Windows 下 R 软件及程序包 packages 安装使用必读

Windows 下R 软件及程序包packages 安装使用必读—R.2.13.1 版（2011.7.8）

前言：

高效、开源的统计计算及图形软件—R 软件，在多门学科中有着重要的、广泛的应用，但由于其使用平台过多于Linux 系统，虽然目前的版本（2.13.1 版upto2011.7.8）已经兼容了Windows 和苹果机，但是使用起来还是不太方便，特别是中文的使用，存在一些小问题，本人经过自己摸索和上网查找资料，获取了一下的使用心得，分享给大家。

From marybr66@

一、下载和安装R 客户端

1、下载：

从R 官网：/ 下载最新的R 版本（2.13.1 版until 2011.7.8）。官网上还有大量的资源和资料可以查看，不过都是英文版，需要花点功夫去看。

2、安装：

直接默认安装，基本上没有什么问题。如果是自定义安装，注意选择使用Internet2，否则安装后的客户端不能使用网络下载和更新安装包，注意看安装后的桌面图标，右键属性，后面会有--internet2 的命令选项，而选择Standard 安装后，生产的桌面图标没有--internet2 的命令选项。

二、下载和安装R 程序包（packages）

1、使用R 图形界面的菜单栏安装（zip 格式的安装包）：

1．1 选择镜像安装

安装好R 之后，打开Rgui.exe 程序窗口->程序包->安装程序包，注意需要使用网络（默认的安装使用了Internet2，可以查看桌面的R 图标，命令中带--internet2）在弹出的镜像中选择一个，镜像的连接与官网一致，然后下一个窗口会弹出packages 的选择框，选中你所需的包，最后就会连接下载安装，信息会在Rgui 窗口中显示。

1．2 选择本地安装需要从网上下载安装包，注意类型必须是.zip 格式，关于格式会在后面说明。还是从官网上/mirrors/CRAN/下载packages，然后打开Rgui.exe 程序窗口->程序包->从本地zip 文件安装程序包，就ok 了，信息会在Rgui 窗口中显示。

2、使用R 客户端的install.packages()函数安装（zip 格式的安装包）：

可以使用？install.packages()查看帮助，具体命令为

install.packages(pkgs, lib, repos = getOption("repos"),

contriburl = contrib.url(repos, type),

method, available = NULL, destdir = NULL,

dependencies = NA, type = getOption("pkgType"),

configure.args = getOption("configure.args"),

configure.vars = getOption("configure.vars"),

clean = FALSE, Ncpus = getOption("Ncpus", 1L),

libs_only = FALSE, INSTALL_opts, ...)

pkgs 为安装包名称，如果repos = NULL，就是本地安装，需要写成全路径的.Zip 文件安装包，lib 表示安装的位置，缺省则为客户端中的系统包的位置，如果需要更改位置，则需要自定义，repos 表示程序库的URL(s)，CRAN 如镜像的安装连接的是""，本地文件安装的时候，可以将repos = NULL，后续的参量一般缺省即可。

注意，R 中可能对路径符―\‖敏感，可以使用―/‖或者―\\‖代替。

注意，这个安装包可以在R 脚本程序中使用，因为这是一个R 的函数。另外，据说linux 下可以安装.tar.gz 格式的源程序，不过在windows 下好像只能安装zip 格式，windows 下好像不方便source 的安装，如果有人知道window 下的tar.gz 格式的安装方法，请联系本人marybr66@。

3、使用R 程序的命令方式安装（Rcmd INSTALL）（zip 或者tar.gz 格式均可）：首先，需要将R 程序的路径添加到系统的环境变量PATH，如本人就将C:\Program Files\R\R-2.13.1\bin\i386 这个添加到PATH 里面了。这样在开始-> 运行->cmd 后，就可以直接使用Rcmd 命令了。检查环境变量添加是否正确的方式，就是在命令提示符中输入r，如果进入Rgui.exe 类似的文字显示时，表示进入了R 系统，可以使用R 中的函数比如ls()等。Rcmd 命令，（老版本是R cmd，现在更新后改了），其实是刚添加的路径下的EXE 程序，其功能是支持类似linux 系统中的命令行操作，比如INSTALL，REMOVE，check，build 等，可输入Rcmd 查看提示的功能。这里的安装同样需要自己下载的程序包，或者自己开发的包，或者从Linux 系统上build 的文件，其格式应该为.tar.gz （源程序，source）或者为.ZIP ，格式（程序，binary）。可以在命令后加入-L 自定义安装包路径，不用全部安装到系统路径中，方便管理，对应的删除命令就是REMOVE。完整的package 安装命令就是：Rcmd INSTALL your_download_path\packagename.zip [-l your_lib_path] 值得注意的是，这里可以安装.tar.gz 格式的源程序（这也是windows 下安装.tar.gz 的source 文件最成功的一个方法），但注意，如果程序中有其他语言的代码如C、C++、Fortran 等，则安装时会不通过，因为缺少相应编译器，可能会安装失败，这时候，需要安装另一个在windows 下支持R 的Rtools 软件，可以在/Rtools/上下载到，该软件支持其他语言在R 软件上安装package，其具体作用在后续的创建R 程序包中详细介绍。

4、格式说明：程序包的格式包括四个，例如pls 程序包：Package source: pls_2.1-0.tar.gz MacOS X binary: pls_2.1-0.tgz Windows binary: pls_2.1-0.zip Reference manual: pls.pdf