淋巴瘤基因克隆性重排检测
t细胞淋巴瘤tcrγ基因重排特征的分析及检测方法优化
T细胞淋巴瘤TCRT基N重排特征分析及检测方法的优化摘要研究背景与目的淋巴瘤在组织和细胞形态学方面与高度反应增生性淋巴组织的鉴别诊断十分困难,容易造成误诊。
淋巴瘤病理诊断是临床病理工作的难题之一。
目前国内主要依靠以形态学为主、免疫组化为辅的诊断手段。
随着分子生物学的发展,从基因水平研究和分析诊断疾病的技术不断出现并且日趋成熟,为淋巴瘤诊断提供了有效工具。
淋巴瘤是由单克隆淋巴细胞增生所致,而反应增生性淋巴组织则来自于多克隆淋巴细胞,这是二者的重要区别。
编码免疫球蛋白(Ig)或T细胞受体(TCR)的基因经过重排以后,不同克隆之间的重排基因互不相同,因此,基因重排对淋巴瘤的诊断具有特异性价值。
以PCR技术为基础的方法以其简便、高效、廉价及适用面广而在淋巴瘤基因重排研究方面越来越受重视。
但不同研究文献中所采用的引物、PCR条件、PCR产物检测方法等都不尽相同,结果也有差异。
因此,难以找到适于常规临床病理诊断之用的标准程序。
Jurkat细胞是T细胞淋巴瘤基因重排研究中常用的阳性对照细胞,但有关Jurkat细胞基因重排的详细情况也未见报道。
假基因是Ig和TCR胚系DNA中常见的基因,有关假基因参与重排的情况以及在设计引物方面是否应将假基因包括在内也未见有关研究报道。
本实验以TCR基因重排为研究对象,通过优化引物选择、PCR条件及PCR产物的检测方法等,分析T细胞淋巴瘤基因重排检测的最佳方法。
同时,分析TCR基因重排的特点,为进一步研究TCR基因重排提供理论和技术支持。
方法1以TCRy基因重排为研究对象,选用通用引物TVG、VvI及TCR7家族特异性引物为工具。
用正交设计实验优化ⅥI引物的PCR条件。
另选一对TCR[j通用引物作为TCRy引物的补充和比较。
2利用PCR和测序研究Jurkat细胞基因重排情况,分析TCR基因重排的基本特点。
3PCR产物检测方法①利用TCR通用引物检测淋巴瘤克隆性基因重排阳性率,分别用琼脂糖电泳和SSCP分析PCR产物;②将PCR产物分别进行直接测序和克隆后测序,分析TCR基因重排的特点及探索测序方法在基因重排检测中的应用;⑧分析PCR产物中DNA的克隆数与SSCP中条带数目的关系。
基因突变和基因重排的检测方法
基因突变和基因重排的检测方法基因突变和基因重排是影响生命过程的两个关键机制。
突变是指DNA序列发生了错误,而重排则是指基因组中的一段DNA序列被移动或复制到另一个位置。
这些变化会导致有害的影响,如导致癌症、自身免疫性疾病和遗传病等。
因此,检测这些变化变得极其重要,以便及早发现并防止这些疾病的发生。
在过去几十年里,科学家已经开发出了多种基因突变和基因重排的检测方法,其中一些方法在诊断遗传性疾病和癌症等方面证明了非常有效。
下面是一些常见的基因突变和基因重排检测方法。
1. Sanger测序Sanger测序是第一种可靠的DNA测序技术,通过分析DNA序列来检测突变和重排。
将DNA反复复制并添加特定的荧光标记,然后测量不同荧光信号的强度来确定DNA序列。
这种方法可以检测单个基因的突变以及一些基因的重排,并已广泛用于诊断遗传性疾病和癌症等。
2. PCRPCR是另一种常见的基因检测方法,它使用聚合酶链反应技术来扩增DNA片段。
通过扩增目标DNA片段,可以检测基因突变和重排。
PCR可以用于从血液、唾液和口腔黏膜等样本中提取DNA,并且已成为诊断基因突变和重排的主要工具。
3. FISHFISH是一种高度特异性的细胞遗传学方法,可用于检测基因重排。
通过将荧光标记的DNA探针与细胞的染色体配对,科学家可以识别染色体上的重排。
这种方法已被广泛用于癌症分析和遗传诊断等领域。
4. CGHCGH是一种用于检测基因重排的分子遗传学技术。
它可以检测整个基因组上的DNA重排,而不是单个基因。
CGH技术基于比较样品DNA和控制DNA之间的差异,以检测DNA重排的部位和类型。
这种方法已被广泛用于研究人类基因组的变异,并在癌症和遗传性疾病诊断中得到应用。
5. NGSNGS是一种DNA测序方法,可以快速、准确地测定DNA序列。
它通过将样品DNA纳入微型反应器中,然后生成数以百万计的DNA片段。
NGS技术可以同时检测多个基因的突变和重排,并已广泛用于快速检测基因变异。
抗原受体基因重排克隆性分析淋巴瘤辅助诊断技术的发展和应用现状
A G的种 系(emie 或称胚 胎 的(mb oi) 型均 由不连 续 的 D A 片段 组成 , 括 可变 区(ai l R grl ) n e r nc 构 y N 包 vr b ae
rg n , 、 ei sV) 变异 区( i r t, ) 连 接 区(on g J 和恒定 区( o s n, , J C 区存在 于 各种 类 型 A G o dv sy D 、 ei jii , ) n cnt tC) V、、 a R 中, D 区仅存在 于 IH 和 T R 及 ^链基 因中。A G基 因重排是 淋 巴细胞 完成发育分 化成 熟 的正常 生理 而 g C1 y 3 R
过 程, 早在 骨髓 淋 巴细胞 分化 阶段 ,R A G基 因即发生重 排 , 形成 V( ) 连 续 D A 片段 ( 1 , 而产生相 应 DJ N 图 )从
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基 因 V、 、 D J片段 的数 量愈 多, 产生 的组 合数也愈 多。该 步骤 可 产生许 多不 同的 D A序 列, N 从而编 码 出 不 同的蛋 白质 , 虽然 它们 的差别及 其微 小 , 却具 有独立特 异性 。基 因重排 过程使种 系 中承载 的相对有 限的 但
李 挺 , 幼立 祖
( . 京 大学 第 一 医 院 病理 科 , 京 1北 北
C re nv r t , S on l U i s y U A) l ei
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遗传 学信息 转变为大量 的基 因片段 , 而再编码 为 I和 T R分子 的抗原结 合部位 。这 些不连接 片段 的重新 从 g C 洗牌和连接从 统计学水 平上 阐释 了人体 免疫 系统 发 生的抗 原 受体 的多变性 。据估 计 , 因重排机 制 可产 生 基
弥漫大b细胞淋巴瘤诊断标准
弥漫大b细胞淋巴瘤诊断标准弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)是一种常见的非霍奇金淋巴瘤。
该病的诊断标准主要包括病理学特征、免疫表型、分子遗传学和临床表现。
本文将对弥漫大B细胞淋巴瘤的诊断标准进行详细介绍。
1. 病理学特征弥漫大B细胞淋巴瘤病理学上主要表现为淋巴结或外部淋巴组织中存在大量异常的B细胞。
该病的病理学特征主要有以下几个方面:(1)弥漫性生长模式:肿瘤细胞在淋巴结或其他组织中弥漫分布,没有明显的结节形成。
(2)大细胞形态特征:肿瘤细胞体积较大,核染色质呈绒毛状,核仁明显,胞浆丰富。
(3)核分裂象:肿瘤细胞中常见核分裂象,反映其高度增殖活性。
2. 免疫表型弥漫大B细胞淋巴瘤的免疫表型在诊断中起到重要作用,常见免疫标记物有以下几个:(1)CD20:阳性表达率高达90%以上,是弥漫大B细胞淋巴瘤的特异性标记。
(2)CD79a:阳性表达率高,也是本病的特异性标记。
(3)CD3:常见阴性,可以与外周T细胞淋巴瘤鉴别。
(4)CD10和BCL6:阳性表达率较高,提示较好的预后。
(5)Ki-67:高表达与肿瘤的生长活跃程度有关。
3. 分子遗传学分子遗传学变异在引起弥漫大B细胞淋巴瘤发生发展过程中起到重要作用。
其中,Bcl-6、c-Myc和Bcl-2等基因异常表达与弥漫大B细胞淋巴瘤的发生发展密切相关。
克隆性IgH基因重排也是该病的常见遗传学异常。
4. 临床表现弥漫大B细胞淋巴瘤的临床表现多样,可包括以下症状和体征:(1)肿块或肿大淋巴结:常见的首发表现是局部淋巴结肿大、无痛。
(2)全身症状:如发热、盗汗、消瘦等,提示疾病进展和系统性受累。
(3)其他表现:肝脾肿大、黄疸、骨髓受累等。
5. 诊断标准根据以上病理学特征、免疫表型和临床表现,弥漫大B细胞淋巴瘤的诊断标准为:(1)病理学特征:存在弥漫性生长模式、大细胞形态和核分裂象。
(2)免疫表型:CD20和CD79a阳性,CD3阴性。
2016年淋巴瘤诊断标准
2016年淋巴瘤诊断标准2016年淋巴瘤诊断标准是指根据淋巴瘤的临床表现、组织学特征和分子生物学特征来判断患者是否患有淋巴瘤。
这些标准是由世界卫生组织(WHO)和国际淋巴瘤研究协会(ICML)联合制定的国际共识标准,可以帮助医生及时准确地诊断淋巴瘤,并为患者提供源于证据的治疗策略。
淋巴瘤是一种源自淋巴细胞的恶性肿瘤,常见于淋巴结、脾、骨髓和外周血液。
淋巴瘤的分类和诊断主要依据WHO独特的系统,将淋巴瘤分为B细胞淋巴瘤、T细胞及自然杀伤细胞(NK细胞)淋巴瘤和浆细胞肿瘤等不同亚型。
下文将分别介绍B细胞淋巴瘤和T细胞及NK细胞淋巴瘤的诊断标准。
1. B细胞淋巴瘤:B细胞淋巴瘤是最常见的淋巴瘤类型之一,包括弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、小淋巴细胞性淋巴瘤(SLL)、黏液性淋巴细胞性淋巴瘤(MALT淋巴瘤)等。
根据2016年的诊断标准,B细胞淋巴瘤的诊断需要同时考虑以下几个因素:- 发病部位:诊断B细胞淋巴瘤需要有淋巴结组织、脾或骨髓等组织的生物标本。
- 组织学表现:根据组织学特征,如细胞形态、核分裂象等,确定淋巴瘤的亚型。
- 免疫表型:通过免疫组化或流式细胞术来确定免疫异型,以排除其他淋巴细胞肿瘤。
- 分子遗传学:通过染色体分析或基因组学方法,检测克隆性免疫重排等遗传学异常。
- 分子生物学:根据基因组或外显子突变、融合基因、基因组重排等特征,确定淋巴瘤亚型。
2. T细胞及NK细胞淋巴瘤:T细胞及NK细胞淋巴瘤是少见的淋巴瘤亚型,包括周围T细胞性淋巴瘤、成人T细胞白血病淋巴瘤(ATLL)等。
2016年的诊断标准针对T细胞及NK细胞淋巴瘤也提供了相关参考内容:- 组织学表现:根据石蜡切片染色、免疫组化或流式细胞术来确定细胞形态和免疫表型。
- 分子生物学:通过基因组学、基因突变、融合基因等特征,协助鉴别不同类型的T细胞及NK细胞淋巴瘤。
- 分期系统:根据淋巴瘤的临床表现、体格检查、影像学检查等,采用Ann Arbor分期系统对淋巴瘤进行分期。
bcr基因重排
bcr基因重排
bcr基因重排是一种常见的基因突变,它发生在B细胞白血病和淋巴瘤等恶性肿瘤中。
bcr基因位于长臂染色体22上,它编码一种酪氨酸激酶,与另一染色体上的abl基因融合后,产生了一种瘤原蛋白bcr-abl。
bcr-abl瘤原蛋白具有不受控制的酪氨酸激酶活性,导致细胞增殖和抗凋亡机制的紊乱,从而导致白血病和淋巴瘤等恶性肿瘤的发生。
bcr基因重排是这些疾病中最常见的突变之一,对于诊断和治疗具有重要意义。
目前,针对bcr-abl瘤原蛋白的靶向治疗已经成为一种常用的治疗策略,有效地改善了患者的生存率和疗效。
- 1 -。
T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用
T细胞性淋巴瘤诊断中TCR基因重排检测的应用潘鑫艳;杨长绍;黎贵芸;杨举伦;王丽【摘要】目的:探讨T细胞受体( T cell receptors, TCR)基因重排检测对T细胞性淋巴瘤诊断的价值。
方法收集T细胞性淋巴瘤30例和淋巴反应性增生组织30例,提取DNA,应用BIOMED-2引物系统中的56条引物进行PCR扩增,核酸分子异源双链凝胶电泳分析结果。
结果30例T细胞性淋巴瘤标本中TCRβ、TCRγ、TCRδ的检出率分别为83.3%(25/30)、93.3%(28/30)、13.3%(4/30),三者联合检测的检出率为96.7%(29/30),30例淋巴反应性增生组织中均未检测出TCR 基因重排。
结论利用BIOMED-2引物系统检测TCR 基因重排可作为T细胞性淋巴瘤的辅助诊断工具。
%Purpose To discuss the TCR gene rearrangements in the diagnosis of T-cell lymphomas. Methods Formalin-fixed and paraffin-embedded samples including 30 cases of T-cell lymphomas and 30 cases of reactive lymphoid hyperplasia were chosen for ex-tracting genomic DNA and PCR amplification using 56 BIOMED-2 primers. PCR products were analyzed by heteroduplex and polyacryl-amide gel electrophoresis. Results In all 30 cases of T-cell lymphomas, 25 cases (83. 3%) showed TCRβ gene monoclonal rear-ran gements, 28 cases (93. 3%) of TCRγ gene monoclonal rearrangements, 4 cases (13. 3%) of TCRδ gene monoclonal rearrange-ments. 29 cases (96. 7%) with TCRβ+TCRγ+TCRδ gene monoclonal rearrangements were detected. but no clonal TCR gene rear-rangements were found in 30 cases of reactive lymphoid hyperplasia. Conclusions The detection of TCR gene rearrangements using BIOMED-2 primers is a useful assistant method for the diagnosis of T-cell lymphomas.【期刊名称】《临床与实验病理学杂志》【年(卷),期】2015(000)004【总页数】4页(P400-403)【关键词】T细胞性淋巴瘤;基因重排;BIOMED-2;TCR基因【作者】潘鑫艳;杨长绍;黎贵芸;杨举伦;王丽【作者单位】成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032;成都军区昆明总医院病理科,昆明 650032【正文语种】中文【中图分类】R733.4非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma,NHL)包括B细胞性淋巴瘤(B-cell lymphoma)和T细胞性淋巴瘤(T-cell lymphoma),因T细胞性淋巴瘤种类繁多,分类复杂,病理诊断较难。
临床病理学:肿瘤病理的分子检测
ORR (%)
71.2 vs 47.3 84.6 vs 37.5 62.1 vs 32.2 73.7 vs 30.7
83 vs 36 58 vs 15 61 vs 22 66.9 vs 23.0
PFS (月)
9.8 vs 6.4 8.4 vs 6.7 9.6 vs 6.6 10.8 vs 5.4 13.1 vs 4.6 9.7 vs 5.2 11.1 vs 6.9 11.0 vs 5.6
ROS1 、 RET基因重排
ROS1重排见于2%肺肿瘤;少吸(<10包、年)/不吸 烟患者;年轻患者;腺癌。临床对克唑替尼敏感。 对EGFR TKIs不敏感。 RET基因融合见于1.3%肺癌,腺癌。
临床检测方法:FISH,RT-PCR
HER2在乳腺癌中…
HER2在乳腺癌中…
HER2扩增与肿瘤发生有关。肿瘤体积大 ,无病生存期 短 ,对CMF等方案耐药, 对蒽环类药物比较敏感,50% 患者为ER或PR阳性。
检测:定量PCR或测序。
ALK基因重排在NSCLC中…
发生率: 3-7% 临床特点: 少吸(<10包、年)/不吸烟
年轻患者 腺泡或印戒细胞癌
融合特点: 主要与EML4存在 至少9种融合方式,其他IFGALK, KIF5B-ALK 与其他癌基因变异不共存
靶向药物:克唑替尼
临床检测方法:FISH,增强免疫组化,RT-PCR
EXON
Genet Med 2009:11(1):21–34
胃肠道间质瘤与格列卫
c-kit/PDGFRA突变类型预测伊马替尼疗效,其中c-kit外显子11突变疗效最佳 PDGFRA D842V突变者对伊马替尼原发耐药。 检测方法:DNA测序
基因重排
女性患者下生殖道淋巴组织高度反应性增生(淋巴瘤样病变):一种具有免疫球蛋白重链克隆性基因重排的良
者 的传染病史 , 新鲜组织 未经 固定 传染性极 强 , 冷冻操 作时
要 养 成 戴 手 套 的 习惯 。遇 到 肝 炎 或 梅 毒 患 者 的标 本 时 , 冷 在
透性好 , 但极易挥发且有 异味 , 应用 时要 随时盖 紧容 器。我 们建议使用 9 % 乙醇 固定 1~2 m n 固定 时 间短 , 果 甚 5 i, 效
[ 骆 新 兰 . 冻 切 片常 见 问题 探 讨 [ ] 临床 与 实 验 病 理 学 杂 志 , 4] 冷 J.
19 ,5 4 :7 . 9 9 1 ( ) 23
・
国外期刊文摘 ・
女 性 患 者 下 生 殖 道 淋 巴组 织 高 度 反 应 性 增 生 ( 巴 瘤 样 病 变 ) 一 淋 : 种具 有 免 疫 球 蛋 白重 链 克 隆 性 基 因重排 的 良性 病 变
[ ] 陈乐真. 3 手术 中 病 理 诊 断 [ ] 北 京 : 民军 医 出版 社 ,9 4 M , 人 19 :
5.
觉与石蜡切片反差不大 , 这样 的切 片才是 一张合格的冷冻切
片, 只有 这 样 的切 片 才 能 为 快 速 而 准 确 的诊 断 提供 保 障 。 38 关于消毒及清洁 . 病 理 科 在 预 约 冷 冻 时 一 定 要 了 解 患
81 .
习惯 , 以便 总 结 经 验 。镜 下 观 察 胞 质 与 胞 核 应 红 蓝 对 比鲜 明, 细胞 无 明 显 收 缩 , 织 无 人 为 裂 隙 , 有 或 极 少 形 成 冰 组 没 晶, 刀痕 少 , 要 观 察 的 肿 瘤 或 组 织 结 构 能 较 完 整 地 呈 现 , 主 感
临床 与实验病理 学杂志
JCi x ahl 00Jn 2 ( ) l Ep P to n 2 1 a ;6 1
IgH基因单克隆重排检测及其在B细胞性非霍奇金淋巴瘤诊断中的应用
IgH基因单克隆重排检测及其在B细胞性非霍奇金淋巴瘤诊断中的应用李银珍;王芳;邵琼;张旭;邓玲;汤涛;张晓;吴秋良【摘要】AIM: To establish a reliable and feasible protocol for detection of monoclonal immunoglobulin heavy chain (IgH) gene rearrangements for routine diagnosis of B - cell non - Hodgkin lymphoma ( B - NHL). METH-ODS : Using the primer combinations of FR2, FR3, LJH and VLJH, modetube A + tube B, and semi - nested PCR, the monoclonal IgH gene rearrangements in 121 cases of B - NHL, 58 cases of T - cell non - Hodgkin lymphoma ( T - NHL) and 19 cases of reactive lymphoid hyperplasia were detected. The differences of clonality detection rate between B - NHLgroup and T - NHL group, B - NHL group and reactive lymphoid hyperplasia group, and between the use of FR2, FR3 and FR2 + FR3primers were analyzed. RESULTS: The clonality detection rates of B - NHL, T - NHL and reactive lymphoid hyperplasia were 81% (96/118), 4% (2/54)and 0% (0/19). There were remarkable differences between B - NHL group and T - NHL group, B - NHL group and reactive lymphoid hyperplasiagroup in monoclonal IgH gene rearrangements ( P < 0. 05 ) . In B - NHL group, monoclonality was found in 58% of the cases using primer FR2, 55% using FR3 , andrn81% using the combination of both primers, with significant differences (P <0. 05) . CONCLUSION: Using the primer combinations of FR2, FR3 , LJH and VLJH, detection of paraffin - embedded tissues, the method of tube A + tube B mode and semi -nested PCR for determining monoclonal IgH gene rearrangements is feasible and reliable, and the clonality de-tection rate is high enough for clinical diagnosis of B - NHL.%目的:建立准确可靠、操作性强、适用于临床实际工作的免疫球蛋白重链(immunoglobulin heavy chain,IgH)基因单克隆重排检测方法,用于B细胞性非霍奇金淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin lymphoma,B-NHL)的辅助诊断.方法:采用骨架区(framework region,FR)引物FR2、FR3和重链连接区(joining region of heavy chain,JH)引物LJH、VLJH组合、A管+B管模式、半巢式聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法对121例B-NHL、58例T细胞性非霍奇金淋巴瘤(T-cell non-Hodgkin lymphoma,T-NHL)和19例淋巴结反应性增生的石蜡组织进行IgH基因单克隆重排检测,分析IgH基因单克隆重排检出率在B-NHL组、T-NHL组和淋巴结反应性增生组中的差异,以及B-NHL中联合应用FR2和FR3与单独应用FR2、FR3之间IgH基因单克隆重排检出率的差异.结果:118例成功检测的B-NHL中,IgH基因单克隆重排检出率为81%(96/118);54例成功检测的T-NHL中,IgH基因单克隆重排检出率为4%(2/54);19例成功检测的淋巴结反应性增生中未检出IgH基因单克隆重排.B-NHL组与T-NHL组、淋巴结反应性增生组相比,IgH基因单克隆重排检出率差异具有显著性(P<0.05).B-NHL中,FR2基因单克隆重排检出率为58%(68/118),FR3基因单克隆重排检出率为55%(65/118),联合应用FR2和FR3,IgH基因单克隆重排检出率为81%(96/118),联合应用FR2和FR3与单独应用FR2、FR3的检出率有显著差异(P<0.05).结论:采用FR2、FR3、LJH及VLJH引物组合、A管+B管模式和半巢式PCR法进行石蜡组织IgH基因单克隆重排检测,简单易行,结果准确可靠,阳性率较高,可用于临床B-NHL的辅助诊断.【期刊名称】《中国病理生理杂志》【年(卷),期】2012(028)011【总页数】5页(P1994-1998)【关键词】淋巴瘤;免疫球蛋白;基因重排【作者】李银珍;王芳;邵琼;张旭;邓玲;汤涛;张晓;吴秋良【作者单位】华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心分子诊断科,广东,广州,510060;华南肿瘤学国家重点实验室,中山大学肿瘤防治中心病理科,广东,广州,510060【正文语种】中文【中图分类】R733.4免疫球蛋白重链(immunoglobulin heavy chain,IgH)基因单克隆重排是B细胞性非霍奇金淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin lymphoma,B-NHL)的重要特征,国内外病理界已达成一致共识:应用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测IgH基因单克隆重排可以辅助诊断BNHL[1-3]。
IgH基因克隆重排在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的的诊断价值
IgH基因克隆重排在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的的诊断价值目的:探讨IgH基因克隆重排在B细胞非霍奇金淋巴瘤的中的诊断价值。
方法:用PCR凝胶电泳检测B细胞非霍奇金淋巴瘤中IgH基因克隆性重排。
结果:43例B细胞非霍奇金淋巴瘤中,39例用FR3A引物检测阳性,阳性率90.7%;22例用FR2A引物检测阳性,阳性率55.2%;FR3A或者FR2A引物联合检测的总阳性率为90.7%。
结论:PCR凝胶电泳技术检测IgH基因克隆重排对B细胞非霍奇金淋巴瘤的诊断有重要的辅助价值。
标签:B细胞非霍奇金淋巴瘤IgH基因克隆重排淋巴瘤作为我国常见恶性肿瘤之一,从分子病理学和分子遗传学水平来探讨相关基因的特征和发病机制,以期建立相应的分子标记,进一步协助诊断、判断预后[1-2]。
淋巴瘤组织学形态多样,免疫组化染色可鉴定淋巴瘤的类型,但无法解决良恶性鉴别难题。
近年来,国外用分子生物学技术证实,细胞增殖的单克隆性可协助肿瘤的诊断。
本研究应用PC R方法检测B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-NHL)中免疫球蛋白重链(IgH)基因重排情况,探讨其在淋巴瘤诊断中的价值。
胚系状态下,IgH基因由可变区(V)、多变区(D)、连接区(J )、恒定区(C)构成。
这些区域在染色体上分布是不连续,片断之间可有长度不等的插入序列将其分开,当淋巴细胞发育到一定阶段,在重组酶的作用下,重新排列组合构成一个有结构的基因,即所谓的基因重排。
正常B淋巴细胞免疫球蛋白重链(IgH )基因重排为多克隆性,而恶性B细胞肿瘤表现为单克隆性。
因此,这种单克隆IgH 基因重排可用于B细胞淋巴瘤的诊断,对鉴别良、恶性淋巴细胞增生有重要的参考价值[3-5]。
1. 材料与方法1.1. 标本来源收集浙江大学附属医院,温州医学院2010-2013年间诊断的B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-NHL)石蜡标本43例,男性24例,女性19例,年龄17-75岁,平均年龄为52岁。
其中弥漫大B淋巴瘤(DLBCL )30例,滤泡性淋巴瘤(FL)4例,粘膜相关淋巴组织淋巴瘤(MALT)4例,套细胞淋巴瘤(MCL)3例,小细胞淋巴瘤(SLL/CLL)2例。
DNA重排的检测方法
小麦-簇毛麦F1 代染色体间易位
染色体涂染显示人染色体组
荧光标记探针
• 不对环境构成污染 • 灵敏度能得到保障 • 可进行多色观察分析,可同时使用多个
探针,缩短因单个探针分开使用导致的 周期过长和技术障碍。
4. 比较基因组杂交
Comparative Genomic Hybridization (CGH)
• 原理:在扩增反应中加入不等量的两段寡核 苷酸引物,引物量相差100倍,通过PCR扩增 获得单链DNA,然后利用双脱氧法直接测序。
• 应用:扩增产物的测序,可以很容易确定群 体中某一特定基因的序列变异情况,这种方 法是了解目的基因突变的较理想的方法。
(5) 原位PCR技术
• 原理:即聚合酶原位扩增技术。将PCR技术 与原位杂交技术结合起来,不改变周围组织 的原有位置,直接在组织、细胞或病原体原 位研究基因变化的技术。
光谱核型分析原理(Spectral karyotyping, SKY)
1996 年 Schroch等首次描述了SKY技术。 应用5种荧光素同时标记24条人染色体,制成 染色体涂染探针,应用Fourier光谱仪,CC成 像和荧光显微镜进行检测分析,经计算成像处 理,46条染色体形成具有不同颜色的核型影像, 可用以分析各种染色体异常。
应用:
• 主要应用在检测肿瘤细胞的遗传变化 • 物种间染色体同源性比较 优势:
• 可快捷检测中期、间期基因组 • 不需预先知道DNA发生改变的部位 • 一次实验即可检出待测样本整个基因
组拷贝数的增减
四、分子生物学技术
1. Southern-blotting • 应用于基因重排检测是1981年Korsmeyer等
• 优势:Southern分析已被应用于IgH、 Igk、 Igl及各种TCR(T-细胞受体)克隆性重排的检测, 并以其令人满意的灵敏度和可靠性被视为基因 重排检测的“金标准”。
基因重排检测技术的建立及其在淋巴瘤诊断中的应用
基因重排检测技术的建立及其在淋巴瘤诊断中的应用【关键词】淋巴瘤Detection and clinical significance of gene rearrangements in diagnosis of lymphomas【Abstract】 AIM: To establish a way to detect the gene rearrangements of IgH and TCR and to assess the application of the detection technique in the diagnosis of malignant lymphoma. METHODS: Fiftythree cases of malignant lymphoma and 20 cases of reactive lymphoid hyperplasia were chosen for making tissue sections. Genomic DNA was extracted, and amplified via PCR. The products were resolved on denaturing polyacrylamide gels and visualized through silver staining. RESULTS: Gene rearrangements of IgH and TCR were negative in 20 cases of reactive lymphoid hyperplasia. In all of 18 cases of T cellnonHodgkins lymphoma (TNHL), gene rearrangement of TCR γ was found in 12 cases and that of TCR β was found in 3 cases, and IgH gene rearrangement was not found. IgH gene rearrangement was found in 28 cases out of 32 cases of B cellNHL (BNHL),in 2 cases of which gene rearrangements of TCR γ and IgH were both found. There was IgH gene rearrangement in 3 cases of suspected lymphomas. There was a remarkable difference between NHL group and benign group in gene rearrangment (P<0.05). CONCLUSION: The detection of gene rearrangements of IgH and TCR by PCR can be a kind of subsidiary means to diagnose the lymphoproliferative disease. Particularly, the clonality showed in the formalinfixed and paraffinembedded samples may be useful in the retrospective researches.【Keywords】 lymphoma; gene rearrangement; polymerase chain reaction; neoplasm【摘要】目的:建立基于克隆性分析技术的B和T淋巴细胞产生的抗原受体分子基因重排检测技术,探讨B淋巴细胞免疫球蛋白及T淋巴细胞受体基因重排在恶性淋巴瘤临床诊断中的应用. 方法:从组织蜡块中切取组织片5~10张,提取基因组DNA,PCR扩增,聚丙烯酰胺凝胶电泳后银染显示基因重排结果. 结果:20例良性淋巴组织反应性增生病例中,淋巴细胞IgH及TCR基因重排均为阴性;18例T细胞非何杰金氏淋巴瘤中TCRγ基因重排12例,TCRβ基因重排3例,未见有IgH基因重排;32例B细胞性非何杰金氏淋巴瘤标本中有28例IgH基因重排阳性,有2例TCRγ和IgH基因重排均阳性;3例未确诊的疑难病例均为IgH基因重排;IgH及TCR基因重排检出率在淋巴瘤组与良性组之间,差异有显著意义(P<0.05). 结论:应用PCR法检测B淋巴细胞IgH和T淋巴细胞TCR基因重排可作为淋巴细胞来源的良、恶性病变的一种辅助诊断手段,且适用于石蜡标本以进行回顾性研究.【关键词】淋巴瘤;基因重排;聚合酶链反应;肿瘤0引言恶性淋巴瘤(malignant lymphoma)是免疫系统的原发性恶性肿瘤,主要发生于淋巴器官和淋巴组织. 根据肿瘤的组织结构及细胞学特征可分为何杰金氏病(Hodgkins disease, HD)及非何杰金恶性淋巴瘤(nonHodgkins malignant lymphoma, NHL),淋巴瘤的诊断一直是病理诊断中的难点,部分淋巴组织增生性病变单纯通过HE和免疫组化很难明确性质,另外NHL由于种类繁多,分类复杂,给临床病理工作者带来了一定的困难.淋巴细胞从原始的胚系构型到分化成熟,其抗原受体(Ig和TCR)基因通过基因重排而形成有功能的基因. 一个T,B细胞或其克隆性后代,均只含一种独特的分子遗传学标记. 一旦某一克隆的淋巴细胞发生恶性变化,即可呈现特异的基因重排[1]. 因此,对基因重排类型进行检测可用于对淋巴细胞增殖性疾病的诊断. 此研究拟应用这一手段,探讨淋巴组织增生性病变的性质,并对该技术在恶性淋巴瘤中的诊断价值进行探讨.1材料和方法1.1材料53例恶性淋巴瘤标本均来自第四军医大学唐都医院病理科(1995~2005). 其中男性29例(55%),女性24例(45%);年龄12~76岁,平均年龄44.2岁. 所有标本均为福尔马林固定、石蜡包埋组织. 其中B细胞非何杰金淋巴瘤32例,T细胞非何杰金淋巴瘤18例,未能定性的淋巴组织增生性病变3例. 20例良性淋巴组织反应性增生病例作为阴性对照. 所有淋巴瘤病例均在取PCR 模板前经临床病理HE和免疫组化标记(B细胞: CD20,CD79α; T细胞: CD3,CD45RO)证实,以确定为相应病例且所取部位确为病变部位,包含有需检测的部分. 3例未能定性的淋巴组织增生性病变怀疑为BNHL(免疫组化标记CD79α阳性),但诊断仍未明确.1.2方法1.2.1石蜡包埋组织DNA的提取每例标本制备厚度为4 μm的切片6张,贴于载玻片上,常规烤片、二甲苯脱蜡、乙醇冲洗,切片自然干燥. 用无菌双面刀片将组织刮入1.5 mL的离心管中,按以前的方法[2-3]提取基因组DNA.1.2.2引物合成引物序列由上海生工生物工程技术公司合成. 引物序列为: β球蛋白基因内对照PC03:ACACAACTGTGTTCACTAGC, PC04:CAACTTCATCCACGTTCACC;免疫球蛋白基因重排(IgH) FR3A:ACACGGCTGTGTATTACTGT, LJH: TGAGGAGACGGTGACC,VLJH:GTGACCAGGGTACCTTGGCCCCAG;T细胞受体基因重排(TCR β链和γ链)Db1: CAAAGCTGTAACATTGTGGGGAC, Jb2:AGCACTGTGAGCCTGGTGCC,TVG: AGGGTTGTGTTGGAATCAGG, TJX: CGTCGACAACAAGTGTTGTTCCAC,Vγ11: TCTGGAGTCTATTACTGTGC,Vγ101: CTCACACTCTCACTTC,Jγ12:CAAGTGTTG TTCCACTGCC, Jp12: GTTACTATGAGCTAGTCC.1.2.3PCR扩增及循环条件PCR扩增在PT200型热循环仪(MJ Research)上进行. 反应体系为25 μL,含10 mmol/L dNTP(Gibco BRL)2 μL,10×缓冲液2.5 μL,50 mmol/L MgCl2 0.75 μL,Taq DNA聚合酶(Gibco BRL) 1 U,20 pmol/L引物1 μL,DNA样品1~5 μL. IgH基因采用半巢氏PCR扩增: 第一轮引物为FR3A和LJH,95℃预变性3 min,然后94℃变性40 s,62℃退火50 s,72℃延伸40 s,共30个循环; 最后72℃延伸10 min. 扩增产物经1∶100稀释后取1 μL进行第二轮扩增,引物为FR3A和VLJH,95℃预变性3 min,然后94℃变性40 s,60℃退火50 s,72℃延伸40 s,共30个循环; 最后72℃延伸10 min. FR 3A与VLJH扩增产物为100~120 bp.TCRβ和TCRγ采用40个循环,其中TCRγ引物为Vγ11,Vγ101和Jγ12或Vγ11,Vγ101和Jp12的混合物. 95℃预变性3 min,然后94℃变性40 s,56℃退火50 s,72℃延伸40 s;最后72℃延伸10 min. TCRβ扩增产物为65~85 bp. TCRγ各组扩增产物在70~200 bp不等.β球蛋白基因引物作为内对照进行扩赠,共40个循环. 95℃预变性3 min,然后94℃变性40 s,60℃退火50 s,72℃延伸40 s;最后72℃延伸10 min. 产物长度为110 bp.1.2.4电泳及结果观察琼脂糖凝胶(20 g/L)电泳评价扩增效果后,将3 μL产物和等体积的上样缓冲液[4](990 mL/L甲酰胺,1 g/L溴酚蓝,1 g/L二甲苯青)混匀后加到厚度为0.8 mm的聚丙烯酰胺凝胶(100 g/L,含尿素8mol/L),应用miniVE系统(AmershamPharmacia Biotech)泳动8 h(80 V).取出后按以前的方法[2]银染,分别用UVP凝胶分析系统(UVP, Cambridge,UK)和光学照相记录数据,根据IgH及TCR相应阳性位置判断结果.1.2.5结果判定阳性结果判定标准:①PCR扩增电泳条带清晰,宽度不大于1 mm,边缘锐利;②片段大小与预计范围相符,与期望值相差不超过5 bp;③若出现期望值大小之外的其他条带或期望值内出现两条或以上可接受的条带,应判定为重排阴性.统计学处理:采用SPSS 10.0统计分析软件对组间率的差别进行χ2检验,以P<0.05为有统计学意义.2结果2.1组织学观察和免疫组织化学结果32例B细胞非何杰金淋巴瘤免疫组化证实CD20和(或)CD79α阳性, CD3和CD45RO阴性(图1); 18例T细胞非何杰金淋巴瘤免疫组化证实CD3和(或)CD45RO阳性, CD20和CD79α阴性(图2),支持原来的诊断和分型. 3例未能定性的淋巴组织增生性病变免疫组化标记CD79α阳性, CD3和CD45RO阴性,怀疑为BNHL. 20例良性淋巴组织反应性增生病例CD20,CD79α,CD3,CD45RO均有不同程度的阳性表达.A: CD79а; B: CD20.图1BNHL组织中CD79а和CD20阳性表达(略)A: CD45RO; B: CD3.图2TNHL组织中CD45RO和CD3阳性表达(略)2.2基因重排检测结果2.2.1石蜡组织标本DNA检测PC03,PC04引物对良性增生的淋巴组织以及淋巴瘤组织DNA进行扩增,均见110 bp大小的β球蛋白特异条带(图3).右侧泳道为100 bp DNA标志物的位置. 1:实验组TNHL. 黄色箭头为110 bp涌动位置;2:实验组BNHL;3:阳性对照TNHL(已知TCRγ重排阳性);4:阳性对照BNHL(已知IgH重排阳性);5:反应性增生淋巴组织作为阴性对照.图3PC03/PC04引物PCR扩增结果电泳图(略)2.2.2良性淋巴组织反应性增生病例结果20例良性淋巴组织反应性增生病变组织B细胞和T细胞抗原受体重排均为阴性(图4).2.2.3阳性对照T,B淋巴瘤检测结果B细胞淋巴瘤阳性对照标本组织B细胞Ig重排阳性(图5). T细胞淋巴瘤阳性对照标本组织T细胞TCRγ1重排阳性(图6).右侧泳道为100 bp DNA标志物的位置. 1:IgH FR3A/LJH, FR3A/VLJH引物扩增产物;2:TCRβDb1/Jb2引物扩增产物;3:TCRγ1 TVG/TJX引物扩增产物;4:TCRγ2 Vγ11/Vγ101/Jγ12引物扩增产物; 5:TCRγ3Vγ11/Vγ101/Jp12引物扩增产物. 黄色箭头为110 bp涌动位置.图4良性淋巴组织反应性增生病例PCR扩增结果电泳图(略)左侧泳道为100 bp DNA标志物的位置. 1:内对照PC03/PC04引物扩增产物;2:IgH FR3A/LJH,FR3A/VLJH引物扩增产物;3:TCRβDb1/Jb2引物扩增产物; 4:TCRγ1 TVG/TJX引物扩增产物; 5:TCRγ2 Vγ11/Vγ101/Jγ12引物扩增产物;6:TCRγ3 Vγ11/Vγ101/Jp12引物扩增产物;7:阴性对照FR3A/LJH,FR3A/VLJH引物扩增产物. 黄色箭头为110 bp涌动位置.图5阳性对照BNHL PCR扩增结果电泳图(略)2.2.4淋巴瘤组织检测结果18例T细胞淋巴瘤中TCRγ基因重排为12例,TCRβ基因重排为3例, TCR基因重排阳性率83.3%,与良性组(TCR基因重排均阴性)相比,差异有显著意义(χ2=15.10, P<0.05);32例B细胞性非何杰金氏淋巴瘤标本中有28例IgH基因重排阳性,其中2例TCRγ基因重排也阳性,基因重排阳性率87.5%,与良性组(IgH基因重排均阴性)相比,差异有显著意义(χ2=25.30, P<0.05).中间泳道为100 bp DNA标志物的位置. 1:TCRβDb1/Jb2引物扩增产物; 2:TCRγ3 Vγ11/Vγ101/Jp12引物扩增产物;3:TCRγ2Vγ11/Vγ101/Jγ12引物扩增产物;4:TCRγ1 TVG/TJX与内对照PC03/PC04引物扩增产物;5:阴性对照TCRγ1 TVG/TJX与内对照PC03/PC04引物扩增产物;6:阴性对照TCRγ2 Vγ11/Vγ101/Jγ12引物扩增产物; 7:阴性对照TCRγ3Vγ11/Vγ101/Jp12引物扩增产物;8:IgH FR3A/LJH,FR3A/VLJH引物扩增产物. 黄色箭头为110 bp涌动位置,红色箭头为190 bp涌动位置,红色箭头为80 bp涌动位置.图6阳性对照TNHL PCR扩增结果电泳图(略)2.2.5未确诊病例检测结果3例未确诊的疑难病例均为IgH基因重排,经FR3A/LJH,FR3A/VLJH引物采用半巢氏PCR扩增后出现95 bp大小IgH阳性条带.3讨论恶性淋巴瘤(malignant lymphoma)是免疫系统的原发性恶性肿瘤,主要发生于淋巴器官和淋巴组织. 淋巴瘤的诊断一直是病理诊断中的难点,部分淋巴组织增生性病变单纯通过HE染色和免疫组化方法很难明确性质,另外NHL种类繁多,分类复杂,给临床病理工作者带来了一定的困难[5].干细胞在向淋巴细胞分化过程中, Ig重链基因(IgH)和T细胞受体(TCR)基因的可变区(V)和结合区(J)基因会发生重排[6]. 基因重排过程是一个正常的过程,正常淋巴细胞在发育中是多克隆性质,但淋巴造血系统肿瘤所具有的是单克隆性重排,也就是全部肿瘤细胞具有一个相同的免疫球蛋白或TCR 基因重排,即表现为重排基因为单一模式,这对研究淋巴细胞恶变的机制和解决临床的诊断问题都十分重要[6]. 检测单克隆性免疫球蛋白和T细胞受体基因有助于鉴别淋巴系统的肿瘤性和反应性增生,并确定细胞的来源.本研究中18例T细胞淋巴瘤中TCRγ基因重排为12例,TCRβ基因重排为3例, TCR基因重排阳性率83.3%,与Diss等[7]报道的T 细胞淋巴瘤78.2%的检出率相近. 而良性淋巴组织未见克隆性条带, TCR基因重排检出率在TNHL及良性淋巴结反应性增生之间相比,差异有显著意义(P<0.05). 说明TCR基因引物对T细胞性NHL的克隆性确定有重要价值. 32例B细胞性非何杰金氏淋巴瘤标本中有28例IgH基因重排阳性,基因重排阳性率87.5%,与Kros等[8]报道的B细胞淋巴瘤77%的检出率以及国内王萍等[9]报道的B细胞淋巴瘤72 %的检出率相近. 而TNHL及反应性增生均未见IgH克隆性基因重排, IgH基因重排检出率在BNHL及良性淋巴结反应性增生之间相比,差异有显著意义(P<0.05). 说明IgH基因引物对B细胞性NHL的克隆性和细胞源性确定有重要价值,可用于淋巴瘤的诊断和分型.B淋巴细胞产生的抗原受体分子Ig和T淋巴细胞产生的抗原受体分子TCR,其编码基因在细胞的分化过程中均发生重排. 一个T,B细胞或其克隆性后代,均只含一种独特的分子遗传学标记. 大量的实验已证实,淋巴细胞肿瘤源于单克隆性增生. 我们利用特定的引物对其基因进行扩增,当将扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳时,多克隆淋巴细胞将产生一片弥漫带(见于反应性增生),而单克隆性增殖的淋巴组织则出现一明显条带(见于恶性淋巴瘤).因此对于淋巴瘤的诊断,首先应依靠形态学检查,并辅以免疫组化结果,对于仍不能明确诊断一小部分病例得,可行基因重排检测,在本研究中有3例较难诊断病例,由于病理HE切片、免疫组化均不能做出明确诊断,通过运用PCR技术对其进行基因重排检测,有IgH的特异性重排条带,提示基因重排的检测对于识别此类交界性及淋巴瘤的早期发现可能具有重要价值.参考文献[1] Garcia MJ, Delgado BM, Granizo JJ, et al. IgH,TCRγ and TCRβ gene rearrangement in 80 B and Tcell NonHodgkins lymphomas: Study of the association between proliferation and the socalled “A berrant” patterns[J]. Diag Mol Pathol, 2001, 10(2): 69-77.[2]王淑芳,苏勤,朱少君,等.多发性子宫平滑肌瘤的克隆性[J].中华病理学杂志,2002, 31:107-111.[3]朱少君,苏勤,王淑芳,等. 女性外阴尖锐湿疣的克隆性[J]. 诊断病理学杂志, 2003, 10:81-84.[4] Lucas DR, Shroyer KR, McCarthy PJ, et al. Desmoid tumor is a clonal cellular proliferation: PCR amplification of HUMARA for analysis of patterns of Xchromosome inactivation[J]. Am J SurgPathol, 1997, 21:306-312.[5]高子芬,潘增刚,裴斐,译. 女性生殖系统. 见: Juan Rosai,ed. 回允中,主译. 阿克曼外科病理学[M]. 8版. 沈阳: 辽宁教育出版社,1999. 1319.[6]朱平. 现代血液肿瘤诊断治疗学[M] . 北京:北京医科大学、中国协和医科大学联合出版社,1998:24-41.[7] Diss TC, Watts M, Pan LX, et al. The polymerase chain reaction in the demonstration of monoclonality in T cell lymphomas[J]. J Clin Pathol, 1995, 48:1045-1050.[8] Kros JM, Bagdi EK, Zheng P, et al. Analysis of immunoglobulin H gene rearrangement by polymerase chain reaction in primary central nervous system lymphoma[J]. J Neurosurg, 2002,97:1390-1396.[9]王萍,王瑞年,卢健,等. 非霍奇金淋巴瘤的IgH和TCRδ基因重排[J]. 临床与实验病理学杂志, 2002,18: 21-23.。
TCR重排
TCR重排一、临床意义:近年来小儿急性淋巴细胞白血病的发生日趋增多, 并且在成年人的发病率也呈增长的趋势, 虽然部分患者经过化疗或干细胞移植, 能够达到临床或血液学的完全缓解( Complete Remission, CR) , 但白血病微小残留病(Minimal Residual Disease, MRD) 导致白血病复发的问题一直困扰着医务人员。
目前检测MRD 的手段很多, 如流式细胞仪检测白血病细胞、RT-PCR 检测白血病基因等方法, 其中白血病基因检测具有灵敏度高的特点具有很高的参考价值。
然而淋巴细胞白血病因为不具有高特异性的白血病基因, 所以在MRD 的监测上比较困难。
1、TCR基因重排技术是检测淋巴细胞克隆性增生的金标准,应用于恶性淋巴瘤的早期诊断和鉴别诊断有重大意义,特别是对于经常规HE、免疫组化检测仍不能确诊的病例有较好的用途和前景。
非霍奇金淋巴瘤是发生于单一亲本细胞的单克隆恶性增殖,瘤细胞的基因重排高度一致。
而正常淋巴组织和良性淋巴组织增生性疾病呈多克隆性,因此可作为非霍奇金淋巴瘤的基因标志。
TCRγ或TCRβ基因重排常作为T 细胞淋巴瘤的基因标志,阳性率可达70%~80%。
为非霍奇金淋巴瘤的诊断、分型及评估预后提供参考依据。
由此可见TCR 基因重排是淋巴细胞恶性增生的特异性标志。
2、我们通过对T 细胞受体(Tcell receptor , TCR) 检测以及它们在监测MRD 中的临床意义的研究, 观察到这种TCR基因重排的检测持续阳性的患者, 更容易导致白血病的早期复发。
因而在ALL 病程中对TCR基因重排进行动态监测, 极大的提高MRD 检出的特异性和敏感性,对ALL患儿的预后、复发的判断及制定相应的个体化治疗方案有重要的指导意义,可以使患儿最大程度的长期无病生存,减少化疗所致的远期不良反应。
二、检测方法:1、S outhern杂交技术(印迹杂交)优点是稳定、可靠, 被称为基因重排的金标准,缺点是成本较高, 需要较多新鲜组织、操作复杂和费时, 且国内收费标准较低, 无法广泛应用于淋巴瘤的鉴别诊断。
κ基因重排在霍奇金淋巴瘤H-RS细胞性质中的研究
P R eut ( )VcJ a d “ J 4 eerarne nsw r bevd i tesm aeo Hogi C .R sl 1 _ I n V / d s 3 d / 2 gn er gmet eeo sre n h a ecs f d knS a
lr hm oua c rs g t e ( S ) ad t oiv inl w r a o f n n i S sr udn y p o a nd l sl oi y e r e n p N HL , n h psie s as ee l o d i t u o n i e t g s u g
S lce ar f5 bolb ld K g n - mi —p cf rmes V J1 , c Jl , c J3 ee td 6 p i o i-a ee e ef l s e ic p s a y i i r : 1 2 V. 2 Vl K, 4J1 , / 4 2 4 / 3 / VK 2 /K 4 V J5 J 混合,d tce h ih h i e erarn e nsi ae fHL b h to fdrc n st / l,V. c ee td te l tc an g n e ra gme t n 3 c sso yte meh d o ieti i g u
淋 巴细 胞 的相 关 性 进 行 研 究 。方 法 : 用 直接 原 位 P R 法 . 生 物 素 标 记 的 V,J 、 J 、 . 、 采 C 5一 V Vd / / V
J 、 、 J 等 6对 K家族特异 性 引物对 3例 霍 奇金淋 巴瘤 组织 H R S细胞 的 K轻链基 因重排 v/ V K /— 情 况进行检 测 。结果 : 1 1例结 节硬 化 型霍 奇金 淋 巴瘤 ( S L 组 织 中, 分 H/ — () NH ) 部 R S细胞重 复 出现 V / 。J 基 因重排 , 亦有部 分 H/ . R S细胞 重复 出现 V / H 基 因重排 , 阳性信 号分别 重复 出现 于其 周 围部分 背景 J。 : 且 淋 巴细胞核 内 . 少数 H/ . R S细胞 未检 测 出 K基 因重排 ; 2 2例 混合 细胞 型霍 奇金淋 巴瘤 ( H ) 织 中, () MC L 组 所有 H R S细胞均 未检 测 出 K轻链 基 因重排 。 /— 结论 :1 本例 N HL的 H/ — () S R S细胞可 能为 多克 隆性 增生 , 且 H R S细 胞 与 其 周 围 部 分 背 景 淋 巴 细 胞 间 可 能 存 在 克 隆相 关 性 , 即 可 能 来 自 同一 个 B 细 胞 克 隆 ; 2 2例 /— ()
皮肤外周t细胞淋巴瘤评价标准
皮肤外周T细胞淋巴瘤(PTCL)是一种罕见的恶性淋巴瘤,起源于皮肤外周T细胞。
这种病症在临床上表现为皮肤病变,并且可能在淋巴结和其他器官中出现转移。
对于这种疾病,评价标准的制定十分重要,能够帮助医生进行诊断和治疗,也可以为临床研究提供统一的参照标准。
下面我们将对皮肤外周T细胞淋巴瘤的评价标准进行详细的探讨。
一、临床表现1. 皮肤病变PTCL患者通常表现为皮肤上的肿块、红斑或溃疡等病变,这些皮肤症状往往是该病的早期表现,对于鉴别诊断非常重要。
2. 淋巴结肿大有些患者在淋巴结区域出现肿大,这可能表明疾病已经向淋巴系统内部发展。
3. 全身症状患者可能出现发热、乏力、体重减轻等全身症状,这些症状一般伴随着病情的进展而逐渐加剧。
二、影像学检查1. 化疗前后CT检查在评估治疗效果时,CT检查可以帮助医生确定病灶的大小和数量的变化,对于评估治疗效果至关重要。
2. PET-CT检查PET-CT检查能够更准确地评估病灶的新陈代谢活性,对于评估疾病的活动程度和治疗效果具有一定的指导意义。
三、病理学检查1. 病变组织病理学检查通过病理学检查,可以观察到肿瘤细胞的形态特点和组织学结构,帮助医生进行准确的诊断。
2. 免疫组化检查通过对肿瘤组织标记特定的免疫组化标记物,可以帮助确定肿瘤的类型和来源,为治疗方案的选择提供依据。
四、分子生物学检查1. T细胞受体基因重排对于皮肤外周T细胞淋巴瘤,T细胞受体基因的重排检测结果有助于确定肿瘤细胞的来源和克隆性,对于诊断和分析病情具有重要意义。
2. 并行测序技术利用高通量测序技术对患者的肿瘤组织进行基因组学分析,有助于发现特定的基因突变和异常,为个体化治疗方案的制定提供依据。
五、分期和风险评估1. Ann Arbor分期采用Ann Arbor分期对PTCL患者进行分期,根据淋巴瘤的累及部位和范围进行分期,有助于评估患者的病情严重程度。
2. PIT评分系统PIT评分系统是根据患者发病时的生理状况、芳龄和淋巴瘤分期等因素进行综合评估,有助于判断患者的不良预后因素和生存率。
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淋巴瘤应用基因重排检测进行辅助/鉴别诊断的方案
注意事项
▪ 检测到克隆性重排未必一定发生恶性病变 某些良性增生也可呈克隆性重排,如CD8+T细胞淋巴增 生性病变、良性单克隆性丙种球蛋白病、皮肤淋巴瘤样 丘疹病、免疫缺陷患者严重的EB病毒感染等;
▪ 检测不到克隆性重排也不能排除恶性病变 某些明确恶性病变的免疫缺陷患者中偶尔检测不到克隆 性重排,NK/T细胞淋巴瘤中IG和TCR基因呈胚系结构, 即也无克隆性重排。
▪ 辅助诊断:少见类型淋巴瘤,如肝脾T细胞淋巴瘤 ▪ 亚类分析:明确是B淋巴恶性增殖还是T细胞恶性增殖 ▪ 区分同一患者两种淋巴细胞恶性肿瘤,包括复发与继发淋巴瘤 ▪ 微小残留病灶监测,评估治疗效果或复发风险(NGS方法) ▪ 细胞免疫治疗监测,监测回输T细胞增殖状况和淋巴组织来源肿
瘤细胞清除效果(NGS)
淋巴瘤基因克隆性重排和 IGHV体细胞超突变检测
血液肿瘤(常规肿瘤)检测方案-
MICM综合分子检测(旌准方案)
形态学
(Morphology)
分子生物学
(Molecular) • 聚丙烯酰胺凝胶电泳 (PAGE) • 毛细管凝胶电泳(CE) • 荧光实时定量 PCR(RTQT-PCR) • 一代测序(Sanger) • 二代测序(NGS)
胞
B-Cell Receptors (BCR) /Immunoglobulins (Ig) T-Cell Receptor (TCR)
蛋白
Ig重链 Ig轻链 Ig轻链
基因
IGH IGK IGL
染色体定 位
14q32 2p12 22q11
蛋白
TCRα TCRβ TCRγ TCRδ
基因 染色体定 位
TRA 14q11
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准”
5
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淋巴细胞克隆性基因重排检测的目标分子
Ig和TCR--单一基因重排,即恶性淋巴细
TRB
7q32
TRG
7p15
TRD 14q11.2
多样性与克隆性
正常淋巴细胞成熟过程/良性多病克变隆性
多种形式的基因重排
恶性淋巴瘤发生的过程 单克隆性 突出单一形式的基因重排
IGH, TRB & TRD: V,
D, and J
淋巴细胞克隆性基因重排检测的临床意义
5%~15%的病例表现复杂,即使做了大量的免疫标志也可能 难以鉴别其良恶性,需要进一步的手段区分。 利用▪分子鉴别生诊物断学:手明段确是分淋析巴Ig组和织T反C应R性基还因是的淋克巴隆细胞性恶重性排增被殖WHO 公认为该疾病诊断手段的重要补充。
Biomed-2研究项目(IGH为例)
van Dongen, J. J. M., et al. (2003). Leukemia 17: 2257.
Biomed-2研究项目(IGH为例)
van Dongen, J. J. M., et al. (2003). Leukemia 17: 2257.
分子检测
检测基 因
方法
IG/TCR 基因重排
Байду номын сангаас
IGH, IGK, IGL, TRB, TRD, TRG
• GEL (PAGE)
• ABI (CE) • NGS
IGHV超 突变
• GEL
IGH
(PAGE) • ABI (CE)
• NGS
EZH2,
基因突变
DNMT3 A,
• •
Sanger NGS
IDH2…
IGH V区体细胞超突变检测的临床意义
对以下疾病提供重要预 后信息: 慢性淋巴细胞白血病 (CLL)
前提:
SHM 判
断IG标H准V突:变
比例
<2%
≥ 2%
▪ 无扩增产物:PCR扩增后电泳未见产物 送ma检rke组rP 织M中H2的O S细1 胞S1 ,S2抗S原2 受体基因无重排(NK,非淋巴细胞)或DNA质量
500过bp差- 。
400bp-
300bp250bp-
200bp175bp-
150bp-
IGH B(250-295bp)
Products are heterodulex-treated followed by PAGE on 6% gel
血液 肿瘤
免疫学
(Immunology) • 免疫组化(IHC) • 流式细胞术(FCM)
细胞遗传学
(Cytogenetics) • 荧光原位杂交(FISH)
辅助诊断 预后分析 指导用药 MRD检测
分子检测-淋巴瘤
Moffitt, A. B. and S. S. Dave (2017). J Clin Oncol 35(9): 955-962.
(IGH, IGK,)量和(得I到G序L列)。
(TRB ,TRD,)( TRG)
BIOMED-2方案,唯一授权)
新兴技术,更高灵敏度 (10-6),更高分辨率, 更高的通量,更广泛的应 用。但成本高,仪器贵, 操作复杂,时间长。
IGH, IGK, TRB , TRG IGHV
从Biomed-2到Invivoscribe-唯一授权
结果分析
▪ (单)克隆性:扩增产物电泳在预期大小范围内一或双条带(峰) 送检组织中,淋巴细胞抗原受体基因的重排方式为单一性。表明组织中存在 单克隆性增生的细胞群。
▪ 多克隆性:扩增产物电泳呈弥散涂抹状(smear)或阶梯状(高斯分布)
送检组织中,淋巴细胞抗原受体基因的重排方式为多样性。表明组织中不存 在单克隆性增生的细胞群。