蛋白质的化学修饰

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修饰蛋白质的方法有哪些

修饰蛋白质的方法有哪些

修饰蛋白质的方法有哪些
修饰蛋白质的方法有很多,常用的方法包括:
1.荧光标记:通过连接荧光染料或荧光标签来标记蛋白质,以便于检测其位置和转运过程。

2.酶标记:利用化学方法将酶与蛋白质结合,可用于检测蛋白质的活性或进行酶联免疫吸附测定。

3.生物素-链霉亲和素系统:利用生物素与链霉亲和素的高度特异性结合,可用于纯化、检测和标记蛋白质。

4.磷酸化修饰:通过磷酸化酶酶解蛋白质,或使用磷酸化特异性抗体,可以鉴定蛋白质上的磷酸化位点。

5.乙酰化修饰:通过乙酰化酶或脱乙酰化酶对蛋白质进行处理,可以检测和定量蛋白质上的乙酰化修饰。

6.甲基化修饰:通过甲基转移酶或甲基化抗体对蛋白质进行修饰,可以研究其功能和相互作用。

7.蛋白质交联:通过化学或酶催化反应将不同的氨基酸残基连接在一起,形成蛋
白质结构的网状网络。

8.糖基化修饰:糖基化是蛋白质上糖类分子与氨基酸残基的共价结合,可以影响蛋白质的功能和稳定性。

这些方法可以用于研究蛋白质的结构、功能、定位和相互作用等方面。

蛋白质的化学修饰

蛋白质的化学修饰
转移
泛素腺苷酸复合物被转移到E2结合酶上。
连接
E3连接酶将活化的泛素分子连接到蛋白质的赖氨酸残基上。
泛素化修饰在生物学中的作用
调控蛋白质的稳定性
01
通过标记需要降解的蛋白质,泛素化修饰可以调控蛋白质的稳
定性。
参与信号转导
02
泛素化修饰可以影响蛋白质的功能,从而参与信号转导过程。
参与细胞周期和DNA修复
磷酸酶
催化蛋白质去磷酸化反应 的酶,将蛋白质上的磷酸 基团去除。
甲基化修饰
将甲基基团添加到蛋白质 的特定氨基酸残基上,调 节蛋白质的活性和功能。
磷酸化修饰在生物学中的作用
信号转导
磷酸化修饰参与细胞内的信号转导过程,调节细 胞反应和功能。
细胞周期和增殖
磷酸化修饰与细胞周期调控和细胞增殖密切相关 ,影响细胞生长和分裂。
04
泛素化修饰的种类
单泛素化
一个泛素分子与蛋白质的特定赖 氨酸残基结合,形成单泛素化修
饰。
多泛素化
多个泛素分子与蛋白质的特定赖氨 酸残基结合,形成多泛素化修饰。
链式泛素化
一个泛素分子的羧基端与另一个泛 素分子的氨基端结合,形成链式泛 素化修饰。
泛素化修饰的酶学机制
活化
泛素分子首先被E1活化酶激活,生成泛素腺苷酸复合物。
重要性
蛋白质化学修饰是生物体内一种重要的调控机制,可以快速 响应生物环境变化,调节蛋白质的活性、定位和稳定性,从 而影响细胞代谢、信号转导、细胞生长和分化等生物学过程 。
蛋白质化学修饰的类型
01
磷酸化
磷酸化是指在蛋白质的丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基上添加磷酸基团,
通常由蛋白激酶催化。磷酸化可以改变蛋白质的电荷性质和构象,从而

蛋白质的化学修饰

蛋白质的化学修饰

终止修饰反应的方法
加入某种化学试剂(通常为氨基酸 与修饰剂反应 加入某种化学试剂 通常为氨基酸)与修饰剂反应,从而消耗 通常为氨基酸 与修饰剂反应, 掉游离的修饰剂; 掉游离的修饰剂; 通过洗滤、 通过洗滤、超滤或透析将修饰蛋白与未修饰蛋白和游离的修 饰剂分开; 饰剂分开; 改变反应条件,如反应的pH值等 使修饰反应停止。 值等, 改变反应条件,如反应的 值等,使修饰反应停止。
pH:多数情况下,在蛋白质等电点附近的pH范围内,增加 :多数情况下,在蛋白质等电点附近的 范围内, 范围内 pH可以提高反应速率,降低 可以减小反应速率。 可以提高反应速率, 可以减小反应速率。 可以提高反应速率 降低pH可以减小反应速率 反应活性较高的修饰剂在中性或近中性的pH下即可以与蛋 反应活性较高的修饰剂在中性或近中性的 下即可以与蛋 白质迅速偶合;而反应活性较低的修饰剂则需要较高的pH。 白质迅速偶合;而反应活性较低的修饰剂则需要较高的 。
蛋白质侧链基团的化学修饰(以下简称化学修饰 蛋白质侧链基团的化学修饰 以下简称化学修饰) 以下简称化学修饰
通过选择性试剂(下称修饰剂) 通过选择性试剂(下称修饰剂)或亲和标记试剂与蛋白质分子侧 链上特定的功能基团(下称功能基)发生化学反应而实现的; 链上特定的功能基团(下称功能基)发生化学反应而实现的; 应用: 应用: 酶和蛋白质的各级结构以及作用机理; 酶和蛋白质的各级结构以及作用机理; 蛋白质纯度分析与鉴定; 蛋白质纯度分析与鉴定; 蛋白质和酶分子的固定化; 蛋白质和酶分子的固定化; 蛋白质分子的改性
蛋白质的化学修饰
定义 通过活性基团的引入或除去, 通过活性基团的引入或除去,而使蛋白质一级结构发生改 变的过程,统称为蛋白质的化学修饰。 变的过程,统称为蛋白质的化学修饰。 蛋白质的化学修饰主要包括两个方面: 蛋白质的化学修饰主要包括两个方面:

蛋白质的化学修饰

蛋白质的化学修饰
2-巯基乙醇、巯基乙酸和二硫苏糖醇(DTT)等主要 用于-S-S-的还原剂。
连四硫酸钠或钾 是一温和的氧化剂, 常用于-SH的可逆 保护剂。
2.1.4 芳香环取代反应
蛋白质AA残基的酚羟基在3和5位上易于发生亲 电取代的碘化和硝化反应。这类修饰反应的典 型例子为四硝基甲烷(TNM), 可以作用于Tyr的 酚羟基, 形成3-硝基Tyr衍生物。这种产物有特 殊光谱,可用于直接的定量测定。
-H2O
[H]
P-NH2 + RCHO +H2O P-N=CHR
P-NH-CH2R
2.3.2 电荷消失的修饰
这 不带类电试。剂可抑制Lys--NH2的质子化, 使形成的衍生物 1. 乙酰化:在微碱性pH下,氨基与乙酸酐反应生成 乙酰化衍生物。
2. 芳香化:三硝基苯磺酸与氨基作用, 生成的衍生物 为黄色,可定量测定-NH2。 (其它:DNFB\DNS)
2.1 特定的AA残基侧链 基团的反应试剂(4种)
2.1.1 酰化及其相关反应
这类化学修饰试剂如乙酰咪唑、酸酐磺酰氯、 硫代三氟乙酸乙酯和O-甲基异脲等,在室温 (20ºC~25ºC),pH 4.5 ~9.0的条件下可与蛋白质某些 侧链基团如 -NH2、-OH、-SH及酚基等发生酰基化 反应。
2.1.2 烷基化反应
此类试剂 ( 如DNFB、碘代乙酸、碘代乙酰胺、苯 甲酰卤代物、碘甲烷等 ) 常带有活泼的卤素原子, 因其电负性而使烷基带部分正电荷,易于导致蛋 白质分子的亲核基团 ( 如-NH2、-SH、 -COOH、 -SCH3和咪唑基 ) 发生烷基化。
2.1.3 氧化和还原反应
H2O2、N-溴代琥珀酰亚胺等具有很强氧化性,能 将侧链基团( -SH\-SCH3\吲哚基\咪唑基和酚基)氧 化, 往往易使肽链断裂(故要控制好氧化条件); 光 敏剂存在下的光氧化是比较温和的氧化作用。

蛋白质化学修饰的研究进展及其在疾病治疗中的应用

蛋白质化学修饰的研究进展及其在疾病治疗中的应用

蛋白质化学修饰的研究进展及其在疾病治疗中的应用随着现代医学研究的不断深入,人们越来越清楚地认识到蛋白质是生物体内最重要的分子之一。

蛋白质化学修饰作为蛋白质结构和功能的关键调节因素,在细胞信号转导、代谢调节、基因表达、免疫应答以及疾病发生发展等方面发挥着至关重要的作用。

本文将介绍蛋白质化学修饰的研究进展和其在疾病治疗中的应用。

一、蛋白质化学修饰的研究进展蛋白质化学修饰是指在蛋白质分子上发生的各种化学反应,包括糖基化、磷酸化、醋酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等多种修饰类型。

其中,糖基化是目前最为广泛研究的一种蛋白质修饰,它涉及到多种糖基转移酶、糖化终产物和受体等。

糖基化的主要功能是调节蛋白质的稳定性、活性和相互作用,进而影响蛋白质参与的细胞生理和病理过程。

近年来,越来越多的研究表明蛋白质化学修饰不仅包括单一修饰的发生,还涉及到复杂的“联合修饰”和“交叉修饰”等模式。

例如,乙酰化和甲基化在修饰特定位点上相互作用,形成了蛋白质的“联合修饰”模式,这种模式在基因表达和染色质结构的调节中更为常见。

另外,一些神经退行性疾病如阿尔茨海默病、亨廷顿舞蹈症等,其病理表现中也涉及到复杂的“交叉修饰”。

除了复杂的修饰模式,科学家们也在不断发掘蛋白质化学修饰的新功能。

例如,乙酰化修饰可以作为非编码RNA的启动子,直接参与到基因转录中;而磷酸化修饰可以诱导蛋白质的异构转变,影响蛋白质相互作用和免疫应答等多种生物学过程。

二、蛋白质化学修饰在疾病治疗中的应用随着对蛋白质化学修饰的深入研究,科学家们也开始尝试利用这些修饰来开发新的疾病治疗策略。

以下是一些目前已知的疾病治疗应用:1. 蛋白质泛素化在肿瘤治疗中的应用泛素化是一种重要的蛋白质化学修饰方式,在调节蛋白质代谢、稳定性和免疫应答等方面发挥着重要作用。

研究表明,许多恶性肿瘤的发生和发展与泛素化失调有关。

因此,利用泛素化修饰来调节肿瘤细胞的代谢和凋亡等生理过程,已经成为很多科学家的研究重点。

化学修饰技术在蛋白学研究中的应用

化学修饰技术在蛋白学研究中的应用

化学修饰技术在蛋白学研究中的应用随着生命科学技术的不断进步,蛋白质学研究在生命科学中越来越受到重视。

在蛋白学研究中,化学修饰技术被广泛应用于蛋白质的分离、分析和指纹图谱鉴定等方面。

本文将从不同角度探讨化学修饰技术在蛋白学研究中的应用和发展。

一、蛋白质的化学修饰化学修饰是指通过化学手段对蛋白质进行结构或化学性质的改变。

在蛋白质研究中,化学修饰被广泛运用,主要有如下几种形式:1. 蛋白质酶解蛋白质酶解是将蛋白质分解为多肽或氨基酸残基的化学修饰方法。

常用的酶解剂包括胰蛋白酶、丝裂原酶和胰蛋白酶-丝裂原酶等。

通过酶解蛋白质可以得到一系列的肽段,便于对蛋白质的研究和分析。

2. 蛋白质修饰基团的磷酸化磷酸化是蛋白质普遍存在的一种化学修饰形式,能够改变蛋白质的分子量、电荷性质和结构等物理化学性质。

通过蛋白质的磷酸化,可以实现调控蛋白质的表达、相互作用等功能。

3. 蛋白质的氧化氧化是一种常见的蛋白质化学修饰方法,常常用于在蛋白质研究中构建氧化修饰图谱。

通过氧化可以获得抗氧化剂的活性或者是增加蛋白质的质量等作用。

二、化学修饰技术在蛋白质组学中的应用1. 差异蛋白质分析差异蛋白质分析是一种基于技术的蛋白质组学研究方法。

该方法的核心是比较不同物种、不同数量、不同环境条件下蛋白质谱图的变化,从而得到差异表达的蛋白质。

差异蛋白质分析通常需要先对样品进行化学修饰,以增强蛋白质的分离和分析能力,从而实现准确识别差异表达的蛋白质分子。

2. 蛋白质的质谱特征分析蛋白质在不同蛋白质组显质谱图中表现出不同的质谱特征,利用化学修饰技术能够进行优化,目前常用的蛋白质化学修饰方法包括:a. 蛋白质N-糖基化修饰技术N-糖基化现象在蛋白质化学修饰技术中被广泛应用。

通过N-糖基化,可以提高蛋白质的抗氧化性、稳定性,并且可以改变蛋白质表面结构和电荷,从而增加其质谱特征。

b. 蛋白质带电修饰技术蛋白质带电修饰技术是利用电泳胶的电荷性质特点,通过加入化学性修饰剂,使蛋白质表面带有不同的电荷,从而实现对蛋白质的电泳分离和分析。

08-5蛋白质的化学修饰

08-5蛋白质的化学修饰

分析酶的活性中心
• PITC可以专一性与酶分子中Ser
CH3 CH3 CH3 CH3 CH O P CH O O
F
用于酶的固定化
• P187-188
• 化学修饰数据的分析
修饰结果的解释
• 蛋白质功能改变的解释
• 修饰残基的不稳定性
• 没有被发现的修饰
5-3蛋白质侧链的修饰
• • • • • • • 氨基的修饰 胍基的修饰 羧基的修饰 巯基的修饰 酚基的修饰 甲硫基的修饰 羟基的修饰
酶分子中可以被修饰的基团
氨基 羧基 Cys-巯基 His-眯唑基 Tyr-酚基
• • • • • • • • 蛋白质分子功能基所在微区域的极性: 如酶分子中氨基和羧基等可解离基团的pK值随其所在微区域的极性 降低而升高。 氢键效应: 如若酶分子中存在酚基-羧基间的氢键作用,则羧基的pK值比正常值 低;而酚基的pK值比正常值高。 静电效应: 在葡萄球菌核酸酶中,由于带电基团间的静电效应,使同位于该酶 中的4个His的pK值各不相同,分别为:5.37, 5.71, 5.74, 6.50. 位阻效应: 如果烷基在空间上与要修饰的功能基比较靠近,则会使修饰剂不能 与功能基反应。如枯草杆菌蛋白酶中,虽然10个酪氨酸都位于分子表面, 但实验表明,只有8个酪氨酸可以被修饰。
5-3蛋白质肽链的交联
• 交联剂(双功能试剂)的含义 • 设计或选择交联剂要考虑的因素 • 交联剂的类型
交联剂(双功能试剂)的含义
设计或选择交联剂要考虑的因素
• 反应的专一性
• 交联距离
• 可裂解性
交联剂的类型
• 同型双功能试剂
• 异型双功能试剂
• 可被光活化的试剂
5-4亲和标记
• 专一性特别强 P149表4-3

蛋白质化学修饰的研究及其在药物研发中的应用研究

蛋白质化学修饰的研究及其在药物研发中的应用研究

蛋白质化学修饰的研究及其在药物研发中的应用研究在现代医学和药物研发过程中,蛋白质化学修饰已成为一个热门的领域。

蛋白质是构成生物体的主要组成部分之一,也是绝大部分生物功能的发挥者。

而在许多生物体中,蛋白质往往会经过一些化学修饰作用,从而使得其在结构和功能上发生改变。

蛋白质化学修饰的研究对于深入了解蛋白质的结构、功能及其参与的生物学过程,进而推动新药物的研发具有十分重要的作用。

本文将从蛋白质化学修饰的概念开始入手,探讨其种类、意义以及在药物研发中的应用。

一、蛋白质化学修饰的概念1. 蛋白质化学修饰的定义蛋白质化学修饰指的是一系列在蛋白质分子上的共价修饰。

包括蛋白质内部基团的改变,如磷酸化、乙酰化、甲基化、乙酰化、糖基化等等,以及蛋白质外部基团的修饰,比如PEG化、Lipid化等等。

这些修饰使得蛋白质分子具有更丰富的功能和更广泛的生物学意义。

2. 蛋白质化学修饰的种类在蛋白质化学修饰中,最为常见的化学修饰为磷酸化。

磷酸化可以将磷酸基添加至蛋白质分子中,从而影响蛋白质分子的结构和功能。

其次,乙酰化是指向蛋白质分子中的赖氨酸基团添加乙酰基。

甲基化是指将甲基分子添加至蛋白质分子中,常见的一个甲基化修饰就是蛋白质的N末端甲基化。

而糖基化则是指将糖基添加至蛋白质分子中,其中包括复杂糖基、寡糖、低聚糖以及N-糖苷基、O-糖苷基等等。

此外,PEG化常常被用来延长蛋白质分子在体内的半衰期,这是一种通过共价连接聚乙二醇(PEG)分子的方法实现的修饰。

二、蛋白质化学修饰的意义1. 蛋白质功能和控制蛋白质化学修饰对于蛋白质的结构和功能起到了至关重要的作用。

以磷酸化修饰为例,磷酸化修饰可以明显影响蛋白质的功能,比如控制蛋白质的蛋白质结合性以及蛋白质的稳定性等等。

而乙酰化修饰的加入则是改变蛋白质的生理和病理功能,包括转录、代谢、凋亡、衰老以及肿瘤发生等。

2. 蛋白质诊断和治疗蛋白质化学修饰可以被用来作为进行蛋白质诊断中的重要工具。

蛋白修饰方式

蛋白修饰方式

蛋白修饰方式
蛋白质修饰是指在蛋白质合成后,通过化学反应或酶催化等方式对蛋白质的结构进行改变或功能进行调节的过程。

常见的蛋白质修饰方式包括:
1. 磷酸化(Phosphorylation):通过添加磷酸基团,改变蛋白质的电荷分布和结构,从而调节蛋白质的活性、互作和定位等。

2. 乙酰化(Acetylation):在蛋白质N-末端或赖氨酸残基上加入乙酰基,影响蛋白质的稳定性、亚细胞定位和相互作用等。

3. 甲基化(Methylation):通过在蛋白质上引入甲基基团,调节蛋白质的结构和功能,涉及到细胞分化、基因表达和转录调控等过程。

4. 糖基化(Glycosylation):在蛋白质上加入糖基,影响蛋白质的稳定性、溶解性和识别性,参与细胞信号传导、免疫应答等生物学过程。

5. 泛素化(Ubiquitination):通过连接泛素分子到蛋白质上,调节蛋白质的稳定性和降解,参与细胞周期、DNA修复和免疫应答等过程。

这些是常见的蛋白质修饰方式,不同的修饰方式可以对蛋白质的结构和功能产生不同的影响,进而调节细胞内的生物学过程。

4.蛋白质的化学修饰

4.蛋白质的化学修饰
如果要修饰的蛋白质对有机溶剂不稳定,必须在水介质 中反应,则应选择在水中有一定溶解性的试剂。 还必须考虑,反应生成物容易进行定量测定;试剂的 体积小一些为宜。
选择蛋白质修 饰剂要考虑:
修饰反应要完成到什么程度; 对个别氨基酸残基是否专一; 在反应条件下,修饰反应有没有限度; 修饰后蛋白质的构象是否基本保持不变; 是否需要分离修饰后的衍生物; 反应是否需要可逆; 是否适合于建立快速、方便的分析方法。
O ENZ C O C NH2 + OH-
O
N C NH2 O
3.芳基化
三硝基苯磺酸(TNBS)与氨基作用,产生三硝基苯衍生物,反 应产物为黄色。 TNBS也能与巯基作用。
NO2
NO2 SO3H + NH2R pH﹥7
NO2
TNBS
NO2
NO2 NHR + SO3H +H+
NO2
(黄色)
(三)引入负电荷的修饰
(一)试剂的选择
选择试剂在很大程度上要依据修饰目的。
对氨基 的修饰
修饰所有氨基,而不修饰其它基团; 仅修饰α-氨基;
修饰暴露的或反应性高的氨基,以及 修饰有催化活性的氨基等。
修饰的部位和程度一般可用选择适当的试剂和反应条件 来控制。
如果修饰的目的是改变蛋白质的带电状况或溶解性, 必须选择能引入最大电荷量的试剂。
1.利用蛋白质分子中,某些基团的特殊活性蛋白质,特殊的空 间结构,能影响某些基团的活性
位置专一性:在蛋白质分子中特别活泼的基团,在适当条件下只是其本身 发生作用,而其它基团皆不作用。
2.选择不同的反应pH
蛋白质分子中各功能基的解离常数是不同的,所以控制不同的反应pH,也 就控制了各功能基的解离程度,从而有利于修饰的专一性。

蛋白质化学修饰是通过在特定氨基酸残基上引入不同的化学基团从而调节蛋白质表达和功能的过程

蛋白质化学修饰是通过在特定氨基酸残基上引入不同的化学基团从而调节蛋白质表达和功能的过程

蛋白质化学修饰是通过在特定氨基酸残基上引入不同的化学基团从而调节蛋白质表达和功能的过程蛋白质化学修饰解析蛋白质是生命体中最为重要的分子之一,它们在细胞中发挥着各种功能。

为了正常地维持生命,蛋白质需要保持一定的空间构象和活性。

所以,细胞中存在着一种叫做蛋白质化学修饰的机制,通过在特定氨基酸残基上引入不同的化学基团从而来调节蛋白质表达和功能。

一、蛋白质化学修饰的种类1. 磷酸化磷酸化是一种常见的化学修饰方式,它是通过在蛋白质上引入磷酸基团来改变蛋白质的空间构象和活性。

磷酸化通常在酪氨酸、丝氨酸和苏氨酸上进行,是一种转移化学修饰。

在生命过程中,磷酸化参与了细胞信号传导、细胞周期调控等各个方面。

2. 甲基化甲基化是一种化学修饰方式,它是通过在蛋白质上引入甲基基团。

甲基化的作用是影响蛋白质与其他分子的结合,例如DNA去甲基化酶MECP2,就是通过与DNA上的甲基化位点结合,从而影响DNA转录和表达。

3. 泛素化泛素化是一种蛋白质降解的化学修饰方式,它是通过附加泛素基团在蛋白质上来形成泛素-蛋白酶复合物,从而将蛋白质进一步降解成氨基酸。

泛素化对于细胞生长和代谢中的蛋白质调节具有重要作用。

二、蛋白质化学修饰对蛋白质表达和功能的调节蛋白质化学修饰对蛋白质的结构和功能有显著的改变。

例如,磷酸化可以改变蛋白质的空间构象,从而影响蛋白质的酶催化活性,DNA 结合能力等。

另外,泛素化可以降解蛋白质,从而使其氨基酸组成的肽链释放出来,泛素化调节蛋白质的生命周期和代谢的能力。

三、蛋白质化学修饰在药物研发中的应用蛋白质化学修饰是一种非常重要的生命现象,因此也广泛应用于药物研发领域。

磷酸化修饰可以作为一种基于蛋白质的治疗策略,例如泛素化作为一种治疗药物肿瘤的靶点。

甲基化修饰不仅与许多疾病有关,还可以用于药物治疗。

总之,蛋白质化学修饰是一个很重要的研究领域,它对于细胞的正常生长和代谢有着举足轻重的作用。

在未来,对于蛋白质化学修饰的深入了解将有助于我们更好地研发出生命科学领域的新药物。

第四讲蛋白质的化学修饰(共94张PPT)

第四讲蛋白质的化学修饰(共94张PPT)

二、确定修饰程度和修饰部位
通过对被修饰蛋白质的降解和氨基酸分析后鉴定修饰部 位。
通过纯化被修饰蛋白质的氨基酸及其衍生物,测定其同位素标 记量或光谱强度或顺磁共振谱或荧光标记量等来确定反应程度 。
一般认为:测定被修饰的氨基酸,要比测定氨基酸的减少 量更准确。
三、化学修饰数据的分析
⒈化学修饰的时间进程曲线 以修饰时间对蛋白质活性作图
蛋白质构象改变会导致微区极性的局部改变,这 种改变对
Trp,Met和Cys的反应性影响最小; 对氨基和咪唑基的反应性影响较大; 而对Tyr,Hcys和COOH的反应性影响最大
。此外,极性的变化也影响到反应类型。
⑵氢键效应
氢键对维持天然蛋白质及其离子稳定性有重要影响, 氢键的变化也可能导致pK发生改变。
S er O H
O H O C C H 2 C H 2
N O 2
⑸局部环境的极性
溶剂极性可能与反应速度有关,如下表:
反应类型
降低极性对速度的影响
⒈RSR+ICH2CONH2
[R2S+CH2CONH2]I- 适当或大大降低
⒉RSR+H2O2
R2SO+H2O
没有影响
⒊RS-+ ICH2CONH2
⒈试剂选择
不同实验,对修饰的专一性要求也不同,因此选择试剂在很大程 度上要依赖修饰目的。
例如,对氨基的修饰,仅修饰氨基;仅修饰α-氨基;修饰暴露的 或反应性高的氨基。
一般通过选择试剂和反应条件来控制修饰的部位和程度
•如果希望改变蛋白质的带电状态或溶解性,应该选择能引入最大
电荷量的试剂。
•例如用顺丁烯二酸酐可将中性的巯基和酸性条件下带正电荷的氨基转变成

蛋白质分子基础蛋白质的化学修饰

蛋白质分子基础蛋白质的化学修饰

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9
化学修饰的应用
❖ 用来测定蛋白质分子中某种氨基酸的数量
只需知道某一种氨基酸的数量而不需要知道其它氨 基酸的数量时,则可用蛋白质的化学修饰进行定量 (参见P152) ❖ 在蛋白质序列分析中的应用
用于测定蛋白质及多肽化学结构的许多方法都是以 蛋白质化学修饰为基础的。
(1)控制酶解程度 (2)化学裂解:溴化氰专一性裂解Met羧基所形成 的肽键;蛋白质中二硫键的裂解。
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13
化学修饰的应用
❖ 蛋白质化学修饰在生物工程中的应用 eg.提高酶的稳定性
改变酶的专一性 创造新的酶活
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14
荷量的试剂 (2)便于定量 (3)试剂的体积要小
❖ 反应条件的选择:温度、pH 要求: (1)不造成蛋白质的可逆变性 (2)便于专一性修饰蛋白质
❖ 反应的专一性
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8
பைடு நூலகம்
❖ 亲和标记:
亲和试剂的结构和与蛋白质作用的底 物或抑制剂相似。在作用前,试剂先以非 共价形式结合到蛋白质的活性部位上,然 后再发生化学反应,将试剂挂在活性部位 上。这种方法在研究酶的活性部位时非常 有用。
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5
影响蛋白质功能基反应性的因素
➢ 微区的极性:
微区的极性是决定基团解离状态的关键因素 之一 .
局部的极性改变对色氨酸、甲硫氨酸、胱氨 酸影响较小,对氨基和组氨酸反应性影响较大; 对含羟基和巯基的氨基酸反应性影响最大。
➢ 氢键效应
天然蛋白质通过氢键维持其稳定性。
➢ 静电效应
➢ 位阻效应
蛋白质分子基础
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1
蛋白质的化学修饰
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蛋白质的化学修饰

蛋白质的化学修饰
E N Z S +I C H C O O 2
pH﹥7
E N Z S C H C O O + I 2
半胱氨酸
碘乙酸
副反应:
ENZ N N H 组氨酸
+I C H C O O 2
pH﹥5.5
E N Z N
C O O N C H 2
+ -+ + I H
E N Z S
甲硫氨酸
C H 3
I C H C O O + 2
S-汞-N-5-二甲氨基萘磺酰半胱氨酸
(四)5,5′-二硫双硝基苯甲酸(DTNB)也常用于修饰巯基, 它与半胱氨酸形成混合二硫化物。 释放出的2-硝基-5-硫代苯
E N ZS N H+ O 2
O O C
S S
N O 2
C O O
pH ﹥6.5
DTNB
甲酸阴离子在412nm处有 吸收,可用光谱法测定其 含量。
O ENZ C O C R NH R NH
+
E N Z C
重排
O + H + N R C N H R
O
四、巯基的修饰
由于半胱氨酸时蛋白质中反应性最强的残基,所以很多试剂可用 来修饰巯基侧链。 1.碘乙酸、碘乙酰胺或环乙烯亚胺 常用的有三类: 2.马来酰亚胺或马来酸酐 3.有机汞试剂 (一)1类试剂是烷化剂,此类试剂还能与甲硫氨酸、赖氨酸或 组氨酸反应。
NO2 C H 2B r OH
pH ﹤7.5
+
ENZ NO 2 CH 2 O N HH
ENZ
+ HBr
2-羟基-5-硝基苄基溴
ENZ NH
色氨酸 醋酸

第五章 蛋白质的修饰

第五章 蛋白质的修饰

(7)突变基因的鉴定。从选出的噬菌斑中制备DNA,用 Sanger方法测定突变部位序列,与预定序列相符合的就 是所需的突变基因。
2、盒式诱变 合成两套分别与靶DNA的两条链互补的寡核苷酸 (10~25bp)。其中一套由单一的一种与野生型靶DNA 一条链的序列精确互补的寡聚核苷酸组成,另一套由 一系列互补于另一条链同一位置带有目标突变的简并 的寡聚核苷酸组成。这样,在有利于形成错配杂交的 条件下将两条互补的寡聚核苷酸混合,则生成1个短 的双链DNA片段,可在片段的两端设计合适的突变末 端,直接插入到重组质粒中以置换同源的野生型序列。
试剂首先与活性部位发生特异性结合;
然后试剂中的活性基团与活性部位中的侧链基团发 生化学反应,将标记基团共价连接于活性部位上。 修饰有两个明显的特点: (1)底物、竞争性抑制剂或配体对修饰有保护作用; (2)修饰反应是定量定点的修饰。
(2)Kcat型的不可逆抑制剂
是根据酶催化过程设计的,这类抑制剂 具有和底物类似的结构,具有被酶结合和催 化的性质,此外,还有一个潜伏反应基团, 在酶对它进行催化反应时,这个潜伏的反应 基团被酶催化而活化,对活性部位起不可逆 抑制作用。这类抑制剂的专一性很高,常被 人们称为“自杀性底物”。
部位,如酶的活性部位、膜蛋 白质上的激素结合部位等位点 的专一性——亲和标记
1、亲和标记
亲和标记:试剂对蛋白质分子中被修饰的部 位的专一性修饰,称为亲和标记或专一性的 不可逆抑制作用。 亲和标记试剂,不仅具有对被作用基团 的专一性,而且具有对被作用部位的专一性, 即试剂作用于被作用部位的某一基团,而不 与被作用部位以外的同类基团发生作用。这 类修饰试剂也被称为位点专一性抑制剂。
第五章 蛋白质的修饰
蛋白质的修饰主要包括两个方面:

第五章蛋白质的化学修饰

第五章蛋白质的化学修饰

(2)无电荷的极性R基氨基酸(共7种): 丝氨酸(Serine,Ser,S), 苏氨酸(Threonine,Thr,T), 酪氨酸(Tyrosine,Tyr,Y), 半胱氨酸(Cysteine,Cys,C), 天冬酰胺(Asparagine,Asn,N),甘氨酸(Glycine,Gly,G), 谷氨酰胺(Glutamine,Gln,Q) (3)带正电荷的极性R基氨基酸(共3种): 赖氨酸(Lysine,Lys,K), 精氨酸(Arginine,Arg,R), 组氨酸(Histidine,His,H) (4)带负电荷的极性R基氨基酸(共2种): 天冬氨酸(Aspartic acid,Asp,D), 谷氨酸(Glutamic acid,Glu,E)
一、蛋白质侧链的化学修饰
4、影响侧链化学修饰的条件
• 温和的反应条件是防止蛋白质分子变性的一个 必要条件
• pH值的变化:决定了具有潜在反应能力的基 团所处的可反应和不可反应的离子状态。
• 温度:影响活性巯基的微环境 • 有机溶剂:试剂需要有机溶剂来助溶,但有机
溶剂可使蛋白质变性。
• 产生二硫键 二硫键被还原剂打开,多肽彼此分开 DTT、 二硫苏糖醇
和咪唑基)是酶的必需基团。 赖氨酸的氨基 天冬氨酸和谷氨酸的羧基 半胱氨酸的巯基 组氨酸的咪唑基 酪氨酸和丝氨酸的羟基
O
H 2 N CH C OH CH 2 OH O
H 2 N CH C OH CH 2 O SH
H 2 N CH C OH CH 2
N NH
O
OH
H 2 N CH C OH O
CH 2 H 2 N CH C OH
一、蛋白质侧链的化学修饰
3、氧化还原修饰
• 二硫键的还原:巯基乙醇、巯基乙酸和二硫苏糖醇等。

蛋白质的化学修饰

蛋白质的化学修饰

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13
TNF-a是一种颇有价值的肿瘤治疗药物,它具有协同的 抗肿瘤效能:一方面直接表现为对肿瘤细胞的细胞毒作用;另
一方面可激活宿主的抗肿瘤应答并选择性地引起肿瘤组织 内部的微循环障碍。但是, TNF-a在体内的清除速率很快,要 产生明显的抗肿瘤效果需要非常大的使用剂量,由此常引发 一系列严重的毒副作用,包括发热、组织炎症和组织损伤,甚
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4
2 反应条件的选择
3
考虑因素包括pH、反应温度、反应介
质以及缓冲液组成
4
允许反应顺利进行
5
不能造成蛋白质的不可逆变性
6
有利于专一性修饰蛋白质
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5
修饰反应的类型
酰化及其相关反应 烷基化反应 氧化还原反应 芳香环取代反应
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6
蛋白质的PEG修饰
聚乙二醇(polyethyleneglycol, PEG)修饰又 称分子的PEG化(PEGalation),是目前蛋白质化 学修饰最重要的技术之一,是用来解决或缓解蛋白 和多肽在药用过程中存在的诸多问题的有效途径。
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7
PEG是由乙二醇单体聚合而成的线性高分子材料,分子组成为 HO-CH2-CH2-(O-CH2-CH2-O)n-CH2-CH2-OH; PEG链还可以与 马来酸酐进一步共聚形成梳状的PEG衍生物,简称PM。 PEG 分子中存在的大量乙氧基能够与水形成氢键,使PEG具有良好 的水溶性;分子末端剩余的羟基通过适当方式活化后可与各类 蛋白分子相偶联。
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10
2 降低抗原性和免疫原性
通过PEG修饰来消除免疫反应活性,将异源性蛋白转化 为非免疫原性的药用蛋白,主要是利用无免疫原性的PEG分 子链与蛋白表面的基团相偶联,进而在蛋白表面形成一道屏 障,将暴露的抗原结合位点屏蔽起来。分子构型独特的梳状 PEG具有更强的屏蔽功能,因而在这方面的应用更为普遍。
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从广义上说:凡通过化学基团的引入或除去, 而使蛋白质共价结构发生改变,都可以称为蛋白 质的化学修饰。
包括两个方面:(1)侧链基团的改变;(2) 主链结构的改变,前者属于化学修饰的范畴,而 后者则属于基因重组和定点突变的方法。
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蛋白质化学修饰的意义
改变蛋白质的药代动力学 调节蛋白质的稳定性以及活性 改变蛋白质的空间构象
6. 10% SDS
取10g SDS,加水至100 ml,完全溶解后室温保存。
7. 10%过硫酸铵溶液(AP)
临用前现配。
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8.染色液(0.25% R-250、50%甲醇、7%乙酸)
考马斯亮蓝R-250 2.5 g、 甲醇(可用无水乙醇代替) 500 ml、70 ml冰乙酸, 溶解后补足水至总体积1000 ml。
4. 0.5 mol /L Tris-HCl浓缩胶缓冲液pH6.8 (4x)
取5.98 g Tris,用1N HCl调至pH6.8,加水至 100 ml,4℃保存。
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19
5. 电极缓冲液(pH 8.3)
取 14.49 g甘氨酸,3.02 g Tris,加100 ml 10%SDS,加水至1 升,4℃保存。
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2 反应条件的选择
考虑因素包括pH、反应温度、反应介质以 及缓冲液组成
允许反应顺利进行
不能造成蛋白质的不可逆变性
有利于专一性修饰蛋白质
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50
修饰反应的类型
酰化及其相关反应 烷基化反应 氧化还原反应 芳香环取代反应
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51
二硝基氟苯法(FDNB,DNFaB): 1945年Sanger提出此方法.52
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25
样品预处理
取样品液与等体积样品缓冲液混合,100℃加热 1~2分钟。
待浓缩胶聚合完全后,小心移出梳子,然后将胶 板固定于电泳装置上,上下槽各加入电极缓冲液。
加样
用微量进样器加样。每个样品孔加入20ul样品。 同时加一个标准品。
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26
【电泳】
在100 V的电压下电泳,当样品全部 进入分离胶时,加大电压至100 V,当溴 酚蓝达到胶底部,关闭电源。
这种迁移率的不同,就蛋白质分子本身 而言,主要与其所带净电荷以及分子量和形 状有关。
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7
当电泳体系中含有一定浓度的十二烷基硫 酸钠(SDS)时,则得电泳迁移率的大小只 取决于蛋白质的分子量,从而可推测蛋白 质的分子量。
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8
SDS的作用原理
SDS是一种阴离子去污剂,能够与蛋白 质结合,破坏蛋白质分子之间以及与其它物 质分子之间的非共价键,使蛋白质变性而改 变原有的空间构象。
因此,在电泳过程中,迁移率仅取决于蛋 白质-SDS复合物的大小,也可以说是取决于蛋 白质分子量的大小,而与蛋白质原来所带电荷 量无关。
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11
当SDS的总量为蛋白量的3~10倍且SDS 单位浓度大于1 mol/L时,这两者的结合是定 量的,大约每克蛋白质可结合1.4克SDS。
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12
组成
该电泳系统由两层不连续聚丙烯酰胺凝胶组成
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四、核磁共振波谱
核 磁 共 振 波 谱 (nuclear magnetic resonance spectroscopy, NMR).是将具有磁矩的核放入磁场后,用适宜的频率的电磁波照射, 它们就会吸收能量,发生原子核能级的跃迁,同时产生核磁共振信 号,得到核磁共振波谱。在有机化合物中,经常用于1H和13C核的共 振吸收波谱。在生物学方面主要研究生物大分子的结构和分子量。 到目前为止,采用1H 2D-NMR(二维NMR)能解决的最大蛋白质分子 量在10000Da左右。如果采用杂核多维NMR技术,能解决的最大蛋白 质分子量大在25000Da左右。
11.TEMED(四甲基乙二胺)
Tetramethylethylenediamine
a
22
分离胶和浓缩胶的配制
分离胶的浓度
12%
重蒸水 /ml
3.35
1.5M Tris-HCl(pH8.8) /ml 2.5
10%SDS /ml
0.1
凝胶贮备液(Acr/Bis) /ml
4.0
10%过硫酸铵 /μl
50
二甲基氨基萘磺酰氯法,丹磺酰氨基酸具有强烈的黄色荧
光,灵敏性是DNFB法的100倍.
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53
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巯基的氧化还原反应可以应用于蛋白质结构分 析、包涵体的复性、增加蛋白质可溶性等。
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33
层析法装置
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35
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优点
分离条件温和 回收率高 重复性好 设备简单
缺点
对样品的稀释大 流速慢 操作费时
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38
三、质谱法
【原理】
质谱仪是利用电磁学的原理,使带电的样品离子按质 荷比进行分离的装置。离子电离后经过加速进入磁场中。 其动能与加速电压及电荷Z有关。 Z:电荷数
a
43
几种测定蛋白质分子量的方法比较
方法
机理
分子量计算
关键技术
特点
电泳 分子表面电荷 电泳条带(mR)
SDS包裹
单链分子
层析 分子质量
层析峰的位置
介质交联度 球形分子
质谱 质荷比
质谱峰直接标识 样品质子化 整体分子
核磁 核磁共振波谱 核磁谱线计算
磁场能量
整体分子
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44
蛋白质的化学修饰
a
45
概念
A. 分离胶的阻力(孔径小),浓缩作用 B. 缓冲液离子成分的不同 [(甘氨酸离子 (慢)氯离子(快)],压缩作用 C .浓缩胶与分离胶之间pH值差(分离胶pH高,
调节慢离子的迁移率)
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15
▼分子筛效应 大分子运动慢,小分子运动快
▼电荷效应 带电荷多的运动快,带电荷少的运动慢
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【器材】
电泳仪、 垂直板电泳槽、 进样器、 乳头吸管、 50 ml小烧杯
9.脱色液(30%甲醇、7%乙酸)
甲醇(可用无水乙醇代替) 300 ml,冰乙酸70 ml, 补足水至1000 ml。
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21
10.样品缓冲液(2x)
H2O 2.4 ml,浓缩胶缓冲液1.0 ml、甘油0.8 ml、10% SDS 3.2 ml,b-硫基乙醇0.4 ml,0.025%(W/V)溴 酚兰0.2 ml。
TEMED/μl(最后加,防烧杯中聚合) 5
总体积 /ml
10ml
浓缩胶的浓度 5%
重蒸水/ml
2.92
0.5M Tis-HCl(pH6.8)/ml 1.25
10%SDS /ml
0.05
凝胶贮备液(Acr/Bis) /ml 0.8
10%过硫酸铵 /μl
25
TEMED /μl
5
总体积 /ml
5ml
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23
上层胶:浓缩胶(stacking or concentration gel) 浓 度 2-5%,缓冲液pH值为6.8
下层胶:分离胶(seperation or resolving gel) 浓 度 5-20%,缓冲液pH值为8.3
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特点
具有很高的分辨力,这是因为它具有以下三种效应:
▼样品浓缩效应
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化学修饰的原理
影响蛋白质化学修饰反应进程的因素有: 1 蛋白质功能基的反应性(亲核性) 1.1 基团之间的氢键及静电作用 1.2 基团之间的空间位阻 2 修饰剂的反应性 2.1 选择吸附 2.2 静电相互作用 2.3 位阻因素
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化学修饰的方法学
1 试剂的选择
水解稳定性; 蛋白质的修饰位点,反应类型以及专一性; 修饰剂的大小; 连接键的稳定性、毒性和抗原性; 修饰后是否需要进一步的分离; 是否适于建立快速、方便的分析方法; 是否能够简便经济的合成或购买
分离生物大分子多采用电喷质谱法,属于动态质谱仪。 基本原理是生物大分子在很高的电场下电离。样品溶液以 很低的流速,在高的电场下使生物分子从毛细管中流出來。
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【方法】
样品溶液以很低的流速(1-20μl/分钟)从毛细管中流出来。 在毛细管的柱头上施加一个高电压(1-5kv),使柱头液体雾化 成很细的带电液滴,这种带电液滴在逆向干燥气流中挥发,使 液滴表面电荷密度增大。直到产生的库仑斥力与液滴表面张力 的雷利极限值相等时,液滴就会发生爆裂,形成更小的子液滴, 这些子液滴又被蒸发,又会形成爆裂。如此循环下去,直到液 滴变得非常小,它的表面的电荷密度变得非常大,形成很强的 电场,并从液滴中解离出带多电荷的分子离子。这些离子是靠 吸附上或丢失若干质子而形成的,所以正离子或负离子谱上会 观察到谱峰。生物大分子在ESI谱上往往是一组带不同的电荷 的分子离子峰。
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【试剂】 1.标准蛋白质:
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2. 30%丙烯酰胺溶液
丙烯酰胺29.2 g, 甲叉双丙烯酰胺0.8 g, 加水至100 ml,棕色瓶4℃保存。
3. 1.5 mol /L Tris-Hcl分离胶缓冲液pH8.8(4x)
取18.15 g Tris, 用1M HCl调pH至 8.8,加水 至100 ml,4℃保存
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2
蛋白质鉴定的主要参数
蛋白质分子是非常复杂的生物大分子,能代表其特征参 数很多.但在普通实验室能够进行测定的、最常用的参数, 归纳起来主要有以下几种。 (1)蛋白质的质量鉴定(分子量) (2)蛋白质带电性鉴定(等电点) (3)蛋白质结构鉴定(一、二级结构、晶体、肽谱、NC-末端) (4)蛋白质生物学功能鉴定(生物活性、比活、酶促动力学) (5)免疫学鉴定(抗原-抗体反应、酶联免疫反应)
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