mimics 使用说明
Mimics17.0软件教程(最完整版)-6
在“文件”菜单中,选择“打开”(Ctrl+O)。浏览到安装额外教程文件的目录,然后双击 femur.mcs 文件。
计算 3D
此数据集中已有一个黄色遮罩可用于计算三维对象。选择黄色遮罩并单击遮罩工具栏中的计算三维图标。在“计 算三维”对话框中,选择“高质量”设置并单击“计算”。
导入 STL
在“文件”菜单中,选择“导入 STL”(或转到“项目管理”中的“STL”选项卡并单击“加载” STL 从选项卡的工具栏。在 STL 选项卡的工具栏中)。从 TutorialData 文件夹加载 inmpt.stl。
要使植入在三维视图中可见,请启用“三维”工具栏中的透明度。通过在 3D 和 STL 选项卡中切换透明度模式, 可以更改每个 3D 对象的透明度设置。左键单击“Transparency(透明度)”设置可更改为其他级别的透明度。
股骨头切除术
为了移除股骨头,我们将使用模拟模块中的多平面切割。从 模拟菜单选择 Cut(切割)->Polyplane Cut(多平面切割)。在“模拟”对话框中,选择骨骼的三维模型黄色。 要在股骨颈顶部执行一次切割单击,请转动 3D 并双击底部。这将创建一个切割平面,如下图所示:
5。当尝试导入 DICOM 图像时,会显示消息“无法处理 DICOMDIR”,并且不会读取任何内容。 它可能是一个 DOS 格式的磁盘,其中包含正在读取的 DICOM 图像。在这些磁盘上通常有一个名为 dicomdir 的 文件,它列出了磁盘上的所有图像。如果找不到该文件,则 mimics 无法导入图像并向您发出此警告。检查磁盘 是否不是空的,因为 DicomDir 很奇怪会丢失…
97
平滑股骨轴
因为股骨的三维模型将仅用于有限元分析,所以可以减少其细节量。
mimics建模教程
人体股骨远端和胫骨近端模型的mimics反求设计3.3.1数据采集股骨远端和胫骨近端的数据采集工作是在天津某医院完成的。
选取正常男性健康志愿者,年龄31岁,身高1.72米,膝关节无疾病及畸形。
对于其右侧膝关节行CT扫描。
扫描层厚1mm,扫描层数199层。
得到连续横断面图像以及矢状面图像。
所得DICOM数据资料通过工作站传输到移动硬盘,作为膝关节重建数据来源。
3.3.2数据预处理将扫描好的CT数据拷贝到计算机上,通过“File”菜单下“Import images”导入扫描图片,如图3-34所示,选择需要的图片数据并打开。
图3-34 MIMICS数据导入界面点击“Next”按钮,如图3-35所示,选中想要进行的转换项目(其中包含图片数量、像素大小、图片类型、定位参数等),点击“Convert”按钮,完成转换。
设置“定位参数”,界面如图3-35所示。
图3-35 图片转换和定位参数的设定导入并完成图片的转换之后,MIMICS软件会自动计算并生成冠状面图和矢状面图。
如图3-34所示,软件用三个视图来显示这三个位置的图片,并且这三个视图是相互关联的,可以通过鼠标和定位工具栏快速定位。
右上角的图是原始的扫描图像;左上角和下角是由原始横断面图像计算生成的冠状面和矢状面图像。
红线指示横断面图像的位置;黄线指示冠状面图像的位置;绿线指示矢状面位置。
由于扫描的CT 图片太多,在重建三维模型时必定过于繁琐,需要通过“Orangize images”命令简化CT 图片,不需要的图片将不会在项目中出现,这样可以减少工作量,节省计算机资源,提高建模效率。
3.3.3 股骨远端模型的构建图3-36 MIMICS 建模工具栏在这里详细介绍股骨远端模型的构建过程。
主要使用的命令如图3-36所示。
1. 阈值分析断层图片中,不同组织的灰度值不同,因此通过阈值来提取相应的组织,利用软件自带的“阈值设定”(Threshold)选择需要重建的模型。
mimics教程
mimics教程第一单元什么是MimicsMimics是Materialise公司的交互式的医学影像控制系统,即为Materiaise's interactive medical image control system.它是模块化结构的软件,可以根据用户的不用需求有不同的搭配。
下面是这些模块的介绍:MIMICS软件介绍MIMICS是一套高度整合而且易用的3D图像生成及编辑处理软件,它能输入各种扫描的数据(CT、MRI),建立3D模型进行编辑,然后输出通用的CAD(计算机辅助设计)、FEA(有限元分析),RP(快速成型)格式,可以在PC机上进行大规模数据的转换处理。
MEDCAD模块:MEDCAD模块是医学影像数据与CAD之间的桥梁,通过双向交互模式进行沟通,实现扫描数据与CAD数据的相互转换。
在MIMICS的项目中建立CAD项目的方法有以下两种:1. 轮廓线建模:在分割功能状态下,MIMICS自动在分离出的掩模上生成轮廓线,MEDCAD能在给定误差的条件下自动生成一个局部轮廓线模型,进而用于医用几何学CAD模型中。
创建的CAD模型的可能方法:-B样条曲线及曲面-点,线,圆,曲面,球体,圆柱体等所有这些实体均可以iges格式输出到CAD软件中制做植入体,另一个典型的运用是用MEDCAD模块做统计分析,如测量很多不同股骨头的数据,为建立标准股骨头植入体时作参考。
2. 参数化或交互式CAD建模可在2D或3D视图中直接创建CAD对象,或者用参数设置的方式创建(如定义圆心、半径来创建一个圆),创建后可用鼠标进行交互式编辑。
方便设计验证:为验证CAD植入体的设计,MIMICS输入STL文件格式在2D视图及标准视图中显示,或在3D视图中显示,用透明方式显示解剖关系,使用这一方法可以快速实现医学影像数据在CAD设计软件中的调用。
RP-SLICE模块:Rp-slice模块在MIMICS与多数RP机器之间建立SLICE格式的接口,RP-Slice 模块能自动生成RP模型所需的支撑结构。
mimics 教程
二 பைடு நூலகம்具使用
Thresholding
• 点击threshold,在出现的对话框中重建组 织的阈值,或者以其为参考,拉动峰图中 的竖线调节。 • 同样,可以在右侧导航栏中,点击new,新 建一个mask,用同样的方法调节阈值。
Region growing
• 点击region growing ,鼠标此时变为双十 字,将双十字在axial 288层面,点击股骨 干,然后出现新的mask: yellow.接着对 yellow ,3D calcualte.
Boolean operation 胫骨
• 用复制的mask减去yellow得到胫骨
Multiple slice edit
Red slice
• 用lasso,选中axial 42.0层,选择所要编辑的 层数,本例40,点击﹀,remove,apply.42以 下的层数全部擦除。3D,calculate得到的 是42层以上的结构。red5
Crop
• 利用该工具可以选择某一局部进行操作。
去掉多余的骶骨
• 1.新建mask blue • 2.点击crop,出现框框,将骶骨选入框中, 点击ok • 3.然后blue 3D,仅选中区域重建出来,得到 3D结果blue 7
Morphology operation
• 可以进行erode、dilate、open、close等操 作
Edit mask
• 首先选择对象mask为yellow • 选择axial,57层,点击edit ,type选 lasso,remove,将髁间的部分选中,然后 点击apply • 同样操作,连续四层。 • 重新应用region growing,3D calcualte出除 去胫骨的股骨以上部分
Mimics8.01简易教程
1、Mimics8.01教程--入门级------import 导入图1Mimics 导入图片只能导入bmp格式的图片,可使用图片处理王转换图片的格式。
如上图所示,点击FILE后,菜单里显示两种导入方法:一为open project;二为import images(其中又分为自动导入,半自动导入,手动导入三种)。
下文分述之:①open project:即导入工程文件,mimics的工程文件后缀名为.mcs,安装完程序后,程序自带工程文件demon.mcs,mimi.mcs,femur.mcs等,当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。
②import imagesauto-import:自动导入,即我们选定路径及文件后,系统自动导入,此限于mimics支持的dicom文件。
点击import images后弹出import images 菜单,左上角显示"1",即第1步,左侧为路径选择栏,右侧为内容,找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后,右侧即显示其中的内容,并默认全部选中状态,可点击下方next(或可选择需要导入的图像,然后点击next),进入第2步,如方才选中的图像参数一致(即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心)则显示为一个部分,如否,则分成几个部分分别显示,然后点击convert。
如果定位参数缺失或不能识别则进入change orientation对话框,此时需手动设置图像的方向,移动鼠标至图像中标为"X”的部位,右键单击,选择top或bottom等。
设置完成,点击OK。
Semi-automatic import:半自动导入,当导入的文件格式为BMP或TIFF 时,会弹出BMP/TIFF import对话框,以设置部分参数,见下图:图2图3 点击convert即可。
2、调整视窗图4鼠标放到红色叉号处右击分别选择试图角度,调整好的角度如下图所示图5点击OK即可。
mimics新手教程
mimics10.01教程--入门级(二)------import 导入2011-05-11 0:241.如上图所示,点击FILE后,菜单里显示两种导入方法:一为open project;二为import images(其中又分为自动导入,半自动导入,手动导入三种)。
下文分述之:①open project:即导入工程文件,mimics的工程文件后缀名为.mcs,安装完程序后,程序自带工程文件demon.mcs,mimi.mcs,femur.mcs等,当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。
②import imagesauto-import:自动导入,即我们选定路径及文件后,系统自动导入,此限于mimics支持的dicom文件。
点击import images后弹出import images菜单,左上角显示"1",即第1步,左侧为路径选择栏,右侧为内容,找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后,右侧即显示其中的内容,并默认全部选中状态,可点击下方next(或可选择需要导入的图像,然后点击next),进入第2步,如方才选中的图像参数一致(即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心)则显示为一个部分,如否,则分成几个部分分别显示,然后点击convert。
如果定位参数缺失或不能识别则进入change orientation对话框,此时需手动设置图像的方向,移动鼠标至图像中标为"X”的部位,右键单击,选择top或bottom等。
设置完成,点击OK。
Semi-automatic import:半自动导入,当导入的文件格式为BMP 或TIFF时,会弹出BMP/TIFF import对话框,以设置部分参数,见下图:一般手动更改红色箭头所标示的Slice Distance,Pixel Size 数值,然后点击OK即可,,如导入错误,则说明其余数值有变动,应向CT扫描人员索取变动信息并填入,余同前。
mimics中文版教程(持续更0812)
第二章Mimi本教程的第二个例子中,我们将为你展示Mimics的一些基本功能,所要讨论的主题如下:●打开工程Opening the Project●窗口化Windowing●二值化Thresholding●区域增长Region Growing●建立3D表示Creating a 3D representation●显示3D表示Displaying a 3D representation●STL+过程STL+ Procedures●生成STL文件Generating a STL file●RP分层过程RP Slice procedures●生成一个轮廓文件Generating a contour file●生成支持文件Generating supports●结果视图View of the end result1.打开工程在文件菜单栏中,选择打开工程选项(或者直接用快捷键Ctrl+O),打开对话框中将显示工作目录中所有工程,双击打开mimi.mcs文件。
所有的图片都被打开并显示在三个视图中,右边视图是轴视图(xy-view或者axial view),左侧上面的视图是前视图(xz-view或者coronal view),左侧下面的视图是侧视图(yz-view或者sagittal view)。
不同颜色的交叉线代表了每个视图的等高线(contour lines),每条指示线能够标记相关视图的切片。
你可以在任意视图的CT图片的任意位置直接用鼠标点击你想要操作的位置,交叉线的位置将会到达你所点的位置,所有试图将更新显示为相关的切片。
如果视图中有些方位标记有错需要修改,在File > Change Orientation中打开窗口你可以通过右键鼠标选择正确的方位。
在菜单栏View > Indicators中可以选择分别关闭刻度线(Trick Marks)、交叉线(Intersection Lines)、分片位置(Slice Position)、方位字符(Orientation strings)指示器。
mimics新手教程
mimics10.01教程--入门级(二)------import 导入2011-05-11 0:241.如上图所示,点击FILE后,菜单里显示两种导入方法:一为open project;二为import images(其中又分为自动导入,半自动导入,手动导入三种)。
下文分述之:①open project:即导入工程文件,mimics的工程文件后缀名为.mcs,安装完程序后,程序自带工程文件demon.mcs,mimi.mcs,femur.mcs等,当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。
②import imagesauto-import:自动导入,即我们选定路径及文件后,系统自动导入,此限于mimics支持的dicom文件。
点击import images后弹出import images 菜单,左上角显示"1",即第1步,左侧为路径选择栏,右侧为内容,找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后,右侧即显示其中的内容,并默认全部选中状态,可点击下方next(或可选择需要导入的图像,然后点击next),进入第2步,如方才选中的图像参数一致(即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心)则显示为一个部分,如否,则分成几个部分分别显示,然后点击convert。
如果定位参数缺失或不能识别则进入change orientation对话框,此时需手动设置图像的方向,移动鼠标至图像中标为"X”的部位,右键单击,选择top或bottom等。
设置完成,点击OK。
Semi-automatic import:半自动导入,当导入的文件格式为BMP或TIFF 时,会弹出BMP/TIFF import对话框,以设置部分参数,见下图:一般手动更改红色箭头所标示的Slice Distance,Pixel Size数值,然后点击OK即可,,如导入错误,则说明其余数值有变动,应向CT扫描人员索取变动信息并填入,余同前。
mimics教程
mimics教程第一单元什么是MimicsMimics是Materialise公司的交互式的医学影像控制系统,即为Materiaise's interactive medical image control system.它是模块化结构的软件,可以根据用户的不用需求有不同的搭配。
下面是这些模块的介绍:MIMICS软件介绍MIMICS是一套高度整合而且易用的3D图像生成及编辑处理软件,它能输入各种扫描的数据(CT、MRI),建立3D模型进行编辑,然后输出通用的CAD(计算机辅助设计)、FEA(有限元分析),RP(快速成型)格式,可以在PC机上进行大规模数据的转换处理。
MEDCAD模块:MEDCAD模块是医学影像数据与CAD之间的桥梁,通过双向交互模式进行沟通,实现扫描数据与CAD数据的相互转换。
在MIMICS的项目中建立CAD项目的方法有以下两种:1. 轮廓线建模:在分割功能状态下,MIMICS自动在分离出的掩模上生成轮廓线,MEDCAD能在给定误差的条件下自动生成一个局部轮廓线模型,进而用于医用几何学CAD模型中。
创建的CAD模型的可能方法:-B样条曲线及曲面-点,线,圆,曲面,球体,圆柱体等所有这些实体均可以iges格式输出到CAD软件中制做植入体,另一个典型的运用是用MEDCAD模块做统计分析,如测量很多不同股骨头的数据,为建立标准股骨头植入体时作参考。
2. 参数化或交互式CAD建模可在2D或3D视图中直接创建CAD对象,或者用参数设置的方式创建(如定义圆心、半径来创建一个圆),创建后可用鼠标进行交互式编辑。
方便设计验证:为验证CAD植入体的设计,MIMICS输入STL文件格式在2D视图及标准视图中显示,或在3D视图中显示,用透明方式显示解剖关系,使用这一方法可以快速实现医学影像数据在CAD设计软件中的调用。
RP-SLICE模块:Rp-slice模块在MIMICS与多数RP机器之间建立SLICE格式的接口,RP-Slice 模块能自动生成RP模型所需的支撑结构。
mimics12.0培训手册(总结)
mimics教程第一单元什么是MimicsMimics是Materialise公司的交互式的医学影像控制系统,即为Materiaise's interactive medical image control system.它是模块化结构的软件,可以根据用户的不用需求有不同的搭配。
下面是这些模块的介绍:MIMICS软件介绍MIMICS是一套高度整合而且易用的3D图像生成及编辑处理软件,它能输入各种扫描的数据(CT、MRI),建立3D模型进行编辑,然后输出通用的CAD(计算机辅助设计)、FEA(有限元分析),RP(快速成型)格式,可以在PC机上进行大规模数据的转换处理。
MEDCAD模块:MEDCAD模块是医学影像数据与CAD之间的桥梁,通过双向交互模式进行沟通,实现扫描数据与CAD数据的相互转换。
在MIMICS的项目中建立CAD项目的方法有以下两种:1. 轮廓线建模:在分割功能状态下,MIMICS自动在分离出的掩模上生成轮廓线,MEDCAD能在给定误差的条件下自动生成一个局部轮廓线模型,进而用于医用几何学CAD模型中。
创建的CAD模型的可能方法:-B样条曲线及曲面-点,线,圆,曲面,球体,圆柱体等所有这些实体均可以iges格式输出到CAD软件中制做植入体,另一个典型的运用是用MEDCAD模块做统计分析,如测量很多不同股骨头的数据,为建立标准股骨头植入体时作参考。
2. 参数化或交互式CAD建模可在2D或3D视图中直接创建CAD对象,或者用参数设置的方式创建(如定义圆心、半径来创建一个圆),创建后可用鼠标进行交互式编辑。
方便设计验证:为验证CAD植入体的设计,MIMICS输入STL文件格式在2D视图及标准视图中显示,或在3D视图中显示,用透明方式显示解剖关系,使用这一方法可以快速实现医学影像数据在CAD设计软件中的调用。
RP-SLICE模块:Rp-slice模块在MIMICS与多数RP机器之间建立SLICE格式的接口,RP-Slice 模块能自动生成RP模型所需的支撑结构。
mimics中文教程
Mimics 是处于扫描数据和模型、STL 格式,CAD 和有限无分析之间的界面 软件。是可以处理所有通用扫描格式的具有 3D 可视化功能的图像处理包。
还提供了其它的使用 STL 快速成型或直接分层格式的模型支持界面支持。也 就是说可以提供给 CAD 或者有限元网格的使用软件。
Materialise 公司的医学图像处理系统软件是个可视化工具,用于 CT 图像和 MRI 图像分割、3D 渲染。
2 STL +模块 STL +模块通过三角化格式提供的界面选项,通过三角片文件,Mimics STL+模块提供
了 Mimics 与所有快速成型系统的接口,为了提高 RP 模型的精度,这些文件在生成的时候 采用了双线性和中值插值算法。
计算参数通过对一些计算参数的设定 ,STL+模块可以减少输出文件中 的三角面片的数 目,可以对图像进行插值,还可以对 3D 文件进行光顺处理。这里有两种计算三角形数目的 方法:矩阵减少和三角形减少。矩阵减少允许象素的分组生成三角形。三角形减少可以减少 网格中三角形的数目。这可以快速的操作文件。
本软件使用户能够控制 CT 扫描和 MRI 扫描的正确划分过程。例如,可以去 除因金属植入物导致的图像失真。可以根据医学参数精确定义物体的成像或者分 析。在建立 3D 医学图像时也不需要特别的专业知识。
为了定义和计算所需的数据,有专门独立的软件来建立医疗对象( S)模型 实现所有快速原型系统的创建。
分割 这一功能可将一个对象分成彼此独立的 3D 模型,然后建立多个不同的局部 3D 模型。 融合 融合功能将所选的不同模型变成一个模型。 镜像 镜像功能可以将选定的对象沿一个设定的平面或一个巳有平面(从人体数据分析或 MEDCAD 得来)镜像生成新的对象,可以选取多个对象进行镜像操作。 重定位 对象可以被转化或者旋转。对每种操作,对象都能被调整到客户需要的合适大小 和位置。客户可以选择相应的对象操作限制。可以选择的有:轴向移动,平面移动,绕轴旋 转和绕点旋转。当然,无限制操作也是可选项之一。通过配准功能 ,客户可以利用标志点简 单的重定位对象。也可以利用鼠标定位对象。 5 FEA Module 有限元分析模块
Mimics 软件教程 最完整版
94
股骨和植入物的重熔
股骨和植入物现在必须在 3-matic 中修复。要执行此操作,请转到 FEA 菜单并选择 Remesh。这将显示以下对 话框:
93
切割方向仍可以修改。当光标停留在红色箭头的中心时 更改为重定位图标,按住鼠标左键。通过移动鼠标,可以更改切割平面的方向。
按住鼠标左键可更改切割平面的方向。 要完成切割,切割平面应完全穿过骨骼。因此需要增加深度。在“使用多平面切割”对话框中,单击“属性”。在“属 性”对话框中,将深度更改为 50 mm。
2。每次从“文件”菜单中选择“导入图像”,计算机都会重新启动。 导入图像时,MIMICS 会尝试联系已连接的 SCSI 设备。它导致问题的原因是这些设备中的一个(或多个)发出 错误消息。在 mimics 中,有一个功能可以阻止来自某些设备的消息,这样这个问题就不会再发生了。打开“模 拟”,然后从“文件”菜单中选择:“选项”->“高级 SCSI”。在出现的对话框中,禁用启用 SCSI 复选框。单击“确 定”,重新启动模拟,然后再次尝试导入。
95
选择植入物和股骨轴,然后单击“确定”。模拟记忆将打开,显示三个选项卡,三维视图,植入物的检查场景,股 骨的检查场景。 我们将首先结合股骨轴和植入物。然后再对组合网进行重熔和分离。
创建非歧管组件
非流形组件是一个具有多个部分的对象,例如在本例中植入物放置在切割的股骨内。这个物体有一个共同的界 面,在我们的例子中是股骨植入界面。创建这样的对象时,希望两个部分的公共曲面相同。为此,我们使用创 建非流形装配操作。此操作将两个网格合并为一个网格,并在接口处保持节点连续性。 转到三维视图,然后从“重读”菜单中选择->创建非歧管组件(或使用 在重熔工具栏中创建非流形部件图标)。 作为主要实体,通过左键单击股骨选择股骨轴。现在单击相交实体并选择植入物。单击“应用”组合两个网格
Mimics17.0软件教程(最完整版)-3
在“文件”菜单中,选择“打开”(Ctrl+O)。浏览到安装额外教程文件的目录,然后双击 femur.mcs 文件。
计ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ 3D
此数据集中已有一个黄色遮罩可用于计算三维对象。在“计算三维”对话框中,选择“高质量”设置并单击“计算”。
重温 3D
在下一步中,我们将重新编写 3D,使其成为 FEA 的最佳用途。进入 FEA/CFD 菜单并选择 Remesh(重熔),启动重熔器。您会注意到有两个 3D 模型,选择黄色的 1 3D 模型。 Femurshaft 模型将在非流形装配教程中使用。
45
3-Matic 将打开,部件已加载以便重新加热。选择零件并单击“创建检查场景”按钮以检查网格 的质量。
有几个形状参数可用于测量三角形的质量。对于这个例子,我们将使用 height/base(n)参数。 此参数是三角形高度和底部之间的标准化比率值。完全等边三角形的质量为 1,非常差的三角形的 质量为 0。在“质量参数”部分中,从“形状度量”下拉框中选择“高度/基准(N)”。
48
执行拉普拉斯(1 阶)并使用以下参数:平滑因子 0.7、3 次迭代和检查使用补偿。 步骤 B:三维对象包含的三角形太多,无法进行有限元分析。减少 三角形,转到 Fix->Reduce(或使用工具栏中的 Reduce 图标)。用鼠标左键点击三维模型进行选择,使用以 下参数方法:法向、翻转阈值角度:15、几何误差:0.2、迭代次数:5。
51
将此表面重命名为小转子: 接下来,从 remesh 工具栏设置自动重读操作,如下所示:
52
从 3-matic 中的左侧边栏中启用“查看三角形”选项以查看三角形。结果如下所示。 53
步骤 E:如果网格仍然包含一组小三角形。这些可以使用保留质量的减少三角形来删除。转到 remesh->quality preserve reduce triangles(或使用质量 保留 remesh 工具栏中的三角形缩减图标)。以下是股骨病例的推荐参数:质量阈值 0.4、迭代次数 4、最大几 何误差 0.3 mm、最大边缘长度 5 mm。
inhibitor and mimics转染使用说明方法学
mmu-miR-125a-5p研究策略Standard 报价Standard 报价2ng 350 RMB 5ng 600 RMBmicr ON™ mmu-miR-125a-5pmimic2ng 300 RMB 5ng 500 RMBmicr OFF™ mmu-miR-125a-5pinhibitor,转染mmu-miR-125a-5p mimic(24孔板为例)1.联系锐博公司合成mmu-miR-125a-5p mimic和mmu-miR-125a-5p inhibitor;2.合成的2ng mmu-miR-125a-5p mimic用1000ul RNase-free water配制成20uM的储存液,分装成5ul每管放-30或-80冻箱冻存(mimic的工作浓度为50nM);3.转染前一天,胰酶消化细胞并计数1X105 c-kit-,细胞铺板,使其在转染日密度为90%。
细胞铺板在0.5ml含血清,不含抗生素的正常生长的培养基中;4.对于每孔细胞,使用50μl无血清培养基(如OPTI-MEMⅠ培养基)稀释1.25ul mmu-miR-125a-5p mimic 存储液;5.对于每孔细胞,使用50μl OPTI-MEMⅠ无血清培养基稀释1μl LIPOFECTAMINE 2000试剂。
Lipofectamine 2000稀释后室温5分钟(在30分钟内同稀释的RNA混合。
室温时间过长会降低活性。
)注意:即使Lipofectamine 2000使用OPTI-MEMⅠ稀释,细胞也可以使用D-MEM培养。
如果D-MEM做为Lipofectamine 2000的稀释液,必须在5分钟内同稀释的DNA混合6.混合稀释的RNA(第4步)和稀释的Lipofectamine 2000(第5步)。
在室温保温20分钟。
注意:溶液可能会混浊,但不会影响转染。
复合物可以在室温保持6小时稳定7.直接将复合物加入到每孔中,摇动培养板,轻轻混匀,加入500ul培养基,混匀。
mimics中文版教程(持续更新版0812)
第二章Mimi本教程的第二个例子中,我们将为你展示Mimics的一些基本功能,所要讨论的主题如下:●打开工程Opening the Project●窗口化Windowing●二值化Thresholding●区域增长Region Growing●建立3D表示Creating a 3D representation●显示3D表示Displaying a 3D representation●STL+过程STL+ Procedures●生成STL文件Generating a STL file●RP分层过程RP Slice procedures●生成一个轮廓文件Generating a contour file●生成支持文件Generating supports●结果视图View of the end result1.打开工程在文件菜单栏中,选择打开工程选项(或者直接用快捷键Ctrl+O),打开对话框中将显示工作目录中所有工程,双击打开mimi.mcs文件。
所有的图片都被打开并显示在三个视图中,右边视图是轴视图(xy-view或者axial view),左侧上面的视图是前视图(xz-view或者coronal view),左侧下面的视图是侧视图(yz-view或者sagittal view)。
不同颜色的交叉线代表了每个视图的等高线(contour lines),每条指示线能够标记相关视图的切片。
你可以在任意视图的CT图片的任意位置直接用鼠标点击你想要操作的位置,交叉线的位置将会到达你所点的位置,所有试图将更新显示为相关的切片。
如果视图中有些方位标记有错需要修改,在File > Change Orientation中打开窗口你可以通过右键鼠标选择正确的方位。
在菜单栏View > Indicators中可以选择分别关闭刻度线(Trick Marks)、交叉线(Intersection Lines)、分片位置(Slice Position)、方位字符(Orientation strings)指示器。
MIMICS软件试用安装与激活
尊敬的用户:
您好!
欢迎试用Mimics Innovation Suite软件。
请您根据下面的流程来完成软件的安装。
谢谢!
软件安装:
点击运行您获得的软件安装文件,采用默认设置,逐步点击Next按钮完成软件安装。
软件激活:
软件安装后,您需要申请软件试用许可或License才能激活并使用软件。
步骤如下:
1.运行软件,弹出如下窗口,选择Evaluation。
2.点击Next按钮,弹出如下窗口,选择第二个选项。
3.点击Next,弹出如下窗口。
4.拷贝System ID发给与您联系的Materialise工程师,工程师会尽快为您申请
软件试用的License Key file。
5.收到License Key file后,点击上图的Browse按钮导入License Key file即可
激化软件。
如果在软件试用的过程中,有任何问题,请联系Materialise工程师。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
注:1)不同细胞的生长速度不同,接种细胞的数量需依经验而定;2)每孔接种的细胞数量尽量相同,使细胞均匀分布。
b. 悬浮细胞:
接种1×105~5×105个细胞至含有500μl完全培养基的24孔板。
2)转染步骤
对于每个转染样品,请按以下步骤准备:
a. 稀释mimic:用50μl 1X ribo FECT TM CP Buffer(v1)稀释1.25μl 20μM miRNA mimic储存液(v2),轻轻混匀,室温孵育5min。
b. 混合液制备:加入5μl ribo FECT TM CP Reagent(v3),轻轻吹打混匀,室温孵育0~15min。
注:1)请不要振荡,溶液可能会有浑浊,但不会影响转染;2)混合液可室温放置一段时间,但不宜超过24h。
c. 将ribo FECT TM CP混合液加入到443.75μl细胞培养基(v4)中,轻轻混匀。
注:混合液加入原细胞培养基,无需移除或更换。
d. (可选)进行其他必要的特殊处理(如加药处理)。
e. 将培养板置于适当的培养条件下培养24~96h(培养时间与实验目的相关)。
表2 使用ribo FECT TM CP转染miRNA mimic用量参考
v1: ribo FECT CP Buffer (1X); v2: 20μM miRNA mimic储存液; v3: ribo FECT CP Reagent; v4: 细胞培养基
注: 1)*:实验示例用量参考。
2)表中数据仅供参考,对于部分细胞类型的转染试剂用量可进一步优化。
3)转染质粒时,转染试剂用量可优化至1μl (24孔板)。
3)效果检测
miRNA mimic/inhibitor作用效果往往通过功能方面检测,转染完成后24~72小时均可进行检测,最佳检测时间与细胞类型及研究的miRNA有关。
以下为几种常用的miRNA效果检测方法:
a. 使用qPCR,基因芯片,新一代测序等方法检测靶基因mRNA转录水平,甚至全基因表达图谱是否发生相应改变;
b. 使用Western Blot,蛋白芯片等方法检测靶基因的蛋白水平是否发生相应改变;
c. 检测细胞功能(细胞增殖、细胞凋亡、细胞迁移等)是否发生相应变化;
d. 通过靶基因siRNA来确认miRNA mimic/inhibitor的作用;
e. 通过与miRNA靶基因双荧光素酶报告载体(锐博生物可提供构建服务)共转来验证miRNA mimic/inhibitor的作用。
表3 细胞实验miRNA mimic、inhibitor、agomir、antagomir用量参考
*: 部分文献报道antagomir不用转染试剂
动物实验方法:
miRNA动物实验的体内环境复杂,实验周期长,对miRNA产品的稳定性提出了更高的要求。
miRNA动物实验方法主要分为两类,局部作用和全身作用。
锐博生物推荐采用稳定性更好、可靠性更高的化学修饰miRNA agomir和antagomir进行动物实验,具体方案需要依据实验目的及条件而定(具体用量请参考表4)。
表4 动物实验agomir和antagomir用量参考。