Pubmed数据库
pubmed数据库
注:如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时,PubMed就将短语
五、PubMed基本检索规则
如: single cell 系统会自动将其分成两个词:single和 cell检索,其检索表达式为:“single AND cell ”。
五、PubMed基本检索规则
强制检索功能
• 强迫短语检索,在检索词上加双引号,将不执行自 动转换匹配和扩展检索.
收录PubMed中未经标引的最新记录。经过主题 词、文献类型、基因库存取号等加工索引后,添加到 Medline数据库中,并从PreMedline库中删除。
[PubMed-in process]
Publisher-Supplied Citations
出版商直接提供的文献,每条记录都标有 [PubMed-as supplied by publisher]。
二、Entrez资源整合系统
Entrez是NCBI为广大生物研究人员提供的一个 基于文本的集成检索系统。通过该平台可以检 索到NCBI提供的28个数据库,这些数据库包括 文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维 蛋白质结构数据库、种群研究库、表达库、完 全人类基因组库、分类信息等。
二、Entrez资源整合系统
主题检索
• 《医学主题词表》是对生物医学文献进行主题分析、 标引和检索的权威性词表,它的作用是使医学文献的 主题标引和检索达到统一和一致,并指导用户高质量 地检索医学文献。它可以指导用户从同义词发现主题 词,告诉用户主题词如何使用,显示主题词之间的相 互关系。
基本概念
• 主题词表:PubMed采用的主题词表是美国国立 医学图书馆的医学主题词表(Medical Subject Headings,简称MeSH) 。 • MeSH :是美国国立医学图书馆编制的权威性主题 词表。它是一部规范化的可扩充的动态性叙词表。 美国国立医学图书馆以它作为生物医学标引的依据, 编制《医学索引》(Index Medicus)及建立计算 机文献联机检索系统MEDLINE数据库。《MeSH》汇 集约24,357多个医学主题词(2007年)。
一PubMed数据库简介
一、PubMed数据库简介
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属 的 国 家 生 物 技 术 信 息 中 心 (NCBI) 开 发 的 、 基 于WWW的医学数据库查询系统。
图1
其它库 NCBI其它数据库的相关记录:
PubMed建立了与NCBI其他数 据库之间联系。它们是双向网 络互连的关系(见下页图)。
NCBI中通过Entrez可互查的数据库
三、PubMed页面的结构
登录 PubMed主页
/entrez/query.fcgi /PubMed/
PubMed的网址: /pubmed
特点:收录范围广、内容全、检索途径多、 检索体系完备,可少部分获取原文。
P75
二、通过PubMed可检索 到如下的信息
MEDLINE PreMedline 出版商提供的书目信息 NCBI其它数据库的相关记录
MEDLINE:是美国国立医学ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ书馆
检索Common Cold AND Vitamin C
preview1
五、 PubMed辅助检索工具(三)
3. History:
保留所有的检索策略和结果,只有在执行了一次检索后, History才能有记录。 显示检索序号、检索词、检索时间以及检索结果数量。 可在检索序号之间添加逻辑运算符进行检索,如#2 AND #6 单击记录条数超级链接可以重新显示检索结果。 点击Clear History按键可以清除History和Preiew/Index中的 信息。 最多存贮检索式数为100个,检索式的存贮时间为1小时。
pubmed数据库及获取文献小技巧
检索字段及标识符
AD(Address): 第一作者所属单位和地址 ALL(All Fields): 全部字段 AU(Author): 作者姓名 DP(Publication Date): 出版时间 EDAT(Entrez Date): 录入时间 1AU(First Author Name): 第一作者姓名 FAU(Full Author Name): 作者姓名全称(02年以后) LASTAU(Last Author) 最后一个作者(通讯作者) IP(Issue): 期号、部分号、增刊号 IS(ISSN): 国际标准刊号 LA(Language): 原文语种
图书馆资源
河北省图书馆 代理中国
河北省图书馆
获取全文小技巧
图书馆资源
河北省图书馆 代理中国
science
Science[ta]
single cell
Pubmed检索
高级检索
nature
Searching by a specific field
chronic proctitis
Pubmed检索
主题检索
《医学主题词表》:
Gastric Neoplasms Gastric Cancer Stomach Cancer Stomach Neoplasms
收录2400多万条题录信息,周 二~周六每日更新,更新2000 ~ 4000条信息。
Pubmed数据库概况
PUBMED收录的文献主要来自三个数据库: 1. Medline 2. In Process Citations 3. Publisher-Supplied Citations
Pubmed数据库
Pubmed数据库
pubmed的文章类型review
从上世纪60年代至今,Pubmed数据库已经收录了大量的医学相关的文献,其中包括了大量的review文章。
review文章在医学领域中扮演着非常重要的角色,它们可以帮助医生、研究人员和学生们及时地了解最新的研究进展和临床应用。
本文将就Pubmed数据库中的review文章类型进行详细的介绍,并分析其在医学领域中的重要性。
一、Pubmed数据库概述Pubmed是由美国国家医学图书馆(NLM)维护的一个免费的医学文献数据库,其中包括了生物医学领域的文献索引。
它涵盖了生物医学的各个子领域,如临床医学、基础医学、生物化学等。
Pubmed提供了对于数以百万计的医学文献的检索和查阅服务,使得医学工作者可以方便地获取最新的研究成果和临床实践。
二、Pubmed中的review文章类型在Pubmed数据库中,review文章类型是一种非常常见的文献类型。
review文章是对某一特定主题进行综合性总结和回顾的文献,通常由专业领域的权威人士或者研究团队撰写。
这类文章不仅可以总结该领域的最新进展,还可以对领域中的争议性问题进行梳理和讨论。
在Pubmed中,review文章通常被归类到专门的review文章类型下,便于用户进行查找和阅读。
三、review文章的重要性review文章在医学领域中具有非常重要的地位和作用。
它们可以帮助医学工作者及时了解某一领域的最新研究成果。
由于医学研究的进展非常迅速,一些研究成果可能会在短时间内产生影响。
而review文章可以将这些研究成果进行总结和梳理,便于医学工作者快速获取信息。
对于一些复杂的疾病或者治疗方案,review文章可以对领域内的各种观点和研究成果进行梳理和综合,帮助医学工作者更好地制定临床治疗方案。
对于医学学生和研究生来说,review文章是他们了解某一领域研究历史和现状的重要参考资料。
四、如何利用Pubmed查找review文章在Pubmed中查找review文章非常简单。
2网上医学数据库(pubmed)
PubMed页面的结构
检索提问区相关数据库链接、 检索提问框 、辅助检索工具
辅 助 功 能 区
Entrez简介、 PubMed服务、 特有检索、相 关资源
检索提示区
对各项检索功能的简单描述
PUBMED中常用的字段
Tag Name Tag Name AB Abstract AD Affiliation AU Author TI Title CN Corporate Author DPPublication Date EDAT Entrez Date FAU Full Author Name GS Gene Symbol IP Issue IS ISSN JID NLM Unique ID LA Language UID Unique Identifier PMID PMID MH MeSH Terms MHDA MeSH Date PG Pagination PL Place of Publication PMID PubMed Unique Identifier PT Publication Type RF Number of References RN EC/RN Number SO Source TA Journal Title Abbreviation VI Volume
sore各种显示方式的Fra bibliotek要内容1、Summary 2、Brief 3、Abstract 4、Citation 5、MEDLINE
各种显示方式的主要内容
6、ASN.1 7、Text 8、Protein links——可显示链接到蛋白质数据库 相关蛋白质的超链。 9、Nucleotide links——可显示链接到核苷酸数 据库相关基因的超链。 10、Structure links——可显示链接到结构数据 库中相关结构的超链。 11、Genome links——链接到相关基因组。
PubMed数据库
PubMed数据库
生物工程122班
李菊秋、鞠文君、梁金姬、宋德涵
PubMed数据库
PubMed简介 PubMed数据范围 认识新版PubMed PubMed检索方法 检索结果保存
一、PubMed简介
PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)
的国家生物技术信息中心 (NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统。 收录1966年以来的包含医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统 及前临床科学的文献。这些数据来源于70多个国家和地区的4000 多种生物医学期刊。 NCBI的任务: 利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化学、遗 传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关先进方法的研 究。 提供基因数据库、文献数据库、分子结构数据库、基因组等 30多个数据库检索。
比如:检索文章题目中含有高血压的中文文献 检索式:hypertension[ti] AND chi[la]
PUBMED数据库检索
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed的基本检索界面
检索功能区
辅助功能区
检索途径与方法
基本检索 - Basic Search 高级检索 - Advanced Search 限定检索 - Limits Search 主题词检索 - MeSH Browser 特定文献查找- Citation Matcher 临床查询 – Clinical Queries
PUBMED具有自动词语匹配功能,系统将按顺 序自动使用如下3种索引,对检索词进行转 换后再进行检索。Mesh转换表、刊名转换表、 著者索引。如果在Mesh表找到相匹配的主题 词,系统用Mesh词和Text Word进行OR组配 检索。
Aspirin
强制检索
十年间发表的人类乙肝疫苗 临床试验研究的英文文献?
保存到剪贴板中的记录
My NCBI的注册与登录
保存到的检索式或记录
保存到NCBI中的记录
保存到NCBI中的记录
总
结
充分认识到PubMed在医学文献检索 中的重要作用 掌握PubMed的各种检索方法,包括基 本检索、限定检索、高级检索,重 点掌握主题词检索 掌握PubMed检索策略和检索记录的 存储 注册My NCBI帮助自己管理检索结果
PUBMED数据库检索
提
纲
PubMed 概述 PubMed 的各种检索方法 PubMed 检索结果的处理 My NCBI
PubMed数据库简介
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医学信息 书目数据库MEDLINE的免费网络版 内容包括美国《 Index Medicus》、《 Index to Dental Literature》、《 International Nursing Index》和部分生命科学领域的期刊文献 内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫 生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药 学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出版的 5,200余种生物医学期刊上发表的文献
pubmed数据库入口ncbi
PubMed数据库入口:NCBI简介PubMed 是一种由美国国家图书馆(National Library of Medicine,NLM)所提供的生物医学文献数据库,是全球最大的生物医学文献存储库之一。
作为生物医学研究领域的重要工具,PubMed 提供了大量的生物医学文献信息,覆盖了基础医学、临床医学、生物技术等多个研究领域。
PubMed 的数据库入口是由美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)负责维护的。
NCBI 是一个提供了一系列生物技术信息资源和工具的综合性生物技术数据库,帮助研究人员获取和分析生物技术相关的数据。
在本文中,我们将重点介绍 PubMed 数据库的入口,即 NCBI 网站的功能和特点。
NCBI 网站NCBI 网站(https:/// )是一个免费提供生物医学信息服务的网站,具有丰富全面的生物医学数据库资源。
在 NCBI 网站上,用户可以访问PubMed 数据库以及其他诸如 GenBank、BLAST、PubChem 等数据库。
NCBI 网站提供了直观友好的用户界面,让用户可以轻松访问并获取所需的生物医学文献信息。
下面我们将介绍 PubMed 数据库的一些主要功能和特点。
PubMed 数据库功能文献搜索作为一个重要的生物医学文献数据库,PubMed 提供了强大的搜索功能,帮助用户快速准确地检索感兴趣的文献。
用户可以根据关键词、作者、期刊等信息进行搜索,也可以通过高级搜索来进一步精确检索。
文献浏览用户搜索到感兴趣的文献后,可以通过 PubMed 的文献浏览功能查看摘要和全文。
摘要提供了文章的主要内容和结论,方便用户了解文献的核心内容。
全文则提供了更详细的信息,包括方法、结果和讨论等。
文献收藏用户在浏览文献时,可以将感兴趣的文献添加到自己的收藏夹中。
这样,用户可以方便地管理和访问自己收藏的文献,随时查阅。
PubMed数据库检索系统
PubMed重点
PubMed数据库的建立维护机构:NCBI NLM 和NCBI的全称和中文含义 PubMed的文献收录范围 其对应的光盘数据库(MEDLINE)和印刷型 检索工具的名称(医学索引、牙科文献索引、 国际护理索引) PubMed检索方式:主题词检索、自由词检索、 索引浏览检索、字段限定检索、逻辑组配检索、 截词检索、强制检索(短语)
文献标记中除了有PMID 号和MEDLINE UI号 外,还 这部分文献记录中只有 注有[PubMed- indexed for PubMed识别码〔PMID〕, MEDLINE] 的说明。 (二)PubMed数据库来源 另外还有〔PubMed – in process〕的说明。
1.MEDLINE
MEDLINE CD
MEDLINE WEB ——PubMed
/pubmed /pubmed
一、PubMed简介
(一) 数据库建立和维护
美国国立医学图书馆下属的生物技 术信息中心( National Center for Biotechnology Information , NCBI)建立 并维护。 文献类型:期刊论文、综述、以及与 其他数据资源链接。 特点:提供原文获取服务
举例:在检索框中输入“science”
如何查找在“science ” 杂志上发表的文献 1. 在高级检索界面 —— science 限定字段 [Journal] 2. 在期刊检索界面 —— science——选 中——send to search box——search 3. 在期刊名字的右边的 Links 按钮 —— 点击——PubMed——检索该刊中的文献
查找近10年发表在“Obstetrics and gynecology”杂志上的有关子宫内膜异位 症的临床试验文献。
Pubmed生物医学数据库NCBI medline
结果排序:根据不同内容对结果排序
时间、作者、期刊、篇名
Summary(txt)格式
Abstract格式
MEDLINE格式
输出格式选择(send to )
File:所有记录文本格式,用对话框保存
Clipboad 剪贴板: 暂时存放选定的记录,检索后一起保存。允许 存储500条记录,保存8 小时。 Collections:标记的文献
返回高级检索页面
Liver cancer and gene therapy
免费论文
点击论文标题查看详细信息
打开全文链接
Details 检索细节
显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:转换、确定规范词
修改检索策略
检索细节可以在高级检索页面打开
检索结果输出
显示检索结果
检索原理
自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping),按照四个表顺序进行检索。
自动扩展检索,系统自动对主题词、副主题词 进行扩展检索。
短语检索(Phrase Searching) 即强制检索,短语加双引号,不进行词汇的 自动转换,也不进行MeSH词的扩检。
截词检索:仅有*,仅限于150个单词,且在 截词检索时,不进行词汇的自动转换,词组 无效。
1997年开始提供了该库的免费检索服务。
1997年1月至2005年9月Pubmed每月的文献检索数量 增长惊人
PubMed收录范围
PubMed
OLDMEDLINE
MEDLINE
PreMEDLINE
Publisher Supplied Citations
数据收录范围
MEDLINE :是PubMed的主体部分。
子集限制
时间
PubMed 数据库
Preview/Index:预览当前检索框内检索策略的
检索结果
婴幼儿巨细胞病毒感染与听力损伤 (Preview)
1. 在检索框内输入“cytomegalovirus infections”, 点击 Preview。系统返回检索序号1及相应的检索结果。 2.同样方法检索hearing loss,得到检索序号2及相应的检 索结果。 3.同样方法检索infants,得到检索序号3及相应的检索结果。 4.在检索框内输入#1 AND #2 AND #3,得到该课题的最后 结果101条。
检索方法
在检索区输入检索策略(检索式),点击GO按钮
检索方法
一、著者检索
格式:姓(全称)+名(缩写) 如:Smith J 系统能识别该格式,并自动与著者索引进行 匹配检索
检索方法
二、刊名检索 格式: 刊名全称 如: American Journal of surgery 刊名简称(参照IM的收编期刊表) 如: Am J Surg 期刊ISSN号
PubMed 数据库
概
况
由美国国立医学图书馆国家生物技术信息中心 (NCBI)开发 免费使用 书目检索系统 部分记录有全文期刊链接(包括免费和收费) 提供原文传递服务(收费)
概
况
PubMed包括以下三部分内容:
MEDLINE、 PreMEDLINE 出版商提供而未被MEDLINE和PreMEDLINE 收录的数据
续上页
点击Limits,在publication date处输入From: 1999, to 2003。 点击GO按钮。 系统返回一条检索结果
医学文献检索(PubMed)
PubMed的功能和用途
PubMed不仅提供了文献的搜索和访问服务,还提供了作者、期刊、引用等高 级检索功能。它被广泛用于医学研究、临床实践和学术交流。
PubMed的数据库结构和搜索词语
PubMed的数据库结构由文章的标题、摘要、关键词、作者等元素构成。通过选择合适的搜索词语,可以提高 检索结果的准确性和相关性。
PubMed中的文献类型有哪些?
PubMed中包含了各种类型的医学文献,包括研究论文、临床试验、综述文章、案例报告等。可以根据需求选 择不同类型的文献。
医学文献检索(PubMed)
PubMed是生命科学和生物医学领域的一种免费资源,提供了世界各地医学文 献的搜索和访问服务。
Байду номын сангаас
什么是PubMed?
PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个生物医学数据库,其中包含了医学领域的上百万篇 研究文献。
PubMed的历史和发展
PubMed起源于20世纪70年代,最初是一个由计算机制作的CD-ROM数据库。随着互联网的发展,PubMed逐渐 成为全球科研人员的主要文献检索工具。
如何通过关键词在PubMed中搜索医学文献?
在PubMed中,可以使用关键词来进行简单的文献检索。通过输入与所需主题相关的关键词,可以快速找到相 关的医学文献。
如何使用MeSH词汇在PubMed 中进行高级搜索?
MeSH词汇是一种用于描述医学主题的控制词汇。在PubMed中,使用MeSH词 汇可以进行更精确和细致的高级文献检索。
PubMed数据库
(2)选择检索途径,选择主题途径或自由词途径。
#1 Transforming Growth Factor bet
#2 Receptors,Transforming Growth Factor beta
#3 Colorectal Neoplasms
#4 Signal Transduction (3)综合检索式 (#1 OR #2)AND #3
图30 Pubmed数据库FREE fulltext PDF格式界面(9)
图31 Pubmed数据库检索史逻辑组配界面(1)
图32 Pubmed数据库检索结果显示界面(2)
图33 Pubmed数据库检索史逻辑组配界面(3)
图34 PubmBiblioteka d数据库检索结果显示界面(4)图35 Pubmed数据库Limits检索界面(1)
PubMed数据库
一、概述
PubMed是由美国国立医学图书馆(NLM)的下属 的美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)建 立 的 生 物 医 学 文 献 检 索 系 统 , 于 1997 年 5 月 在 Internet 上 向 用 户 提 供 的 免 费 检 索 服 务 , 网 址 是 /pubmed 。 该系统具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索 体系完备等特点,并与多家生物医学期刊出版商联合, 通过链接可获取全文或部分全文。PubMed的主界 面见图1。
文链接
五、PubMed数据库检索实例分析
例1.检索有关“转化生长因子β信号传导抵抗在结直肠 癌的作用”这一课题研究方面的国外文献。
检索要求: (1)查找近3年的文献,语种为英文。 (2)期刊检索:从检索结果中选中的期刊,进一步了解
PubMed
PubMed 数据库检索指南 数据库检索指南一、简介PubMed 数据库由美国国家医学图书馆所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于 2000 年开 发的基于 WEB 的生物医学信息检索系统,它提供与许多生物数据库的链接;提供 1966 年至今 的生物医学信息,其信息源来自于 Medline、 Premedline 和出版商提供的信息, 其中有一些免费 全文提供。
检索方便,且具有自动匹配功能。
二、主要检索途径 主要检索途径1.基本检索(Search):在检索框中输入相应的检索式检索。
2.高级检索(Advanced Search):在输入框中输检索词,选择相应的字段和逻辑算符检索。
3.限定检索(Limits) :可对文献类型、语种、性别、年龄段进行限定检索。
4.主题检索(MeSH Database):是以规范化的主题词、副主题词检索文献。
许多情况下也 可以以自由词为入口,该途径可以提供与该自由词相关的主题词供检索者选择。
5.单篇引文匹配检索(Single Citation Matcher):已知某篇文献的相关信息(如标题、刊名、 年、卷期等) ,可直接检索出该篇文章。
6.期刊检索(Journals Database):对某种具体期刊刊载的文献和期刊本身相关信息进行检 索。
三、检索实例1.PubMed 主页介绍限定检索 限定检索 高级检索基本检索单篇引文匹配检索主题检索 期刊检索2.基本检索途径 基本检索途径 基本检索途径:用该途径检索时应将同一概念不同表达即同义词、或下位词收集全检 索,否则易造成漏检。
可在输入框中输入综合检索式检索或分步检索,然后在高级检索界面 下的 中, 进行相应的组配检索。
如检索有关艾滋病治疗的文献, 检索式: (aidsOR hiv infection OR "Acquired Immunodeficiency Syndrome") AND (treatment OR therapy)检索式 检索式选择显示 格式、 格式、显示 篇数和排 序 文献下载 点击此处可将检 索结果文献与本 校全文库链接文 献 题 录格式3.高级检索途径:在输入框中输入综合检索式检索或分步检索,然后在 高级检索途 高级检索 中,进行相应的组配。
PUBMED数据库检索
主要内容
(一)PubMed 概述
(二)PubMed 的主要检索途径和方法
(三)PubMed数据库的辅助功能
(四)PubMed 检索结果的处理
(一)PUBMED概述
PubMed是美国国立医学图书馆开发的生物医
学信息书目数据库MEDLINE的免费网络版。
内容包括美国《 Index Medicus》、《
Index to Dental Literature 》、《
International Nursing Index》和部分生命 科学领域的期刊文献。
(一)PUBMED概述
内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、
营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、
微生物、药学、社会医学等领域。 可检索1950年以来世界70多个国家和地区出 版的5,200余种生物医学期刊上发表的文献 2,200文献。
Batch Citation Matcher(多引文匹配器)
Clinical Queries(临床咨询)
Topic-Specific Queries(特定主题查询)
PubMed Tools
Single Citation Matcher (单引文匹配器)
Batch Citation Matcher(多引文匹配器)
法的异同。
Stem cell
My NCBI
NCBI是PUBMED提供的一个个性化服务;
使用NCBI必须事先进行注册;
NCBI可以查看并管理已保存的检索策略
(Saved Searches)、创建和管理我的书目
(My Bibliography和过滤器(Filters)等。
(四)检索结果的显示和输出
pubmed使用介绍
2000年
02
01
03
04
05
PubMed的起源和发展
A
B
C
D
PubMed的特点和优势
权威性
收录内容主要来源于权威的医学学术期刊和会议论文集,具有很高的学术价值和可信度。
更新及时
收录的文献内容实时更新,能够反映全球生物医学领域的最新研究成果。
检索功能强大
提供多种检索方式,方便用户快速找到所需内容。
关键词筛选
文章类型筛选
发表时间筛选
根据文章类型,如期刊论文、综述、病例报告等进行筛选。
选择特定时间范围内的文章,如近五年、近十年等。
03
02
01
检索结果筛选
检索结果数量
显示符合条件的文章总数。
学科分布
统计各学科领域符合条件的文章数量,便于了解相关领域的研究热点和发展趋势。
高频关键词
分析检索关键词中出现频率较高的词汇,有助于了解相关领域的研究重点和热点话题。
跨学科研究的支持
THANKS FOR
感谢您的观看
WATCHING
个性化服务的进一步发展
跨学科研究热点分析
利用人工智能技术对多学科领域的文献数据进行热点分析和趋势预测,帮助用户了解跨学科研究的前沿和动态。
跨学科合作平台
构建跨学科的合作平台,促进不同学科领域的研究者之间的交流与合作,推动跨学科研究的创新和发展。
跨学科主题词系统
建立和完善跨学科的主题词系统,方便用户检索和获取不同学科领域的文献资源。
与Scopus的整合
用户可以在PubMed搜索框中输入关键词,然后点击"在Scopus中搜索"选项,直接跳转到Scopus数据库进行相关文献的搜索。
2024年pubmed数据库使用指南
概述:
PubMed是一个生命科学领域的文献数据库,是生物医学文献检索的重要工具。
本文对PubMed数据库的使用做一个简要介绍,以帮助读者更好地利用这个数据库进行文献检索。
1. PubMed数据库的结构和特点:
PubMed数据库是由美国国立卫生研究院(NIH)的国家医学图书馆(NLM)开发维护的。
它是一个免费的公共数据库,收录了生物医学和生命科学领域的大量学术文献,包括期刊文章、会议论文、学位论文等。
2.检索策略:
(1)关键词检索:根据文献的关键词进行检索。
关键词可以是疾病名、药物名、基因名等。
使用AND、OR、NOT等逻辑符号来组合关键词,以缩小或扩大范围。
(2)高级检索:在PubMed的高级界面中,可以通过使用多个字段、设置日期范围、对检索结果进行限定等方式,更精确地进行文献检索。
3.结果筛选和排序:
(1)限制结果:通过在界面的左侧面板中选择相关选项,可以限制结果的类型、语言、年份等。
(2)排序方式:结果默认按相关性排序,但也可以按出版日期、被引用次数等进行排序。
4.期刊和发表者信息:
5.数据库更新与同步:
(1)PubMed数据库每周更新,保持最新的文献信息。
(2)可以通过RSS订阅或设置自动更新来获取最新的文献信息。
6.其他功能和工具:。
2023年关于1PubMed数据库介绍
PubMed数据库介绍PubMed是世界上最大的生命科学和医学文献数据库,它为研究人员、医生和学生提供了广阔的科学信息资源。
本文将为读者介绍PubMed数据库的背景、功能和使用方法。
背景PubMed是由美国国家医学图书馆(National Library of Medicine,简称NLM)创建和维护的免费数据库,它的起源可以追溯到1966年。
最初,PubMed作为MEDLINE文献数据库的在线查询工具而建立,旨在帮助医学研究人员查找相关的医学文献。
随着互联网的广泛应用,PubMed也发展成为一个全球性的医学文献检索平台。
功能1. 文献检索:PubMed收录了包括生物医学、生命科学、健康科学和相关领域的超过3000万篇文献,并每年以数百万计的速度增长。
用户可以通过输入关键词、作者、期刊、机构等信息进行文献检索,以找到自己感兴趣的研究论文。
检索结果通常以相关度高低排序,同时还提供了摘要和全文的访问途径。
2. 文献管理:用户可以创建自己的PubMed账户,通过使用我的NCBI工具来管理和保存检索的文献。
该工具可以帮助用户创建文献收藏夹、设置文献提醒和共享文献等。
此外,用户还可以使用文献管理软件(如EndNote、Zotero)与PubMed进行同步,方便对文献进行整理和引用。
3. 数据库链接:PubMed与其他重要的生物医学数据库(如GenBank、Protein Data Bank)建立了链接,使用户可以在PubMed的检索结果中直接访问其他数据库的详细信息。
这不仅方便了用户获取更多的相关信息,还促进了不同数据库之间的数据共享和整合。
4. :PubMed还与进行了链接,提供了临床试验信息的检索。
用户可以在PubMed上找到与特定疾病或治疗相关的临床试验,并了解其最新进展和结果。
使用方法1. 关键词检索:在PubMed的主页上,用户可以输入关键词(如疾病名称、治疗方法)进行检索。
为了提高准确性和召回率,可以使用布尔运算符(如AND、OR)和括号来组合多个关键词。
外文数据库pubmed检索
PubMed与Web of Science的比较
学科领域
PubMed主要针对生物医学领域,而Web of Science涵盖 多个学科领域,包括自然科学、社会科学等。
引文分析
Web of Science提供强大的引文分析功能,可以分析论文的引用 网络和影响因子;PubMed则主要关注医学领域的引文分析。
检索范围
PubMed主要专注于生物医学领域,提供大量医学文献和临床试验结果;而Google Scholar则覆盖更 广泛的主题,包括社会科学、人文科学等。
学术质量
PubMed收录的文献经过严格筛选,质量较高;Google Scholar则包含大量学术和非学术文献,质量 参差不齐。
检索深度
PubMed提供高级检索功能,支持复杂的布尔逻辑运算和精确匹配;Google Scholar的检索功能相对 简单,但可以通过关键词匹配获取更多相关结果。
数据整合
Web of Science整合了多个数据库和专利信息,方便用户 进行跨库检索;PubMed则主要专注于医学文献的检索。
PubMed与Scopus的比较
学科覆盖范围
Scopus覆盖的学科范围比 PubMed更广泛,包括医学、生 命科学、物理、化学、工程等众 多领域。
国际性
Scopus收录的文献来自全球各地, 更加国际化;PubMed则以英文 医学文献为主。
数据分析工具
Scopus提供了丰富的数据分析工 具,如引用分析、学科领域分析 等;PubMed也提供了一定的数 据分析功能,但相对较少。
05
PubMed的未来发展
PubMed的创新和发展方向
人工智能和机器学习技术 应用
利用人工智能和机器学习技术,提高 PubMed的检索效率和准确性,提供更加智 能化的检索服务。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
MEDLINE数据库的标记码
(3)出版商提供的电子文献---[PubMed - as supplied by publisher]
(4)NCBI其它数据库的相关记录
Medline数据库
由出版商提供的检索记录
Premedline数据库
Pubmed identifier 本条数据在数据库中的 唯一标识号
所属的美国生物技术信息中心(NCBI
for Biotechnology Information)开发研制的网络文献 检索系统。由许多期刊出版商参与共建
PubMed特点: 1、资源丰富 2、强大的链接功能(LinkOut)可链接许多免费的全 文期刊可根据检中的二次文献直接在网上订购原文。 3、提供多种检索方式 4、提供多种显示格式 5、报道速度比MEDLINE更快,更新。
网络版——PubMed检索系统
美国《医学索引》印刷版
Index Medicus 简称IM,是美国国立医学图书馆 编辑出版的、世界上最负盛名的医学文献检索工具。 包括题录,文摘及部分全文。 美国《医学索引》内容包括: 基础医学、 职业卫生、 卫生管理、 营养卫生、 环境医学、 药理和药剂学、 临床医学、 护理学、 卫生保健、 齿科学、 情报学 兽医学
点击 精确查找
所检索的词本身不是主题词,但此页列 出了所有与其内容相关的主题词---《主题词字顺表》,可以从中选择自己 需要的主题词
Sugar diabetes
点击 精确查找
说明sugar diabetes这个 词组没被收入 主题词数据库
Diabetes mellitus
点击 精确查找
Diabetes mellitus
通过树状结构表的方法来确定主题词主要考察两点:
1、要辨识英文词的意思; 2、通过专业知识来确定检索内容的归类所属。
主题词 Influenza vaccines
只有主题词才会 有这样的说明性 的界面,所以出 现这样的界面就 是主题词。
确定主题词方法 2---主题词字顺表
在字顺表检索框里 直接输入检索词 Influenza Vaccines
Pubmed 数据来源与收录范围
(1)Medline数据库 ---[PubMed - indexed for MEDLINE] (2)Premedline数据库 --- [PubMed - in process] 正在加工处理中的文献,这些数据经规范处理后,每星期 转入MEDLINE数据库一次,并从本数据库中被删除,并标上
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Medline格式字段说明 此为数据库中第 1985条题录,下面 是这条题录的全 部字段
字段缩写
字 段 的 全 称
医学主题词字 段MH或MeSH
医学主题词
MH 或 MeSH
◆
(Medical
Subject
Headings)
用于描述生物医学概念的标准术语
◆
把所有的医学主题词组织起来形成了<MeSH主题表> 在计算机检索系统为<MeSH主题词数据库>
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aids
aids
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Hypertension
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33173条数据
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组合式主题词检索
表达两个(或更多)概念的词都是主题词,没有副主题词, 不用主题词数据库进行组配,确定主题词后,由诸主题词 直接组合检索式,在PubMed数据库中进行检索。
文摘(BA)、美国化学文摘(CA)
3、引文索引数据库
揭示文献之间的引用关系 如:美 国《科学引文索引》SCI 中国《科学引文索引数据库》CSCD
4、全文数据库
是原始文献信息的集合,查到文献的线索后可直接 获取电子版的全文信息。 如:中文全文数据库 CNKI中的“中国期刊全文数据库” 维普的“中ProQuest Medical Library
◆
实际就是主题索引
主题词的意义:
保障文献的‘检全率’和‘检准率’
主题词的实质: 把用任何‘字样’表达的同一概念的所有文献,都归结到 ‘主题词’下,比如有一篇关于糖尿病的文章,哪怕通篇没
有一个糖尿病的‘字样’,它也被归到糖尿病的主题词下,
因为文章的主题是关于糖尿病的,要按主题归类,而不是按 字样归类.
1、题录(书目)数据库
检索的结果是找到获取文献原文的线索。提供文献 的特征,如篇名、作者、摘要、刊登在哪里、收藏 在何地等。如PubMed数据库(它也包括文摘和全文)
2、文摘数据库
检索结果是获取文献的摘要,通过阅读摘要来确定是 否需要进一步获取全文文献。如中国生物医学文献数
据库(CBMdisc)、荷兰医学文摘(EMBase)、美国生物学
美国《医学索引》的光盘版 MEDLINE数据库 是当前国际上最具权威性的生物医学文献数据库。 特点: 1、报道的文献量大、质量高 国家: 70多个 语种: 40多种 期刊: 4700多种 文献: 年报道量40多万篇 英文发表量: 88% 英文文摘量: 75% 我国被收期刊: 50多种 可检索年限为: 1966年至今
7、事实数据库
提供问题答案的数据库,如: 医学术语、疾病的诊断方法、药物的用法和不良 反应、化合物的结构和化学反应等。 电子版的词典、百科全书、年鉴、手册、名录、 指南等都属于事实数据库。
8、多媒体数据库 用文字、声音、图像同时表达信息的数据库, 如:视频文献等。 9、知识数据库 以专门学科的知识点为收藏对象的数据库,如: 中医药知识库;称为基因百科全书的GenGard数据库等
有的数据库有网络版,可以在网上直接使用, 有的是光盘版,要由使用单位购买后将光盘 安装在自己局域网的服务器上使用。各个数 据库的使用方法略有不同,可以通过数据库 界面上的使用帮助来进行了解。
美国《医学索引》
美国《医学索引》 的三种版本
印刷版——Index Medicus 简称(IM) 光盘版——MEDLINE数据库
Summary (text) 格式
Abstract格式
检索结果包括文摘、全文链接图标、及作者单位、邮箱
Abstract
比Summary格式多了文摘和全文图标和
作者单位字段
作者单位字段
全文链接图标
文摘字段
含有全文的网页
作者邮箱
Medline格式
含有主题词MH
字段缩写
此格式的特点是: 字段分解的特别详细,检索 标识丰富,每个字段都是一 个信息点。
包含任一字词
确定主题词方法1---主题词树状结构表 例:确定 流行感冒疫苗‘Influenza Vaccines’是否为主题词
用树状结构表查找
解剖学 有机体
疾病
化学药品\药
目录树
化学药品\药
化合物
化合物
生物制品
生物制品
疫苗
疫苗
病毒疫苗
化合物
生物制品
疫苗
病毒疫苗
流行感冒疫苗 点击进入主题词 说明页面
点击 精确查找
主题词 Influenza Vaccines
同样进入与之同 概念的主题词说 明页面
入口词 LAIV vaccine
对于一个概念有多个词表达的情况,要逐个输入各个词进行主题词的确定。
如:糖尿病--diabetes、diabetes mellitus、sugar diabetes
diabetes
如何确定主题词
MeSH Database 主题词数据库
在此点击进入
MeSH
主题词浏览器
主题词检索界面 专门用来找主题 词的
‘主题词’查找方法
1、 在‘主题词’树状结构表中查找 2 、在‘主题词’字顺表中查找
1、在主题词树状结构表查找 2、用主题词字顺表查找
包含完整字句 即精确查找
包含全部字词
Main Headings 主题词选项
点击 精确查找
Influenza Vaccines
进入主题词说明 界面,第一行出 现的词即为主题 词
LAIV vaccine
页面的 下半部
入口词 (主题词的同义词)用 入口词检索,系统会 自动转入主题词。
将入口词LAIV vaccine 输入检索框
主题词选项
完整的基因组数据 结构数据库或称分子模型数据库 生物学门类数据库 单核苷酸多肽性数据库 Entrez Structure 中特定功能域的三维结构 标记物和图示数据 人口研究数据集
基因表达和微阵列数据集
跨库检 索
Virus 病毒
点击数字可进入 相应的数据库结 果页面
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此网页是美国国立医学图书馆 (National Library of Medicine ,NLM)下属的 美国国家生物技术信息中心 (National Center for Biotechnology Information ,NCBI)开发研制的网络数据库的首页。 包含: 蛋白质、基因组、孟德尔人类遗传学、主题词、 医学文献等20多个数据库。 Pubmed是其中的一个子数据库