cdna文库 名词解释
名词解释汇总(带答案)

名词解释汇总1.分子杂交不同的DNA 片段之间,DNA 片段与RNA 片段之间,如果彼此间的核苷酸排列顺序互补也可以复性,形成新的双螺旋结构。
这种按照互补碱基配对而使不完全互补的两条多核苷酸相互结合的过程称为分子杂交。
2.cDNA文库以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性。
3.选择标记基因选择基因(又称选择标记基因),主要是一类编码可使抗生素或除草剂失活的蛋白酶基因,这种基因在执行其选择功能时,通常存在检测慢(蛋白酶作用需要时间)、依赖外界筛选压力(如抗生素、除草剂)等缺陷。
4.ORF 开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)从起始密码子开始,是DNA序列中具有编码蛋白质潜能,一段无终止密码子打断的碱基序列。
5.转化转化(transforma on)是某一基因型的细胞从周围介质中吸收来自另一基因型的细胞的DNA而使它的基因型和表现型发生相应变化的现象。
该现象首先发现于细菌。
6.转染专指感受态的大肠杆菌细胞捕获和表达噬菌体DNA分子的过程7.转导转导(transduc on)由噬菌体将一个细胞的基因传递给另一细胞的过程。
它是细菌之间传递遗传物质的方式之一。
其具体含义是指一个细胞的DNA或RNA通过病毒载体的感染转移到另一个细胞中。
8.质粒不亲和性在没有选择压力下,两种不一样的质粒不能在同一宿主细胞系中稳定共存的现象9.RACE RACE是基于PCR技术基础上由已知的一段cDNA片段,利用锚式PCR,快速扩增cDNA末端从而获得已知mRNA内一段小序列与3‘或5’的cDNA序列技术。
cDNA和基因组文库DNA的构建

T4多核苷酸激酶(3000单位/ml) 1μl
室温温育15分钟。 2 . 7.测定从上面步骤4取出的3μl反应物中放射性活度,测定1μl第二链合 成产物中能被三氯乙酸沉淀的放射性活度。
• 2 . 8.用下面公式计算第二链反应中所合成的cDNA量。要考虑到
已掺入到DNA第一链种的dNTP的量。 [第二链反应中所掺入的活度值(cpm)/总活度值(cpm)]*(6某种生物体全部基因的随机片段的重组 DNA克隆群体;cDNA是指含有所有重组cDNA的克隆群体。
基因组:来源于基因组DNA,反映基因组的全部信息, 用于基因组物理图谱的构建,基因组序列分析,基因在染色体上 的定位,基达 的基因序列信息,用于研究特定细胞中基:反转录酶催化合成cDNA第一链
阶段2:cDNA第二链的合成
阶段3:cDNA的甲基化 阶段4:接头或衔接子的连接 阶段5:Sepharose CL-4B凝胶过滤法分离cDNA 阶段6:cDNA (互补DNA)
成的下一步骤。
3:cDNA的甲基化
• 3 . 1.在cDNA样品中加入以下试剂: 2 mol/L Tris-HCl (pH8.0) 5μl 5 mol/L NaCl 2μl 0.5 mol/L EDTA(pH8.0) 2μl 20 mmol/L S-腺苷甲硫氨酸 1μl 加H2O至 96μl 3 . 2.取出两小份样品(各2μl)至0.5ml微量离心管中,分别编为1号和2号, 置于冰上。
4.4.加入1μl 0.5mol/L EDTA(pH8.0),以终止反应。
• 4.5.用酚:氯仿抽提,再通过Sephadex G-50离心柱层析,除去未
掺入的dNTP。
4.6.在柱流出液中加入0.1倍体积的3 mol/L 乙酸钠(pH5.2)和二 倍体积的乙醇,样品于4℃至少放置15 min。
cDNA文库和基因组文库比较

个人收集整理-ZQ文库和基因组文库比较文库:以为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成,与适当地载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部信息地克隆集合称为该组织细胞地文库.基因组文库: 一个生物体地基因组用限制性内切酶部分酶切后,将酶切片段插入到载体分子中,所有这些插入了基因组片段地载体分子地集合体,将包含这个生物体地整个基因组,也就是构成了这个生物体地基因文库. b5E2R。
基因组文库与文库地比较:基因组文库地优点相对于文库,基因组文库地优点: 克隆只能反映着地分子结构,没有包括基因组地间隔序列, 文库中,不同克隆地分布状态总是反映着地分布状态,即:高丰度地克隆,所占比例较高,分离基因容易;低丰度地克隆,所占比例较低,分离基因困难; 从克隆中,不能克隆到基因组中地非转录区段序列,不能用于研究基因编码区外侧调控序列地结构与功能. p1Ean。
文库地主要优点:①文库以为材料,特别适用于某些病毒等地基因组结构研究及有关基因地克隆分离.②文库地筛选比较简单易行.③每一个文库都含有一种序列,这样在目地基因地选择中出现假阳性地概率就会比较低,因此阳性杂交信号一般都是有意义地,由此选择出来地阳性克隆将会含有目地基因.DXDiT。
④文库可用于在细菌中能进行表达地基因地克隆,直接应用于基因工程操作.⑤克隆还可用于真核细胞地结构和功能研究.克隆地主要地缺点:文库所包含地遗传信息要远远少于基因组文库,并且受细胞来源或发育时期地影响. 文库虽能反映地分子结构和功能信息,但不能直接获得基因内含子序列和基因编码区外大量调控序列地结构与功能方面信息. 在文库中,相应于高丰度地克隆所占地比例比较高,分离起来比较容易,而相应于低丰度地克隆所占地比例则比较低,因此分离也就比较困难.RTCrp。
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基因工程名词解释

名词解释【基因工程】:在体外对不同生物的遗传物质(基因)进行剪切、重组、连接,然后插入到载体分子中(细菌质粒、病毒或噬菌体DNA),转入微生物,植物或动物细胞内进行无性繁殖,并表达出基因产物。
【限制性核酸内切酶】:是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列(4-8bp),并由此处切割DNA双链结构的核酸内切酶。
【识别序列】:限制性核酸内切酶在双链DNA上能够识别的特殊核苷酸序列被称为识别序列。
【酶切位点】:DNA在限制性核酸内切酶的作用下,使多聚核苷酸链上磷酸二酯键点开的位置被称为切割位点。
【粘性末端】:是指含有几个核苷酸单链的末端,可通过这种末端的碱基互补,使不同的 DNA片段发生退火。
【平末端】:限制酶在它识别序列的中心轴线处切开时产生的平齐的末端。
【同裂酶】:一些来源不同的但能识别位点的序列相同的限制性内切酶。
【同尾酶】:一些来源不同且识别序列不同,但能产生相同粘性末端的限制性内切酶。
【DNA的甲基化程度】:DNA被甲基化酶甲基化,识别序列中的核苷酸一旦被甲基化,就会影响内切酶的切割效率。
【位点偏爱】:对不同位置的同一个识别序列表现出不同的切割效率的现象【内切酶的star活性】:某种限制性核酸内切酶在特定条件下,可在不是原来的识别序列处切割DNA,这种现象称为star活性。
【末端转移酶】:一种能将脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)加到某DNA片段上3’-OH基上的酶。
【DNA连接酶】:借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA双链,DNA片段紧靠在一起的3’-OH末端与5’-PO4末端之间形成磷酸二酯键,使两末端连接【DNA聚合酶】:以DNA为复制模板,使DNA由5'端点开始复制到3'端的酶。
【反转录酶】:与DNA聚合酶作用方式相似:5’→3’聚合,模版是mRNA,合成DNA【碱性磷酸酶】:能够催化核酸分子脱掉5’磷酸基团,从而使DNA(或RNA)片段的5’-P 末端转换成5’-OH末端。
cdna基因文库名词解释 概述及应用场景

cdna基因文库名词解释概述及应用场景1. 引言1.1 概述CDNA基因文库是指利用互补式DNA(complementary DNA)技术构建而成的一类基因文库,其中包含了特定细胞或组织内所表达的mRNA分子的DNA 复制品。
通过将mRNA转录为cDNA,并将其插入到合适的质粒载体中,科学家们可以获取到特定时期或特定条件下细胞中所表达的全部转录本信息。
CDNA基因文库构建技术是基于反转录酶作用原理而来,通过选取合适的引物和核苷酸,在体外将mRNA逆转录合成相应的cDNA。
这些cDNA分子可进一步克隆到质粒载体中,并在宿主细胞内扩增。
最终形成一个包含大量不同cDNA 片段的基因文库,可供后续研究使用。
1.2 文章结构本文首先会对CDNA基因文库进行详细的名词解释,包括其定义、合成过程及特点以及构建方法与步骤。
接着,将进一步讨论CDNA基因文库在不同领域中的应用场景,尤其是在基因表达研究、蛋白质研究以及新药研发方面的应用。
最后,我们将总结已有的研究成果,并展望CDNA基因文库在未来的发展前景和应用潜力。
1.3 目的本文的目的是为读者提供关于CDNA基因文库的详细解释和应用场景的介绍。
通过阅读本文,读者将更全面地了解CDNA基因文库的概念、构建过程以及其在科学研究中的重要性和广泛应用。
同时,本文也旨在展示CDNA基因文库在基因表达、蛋白质研究以及新药研发等领域所起到的关键作用,为读者理解该技术在科学研究中所扮演的角色提供深入了解。
最后,通过总结已有研究成果并展望未来发展前景,让读者对CDNA基因文库技术有一个更加清晰的认识,并认识到其仍然具有巨大的发展潜力。
2. CDNA基因文库名词解释2.1 CDNA基因文库的定义CDNA基因文库,即亦称为互补脱氧核糖核酸(complementary DNA,cDNA)文库,是一种由转录反应合成的DNA序列集合,其中包含了从细胞中提取的mRNA分子逆转录合成的互补DNA。
生物技术概论考试复习题解答

现代生物技术概论复习题一、名词解释1、生物技术:也称生物工程,是人们以现代生命科学为基础,结合先进的工程技术手段和其他基础科学的科学原理,按照预先的设计,改造生物体或加工生物原料,为人类生产出所需产品或达到某种目的的一门新兴的、综合性的学科。
2、基因组DNA文库:将某一种基因DNA用适当的限制酶切断后,与载体DNA重组,再全部转化宿主细胞,得到含全部基因组DNA的种群,称为基因组DNA文库。
3、蛋白质工程是指:利用基因工程的手段,在目标蛋白的氨基酸序列上引入突变,从而改变目标蛋白的空间结构,最终达到改善其功能的目的。
4、基因工程:在体外将外源基因进行切割并与一定的载体连接,构成重组DNA分子并导入相应受体细胞,使外源基因在受体细胞中进行复制、表达,使目的基因大量扩增或得到相应基因的表达产物或进行定向改造生物性状。
简单概括,就是将外源目的基因与载体重组后再进入宿主细胞的过程。
5、发酵工程:是发酵原理与工程学的结合,是研究由生物细胞(包括动植物、微生物)参与的工艺过程的原理和科学,是研究利用生物材料生产有用物质,服务于人类的一门综合性科学技术。
6、基因和基因组DNA分子中具有特定生物学功能的片段称为基因(gene)。
一个生物体的全部DNA序列称为基因组(genome)5、载体:把一个有用的目的DNA片段通过重组DNA技术,送进受体细胞中去进行繁殖或表达的工具称为载体。
6、cDNA文库:即由mRNA经过反转录成cDNA,然后来构建文库,构建的文库不包含内含子。
7、转化:外源DNA导入宿主细胞的过程称之为转化。
8、重叠基因:一个基因序列中,含有另一基因的部分或全部序列。
9、基因组文库:把某种生物基因组的全部遗传信息通过载体贮存在一个受体菌克隆子群体中,这个群体即为这种生物的基因组文库。
10、细胞工程:以生物细胞、组织或器官为研究对象,运用工程学原理,按照预定目标,改变生物性状,生产生物产品,为人类生产或生活服务的科学。
分子诊断学 名词解释

基因(分子)诊断:采用分子生物学的方法,在DNA水平或RNA水平对基因的结构和功能进行分析,从而对疾病做出诊断的方法。
基因:编码RNA或蛋白质的全部核苷酸序列。
基因组:一个单倍体生物所含有的全部DNA。
结构基因:编码RNA或蛋白质的核苷酸序列。
转录单位:从启动子到转录终止子之间的DNA节段。
基因表达:是指DNA携带的遗传信息通过转录传递给RNA,mRNA通过翻译将基因的遗传信息在细胞内合成具有生物功能的各种蛋白质的过程。
基因表达调控:指对基因组中某一基因或一些功能相近的基因表达的开启、关闭和表达强度的直接调节。
开放阅读框(ORF):始于起始密码子并终于终止密码子的一串密码子组成的核苷酸序列。
内含子:DNA或RNA中的非编码序列。
外显子:DNA或RNA中的编码序列。
启动子:与RNA聚合酶识别、结合和转录起始所需的DNA序列。
SD序列:mRNA 5′-端在起始密码子AUG 上游3~11bP处,含A-G 短序列,容易与16S r RNA 3′-端含U-C 序列互补配对的序列称为SD 序列。
操纵子:由一组功能相关的结构基因连同其上游调控序列共同构成一个转录单位。
重叠基因:一段DNA序列有两个或两个以上ORF,可以编码两种或两种以上多肽链。
质粒:细菌细胞染色体以外,能独立复制并稳定遗传的共价闭合环状DNA分子。
断裂基因:基因组由编码序列和非编码序列间隔组成。
重复序列:多拷贝的相同或近似DNA片段。
分段基因组:病毒基因组由数条不同的核酸分子组成,多见于RNA 病毒。
正链病毒:基因组序列与mRNA相同,称为正链DNA(+DNA)或正链RNA(+RNA)病毒。
负链病毒:基因组序列与mRNA互补,则称为负链DNA(-DNA)或负链RNA(-RNA)病毒。
重组DNA:不同来源的DNA,通过磷酸二酯键连接而重新组合成新的DNA分子的过程。
重组DNA技术:在基因水平上,将目的DNA在体外重组于能自我复制的载体DNA分子上,然后将重组DNA导入宿主细胞中进行增生,以获得大量的DNA片段或得到相应的蛋白质产物的过程。
名词解释 cdna文库

名词解释:cdna文库
cdna文库是指通过反转录将转录本(mRNA)转化为相应的DNA序列,并将其进行克隆、放大保存起来的一种DNA库。
cdna文库包含了特定生物体(如人、动物、植物等)在特定条件下的大部分mRNA序列,可以用于研究基因表达、寻找新基因以及研究基因功能。
在构建cdna文库时,首先需从目标生物组织中提取总RNA。
然后,利用酶逆转录将mRNA转录成相应的cDNA,并添加适配器序列。
接下来,通过PCR反应进行扩增,得到了包含全部mRNA序列的cDNA文库。
这些cDNA可以被克隆入载体中,形成cdna文库。
cdna文库的构建对于研究基因表达具有重要意义。
通过cdna文库,研究人员可以分离出感兴趣的基因,并进一步探索其在不同组织、不同发育阶段或不同环境条件下的表达情况。
此外,cdna文库还可以用于筛选新的基因、研究基因功能以及进行基因工程等领域的研究。
关于cDNA文库

1 cDNA 文库的构建1.1 cDNA 文库构建的基本原理与方法cDNA 文库是指某生物某发育时期所转录的全部mRNA 经反转录形成的cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合。
经典cDNA 文库构建的基本原理是用Oligo(dT) 作逆转录引物,或者用随机引物,给所合成的cDNA 加上适当的连接接头,连接到适当的载体中获得文库。
其基本步骤包括:RNA 的提取(例如异硫氰酸胍法,盐酸胍—有机溶剂法,热酚法等等,提取方法的选择主要根据不同的样品而定),要构建一个高质量的cDNA 文库,获得高质量的mRNA 是至关重要的,所以处理mRNA 样品时必须仔细小心。
由于RNA 酶存在所有的生物中,并且能抵抗诸如煮沸这样的物理环境,因此建立一个无RNA 酶的环境对于制备优质RNA 很重要。
在获得高质量的mRNA 后,用反转录酶Oligo(dT) 引导下合成cDNA 第1链,cDNA 第2链的合成(用RNA 酶H 和大肠杆菌DNA 聚合酶I,同时包括使用T4 噬菌体多核苷酸酶和大肠杆菌DNA 连接酶进行的修复反应),合成接头的加入、将双链DNA 克隆到载体中去、分析cDNA 插入片断,扩增cDNA 文库、对建立的cDNA 文库进行鉴定。
这里强调的是对载体的选择,常规用的是λ 噬菌体,这是因为λ DNA 两端具有由12个核苷酸的粘性末端,可用来构建柯斯质粒,这种质粒能容纳大片段的外源DNA。
1.2 cDNA 全长文库经典cDNA 文库的构建虽然高效、简便,但文库克隆的片段一般较小,单个克隆上的DNA 片段太短,所能提供的基因信息很少,大多需要几个克隆才能覆盖一个完整的全基因的cDNA。
为了克隆到真正的cDNA 全长,建立富含全长的cDNA 文库具有重要意义。
为此,必须克服仅用mRNA 的PolyA 尾合成以及由普通逆转录酶作用特点所导致的局限性。
全长cDNA 文库,是指从生物体内一套完整的mRNA 分子经反转录而得到的DNA 分子群体,是mRNA 分子群的一个完整的拷贝。
cDNA文库和基因组文库比较

cDNA文库和基因组文库比较cDNA文库:以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
基因组文库: 一个生物体的基因组DNA用限制性内切酶部分酶切后,将酶切片段插入到载体DNA分子中,所有这些插入了基因组DNA片段的载体分子的集合体,将包含这个生物体的整个基因组,也就是构成了这个生物体的基因文库。
基因组DNA文库与cDNA文库的比较:1 基因组DNA文库的优点相对于cDNA文库,基因组文库的优点: cDNA克隆只能反映着mRNA的分子结构,没有包括基因组的间隔序列, cDNA文库中,不同克隆的分布状态总是反映着mRNA的分布状态,即:高丰度mRNA的cDNA克隆,所占比例较高,分离基因容易;低丰度mRNA的cDNA克隆,所占比例较低,分离基因困难; 从cDNA克隆中,不能克隆到基因组DNA 中的非转录区段序列,不能用于研究基因编码区外侧调控序列的结构与功能.2 cDNA文库的主要优点:①cDNA文库以mRNA为材料,特别适用于某些RNA病毒等的基因组结构研究及有关基因的克隆分离.②cDNA文库的筛选比较简单易行.③每一个cDNA文库都含有一种mRNA序列,这样在目的基因的选择中出现假阳性的概率就会比较低,因此阳性杂交信号一般都是有意义的,由此选择出来的阳性克隆将会含有目的基因.④cDNA文库可用于在细菌中能进行表达的基因的克隆,直接应用于基因工程操作.⑤cDNA克隆还可用于真核细胞mRNA的结构和功能研究.3 cDNA克隆的主要的缺点:cDNA文库所包含的遗传信息要远远少于基因组DNA文库,并且受细胞来源或发育时期的影响. cDNA文库虽能反映mRNA的分子结构和功能信息,但不能直接获得基因内含子序列和基因编码区外大量调控序列的结构与功能方面信息. 在cDNA文库中,相应于高丰度mRNA 的cDNA克隆所占的比例比较高,分离起来比较容易,而相应于低丰度mRNA的cDNA克隆所占的比例则比较低,因此分离也就比较困难. 3、通过活动,使学生养成博览群书的好习惯。
名词解释

名词解释:1插入序列:是最简单的转座子,是细菌的一小段可转坐元件,它不含有任何宿主基因而常被称为插入序列,它们是细胞染色体或质粒DNA的正常组成部分。
2负调节:调节物为抑制物,使转录关闭,解除抑制的物质称为诱导物。
3正调节:调节物为激活物,使转录开放。
正、负调节可以同时在一个调节系统中起作用。
4分子克隆载体:是一类可供外源DNA插入并携带重组DNA分子进入适当宿主细胞的分子。
5基因组DNA文库:是某一生物体全部或部分基因的集中。
6转座子:是存在于染色体DNA上可自主复制和移位的基本单位。
7 RNA干扰:当细胞中导入与内源mRNA编码区同源的双链RNA(dsRNA)时,该mRNA 发生降解而导致基因表达沉默的现象。
8引发体:是蛋白复合体, 主要成份是引物酶和DNA解旋酶,是在合成用于DNA复制的RNA引物时装配的。
9顺式作用原件:在DNA中一段特殊的碱基序列,对基因的表达起到调控作用的基因元件。
存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列,包括启动子,增强子。
10锌指结构:指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域,这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。
11同功tRNA:由于简并性,多种tRNA代表同一种氨基酸,称之为同工tRNA。
12 基因敲除技术:针对一个序列已知但功能未知的基因,从DNA水平上设计实验,彻底破坏该基因的功能或消除其表达机制,从而推测该基因的生物学功能。
13基因定点突变技术:向靶DNA片段中引入所需的变化,包括碱基的添加,删除或改变,是分子生物学研究中一种非常有用的手段。
14 DNA变性:加热或用碱处理双链DNA,使氢链断裂,结果DNA变成为单链,此称为DNA的变性。
15 DNA复性:DNA的复性指变性DNA 在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程。
16 cDNA文库:生物某器官或某组织细胞mRNA所含的遗传信息。
分子生物学名词解释含解释

1.cDNA library:cDNA文库。
是以细胞总mRNA为模板,利用反转录酶合成与mRNA互补的cDNA单链,再将其复制成双链,然后与合适的载体连接后转入受体菌中所建立的含多克隆cDNA片段的混合体。
理论上包含一种细胞中的全部mRNA信息。
2.DNA denature:DNA变性。
双链DNA在变性因素(如加热、过酸性条件、过碱性条件等)影响下,解离成为两条单链的过程,被称为DNA变性。
3.Klenow fragment:Klenow片段。
是原核生物DNA-polI经特异的蛋白质酶水解后产生的大片段,具有3′→5′核酸外切酶活性和聚合酶活性。
实验室合成DNA和分子生物学研究上,常用Klenow片段代替DNA聚合酶。
4.RNA replication:RNA复制。
由RNA依赖的RNA聚合酶催化合成RNA的过程,常见于病毒,是逆转录病毒以外的RNA病毒在宿主细胞以病毒的单链RNA为模板合成RNA的途径。
5.RNA interference:RNA干涉。
指短双链RNA以序列同源互补的mRNA为靶点,通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异地阻断体内特定的基因表达的现象。
该现象揭示了转录后水平的基因沉默机制,可以作为基因功能研究的有力工具。
6.RNA splicing:RNA剪接。
发生在真核生物转录后,切除初级RNA转录物中内含子,连接外显子的过程,是转录后加工的形式之一。
剪接的过程称为二次转酯反应,不消耗能量.7.RNA cleavage:RNA剪切.发生在真核生物转录后,剪去RNA中的某些内含子,并在上游的外显子3’端直接进行多聚腺苷酸化,不进行相邻外显子之间连接的过程,是转录后加工的形式之一.8.RNA polymerase:RNA聚合酶。
以DNA或RNA为模板,以5′三磷酸核苷为原料,能催化合成RNA的酶.可分为DNA依赖的RNA聚合酶和RNA依赖的RNA聚合酶。
其中DNA依赖的RNA聚合酶较为广泛,原核生物中有一种,真核生物有三种,在转录中发挥了重要的作用。
c dna文库的名词解释

c dna文库的名词解释
cDNA文库是指一种用于存储和分析基因序列数据的库。
它是将基因序列以DNA分子的形式存储在特殊的DNA文库载体中,并可以通过PCR扩增等方式进行基因表达的样本。
cDNA文库的名词解释如下:
1. DNA文库载体:一种能够将DNA序列存储在可存储有机分子中的材料,通常由外壳蛋白和DNA片段组成。
外壳蛋白可以保护DNA序列免受环境破坏,而DNA 片段则负责存储基因信息。
2. 基因序列:指由DNA分子中确定的遗传信息,是构成基因的主要元素。
3. PCR扩增:一种用于从cDNA文库中扩增出特定基因的方法,通过聚合酶链反应(PCR)将DNA片段和引物结合到目标基因上,并在适当的温度和条件下进行扩增。
4. 基因组:指人类或任何生物体整个DNA序列的长度。
5. 基因表达:指DNA中的特定序列被翻译成蛋白质的过程。
cDNA文库作为一种存储和分析基因序列数据的重要工具,已经被广泛应用于生物医学研究、药物研发和基因组学等领域。
通过使用cDNA文库,科学家可以更好地理解特定基因的功能和调控机制,从而推动生物医学的发展。
cDNA文库及其构建.
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cDNA文库科技名词定义中文名称:cDNA文库英文名称:cDNA library定义:含一种生物体所有基因编码的cDNA分子的克隆群。
应用学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)本内容由全国科学技术名词审定委员会审定公布以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
概述cDNA文库是以特定的组织或细胞mRNA为模板,逆转录形成的互补DNA (cDNA)与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌形成重组DNA 克隆群,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织或细胞的cDNA文库。
cDNA文库特异地反映某种组织或细胞中,在特定发育阶段表达的蛋白质的编码基因,因此cDNA文库具有组织或细胞特异性。
cDNA文库显然比基因组DNA文库小得多,能够比较容易从中筛选克隆得到细胞特异表达的基因。
但对真核细胞来说,从基因组DNA文库获得的基因与从cDNA 文库获得的不同,基因组DNA文库所含的是带有内含子和外显子的基因组基因,而从cDNA文库中获得的是已经过剪接、去除了内含子的cDNA。
真核生物基因组DNA十分庞大,其复杂程度是蛋白质和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重复序列. 采用电泳分离和杂交的方法,都难以直接分离到目的基因.这是从染色体DNA为出发材料直接克隆目的基因的一个主要困难。
高等生物一般具有105种左右不同的基因,但在一定时间阶段的单个细胞或个体中,都尽有15%左右的基因得以表达,产生约15000种不同的mRNA分子.可见,由mRNA出发的cDNA克隆,其复杂程度要比直接从基因组克隆简单得多。
cDNA文库在研究具体某类特定细胞中基因组的表达状态及表达基因的功能鉴定方便具有特殊的优势,从而使它在个体发育、细胞分化、细胞周期调控、细胞衰老和死亡调控等生命现象的研究中具有更为广泛的应用价值,是研究工作中最常使用到的基因文库。
基因工程 名词解释 (1)
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1.基因工程:是指将一种或多种生物体(供体)的基因与载体在体外进行拼接重组,然后转入另一种生物体(受体)内,使之按照人们的意愿稳定遗传并表达出新产物或新性状的DNA体外操作程序。
2.限制性内切核酸酶:是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列,并由此处切割DNA双链的核酸内切酶。
3.粘性末端:指DNA分子在限制酶的作用下形成的含有几个核苷酸单链的末端,它们能够通过互补碱基间的配对而重新环化起来4.平末端:当限制酶从识别序列的中心轴线处切开时,切开的DNA两条单链的切口,是平整的,这样的切口叫平末端5.酶的星号活性:极度非标准反应条件下,当条件改变时许多限制酶的识别位点会改变,导致与切割序列的非特异性,这种现象称为星号活性6.载体:将外源DNA或基因携带进入宿主细胞进行扩增或表达的工具7.质粒的不相容性:两种质粒在同一宿主细胞中不能共存的现象8.PCR引物:在PCR反应中,与待扩增的DNA两侧碱基互补的寡核苷酸片段,其本质是单链DNA9.cDNA文库:指将某种生物体基因组转录的全部mRNA经反转录产生的cDNA片段,分别与克隆载体重组,储存于某种受体菌中,该群体就称该生物基因组的cDNA 文库10.基因组文库:指将某种生物体的全部基因组DNA用限制性内切酶或机械力量切割成一定长度范围的DNA片段,在与合适的载体在体外重组,并转化相应的宿主细胞,获得的所有阳性菌落,这个群体就称为该生物基因组文库11.DNA体外重组:将外源DNA用DNA连接酶在体外连接到合适的载体DNA上12.感受态细胞:经过适当处理后容易接受外源DNA进入的细胞13.受体细胞:从实验技术上讲是能摄取外源DNA并使其稳定维持的细胞14.报告基因:一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说是一-个其表达产物非常容易被鉴定的基因。
把它的编码序列和基因表达调节顺序相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序.列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控,筛选得到7转化体15.简并序列:分子生物学中,同-种氨基酸具有两个或更多个密码子现象称为密码子的简并性,这样的序列就叫兼并序列16.目的基因:那些已被或者准备要分离、改造、扩增或表达的特定基因或DNA 片段17.同尾酶:来源不同,识别靶序列不同,但产生相同的粘性末端的核酸内切酶。
文库构建
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cDNA基因文库的构建2009-10-11 17:56:18| 分类:||一、cDNA文库的特征和发展:cDNA (complementary DNA):以mRNA为模板,在反转录酶的作用下合成的与之反向互补的DNA链(单链cDNA,反义链),以单链cDNA为模板还可以合成其反向互补链(取代mRNA的DNA链,正义链),得到双链cDNA。
将生物某一组织细胞中的总的mRNA分离出来作为模板,在体外用反转录酶合成互补的双链cDNA,然后连接到合适的载体上,并转入宿主细胞。
这种方法所形成的所有克隆的集合体叫cDNA文库。
1)cDNA只含有对应于成熟mRNA的转录区,不含启动子、终止子、内含子、基因间隔区等。
2)cDNA一般较短,平均长度1.5kb左右,多数为100bp至10kb。
3)表达谱的时空动态性决定了cDNA文库的多样性。
4)不同基因的cDNA间存在丰度上的差异。
二、cDNA文库的构建:1、RNA的分离mRNA是构建cDNA文库的起始材料。
总RNA中绝大多数是tRNA和rRNA,而mRNA只占总RNA的1﹪-5﹪,平均为2%,mRNA的比例取决于细胞类型和细胞的生理状态。
由于mRNA在总RNA中所占比例很小,因此从总RNA中富集mRNA是构建cDNA文库的一个重要步骤。
通过降低rRNA和tRNA含量,可大大提高筛选到目的基因的可能性。
利用Poly(A)尾巴纯化或直接提取mRNA。
1)根据研究目标合理选择器官、组织和细胞类型以及合理的环境条件,用于提取RNA。
2)保持mRNA的完整性,是构建全长cDNA文库的核心。
3)选取合适的提取方法,除完整性外,mRNA还要求纯度高、DNA污染少,最好是采用无RNase的DNase去除杂质DNA。
4)RNA定量准确,保存合理。
5)根据目标和条件决定是否需要纯化mRNA或直接使用总RNA。
2、第一链cDNA的合成由mRNA到cDNA的过程称为反转录(reverse transcription,RT),由反转录酶(reverse transcriptase, RTase)催化。
CDNA文库
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oligo(dT)引导的DNA合成法: 利用真核mRNA分子所具有的poly(A)尾巴的特性,加入12-20个脱氧胸腺嘧啶核苷组成的oligo(dT)短片段,由反转录酶合成cDNA的第一链. 缺 陷: 因为逆转录酶无法到达mRNA分子的5'-末端,必须从3'-末端开始合成cDNA.对于大分子量的较长的mRNA分子而言,特别麻烦. 随机引物引导的cDNA合成法 (randomly primed cDNA synthesis) : 根据许多可能的序列,合成出6-10个核苷酸长的寡核苷酸短片段(混合物),作为合成第一链cDNA的引物.在应用这种混合引物的情况下,cDNA的合成可以从mRNA模板的许多位点同时发生,而不仅仅从3'-末端的oligo(dT)引物一处开始.
以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,与适当的载体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的一部分表达,而且处在不同环境条件、不同分化时期的细胞其基因特异表达NA。 真核生物基因组DNA十分庞大,其复杂程度是蛋白质和mRNA的100倍左右,而且含有大量的重复序列. 采用电泳分离和杂交的方法,都难以直接分离到目的基因.这是从染色体DNA为出发材料直接克隆目的基因的一个主要困难. 高等生物一般具有105种左右不同的基因,但在一定时间阶段的单个细胞或个体中,都尽有15%左右的基因得以表达,产生约15000种不同的mRNA分子.可见,由mRNA出发的cDNA克隆,其复杂程度要比直接从基因组克隆简单得多.
编辑本段双链cDNA分子的克隆
将合成的双链重组到质粒载体或噬菌体载体上,转化大肠杆菌寄主细胞增殖. 1,同聚物加尾法 利用小牛胸腺末端转移酶在双链cDNA和质粒载体的3'-端都加上一个互补的同聚片段,通过退火使两个片段连接成重组质粒,再将重组质粒转化受体细胞. 同聚物加尾法克隆双链cDNA 2,接头-衔接头法 3,mRNA-cDNA克隆法 方 法: 在mRNA反转录合成cDNA第一链后,将dA残基加到mRNA:cDNA杂交体上,然后与带dT尾的克隆载体连接,转化受体细胞,在宿主细胞内,mRNA被降解并代之以DNA. 缺 点: 克隆的效率低(为双链cDNA克隆的1/10) 4,Okayama-Berg法合成并克隆双链cDNA
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cdna 文库名词解释
cDNA 文库是一种生物学研究中常用的技术手段,它通过反转录酶将 mRNA 转录成 cDNA,再进行克隆和扩增,最终得到一个包含所有基因编码的 cDNA 分子的克隆群。
本文将为您详细介绍 cdna 文库的概念、制作方法、优缺点以及在生物学研究中的应用。
一、cdna 文库的概念
cdna 文库是指某生物某一发育时期所转录的 mRNA 全部经反转录形成的 cDNA 片段与某种载体连接而形成的克隆的集合,具有组织或细胞特异性。
cDNA 文库的制作方法通常包括 mRNA 的提取、反转录、克隆和扩增等步骤。
二、cdna 文库的制作方法
1.mRNA 的提取:从生物组织或细胞中提取 mRNA,可以使用酚/氯仿法、异硫氰酸胍法等方法进行提取。
2.反转录:将提取到的 mRNA 用反转录酶反转录成 cDNA,反转录酶通常使用 MMLV 或 HIV 反转录酶。
3.克隆:将反转录产生的 cDNA 片段与载体连接,通常使用质粒载体,如 pCDNA3.1 等。
4.扩增:通过 PCR 技术对克隆的 cDNA 片段进行扩增,获得足够的 cDNA 文库。
三、cdna 文库的优缺点
cdna 文库的优点是可以从组织或细胞中快速、高效地获取目的基因,并且可以进行高通量测序,获取大量的转录组信息。
此外,由于 cDNA 文库只包含 mRNA 转录的 cDNA 片段,因此可以减少基因组DNA 污染和 rRNA 等非编码 RNA 的干扰。
cdna 文库的缺点是需要进行反转录过程,可能会引起基因突变;同时,由于反转录酶的作用,cDNA 文库中可能会含有一些误差,如插入误差、缺失误差等。
四、cdna 文库在生物学研究中的应用
cdna 文库在生物学研究中应用广泛,例如:
1.基因表达分析:通过比较不同组织或细胞中的 cDNA 文库,可以了解基因在不同组织或细胞中的表达情况,从而探究基因的功能和调控机制。
2.基因克隆和表达:通过 cDNA 文库可以快速克隆目的基因,并进行表达和功能研究。
3.转录组学研究:通过对 cDNA 文库进行高通量测序,可以获取某一组织或细胞在不同时期或环境下的全部转录组信息,从而进行转录组学研究。