毕赤酵母表达系统资料整理
毕赤酵母分泌表达报告
实验报告毕赤酵母分泌表达报告订单号:«订单号»客户:«客__户»日期:«日__期»目录1 材料与方法 (1)1.1 菌株的保存与培养 (1)1.2 载体构建 (1)1.3 质粒电转毕赤酵母 (1)1.4 转化子筛选 (2)1.5 转化子表达小试 (4)1.6 最优转化子扩大表达 (6)1.7 蛋白鉴定与纯化 (7)2 结果与分析 (9)2.1 转化子筛选 (9)2.2 转化子表达小试 (9)2.3 最优转化子扩大表达 (10)2.4 蛋白纯化与浓度测定 (10)1.材料与方法1.1 菌株的保存与培养大肠杆菌(Eschrichia coli)菌株TOP10于LB培养液摇菌后保存成20%的甘油菌于-80℃冷冻保存。
大肠杆菌于37℃培养箱中培养。
毕赤酵母(Pichia pastoris)菌株X-33于YPD培养液摇菌后保存成25%的甘油菌于-80℃冷冻保存。
毕赤酵母于28℃培养箱中培养。
1.2 载体构建1)目的基因信号肽预测,采用SignalP 4.0和5.1预测,去除信号肽序列;2)根据毕赤酵母表达系统进行密码子优化,避开SacI酶切位点;3)基因合成至pPICZαA,目的基因紧挨着载体α-factor,C端带上6×His。
1.3 质粒电转毕赤酵母1.3.1 目的载体线性化1)按下表配制载体酶切体系:组分体积(ul)质粒(5-10 ug)6 ug10×buffer 5SacI 1 ulddH2O 补到502)37℃酶切过夜;3)琼脂糖凝胶电泳检测,以未酶切的质粒作为对照;4)检测酶切成功后,65℃ 20 min灭活。
1.3.2 线性化载体纯化回收1)按下表配置载体纯化体系:组分体积(ul)酶切产物50核酸助沉剂103 M NaAc,pH=5.2 6无水乙醇1652)-20℃静置35 min以上;3)4℃ 12000 rpm离心15 min,弃上清,此时可以观察到壁上有白色沉淀;4)加入400 ul预冷的80%乙醇重悬沉淀;5)4℃ 12000 rpm离心10 min,弃上清,开盖干燥;6)加入10 ul ddH2O溶解沉淀。
毕赤酵母表达知识归纳
毕赤酵母表达知识归纳1a.配制500×BIOTIN stock solution(0.02%)有这么3种方案:1、懒人是将Biotin直接溶在去离子水中,放过夜,基本就能溶;2、急性子是将溶液配成0.02N的NaOH,就很容易溶解了;3、水浴加热,温度不能高于50度。
D-生物素是具有生物活性的生物素,也就是vitaminH。
在毕赤酵母代谢过程中,作为多种酶的辅基起作用。
天然培养基中一般可以不单独添加,因为YNB中、酵母粉、蛋白胨中均含有一定量的生物素,但是做高密度发酵还是必须要添加的。
b.有几个比较迷惑的问题请教大家:(很典型的小问题)1、制感受态细胞,OD多少比较好?pyrimidine 战友的方法:取1mlGS115过夜培养物(OD约6-10) 分装到1.5ml EP管中。
说明书还有一些文献是说在1.3左右效率高,再高了效率会很低2、关于高效转化法,文献说用(LiAc),而invitrogen的说明书说转化毕赤酵母用(LiAc)没用,要用LiCl。
Lithium acetate does not work with Pichia pastoris. Use only lithium chloride.3、YNB到底能高温灭么?有的说能有的说不能。
过滤灭菌的怎么操作?我是把滤器装好膜绑到瓶口用纱布盖上,报纸包上,瓶盖放烧杯里单灭。
然后把配好的溶液用注射器一点点推进去。
4、葡萄糖为什么在YPD里一起灭颜色很深,单灭则不会。
该115度还是121度灭?网上搜了下,都有人用!5、电转化参数用400欧还是200欧?有的用400,有的还专门说不是用400。
都是从园里看到的!电击参数:1.5KV,25uF,200欧姆(不是400)6、电转后,在MD平板上长的应该就是整合了目的基因的重组子了吧?如果不想筛高拷贝的,是否PCR验证一下即可?网友的回答:ynb最好不灭菌,我是0.22um过滤处理的。
invitrogen手册上可以灭菌的。
6毕赤酵母介绍
毕赤酵母及级胰岛素——优思灵巴斯德毕赤酵母(P/ch/a pastor/s)表达系统是目前最优秀、应用最广泛的外源基因表达系统之一,它不但克服了大肠杆菌表达系统不能表达结构复杂的蛋白质、表达的蛋白多形成不溶性包涵体、背景蛋白多、表达产量低等缺陷,弥补了哺乳类细胞、昆虫细胞表达系统操作复杂、表达水平低、产业化生产造价昂贵的不足,还具有其他酵母表达系统无法比拟的优越之处。
酵母作为一种最简单的单细胞真核生物, 兼有原核生物和真核生物的某些优点。
毕赤酵母生活史与酿酒酵母十分相似。
这使得毕赤酵母的发酵工程部分可与酿酒酵母相同, 从而节省了重新购臵设备和进行新技术探索的巨额花费, 这是用其他方法进行大规模商品化的外源蛋白生产所不能比拟的优势。
现将毕赤酵母表达系统优点概括如下:①毕赤酵母更接近高等真核细胞, 不含内毒素和其他有害物质, 使用安全;②同酿酒酵母一样, 繁殖速度快, 对培养条件要求低, 培养基价廉, 能进行高密度培养, 且能耐受较高的液体静压, 便于工业化生产;②该系统的载体能与核基因组进行整合, 因此构建的菌株较稳定, 一般不会在传代过程中出现丢失现象;③在毕赤酵母中表达的蛋白既可存在于胞内, 又可在分泌信号作用下将蛋白分泌至胞外;⑤具有强有力的易控制的乙醇氧化酶基因(AOX1)或磷酸甘油酸脱氢酶( GAP) 基因启动子作为外源基因启动子, 可对外源蛋白的表达进行严格调控;⑥作为真核表达系统, 可对表达的外源蛋白进行翻译后的加工和修饰, 即二硫键的形成、脂肪的酰化、蛋白磷酸化、折叠、信号序列加工、N糖基化、O糖基化, 从而使目的蛋白具有所应有的生物学活性;⑦外源蛋白表达量高, 同时自身分泌的背景蛋白少, 表达产物易于纯化;⑧和酿酒酵母相比, 毕赤酵母中加到翻译蛋白上的糖链长度平均每条侧链为8~14个甘露糖残基, 比酿酒酵母每条侧链平均50~150个甘露糖残基短得多。
毕赤酵母极少出现过渡糖基化, 可避免外源蛋白生产过强的免疫原性或因糖链过长干扰外源蛋白正确折叠而影响其功能, 而且糖链中不含具有致敏作用的α21, 32甘露糖, 使其使用更加安全。
巴斯德毕赤酵母
巴斯德毕赤酵母表达系统点击认领巴斯德毕赤酵母表达系统是近十年发展起来的真核表达体系,是目前最为成功的外源蛋白表达系统之一,与现有的其它表达系统相比,巴斯德毕赤酵母在表达产物的加工、外分秘、翻译后修饰以及糖基化修饰等方面有明显的优势,现已广泛用于外源蛋白的表达。
编辑摘要巴斯德毕赤酵母表达系统 - 简介十年代巴斯德毕赤酵母曾被用于生产单细胞蛋白(SCP),有很好的发酵基础,菌体密度可达100g/L干重。
其生长培养液的组分包括无机盐、微量元素、生物素、氮源和碳源,廉价而无毒。
它能在以甲醇为唯一碳源的培养基中快速生长,其中醇氧化酶AOX——甲醇代谢途径的关键酶可达细胞可溶性蛋白的30%。
而在葡萄糖、甘油或乙醇作为碳源的培养细胞中则检测不到AOX。
AOX的合成是在转录水平调控的。
其基因启动子具有明显的调控功能,可用于调控外源基因的表达。
此调控作用是由一般碳源抑制/解抑制及碳源特殊诱导又重机制控制的。
外源基因在甲醇以外的碳源中处于非表达状态,而在培养液中加入甲醇后,外源基因即被诱导表达。
巴斯德毕赤酵母中存在着一种称为微体的细胞器,其中大量合成过氧化物酶,因此也称为过氧化物酶体。
合成的蛋白质贮存于微体中,可免受蛋白酶的降解,且不对细胞产生毒害。
巴斯德毕赤酵母表达系统 - 毕赤酵母表达系统的特点自从1987年Cregg等首次用巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)作为宿主表达外源蛋白以来,作为一种新的高效的表达系统,毕赤酵母越来越引起人们的重视,到1995年,已有四十多种外源蛋白在该宿主菌中获得表达。
而最近几年每年报道的在毕赤酵母中表达的外源基因就有几十种,且一年比一年多,与其它表达系统相比,毕赤酵母表达系统具有以下优势:1)含有特有的强有力的AOX(醇氧化酶基因)启动子,用甲醇可严格地调控外源基因的表达;2)表达水平高,即可在胞内表达,又可分泌型表达。
毕赤酵母中,报道的最高表达量为破伤风毒素C为12g/l,一般大于1g/l。
酵母表达体系
酵母表达体系毕赤酵母是甲醇营养型,甲醇代谢的第一步是:醇氧化酶利用氧分子将甲醇氧化为甲醛和过氧化氢。
为避免过氧化氢的毒性,甲醛代谢主要在过氧化物酶体里进行,使得有毒的副产物远离细胞其余组分。
由于醇氧化酶与O2 的结合率较低,因而毕赤酵母代偿性地产生大量的酶。
而调控产生醇氧化物酶的启动子也正是驱动外源基因在毕赤酵母中表达的启动子。
毕赤酵母含有两种醇氧化物酶,AOX1 AOX2。
细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1 基因产物。
甲醇可紧密调节、诱导 AOX1 基因的高水平表达,为Mut+菌株,可占可溶性蛋白的30%以上。
AOX2 基因与AOX1 基因有97%的同源性,但在甲醇中带AOX2 基因的菌株比带AOX1 基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts 菌株。
毕赤酵母表达外源蛋白:分泌型和胞内表达。
利用含有α因子序列的分泌型载体即可。
翻译后修饰:酿酒酵母与毕赤酵母大多数为N-连接糖基化高甘露糖型,毕赤酵母中蛋白转录后所增加的寡糖链长度(平均每个支链8-14 个甘露糖残基)比酿酒酵母中的(50-150 个甘露糖残基)短得多。
菌株:GS115 ( Mut+, Muts)和 KM71(Muts)分泌型载体:pPICZα A,B,and C(5’AOX1启动子,紧密型调节,甲醇诱导表达,α分泌信号介导的分泌表达,Zeocin抗性基因,C端含有6XHis标签)胞内表达型载体:pPICZ A,B,and C,一:分子克隆1.设计引物分泌型载体图谱:见酵母表达说明书(p13-pPICZ A,p14-pPICZ B,p15-pPICZ C)2.PCR扩增基因PCR反应体系(50μl)模板DNA 1μlForward Primer(10μM)1μlReverse Primer(10μM)1μldNTP Mixture(各2mM): 4μl5×PrimerSTAR buffer(Mg2+ plus)10μlPrimerSTAR DNA Polymerase 0.5μlddHO up to 50μl2PCR 反应流程预变性98℃ 2min变性98℃ 10sec退火56℃ 10sec 30个循环延伸72℃ 30sec完全延伸72℃ 10min保存4℃3.双酶切及其回收双酶切反应体系(40μl)DNA(空载体或目的基因) 30μlBamHⅠ 1.5μlXholⅠ 1.5μl10×Buffer K 4.0μl4.酶连接首先利用1%的琼脂糖电泳将双酶切后的PCR产物和载体进行分离,并通过胶回收试剂盒回收,按照目的基因和空载体的碱基摩尔比在1:3--1:9之间,一共吸取目的基因和空载体的总体积为5μl,在加入等量的5μl DNA快速连接试剂盒SolutionⅠ,16℃连接4-6h。
毕赤酵母表达系统资料整理
毕赤酵母表黑系统之阳早格格创做Mut+战Muts毕赤酵母中有二个基果编码醇氧化酶——AOX1及AOX2,细胞中大普遍的醇氧化酶是AOX1基果产品,甲醇可稀切安排、诱导AOX1基果的下火仄表黑,较典型的是占可溶性蛋黑的30%以上.AOX1基果调控分二步:压制/去压制体制加诱导体制.简朴去道,正在含葡萄糖的培植基中,纵然加进诱导物甲醇转录仍受压制.为此,用甲醇举止劣化诱导时,推荐正在苦油培植基中培植.注意纵然正在苦油中死少(去压制)时,仍缺乏以使AOX1基果达到最矮火仄的表黑,诱导物甲醇是AOX1基果可辨表黑火仄所必须的.AOX1基果已被分散,含AOX1开用子的量粒可用去促进编码中源蛋黑的手段基果的表黑.AOX2基果与AOX1基果有97%的共源性,然而正在甲醇中戴AOX2基果的菌株比戴AOX1基果菌株缓得多,通过那种甲醇利用缓缓表型可分散Muts菌株.正在YPD(酵母膏、蛋黑胨、葡萄糖)培植基中,不管是Mut+仍旧Muts其正在对付数期删殖一倍的时间约莫为2h.Mut+战Muts菌株正在不甲醇存留的情况下死少速率是一般的,存留甲醇的情况下,Mut+正在对付数期删殖一倍的时间约莫为4至6个小时,Muts正在对付数期删殖一倍的时间约莫为18个小时.菌株GS115、X-33、KM71战SMD1168的辨别GS115、KM71战SMD1168等是用于表黑中源蛋黑的毕赤酵母受体菌,与酿酒酵母相比,毕赤酵母不会使蛋黑过糖基化,糖基化后有好处蛋黑的溶解或者产死粗确的合叠结构.GS115、KM71、SMD1168正在组氨酸脱氢酶位面(His4)有突变,是组氨酸缺陷型,如果表黑载体上携戴有组氨酸基果,可补偿宿主菌的组氨酸缺陷,果此不妨正在不含组氨酸的培植基上筛选变化子.那些受体菌自收突形成组氨酸家死型的概率普遍矮于10-8.GS115表型为Mut+,沉组表黑载体变化GS115后,少出的变化子大概是Mut+,也大概是Muts(载体与代AXO1基果),不妨正在MM战MD 培植基上审定表型.SMD1168战GS115类似,然而SMD1168基果组中的Pep4基果爆收突变,是蛋黑酶缺陷型,可落矮蛋黑酶对付中源蛋黑的落解效率.其中X-33由于是家死型,果此耐受性比较佳,如果担心变化率的话不妨思量那种酵母菌,而X33与GS115一般皆是属于MUT+表示型,也便是道不妨正在含甲醇的培植基中赶快死少,然而是传闻会对付中源基果表黑灵验率,KM71的亲原菌正在粗氨酸琥珀酸裂解酶基果(arg4)有突变,正在不含粗氨酸的培植基中不克不迭死少.用家死型ARG4基果(约2kb)拔出到克隆的家死型AOX1基果的BamHI(AOX1基果15/16暗号子)及SalI(AOX1基果227/228暗号子)位面,与代了AOX1基果16-227暗号子,此结构变化至KM71亲原菌(arg4his4)中,分散爆收KM71 MutsArg+His-菌株,Arg+变化子遗传领会隐现家死型AOX1被aox1::ARG4结构所与代,所以KM71所有变化子皆是Muts表型.AOX1位面不被真足缺得,表面上可用您的手段结构通过基果与代要领替换aox1::ARG4结构,那样沉组菌株的表型是His+MutsArg-,那表示着沉组菌株死万古需粗氨酸.然而仅增加粗氨酸本去不克不迭真足缓战arg4突变的效率,arg4菌株正在含粗氨酸的最小培植基中不克不迭很佳天死少.果此不推荐正在KM71中通过与代aox1::ARG4结构去赢得His+变化子.普遍去道,如果是胞内表黑,应尽管用Muts细胞,那样得到的蛋黑产品中醇氧化酶蛋黑量较少而手段蛋黑量相对付较多,使下游杂化更易举止.而对付于分泌蛋黑的表黑,无论是甲醇利用缓(Muts)仍旧甲醇利用快(Mut+)的细胞皆可应用.基果沉组Pichia.pastoris酵母菌体内无天然量粒,所以表黑载体需与宿主染色体爆收共源沉组,将中源基果表黑框架调整于染色体中以真止中源基果的表黑,包罗开用子、中源基果克隆位面、末止序列、筛选标记表记标帜等.细菌内共源沉组被认为是沉组量粒构修历程的易面,果为已线性化的环状量粒之间爆收共源沉组的几率非常矮,所以沉组变化载体必须用特定的节制性内切酶举止线性化处理.那种处理的手段是预防随机拔出沉组时量粒正在功能区断开,制成手段基果表黑得活,让共源沉组以指定的办法爆收.表黑载体主要分为以下几类:(1)胞内表黑载体主要有pHIL-D2、pA0815、pPIC3K、pPICZ、pHWO10,pGAPZ、pGAPZa(Invitrogen)等.该类载体不妨将手段基果表黑正在胞内,不妨预防毕赤酵母的糖基化,主要符合于那些不克不迭被糖基化相闭基果的表黑;(2)分泌型表黑载体主要有pPIC9、pHIL-S1、pPICZα、pYAM75P等.由于毕赤酵母自己的泌内源蛋黑非常少,将中源蛋黑分泌到胞中,非常有好处手段蛋黑量的杂化及聚集.时常使用的分泌的旗号序列主假如由89个氨基酸组成的α接配果子(α-factor)的带领;(3)多拷贝拔出表黑载体如pPIC9K,pPIC3.5K.正在某些情况下,毕赤酵母中沉组基果多拷贝调整可减少所需蛋黑的表黑量.该载体均可用于正在体内(pPIC3.5K, pPIC9K)或者体中(pAO815)爆收并分散多拷贝拔出,共时可检测减少沉组基果的拷贝数是可减少蛋黑表黑量.体内调整可通过下遗传霉素抗性筛选大概的多拷贝拔出,而体中调整可通过对接爆收中源基果的串联拔出.正在GS115中筛选His+Mut+变化子:用SalI或者StuI线性化量粒变化GS115后,大多正在His4位面上爆收沉组,大普遍变化子是Mut+表型;然而由于量粒含有AOX1基果序列,有大概正在AOX1位面爆收沉组,损害家死型AOX1基果,爆收His+Muts变化子,则需要正在MD及MM仄板上检测可证据His+ Mut+变化子.毕赤酵母表黑时常使用培植基10×YNB(13.4%的无氨基酸酵母氮源),134gYNB固体溶于1L蒸馏火,过滤灭菌,4℃保存.YPD真足培植基:酵母提与物10 g/L,蛋黑胨20 g/L,葡萄糖20 g/L(固体培植基含1.5%琼脂).变化培植基RDB:每100mL加进山梨醇18g(186 g/L),琼脂糖2g(20g/L)121℃灭菌20分钟,而后待温度落至60℃以去正在超洁台上加进10×YNB 10mL(13.4 g/L),10×葡萄糖10mL(20 g/L),500×死物素0.2mL(4×10-4g/L),100×AA 1mL.混匀,倒仄板(灭菌时只加进80ml火即可).采用培植基MD(最小葡萄糖):配100mL,背80mL火中加进琼脂糖2g(20 g/L)121℃灭菌20分钟,待温度落至60℃以去正在超洁台上加进10×YNB10mL(13.4 g/L),10×葡萄糖10mL(20 g/L),500×死物素0.2mL(4×10-4g/L).采用培植基MM(最小甲醇):配100mL,背90mL火中加进琼脂糖2g(20 g/L) 121℃灭菌20分钟,待温度落至60℃以去正在超洁台上加进10×YNB 10mL(13.4 g/L),500×死物素0.2mL(4×10-4g/L),0.5mL甲醇(0.5%).诱导表黑培植基BMGY:配1L,酵母提与物10 g/L,蛋黑胨20 g/L,3g/L K2HPO4,11.8g/L KH2PO4,加火至890mL,121℃灭菌20分钟,而后待温度落至60℃以去正在超洁台上加进10×YNB 100mL(13.4 g/L),500×死物素1mL(4×10-4g/L),苦油10mL.诱导表黑培植基BMMY:酵母提与物10g/L,蛋黑胨20 g/L,3g/LK2HPO4,11.8g/L KH2PO4,加火至895mL,121℃灭菌20分钟,而后待温度落至60℃以去正在超洁台上加进100×YNB 100mL(13.4 g/L),500×死物素1mL(4×10-4g/L),甲醇5mL.BMGY/BMMY含酵母浸出物及蛋黑胨,可宁静分泌蛋黑,遏止或者缩小分泌蛋黑的领会.如果手段蛋黑对付中性PH蛋黑酶敏感的话,可正在无缓冲培植基(MGY、MM)中表黑.如果不凭证道明您的分泌蛋黑对付中性PH 值蛋黑酶敏感,修议开初表黑时用BMMY.如果表黑蛋黑落解了,测验考查正在无缓冲培植基中举止表黑.如果以上条件仍不克不迭灵验预防蛋黑落解,可将基果转进SMD1168中,该菌株表型是his4pep4,缺得了蛋黑酶,变化与表黑步调与GS115相共,也可用于大规模收酵.用考马斯明蓝G-250测蛋黑含量。
biogrammatics—糖基化毕赤酵母表达体系
一、引言近年来,研究表明糖基化在生物体内扮演了重要的角色,对于细胞生殖、发育、信号传导等生物功能具有重要影响。
糖基化毕赤酵母是一种广泛应用的表达宿主,其表达系统在研究和工业生产中具有重要的应用价值。
本文将对糖基化毕赤酵母表达体系进行系统介绍,并深入探讨其在生物学和工业领域的应用前景。
二、糖基化毕赤酵母表达体系的构建1.构建原理糖基化毕赤酵母表达体系的构建主要基于毕赤酵母本身的细胞生物学特性和代谢途径。
通过对毕赤酵母细胞进行基因工程改造,使其能够表达特定的糖基化相关酶,从而实现目标蛋白的糖基化修饰。
2.基因工程技术利用CRISPR/Cas9等基因编辑技术,可将糖基化相关基因导入毕赤酵母细胞内,实现对其表达系统的改造。
引入携带目标基因的质粒,使其在毕赤酵母细胞内得到高效表达。
三、糖基化毕赤酵母表达体系的优势1.高效表达糖基化毕赤酵母表达体系具有较高的表达能力,能够在短时间内获得大量的目标蛋白。
2.糖基化修饰由于毕赤酵母细胞内具有完善的糖基化代谢途径,其表达的目标蛋白可以实现多种糖基化修饰,包括N-糖基化、O-糖基化等。
3.生物相容性糖基化毕赤酵母表达体系产生的目标蛋白,在生物学活性和免疫原性上具有良好的生物相容性,适合用于生物学研究和药物生产。
四、糖基化毕赤酵母表达体系的应用前景1.生物学研究糖基化毕赤酵母表达体系为生物学研究提供了良好的工具,可用于合成糖基化修饰的重组蛋白,从而探究其在细胞生物学和生理学上的功能。
2.药物研发许多药物的疗效和副作用与其糖基化状态密切相关,利用糖基化毕赤酵母表达体系可以生产具有特定糖基化修饰的药物蛋白,为药物研发提供了新的途径。
3.工业生产糖基化毕赤酵母表达体系在工业生产中具有重要应用潜力,可用于大规模生产糖基化修饰的工业酶、药物蛋白等。
五、总结糖基化毕赤酵母表达体系作为一种重要的细胞表达宿主,具有较高的表达效率和糖基化修饰能力,其在生物学和工业领域具有广阔的应用前景。
毕赤酵母表达系统(学习资料)
毕赤酵母表达系统前言:所用表达质粒有pPIC3.5K,pAO815用于胞内表达,而pPIC9K用于分泌表达,所有载体均利用AOX1启动子来诱导高水平表达。
抗性选择:最有效的筛选遗传霉素抗性及高抗性克隆的程序需要先对HIS+转化子进行选择,再进行不同水平遗传霉素抗性筛选。
毕赤菌株表型:毕赤酵母菌GS115 及KM71 在组氨酸脱氢酶位点(His4)有突变,因而不能合成组氨酸,所有表达质粒都有HIS4 基因可与宿主进行互补,通过不含组氨酸的培养基来选择转化子。
GS115 及KM71都可在复合培养基如YPD(YEPD)及含组氨酸的最小培养基中生长。
转化之前,GS115 及KM71 都不能在最小培养基中生长,因为它们是His-。
培养温度:毕赤酵母生长温度为28-30度(液体、平板、斜面)。
在32 度以上诱导生长时,对蛋白表达有害,甚至会导致细胞死亡。
贮存:贮存细胞几周或几月,用YPD培养基或YPD 琼脂斜面1 挑取所需菌株单克隆在YPD 平板上划线生长;2 挑取单克隆转移至YPD进行穿刺培养,30 度2 天;3 细胞在4 度可放几周几月或几年,存于-80度1 挑取所需菌株单克隆在YPD 中过夜培养;2 收集细胞,在含15%甘油的YPD 中悬浮至终OD600 为50-100(大约2.5-5.0×109细胞/ml);3 细胞先用液氮或干冰/酒精浴中冰冻再贮存于-80 度。
注意:在4 度或-80 度长期保存后,用之前建议在MM、MD 或MGY 平板上划线培养以检测His+转化子的表型是否正确及其活力。
以质粒pPIC9K,酵母Pichia pastoris GS115为例说明做法。
载体pPIC9K酶切为点线性化质粒DNA:建议使用下列方法线性化载体以获得Mut+及Muts重组子,可能其中一个会比另一个更利于表达多拷贝重组子。
如果只想得到Muts重组子,使用KM71 菌株。
单个十字交换事件可比双重十字交换更容易、更有效地获得Muts重组菌(例如:插入A OX1或his4 而不是取代AOX1)。
毕赤酵母表达系统资料整理
毕赤酵母表达系统Mut+和Muts毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶一一AOX1及AOX2,细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1基因产物,甲醇可紧密调节、诱导AOX1基因的高水平表达,较典型的是占可溶性蛋白的30%以上。
AOX1基因调控分两步:抑制/去抑制机制加诱导机制。
简单来说,在含葡萄糖的培养基中,即使加入诱导物甲醇转录仍受抑制。
为此,用甲醇进行优化诱导时,推荐在甘油培养基中培养。
注意即使在甘油中生长(去抑制)时,仍不足以使AOX1基因达到最低水平的表达,诱导物甲醇是AOX1基因可辨表达水平所必需的。
AOX1基因已被分离,含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的基因的表达。
AOX2基因与AOX1基因有97%的同源性,但在甲醇中带AOX2基因的菌株比带AOX1基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts菌株。
在YPD(酵母膏、蛋白月东、葡萄糖)培养基中,不论是Mut+还是Muts其在对数期增殖一倍的时间大约为2h。
Mut+和Muts菌株在没有甲醇存在的情况下生长速率是一样的,存在甲醇的情况下,Mut+在对数期增殖一倍的时间大约为4至6个小时,Muts在对数期增殖一倍的时间大约为18个小时。
菌株GS115、X-33、KM71和SMD1168的区别GS115、KM71和SMD1168等是用于表达外源蛋白的毕赤酵母受体菌,与酿酒酵母相比,毕赤酵母不会使蛋白过糖基化,糖基化后有利于蛋白的溶解或形成正确的折叠结构。
GS115、KM71、SMD1168在组氨酸脱氢酶位点(His4)有突变,是组氨酸缺陷型,如果表达载体上携带有组氨酸基因,可补偿宿主菌的组氨酸缺陷,因此可以在不含组氨酸的培养基上筛选转化子。
这些受体菌自发突变为组氨酸野生型的概率一般低于10-8oGS115表型为Mut+,重组表达载体转化GS115后,长出的转化子可能是Mut+,也可能是Muts(载体取代AXO1基因),可以在MM和MD培养基上鉴定表型。
毕赤酵母表达手册(详细)
毕赤酵母表达(pichia pastoris expression )实验手册2010-07-15 10:54:56| 分类:毕赤酵母| 标签:|字号大中小订阅一.毕赤酵母表达常用溶液及缓冲液的配制二.毕赤酵母表达的培养基配制三.主要试验环节的操作 3.1 酵母菌株的分离纯化 3.2 pPICZαA原核宿主菌TOP10F’的活化培养 3.3毕赤酵母表达的试验方法 3.4 毕赤酵母电转化方法 3.5 Pichia酵母表达直接PCR鉴定重组子的方法 3.6 毕赤酵母基因组提取方法 3.7 Mut+表型重组酵母的诱导表达实验关键词:酵母实验毕赤酵母表达 pichia pastoris expression 毕赤酵母酵母菌株大肠杆菌表达系统最突出的优点是工艺简单、产量高、周期短、生产成本低。
然而,许多蛋白质在翻译后,需经过翻译后的修饰加工,如磷酸化、糖基化、酰胺化及蛋白酶水解等过程才能转化成活性形式。
大肠杆菌缺少上述加工机制,不适合用于表达结构复杂的蛋白质。
另外,蛋白质的活性还依赖于形成正确的二硫键并折叠成高级结构,在大肠杆菌中表达的蛋白质往往不能进行正确的折叠,是以包含体状态存在。
包含体的形成虽然简化了产物的纯化,但不利于产物的活性,为了得到有活性的蛋白,就需要进行变性溶解及复性等操作,这一过程比较繁琐,同时增加了成本。
大肠杆菌是用得最多、研究最成熟的基因工程表达系统,当前已商业化的基因工程产品大多是通过大肠杆菌表达的,其主要优点是成本低、产量高、易于操作。
但大肠杆菌是原核生物,不具有真核生物的基因表达调控机制和蛋白质的加工修饰能力,其产物往住形成没有活性的包涵体,需要经过变性、复性等处理,才能应用。
近年来,以酵母作为工程菌表达外源蛋白日益引起重视,原因是与大肠杆菌相比,酵母是低等真核生物,除了具有细胞生长快,易于培养,遗传操作简单等原核生物的特点外,又具有真核生物时表达的蛋白质进行正确加工,修饰,合理的空间折叠等功能,非常有利于真核基因的表达,能有效克服大肠杆菌系统缺乏蛋白翻译后加工、修饰的不足。
毕赤酵母表达系统
毕赤酵母表达系统毕赤酵母表达系统前言:所用表达质粒有pPIC3.5K,pAO815用于胞内表达,而pPIC9K用于分泌表达,所有载体均利用AOX1启动子来诱导高水平表达。
抗性选择:最有效的筛选遗传霉素抗性及高抗性克隆的程序需要先对HIS+转化子进行选择,再进行不同水平遗传霉素抗性筛选。
毕赤菌株表型:毕赤酵母菌GS115 及KM71 在组氨酸脱氢酶位点(His4)有突变,因而不能合成组氨酸,所有表达质粒都有HIS4 基因可与宿主进行互补,通过不含组氨酸的培养基来选择转化子。
GS115 及KM71都可在复合培养基如YPD(YEPD)及含组氨酸的最小培养基中生长。
转化之前,GS115 及KM71 都不能在最小培养基中生长,因为它们是His-。
培养温度:毕赤酵母生长温度为28-30度(液体、平板、斜面)。
在32 度以上诱导生长时,对蛋白表达有害,甚至会导致细胞死亡。
贮存:贮存细胞几周或几月,用YPD培养基或YPD 琼脂斜面1 挑取所需菌株单克隆在YPD 平板上划线生长;2 挑取单克隆转移至YPD进行穿刺培养,30 度2 天;3 细胞在4 度可放几周几月或几年,存于-80度1 挑取所需菌株单克隆在YPD 中过夜培养;2 收集细胞,在含15%甘油的YPD 中悬浮至终OD600 为50-100(大约2.5-5.0×109细胞/ml);3 细胞先用液氮或干冰/酒精浴中冰冻再贮存于-80 度。
注意:在4 度或-80 度长期保存后,用之前建议在MM、MD 或MGY 平板上划线培养以检测His+转化子的表型是否正确及其活力。
以质粒pPIC9K,酵母Pichia pastoris GS115为例说明做法。
载体pPIC9K酶切为点线性化质粒DNA:建议使用下列方法线性化载体以获得Mut+及Muts重组子,可能其中一个会比另一个更利于表达多拷贝重组子。
如果只想得到Muts 重组子,使用KM71 菌株。
单个十字交换事件可比双重十字交换更容易、更有效地获得Muts 重组菌(例如:插入AOX1或his4 而不是取代AOX1)。
巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)表达系统综述
毕赤酵母启动子以及诱导物
启动子 诱导表达 AOX1,AOX2(甲醇氧化酶) 以甲醇诱导表达 GAP (3 一磷酸甘油醛脱氢酶) 葡萄糖组成型 表达(甘油或甲醇诱导产量只有2/3,1/3) FLD1(甲醛脱氢酶) 以甲基化胺为氮源 (葡萄 糖为碳源),甲醇为碳源 (硫酸铵为氮源)表达 PEX8(过氧化物酶体基质蛋白) 以葡萄糖、 甲醇诱导表达 YPT1(GTP酶) 以葡萄糖甲醇、甘露糖醇组 成型表达
外源蛋白在巴斯德毕赤酵母中的 表达种类
具有代表性的如下列一些外源蛋白质P.pastoris中已经获得高效产 生: (1)蛋白酶类,如人溶菌酶、人胃促胰酶、葡萄糖苷酶等; (2)激素类,如胰岛素前体、人绒毛膜促性腺激素、鲤鱼生长激 素等; (3)受体、抗体及单链抗体等生物活性蛋白; (4)抗原类,如乙型肝炎表面抗原、破伤风毒素片段C、登革热病 毒E蛋白等; (5)细胞因子类,如肿瘤坏死因子、表皮生长因子、血管生成抑制 因子等; (6)酶制剂类,如植酸酶等; (7)病毒蛋白类,如乙型脑炎病毒E蛋白、伪狂犬病病毒Ea株gE蛋 白等
毕赤酵母的优点
利用受甲醇诱导的醇氧化酶(AOX1)启动子,可严格 控制外源基因的表达
营养要求简单,生长快速,适合高密度大规模培养, 很少产生有毒物质,毒性比细菌小,用甲醇不易染菌, 可以减少污染。 外源蛋白基因遗传高稳定性,外源蛋白质具有一定程 度上的折叠加工和糖基化修饰,性质较原核表达的蛋 白质更加稳定,特别适合于表达真核生物基因和制备 有功能的蛋白质。
毕赤酵母发酵工艺对产量的影响
甲醇营养型毕赤酵母表达外源蛋白发酵一般有二个阶 段,即酵母细胞营养生长阶段和外源蛋白表达阶段。 酵母细胞生长阶段主要目的为达到一定的菌体量,另 一方面通过流加限制甘油来抑制甲醇代谢途径,并使 细胞从甘油相顺利向甲醇相过渡。 蛋白表达阶段由于毕赤酵母具有以甲酵作为唯一碳源 和能源的特性,且外源基因就插入在能够利用甲醇的 AOX基因中,当甘油用完时立刻补入甲醇诱导AOX基 因产生醇氧化酶来利用甲醇,同时启动表达外源基因 的AOX的启动子(PAOX)表达外源基因蛋白
毕赤酵母表达系统简介
巴斯德毕赤酵母及启动子1.1 毕赤酵母表达系统简介随着蛋白异源表达的飞速发展,越来越多的表达系统被建立并得到应用。
酵母作为单细胞真核生物,因具有比较完备的基因表达调控机制和对表达产物的加工修饰能力,仍表现出不可比拟的优势。
以甲醇营养型酵母(Methylotrophic yeast)-毕赤酵母为代表的第二代酵母表达系统,是近年来被公认的最有效的外源蛋白表达系统之一,已有多种外源蛋白在该宿主系统中获得了成功表达[1]。
作为生产外源蛋白的重要宿主菌,依靠其各种不同功能的表达载体,已经得到广泛的应用。
表达的蛋白质包括酶、膜蛋白、抗原、抗体和调节蛋白等[2,3]。
毕赤酵母(Pichia pastoris)表达系统是近年来发展迅速、应用广泛的一种真表达系统。
它是甲醇营养型酵母菌,有两个乙醇氧化酶(alcohol oxidase,Aox)码基因AOX1和AOX2,两者序列相似,AOX1基因严格受甲醇诱导和调控。
当甲醇为唯一碳源时,AOX1启动子可被甲醇诱导,启动乙醇氧化酶的表达,从而用甲醇进行代谢[4]。
含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的因的表达。
随着Invitrogen公司开发的一系列毕赤酵母表达试剂盒的应用,目前用该统已成功表达出了数以千计的来自细菌、真菌、原生动物、植物、无脊椎动物、包括人在内的脊椎动物以及病毒等的具有生物学功能的外源蛋白或蛋白结构[5,6]。
1.1.1 P.Pastoris表达载体及其元件由于毕赤酵母没有稳定的附加质粒,表达载体需与宿主染色体发生同源重组,外源基因表达框架整合于染色体中以实现外源基因的表达整合表达的优点在于保持外源基因稳定性并可产生多拷贝基因。
典型的毕赤氏酵母表达载体含有醇氧化酶基因的调控序列,主要的结构包括:5′AOX1启动子片段、多克隆位点(MCS)、转录终止和polyA形成基因序列(TT)、筛选标记(His4或Zeocin)、3′AOX1基因片段,作为一个能在大肠杆菌中繁殖扩增的穿梭质粒,它还有部分pBR322质粒或COLE1序列。
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Mut+ 和Muts
毕赤酵母中有两个基因编码醇氧化酶一一A0X1及A0X2细胞中大多数的醇氧化酶是AOX1基因产物,甲醇可紧密调节、诱导AOX1基因的高水平表达,较典型的是占可溶性蛋白的30%以上。
AOX1基因调控分两步:
抑制/去抑制机制加诱导机制。
简单来说,在含葡萄糖的培养基中,即使加入诱导物甲醇转录仍受抑制。
为此,用甲醇进行优化诱导时,推荐在甘油培养基中培养。
注意即使在甘油中生长(去抑制)时,仍不足以使AOX1基因达到最低水平的表达,诱导物甲醇是AOX1基因可辨表达水平所必需的。
AOX1基因已被分离,含AOX1启动子的质粒可用来促进编码外源蛋白的目的基因的表达。
AOX2基因与AOX1基因有97%的同源性,但在甲醇中带AOX2基因的菌株比带
AOX1基因菌株慢得多,通过这种甲醇利用缓慢表型可分离Muts菌株。
在YPD酵母膏、蛋白豚、葡萄糖)培养基中,不论是Mut+还是Muts其在对数期增殖一倍的时间大约为2h ° Mut+和Muts菌株在没有甲醇存在的情况下生长速率是一样的,存在甲醇的情况下,Mut+在对数期增殖一倍的时间大约为4至6个小时,Muts在对数期增殖一倍的时间大约为18个小时。
菌株GS
115 > X- 33、KM71 和SMD1168 的区另I]
GS
115、KM71和SMD1168等是用于表达外源蛋白的毕赤酵母受体菌,与酿酒酵母相比,毕赤酵母不会使蛋白过糖基化,糖基化后有利于蛋白的溶解或形成正确的折叠结构。
GS
115 > KM 71 ' SMD1168在组氨酸脫氢酶位点(His4)有突变,是组氨酸缺陷型,如果表
达载体上携带有组氨酸基因,可补偿宿主菌的组氨酸缺陷,因此可以在不含组氨酸的培养基上筛选转化子。
这些受体菌自发突变为组氨酸野生型的概率一般低于10-
8。
GS115表型为Mut+,重组表达载体转化GS115后,长出的转化子可能是
Mut+,也可能是Muts (载体取代AX01基因),可以在MM和MD培养基上鉴定表型。
SMD1168和GS115类似,但SMD1168基因组中的Pep4基因发生突变,是蛋白酶缺陷型,可降低蛋白酶对外源蛋白的降解作用。
其中X-33由于是野生型,因此耐受性比较好,如果担心转化率的话可以考虑这种酵母菌,而X33与GS115 —样都是属于MUT+表现型,也就是说可以在含甲醇的培养基中快速生长,但是据说会对外源基因表达有影响,KM71的亲本菌在精氨酸琥珀酸裂解酶基因(arg4)有突变,在不含精氨酸的培养基中不能生长。
用野生型ARG4基因(约2kb)插入到克隆的野生型AOX1基因的BamHI (A0X1基因密码子)及Sall (AOX1基因密码子)位点,取代了AOX1基因16-227密码子,此结构转化至KM71亲本菌(arg4his4)中,分离产生KM71 MutsArg+His菌株,Arg+ 转化子遗传分析显示野生型AOX1被aox1::
ARG4结构所取代,所以KM71所有转化子都是Muts表型。
AOX1位点没有被完全缺失,理论上可用你的目的结构通过基因取代方法替换aox1::
ARG4结构,这样重组菌株的表型是His+MutsArg-,这意味着重组菌株生长时
需精氨酸。
但仅添加精氨酸并不能完全缓和arg4突变的影响» arg4菌株在含
精氨酸的最小培养基中不能很好地生长。
因此不推荐在KM71中通过取代aox1::
ARG4结构来获得His +转化子。
一般来说,如果是胞内表达,应尽量用Muts细胞,这样得到的蛋白产物中醇氧化酶蛋白量较少而目的蛋白量相对较多,使下游纯化更易进行。
而对于分泌蛋白的表达,无论是甲醇利用慢(Muts)还是甲醇利用快(Mut+)的细胞都可应用。
基因重组
Pichia.pastoris酵母菌体内无天然质粒,所以表达载体需与宿主染色体发生同源
重组,将外源基因表达框架整合于染色体中以实现外源基因的表达,包括启动子、外源基因克隆位点、终止序列、筛选标记等。
细菌内同源重组被认为是重组质粒构建过
程的难点,因为未线性化的环状质粒之间发生同源重组的几率非常低,所以重组转移载体必须用特定的限制性内切酶进行线性化处理。
这种处理的目的是防止随机插入重组时质粒在功能区断开,造成目的基因表达失活,让同源重组以指定的方式发生。
表达载体主要分为以下几类:
(1) 胞内表达载体主要有PHIL-
D2、p
A0815、pPIC3K pPICZ pHWOlO, pGAPZ pGAPZa(lnvitrogen 等。
该类载体可
以将目的基因表达在胞内,可以避免毕赤酵母的糖基化,主要适合于那些不能被糖基化相尖基因的表达;
(2) 分泌型表达载体主要有pPI
C9、pHIL-S
1、pPICZ a pYAM75P等。
由于毕赤酵母本身的泌内源蛋白非常少,将外源蛋白分泌到胞外,非常有利于目的蛋白质的纯化及积累。
常用的分泌的信号序列主要是由89个氨基酸组成的a交配因子(a-factor)的引导;
(3) 多拷贝插入表达载体如PPIC9K,pPI
C3.5K。
在某些情况下,毕赤酵母中重组基因多拷贝整合可增加所需蛋白的表达量。
该载体均可用于在体内(PPI
C3.5K大多数转化子是Mut+表型;然而由于质粒含有AOX1基因序列,有可能在AOX1位点发生重组,破坏野生型AOX1基因,产生His+Muts转化子,则需要在MD及MM平板上检测可证实His+ Mut+转化子。
线性化酶切位点插入事件GS115表型KM71表型
His+Mut+His+Muts
Sall 或Stul 插入his4
Sacl 插入5’ A0X1 His+Mut+His+Muts
Bglll 取代AOX1His+MutsHis+Muts 不推荐)
xx酵母表达常用培养基
10x YNB(
13.4%的无氨基酸酵母氮源),134gYNB固体溶于1L蒸馆水,过滤灭菌,4C保存。
YPD完全培养基:
酵母提取物10g/L,蛋白陈20 g/L,葡萄糖20 g/L(固体培养基含
1.5%xx)。
转化培养基RDB :
每10OmL加入Lh梨醇18g(186 g/L),琼脂糖2g(20g/L)12lC灭菌20分钟,然后待温度降至60C以后在超净台上加入10x YNB 10mL(
13.4 g/L), 10 >葡萄糖10mL(20 g/L), 500 X生物素
0.2mL(4 x 10-4g/L)100 x AA1mL混匀,倒平板(灭菌时只加入80ml水即可)。
选择培养基MD (最小葡萄糖):
配100mL,向80mL水中加入琼脂糖2g(20g/L)12lC灭菌20分钟,待温度降至60C以后在超净台上加入10X YNB 10mL(
13.4 g/L), 10 >葡萄糖10mL(20 g/L), 500 X生物素
0.2mL(4 x 10-4g/L)
选择培养基MM(最小甲醇):
配100mL,向90mL水中加入琼脂糖2g(20 g/L) 12TC灭菌20分钟,待温度降至60C以后在超净台上加入10X YNB 10mL(
13.4 g/L),500〉生物素
0.2mL(4 x 10-4g/L)
0.5mL甲醇( 0.5%)。
诱导表达培养基BMGY :
配亿,酵母提取物10g/L,蛋白B 20 g/L, 3g/L K
2HPO
4,
11.8g/L KH
2PO
4,加水至890mL, 121 C灭菌20分钟,然后待温度降至60C以后在超净台上加入10xYNB100mL(
13.4g/L), 500 Xfe 物素1 mL(4 x 10-4g//)甘油10mL。
诱导表达培养基BMMY :
酵母提取物10g/L,蛋白豚20g/L, 3g/LK
2HPO
4,
11.8g/LKH
2PO
4,加水至895mL, 121C灭菌20分钟,然后待温度降至60C以后在超净台上加入100X YNB100mL(
13.4g/L), 500 座物素1mL(4 x 10・4g/,甲醇5mL。
BMG Y/BMMY含酵母浸出物及蛋白月东,可稳定分泌蛋白,阻止或减少分泌蛋白
的分解°如果目的蛋白对中性PH蛋白酶敏感的话,可在无缓冲培养基(MGY、MM)中表达。
如果没有证据证明你的分泌蛋白对中性RH值蛋白酶敏
感,建议开始表达时用BMMY o如果表达蛋白降解了,尝试在无缓冲培养基中进行表达°如果以上条件仍不能有效防止蛋白降解,可将基因转入SMD1168中,该菌株表型是his4pep4 ‘缺失了蛋白酶,转化与表达程序与GS115相同,也可用于大规模发酵。
、
用考xxxxG-250测蛋白含量。