中国首个NGS在临床肿瘤学实践中的大规模调研报告

中国首个NGS在临床肿瘤学实践中的大规模调研报告

2018年《JCO Precision Oncology》发表了一项具有美国NGS 代表性的肿瘤医生调研报告：75.6% 的美国肿瘤医生都在用NGS 基因检测技术指导肿瘤治疗！1

2019年9月19日，CSCO燃石卫星会上报告了一项具有中国NGS代表性的肿瘤医生调研报告：95.4%的中国肿瘤医生愿意在未来推荐更多患者选择NGS检测，同时，在不考虑经济因素的情况下，46.5%的医生会推荐NGS大panel，大panel 的NGS已经逐渐成为临床选择趋势！2

▲中国NGS在临床肿瘤学实践中的调研报告

二代测序（NGS）又称大规模平行测序，能够同时对上百万甚至数十亿个DNA分子进行测序，实现了大规模、高通量测序的目标，是继Sanger 测序之后的革命性进步。近年来，NGS技术发展迅速，其应用已进展至临床肿瘤检测，尤其在中国的普及发展，由于没有受到监管的控制，NGS的普及应用程度可能比国外更高。

中国肿瘤NGS临床普及应用程度有多高？没人统计过，基于此背景，CSCO肿瘤生物标志物委员会携手燃石医学共同发起和完成了具有中国NGS代表性的肿瘤医生调研报告。（ppt内容来自2019年CSCO 燃石卫星会，旨在进行学习交流，侵删！）

✦调研方式：线上调研。

✦调研对象：30个省市的临床肿瘤医生（三甲医院，主治及以上为主）。

✦调研数量：1020名（980名曾推荐患者进行NGS检测的医生+ 40名未曾推荐患者进行NGS检测的医生）。

✦调研医生背景：看诊癌种与中国癌症流行数据一致（Globocan2018）。

中国首个NGS在临床肿瘤学实践中的大规模调研报告将分为以下

三个部分进行介绍：

① NGS临床应用习惯；② 不同癌种Biomarker 认知程度；③ NGS检测规范化情况。

① NGS临床应用习惯：

✦ NGS使用频率：>30%肿瘤医生每个月NGS检测处方量超过5个；表明NGS检测已成为中国肿瘤临床医生的常规检测工具！✦ NGS 检测主要目的：临床指导用药！（国内临床NGS检测主要目的：1. 临床指导用药；2. 复发监控、疗效评估；3. 跨适应症用药vs 美国临床NGS检测主要目的：1. 临床指导用药；2. 复发监控、疗效评估；3. 跨适应症用药）✦NGS使用目的与各癌种目前诊治现状高度相关：辅助诊断和用药：肺癌，结直肠癌，乳腺癌等；复发监控疗效评估：子宫内膜癌，淋巴瘤，肝癌等；跨适应症用药：淋巴瘤，乳腺癌，胃癌/食管癌等；临床入组：尿路上皮癌，卵巢癌，肝癌等。✦遗传筛查关注度最高癌种：卵巢癌（54%）> 子宫内膜癌（38%）=乳腺癌（38%）> 结直肠癌（37%）等。✦ NGS应用场景：以一线治疗为主导，NGS检测在临床诊疗的各阶段都有应用；晚期一线治疗（胰腺癌，淋巴瘤，肺癌等）> 术后辅助治疗（子宫内膜癌，肝癌，结直肠癌等）> 晚期后线治疗（胰腺癌，卵巢癌，淋巴瘤等） > 新辅助治疗（尿路上皮癌，前列腺癌，胃癌/乳腺癌等）。✦NGS主要参数关注顺序：肿瘤医生在具体推荐检测panel 时，基因数目是临床考虑的主要参数。基因数目 > 变异类型是否覆盖 > 测序深度 >最低检测限。目前，超过半数临床医生开始关注NGS的具体质控参数。在不考虑经济因素的情况下，46.5%的医生会推荐大panel，大panel的NGS已经逐渐成为临床选择趋势！

② 不同癌种 Biomarker 认知程度：

✦肺癌Biomarker：EGFR、ALK、ROS1、KRAS、PD-L1等。

62.8%的医生同时关注EGFR、ALK、ROS1这三个基因；免疫治疗在肺癌中受到认可，>50%医生关注PD-L1的表达；单次检测已经无法满足肺癌的临床需求，多基因平行检测是肺癌的刚需。✦结直肠癌Biomarker：KRAS/NRAS、BRAF、MSI等。✦胃癌/食管癌/EGJ

癌 Biomarker：MSI，PD-L1，TMB，HER2等。✦乳腺癌 Biomarker：HER2，BRCA1/2，CDK4/6等。✦全癌种免疫Biomarker：绝大多数医生重视免疫治疗，最为关注PD-L1的检出，此外，67.5%医生同时关注PD-L1和TMB。

③ NGS检测规范化情况：

✦选择检测平台时，精准检测、生信解读、质控成为临床医生最重要考量因素。

✦规范化检测背书：国际认证、NMPA审批；75.4%的医生认为，拥有国际质量管理体系证书代表NGS检测规范化！

✦ 23.27%临床专家对NGS实验室认证体系完全不了解。

✦月均>10个患者进行NGS检测的医生中，30.36%从未收到过送检样本不合格/样本质量警示提醒。燃石内部数据显示样本质检不达标比例在0.5~5%。

✦ 58.47%的医生常规推荐1-2家检测公司，41.53%的医生常规推荐≥3家检测公司。推荐比较多的检测公司有燃石医学，艾德生物，华大基因，世和基因，思路迪等。

✦中国NGS临床应用主要限制因素：价格高、是否有临床价值、缺少接触渠道。价格高在美国也是主要限制因素。

✦超过 95% 医生愿意在未来推荐更多患者选择NGS检测！

重点总结：✦在推荐患者进行NGS检测的医生中，超过 30% 临床医生每月NGS检测大于5个，NGS已经成为肿瘤临床肿瘤医生常用检测工具；✦不同医生对NGS检测目的、临床应用场景略有不同，但均与各癌种目前诊治现状高度匹配；✦基因数目是临床选择NGS考虑的主要参数，在不考虑经济条件下，超过300基因的大panel成为临床选择趋势；✦免疫Biomarker如 PD-L1，TMB已经成为常用靶点之后临床最为关注的分子标志物；✦ 23% 的临床医生对NGS实验室认证体系完全不了解，超过 30% 常用NGS的临床医生从未收到不合格/警戒提示，90% 医生临床医生NGS报告需要解读，说明国内NGS检测的规范化及教育仍任重道远。