氨基酸及其密码子对照
氨基酸与密码子表_氨基酸属性对照表(Excel版可排序查找)
G
C2H5NO2 75
H
C6H9N3O2 155
I
C6H13NO2 131
K
C6H14N2O2 146
L
C6H13NO2 131
M C5H11NO2S 149
N
C4H8N2O3 132
P
C5H9NO2 115
Q
C5H10N2O3 146
R
C6H14N4O2 174
S
C3H7NO3 105
T
C4H9NO3 119
氨基酸与密码子表 密码子简并性表
第一个字母
U
第二个字母
C
A
G
F
S
Y
C
U
F
S
Y
C
L
S
*
*
L
S
*
W
L
P
H
R
C
L
P
H
R
L
P
Q
R
L
P
Q
R
I
T
N
S
A
I
T
N
S
I
T
K
R
M
T
K
R
V
A
D
G
G
V
A
D
V
A
E
G G
V
A
E
G
第三个字母
U C A G U C A G U C A G U C A G
颜色标注 用于辅助 查看密码 子简并性, 未标颜色 的简并性 密码子位 置比较集 中。
脯氨酸 非极性 杂环亚氨基酸
谷氨酰胺 极性不带电 脂肪族
精氨酸 极性带正电 脂肪族
氨基酸简写和密码子表
缬氨酸V
丙氨酸A
天冬氨酸D
甘氨酸G
C
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
A
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
G
谷氨酸E
甘氨酸G
A
缬氨酸V
丙氨酸A
谷氨酸E
甘氨酸G
G
氨基酸简写和密码子表
第一个
核苷酸5′
第二个核苷酸
第三个
核苷酸3
U
C
A
G
U
苯丙氨酸F
丝氨酸S
酪氨酸Y
半胱氨酸C
U
苯丙氨酸F
丝氨酸S
酪氨酸Y
半胱氨酸C
C
亮氨酸L
丝氨酸S
终止密码子
终止密码子
A
亮氨酸L
丝氨酸S
终止密码子
色氨酸W
G
C
亮氨酸L
脯氨酸P
组氨酸H
精氨酸R
U
亮氨酸L
脯氨酸P
组氨酸H
精氨酸R
C
亮氨酸L
脯氨酸P
谷氨酰胺Q
精氨酸R
A
亮氨酸L
脯氨酸P
谷氨酰胺Q
精氨酸R
G
A
异亮氨酸I
苏氨酸T
天冬酰胺N
丝氨酸S
U
异亮氨酸I
苏氨酸T
天冬酰胺N
丝氨酸S
C
异亮氨酸I
苏氨酸T
赖氨酸K
精氨酸R
A
甲硫氨酸M
苏氨酸T
赖氨酸K
精氨酸R
G
G
缬氨酸V
丙氨酸A
天冬氨酸D
甘氨酸G
氨基酸简写和密码子表
第一个
核苷酸5′
氨基酸密码子对照表
氨基酸密码子对照表酸 e Leu 160 -CH-CH 2 - 类赖氨酸LysineK 或Lys146.17H 2 N-(CH 2 )4 -碱性氨基酸类蛋氨酸MethionineM 或Met149.199CH 3 -S-(CH2 ) 2 -含硫类苯丙氨酸PhenylalanineF 或Phe165.177Phenyl-CH 2 -芳香族类脯氨酸ProlineP 或Pro115.117-N-(CH 2 ) 3-CH-|_________|亚氨基酸丝氨酸SerineS 或Ser105.078HO-CH 2 - 羟基类苏氨酸ThreonineT 或Thr119.105CH 3 -CH(OH)- 羟基类色氨酸TryptophanW 或Trp204.213Phenyl-NH-CH=C-CH 2 -|___________|芳香族类酪氨酸TyrosineY 或Tyr181.1764-OH-Phenyl-CH 2 -芳香族类缬氨酸ValineV 或Val117.133CH 3 -CH(CH2 )-脂肪族类与核苷酸序列相关的特征关键词表 关键词说明allel e 相关的个体或菌株含有相同基因的稳定的其它形式,该形式区别于这一位置的现有的序列(和或许其它序列)atten uator 存在调节转录的终止的DNA 区域,它控制了一些细菌操纵子的表达; (2)位于启动子和第一个结构基因之间，引起转录的部分终止的序列区段C_reg ion 免疫球蛋白轻和重链的恒定区,和T-细胞受体α,β,和γ链；根据特定的链可包括一个或多个外显子CAAT_signa CAAT 盒;位于可能参与RNA 聚合酶结合的真核生物转录单位的起始点的75bp 上游l 的保守序列的一部分；共有序列＝GG(C或T)CAATCTCDS 编码序列;对应于蛋白质中的氨基酸序列的核苷酸的序列(位置包括终止密码子);特征包括氨基酸概念上的翻译Confl ict 在这一位点或区域,单独确定的“相同”序列有所不同D-loo p 置换环；线粒体DNA内的一个区域,其中RNA的短的序列与DNA的一条链配对,代替了这一区域的原始配对DNA链;也用于说明在RecA蛋白质催化的反应中，侵入的单链替代双链DNA的一条链的区域D-seg ment 免疫球蛋白重链的多变区,和T-细胞受体的β链Enhan cer 顺式-作用序列,它增强了(一些)真核生物启动子的作用,并能在任一方向和与启动子相关的任何位置处 (上游或下游)起作用Exon 编码剪接mRNA部分的基因组区域;可以含有5'UTR,所有CDS,和3'UTRGC_si gnal GC盒;位于真核生物转录单位起始点上游的保守的富含GC区域,可以以多重拷贝或任一方向存在;共有序列=GGGCGGgene 鉴定为基因的生物学意义的区域,并已经指定名称iDNA 间插DNA;通过几种重组中的任何一种能被消除的DNAintro n 被转录的DNA 区段,但通过同时剪接位于其两侧的序列(外显子)即可从转录本内部将其除去J_seg ment 免疫球蛋白轻链和重链的连接区段,和T-细胞受体α,β和γ链LTR 长的末端重复,在确定序列的两端直接重复的序列, 类型典型地见于逆转录病毒中mat_p eptid e 成熟的肽或蛋白质的编码序列;翻译后修饰之后成熟的或最终的肽或蛋白质产物的编码序列;位置不包括终止密码子(与相应的CDS 不同)misc_bindi ng 不能用任何其它Binding 关键词(primer_bind 或protein_bind)表述的与另一个组成成分共价或非-共价结合的核酸中的位点misc_diffe rence 特征序列与记载中存在的有所不同,并且不能用任何其它不同关键词(conflict,unsure,old_sequence,mutation,variation,allele 或modified_base)表述misc_featu re不能用任何其它的特征关键词表述的具有生物学意义的区域;新的或少见的特征misc_ recom b 任何一般性的,位点特异性的或复制的重组事件的位点,该位点中有不能用其它重组关键词(iDNA和virion)或来源关键词的修饰词(/transposon,/proviral)表述的双螺旋DNA的断裂和愈合misc_ RNA 不能用其他RNA关键词（prim_transcript,precursor_RNA,mRN A,5'clip,3'clip,5'UTR,3'UTR,exon,CD S,sig_peptide,transit____peptide,mat_peptide,intron,polyA_ site,rRNA,tRNA,scRNA和snRNA)限定的任何转录本或RNA产物misc_ signa l 含有控制或改变基因功能或表达之信号的任何区域,所述信号不能用其他Signal 关键词(promoter,CAAT_signal,TATA_signal,-35_signal,10_signal,GC_signal,RBS,p olyA_signal,enhancer,attenuator,ter minator,和rep_origin)表述misc_ struc ture 不能用其他Structure关键词(stem_loop 和D-loop)表述的任何二级或三级结构或构象modif ied_b 被指示的核苷酸是经修饰的核苷酸,并应由被指示的分子(在mod_base修饰词意义ase 中给出)所取代mRNA 信使RNA ；包括5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS ，外显子)和３'非翻译区（３'UTR ）mutat ion 在此位置处，相关品系的序列中具有突然的，可遗传的变化N_reg ion 在重排的免疫球蛋白区段之间插入的额外的核苷酸Old_s equen ce在此位置处，所表述的序列修改了此序列以前的版本PolyA _sign al聚腺苷酸化之后内切核酸酶裂解RNA 转录本所必需的识别区域；共有序列＝AATAAA PolyA _site RNA 转录本上的位点,通过转录后聚腺苷酸化该位点将被加上腺嘌呤残基Precu rsor_RNA 仍不是成熟的RNA 产物的任何RNA 种类；可包括5'剪切区(5'clip)，5'非翻译区(5'UTR)，编码序列(CDS ，外显子)，间插序列（内含子），3'非翻译区（3'UTR ）,和3'剪切区(3'clip)prim_trans cript 初级（最初的，未加工的）转录本；包括５'剪切区（５'clip ）,５'非翻译区（５'UTR ）,编码序列(CDS,外显子),间插序列(内含子),3'非翻译区(3'UTR)和3'剪切区(3'clip)prim_bind 起始复制,转录或逆转录的非－共价的引物结合位点;包括合成的例如PCR 引物元件的位点Promo ter 参与RNA 聚合酶的结合以启动转录的DNA 分子区域prote in_bind核酸上非－共价的蛋白质结合位点 RBS 核糖体结合位点repea t_region含有重复单位的基因组区域repea t_unit单个重复元件rep_o rigin 复制起点;复制核酸以得到两个相同拷贝的起始位点RRNA 成熟的核糖体RNA ；将氨基酸装配成蛋白质的核糖核蛋白颗粒（核糖体）中的RNA 成份S_reg ion 免疫球蛋白重链的开关区；它参与重链DNA 的重排,导致来自相同B －细胞的不同免疫球蛋白类的表达Satel lite 短的基本重复单位的很多串联重复(相同或相关的);大多数具有的碱基组成或其它性质与基因组的一般水平不同,这使得它们与大部分(主带)的基因组DNA分离开来ScRNA 小的细胞质RNA;几个小的细胞质ＲＮＡ分子中的任何一个存在于真核生物的细胞质和（有时）核中sig_p eptid e 信号肽编码序列；被分泌的蛋白质的Ｎ－末端结构域的编码序列；此结构域涉及新生多肽与膜的结合；前导序列SnRNA 小的核RNA；很多小的RNA种类中的任何一个都被局限于核中；几个snRNA参与剪接或其它RNA加工反应sourc e 鉴定序列中特定范围的生物来源；此关键词是强制性的；每一项至少要有一个跨越整个序列的单一来源关键词；每个序列可允许有一个以上的来源关键词stem_ loop 发卡结构；由RNA或DNA单链的相邻（反向）互补序列之间的碱基一配对形成的双螺旋区域STS 序列标记位点：表述基因组上作图界标并能通过PCR检测的短的，单拷贝DNA序列；通过测定STS系列的次序即可作出图谱的基因组区域TATA_ signa l TATA盒；Goldberg-Hogness盒；在每个真核生物RNA聚合酶Ⅱ转录单位起点前约25bp处发现的保守的富含AT的七聚体，它可能涉及使酶定位以正确地起始；共有序列＝TATA （Ａ或Ｔ）Ａ（Ａ或Ｔ） termi nator 或者位于转录本的末端或者与启动子区域相邻的DNA 序列，该序列可导致RNA 聚合酶终止转录；也可以是阻抑蛋白的结合位点trans it_pe ptide 转运肽编码序列；核编码的细胞器蛋白质Ｎ－末端结构域的编码序列；此结构域参与将蛋白质翻译后运送到细胞器中tRNA 成熟的转移RNA,，小的RNA 分子（75－85个碱基长），介导核酸序列翻译成氨基酸序列unsur e作者不能确定此区域的准确序列 V_reg ion 免疫球蛋白轻链和重链的可变区，和Ｔ－细胞受体α，β和γ链；编码可变的氨基末端部分；可由V ＿segment,D_segment,N_region 和J_segment 组成V_seg ment 免疫球蛋白轻链和重链的可变区段，和T －细胞受体α，β和γ链；编码大多数可变区（v_region ）和前导肽的最后几个氨基酸varia tion 含有来自相同基因的稳定突变的相关系列（例如RFLP ，多态性等），在此（和可能其它）位置处所述相同基因与被表述的不同3’cl ip 在加工过程中被切下的前体转录本3'端大部分区域3’UT P 不被翻译成蛋白质的成熟转录本的３'末端区域（终止密码子之后）5’cl ip 在加工过程中被切下的前体转录本５'端大部分区域5’UT P 不被翻译成蛋白质的成熟转录本的５'末端区域（起始密码子之前）_ 10 _sign al Pribnow盒；细菌转录单位起点上游约10bp处的保守区域,它可能参与结合RNA 聚合酶;共有序列=TatAaT_ 35 _sign al 细菌转录单位起点上游约35bp处的保守六聚体；共有序列=TTGACa[]或TGTTGACA[]与蛋白质序列相关的特征关键词表关键词说明CONFLICT 不同的论文报道了不同的序列VARIANT 作者报道存在序列变体VARSLIC 由可选择的剪接产生的序列变体的表述MUTAGEN 经实验操作已改变的位点MOD_RES 残基的翻译后修饰ACETYLATION N －末端或其它AMIDATION 通常位于成熟的活性肽的C －末端BLOCKED 不能被测定的N －或C －末端封闭基团FORMYLATION N －末端甲硫氨酸的GAMMA-CARBOXY-GLUTAMIC ACID HYDROXYLATION天冬酰胺，天冬氨酸，脯氨酸或赖氨酸的METHYLATION 通常为赖氨酸或精氨酸的PHOSPHORYLA TION 丝氨酸，苏氨酸，酪氨酸，天冬氨酸或组氨酸的PYRROLIDONE CARBOXYLICA CID已形成内部环内酰胺的N －末端谷氨酸 SULFATATION 通常为酪氨酸的LIPID 脂质组成成分的共价结合MYRISTATE 通过酰胺键与蛋白质成熟形式的N－末端甘氨酸残基或内部的赖氨酸残基结合的豆蔻酸基团PALMITATE 通过硫酯键与半胱氨酸残基或通过酯键与丝氨酸或苏氨酸残基结合的棕榈酸基团FARNESYL 通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的法尼基GERANYL-GER ANYL 通过硫酯键与半胱氨酸残基结合的香叶基－香叶基基团GPI ＿ANCHOR 与蛋白质成熟形式Ｃ－末端残基的α－羧基相连的糖基－磷脂酰肌醇（GPI ）基团N ＿ACYL DIGLYCERIDE 原核生物脂蛋白成熟形式的N －末端半胱氨酸，所述脂蛋白具有酰胺－键联的脂肪酸和通过酯键连接了两个脂肪酸的甘油基DISULFID 二硫键；“FROM ”和“TO ”终点表示通过一个链－内二硫键连接的两个残基；如果“FROM ”和“TO ”终点是完全相同的，则二硫键是链－间键，而说明书领域示出交联的性质THIOLEST 硫醇酯键；“FROM ”和“TO ”终点表示通过硫醇酯键连接的两个残基THIOETH 硫醚键；“FROM ”和“TO ”终点表示通过硫醚键连接的两个残基CARBOHYD 糖基化位点；碳水化物（如果已知）的性质在说明书领域给出METAL 金属离子的结合位点；说明书领域示出金属的性质BINDING 任何化学基团（辅酶，辅基，等等）的结合位点；基团的化学性质在说明书领域给出SIGNAL 信号序列的范围（前肽）TRANSIT 运转肽的范围（线粒体，叶绿体或微体）PROPEP 前肽的范围CHAIN 成熟蛋白质中多肽链的范围PEPTIDE 被释放的活性肽的范围DOMAIN 序列中感兴趣的区域的范围；所述区域的特征在说明书领域给出CA＿BIND 钙－结合区域的范围DNA＿BIND DNA-－结合区域的范围NP_BIND 核苷酸磷酸酯结合区域；核苷酸磷酸酯的特征示于说明书领域TRANSMEM 转膜区域的范围ZN_FING 锌指区域的范围SIMILAR 与另一个蛋白质序列具有相似性的区域；与那个序列有关的精确的资料在说明书领域给出REPEAT 内部序列重复的范围HELIX 二级结构；螺旋，例如α－螺旋，３（10）螺旋，或Pi-螺旋STRAND 二级结构；β－链，例如氢键连接的β－链，或分离的β－桥中的残基TURN 二级结构转角，例如Ｈ－键连的转角（３－转角，４－转角或５－转角）ACT_SITE 涉及酶活性的氨基酸SITE 序列中任何其它感兴趣的位点INIT_MET 已知序列以起始密码子甲硫氨酸开始NON_TER 序列末端的残基不是末端残基；如果应用于位置１，这表示第一个位置不是完整分子的Ｎ－末端；如果应用于最后一个位置，这表示此位置不是完整分子的Ｃ－末端；对此关键词没有说明书领域NON_CONS 非连串残基；表示序列中的两个残基不是连串的，在它们之间有很多末测序的残基UNSURE 序列的不确定性；用于表述不能确定序列排列的序列区域。
密码子和氨基酸的对应关系
密码子和氨基酸的对应关系DNA的密码子是由四个核苷酸构成的有序序列，这四个核苷酸分别是腺苷（A）、胞苷（G）、胆苷（C）和俳苷（T）。
每个密码子都有一个相应的氨基酸。
下面是DNA密码子和氨基酸之间的对应关系：1、UUU（腺苷腺苷腺苷）/ UUC（腺苷腺苷胞苷）：表示色氨酸（Phenylalanine）2、UAU（腺苷胞苷腺苷）/ UAC（腺苷胞苷胞苷）：表示鸟氨酸（Tyrosine）3、AUU（胞苷腺苷腺苷）/ AUC（胞苷腺苷胞苷）/ AUA（胞苷腺苷胞苷）：表示苏氨酸（Isoleucine）4、GUU（胞苷腺苷胞苷）/GUC（胞苷腺苷胞苷）/GUG（胞苷腺苷胞苷）/GUU（胞苷腺苷胞苷）：表示天冬酰胺酸（Valine）5、GUU（胞苷腺苷腺苷）/GUC（胞苷腺苷胞苷）/GUU（胞苷腺苷胞苷）/GUG（胞苷腺苷胞苷）：表示丙氨酸（Alanine）6、GAA（胞苷胞苷腺苷）/GAG（胞苷胞苷胞苷）：表示谷氨酸（Glutamic Acid）7、CUU（胞苷胞苷腺苷）/CUC（胞苷胞苷胞苷）/CUA（胞苷胞苷腺苷）/CUG（胞苷胞苷胞苷）：表示缬氨酸（Leucine）8、AAA（腺苷胞苷胞苷）/AAG（腺苷胞苷胞苷）：表示甘氨酸（Lysine）9、CAU（胞苷腺苷胞苷）/CAC（胞苷腺苷胞苷）：表示半胱氨酸（Histidine）10、AUG（胞苷腺苷胞苷）：表示甲硫氨酸（Methionine）11、UGU（腺苷胞苷腺苷）/UGC（腺苷胞苷胞苷）：表示精氨酸（Cysteine）12、CCU（胞苷胞苷腺苷）/CCC（胞苷胞苷胞苷）/CCA（胞苷胞苷腺苷）/CCG（胞苷胞苷胞苷）：表示丝氨酸（Serine）13、UUA（腺苷腺苷胞苷）/UUG（腺苷腺苷胞苷）：表示色氨酸（Leucine）14、UAA（腺苷胞苷胞苷）/UAG（腺苷胞苷胞苷）/UGA（腺苷胞苷胞苷）：表示终止密码子（Stop Codon）DNA密码子和氨基酸之间的对应关系是基因组编码的基础。
氨基酸密码子表
第一个核苷酸5′UU苯丙氨酸亮氨酸C亮氨酸亮氨酸A异亮氨酸异亮氨酸蛋氨酸G缬氨酸缬氨酸C第二个核苷酸A酪氨酸终止密码子组氨酸谷氨酰胺天冬酰胺赖氨酸天冬氨酸谷氨酸G半胱氨酸终止密码子色氨酸精氨酸精氨酸丝氨酸精氨酸甘氨酸甘氨酸第三个核苷酸3′UCAGUCAG丝氨酸丝氨酸脯氨酸脯氨酸苏氨酸苏氨酸丙氨酸丙氨酸体内20种氨基酸按理化性质可分为4组：
①非极性、疏水性氨基酸：
甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸。
②极性、中性氨基酸：
色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和苏氨酸。
③酸性的氨基酸：
天冬氨酸和谷氨酸。
④碱性氨基酸：
赖氨酸、精氨酸和组氨酸。
中文名称甘氨酸丙氨酸缬氨酸亮氨酸异亮氨酸脯氨酸苯丙氨酸酪氨酸色氨酸丝氨酸英文名称GlycineAlanineValineLeucineIsoleucineProlinePhenylanineTyrosineTryptophanSerine 三字母缩写GlyAlaValLeuIleProPheTyrTrpSer单字母符号GAVLIPFYWS苏氨酸半胱氨酸蛋氨酸天冬酰胺谷氨酰胺天冬氨酸谷氨酸赖氨酸精氨酸组氨酸ThreonineCystineMethionineAsparagineGlutarnineAsparticacidGlutamicacidLysineAr gineHistidineThrCysMetAsnGlnAspGluLysArgHisTCMNQDEKRH
1/ 1。
氨基酸与密码子表_氨基酸属性对照表(Excel版可排序查找)
U C A F S Y F S Y L S *L S *L P H L P H L P Q L P Q I T N I T N I T K M T K V A D V A D V A E VA E英文名称三字母单字母分子式MWPI 中文名称极性化学结构Alanine ALA AC 3H 7NO 2896丙氨酸非极性 脂肪族Cysteine CYS CC 3H 7NO 2S ## 5.02半胱氨酸极性不带电 脂肪族Aspartic Acid ASP DC 4H 7NO 4## 2.77天冬氨酸极性带负电 脂肪族Glutamic Acid GLU EC 5H 9NO 4## 3.22谷氨酸极性带负电 脂肪族Phenylalanin e PHE FC 9H 11NO 2## 5.48苯丙氨酸非极性 芳香族Glycine GLY GC 2H 5NO 275 5.97甘氨酸极性不带电 脂肪族Histidine HIS HC 6H 9N 3O 2##7.47组氨酸极性带正电 杂环族Isoleucine ILE IC 6H 13NO 2## 5.94异亮氨酸非极性 脂肪族Lysine LYS KC 6H 14N 2O 2##9.59赖氨酸极性带正电 脂肪族Leucine LEU LC 6H 13NO 2## 5.98亮氨酸非极性 脂肪族Methionine MET MC 5H 11NO 2S ## 5.74甲硫氨酸非极性脂肪族Asparagine ASN NC 4H 8N 2O 3## 5.41天冬酰胺极性不带电 脂肪族Proline PRO PC 5H 9NO 2## 6.3脯氨酸非极性杂环亚氨基酸Glutamine GLN QC 5H 10N 2O 3## 5.65谷氨酰胺极性不带电 脂肪族Arginine ARG RC 6H 14N 4O 2##11.15精氨酸极性带正电 脂肪族Serine SER SC 3H 7NO 3## 5.68丝氨酸极性不带电 脂肪族Threonine THR TC 4H 9NO 3## 5.64苏氨酸极性不带电 脂肪族Valine VAL VC 5H 11NO 2## 5.96缬氨酸非极性 脂肪族Tryptophan TRP WC 11H 12N 2O 2## 5.89色氨酸非极性 杂环族TyrosineTYRYC 9H 11NO 3##5.66酪氨酸极性不带电 芳香族排序列氨基酸与密码子表密码子简并性表第三个字母第一个字母UCAG颜色标注用于辅助查看密码子简并性,未标颜色的简并性密码子位置比较集中。
氨基酸密码子对照表
丙氨酸Alanine A 或 Ala CH 3 - 脂肪族类精氨酸Arginine R 或 Arg HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3-碱性氨基酸类天冬酰胺Asparagine N 或 Asn H 2 N-CO-CH 2 - 酰胺类天冬氨酸AsparticacidD 或 Asp HOOC-CH 2 -酸性氨基酸类半胱氨酸Cysteine C 或 Cys HS-CH 2 - 含硫类谷氨酰胺Glutamine Q 或 Gln H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 - 酰胺类谷氨酸GlutamicacidE 或 Glu HOOC-(CH 2 ) 2 -酸性氨基酸类甘氨酸Glycine G 或 Gly H- 脂肪族类组氨酸Histidine H 或 His N=CH-NH-CH=C-CH 2 -|__________|碱性氨基酸类异亮氨酸Isoleucine I 或 Ile CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )- 脂肪族类亮氨酸Leucine L 或 Leu (CH 3 ) 2 -CH-CH 2 - 脂肪族类赖氨酸Lysine K 或 Lys H 2 N-(CH 2 ) 4 - 碱性氨基酸类蛋氨酸Methionine M 或 Met CH 3 -S-(CH 2 ) 2 - 含硫类苯丙氨酸PhenylalanineF 或 Phe Phenyl-CH 2 - 芳香族类脯氨酸Proline P 或 Pro -N-(CH 2 ) 3 -CH-|_________|亚氨基酸丝氨酸Serine S 或 Ser HO-CH 2 - 羟基类苏氨酸Threonine T 或 Thr CH 3 -CH(OH)- 羟基类色氨酸Tryptophan W 或 Trp Phenyl-NH-CH=C-CH 2 -|___________|芳香族类酪氨酸Tyrosine Y 或 Tyr 4-OH-Phenyl-CH 2 - 芳香族类缬氨酸Valine V 或 Val CH 3 -CH(CH 2 )- 脂肪族类。
氨基酸的密码子表,名称及缩写
精氨酸
Arginine
R或Arg
174.188
HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 -
碱性氨基酸类
天冬酰胺
Asparagine
N或Asn
132.104
H 2 N-CO-CH 2 -
酰胺类
天冬氨酸
Aspartic acid
D或Asp
133.089
HOOC-CH 2 -
酸性氨基酸类
半胱氨酸
P或Pro
115.117
-N-(CH 2 ) 3 -CH-
|_________|
亚氨基酸
丝氨酸
Serine
S或Ser
105.078
HO-CH 2 -
羟基类
苏氨酸
Threonine
T或Thr
119.105
CH 3 -CH(OH)-
羟基类
色氨酸
Tryptophan
W或Trp
204.213
Phenyl-NH121.145
HS-CH 2 -
含硫类
谷氨酰胺
Glutamine
Q或Gln
146.131
H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 -
酰胺类
谷氨酸
Glutamic acid
E或Glu
147.116
HOOC-(CH 2 ) 2 -
酸性氨基酸类
甘氨酸
Glycine
G或Gly
75.052
H-
脂肪族类
组氨酸
Histidine
H或His
155.141
N=CH-NH-CH=C-CH 2 -
|__________|
碱性氨基酸类
起始密码子对应的氨基酸
起始密码子对应的氨基酸起始密码子是遗传学中非常重要的一部分，它们在蛋白质合成过程中起着关键作用。
在细胞中，RNA被读取以产生氨基酸序列，其中起始密码子是最初的一组遗传代码，用于启动蛋白质的合成。
本文将详细介绍起始密码子及其对应的氨基酸。
一、什么是起始密码子？起始密码子是信使RNA（mRNA）上的三个碱基，被称为AUG、GUG 或UGG。
这些起始密码子用于引导蛋白质合成过程中的起始点。
在蛋白质合成过程中，mRNA通过核糖体被读取并被翻译成氨基酸序列，形成所需的蛋白质。
1. 甲硫氨酸（Met）：甲硫氨酸是起始密码子AUG对应的氨基酸。
它在蛋白质合成过程中作为起始点，启动肽链的合成。
AUG通常在信使RNA上位于蛋白质的N端，但有些情况下也可能在其他位置出现。
2. 缬氨酸（Val）：起始密码子GUG对应的氨基酸是缬氨酸。
虽然缬氨酸在生物体内也广泛存在，但需要注意的是，不同的生物可能对GUG的选择有所不同，因此在遗传学研究中需要谨慎使用。
3. 异亮氨酸（Ile）：起始密码子UGG对应的氨基酸是异亮氨酸。
它在自然界中是最常见的起始密码子之一，常被翻译为异亮氨酸。
除了上述三种常见的起始密码子对应的氨基酸外，还存在其他一些特殊的起始密码子和相应的氨基酸。
例如，GUG启动的RNA可以被翻译为苯丙氨酸（Phe），而UUU和UCU启动的RNA可以被翻译为脯氨酸（Pro）。
这些特殊情况需要在实际应用中加以注意。
三、如何识别起始密码子？起始密码子的识别通常通过使用DNA测序、逆转录酶和限制性酶切等方法进行。
在某些情况下，通过蛋白质组学技术，如质谱分析，也可以检测到起始密码子的存在和选择。
需要注意的是，在使用这些方法时，必须遵循实验室安全和伦理标准，并确保数据的准确性和可靠性。
四、总结起始密码子是遗传学中非常重要的一部分，它们在蛋白质合成过程中起着关键作用。
本文详细介绍了起始密码子及其对应的氨基酸，包括常见的甲硫氨酸、缬氨酸和异亮氨酸，以及一些特殊的起始密码子和相应的氨基酸。
氨基酸密码子对照表和点突变引物设计
氨基酸密码子对照表和点突变引物设计Alanine 89.079 CH 3 - 丙氨酸 A 或 Ala 脂肪族类碱性氨基酸HN=C(NH 2 )-NH-(CH 2 ) 3 精氨酸 Arginine R 或 Arg 174.188 - 类 Asparagine 132.104 H 2 N-CO-CH 2 - 天冬酰胺 N 或 Asn 酰胺类酸性氨基酸Aspartic acid 133.089 HOOC-CH 2 - 天冬氨酸 D 或 Asp 类Cysteine 121.145 HS-CH 2 - 半胱氨酸 C 或 Cys 含硫类 Glutamine 146.131 H 2 N-CO-(CH 2 ) 2 - 谷氨酰胺 Q 或 Gln 酰胺类酸性氨基酸谷氨酸 Glutamic acid E 或 Glu 147.116 HOOC-(CH 2 ) 2 - 类Glycine 75.052 H- 甘氨酸 G 或 Gly 脂肪族类碱性氨基酸N=CH-NH-CH=C-CH 2 - Histidine 155.141 组氨酸 H 或 His|__________| 类 Isoleucine 131.160 CH 3 -CH 2 -CH(CH 3 )- 异亮氨酸 I 或Ile 脂肪族类 Leucine 131.160 (CH 3 ) 2 -CH-CH 2 - 亮氨酸 L 或 Leu 脂肪族类碱性氨基酸赖氨酸 Lysine K 或 Lys 146.17 H 2 N-(CH 2 ) 4 - 类Methionine 149.199 CH 3 -S-(CH 2 ) 2 - 蛋氨酸 M 或 Met 含硫类Phenylalanine 165.177 Phenyl-CH 2 - 苯丙氨酸 F 或 Phe 芳香族类-N-(CH 2 ) 3 -CH- 脯氨酸 Proline P 或 Pro 115.117 亚氨基酸|_________|丝氨酸 Serine S 或 Ser 105.078 HO-CH 2 - 羟基类 Threonine 119.105 CH 3 -CH(OH)- 苏氨酸 T 或 Thr 羟基类Phenyl-NH-CH=C-CH 2 - Tryptophan 204.213 色氨酸 W 或 Trp 芳香族类|___________|Tyrosine 181.176 4-OH-Phenyl-CH 2 - 酪氨酸 Y 或 Tyr 芳香族类 Valine 117.133 CH 3 -CH(CH 2 )- 缬氨酸 V 或 Val 脂肪族类TorR PRMPHHIVIVEDEPVTQARLQSYFTQEGYTVSVTASGAGLREIMQNQSVDLILLDINLPDENGLMLTRALRERSTVGIILVTGRSDRIDRIVGLEMGADDYVTKPLELRELVVRVKNLLWRIDLARQAQPHTQDNCYRFAGYCLNVSRHTLERDGEPIKLTRAEYEMLVAFVTNPGEILSRERLLRMLSARRVENPDLRTVDVLIRRLRHKLSADLLVTQHGEGYFLAADVCTorR 核酸1 ATG CCA CAT CAC ATT GTT ATT GTT GAA GAT31 GAG CCG GTT ACC CAG GCG CGA TTA CAA TCC 61 TAC TTC ACT CAG GAG GGG TAT ACC GTT TCC 91 GTT ACG GCG AGC GGT GCT GGG CTA CGG GAA 121 ATT ATG CAG AAT CAG TCG GTA GAT TTA ATT 151 CTG CTG GAT ATC AAC TTA CCC GAT GAA AAT 181 GGC CTG ATG TTA ACC CGC GCC CTG CGA GAA 211 CGC TCA ACG GTG GGG ATT ATT CTG GTT ACC 241 GGA CGC AGC GAT CGG ATT GAC CGT ATT GTT 271 GGG CTG GAA ATG GGC GCA GAC GAT TAC GTC 301 ACC AAA CCG CTG GAA CTG CGC GAA CTG GTA 331 GTA CGG GTG AAA AAT CTG CTC TGG CGA ATC 361 GAC CTC GCG CGA CAA GCT CAA CCG CAC ACT 391 CAG GAC AAC TGC TAT CGC TTT GCC GGT TAT 421 TGC CTG AAT GTG TCG CGC CAT ACG CTG GAG 451 CGG GAT GGC GAG CCG ATT AAA CTG ACC CGC 481 GCA GAG TAT GAA ATG TTG GTG GCA TTT GTG 511 ACG AAT CCG GGC GAA ATT CTC AGC CGT GAA 541 CGT CTG CTA CGT ATG CTT TCT GCG CGT CGG 571 GTG GAA AAC CCT GAC CTG CGC ACC GTC GAT601 GTG TTA ATT CGT CGT TTA CGT CAT AAA CTC 631 AGC GCG GAT TTA CTG GTG ACG CAA CAT GGT 661 GAA GGT TAT TTC TTA GCC GCT GAT GTG TGC 691 TGA点突变后TORR1 ATG CCA CAT CAC ATT GTT ATT GTT GAA GAT31 GAG CCG GTT ACC CAG GCG CGA TTA CAA TCC 61 TAC TTC ACT CAG GAG GGG TAT ACC GTT TCC 91 GTT ACG GCG AGC GGT GCT GGG CTA CGG GAA 121 ATT ATG CAG AAT CAG TCG GTA GAT TTA ATT 151 CTG CTG CAT ATC AAC TTA CCC GAT GAA AAT 181 GGC CTG ATG TTA ACC CGC GCC CTG CGA GAA 211 CGC TCA ACG GTG GGG ATT ATT CTG GTT ACC 241 GGA CGC AGC GAT CGG ATT GAC CGT ATT GTT 271 GGG CTG GAA ATG GGC GCA GAC GAT TAC GTC 301 ACC AAA CCG CTG GAA CTG CGC GAA CTG GTA 331 GTA CGG GTG AAA AAT CTG CTC TGG CAA ATC 361 GAC CTC GCG CGA CAA GCT CAA CCG CAC ACT 391 CAG GAC AAC TGC TAT CGC TTT GCC GGT TAT 421 TGC CTG AAT GTG TCG CGC CAT ACG CTG GAG 451 CGG GAT GGC GAG CCG ATT AAA CTG ACC CGC 481 GCA GAG TAT GAA ATG TTG GTG GCA TTT GTG 511 ACG AAT CCG GGC GAA ATT CTC AGC CGT GAA 541 CGT CTG CTA CGT ATG CTT TCT GCG CGT CGG 571 GTG GAA AAC CCT GAC CTG CGC ACC GTC GAT 601 GAG TTA ATT CGT CGT TTA CGT CAT AAA CTC 631 AGC GCG GAT TTA CTG GTG ACG CAA CAT GGT 661 GAA GGT TAT TTC TTA GCC GCT GAT GTG TGC 691 TGA突变ASP53-ARG1191 ATG CCA CAT CAC ATT GTT ATT GTT GAA GAT31 GAG CCG GTT ACC CAG GCG CGA TTA CAA TCC 61 TAC TTC ACT CAG GAG GGG TAT ACC GTT TCC 91 GTT ACG GCG AGC GGT GCT GGG CTA CGG GAA 重叠区延伸区 F: 5` CG GTA GAT TTA ATT CTG121 ATT ATG CAG AAT CAG TCG GTA GAT TTA ATT CTG CAT ATC AAC T 3` 延伸重区 R: 5` G CAG CAG AAT TAA ATC 151 CTG CTG CAT ATC AAC TTA CCC GAT GAA AAT 叠TAC CGA CTG ATT CTG 3` 区 F 30bp 58? 37% 181 GGC CTG ATG TTA ACC CGC GCC CTG CGA GAAR 31 bp 60? 42%211 CGC TCA ACG GTG GGG ATT ATT CTG GTT ACC241 GGA CGC AGC GAT CGG ATT GAC CGT ATT GTT 271 GGG CTG GAA ATG GGC GCA GAC GAT TAC GTC301 ACC AAA CCG CTG GAA CTG CGC GAA CTG GTA重叠区延伸区331 GTA CGG GTG AAA AAT CTG CTC TGG CAA ATC F: 5` GTG AAA AAT CTG CTC TGG 延伸361 GAC CTC GCG CGA CAA GCT CAA CCG CAC ACT CAA ATC GAC CTC 3` 区R: 5`TG CCA GAG CAG ATT TTT 391 CAG GAC AAC TGC TAT CGC TTT GCC GGT TATCAC CCG TAC TAC C 3`F 30 62? 47% 421 TGC CTG AAT GTG TCG CGC CAT ACG CTG GAG R 30 63? 50% 451 CGG GAT GGC GAG CCG ATT AAA CTG ACC CGC 481 GCA GAG TAT GAA ATG TTG GTG GCA TTT GTG 511 ACG AAT CCG GGC GAA ATT CTC AGC CGT GAA 541 CGT CTG CTA CGT ATG CTT TCT GCG CGT CGG 571 GTG GAA AAC CCT GAC CTG CGC ACC GTC GAT 601 GAG TTA ATT CGT CGT TTA CGT CAT AAA CTC 631 AGC GCG GAT TTA CTG GTG ACG CAA CAT GGT 661 GAA GGT TAT TTC TTA GCC GCT GAT GTG TGC 691 TGA总结:ASP53F: 5` CG GTA GAT TTA ATT CTG CTG CAT ATC AAC T 3`3` GTC TTA GTC A GC CAT CTA AAT TAA GAC GAC G 5`ARG119F: 5` GTG AAA AAT CTG CTC TGG CAA ATC GAC CTC 3`3` C CAT CAT GCC CAC TTT TTA GAC GAG ACC GT5`F: 5` CG GTA GAT TTA ATT CTG F: 5` GTG AAA AAT CTG CTC TGGCTG CAT ATC AAC T 3` AA ATC GAC CTC 3` CR: 5`TG CCA GAG CAG ATT TTT R: 5` G CAG CAG AAT TAA ATCTAC CGA CTG ATT CTG 3` CAC CCG TAC TAC C 3`F 30bp 58? 37% F 30 62? 47%R 31 bp 60? 42% R 30 63? 50%ASP53-P1 CGGTAGATTTAATTCTGCTGCATATCAACT ASP53-P2 GCAGCAGAATTAAATCTACCGACTGATTCTG ARG119-P1 GTGAAAAATCTGCTCTGGCAAATCGACCTC ARG119-P2 TGCCAGAGCAGATTTTTCACCCGTACTACC ASP53-P1 CggTAgATTTAATTCTgCTgCATATCAACTASP53-P2 gCAgCAgAATTAAATCTACCgACTgATTCTgARG119-P1 gTgAAAAATCTgCTCTggCAAATCgACCTCARG119-P2 TgCCAgAgCAgATTTTTCACCCgTACTACC。
密码子与氨基酸的对应关系
密码子与氨基酸的对应关系密码子与氨基酸的对应关系描述•密码子与氨基酸是生物体进行蛋白质合成过程中的关键元素。
•密码子是DNA或RNA上的一段三个碱基，用以编码特定的氨基酸。
•氨基酸则是构成蛋白质的基本单位。
对应关系•在生物体的基因组中，每个密码子编码一个特定的氨基酸。
•有61个不同的密码子，可编码的氨基酸种类为20个。
这意味着多个密码子可能对应同一个氨基酸。
样例对应关系：•密码子 AUG 对应氨基酸转肽酶（Methionine）。
•密码子 UAA, UAG, 和 UGA 不对应任何氨基酸，它们作为终止密码子用于终止蛋白质合成过程。
解释说明•DNA上的密码子在转录为mRNA时，通过一种叫做转录的过程将信息复制到mRNA中，形成mRNA的密码子序列。
•mRMA上的密码子序列将在蛋白质合成过程中被“翻译”为对应的氨基酸序列。
•这种对应关系的准确性是蛋白质合成过程的基础，也是生物体正常功能的关键因素之一。
总结•密码子与氨基酸的对应关系是生物体进行蛋白质合成的基础。
•在基因组中，每个密码子编码一个特定的氨基酸。
•这种对应关系的准确性和稳定性在生物体的正常功能中起着重要作用。
影响因素•除了基本的密码子与氨基酸的对应关系外，还有一些额外的因素可能影响这种对应关系。
基因组差异•不同生物体的基因组之间可能存在差异，导致不同的密码子与氨基酸对应关系。
•在不同物种中，同一个密码子可能对应不同的氨基酸。
突变•突变是产生不同密码子与氨基酸对应关系的重要原因之一。
•在基因组中，DNA序列可能发生突变，导致密码子的改变，从而改变对应的氨基酸。
编码表修订•由于对密码子与氨基酸对应关系的深入研究，编码表可能会随着时间不断修订。
•在修订编码表时，可能会发现新的密码子与氨基酸对应关系，或者修正原有的对应关系。
应用和意义•对密码子与氨基酸的对应关系的深入研究有助于理解蛋白质合成过程的机制和调控。
•这种对应关系也是基因工程和生物技术中的重要基础，例如基因克隆和转基因技术。
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氨基酸及其密码子对照
Alanine Ala A GCU, GCC, GCA, GCG
Arginine Arg R CGU, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG
AAC Asparagine Asn N AAU,
Aspartic acid Asp D GAU, GAC
UGC Cysteine Cys
C UGU,
CAG
Q CAA, Glutamine Gln
Glutamic acid Glu E GAA, GAG
Glycine Gly G GGU, GGC, GGA, GGG
H CAU,
CAC Histidine His
AUA
AUC, Isoleucine Ile I AUU,
CUU, CUC, CUA, CUG
UUG,
L UUA,
Leucine Leu
AAG Lysine Lys
K AAA, Methionine Met M AUG
Phenylalanine Phe F UUU,
UUC Proline Pro P CCU, CCC, CCA, CCG
Serine Ser S UCU, UCC, UCA, UCG, AGU,AGC Threonine Thr T ACU, ACC, ACA, ACG
Tryptophan Trp W UGG
UAC Tyrosine Tyr
Y UAU, Valine Val V GUU, GUC, GUA, GUG
* Start AUG
Stop UAG (amber), UGA (opal), UAA (ochre)
AUG is the most common start codon. Alternative start codons include CUG in eukaryotes and GUG in prokaryotes.
常用限制性酶及其酶切位点
AatII GACGT C KpnI GGTAC C AflII C TTAAG NarI GG CGCC AgeI A CCGGT NcoI C CATGG ApaI GGGCC C NdeI CA TATG ApaLI G TGCAC NheI G CTAGC AseI AT TAAT NotI GC GGCCGC BamHI G GATCC NruI TCG CGA BclI T GATCA PmlI CAC GTG BglII A GATCT PstI CTGCA G BstBI TT CGAA PvuII CAG CTG ClaI AT CGAT SacI GAGCT C DraI TTT AAA SacII CCGCG G EagI C GGCCG SalI G TCGAC EcoRI G AATTC SmaI CCC GGG EcoRV GAT ATC SpeI A CTAGT FspI TGC GCA StuI AGG CCT HindIII A AGCTT XbaI T CTAGA HpaI GTT AAC XhoI C TCGAG。