Pubmed数据库
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标引的质量高、检索效果好:
它的编撰队伍由医学专家和图书馆学专家组成, 有一部完善的主题词表,能保证较高的检全率 和检准率,其标引质量之高堪称现代检索工具的典范。
PubMed数据库---美国《医学索引》的网络版
是MEDLINE数据库的网上免费检索系统,它是由美国
国立医学图书馆(NLM National Library of Medicine ) National Center
完整的基因组数据 结构数据库或称分子模型数据库 生物学门类数据库 单核苷酸多肽性数据库 Entrez Structure 中特定功能域的三维结构 标记物和图示数据 人口研究数据集
基因表达和微阵列数据集
跨库检 索
Virus 病毒
点击数字可进入 相应的数据库结 果页面
PubMed主页介绍
pubmed 点击 Search
检索区
Pubmed 首页
使用帮助
专项检索区
专项数据库
检索功能介绍
aids
aids
点击
显示格式选择,其默认格式为
Summary格式
结果总数
篇名字段 作者字段 刊 名 字 段
刊期字段
条目识别 号PMID (PubMed Identifier)
检索结果 界面
格式显示 选择
每页显示 结果数
结果排序方式
所属的美国生物技术信息中心(NCBI
for Biotechnology Information)开发研制的网络文献 检索系统。由许多期刊出版商参与共建
PubMed特点: 1、资源丰富 2、强大的链接功能(LinkOut)可链接许多免费的全 文期刊可根据检中的二次文献直接在网上订购原文。 3、提供多种检索方式 4、提供多种显示格式 5、报道速度比MEDLINE更快,更新。
有的数据库有网络版,可以在网上直接使用, 有的是光盘版,要由使用单位购买后将光盘 安装在自己局域网的服务器上使用。各个数 据库的使用方法略有不同,可以通过数据库 界面上的使用帮助来进行了解。
美国《医学索引》
美国《医学索引》 的三种版本
印刷版——Index Medicus 简称(IM) 光盘版——MEDLINE数据库
美国《医学索引》的光盘版 MEDLINE数据库 是当前国际上最具权威性的生物医学文献数据库。 特点: 1、报道的文献量大、质量高 国家: 70多个 语种: 40多种 期刊: 4700多种 文献: 年报道量40多万篇 英文发表量: 88% 英文文摘量: 75% 我国被收期刊: 50多种 可检索年限为: 1966年至今
7、事实数据库
提供问题答案的数据库,如: 医学术语、疾病的诊断方法、药物的用法和不良 反应、化合物的结构和化学反应等。 电子版的词典、百科全书、年鉴、手册、名录、 指南等都属于事实数据库。
8、多媒体数据库 用文字、声音、图像同时表达信息的数据库, 如:视频文献等。 9、知识数据库 以专门学科的知识点为收藏对象的数据库,如: 中医药知识库;称为基因百科全书的GenGard数据库等
Summary (text) 格式
Abstract格式
检索结果包括文摘、全文链接图标、及作者单位、邮箱
Abstract
比Summary格式多了文摘和全文图标和
作者单位字段
作者单位字段
全文链接图标
文摘字段
含有全文的网页
作者邮箱
Medline格式
含有主题词MH
字段缩写
此格式的特点是: 字段分解的特别详细,检索 标识丰富,每个字段都是一 个信息点。
直接进入diabetes mellitus的主题词说明界面,检索 时没有进入主题词解释说明界面则说明它们不是入口词。
入口词一定是同义词,同义词不一定是入口词。
MeSH系统,处理关键词的几种类别
1、边缘词,不做处理 2、相关词,给出相关主题的其它主题词字顺表
3、入口词,直接转换到主题词的解释说明界面
如何确定主题词
MeSH Database 主题词数据库
在此点击进入
MeSH
主题词浏览器
主题词检索界面 专门用来找主题 词的
‘主题词’查找方法
1、 在‘主题词’树状结构表中查找 2 、在‘主题词’字顺表中查找
1、在主题词树状结构表查找 2、用主题词字顺表查找
包含完整字句 即精确查找
包含全部字词
MeSH Database 主题词数据库
在此点击进入
NLM MeSH Homepage 主题词数据库
在此点击进入此页面来确定主题词
主题词浏览器
确定主题词, 必须来此页面
输入检索词Hypertension
Main Headings主题词选项
点击 精确查找
主题词 Hypertension
输入主题词
点击 精确查找
主题词 Influenza Vaccines
同样进入与之同 概念的主题词说 明页面
入口词 LAIV vaccine
对于一个概念有多个词表达的情况,要逐个输入各个词进行主题词的确定。
如:糖尿病--diabetes、diabetes mellitus、sugar diabetes
diabetes
直接进入了主题词说明页面,所以 糖尿病---diabetes mellitus是‘主题词’
这里有两个树状结构表的 标号,说明这个主题词分属 两个上位词
葡萄糖代谢紊乱
内分泌疾病
页面的下方展 示的是此主题 词在数状结构 表中的位置
如果diabetes和
sugar diabetes是
检索时系统会
diabetes mellitus的入口词,
PubMed Central 要经常浏览这里, 获取免费资源
NCBI
子数据库群缩写
All Databases
在检索框空 白的状态下 点击Search
进入了完整 的数据库群 平台
生物医学文献数据库 •NLM有关生物医学和生命科学杂志的免费电子文档。
在线生物医学图书
孟德尔人类遗传数据库
核酸序列数据库 蛋白质序列数据库
网络版——PubMed检索系统
美国《医学索引》印刷版
Index Medicus 简称IM,是美国国立医学图书馆 编辑出版的、世界上最负盛名的医学文献检索工具。 包括题录,文摘及部分全文。 美国《医学索引》内容包括: 基础医学、 职业卫生、 卫生管理、 营养卫生、 环境医学、 药理和药剂学、 临床医学、 护理学、 卫生保健、 齿科学、 情报学 兽医学
文摘(BA)、美国化学文摘(CA)
3、引文索引数据库
揭示文献之间的引用关系 如:美 国《科学引文索引》SCI 中国《科学引文索引数据库》CSCD
4、全文数据库
是原始文献信息的集合,查到文献的线索后可直接 获取电子版的全文信息。 如:中文全文数据库 CNKI中的“中国期刊全文数据库” 维普的“中文科技期刊数据库” 万方的“数字化期刊全文库” 英文全文数据库 OVID全文期刊库 ProQuest Medical Library
通过树状结构表的方法来确定主题词主要考察两点:
1、要辨识英文词的意思; 2、通过专业知识来确定检索内容的归类所属。
主题词 Influenza vaccines
只有主题词才会 有这样的说明性 的界面,所以出 现这样的界面就 是主题词。
确定主题词方法 2---主题词字顺表
在字顺表检索框里 直接输入检索词 Influenza Vaccines
Pubmed数据库用法介绍
http://www.ncbi.nlm.nih.gov
NCBI首页
此网页是美国国立医学图书馆 (National Library of Medicine ,NLM)下属的 美国国家生物技术信息中心 (National Center for Biotechnology Information ,NCBI)开发研制的网络数据库的首页。 包含: 蛋白质、基因组、孟德尔人类遗传学、主题词、 医学文献等20多个数据库。 Pubmed是其中的一个子数据库
点击 精确查找
所检索的词本身不是主题词,但此页列 出了所有与其内容相关的主题词---《主题词字顺表》,可以从中选择自己 需要的主题词
Sugar diabetes
点击 精确查找
说明sugar diabetes这个 词组没被收入 主题词数据库
Diabetes mellitus
点击 精确查找
Diabetes mellitus
数据库Biblioteka Baidu
是计算机专业术语,是存储在计算机 载体中的同类信息的有序集合。
数据库类型
从文献的发表形式分 论文数据库 从揭示内容的类型分 1、题录(书目)数据库 2、文摘数据库 3、引文索引数据库 4、全文数据库 5、图片数据库 6、数值数据库 7、事实数据库 8、多媒体数据库 9、知识数据库
期刊数据库
报纸数据库
Pubmed 数据来源与收录范围
(1)Medline数据库 ---[PubMed - indexed for MEDLINE] (2)Premedline数据库 --- [PubMed - in process] 正在加工处理中的文献,这些数据经规范处理后,每星期 转入MEDLINE数据库一次,并从本数据库中被删除,并标上
4、主题词,直接进入主题词的解释说明界面
用主题检索的三种主要方式
单一主题词检索(一个主题词) 组合式主题词检索(两个以上主题词组合)
限定式检索(副主题词限定主题词)
‘单一主题词’的检索
检索有关‘高血压’的文章 高血压---Hypertension 步骤: 1、先到MeSH(主题词)数据库中确定主题词, 2、再用主题词到PubMed数据库中去检索。
Hypertension
点击
33173条数据
结果页面
组合式主题词检索
表达两个(或更多)概念的词都是主题词,没有副主题词, 不用主题词数据库进行组配,确定主题词后,由诸主题词 直接组合检索式,在PubMed数据库中进行检索。
包含任一字词
确定主题词方法1---主题词树状结构表 例:确定 流行感冒疫苗‘Influenza Vaccines’是否为主题词
用树状结构表查找
解剖学 有机体
疾病
化学药品\药
目录树
化学药品\药
化合物
化合物
生物制品
生物制品
疫苗
疫苗
病毒疫苗
化合物
生物制品
疫苗
病毒疫苗
流行感冒疫苗 点击进入主题词 说明页面
◆
实际就是主题索引
主题词的意义:
保障文献的‘检全率’和‘检准率’
主题词的实质: 把用任何‘字样’表达的同一概念的所有文献,都归结到 ‘主题词’下,比如有一篇关于糖尿病的文章,哪怕通篇没
有一个糖尿病的‘字样’,它也被归到糖尿病的主题词下,
因为文章的主题是关于糖尿病的,要按主题归类,而不是按 字样归类.
Medline格式字段说明 此为数据库中第 1985条题录,下面 是这条题录的全 部字段
字段缩写
字 段 的 全 称
医学主题词字 段MH或MeSH
医学主题词
MH 或 MeSH
◆
(Medical
Subject
Headings)
用于描述生物医学概念的标准术语
◆
把所有的医学主题词组织起来形成了<MeSH主题表> 在计算机检索系统为<MeSH主题词数据库>
5、图片数据库 是集合专业普片的数据库,如: Bristol生物医学图谱数据库 http://www. Bristol.ac.uk
37˚C医学网 http://www.37c.com.cn
除了有专门的图片数据库外,许多医学 网站都有图谱链接,可以搜索图谱。
6、数值数据库 提供数据信息的数据库,如: 人口统计数据、科学实验数据、疾病发生和死 亡数据等等。
MEDLINE数据库的标记码
(3)出版商提供的电子文献---[PubMed - as supplied by publisher]
(4)NCBI其它数据库的相关记录
Medline数据库
由出版商提供的检索记录
Premedline数据库
Pubmed identifier 本条数据在数据库中的 唯一标识号
Main Headings 主题词选项
点击 精确查找
Influenza Vaccines
进入主题词说明 界面,第一行出 现的词即为主题 词
LAIV vaccine
页面的 下半部
入口词 (主题词的同义词)用 入口词检索,系统会 自动转入主题词。
将入口词LAIV vaccine 输入检索框
主题词选项
1、题录(书目)数据库
检索的结果是找到获取文献原文的线索。提供文献 的特征,如篇名、作者、摘要、刊登在哪里、收藏 在何地等。如PubMed数据库(它也包括文摘和全文)
2、文摘数据库
检索结果是获取文献的摘要,通过阅读摘要来确定是 否需要进一步获取全文文献。如中国生物医学文献数
据库(CBMdisc)、荷兰医学文摘(EMBase)、美国生物学