聚合酶链反应原理及应用
QPCR原理及应用
QPCR原理及应用QPCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)即定量聚合酶链式反应,是一种可以对DNA进行定量检测的分子生物学技术。
通过测定DNA模版的初始数量,能够准确地对靶DNA在样品中的量进行定量分析。
QPCR技术已经广泛应用于医学、农业、环境科学等众多领域,并且在疾病诊断、基因表达研究、生物安全监测等方面具有重要意义。
QPCR的原理:QPCR主要基于DNA聚合酶链式反应(PCR)的原理。
PCR技术通过DNA聚合酶,利用DNA引物和酶切的DNA模板来扩增特定DNA序列。
在PCR的每一个循环中,DNA模板会被酶切成两段,然后引物结合到目标DNA上并扩增。
然后,扩增的DNA产物作为下一个PCR循环的模板,以此循环反复扩增。
在QPCR中,扩增的DNA产物通过酶的同步检测来实时监测。
QPCR使用一种荧光探针,在引物结合区域的扩增过程中释放出荧光信号。
荧光信号的强度与扩增DNA的数量呈正比。
通过检测荧光信号的强度,可以确定DNA的初始数量。
QPCR的应用:1.疾病诊断:QPCR可以快速、准确地检测疾病相关基因的表达水平,从而帮助进行疾病的早期诊断和病情监测。
比如,QPCR可以检测癌症相关基因的表达水平,辅助肿瘤的早期诊断和治疗。
2.基因表达研究:QPCR能够定量检测基因的表达水平,从而帮助研究基因在细胞和组织中的功能调控机制。
比如,研究在药物处理、细胞因子刺激等条件下,特定基因的表达水平的变化。
3.遗传病筛查:QPCR可以对遗传病相关基因进行定量检测,从而帮助进行遗传病的筛查。
通过检测特定基因的突变和表达水平,可以早期发现遗传病,并进行相应的干预和治疗。
4.放射性污染监测:QPCR可以快速、敏感地检测放射性物质污染的程度和范围。
比如,监测环境中的放射性同位素污染,以保护公众健康。
5.植物基因改良:QPCR可以帮助筛选目标基因在转基因植物中的表达水平。
通过检测基因的表达水平,可以确定转基因植物是否具有目标特性,从而加速植物基因改良的进程。
pcr技术原理及步骤
pcr技术原理及步骤
PCR(聚合酶链式反应)是一种生物学技术,用于在体外大量复制特定的DNA片段。
它在分子生物学和遗传学的研究中得到了广泛应用。
PCR技术的原理是通过逐渐加热和降温的循环反应,使DNA序列在体外被精确地复制。
PCR的步骤主要包括:变性、退火和延伸。
1. 变性:首先将DNA模板加热至95°C,这样会使DNA双链解开,变为两条单链DNA。
2. 退火:将温度降至50-65°C,加入DNA引物(引物是特异性序列,与待扩增的DNA序列互补)。
在适当的温度下,引物会与单链DNA的两端结合形成引物-模板复合物。
3. 延伸:将温度升至72°C,加入热稳定的DNA聚合酶。
在此温度下,DNA聚合酶会沿着引物-模板复合物的DNA链合成新的DNA链。
这样,一个PCR循环完成后,原有的DNA分子被扩增成两个分子。
然后,将温度逐渐循环升高和降低,重复数十次甚至数百次,可以快速产生大量目标DNA。
PCR技术的应用非常广泛,例如在基因工程中用于克隆和表达目的基因、医学诊断中检测特定基因、法医学中的DNA鉴定等。
其原理和步骤的灵活性和高效性使其成为现代生物学的重要工具。
PCR技术原理、实验步骤和应用
一、实验目的1.掌握聚合酶链式反应的原理。
2. 掌握移液枪和PCR仪的基本操作技术。
二、实验原理PCR技术,即聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)是由美国PE Cetus公司的Kary Mullis在1983年(1993年获诺贝尔化学奖)建立的。
这项技术可在试管内的经数小时反应就将特定的DNA 片段扩增数百万倍,这种迅速获取大量单一核酸片段的技术在分子生物学研究中具有举足轻重的意义,极大地推动了生命科学的研究进展。
它不仅是DNA分析最常用的技术,而且在DNA重组与表达、基因结构分析和功能检测中具有重要的应用价值。
PCR可以被认为是与发生在细胞内的DNA复制过程相似的技术,其结果都是以原来的DNA为模板产生新的互补DNA片段。
细胞中DNA的复制是一个非常复杂的过程。
参与复制的有多种因素。
PCR 是在试管中进行的DNA复制反应,基本原理与细胞内DNA复制相似,但反应体系相对较简单。
PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至94℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应做准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在Taq酶的作用下,以dNTP 为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链。
重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。
每完成一个循环需2~4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
三、实验试剂与器材模板DNA、2.5mmol/L dNTPTaq DNA聚合酶(5U/μL)、SSR引物10 ×buffer、15mmol/L Mg2+、ddH2OPCR仪、移液枪、PCR板四、实验步骤1、配制20μL反应体系,在PCR板中依次加入下列溶液:模板DNA 2μL引物1 1μL引物2 1μLdNTP 1.5μLMgCl2 2μL10×buffer 2μLddH2O 10μLTaq酶0.5μL2、设置PCR反应程序。
聚合酶链式反应(PCR)
操作: 5份标本
Taq 酶 (5U/μl): 0.2μl × 6 = 1.2μl 水: 共174μl,先用移液器 / 指弹混匀,后用离心机瞬时 混匀(管壁上液体沉至管底)。
2. 另取 5 支0.2ml Ep管,分别加入上述液体29μl。
3. 分别取标本模板各1μl,加入上述5支 Ep 管中,混 匀,分别加入2滴液体石蜡(防止加温过程中液体蒸 发影响反应体积),离心机瞬时离心,备用。
⑶ 延伸温度和时间:
一般位于Taq酶最适作用温度70 ~ 75 ℃之间。 引物小于16个核苷酸时,过高的延伸温度不利于引 物与模板的结合,可以缓慢升温到70 ~ 75 ℃。 延伸反应时间,可根据待扩增片段的长度而定, < 1Kb,1分钟足够;> 1Kb需加长延伸时间,10Kb 片段延伸时间可达15分钟。
0.2×30 / 10 = 0.6μl 0.4×30×2 / 10 = 2.4μl 1μl 30-3-1.8-0.6-2.4-0.2-1=21μl
Taq 酶(5U/μl):1 / 5 = 0.2μl 模板: 水:
总体积 30μl ×6 = 180μl 1. 取一 0.5 ml Ep 管,依次加入下列试剂: 10×buffer: 3μl ×6 = 18μl MgCl2: 1.8μl×6 = 10.8μl dNTPs: 引物 P: 0.6μl×6 = 3.6μl 2.4μl ×6 = 14.4μl 21μl × 6 = 126μl
扩增的特异性取决于引物与模板DNA的特异 结合,基本反应步骤分三步: 1. 变性 (Denaturation): 加热使模板DNA双链间的氢键断裂而形成两 条单链。94℃ 30″
2. 退火 (复性) (Annealling):
突然降温后模板DNA与引物按碱基配对原则 互补结合,也存在两条模板链之间的结合,但由 于引物的高浓度,结构简单的特点,主要的结合 发生在模板与引物之间。55 ℃ 30 ″
PCR定量方法概述
PCR定量方法概述PCR(聚合酶链式反应)是一种广泛应用于分子生物学研究中的技术,可通过扩增特定DNA片段数量来进行定量分析。
PCR定量方法的发展使得我们能够更加准确、快速地测量和定量目标DNA序列或基因表达水平。
本文将概述PCR定量方法的原理、步骤和应用。
一、PCR定量方法的原理PCR定量方法是基于PCR技术的扩增效率与起始模板浓度成正比的原理。
在PCR反应中,模板DNA以指数级倍增,而每个PCR周期后,扩增效率会逐渐降低。
通过确定PCR周期数和目标序列浓度之间的关系,可以利用定标曲线或计算方法来定量目标DNA的起始浓度。
二、PCR定量方法的步骤1. DNA提取:从样本(如细胞、组织或血液)中提取DNA,并纯化得到高质量的模板DNA。
2. 靶序列选择:根据需要定量的目标序列,设计引物和探针,保证其特异性和高效性。
3. PCR反应设置:根据目标序列的长度和特性,确定PCR反应体系中的引物和探针的浓度,优化反应条件(如温度和时间)。
4. 制备标准曲线:通过系列稀释的已知浓度的标准品,构建定标曲线,用于后续定量计算。
5. PCR扩增:将模板DNA与引物和探针加入PCR反应体系中,进行一系列PCR循环,扩增目标序列。
6. 实时监测:利用实时荧光PCR仪或其他检测方法,监测PCR反应过程中探针的荧光信号强度。
7. 数据分析:根据定标曲线和荧光信号强度,计算出目标DNA的起始浓度。
三、PCR定量方法的应用1. 基因表达分析:通过比较不同样品中目标基因的表达水平,研究基因在生理和病理过程中的变化。
2. 病原体检测:定量PCR可用于检测和定量病原体DNA,用于快速诊断与预后评估。
3. 肿瘤检测:通过定量PCR检测肿瘤标志物,提供肿瘤早期诊断和治疗效果监测。
4. 遗传病筛查:利用PCR定量方法可以检测和定量与遗传病相关的突变或多态性位点。
5. GMO检测:定量PCR可用于识别和量化转基因生物的成分和含量。
6. 受精能力评估:通过检测精子和卵子中特定基因的数量,评估生殖健康和受精能力。
聚合酶链反应技术在临床诊断中的应用
聚合酶链反应技术在临床诊断中的应用简介聚合酶链反应技术(polymerase chain reaction,PCR)是一种用于复制DNA序列的技术,可以在短时间内扩增少量的DNA样品,被广泛应用于临床诊断、基因工程等领域。
PCR技术的原理基于DNA的复制能力,采用DNA聚合酶酶解、引物扩增、芯片分析等技术,可以快速诊断出各种疾病。
本篇文章将介绍PCR技术在临床诊断中的应用,以及其优缺点。
PCR技术在临床诊断中的应用PCR技术可以用于快速检测许多疾病的标记物,如肿瘤标记物、传染病标记物等。
在临床上,PCR技术被广泛应用于快速准确诊断疾病、分子诊断和治疗流程中。
1. 传染病检测PCR技术在传染病检测中可以提高检测速度、灵敏度和特异性。
通过PCR技术检测病菌DNA或RNA,可以在病人感染后的短时间内,准确检测出病原体,如肺结核、流感、病毒性肝炎等传染病。
与传统的检测方法相比,PCR技术的检测结果更加可靠,能够避免虚假阳性或阴性的影响,提高了诊断准确性。
2.遗传病检测PCR技术在遗传病检测中可以通过扩增特定基因区段的方法,检测患者是否携带有致病基因突变,包括:遗传性失听症、囊性纤维化、肌萎缩性脊髓侧索硬化症等多种遗传病。
PCR技术使得医生可以在患者出现症状前就进行诊断,为早期预防和治疗提供了更加可靠的科学依据。
3. 肿瘤检测PCR技术在肿瘤检测中可以检测出特定肿瘤相关基因和基因突变,如白血病、乳腺癌、早期子宫内膜癌和黑色素瘤等。
与传统的检测方式相比,PCR技术可以在较短时间内完成诊断,并对肿瘤的类型和治疗方案进行评估,有利于肿瘤治疗的个体化。
PCR技术的优缺点1. 优点(1)快速:PCR技术只需要数小时就可以得到具有高灵敏性和特异性的评估结果。
(2)灵敏:PCR技术可以扩增极小量的DNA,并能够检测数量几乎无限制的目标基因组。
(3)特异性:PCR技术利用引物定向扩增目标DNA,可以避免与非目标的DNA序列结合而误诊的风险。
聚合酶链反应及其应用课件
DNA聚合酶的保真性能(主要因素) DNA链的物理损伤 PCR反应体系的洁净度
•聚合酶链反应及其应用
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DNA聚合酶对PCR精确性的重要影响
DNA聚合酶的保真性主要取决于其3’→5’的核酸外切酶活性,它 负责对错误掺入的碱基进行校正。相关研究结果表明,DNA聚合酶的 出错率在每轮延伸每核苷酸1.6 X 10–6 - 2.1 X 10–4范围内。DNA聚合 酶的碱基掺入错误可能发生在其延伸阶段的五种活性:
模板浓度的变化很大程度上取决于待扩增的碱基序列,但一般
而言,模板DNA长度小,PCR扩增产物的量就大,因此对于大分子 量的模板DNA(尤其是真核生物基因组DNA),在扩增之前最好先 用超声波处理或限制性酶消化。
•聚合酶链反应及其应用
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4 PCR的引物设计及合成
PCR引物的设计原则 引物的在线设计工具及免费软件简介 PCR引物的使用
Taq DNA酶在使用时应注意:
避免稀释保存Taq DNA聚合酶
Taq DNA聚合酶在室温下也具有延伸引物的活性
•聚合酶链反应及其应用
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用于PCR的DNA聚合酶简介
KlenTaq DNA聚合酶(Thermus aquaticus)
KlenTaq DNA聚合酶是一种N端缺失了的Taq DNA聚合酶,因而 没有5’的核酸外切酶活性;
•聚合酶链反应及其应用
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粗样品中的PCR抑制剂
粪便 胆盐、胆红素(抑制浓度50mg / mL) 血液 亚铁血红素、聚乙醇磺酸钠、heparin(抗凝剂) 植物 硫酸右旋糖苷 土壤 腐殖物质、含铁化合物 食品 未鉴定的抑制剂 痰液 未鉴定的抑制剂
•聚合酶链反应及其应用
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PCR模板的使用
pcr应用于遗传病的原理
PCR应用于遗传病的原理1. 什么是PCR?PCR(聚合酶链式反应,Polymerase Chain Reaction)是一种常用的分子生物学技术,用于扩增DNA片段,从而能快速、高效地产生大量目标DNA序列。
2. PCR在遗传病研究中的应用PCR在遗传病研究中的应用相当广泛。
它可以用于诊断遗传病的检测、疾病的遗传风险评估、基因突变的筛查、克隆特定基因等。
3. PCR的原理PCR主要由以下三个步骤组成:变性、退火和延伸。
3.1 变性(Denaturation)PCR反应开始时,将待扩增的DNA样品加热至94-96°C的高温。
高温会使DNA的双链解开,变为两条单链。
3.2 退火(Annealing)在变性步骤之后,PCR反应体系会降温至50-65°C,使引物(primer)能够与待扩增DNA的两个末端部分互相结合。
引物是短的DNA片段,它们的序列与待扩增DNA的两端互补。
引物的结合会导致新的DNA链合成起点的形成。
3.3 延伸(Extension)在退火步骤之后,PCR反应体系会加入DNA聚合酶、四个脱氧核苷酸(dNTPs)和盐溶液。
此时,DNA聚合酶会沿着引物延伸,合成与待扩增DNA互补的新DNA链。
这一步骤的温度约为72°C。
经过这三个步骤的循环反复进行,就可以扩增出大量的目标DNA序列。
3.4 PCR扩增的关键因素PCR扩增的关键因素包括模板DNA浓度、引物浓度、延伸时间、退火温度等。
合理选择这些因素可以保证PCR反应的准确性和高效性。
4. PCR扩增与遗传病诊断PCR扩增技术在遗传病的诊断中起着重要作用。
以下是PCR在遗传病诊断中的应用:•突变筛查:PCR可以检测特定突变位点的存在与否,从而判断个体是否携带突变基因。
•基因拷贝数变异:PCR可以检测基因拷贝数变异,判断某些基因的拷贝数量是否正常。
例如,在某些遗传性疾病(如遗传性失聪)中,可以通过PCR检测特定基因的拷贝数变异。
amos聚合酶链式反应
amos聚合酶链式反应
Amos聚合酶链式反应(Amplification of Multiple Targets for Nucleic Acid Sequencing)是一种基于聚合酶链式反应(PCR)的方法,用于同时扩增多个靶标的核酸序列。
它可以在单个反应体系中同时扩增数十至数百个靶标序列,具有高度的多重并行性和高效性。
Amos聚合酶链式反应的原理与传统PCR类似,但是在反应过程中引入了多个引物对,每个引物对应一个靶标序列。
通过在PCR反应体系中添加多个引物对,可以同时扩增多个靶标序列。
Amos聚合酶链式反应的应用非常广泛,特别适用于高通量测序、基因组学研究、疾病诊断等领域。
它可以快速、准确地扩增多个靶标序列,可以有效地提高测序效率和准确性,同时节省时间和成本。
Amos聚合酶链式反应是一种高效的核酸扩增技术,可以同时扩增多个靶标序列,广泛应用于生物学研究和临床诊断中。
聚合酶链式反应原理和应用
聚合酶链式反应原理和应用
聚合酶链式反应原理是双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。
聚合酶链式反应技术应用广泛,在很多领域都有应用,如:
1.分子生物学和基因组学:用于扩增特定的DNA片段,对目的基因进行体外
扩增和克隆。
2.临床和诊断:用于检测和鉴定DNA序列,进行基因突变分析、基因分型
等。
3.生物技术和基因工程:用于构建转基因动物和植物,进行基因敲除、基因
沉默等。
4.分子进化:用于研究DNA序列的进化关系,分析物种之间的亲缘关系。
5.医学和临床:用于检测和鉴定遗传性疾病的基因序列,进行产前诊断和基
因治疗等。
聚合酶链反应的原理和过程
聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)的原理和过程1. 引言聚合酶链反应(PCR)是一种在分子生物学中广泛应用的技术,能够在体外迅速扩增特定DNA片段。
PCR的原理基于DNA的复制过程,通过重复进行一系列的温度变化和酶催化反应,使得DNA模板序列得以扩增。
PCR技术的发展极大地促进了基因组学、遗传学、医学诊断和犯罪学等领域的研究。
2. PCR的基本原理PCR技术借助于DNA聚合酶这个酶来实现DNA片段的扩增。
其基本原理可以概括为三个步骤:变性、退火和延伸。
2.1 变性首先,在高温条件下(通常为94-98摄氏度),将待扩增样品中的双链DNA解链成两条单链模板。
这一步被称为变性(Denaturation),其目的是打破氢键连接,使双链DNA分离成两条单链。
2.2 退火接下来,在较低温度(通常为50-65摄氏度),通过引入一组特异性的引物(即寡核苷酸引物,通常为20-30个碱基),使其与目标DNA序列的两端互补结合。
这一步被称为退火(Annealing),其目的是将引物定位在待扩增的DNA序列上。
2.3 延伸最后,在适宜温度下(通常为72摄氏度),加入DNA聚合酶和四种脱氧核苷酸(dNTPs),使其沿着引物向3’端延伸,合成新的DNA链。
这一步被称为延伸(Extension)或扩增,其目的是合成与模板DNA相对应的新链。
通过重复进行上述三个步骤,PCR技术可以在相对短的时间内从少量起始DNA扩增出大量特定片段的DNA。
3. PCR反应体系PCR反应体系由以下几个关键组分组成:3.1 DNA模板PCR反应需要待扩增的DNA片段作为模板。
模板可以是从细胞提取得到的基因组DNA、cDNA、质粒等。
3.2 引物PCR反应需要两条引物,分别位于待扩增序列的两端。
引物是由碱基组成的短链RNA或DNA分子,具有与待扩增序列互补的碱基序列。
引物的设计十分重要,需要确保其与待扩增序列的特异性结合,避免与其他非目标DNA结合。
rt-pcr的原理实验步骤及应用
RT-PCR的原理、实验步骤及应用1. 原理RT-PCR(逆转录聚合酶链式反应)是一种常用的分子生物学技术,它结合了逆转录和聚合酶链式反应的原理,用于检测和定量RNA的表达水平。
下面是RT-PCR的基本原理:•首先,通过逆转录作用,将RNA转录成相应的cDNA(互补DNA)。
逆转录酶会在反应中合成cDNA互补链,其中DNA聚合酶将dNTPs部分替换为对应的ddNTPs(荧光标记的核苷酸)用于标记合成的cDNA。
•然后,在PCR反应中使用特定的引物(primers)来扩增目标cDNA。
引物是两个短的DNA序列,它们能够与cDNA互补的序列部分结合,从而指导DNA聚合酶合成新的DNA链。
•最后,通过荧光检测仪读取PCR反应体系中的信号,从而定量检测目标RNA的表达水平。
2. 实验步骤RT-PCR实验通常包括以下步骤:2.1 样品准备•收集所需的细胞或组织样品,并保存在RNA保护液中以保护RNA的完整性。
•如果需要,使用RNA提取试剂盒从细胞或组织中提取RNA。
2.2 逆转录反应•准备RT-PCR反应体系,包括逆转录酶、随机引物、RNA样品和其他反应组分。
•混合反应液,然后进行逆转录反应。
此步骤通常在反应器中以特定温度下进行。
2.3 PCR反应•将逆转录反应产生的cDNA用作PCR反应的模板。
•准备PCR反应体系,包括DNA聚合酶、引物和其他反应组分。
•将PCR反应液混合均匀,然后进行PCR反应。
PCR反应通常包括一系列的循环,在每个循环中,温度会发生变化以使DNA链合成和扩增。
2.4 结果分析•将PCR反应体系中的产物用琼脂糖凝胶电泳进行分离。
•根据PCR反应产物大小,使用合适的染料将琼脂糖凝胶染色。
•使用紫外线透射仪观察琼脂糖凝胶中的DNA带,以便分析目标基因的扩增效果。
3. 应用RT-PCR广泛应用于分子生物学和医学领域,具有以下应用方面:•基因表达分析:通过测量RNA的表达水平,可以了解目标基因在不同样品中的表达情况,从而研究基因调控、识别潜在的生物标记物等。
聚合酶链式反应
反应的控制
变性温度和时间 95℃,30s 退火温度和时间低于引物Tm值5 ℃左右,一般在45~55℃ 延伸温度和时间 72℃,1min/kb(10kb内) Tm值=4(G+C) +2(A+T) 循环次数 :一般为25 ~ 30次。循环数决定PCR扩增的产量。模板初始浓度低,可增加循环数以便达到有 效的扩增量。但循环数并不是可以无限增加的。一般循环数为30个左右,循环数超过30个以后,DNA聚合酶活性 逐渐达到饱和,产物的量不再随循环数的增加而增加,出现了所谓的“平台期”。
引物退火
退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后 在此次实验基础上做出预估。退火温度对PCR的特异性有较大影响。
Hale Waihona Puke 物延伸引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时 间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。
PCR原理
PCR原理
DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚 合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性 解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合 酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。
但是,DNA聚合酶在高温时会失活,因此,每次循环都得加入新的DNA聚合酶,不仅操作烦琐,而且价格昂 贵,制约了PCR技术的应用和发展。
耐热DNA聚合酶-Taq酶的发现对于PCR的应用有里程碑的意义,该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活,不 需要每个循环加酶,使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本,PCR技术得以大量应用,并逐步应用于临 床。
聚合酶链式反应
聚合酶链式反应简介聚合酶链式反应(PCR)是一种重要的分子生物学技术,被广泛应用于基因分析、基因工程、医学诊断等领域。
PCR 能够快速、高效地扩增特定DNA片段,使得原本数量有限的DNA样本得以增加,从而便于进行后续实验。
PCR的核心原理是利用DNA聚合酶酶活性,通过不断重复三个步骤(变性、退火、延伸),在适宜的反应条件下,将目标DNA序列扩增至数百万份的数量。
依靠PCR技术,无需使用传统的细菌培养方法,仅需少量DNA样本和简单的实验设备,即可实现高效扩增目标DNA。
PCR反应步骤反应体系构建PCR反应所需的关键成分包括目标DNA模板、DNA聚合酶、引物(primer)、核苷酸和反应缓冲液。
引物是一对短的DNA片段,其序列与目标DNA序列上的起始和终止部分的互补序列匹配。
反应缓冲液是维持PCR反应过程中所需酶活性的化学平衡和适宜pH的缓冲物质。
变性PCR反应开始时,反应体系中的DNA样本被放置在高温环境中(通常为94-98摄氏度),使其双链DNA解离为两条单链DNA。
这个步骤可以通过加热反应体系来实现,高温会断裂氢键,使DNA的双链解开。
退火在反应体系降温至适宜的温度范围时(通常为50-65摄氏度),引物与目标DNA序列上的互补区域结合形成稳定的双链结构。
引物的选择非常重要,其应与目标DNA序列完全匹配,以确保选择性扩增。
延伸DNA聚合酶将新的核苷酸从反应缓冲液中获得,并在目标DNA的3’末端上依次加入。
这个过程被称为延伸,其速率与延伸温度和所用聚合酶的酶活性相关。
通常延伸温度为60-72摄氏度。
经过以上三个步骤的循环反复进行,每一轮都会使目标DNA序列数量翻倍。
因此,PCR可以在短时间内扩增出大量的目标DNA片段。
PCR应用PCR技术在生物学研究、医学诊断、疾病预防和基因工程等领域有着广泛的应用。
基因分析PCR被广泛用于分析基因的结构和功能。
通过PCR,可以快速扩增出感兴趣的DNA片段,然后进行测序分析、限制性酶切或其他分子生物学实验,以研究目标基因的结构和功能。
生化试验教材实验九:聚合酶链式反应
检测电泳结果
观察电泳结果,通过染色或荧光染料标记的方法检测PCR产物的位 置和大小,判断是否成功扩增出目标片段。
04
结果分析
电泳结果解读
01
电泳条带的亮度与产物量
电泳条带的亮度通常与产物量成正比。如果观察到某一泳道的条带亮度
显著高于或低于其他泳道,可能表明该泳道的PCR产物量存在异常。
感谢观看
THANKS
例混合,配置成PCR反应液。
设定PCR程序
根据所使用的DNA聚合酶和PCR 仪器的要求,设定PCR扩增程序, 包括变性、退火、延伸等温度设置 以及循环次数等。
进行PCR扩增
将PCR反应液放入PCR仪器中,按 照设定的程序进行扩增反应。
电泳检测
配置电泳液
选择适当的电泳缓冲液和染料,配置成电泳液。
进行电泳
移液器
精确移取一定量的溶液,进行 实验操作。
电泳仪和电泳槽
用于检测PCR产物,通过电泳 观察扩增结果。
实验试剂准备
01
02
03
缓冲液
提供PCR反应所需的缓冲 环境,维持反应体系的酸 碱度和离子浓度。
去离子水
稀释和配制溶液所需的水 源。
染料
用于电泳时染色DNA片段, 便于观察和检测。
03
实验步骤
模板DNA的制备
定量分析
通过测量PCR产物在特定波长下的吸光度,可以定量分析 产物量。常用的定量方法包括终点法、动力学法和标准曲 线法。
重复性评估
为了确保实验结果的可靠性,需要评估不同实验条件下 (如不同PCR循环数)的重复性。这可以通过计算重复实 验之间的变异系数来实现。
PCR技术在植物病理学中的应用
PCR技术在植物病理学中的应用PCR技术,即聚合酶链式反应技术,是一种快速、高效、灵敏的分子生物学技术。
在植物病理学领域,PCR技术也得到了广泛的应用。
本文将介绍PCR技术在植物病理学中的应用以及一些相关的知识点。
一、PCR技术原理PCR技术是通过DNA聚合酶在体外模拟DNA的自然复制过程,扩增DNA序列。
具体而言,PCR技术通过为DNA序列提供特定的定向引物,使其在体外经过多轮循环反应,从而使原有的DNA序列扩增为几千万份甚至更多份的DNA序列。
PCR技术的基本步骤包括:1)变性;2)引物结合;3)延伸;4)复性。
PCR技术可以扩增目标DNA序列,从而用于病毒、细菌、真菌等病原体的检测。
二、PCR技术在植物病理学中的应用PCR技术在植物病理学中的应用非常广泛,其主要应用是检测植物病原体的DNA序列。
比如,某些种类的真菌、细菌、病毒等会致使植物产生疾病,检测这些植物病原体是至关重要的。
通过PCR技术检测植物病原体的DNA序列,可以更快速、高效地准确鉴定出病原体,从而加快病情的治疗和控制。
同时,PCR技术是一种特异性强、灵敏度高的方法,大大提高了检测结果的可靠性。
在植物病理学中,PCR技术的应用不仅仅局限于检测植物病原体的DNA序列,它还可以用于检测植物基因序列、开展基因的克隆等实验。
通过PCR技术在体外扩增目标基因,可以获取足够的基因模板,从而利用构建重组质粒、制备转录子、克隆目标基因等技术。
三、PCR技术在植物病理学中的优点PCR技术在植物病理学中的应用主要有以下几个优点:1、快速、高效:PCR技术可以在很短的时间内(几个小时之内)扩增出大量的目标DNA序列,检测结果准确,迅速判断植物是否感染了病原体。
2、特异性强:PCR技术采用特异性的引物,可以扩增出目标DNA序列,排除样本中其他 DNA 序列的干扰,保证了检测结果的准确性。
3、灵敏度高:PCR技术只需少量的样品就能够稳定地扩增目标DNA序列,做到非常高的检测灵敏度,能够检测出样品中非常微弱的植物病原体。
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时间(min)
重复1~3步 25~30轮 目的DNA片段 扩增100万倍以上
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PCR的基本原理
PPCCRR反过应程条件95℃
PCR的特点
1 2 模板D3NA
高温变性 低温退火 适温延伸
94
温
度 72
(℃)
55
22
DNA 2
形 成
条变
子链延伸
单性
DNA加倍
链
DNA单链
与引物复性
DNA双螺旋
一、概念
(一)PCR: polymerase chain reaction
聚合酶链反应
PCR技术是一种体外模拟自然DNA复制过程的核酸扩增技术,亦称为 无细胞分子克隆技术。它是以待扩增的双链DNA为模板,在一对人工合成的 寡核苷酸引物的介导下,以四种dNTP为底物,通过耐高温DNA聚合酶的酶 促作用,经过变性、退火、延伸的循环快速特异地扩增出特定的DNA片断。
引物—— 5’ATCCGGAC
Mg2+
耐热DNA聚合 酶
酶活化因子
dGTP dTTP dATP dCTP
底物
二 PCR技术简史
• DNA的复制 • 核酸体外扩增的设想 • 聚合酶链反应的发明
DNA 5’ ATCGCGATAGCGTAGCTGCGACCTAGC 解旋解链 TAGCGCTATCGCATCGACGCTGGATCG
标准的PCR反应体系
4种dNTP
各200umol/L
引物
各100pmol
模板DNA
0.1~2ug
Taq DNA-pol 2.5u
Mg2+
1.5mmol/L
温 度 (℃)
94 72
55
22
1
2
3
高温变性 低温退火 适温延伸
DNA 2
形
成
条 单 链
变 性
DNA单链
子链延伸 DNA加倍
与引物复性
DNA双螺旋
1988年初,Keohanog改用T4 DNA聚合酶进行 PCR,扩增的DNA片段均一,真实性好,特异性 高。但是该酶不耐热,每次循环仍需加入新酶。
(二)Erlich发现耐高温的DNA聚合酶
Taq DNA聚合酶(thermus aquaticus)
100
酶 80
活 性
60
40
(%)
20
40 50 60 70 80 90 100
PPCCRR反过应程条件7925℃
PCR的特点
第1轮结束 第2轮开始
PCR的基本原理 Taq
PPCCRR反过应程条件957502℃
PCR的特点
Taq
Taq
Taq
PCR的基本原理
PPCCRR反过应程条件72℃
PCR的特点
第2轮结束
模板DNA
第1轮扩增 第2轮扩增
但由于测序和引物合成的困难,以 及70年代基因工程技术的发明使克 隆 基 因 成 为 可 能 , 所 以 , Khorana 的设想被人们遗忘了……
1985 年 , 美 国 PE-Cetus 公 司 的 Kary B. Mullis等人发明了聚合酶链反应(PCR)
基本原理是在试管中模拟细胞内的DNA复制 最初采用E-coli DNA聚合酶进行PCR,由于该
3’
解旋解链 3’ TAGCGCTATCGCATCGACGCT 聚ADT合NAA酶GCGTAGCTGCGAGGATCG
3’
子链延长 TAGCGCTATCGCATCGACGCTGGATCG
3’
5’
1971年,Khorana提出:经过DNA 变性,与合适引物杂交,用DNA聚 合酶延伸引物,并不断重复该过程 便可克隆tRNA基因。
酶不耐热,使这一过程耗时,费力,且易出错 耐热DNA聚合酶的应用使得PCR能高效率的进
行,随后PE-Cetus公司推出了第一台PCR自动 化热循环仪 1993年,Mullis等因此项技术获诺贝尔化学奖
三、PCR原理
(一)Mullis的设想
94℃变性
50-65℃退火
适度延伸
94℃
55℃
37℃
Mullis最初使用的DNA聚合酶是E. coli DNA聚合 酶1的Klenow片段,起主要缺点是:不耐高温, 加热时会变性失活,每次循环都要重新加入;引 物链延伸反应在37 ℃下进行,容易发生模板和引 物之间的碱基错配,产物特异性较差,合成的 DNA片段不均一。
第四章 聚合酶链反应 原理及应用
聚合酶链反应(PCR)是 80年代中期发展起来的 体外核酸扩增技术。它 具有特异、敏感、产率 高、快速、简便、重复 性好、易自动化等突出 优点;能在一个试管内 将所要研究的目的基因 或某一DNA片段于数小 时内扩增至十万乃至百 万倍,使肉眼能直接观 察和判断;可从一根毛 发、一滴血、甚至一个 细胞中扩增出足量的 DNA供分析研究和检测鉴定。过去几天 几星期才能做到的事情,用PCR几小时便可完成。PCR技术是生物 医学领域中的一项革命性创举和里程碑。
简单的讲, PCR技术即通过引物延伸核酸的某个区域而进行的重复双向 DNA合成。
(二)PCR反应条件
模板 (template) 上、下游引物(primer) 4种dNTP (dATP,dGTP,dCTP,dTTP) 酶 (Taq DNA polymerase)
PCR扩增体系
模板—— 3’TTAGGCCTGGATAAGCGCCTGGA 5’
3’
合成引物
3’ 解旋酶解链酶
5’
子链延长
DNA 5’ ATCGCGATAGCGTAGCTGCGACCTAGC
3’
解旋解链
GGAUCG 引5‘物酶
RNA引物
合成引物
RNA引
5‘AU物CGCG
子链延长 引T物A酶GCGCTATCGCATCGACGCTGGATCG
3’
5’
DNA 5’ ATCGCGATAGCGTAGCTGCGACCTAGC
重复1~3步 25~30轮
目的DNA片段 扩增100万倍以上
1
2
3
4
5
时间(min)
PCR的基本原理
DNA引物
PPCCRR反过应程条件955℃
PCR的特点
引物1
引物2
PCR的基本原理
PPCCRR反过应程条件5702℃
PCR的特点
Taq酶 引物1
DNA引物
引物2 Taq酶
PCR的基本原理
温度(℃)
Taq DNA聚合酶的特点:
耐热性:在70 ℃下反应2h后起残留活性大 于原来的90%;
在热变性时不会被钝化,不必再每次扩增 反应后再加新酶;
大大提高了扩增片段的特异性和扩增效率, 增加了扩增长度。
94℃
55℃
72℃
PCR循环
(三)PCR的基本原理
• PCR反应条件 • PCR的过程