基因芯片技术及其应用
基因芯片技术及其应用
基因芯片技术及其应用随着生物学、生命科学的发展,基因芯片技术越来越受到关注。
基因芯片又称为DNA芯片,是一种利用微阵列技术来检测基因表达水平的高通量方法。
基因芯片技术的发展带来了许多应用领域的新成果,包括疾病预测、药物研发等。
本文将介绍基因芯片技术及其应用。
一、基因芯片技术的原理基因芯片技术是一种高通量的生物技术,它利用微阵列生物芯片来检测基因表达的水平。
这种技术利用了DNA分子的特异性与完整性,它可以在任何生物样品中高效地检测出其蛋白质表达水平和基因组变异情况。
基因芯片技术的工作原理基于蛋白质表达水平与基因组变异情况的探测。
首先,需要将基因DNA序列通过逆转录过程转换成mRNA序列,进而使用荧光标记标记mRNA序列。
接下来将标记好的mRNA序列通过微阵列技术固定到芯片上,并使用高通量扫描技术来观察标记后荧光强度的变化程度。
荧光值越高,则说明该基因表达水平越高。
基因芯片技术不仅可以检测基因表达水平,还可以检测基因序列的变异情况,用于了解某种疾病或细胞状态的基因组变化情况。
比如,可以用这种技术针对某种疾病相关的单核苷酸多态性位点检测基因变异情况。
二、基因芯片技术的应用1. 癌症筛查基因芯片技术可用于癌症筛查,将肿瘤组织中的RNA与正常细胞组织的RNA进行比较,寻找表达水平具有显著差别的基因,进而确定这些基因是否与癌症发展相关。
利用这种方法可以更加准确地判断某个癌症的种类、发展程度等。
2. 个性化药物设计基因芯片技术可用于个性化药物设计,通过基因芯片可以确定某个病人,是否会对某种药物产生不良反应,从而确定是否使用该药物。
同时,可以利用基因芯片技术根据病人的基因组变异情况,设计出一种更加适合该病人的药物。
3. 遗传疾病筛查基因芯片技术可用于遗传疾病筛查,利用基因芯片技术可以检测出某些基因的表达水平是否异常,从而确定在某些疾病中,基因的表达水平是否存在异常。
4. 农业和环保应用基因芯片技术不仅可以应用在医学领域,还可以应用于农业和环保领域,例如种植业、畜牧业、水产养殖业等。
基因芯片技术的应用
基因芯片技术的应用随着生物技术和基因研究的不断进展,基因芯片技术已经广泛应用于生物医学、农业、动植物繁殖、环境保护等领域。
本文将从基因芯片技术的原理、应用场景和前景展开阐述,探讨该技术的研究热点和发展趋势。
一、基因芯片技术的原理基因芯片是一种利用高通量技术同时检测成千上万个基因表达的工具。
它通过利用DNA技术将成千上万的基因DNA序列固定在玻璃芯片上,并可检测目标样本中RNA或cDNA的水平。
基因芯片技术主要包括以下步骤:1. 设计芯片:确定目标基因序列,利用计算机技术进行芯片设计,制备出针对目标基因甚至全基因组的芯片。
2. 样本制备:提取RNA或cDNA,并借助反转录技术将RNA 转化成cDNA,再对其进行扩增。
3. 杂交:采用特殊设备将目标样本中的cDNA标记为不同颜色的探针,与芯片表面的DNA序列杂交。
4. 扫描和分析:利用激光扫描装置对芯片表面进行扫描,测量复合体的强度,并进行统计和分析。
这样,我们就能够在一张小芯片上探测到成千上万个基因,分析并比较样本之间的差异,从而揭示出基因调控、信号传递和代谢途径等生物学特征。
二、基因芯片技术的应用场景基因芯片技术的应用范围极广,以下列举几种典型场景:1. 生物医学基因芯片技术在生物医学领域中主要用于诊断和治疗基因相关疾病。
例如,我们能够将基因芯片应用于肿瘤分型和分级、遗传性疾病的基因筛查、药物研发等方面。
此外,基因芯片技术还可以为个体化医学提供技术支持,为临床医生制定精准个体化治疗方案提供重要依据。
2. 农业基因芯片技术的应用在土地的病虫害监测、作物品种鉴定、转基因食品检测等方面具有重要意义。
例如,在生产实践中,农民们经常遭受由于病虫害带来的经济损失,而基因芯片技术能够帮助他们快速诊断设备,确定病虫害的种类和数量,从而更好地进行管理和防范。
3. 环境保护环境污染问题已经成为全球性的挑战,而基因芯片技术则为环境保护带来了新的手段。
例如,通过检测微生物的基因组DNA,我们可以了解大气、水环境以及土壤中的微生物种类组成状况,协助我们了解生态系统的状况和进行环境监测。
基因芯片技术及其应用(精)
基因芯片技术及其应用(精)基因芯片技术及其应用李家兴1001080728 园艺107基因芯片( gene chip, DNA chip, DNA microarray 又被称为DNA芯片、DNA微阵列和生物芯片, 是指以大量人工合成的或应用常规分子生物学技术获得的核酸片段作为探针, 按照特定的排列方式和特定的手段固定在硅片、载玻片或塑料片上, 一个指甲盖大小的芯片上排列的探针可以多达上万个[1- 3]。
在使用时,先将所研究的样品标记, 然后与芯片上的寡聚核苷酸探针杂交,再用激光共聚焦显微镜等设备对芯片进行扫描, 配合计算机软件系统检测杂交信号的强弱, 从而高效且大规模地获得相关的生物信息。
此项技术将大量的核酸分子同时固定在载体上, 一次可检测分析大量的DNA和RNA, 解决了传统核酸印迹杂交技术复杂、自动化程度低、检测目标分子数量少、成本高、效率低等的缺点[4]。
此外, 通过设计不同的探针阵列( array , 利用杂交谱重建DNA序列, 还可实现杂交测序( sequencing by hybridization,SBH [5]。
目前, 该技术在基因表达研究、基因组研究、序列分析及基因诊断等领域已显示出重要的理论和应用价值[6]。
1 基因芯片技术的产生和发展21 世纪将是生命科学的世纪, 基因芯片技术是近年产生的一项生物高新技术, 它将像计算机一样成为21 世纪即将来临的又一次新兴革命的奠基石[7,8]。
基因芯片技术的产生与发展与人类基因组计划(Human Genome Project, HGP 的研究密不可分[9]。
人类基因组的大量信息需要有一种快速、敏感、平行检测的技术,随着越来越多的基因被解码, 基因的功能研究成为迫切需要解决的课题。
在这一背景下, 以基因芯片技术为主体的生物芯片诞生了, 它被誉为是20 世纪90 年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一。
基因芯片技术充分结合灵活运用了寡核苷酸合成、固相合成、PCR 技术、探针标记、分子杂交、大规模集成电路制造技术、荧光显微检测、生物传感器及计算机控制和图像处理等多种技术, 体现了生物技术与其他学科相结合的巨大潜力。
基因芯片的原理和临床应用
基因芯片的原理和临床应用1. 引言基因芯片是一种用于检测和分析大量基因表达的工具,它在基因组学研究和临床诊断中起着重要的作用。
本文将介绍基因芯片的原理和其在临床应用中的重要性。
2. 基因芯片的原理基因芯片是一种微型实验室,在一个非常小的芯片上集成了数千到数百万个基因探针。
基因探针是一种能够与特定基因或RNA分子结合的DNA片段或RNA片段。
基因芯片通过检测这些基因探针与样本中的基因或RNA分子的结合程度,来确定基因表达水平的高低。
基因芯片通常包括两个主要部分:探针和样本。
探针是在芯片上固定的DNA或RNA片段,用于特异性识别样本中的基因或RNA分子。
样本是待检测的基因或RNA样品。
当样本与探针结合时,基因芯片可以精确地测量探针与样本中目标基因或RNA的结合程度。
这种结合程度的强弱可以反映基因的表达水平。
3. 基因芯片的工作流程基因芯片的工作流程可以分为以下几个步骤:3.1 采集样本首先,需要采集待检测的样本,样本可以是组织、血液、唾液等。
采集样本的同时,需要记录样本的相关信息,如年龄、性别、病史等。
3.2 样本预处理为了准确地检测基因表达水平,需要对样本进行预处理。
预处理包括样本的RNA或DNA提取、质量检测、纯化等步骤。
这些预处理步骤可以确保样本中的基因或RNA分子的完整性和纯度。
3.3 杂交反应杂交反应是基因芯片最关键的步骤之一。
在这一步骤中,样本中的RNA或DNA与芯片上的探针发生特异性结合。
这种结合通常发生在高温下,并伴随着一系列的洗涤步骤,以去除非特异性结合的分子。
3.4 荧光染色为了检测探针与样本中基因或RNA分子的结合程度,常常在芯片上采用荧光标记的方法。
荧光染料会与结合的探针形成复合物,并在芯片上产生荧光信号。
3.5 数据分析基因芯片的数据分析是整个基因芯片实验中最关键的一步。
数据分析包括信号强度的计算、背景噪声的去除、数据归一化等步骤。
通过这些步骤,可以生成基因表达矩阵,用于后续的数据挖掘和生物信息学分析。
基因芯片技术及其在生物医学中的应用
基因芯片技术及其在生物医学中的应用随着科技日益发展,基因芯片技术受到了越来越多的关注和重视,因为它可以对数万个基因进行分析,并在更短的时间内获取更准确的基因信息。
在现代生物医学领域中,基因芯片技术可以被应用到许多方面,如研究疾病的原因、制定诊断方案和治疗方案等。
一、基因芯片技术的原理基因芯片技术以小而微的芯片为载体,通过高通量的技术对芯片表面上的核酸探针进行检测,从而检查目标核酸(如DNA, RNA)的序列和表达谱。
这些芯片上一般会固定几万甚至几十万个寡核苷酸探针,用于检测样本中的基因、蛋白质、代谢物等。
二、基因芯片技术在疾病研究中的应用1. 研究肿瘤的发生和发展基因芯片技术可以用于研究肿瘤的发生和发展,它可以检测数千个基因的表达谱,并找到可能与肿瘤相关的基因。
这些信息可以帮助人们了解肿瘤的细胞生长、代谢、分化和凋亡等生理和病理过程,从而为研究肿瘤的治疗和预防提供重要的基础数据。
2. 帮助筛选新的药物靶标基因芯片技术可以帮助科学家筛选新的药物靶标。
例如,专家可以通过比较病人的肿瘤基因组和正常组织样本的基因组数据,找到与肿瘤相关的基因。
然后,研究人员可以进一步研究这些基因的功能,验证其与肿瘤形成过程的相关性。
这样,基因芯片技术可以帮助研究人员快速准确地找到可能用于开发新药物的分子靶标。
3. 帮助制定个性化医疗方案基因芯片技术也可以使用个体化医疗的方法。
通过使用基因芯片技术,医生可以获得患者的基因组数据,并根据这些数据来制定个性化的治疗方案。
例如,基因芯片可以检测基因突变和异常表达以确定治疗某种癌症所需的化疗药物,甚至可以在治疗开始之前查明是否存在的不良反应风险。
三、基因芯片技术在生殖医学中的应用1. 早期孕期检测基因芯片技术可以作为一种早期孕期检测手段,通过检测孕妇血液中游离DNA的含量来确定胚胎的健康状况,并预测是否存在胎儿染色体异常,如唐氏综合征等。
这种方法使用基因芯片可以快速、精确和无创地确定胚胎的染色体状态。
基因芯片技术在分子诊断中的应用
基因芯片技术在分子诊断中的应用随着科学技术的发展,分子诊断已经成为医学领域中的一种重要诊断方法。
而基因芯片技术作为高通量分子诊断手段之一,早已经在生物医学研究和临床诊断领域中得到了广泛应用。
本文将详细阐述基因芯片技术在分子诊断中的应用。
一.基因芯片技术的概述基因芯片技术是一种高通量生物分析技术,也称为DNA芯片技术、基因微阵列技术等。
它主要是利用印刷生物材料到集成电路芯片上的方法,来探测已知的DNA序列或RNA序列、蛋白质等分子信息。
基因芯片是由微型反应器制成的,具有高度自动化、高通量、快速、灵敏度高等优点。
利用基因芯片技术,我们可以快速鉴定和筛选目标物质,并得到更准确的筛选结果。
同时可以发现新的分子和与疾病相关的基因和蛋白质等信息,有助于病理研究和治疗。
二.基因芯片技术在临床前分子诊断中的应用1.基因芯片检测遗传疾病基因芯片技术可以快速而准确地鉴定人类遗传病变的基因。
通过了解哪些变异基因存在,我们可以更好地预测疾病风险,诊断疾病,并制定个性化的治疗方案。
此外,基因芯片在新生儿筛查中也有着广泛的应用,可以提前发现遗传疾病,为儿童的健康提供保障。
2.基因芯片检测肿瘤基因芯片技术对于癌症患者的治疗方案的制定至关重要。
利用基因芯片技术,我们可以快速分析肿瘤的基因组,鉴定病人体内的致癌基因和抑癌基因等相关信息,从而为治疗提供更多的选择。
同时,在癌症治疗过程中,基因芯片技术还可以帮助监测肿瘤治疗的效果。
3.基因芯片检测菌群菌群是人体内微生物的总体称呼,目前研究显示菌群与肠道疾病、人体免疫力等相关。
利用基因芯片技术,我们可以高通量快速地鉴定不同菌株的特征、数量、种类和功能等信息,从而更准确地了解人体菌群的组成变化,并为未来的菌群治疗提供奠定基础的数据。
三.基因芯片技术在临床诊断中的应用1.诊断疾病通过基因芯片技术,医生可以在很短的时间内检测病人体内的有关基因序列信息,有助于更快地进行病原体检测,诊断疾病。
2.制定个性化治疗方案个性化治疗是现代医学中的一个热门话题,基因芯片技术可以获得更加精准的生物标志物信息,准确了解病情及患者个体差异。
基因芯片技术及其在肿瘤诊断中的应用
基因芯片技术及其在肿瘤诊断中的应用随着科技的发展,基因芯片技术也越来越成熟。
在肿瘤诊断中,基因芯片技术的应用受到越来越多的关注。
基因芯片技术的原理、优势以及在肿瘤诊断中的应用是本文想要探讨的内容。
一、基因芯片技术的原理基因芯片是一种测试片,它能够查看成千上万的基因,了解这些基因的表达情况。
在基因芯片的使用中,需要将样本基因片段提取出并加以扩增,再将其复制到芯片上。
而一条螺旋结构的DNA是由四个不同的碱基组成的,即腺嘌呤、胸腺嘧啶、鸟嘌呤以及鳥嘌呤。
因此,基因芯片中会包含这四个碱基。
基因芯片技术的原理是基于杂交技术而成。
假设研究者需要检测一组细胞的基因表达情况,那么这一组细胞的RNA需要被提取出来。
接下来,这些RNA会被转化成反羧基亲和素(cDNA)并标记。
标记后的cDNA会被加在基因芯片上的探针上。
而这些探针则是具有固定位置的基因序列,通常是基因的完整序列或者是基因的特定部分。
通过将标记后的cDNA和探针进行杂交,就可以检测出RNA的表达情况。
二、基因芯片技术的优势相比于传统的基因检测方法,基因芯片技术在一定程度上具有以下优势:1.高通量:基因芯片能够检测成千上万的基因,检测结果也更加准确。
2.高灵敏度:基因芯片需要的样本数量很少,甚至能够通过采集少量血液及组织来获得详细的基因信息。
3.高精度:基因芯片的结果非常精确,因为它能够避免操作过程中的人为误差。
4.快速结果:基因芯片的检测速度非常快,检测结果能够在短时间内得到。
基因芯片技术的优势使得它在疾病诊断、药物研究以及基因治疗方面有着广泛的应用。
三、基因芯片技术在肿瘤诊断中的应用肿瘤是一种细胞无序分裂并且进行恶性侵袭的疾病。
肿瘤发生后,患者的基因表达情况会发生改变。
基因芯片技术可以检测这些改变,从而对肿瘤的诊断以及治疗提供参考。
1.肿瘤类型的诊断基因芯片技术通过检测基因的表达情况来确定肿瘤的类型。
在不同的肿瘤中,基因的表达情况都有所不同。
如在一项基因芯片研究中,研究者利用基因芯片技术成功地对70%的乳腺癌患者进行了分类诊断。
基因芯片技术在基因表达研究中的应用
基因芯片技术在基因表达研究中的应用随着现代科学技术的不断发展,基因芯片技术作为一种新兴的科学技术,引起了人们的广泛关注。
基因芯片技术是一种基于DNA 光学成像技术的高通量分析技术,能够以高效的方式同时识别和监测上千个基因,并且可以用于大规模、高通量的基因表达研究。
一、基因芯片技术的原理基因芯片技术通过特定的方法把数万个 DNA 片段置于一个非常小的芯片上,在每个 DNA 碎片的位置上附着荧光分子或其他化学分子,然后监测每个位置上分子的光信号来测量每个 DNA 片段的实时表达情况。
通过这种方法,可以大规模地研究生物体内基因的表达模式,以及这些表达模式与生物体的生理状态和疾病发生的关系。
二、基因芯片技术是一种非常有前景的新兴分析技术,可以广泛应用于生命科学领域的基因研究、基因表达分析和疾病诊断。
下面我们将重点介绍基因芯片技术在基因表达研究方面的一些应用。
1、基因表达谱分析基因芯片技术不仅可以识别和量化单个基因的表达,同时还能够同时测量并比较限定的许多基因。
这种方法的产生使学者们无需单独的克隆和筛选,也不需要对基因的序列信息有很深的了解,就可以大规模快速、全面地分析基因表达谱。
举个例子,基因芯片技术可以在一个非常短的时间内分析一组基因的表达情况,通过分析,把不同结构和功能基因的表达情况可视化,这有助于学者们理解基因和生物体之间的关系。
这一应用在生命科学领域中被广泛使用。
2、发现基因与疾病之间的关系基因芯片技术不仅可以发现表达谱在基因水平上的变化,同时还能够帮助学者们发现与某些疾病有关的基因。
基因芯片技术通过对于基因的大规模分析,可以大大缩小关键基因的范围,这对于医学研究者来说,是一个极为宝贵的资源。
3、建立生命科学数据库基因芯片技术还可以通过全面的基因识别研究,为构建生命科学数据库作出重要贡献。
基因芯片技术可以获取基因表达谱信息,用以建立相应的数据库,这有助于学者们研究生物体的生理状态、基因调控网络的建立和控制机制的研究等方面。
基因芯片技术及其应用
基因芯片技术及其应用摘要:1953年,Waston和Crick发现DNA双螺旋结构,从此开创了分子生物学研究的新时代。
分子生物学的深入发展,使科学家认识到基因调控在生命现象中的重要意义。
1996年底,美国研制出了第一块DNA芯片,从此,基因芯片技术以一种综合、全面、系统的观点来研究生命现象,并充分利用了生物学、信息学等当今带头学科的成果,使生命科学研究的思维方式发生了深刻变化。
关键词:基因芯片基因表达研究应用一、基因芯片的概述所谓基因芯片是以硅、玻璃、微孔滤膜等材料作为承载基片,通过微加工技术,在其上固定密集的不同序列DNA微阵列,一次检测即可获得大量的DNA杂交信息。
其原理是将特定序列的寡核苷酸片段以很高的密度有序地固定在一块玻璃、硅等固体基片上, 作为核酸信息的载体,通过与样品杂交反应来识别、提取信息。
它能在同一时间内分析大量的基因,使人们准确高效地破译遗传密码。
这将是继大规模集成电路后又一次意义深远的科技革命。
固定在芯片的DNA来源可分为三种:1、从不同生物来源分离到的基因、基因片段或其克隆2、cDNA或其表达序列标签3、合成的寡核苷酸基片的材料,微加工技术和检测方法等都会影响芯片的性能。
实际应用是可根据不同需要来选择相应性能的芯片来完成工作。
基因芯片具有以下几种特点:1、并行性。
高度的并行性不仅大大提高实验的进程,并且有利于芯片技术所展示图谱的快速对照和阅读。
2、多样性。
是指在单个芯片中可以进行样品的多方面分析,从而大大提高分析的精确性,避免因不同实验水平产生误差。
3、微化性。
是当前芯片制造中普遍的趋势。
其好处是可以减少试剂用量和反应液体积,从而提高样品浓度和反应速率。
二、基因芯片的设计与制备DNA方阵的构建可大致分为四个步骤:首先,根据需要选择不同材料的载体,同时载体表面需有能与DNA偶联的活性基团,及良好的化学性质,以便测量;然后,选择合适的方阵构建分子,用光刻DNA合成法激活合成,点样;随后进行杂交,杂交条件的选择与芯片中片段的长度和芯片本身的用途有关;最后一步是杂交图谱的检测和读出,分为荧光标记法和质谱法。
何为基因芯片简述其原理及应用
何为基因芯片简述其原理及应用基因芯片(gene chip)是一种在一个固定的芯片上容纳了数千至数百万个特定DNA探针(DNA probe)的生物芯片。
它是通过标记特定DNA序列的方法,用于检测和分析DNA序列的存在和表达。
基因芯片可以帮助科学家了解某个生命体的基因组以及基因在不同条件下的表达情况,进而揭示基因与疾病之间的关联,以及基因与环境之间的相互作用。
基因芯片的原理是利用互补基因的碱基配对原则,通过将一个小小的、可能存在于样品中的DNA片段与芯片上的DNA序列进行杂交,来检测该DNA片段的存在。
基因芯片上的DNA序列由探针构成,探针的选择是根据以往的基因信息和预设的基因库来确定的。
当待测的DNA片段与探针杂交时,这个杂交信号会在芯片上通过荧光或其它信号的形式来探测和分析。
基因芯片的应用非常广泛。
主要应用有以下几方面:1. 基因表达分析:可以通过检测基因芯片上的探针与待测样品中的RNA分子杂交的信号强度来了解不同生物条件下基因的表达水平。
通过比较不同样品的表达谱,可以发现与特定生理和病理状态相关的基因,了解基因在不同组织器官、不同疾病及不同治疗方案下的表达差异。
2. 基因组分析:基因芯片可以用于整个基因组的分析,包括检测基因等位基因的表达和遗传突变等。
通过对不同个体基因组的比较和分析,可以寻找与多种遗传性疾病相关的突变以及基因变异。
基因芯片还可以用于寻找与抗生物药物抗性相关的基因突变,以指导个性化治疗。
3. 疾病诊断和预测:基因芯片可以用于不同疾病的诊断和预测,包括癌症、心脑血管疾病等。
通过检测样品中特定的基因表达谱,可以判断个体是否处于正常状态或疾病状态,以及预测个体患病的风险。
基因芯片还可以用于药物疗效预测,通过分析患者基因表达差异,预测特定药物对患者的疗效,并指导个性化治疗。
4. 细菌和病毒检测:基因芯片可以用于检测和鉴定细菌和病毒等微生物的存在和基因组成。
通过将待测细菌或病毒的DNA与芯片上的特定探针进行杂交,在芯片上检测出杂交信号,可以快速而准确地鉴定细菌或病毒的类型和数量。
基因芯片技术及其在医学检测中的应用
基因芯片技术及其在医学检测中的应用近年来,随着科学技术的不断发展和进步,基因芯片技术在医学领域中的应用越来越受到重视。
基因芯片技术是一种以高通量、高精度的方法进行基因表达谱的测定和分析的技术,它的出现使得疾病的发现和治疗更加精准和有效。
本文将主要介绍基因芯片技术的原理、分类以及其在医学检测中的应用。
一、基因芯片技术的原理基因芯片技术是一种高通量的基因检测技术,它的原理是通过一系列的操作,将需要测试的基因片段固定在特定芯片上,使得基因片段与芯片上的探针发生特异性的杂交反应,然后对杂交反应的结果进行检测和分析。
基因芯片技术最大的特点是能够同时检测大量的基因片段,从而能够在多个方面同时评估基因样本的表达和变化。
二、基因芯片技术的分类基因芯片技术根据不同的应用可以分为不同的类型。
其中最常见的是表达芯片和基因组芯片。
1. 表达芯片表达芯片用于检测组织或细胞的基因表达情况。
它可以同时检测数以万计的基因,通过比较不同组织或细胞的基因表达谱,可以寻找到不同基因在不同条件下的表达情况。
表达芯片可以用于疾病的诊断和治疗。
2. 基因组芯片基因组芯片用来检测整个基因组的变异情况。
它可以同时检测上百万个基因的变异情况,通过对比病人和正常人的基因组变异情况,可以找到具体的病因。
三、基因芯片技术在医学检测中的应用基因芯片技术在医学领域中的应用非常广泛。
它可以用于疾病的诊断、治疗和预防。
以下是基因芯片技术在医学检测中的应用:1. 癌症诊断以肿瘤标志物为例,对肝癌、胃癌、卵巢癌等多种癌症进行早期筛查,以实现癌症的早期诊断和早期治疗。
2. 器官移植通过检测器官的基因表达谱,可以评估移植后器官的状态和功能是否正常,从而更好地指导移植后的治疗。
3. 药物研究通过检测药物对细胞或组织的影响,可以预测不同患者对药物的敏感性,从而更好地选择和调整药物治疗方案。
4. 胚胎筛查通过检测胚胎基因组的变异情况,可以筛查出具有遗传病基因的胚胎,从而避免患有遗传病的孩子的出生。
基因芯片技术的新发展及其应用
基因芯片技术的新发展及其应用随着科技的不断发展,基因芯片技术又迎来了新的发展。
基因芯片技术是一种高通量的分析方法,可以在短时间内高效地检测大量基因信息,是生物医学研究、疾病诊断、药物研发和个性化医疗等领域中不可或缺的一项技术手段。
一、基因芯片技术的基础基因芯片技术的基础是DNA芯片技术。
DNA芯片是一种基于微电子工艺的生物芯片,利用集成电路技术将数百万个或数千万个碱基序列植入到一个小小的芯片上,从而可以在芯片上同时检测DNA样本中的成千上万个基因。
基因芯片技术可以高通量地检测基因的表达量、基因型信息等,极大地提高了对生物学过程的理解和分子生物学研究的速度和效率。
二、基因芯片技术的发展目前,基因芯片技术已经发展出许多不同类型的芯片,如基因表达芯片、SNP芯片、CNA芯片等。
其中,基因表达芯片可以检测不同实验条件下RNA的表达水平,是最常用的一种芯片类型。
SNP芯片可以针对单核苷酸多态性(SNP)进行检测,其中某些SNP位点与疾病的关联已经被证实。
CNA芯片可以检测染色体数目异常(例如失活、扩增)或基因重排等基因变异,对于肿瘤等疾病诊断和治疗具有重要作用。
基因芯片技术的发展还带来了相应的算法和分析软件。
常用的数据分析软件包括R、Bioconductor、MATLAB等。
这些软件可以对芯片数据进行预处理、质量控制、差异分析、聚类分析、生物通路分析、基因功能富集分析等。
这些算法和软件在加速了数据分析处理的同时,也对基因芯片技术的应用和发展提供了帮助。
三、基因芯片技术的应用基因芯片技术在临床、药物研发和生态学等领域具有广泛的应用。
以下是几个具体应用案例:1. 临床诊断临床诊断中,基因芯片技术可以实现癌症早期诊断、疾病预测和治疗方案的个性化设计。
例如,肺癌基因芯片可以检测肺癌患者的基因表达信息,从而帮助医生进行疾病分级和个性化治疗。
2. 药物研发在药物研发中,基因芯片技术可以快速筛选有潜力的药物靶点和药物分子,并监测药物分子与基因的相互作用。
基因芯片技术的原理与应用
基因芯片技术的原理与应用基因芯片技术是一项当前非常热门的技术,其应用范围越来越广泛,因此掌握它的原理和应用有助于我们更好地了解这一领域。
本文将着重介绍基因芯片技术的原理和应用。
一、基因芯片技术的原理基因芯片技术是一种利用微电子制造技术,将许多小的DNA片段固定在芯片上,并通过复杂的芯片扫描等操作,快速检测和分析某一个组织或生物体内数百甚至数千个基因的表达情况的一项技术。
基因芯片通常由两个主要部分组成,即探针和信号检测系统。
探针又叫做探针片,是将具有特定生物功能的DNA序列经过微阵列技术印刷在玻片或硅片上,还可以在质子棒上喷涂聚合物材料形成的小球上。
探针到底是片状还是球状,是根据应用的不同而定。
芯片的每一个探针对应于一个基因,又称之为基因探针,其DNA序列与所要检测的目标DNA序列互补配对,由此能检测出该物质基因是否存在或者处于什么状态。
信号检测系统是将基因芯片放入一个检测器中,通过荧光染料、辐射计数和化学荧光等方式检测芯片上的荧光强度或化学反应等情况进行检测。
这些荧光或化学反应信号与芯片上每个基因探针中的DNA相应的特点相对应。
二、基因芯片技术的应用基因芯片技术的应用非常广泛,下面来介绍几个常见的领域:1. 生命科学领域基因芯片技术可用于研究基因表达、基因调节、基因突变等生命科学领域,成为了这些研究领域中不可缺少的工具。
通过基因芯片技术,我们可以快速检测和分析数百至数千个基因在某个生物体或者组织中的表达情况,为我们更加深入地研究生命科学领域提供了有力的工具支持。
2. 医学领域基因芯片技术在医学领域中可用于医学诊断、疾病预测以及药物治疗方面。
通过检测患者的基因芯片,我们可以更早地发现患者的疾病状况,并对其疾病发展进行预测,从而制定更为科学、准确的治疗方案,提高治疗成功率。
3. 环境科学领域基因芯片技术还可以被应用于环境科学领域,例如检测环境中某种植物或者微生物的基因,从而了解它们的分布规律,为环境治理和保护提供更为准确的数据支持。
基因芯片的具体原理及应用
基因芯片的具体原理及应用1. 概述基因芯片是一种用于研究基因表达和基因变异的技术。
其具体原理是将大量的DNA探针固定在玻璃芯片或硅芯片上,在芯片上形成互不重叠的固定探针阵列。
这些固定的DNA探针可以与待测样本中的DNA进行特异性杂交,从而实现对基因表达水平和基因变异的测定。
2. 基因芯片的工作原理基因芯片的工作原理可以分为以下几个步骤:2.1 样品准备样品准备是基因芯片实验的第一步。
样品可以是RNA,DNA或蛋白质等。
样品需要经过提取、纯化和标记等处理步骤,以保证样品的质量和可靠性。
2.2 杂交反应在杂交反应中,待测样品中的RNA或DNA与基因芯片上固定的DNA探针进行特异性结合。
这个过程一般在液相中进行,并且需要一定的时间和温度,以保证杂交的充分性和特异性。
2.3 洗涤和检测在杂交反应之后,芯片需要经过一系列洗涤步骤,以去除非特异性结合的RNA或DNA。
然后,使用荧光标记的二次探针或其他检测方法对芯片上的信号进行检测。
通过检测芯片上的荧光强度或信号强度,可以获得每个探针的信号强度,从而得到基因表达水平或基因变异的信息。
2.4 数据分析通过对芯片上的信号强度进行数学统计分析,可以获得基因表达水平或基因变异的数据。
这些数据可以进一步通过生物信息学分析和统计学方法进行解读和比较,以挖掘潜在的生物学机制和生物标志物等。
3. 基因芯片的应用基因芯片在生物医学研究、药物研发和临床诊断等领域有着广泛的应用。
3.1 基因表达研究基因芯片可以用于研究不同组织、不同时间点或不同病理状态下的基因表达水平变化。
这对于理解基因调控网络、疾病机制的研究以及生物标志物的发现都具有重要意义。
3.2 基因变异检测基因芯片可以用于检测基因突变、SNP(Single Nucleotide Polymorphism)、DNA重排等基因变异的情况。
这对于遗传病的诊断、个体化医疗的实现以及药物敏感性的预测等都具有重要意义。
3.3 药物筛选和研发基因芯片可以用于筛选和评估潜在药物的效果和副作用。
基因芯片的原理和应用
基因芯片的原理和应用前言基因芯片是一种高通量的生物技术工具,广泛应用于基因组学和遗传学的研究中。
本文将介绍基因芯片的原理和应用。
1. 基因芯片的原理基因芯片是一种微型化的固相基因芯片。
它基于DNA杂交技术,能够同时测量数万到数百万个DNA或RNA分子的存在及其表达水平。
基因芯片一般由玻璃片或硅片制成,上面覆盖着大量的DNA或RNA探针。
其原理主要包括:1.1 探针设计基因芯片中的探针是特异性DNA或RNA片段,用于检测待测标本中的靶标DNA或RNA。
探针的设计需要考虑靶标的选择、探针长度、探针浓度等因素。
1.2 样本制备待测样本需要进行提取和标记,以便在芯片上与探针杂交。
标记通常使用荧光染料或其他化学标记物。
1.3 杂交反应待测样本和探针在特定条件下进行杂交反应,通过探针与靶标的互补碱基配对形成双链结构。
1.4 芯片扫描杂交反应后,芯片需要进行扫描以检测标记的信号。
扫描仪会测量标记物的荧光强度,从而确定靶标DNA或RNA的存在及其表达水平。
2. 基因芯片的应用基因芯片在生命科学研究中有着广泛的应用,涵盖了基因组学、转录组学、蛋白质组学等多个领域。
以下是基因芯片的主要应用领域:2.1 基因表达分析基因芯片可用于同时检测数万到数百万个基因的表达水平。
通过比较不同样本之间的基因表达谱,研究人员可以发现与疾病相关的新基因、确定调控网络、了解基因表达的调控机制等。
2.2 基因突变检测基因突变是疾病发生的重要原因之一。
基因芯片可用于检测DNA序列中的突变位点。
通过分析突变位点的信息,可以帮助诊断遗传病、研究疾病发生的机制。
2.3 比较基因组学基因芯片可以比较不同物种的基因组序列,揭示物种间的差异和相似之处。
这有助于研究物种进化、基因家族扩增等问题。
2.4 药物筛选基因芯片可以用于筛选具有特定活性的化合物。
通过检测药物对基因表达的影响,研究人员可以寻找到新的药物靶点,加速药物开发过程。
2.5 个体化医疗基因芯片可以用于预测个体对特定药物的反应。
基因芯片的基本原理及应用
基因芯片的基本原理及应用介绍基因芯片是一种微电子技术在生物学领域的应用,它可以高效地检测和分析大量基因序列。
基因芯片的出现革命性地改变了基因研究的方法,使得科学家可以更快速、更全面地了解生物体的基因表达。
基本原理基因芯片的基本原理是利用固相合成技术在晶片上合成大量的核酸序列探针。
这些探针可以与样品中的RNA或DNA分子特异性结合,从而实现对目标序列的检测和分析。
1.探针设计:探针的设计是基因芯片的核心步骤。
根据研究目的,科学家需要确定所需的目标基因序列,并设计合适的探针。
探针通常包含特异性的DNA或RNA序列,能够与目标分子互补配对。
2.探针合成:探针的合成是基因芯片制备的重要步骤。
合成方式通常采用固相合成技术,即将一系列碱基逐渐加入到固相材料上,从而逐步构建起目标探针序列。
3.样品制备:在进行基因芯片分析之前,需要对待检样品进行预处理。
样品处理的方法包括RNA或DNA的提取、纯化和标记等步骤。
这些操作旨在将样品转化为适合基因芯片分析的形式。
4.杂交反应:基因芯片在接受样品之前,需要先进行杂交反应。
杂交反应是将样品中的RNA或DNA与基因芯片上的探针进行结合的过程。
这个过程中,样品中的目标序列与探针互补配对,形成稳定的杂交复合物。
5.芯片扫描:杂交反应完成后,基因芯片需要进行扫描以获取数据。
扫描过程中,芯片上的荧光信号会被探针所结合的目标序列激发,从而反映目标序列的存在和含量。
6.数据分析:基因芯片扫描得到的数据需要经过严格的数据处理和分析。
科学家可以利用不同的算法和统计方法,从大量的数据中提取出有意义的信息。
这些信息可以用于了解基因表达、发现新的基因和寻找致病基因等。
应用基因芯片在生物学研究中有广泛的应用。
以下是一些常见的应用领域:•基因表达分析:基因芯片可以同时检测和分析一个组织或细胞中成千上万个基因的表达水平。
这种高通量的分析方法能够帮助科学家发现不同组织或疾病状态下的基因表达差异,从而揭示基因调控网络和生物过程。
基因芯片的原理与应用
基因芯片的原理与应用基因芯片(gene chip)是一种高通量基因分析技术,可以快速、准确地检测和分析上千种基因在一些生物体内的表达情况。
基因芯片的原理是利用光刻技术将上千种基因序列固定在芯片上,然后通过杂交、加标和扫描等步骤,得到样本中各个基因的表达水平。
基因芯片的基本结构包括探针、阵列和读取系统。
探针是芯片上固定的DNA或RNA片段,可以与样本中的基因序列互补配对。
阵列是指将上千种探针有序排列在芯片上的格点状结构。
读取系统包括光源和光电探测器,用于探测芯片上每个探针与样本中目标基因的结合情况。
1.基因表达分析:基因芯片可以同时检测上千种基因在一些生物体内的表达情况,帮助研究者了解基因表达的调控机制。
通过比较不同状态下的基因表达差异,可以发现与疾病、发育和环境有关的基因。
2.基因突变检测:基因芯片可以检测一些生物体中基因的突变情况,帮助研究者发现与疾病相关的突变基因。
通过与正常基因序列比对,可以识别出基因中的缺失、替代或插入等突变。
3.药物研发:基因芯片可以在药物研发中发挥重要作用。
研究者可以将细胞或组织在不同处理条件下进行基因表达分析,从而筛选出对药物敏感的基因或靶标,并用于新药的靶标验证和效果评估。
4.个体化医学:基因芯片可以为个体化医学提供基因信息。
通过基因芯片分析,可以了解一个人在基因水平上的个体差异,为个体化的健康管理和疾病预防提供依据。
此外,在临床诊断中,基因芯片也可以协助医生筛选出与患者疾病相关的基因。
5.遗传学研究:基因芯片可以用于遗传学研究。
通过比较不同物种或个体之间的基因表达差异,可以揭示基因在进化、发育和适应性演化中的作用。
同时,基因芯片也可以进行基因型和表型的关联研究,帮助揭示一些遗传疾病的发病机制。
基因芯片技术的发展为生命科学领域带来了革命性的突破。
其快速、高通量、高灵敏度的特点使得基因芯片成为研究基因表达和生物信息的重要工具之一、未来,随着基因芯片技术的进一步发展,相信它在生命科学研究和医学应用中的作用会更加广泛和深远。
基因芯片检测技术及其应用
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小结: 基因芯片的诞生
基因芯片的特点 基因芯片的原理 基因芯片的制作 基因芯片的应用 基因芯片的发展方向
思考题: 基因芯片在后基因组研究
中的应用。
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6.943862758
M58603
nuclear factor kappa-B DNA binding subunit (NF-kappa-B)
4.542132554
U16996
protein tyrosine phosphatase
4.451960278
AF059617 Homo sapiens serum-inducible kinase mRNA, complete cds.
2. 检测与疾病相关的基因,
进而用于疾病诊断
3. 药物筛选,
4. 检测基因突变
5. 其他
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基因功能分析研究
将成千上万个我们克隆到的特异性靶基因 固定在一块芯片上,对来源于不同个体不同组 织不同细胞周期不同发育阶段不同分化阶段不 同病变不同刺激(包括不同诱导不同治疗手段) 下细胞内的mRNA或逆转录所得的cDNA进行检测, 从而对这些基因表达的个体特异性组织特异性 发育阶段特异性分化阶段特异性。进行综合评 定与判断,极大加快这些基因功能的确立。
一般有三种方法
1.直接将核酸片段“点”至包 被过的芯片表面做靶片段
2.预先合成寡核苷酸,再将其 固定至芯片表面作为靶片段
3.原位合成寡核苷酸靶片段
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6400点的基因芯片
(面积 12X14 mm)
5. 基因芯片的应用
基因芯片技术及其在分子诊断中的应用
基因芯片技术及其在分子诊断中的应用近年来,随着生命科学领域的迅速发展,基因芯片技术已成为研究基因表达和基因功能的重要手段之一。
基因芯片技术不仅可以同时检测大量基因的表达水平和突变状态,还可以加速疾病的诊断和治疗。
本篇文章将介绍基因芯片技术的基本原理、分类及其在分子诊断中的应用。
基因芯片技术的基本原理基因芯片是一种用于检测大量基因表达及其功能的技术。
它通常由一小块玻璃或硅片构成,上面涂有上千个特定的DNA或RNA探针。
这些探针是根据已知的基因序列设计,它们可以与待测样本中的mRNA结合,从而测量不同基因的表达水平。
基因芯片的制备需要经过多个步骤。
首先,需要确定待测基因的探针序列,然后在芯片表面固定这些探针。
接下来,将样本RNA提取并转录成cDNA,然后用荧光染料标记并加在芯片上。
最后,通过荧光标记来检测每个探针与待测样本中RNA的互作程度,以确定各个基因的表达水平。
基因芯片的分类根据芯片上探针的类型,可以将基因芯片分为基因表达芯片、SNP芯片、甲基化芯片等几种类型。
基因表达芯片是应用最广泛的基因芯片类型之一。
它可以检测待测样本中成千上万个基因的表达水平,帮助研究人员了解不同生理和病理条件下基因表达的变化情况。
SNP芯片检测的是单核苷酸多态性(SNP,Single Nucleotide Polymorphism)。
SNP是常见的DNA序列变异形式,可能与一些疾病的发生和发展有关。
因此SNP芯片可以用于基因分型、蛋白质结构的预测等研究领域。
甲基化芯片检测基因组中的甲基化状态。
甲基化是一种重要的表观遗传修饰机制,它可以影响基因的表达和细胞分化。
甲基化芯片可以帮助研究人员探究甲基化与疾病的相关性,为疾病的诊断和治疗提供有力支持。
基因芯片在分子诊断中的应用基因芯片技术在分子诊断中有广泛的应用,尤其是在肿瘤学、遗传病学、感染病学等领域。
以下是一些典型的应用案例:肿瘤诊断基因芯片技术可以帮助医生诊断肿瘤的类型及预后。
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三、在植物研究中的应用
1、基因表达水平的检测
植物基因的表达受遗传、环境或生化信号的影响,并 且具有时空特异性,组织器官的基因只在某个特定的情况 下才会表达,表达量也有很大差异,形成不同的基因表达 谱,基因表达谱能够用来帮助理解植物体内功能基因的不 同表达情况,可以揭示基因的功能以及它们在植物生理生 化代谢途径中的作用。
2、转基因食品的检测
转基因食品的安全性现在还有很大的争议,利用基因芯片 技术可以快捷准确的检测出样品是否为转基因食品。只需 将目前通用的报告基因、抗性基因、启动子和终子的特异 片断制成检测芯片与待测产品的 DNA进行杂交, 就可以判 断待测样品是否为转基因产品。该技术检测的可靠性已被 对大豆、玉米、油菜、棉花等农作物样品的检测结果所证 实。另外, 利用该技术也可以筛选转基因所需要的目的基 因。
3、对食品营养成分的检测
传统的检测方法对食品的营养成分检测是非常繁琐的 ,更不用说对不同食品的类别和性质进行真伪鉴定了。基 因芯片技术可用来研究食品的营养成分,对食品的类别和性 质进行快速准确的鉴定。Lyakhovich等应用DNA芯片技术 检测 1,25- 二羟维生素 D3 处理过的乳腺癌细胞的 FGF-7 的 表达,发现无论在mRNA水平还是在蛋白水平都有明显的 增加,从而首次揭示了维生素 D 可能通过调节 FGF-7 的表 达而调节细胞的生长分化。
基因芯片技术的应用
一、在食品中的应用
1、细菌检测
细菌污染是食品最常见的污染,食品中病原性细菌检 测是食品卫生安全检测中一个重要的方面。 Anthony 等人 建立了 1个在 4h 以内致病细菌的快速诊断方法。他们运用 该法158例经血培养鉴定为阳性的样品进行检测, 结果符合 率为 79.7% 。Carl 等在对 4 种细菌,即大肠埃希菌、痢疾 杆菌、伤寒杆菌、空肠弯曲菌采用了基因芯片的检测方法, 其检测结果不仅敏感度高于传统方法, 且操作简单, 重复性 好, 并节省了大量时间, 大大提高了 4 种细菌诊断效率。
基因表达水平的检测
Schena 等采用拟南芥基因组内共 45 个基因的 cDNA 微 阵 列 ( 其 中 14 个 为 完 全 序 列 , 31 个 为 EST ),检测该植物的根、叶组织内这些基因的 表达水平,用不同颜色的荧光素标记逆转录产物 后分别与该微阵列杂交,经激光共聚焦显微扫描 ,发现该植物根和叶组织中存在 26 个基因的表达 差异,而参与叶绿素合成的CAB1基因在叶组织较 根组织表达高500倍。
基因芯片技术的四个技术环节
1、芯片的制备
主要是原位合成法和直接点样法。原位合成法适用于 寡核苷酸;点样法多用于大片段,有时也用于寡核苷酸。 原位合成法包括光导合成法和压电合成法。其优点是反应 量大,探针的密度高并且可以和其他芯片制备方法结合使 用,该方法的缺点是探针的长度较短,一般为20~50bp。 点样法包括接触式点样和非接触式点样又称喷墨式打印。 因点样法成本高,故适用于芯片上需要同一探针或是探针 是长链DNA。
2、基因多态性分析及突变性检测
将基因芯片技术用于检测分子突变,不仅可准确地确 定突变位点和突变类型,更主要的是它的快速高效是目前 所用的其他方法无法比拟的。基因芯片可以同时检测多个 基因乃至整个基因组的突变,还可研究基因 ( 组 ) 的多态性 ,这将大大促进植物育种科学的发展并促进植物新品种的 产生。研究突变性和多态性对检测防治植物疾病,探究分 子突变与环境的关系,促进植物育种和植物新品种的产生 等有积极意义 。
基因芯片的原理
基于核酸分子碱基之间( A-T/G-C) 互补配对的原理 ,利用分子生物学、基因组学、信息技术、微电子、精密 机械和光电子等技术将一系列短的、已知序列的寡核苷酸 探针排列在特定的固相表面构成微点阵,然后将标记的样 品分子与微点阵上的DNA杂交,以实现对多到数万个分子 之间的杂交反应,并根据杂交模式构建目标DNA的序列, 从而达到高通量大规模地分析检测样品中多个基因的表达 状况或者特定基因(DNA)分子是否存在的目的。
二、在医药领域的应用
1、用于药物作用新靶标的发现
运用基因芯片技术能够比较正常组织细胞及 病变组织细胞中大量 ( 可达数千 ) 基因的表达差异 , 从而发现一组疾病相关基因或致病新基因作为药 物筛选靶标。
用于药物作用新靶标的发现
Kumar Sinha等利用DNA芯片筛选发现,在乳腺癌及 其 他 癌 细 胞 中 , 均 检 测 到 脂 肪 酸 合 成 酶 (fatty acid synthesis, FAS) 基因过度表达,酪氨酸激酶抑制剂抑制 FAS基因表达可诱导乳腺癌细胞的凋亡。表明 FAS基因及 其相应的信号通路与乳腺癌的发生有关,可能被用来作为 治疗或药物筛选的新靶标。Mandel等利用基因芯片建立帕 金森病的基因表达指纹(finger-prints)图谱,发现了多种有利 于抗帕金森病药物研制和开发的潜在药靶。
特点:高通量、高集成、微型化、平行化、多样化和自动化。
பைடு நூலகம்
基因芯片的分类
按其片基不同可分为:无机片基芯片和有机 合成片基芯片。
按其应用不同可以分为:表达谱芯片、诊断 芯片、检测芯片。 按其结构不同可分为: DNA 阵列和寡核苷 酸芯片。 按其制备方法不同可分为:原位合成芯片和 合成后交联芯片(合成后点样芯片)。
小结
目前,基因芯片技术飞速发展,广泛应用于基因表达 分析、基因诊断、药物筛选、序列分析等诸多领域。而且 而且在农业、工业, 以及食品、环境监测等方面也表现出 极大的应用潜力。尽管基因芯片技术在生命科学领域越来 越受到关注,但也还有许多问题有待解决如:简化样品制 备过程,提高检测过程的智能化 ,提高芯片灵敏度及特异性 , 以及方法的标准化等方面。相信随着科学技术的进步这些 问题将会被解决,基因芯片技术一定会得到更加广泛的应 用。
基因芯片技术及应用示例
目 录
4 5 3
定义 2 基因芯片的分类 基因芯片的原理
1
基因芯片技术的四个技术环节 基因芯片技术的应用
定义
基因芯片技术是指采用寡核苷酸原位合成或显微打印手段 ,将数以万计的DNA探针固化于支持物表面上,产生二维
DNA探针阵列,然后与标记的样品进行杂交,通过检测杂
交信号来实现对生物样品快速、并行、高效地检测或医学 诊断。
2、用于药物有效成分的筛选
如何分离和鉴定药物的有效成分是目前药物开发遇到 的重大障碍,基因芯片技术是解决这一障碍的有效手段。 如在寻找 HIV药物中 , Jellis用组合化学合成 DNA芯片技术 筛选 65453 种硫代磷酸八聚核苷酸,并从中确定了具有 XXG4XX 样结构的抑制物,实验表明,这种筛选物对 HIV 感染细胞有明显阻断作用。
2、样品制备与标记
从待检细胞或组织中分离出 DNA或RNA,经逆转录、PCR扩增、 末端标记等操作,标记主要有荧光标记,生物素或同位素标记、现在 常用荧光素标记,以提高检测的灵敏度和使用者的安全性。
3、杂交反应
属于固-液相反相杂交,探针分子固定于芯片表面,与液相的靶 分子进行反应。但杂交条件的选择需考虑多方面的因素,如杂交反应 体系中盐浓度、探针G-C含量和所带电荷、探针与芯片之间连接臂的 长度及种类、检测基因的二级结构的影响。由于基因芯片影响因素很 多,所以要合理设置异种核酸平行实验、核酸质量、检测对照、封闭 对照、归整化对照,以保证结果的准确性和重复性。
4、信号检测和分析
当芯片杂交完毕之后,需要对信号进行收集和分析。使 用的标记物不同,相应的检测方法也各异。常用的荧光标记 法使用激光共聚集荧光扫描仪进行信号检测。激光共聚焦 扫描仪的激光光源可产生激发不同荧光染料的光,当探针 与待测核酸完全正常配对时的荧光信号强度是具有单个或 2个错配碱基探针的5~35倍,而且荧光信号的强度还与样 品中靶分子的含量呈一定的线性关系。新发展的纳米金标 记,通过银放大后可直接用肉眼观察,具有非常好的灵敏 度(超过荧光标记法100倍)和特异性。