA、RNA和蛋白质序列的分析、比对和预测,以及基因组、转录组和蛋白质组的分析和解释。
生物信息学的发展始于1970年代,当时蛋白质和核酸的序列数据开始被大规模地产生。
随着技术的不断进步,生物学数据的规模和复杂性逐渐增加,生物信息学也变得越来越重要。
现代生物信息学不仅可以处理DNA和蛋白质的序列数据,还可以分析基因表达和蛋白质互作网络等更复杂的生物学数据。
生物信息学的应用生物信息学在生物学研究中有着广泛的应用。
下面我们将介绍一些常见的生物信息学应用领域:基因组学基因组学是研究整个基因组的结构、功能和演化的学科。
生物信息学在基因组学中发挥着重要作用,它可以用于基因鉴定、基因预测、基因家族的分析等。
转录组学转录组学是研究基因转录产物(mRNA或RNA)的全集及其表达模式的学科。
生物信息学在转录组学研究中可以用于基因表达的定量和差异分析、信号通路的预测和建模等。
蛋白质组学蛋白质组学是研究整个蛋白质组的结构、功能和相互作用的学科。
生物信息学在蛋白质组学中可以用于蛋白质结构的预测、功能注释、蛋白质相互作用网络的构建等。
进化生物学进化生物学是研究物种起源和演化过程的学科。
生物信息学在进化生物学中可以用于物种间基因组的比较、系统发育树的重建和进化模拟等。
药物设计与分析生物信息学在药物设计与分析中扮演着重要角色。
它可以用于药物靶点的预测、药物分子库的筛选和药物相互作用的模拟等。
生物信息学的未来发展方向生物信息学在过去几十年取得了巨大的进展,但仍然面临一些挑战和机遇。
生物信息学论文 (4)
生物信息学论文引言生物信息学是一个蓬勃发展的跨学科领域,将计算机科学和统计学应用于生物学研究中。
它涵盖了多个领域,包括基因组学、蛋白质组学、代谢组学等。
随着高通量实验技术的广泛应用,生物信息学在生命科学研究中变得越来越重要。
例如,通过分析大规模基因表达数据,我们能够揭示基因调控网络,发现新的生物标志物,并且可以为疾病的诊断和治疗提供重要的信息。
生物信息学的基本原理生物信息学的基本原理是将生物学数据转化为计算机可以处理的形式,并使用计算机算法来分析和解释这些数据。
最常见的生物学数据类型包括基因序列、蛋白质序列、基因表达数据和代谢数据。
生物信息学方法的发展主要包括以下几个方面:序列比对序列比对是生物信息学中的基础操作之一。
它通过比较两个或多个序列的相似性,来判断它们是否具有相同的功能或结构。
常见的序列比对算法包括Smith-Waterman算法和Needleman-Wunsch算法。
这些算法通过对序列进行全局或局部比对,来发现序列之间的相似区域。
基因表达数据分析基因表达数据分析是生物信息学中的一个重要研究方向。
它通过测量基因在不同组织或不同条件下的表达水平,来揭示基因在生物学过程中的功能和调控机制。
基因表达数据分析涉及到数据预处理、差异表达基因的筛选和功能注释等步骤。
常用的基因表达数据分析工具包括DESeq2和EdgeR。
基因组学基因组学是生物信息学中研究基因组的一门学科。
它主要研究基因的组织、结构和功能。
基因组学的研究方法包括基因预测、基因注释和基因组比较等。
基因组学的研究成果对于理解基因的进化和功能起着重要的作用。
生物信息学在疾病研究中的应用随着生物信息学方法的发展,它在疾病研究中的应用也越来越广泛。
生物信息学可以帮助我们理解疾病的发病机制,发现新的治疗靶点,并且为药物设计和个体化医疗提供支持。
疾病基因的鉴定生物信息学可以帮助我们鉴定疾病的遗传基因。
通过分析患者和正常人的基因组数据,我们可以发现与疾病相关的遗传变异。
生物信息学应用论文4000字_生物信息学应用毕业论文范文模板
生物信息学应用论文4000字_生物信息学应用毕业论文范文模板生物信息学应用论文4000字(一):结构生物信息学在肽体药物分子设计中的应用论文摘要:肽是人体七大营养素之一,具有抑制细胞变性、增强免疫力,激活细胞、清除自由基,修复变性细胞、促新陈代谢,维持细胞正常活动四大功效。
本研究概述了肽类药物分子设计的相关概述,进而设计出了一种基于结构生物信息学的纳米肽类药物,以为药物实现长时间血液循环、靶向性爆发释放、提升试剂装载率、降低毒副作用提供可行性借鉴。
关键词:结构生物信息学;肽体药物;分子;设计肽是人体七大营养素之一,具有抑制细胞变性、增强免疫力,激活细胞、清除自由基,修复变性细胞、促新陈代谢,维持细胞正常活动四大功效。
肽体药物的制备之于人类具有重要的科研价值。
从结构生物信息学的相关理论来看,肽体药物涵盖白蛋白、蛋白肽、羊胎素、干细胞、胰岛素、催产素、胸腺肽等多种物质,在疾病防控和治疗领域发挥了显著的功效。
1肽体药物概述在过去的数十年间,肿瘤学治疗领域中诞生了以分子靶向药物的病因治疗机制革新和替代了非特异性化疗药物的治疗策略。
以肽类药物为例,通过药物制备环节分子设计,整体上实现了肿瘤微环境改善、阻断了肿瘤细胞或肿瘤特异性细胞表达,同时以高分子作用机制阻断肿瘤细胞恶性增殖、转移,促使其凋亡的尝试,一度成为结构生物信息学研究背景领域的关键性议题,并在现实实践中发挥了突出作用。
肽类药物分子设计主要通过智能超分子光动力纳米技术作用,在金属配位能力设计、装载效率、稳定性测试、血液循环时间、临床试验治疗疗效上发挥了特异性作用。
2设计细则2.1设计背景2018年5月,多家研究机构合作报道了Schlafen(SLFN)蛋白家族被发现20年以来的第一个晶体结构,证实SLFN是一个新型的核酸内切酶家族,通过破坏蛋白翻译机器调控真核生物的翻译进程,能够有效控制HIV病毒的复制和包装。
肽类药物分子设计正是基于小分子化合物与蛋白靶标的对接上,并在结果排序中得到充分验证。
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生物信息学的发展和前景
摘要:生物信息学已成为整个生命科学发展的重要组成部分,成为生命科学研究的前沿。
本文对生物信息学的产生背景及其研究现状等方面进行了综述,并展望生物信息学的发展前景。
生物信息学的发展在国内、外基本上都处在起步阶段。
因此,这是我国生物学赶超世界先进水平的一个百年一遇的极好机会。
关键字:生物信息学、产生、发展、前景
生物信息学的发展和前景
随着生物科学技术的迅猛发展,生物信息数据资源的增长呈现爆炸之势,同时计算机运算能力的提高和国际互联网络的发展使得对大规模数据的贮存、处理和传输成为可能,为了快捷方便地对已知生物学信息进行科学的组织、有效的管理和进一步分析利用,一门由生命科学和信息科学等多学科相结合特别是由分子生物学与计算机信息处理技术紧密结合而形成的交叉学科——生物信息学(Bioinformatics))应运而生,并大大推动了相关研究的开展,被誉为“解读生命天书的慧眼”。
生物信息学的产生
生物信息学是80年代未随着人类基因组计划(Human genome project)的启动而兴起的一门新的交叉学科。
它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析,进而达到揭示数据所蕴含的生物学意义的目的。
由于当前生物信息学发展的主要推动力来自分子生物学,生物信息学的研究主要集中于核苷酸和氨基酸序列的存储、分类、检索和分析等方面,所以目前生物信息学可以狭义地定义为:将计算机科学和数学应用于生物大分子信息的获取、加工、存储、分类、检索与分析,以达到理解这些生物大分子信息的生物学意义的交叉学科。
事实上,它是一门理论概念与实践应用并重的学科。
生物信息学的产生发展仅有10年左右的时间---bioinformatics这一名词在1991年左右才在文献中出现,还只是出现在电子出版物的文本中。
事实上,生物信息学的存在已有30多年,只不过最初常被称为基因组信息学。
美国人类基因组计划中给基因组信息学的定义:它是一个学科领域,包含着基因组信息的获取、处理、存储、分配、分析和解释的所有方面。
自1990年美国启动人类基因组计划以来,人与模式生物基因组的测序工作进展极为迅速。
迄今已完成了约40多种生物的全基因组测序工作,人基因组约
3x109碱基对的测序工作也接近完成。
至2000年6月26日,被誉为生命“阿波罗计划”的人类基因组计划终于完成了工作草图,预示着完成人类基因组计划已经指日可待。
截止目前为止,仅登录在美国GenBank数据库中的DNA序列总量已超过70亿碱基对。
此外,迄今为止,已有一万多种蛋白质的空间结构以不同的分辨率被测定。
基于cDNA序列测序所建立起来的EST数据库其纪录已达数百万条。
在这些数据基础上派生、整理出来的数据库已达500余个。
这一切构成了一个生物学数据的海洋。
这种科学数据的急速和海量积累,在人类的科学研究历史中是空前的。
数据并不等于信息和知识,但却是信息和知识的源泉,关键在于如何从中挖掘它们。
与正在以指数方式增长的生物学数据相比,人类相关知识的增长(粗略地用每年发表的生物、医学论文数来代表)却十分缓慢。
一方面是巨量的数据;另一方面是我们在医学、药物、农业和环保等方面对新知识的渴求,这些新知识将帮助人们改善其生存环境和提高生活质量。
这就构成了一个极大的矛盾。
这个矛盾就催生了一门新兴的交叉科学,这就是生物信息学。
生物信息学的研究现状
数据库是生物信息学的主要内容,至今世界各国纷纷建立了生物信息数据库,其数量呈爆炸性增长,几乎涉及了生命科学的各个研究领域。
目前主要有美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank();欧洲生物信息学研究所(EBI)的(EMBL)(http://www.emblheidelberg.de)数据库;日本国立遗传学研究所(NIG)的DNA数据库(DDBJ)(http://www.nig.ac.jp)瑞士生物信息学研究所(SIB)的SWISSPROT (http://www.expasy.ch/sprottop.html);美国Brookhaven国家实验室(BNL)的PDB(/pdb/);NCBI开发的ENTERZ系统综合了上述各大数据库的信息和MEDLINE的文献信息。
目前我国在生物信息数据库领域的主要任务是:实验室数据信息化管理、数据库标准化、数据库共享与集成;建立基因信息的评估与检测系统;构建我国自已特殊需要的二级、三级数据库和专业数据库,并与国际常用数据库有效连接和及时更新。
近年来,生物信息学家已经取得了多项研究成果,确定了数千个基因的功能,其中包括搜索碱基对序列匹配的有效方法,统计学工具,利用新的计算机工具组装整个基因组等,但生物信息学的发展面临新的挑战,迫切需要新的研究手段和研究方法。
生物信息学的发展前景
《第三次技术革命》里有这样描述:“一场与工业革命和以计算机为基础的革命有相同影响力的变化正在开始。
下一个伟大时代将是基因组革命时代,它现在处于初期阶段。
”基因组学的发展已经进入后基因组研究阶段,致力于蛋白质功能研究的蛋白质组学和功能蛋白质组学正在蓬勃发展,在生物信息学发展的带动下,我们必定能够揭示各种生命现象的奥秘,并带动多个学科的跨越式发展。
生物信息学的发展将对分子生物学、药物设计、工作流管理和医疗成像等领域产生巨大的影响,极有可能引发新的产业革命。
此外,生物信息学所倡导的全球范围的资源共享也将对整个自然科学乃至人类社会的发展产生深远的影响。
有理由相信,今日生物学数据的巨大积累将导致重大生物学规律的发现,生物信息学的发展在国内、外基本上都处在起步阶段,因此,这是我国生物学赶超世界先进水平的一个百年一遇的极好机会。
生物学是生物信息学的核心和灵魂,数学与计算机技术则是它的基本工具。
这一点必须着重指出。
预测生物信息学的未来主要就是要预测他对生物学的发展将带来什么样的根本性的突破。
这种预测是十分困难的,甚至几乎不可能。
但机不可失,时不再来,鉴于生物信息学在我国生物信息学和经济发展中的重要意义和其发展的紧迫性,因此,由国家出面组织全国的力量,搞个类似"两弹一星"那样的,但是,规模要小的多,花钱也少的多的生物信息学发展计划,不是不可以考虑的。
要充分发挥中央与地方,生物学科研究人员等方方面面的积极性。
生物信息学研究投资少,见效快,可充分发挥我国智力资源丰富的长处,是特别适合我国国情的一项研究领域。
要在大学里建立生物信息学专业,设立硕士点和博士点,培养专门人才。
可以组织一大批数学、物理、化学和计算机科技工作者,在自愿的基础上,学习有关的生物学知识,开展多方面的生物信息学研究。
经过十几年或更长的时间的努力,逐渐使我国成为生物信息学研究强国,是完全有可能的。
信息学的商业价值十分显著。
国外很多大学,研究机构,软件公司甚至政府机构纷纷成立各种生物信息机构,建立自立的生物信息集成系统,研制这方面的软件,重金招聘人才,期望从中获取更多的生物信息和数据加以研究和利用,缩短药物开发周期,抢注基因专利,获取更大利润。
我国如不加大资金投入力度,将来可能会花更多的钱去购买别人的软件,使用专利基因或购买新的药物。
所幸,我国也开始重视这一学科:南、北方人类基因组中心的相继建成,北大生物城的破土动工等,标志着我国对生物信息学的重视。
我们有理由相信,我国的生物信息学在21世纪会有巨大的飞跃。
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