医学索引(Index_Medicus(IM)、MEDLINE、PubMed).
国内外常用数据库介绍-meiguo
国内外常用数据库介绍-meiguoPubMedPubMed是互联网上最著名的免费Medline数据库,由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)提供,网址为:。
该系统于1997年开始使用,与以往的Medline光盘数据库相比,收录范围广、更新速度快、界面友好。
PubMed的数据主要有4个部分: Medline:与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同,但数据更新速度较快。
OLDMEDLINE:收录了1950-1965年间的美国医学索引(IM)中的题录。
In Process Citations:临时性的数据库,收录准备进行标引的题录和文摘信息,每天都在接受新的数据,进行文献的标引和加工,每周把加工好的数据加入到Medline中,同时从In Process Citations 库中删除。
InProcess Citations中的记录标有[PubMed- in process]的标记。
Record supplied by publisher:出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后,每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记,这些记录每天都在不停地向In Process Citations 库中传送,加入到InProcess Citations后,原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。
由于被Medline收录的有些期刊所涉及学科范围较广,有些文献已超出了Medline的收录范围(如地壳运动、火山爆发等),从而不能进入Medline,但仍然存在于PubMed 中,其标记为[PubMed]。
10、MEDLINEMEDLINE是美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine,NLM)开发的当今世界上最具权威性的文摘类医学文献数据库之一。
医学索引的名词解释
医学索引的名词解释引言医学索引是医学领域中一种重要的工具,它可以帮助医务人员和研究者在海量医学文献中快速地找到所需信息。
本文将对医学索引进行全面的解释,包括其定义、分类、应用以及一些常见的医学索引类型。
一、医学索引的定义医学索引是指将医学文献的关键词、主题和其他有关信息进行系统整理和编制的工具。
它通过建立索引词表、主题分类和关键词检索等方式,使用户能够快速定位到所需的医学文献资源。
医学索引的主要目的是提高医学研究和临床实践的效率,促进医学知识的传播和应用。
二、医学索引的分类1. 主题索引主题索引是按照医学文献的主题内容进行编制的索引工具。
它将文献按照不同的主题和子主题进行分类,并为每个主题分配一个索引词,以便用户能够根据需要检索相关信息。
主题索引常用的分类标准有医学分类编码和词表法等。
2. 作者索引作者索引是按照医学文献的作者姓名进行编制的索引工具。
它按照作者的姓氏字母顺序排列,为每位作者编制一个索引词,用户可通过作者索引快速查找到某位作者所发表的相关文献。
3. 文献类型索引文献类型索引是按照医学文献的类型进行编制的索引工具。
它根据文献的形式和用途将文献分为不同的类型,如原始研究、综述、案例报告等,并为每种类型编制相应的索引词,便于用户按照文献类型检索所需信息。
三、医学索引的应用1. 文献检索医学索引的主要应用之一是帮助用户进行文献检索。
用户可以根据自己的研究或临床需求,在医学索引中输入关键词或主题进行检索,从而找到相关的医学文献资源。
在文献检索过程中,医学索引可以起到筛选和导航的作用,提高用户的检索效率和准确性。
2. 学术研究医学索引为医学研究者提供了丰富的学术资源和研究成果。
研究者可以通过医学索引查找到与自己研究方向相关的文献,了解前人的研究进展和成果,为自己的研究提供理论支持和参考。
此外,医学索引还可以帮助研究者发现新的研究课题和创新点,促进学术交流和合作。
3. 临床决策医学索引对于临床医务人员来说也是一种宝贵的工具。
美国《医学索引》收录中国期刊名单
美国《医学索引》收录中国期刊名单
《医学索引》(Index Medicus, IM)由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)编辑出版。
NLM的宗旨是搜集覆盖全世界多种语言的医学刊物,为美国和世界的读者服务。
《医学索引》创刊于1879年,其刊名、编辑形式及出版机构,几经变更,至1960年才定型为Index Medicus。
根据美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)发布的“2010年版《医学索引》收录期刊名单”,Medline/PubMed现收录中国期刊共111种。
其中大陆编辑或出版的期刊93种,台湾省13种,香港4种,澳门1种。
2009和2010年PubMed新收录中国期刊3种。
它们是:2009年10月通过评审的《中国计划免疫》(1995年创刊,中国预防医学科学院和卫生部疾病控制司联合主办),2010年2月通过评审的《动物学研究》(1980年创刊,中国科学院昆明动物研究所主办)和Virologica Sinica(原《中国病毒学》,2007年改为英文版,中国科学院武汉病毒研究所和中国微生物学会共同主办)。
见下表:
(本文摘自:周庆辉,朱诚的《美国国立医学图书馆Medline/PubMed 2010年收录中国期刊名单》)
医学图书馆
2010 08 02。
美国医学索引
如:肌骨骼畸形(类目词)、身体部位(类目词)等等
(3)款目词:也称入口词,其作用是将自由词引见到主题词。如:
弓形足 见 足畸形
lung cancer see lung neoplasms
IM收录世界上70多个国家和地区、40多个语种的近4000种生物医学及其相关学科期刊,内容涉及生物医学的各个领域,其中70%为英文文献,文献类型包括期刊论文、编者述评、综述、会议论文、著名人物传记及讣告等。
特点:收录文献范围广泛,报道文献信息量大,能适时反映生物医学学科领域的发展动态。
编辑文献的力量强大,文献标引的质量较高。NLM聘请了著名医学专家、医学编辑及医学图书馆学专家,对IM的编辑工作进行指导,收录有价值的文献,编制医学主题词表等以保证质量的绝对优势。
20世纪80年代, Medline光盘数据库问世,国内曾主要购买的是银盘公司的Medline on CD。20世纪90年代, Medline纳入许多基于因特网的信息检索中,如PubMed、NLM Gateway、OVID、Dialog、ISI Web of Knowledge EBSCO 等。
(牙科文献索引)
International Nursing Index
(国际护理索引)
Medline的由来最早可追溯到1879年NLM出版的医学文献检索刊物Index Medicus(IM)。为了实现IM的自动化编辑,1964年NLM开发了MEDLARS(Medical Literature Analysis and Retrieval System,医学文献分析与检索系统),1971年正式建成并投入联机检索服务。自此Medline一直成为MEDLARS40余个数据库种数据量最大、使用频率最高的数据库。
美国《医学索引》
特点:收录文献范围广泛,报道文献信息量大,能适时反映生物医学学科领域的发展动态。
编辑文献的力量强大,文献标引的质量较高。NLM聘请了著名医学专家、医学编辑及医学图书馆学专家,对IM的编辑工作进行指导,收录有价值的文献,编制医学主题词表等以保证质量的绝对优势。
20世纪80年代,Medline光盘数据库问世,国内曾主要购买的是银盘公司的Medline on CD。20世纪90年代,Medline纳入许多基于因特网的信息检索中,如PubMed、NLM Gateway、OVID、Dialog、ISI Web of Knowledge EBSCO等。
4.PubMed数据库
Medline收录内容对应于以下3种印刷型检索工具:
Index Medicus
(医学索引)
Index to Dental Literature
(牙科文献索引)
International Nursing Index
(国际护理索引)
Medline的由来最早可追溯到1879年NLM出版的医学文献检索刊物Index Medicus(IM)。为了实现IM的自动化编辑,1964年NLM开发了MEDLARS(Medical Literature Analysis and Retrieval System,医学文献分析与检索系统),1971年正式建成并投入联机检索服务。自此Medline一直成为MEDLARS40余个数据库种数据量最大、使用频率最高的数据库。
5.练习题
利用PubMed检索下列课题的文献:
美国医学索引
来回溯检索。(注意累积索引的使用)
(三)引用期刊目录
(LIST OF JOURNALS INDEXED)
该目录汇集了IM引用的全部期刊名称, 其主要作用是查找原始文献的期刊刊名全称 和标著期刊刊名缩写。
CONTENTS
Introduction Journal Actions during 2002
3、医学综述题录
(Bibliography of Medical Reviews)
● 医学综述题录是用来从主题概念检索 综述型文献的一种主题索引。
●该目录的编排与使用方法同主题部分相同. ● 它只收录综述型(Review)或评论Cumulated Index Medicus, CIM)
(Wurtz RH) Hikosaka o.Probing consciousness
with anelectrode. Brain Res Bull 1999; 50 (5-6):
337-338.
被传记人
练习题一:
● 查找Maria Acosta Ana发表的文章,该著者在
著者索引中正确编排是——。
Gre
希腊语
● 期索引正文部分 1、主题部分(Subject Section)
主题部分是以主题词作为检索标目, 按其字顺编排的用来从主题概念检索文献 的一种主题索引。
主题部分由主题词、副主题词和文献 题录三个层次组成。
COLONIC DISEASES
SURGERY
Laparoscopic colon and rectal surgery. Talac R, et al. Surg Oncol clin N Am 2000 Jan; 9(1):1-12. (65 ref.)
美国《医学索引》.
Index Medicus (IM)
一、概论 二、编排结构与著录格式 三、医学主题词表 四、引用期刊一览表 五、检索举例
一、概况
1、刊名全称:Index Medicus(IM)
2、创刊年:1879年 3、编辑出版单位:美国国立医学图书馆
(National Library of Medicine NLM)
所以MeSH既有主题法的专指性、灵活性、直接性, 又有主题法的系统性和稳定性。 (3)使用二表注意事项:1.1 选择恰当的主题词。
1.2 一般先用字顺表找主题词,再按主题词后面的树状结 构号在树状结构表中的上下位主题词中选准主题词,确定 主题词后,在字顺表里通过各种注释确定哪一年该用什么 词。
问题:
(原语种名称缩写)
LIVER
The selection family is responsible for
microcirculatory disturbances after cold ischemia and
reperfusion of the liver[Editorial].Hamamoto I,et
al.Tห้องสมุดไป่ตู้ansplant Proc 1996 Feb;28(1):68-69
BLOOD SUPPLY [Vascular exclusion of the liver]Frangov T,et al. Khirurgiia 1995;48(4):41-5(61ref.) (Eng.Abstr.)
(Pol)
现医学科学的发展和进步;也体现了主题词的动态性。
(2)字顺表:是17600个主题词和82个副主题词按英文字 顺排列。它是医学主题词表的主表,相当于一部词典。它 有其 著录格式和特有的三个特点,可提供较好的检索方
PubMed数据库检索系统
Author address [AD] Author [AU] Language [LA] Journal Title [TA] EC/RN Number [RN] MeSH Major Topic [MAJR] MeSH Subheadings [SH] MeSH Terms [MH] PubMed检索方式 [PT] Text Words Publication Type [TW] Title [TI] Title/Abstract PubMed主要提供以下几种检索方式:[TIAB]
(五)引文匹配
提供通过已知的文献线索,查询特定文献的 摘要、作者、文献题目等信息。包括单篇引文匹配 和成匹引文匹配两个界面。
检索Tang BK在《Biochemical Pharmacology》 杂志第29卷第14期上发表的文章 。 要求: 用单篇引文匹配检索。
2 . 限定检索(Limits)
可以进行各种字段限定及其它的限定检索。以进一步 缩小检索范围。 包括:作者限定;期刊限定;文献发表时间;文献研 究对象、性别年龄划分;文献语种;数据库子段;文献类 型以及拟检索字段限定等。
进 行 限 制 后 只 能 检 索 medline 中 的 内 容 , “ in
PubMed接入
网址: /pubmed
/pubmed
1. 简单检索( Go)
在此可以进行任意词语的检索。如自由词、人名
、主题词、期刊名称等,系统会进行自动转换和匹配 ,并显示检索结果。 简单检索界面允许实现检索词的逻辑组配、截词 (*) 、字段限定和短语等检索,但逻辑组配需用大写( AND;OR;NOT)。
process” and “supplied by publisher”因还没有进 行字段制作,不能检索到。
美国《医学索引》的使用方法及检索技巧
美国《医学索引》的使用方法及检索技巧美国《医学索引》( Index Medicus, 简称 IM ) , 由美国国立医学图书馆( National Library of Medicine )编辑出版。
一、概况收录文献范围广,报道速度快,检索方便,用于检索世界各国报道的生物医学文献信息。
收录73 个国家和地区,41 种文字,3419 种刊物(其中收录中国期刊 59 种,包括大陆 49 种,香港 1 种,台湾 9 种)的文献,年报道医学及相关文献题录 30 余万条。
每年出版有期索引 Index Medicus, 医学主题词表( Medical Subject Headings, 简称 MeSH ),索及期刊一览表( Listof Journals Indexed ) , 累积索引( CumulatedIndex Medicus, 简称 CIM )。
期索引 Index Medicus: IM 的期索引是月刊,每期两册包括:subject section 主题索引,author section 著者索引,bibliography of medical reviews 述评题录索引。
二、主题索引(subject section): 主题索引按主题词英文字顺排列,大部分主题词下列有能与该主题词组配的副主题词,副主题词亦按英文字顺排列,有关文献题录排列其后。
利用主题索引查文献,只要利用主题索引查文献,只要选准了课题的主题词、副主题词,象查字典一样,在主题索引中查出主题词、副主题词,即可获得所需文献题录。
主题索引编排结构示例:英文文献题录著录格式Ten-year trends in hospital care for confestice heart failure:improved outcomes and increased use of resources ① .Polanczyk CA, et al ② .Arch Intern Med ③ 2000 Feb 14 ④ ; 160(3):325-32 ⑤注:①论文标题;②著者:一篇文章有多个著者时,只标出第一著者,其余用“et al ” 表示;③刊名;④出版年、月、日;⑤卷(期),起止页码。
PubMed外文数据库检索
大部分为英语语种的文献,其中我国大陆期刊80多
种。
二、MedLine数据库使用形式
MedLine CD-ROM 由出版商将数据库制成了光盘,然后邮寄给用户 。 不同出版商的数据库检索界面略有不同,我国主要 引进Ovid(原Silver Platter)公司产品。检索界面与 CBMdisc类似。
PubMed的主体部分,记录末尾标有[PubMed-indexed for MedLine]。 (2)PreMedline
临时性的医学数据库,收录最新出版的文献,缩短文献报 道时差。PreMedline中的记录每天有进有出,新进的记录标有 [PubMed-in process],标引好主题词和文献类型等字段的记录 转入Medline。
检索区 主要功能区 辅助功能区
二、PubMed主页简介
1.检索区 位于主页上方,通过点击数据库栏列表中PubMed旁
边的下拉菜单,根据实际检索需要可以更改数据库(主 要用来检索的数据库有:all database、PubMed、 Protein、Nucleotide、GSS、EST、Structure、Genome 等),高级检索(Advanced ),点击Help可查看检索帮 助,在检索式输入框中输入检索式,点击“Search”按 钮,可执行检索操作。
PMID(PubMed Unique Identifier)号,用PMID号可快 速检索到该ID号对应的文献。
提纲
一.PubMed概述 二.PubMed主页简介 三.PubMed检索规则 四.PubMed的检索途径和方法 五.PubMed的检索结果处理
二、PubMed主页简介
PubMed主页面分为3部分 1. 检索区 2. 主要功能区 3. 辅助功能区
MEDLINE与PubMed的区别
MEDLINE与PubMed的区别MEDLINE是一个数据库,是美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine,NLM)生产的国际性综合生物医学信息书目数据库,是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。
内容包括美国《医学索引》(Index Medicus,IM)的全部内容和《牙科文献索引》(Index to Dental Literature)、《国际护理索引》(International Nursing Index)的部分内容,涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。
MEDLINE收录1966年以来世界70多个国家和地区出版的3400余种生物医学期刊的文献,近960万条记录。
目前每年递增30-35万条记录,以题录和文摘形式进行报道,其中75%是英文文献,70%-80%文献有英文文摘。
PubMed是一个免费的搜索引擎,是NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统(/pubmed/),提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。
它的数据库来源有:MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等,数据类型:期刊论文、综述以及与其他数据库链接。
其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科。
它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的支援,像是生化学与细胞生物学。
PubMed的资讯并不包括期刊论文的全文,但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的连结。
有人认为,PubMed和MEDLINE联机数据库只不过是同一内容的两种不同版本。
但是,当我们用这两个版本对同一个课题进行检索时,就会发现其结果明显不同。
主要表现在以下几点:(1)文献的收录范围 MEDLINE是PubMed系统的最大组成部分。
美国《医学索引》、Medline数据库
(4)副主题词:对文献主题起限定作用,构成主题 的一些通用性概念,本身无独立检索意义。 在MeSH中提供了83个副主题词,按英文字顺排序, 同时给予每个词词义解释,还限定每个副主题词允 许组配的主题词范畴,即在其后的括号内标示该词 可以组配的主题词类号。如: Diagnosis 诊断(C1-23, F3)DI
Medline收录内容对应于以下3 Medline收录内容对应于以下3种印刷 型检索工具: Index Medicus (医学索引) 医学索引) Index to Dental Literature (牙科文献索引) 牙科文献索引) International Nursing Index (国际护理索引) 国际护理索引)
3.Medline数据库 Medline数据库
Medline由美国国立医学图书馆创建和维护, Medline由美国国立医学图书馆创建和维护, 是世界上权威性的生物医学书目数据库。它收录了 80多个国家和地区的5000多种期刊,累积了1950年 80多个国家和地区的5000多种期刊,累积了1950年 至今的1600多万篇文献,年收录文献约40 至今的1600多万篇文献,年收录文献约40万篇, 1600 40万篇, 90%为英文文献,约79%含文摘。 90%为英文文献,约79%含文摘。 Medline的内容涉及基础医学、临床医学、药理 Medline的内容涉及基础医学、临床医学、药理 学、预防医学、护理学、口腔医学、兽医学、生物 学、环境科学和情报科学等。
20世纪80年代, Medline光盘数据库 20世纪80年代, Medline光盘数据库 问世,国内曾主要购买的是银盘公司 的Medline on CD。20世纪90年代, CD。20世纪90年代, Medline纳入许多基于因特网的信息检 Medline纳入许多基于因特网的信息检 索中,如PubMed、 索中,如PubMed、NLM Gateway、 Gateway、 OVID、Dialog、 OVID、Dialog、ISI Web of Knowledge EBSCO 等。
医学数据库介绍
WinSPIRS
WinSPIRS
WinSPIRS
WinSPIRS
WinSPIRS
WinSPIRS检索操作
陈小忠 Chen Xiaozhong 广东省人民医院图书馆
Searches
在Searches状态下,直接在检索框内输入 检索词或检索式,然后点击右边的Search 按钮(或按Enter键)。屏幕中间部分为检索 历史区,显示输入的检索式和检出记录 数。 屏幕下方为检索结果显示区。 检索框内输入的检索词可以是单词或词组, 也可以是含有运算符的检索式。用主题词 加副主题词检索的格式是: stomach neoplasms/diagnosis 或者 stomach-neoplasms-diagnosis
概况
数据类型(状态)
Publisher Supplied Ctitations:出版商提供的文 献数据,周二~周六每天均有新数据加入,标 识[PubMed - as supplied by publisher] In Process Citations:正在处理的文献数据,周 二~周六每天将处理完毕的数据向MEDLINE 提供一次更新,标识[PubMed - in process]
MeSH词表的字顺表(alphabetic list)
MeSH 词表中约有十分之一的主题词与 自然词序相反,称为倒置主题词。例如 “ Hepatitis,A1coholic”( 肝炎,乙醇性 ) , “ Leukemia,Lymphocytic,Chronic”( 白 血病,淋巴细胞,慢性 )。倒置主题词中, 核心词在前,修饰词在后,用逗号表示倒 置。主题词倒置的优点是:突出核心词; 含有相同核心词的主题词在字顺表或索引 中按字母顺序集中排在一起,方便选词。
医学索引(Index_Medicus(IM)、MEDLINE、PubMed
研究院)
9
Entrez
Entrez是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)主持的一个 数据库检索系统,它包括PubMed, Nucleotide and Protein Sequences, Protein Structures, Complete Genomes, Taxonomy, 等数据库。
7
PUBMED
由美国国立医学图书馆(NLM)所属国家生物技术信息中 心(NCBI) 建立。
PUBMED是NCBI’s Entrez retrieval system众多数据库之 一。
PUBMED目前收录的文献记录超过1900多万篇。 PUBMED提供全文链接。
8
PUBMED
(是NCBI的Entrez系统中的数据库之一) 检索入口:
Out-of-scope articles from selectively indexed MEDLINE journals 记录标注为:[PubMed]
Articles from issues of journals published prior to selection for MEDLINE indexing
记录标注为:[PubMed - as supplied by publisher]
11
PUBMED收录范围(2)
In Process Citations:没有完成MeSH标引、加入到MEDLINE 之前的数据,是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不 断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其 文献条目在标引和加工后向MEDLINE移交(周二到周六)。
6
MEDLINE
pubmed使用介绍
2000年
02
01
03
04
05
PubMed的起源和发展
A
B
C
D
PubMed的特点和优势
权威性
收录内容主要来源于权威的医学学术期刊和会议论文集,具有很高的学术价值和可信度。
更新及时
收录的文献内容实时更新,能够反映全球生物医学领域的最新研究成果。
检索功能强大
提供多种检索方式,方便用户快速找到所需内容。
关键词筛选
文章类型筛选
发表时间筛选
根据文章类型,如期刊论文、综述、病例报告等进行筛选。
选择特定时间范围内的文章,如近五年、近十年等。
03
02
01
检索结果筛选
检索结果数量
显示符合条件的文章总数。
学科分布
统计各学科领域符合条件的文章数量,便于了解相关领域的研究热点和发展趋势。
高频关键词
分析检索关键词中出现频率较高的词汇,有助于了解相关领域的研究重点和热点话题。
跨学科研究的支持
THANKS FOR
感谢您的观看
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个性化服务的进一步发展
跨学科研究热点分析
利用人工智能技术对多学科领域的文献数据进行热点分析和趋势预测,帮助用户了解跨学科研究的前沿和动态。
跨学科合作平台
构建跨学科的合作平台,促进不同学科领域的研究者之间的交流与合作,推动跨学科研究的创新和发展。
跨学科主题词系统
建立和完善跨学科的主题词系统,方便用户检索和获取不同学科领域的文献资源。
与Scopus的整合
用户可以在PubMed搜索框中输入关键词,然后点击"在Scopus中搜索"选项,直接跳转到Scopus数据库进行相关文献的搜索。
医学信息检索
2 树状结构表 : 树状结构表将字顺表中的主题 词按照每个词的词义范畴和学科属性,分别归入15 个大类之中,多数大类又进一步细分多达9 级。每 一级类目用一组号码标明,级与级之间用“.”号隔 开。主题词上、下级之间采用逐级缩进格式表现主 题之间的隶属关系,每个主题词都有一个或两个以 上的树状结构号,该号是联系字顺表和树状结构表 的纽带。现摘录范畴表片段如下:
该刊历史悠久,收集文献种类多,报道速度快, 内容全面,检索方法简便,是当今国际上公认的最 重要的医学情报检索工具之一。 《医学索引》有月刊和年刊两种。月刊每年12期, 合为一卷。另有《医学主题词表》和《医学索引索 及期刊一览表》。
二、 编排与著录
《医学索引》月刊和年刊的正文部分均包括三 个部分: 主题部分 著者部分 综述文献部分 正文部分的条目按主题词或著者姓名的字顺编 排。
1997 年 6 月,美国国立医学图书馆在美国国家 生物技术信息中心( NCBI )的主页上推出免费的 Medline数据库,通过Internet向全世界开放。
PubMed: /PubMed/
PubMed是由NLM的国家生物技术信息中心开发的 一个实验系统,主要用来检索国家生物技术信息中 心尚未出版或正在出版的文章。链接众多出版商的 因特网网址可得到文献的全文。在这个主页上,除 了可以检索Medline和Premedline两个数据库外, 还可查到一些分子生物学方面的数据库。
如果输入的是多个词,系统未能在上述四个表 中找到与之一致的词组形式,会自动将每个词用 “AND”联结起来进行检索。例如,输入提问式taxol lung cancer,系统转换为以下检索式: (((“paclitaxel”[MeSH Terms] OR taxol[Text Word]) AND (“lung neoplasms”[MeSH Terms] OR lung cancer[Text Word])) AND notpubref[sb])。
PubMed
年龄段、性别、文本选择(有无摘要/全文)等。
研究对象:人类或动物(Humans
or Animals)
出版物类型包括:临床试验、评论、信件、Meta分析、实践指南、随机
对照实验、综述。
全文链接(Full
Text 或 Free Full Text)、有摘要(Abstracts)。
检索举例
姚开泰院士1985-2010年发表的鼻咽癌
PubMed检索特点
检索布尔逻辑运算符AND、NOT、OR必须大写。
(vitamin c OR zinc) AND common cold
支持截词检索(*),但对词组无效。
如bacter*, 可以检出以bacter为词干的单 词bacteria、bacterium等最多600个单词。 截词检索时,系统的自动词语匹配功能和 MeSH自动扩展功能将不再被执行,如: heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction。
内容,涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫
生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、
社会医学等等领域。
收录80多个国家5400多种生物医学期刊的题录与文
摘,是世界上最权威的生物医学数据库。
现有1865年以来的2000万篇文献记录。
每年增加60余万条文献记录。
90%的文献为英文;70%以上的文献有摘要;
提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接,如
Nucleotide、Protein、Genome、OMIM、Structure、
Taxonomy等。
提供美国国立医学图书馆多种资源的链接
提供相关文献(RELATED ARTICLES)的链接
pubmed检索方法
Single Citation Matcher
输入已知条件
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
(八)临床查询
1. Clinical Study Categories 2. Systematic Review 3. Medical Genetics
Clinical Queries
Journal
第二节 Pubmed与NCBI
二、Pubmed检索系统
(七)单篇引文匹配器
输入题录信息,查找特定文献进行补缺。 刊名要准确,缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 如:已知:第一著者是Challis DE,出处是Pediatric Research; 2000,47(3):309-15,要求写出其他合著者
第三章 外文信息资源检索-PUBMED
南京医科大学图书馆
第一节 美国医学索引与Medline
一、美国医学索引(Index Medicus, IM)
(一)美国医学索引概况
收录范围:世界上著名大型医学文献题录型检索期刊 2. 文献类型:论文、社论、通信、综述等 3. Index Medicus特色
Institute of Health):美国国立卫生研究
院 NLM(Natioanl Library of Medicine):美国国立医学图 书馆 NCBI(National Center for Biotechnology Information, 美国生物技术信息中心) Entrez
1.
(1) 字顺表 (2) 树状结构表 (3) 副主题词表 (4) 收编期刊目录
MEDLINE,EMBASE,PubMed,PMC,OVID的区别和联系
MEDLINE,EMBASE,PubMed,PMC,OVID的区别和联系MEDLINEMEDLINE是一个数据库,是美国国立医学图书馆(The National Library of Medicine,NLM)生产的国际性综合生物医学信息书目数据库,是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。
内容包括美国「医学索引」(Index Medicus,IM)的全部内容和「牙科文献索引」(Index to Dental Literature)、「国际护理索引」(International Nursing Index)的部分内容,涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。
MEDLINE收录1966年以来世界70多个国家和地区出版的3400余种生物医学期刊的文献,近960万条记录。
目前每年递增30-35万条记录,以题录和文摘形式进行报道,其中75%是英文文献,70%-80%文献有英文文摘。
EMBASEEMBASE数据库全称Excerpta Medica Database,由荷兰爱思唯尔(Elsevier)公司出版,是印刷型检索工具Excerpta Medica(荷兰《医学文摘》)的电子版,也是最重要的生命科学文献书目型数据库之一。
(如果没有购买的话,会直接跳到了/online-tools/embase)是EMBASE与MEDLINE强强联合而成的生物医学与药理学信息专业检索引擎。
将1974年以来的EMBASE生物医学记录与1966年以来的MEDLINE记录相结合,囊括了70多个国家/地区出版的7000多种期刊,覆盖各种疾病和药物信息,尤其涵盖了大量欧洲和亚洲医学刊物,是其它同类型数据库所无法匹敌的,从而真正满足生物医学领域的用户对信息全面性的需求。
内容涵盖了整个临床医学和生命科学的广泛范围。
事实与特征来自70个国家的7000多种期刊1800多万条EMBASE和MEDLINE文献记录(无重复),80%的记录有文摘。
PubMed使用指南
同义词
如2型糖尿病 non insulin dependent diabetes mellitus NIDDM Type 2 Diabetes (Mellitus ) Adult-Onset Diabetes Mellitus Maturity-Onset Diabetes Mellitus Stable Diabetes Mellitus Slow-Onset Diabetes Mellitus Ketosis resistant diabetes
- PreMEDLINE [PubMed-in process]:已被MEDLINE录用,正处于加工标引状态的文 献数据。
- [Epub ahead of print ][PubMed-as supplied by publisher]:由出版商提供的纸质版尚未 正式出版的文献,大部分最终会转入PubMed-in process,再正式转入MEDLINE, 部分不在MEDLINE收录学科范围内的数据,最终会转化为PubMed-as supplied by publisher/PubMed 状态。
功能:a 字段限定 b 时间限定 c 文献类型限定 d 语种限定 e 年龄性别限定 f 全文获取限定 g 检索子集限定 ……
案例1 作者与文献语种限定
检索2002年以来PubMed收录的葛坚教授发表的青光 眼的中文文献。 检索词: 作者:ge jian[2002年以后的作者检索可以用全称] 主题概念:glaucoma Limits:2002-2010 出版年限
①PubMed基本检索
- 支持布尔逻辑运算 AND, OR, NOT - 支持截词检索* - 支持字段检索:如liver cancer[ti] - 支持短语检索 “ ” - 自动词语匹配(字段限定、词组、截词检索时该功能失效)
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其中大约有90%的文献为英文文献,文献来源以美 国为主(47%)。目前MEDLINE的记录数已经超过了 1600多万条,覆盖了基础医学、临床医学、护理学、 牙科学、兽医学、卫生保健、营养卫生、职业卫生、 卫生管理等。数据库不提供全文,79%的文献都带 有英文文摘(1975年以前的文献无文摘)。
/Database/
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PUBMED收录范围(1)
Publisher Supplied Citations:出版商直接向PubMed提供电子记 录,记录中用[PubMed-as supplied by publisher]标记表示。大 部分记录会发展为“in-process”状态,稍后成为“indexed for MEDLINE” 状态,但是,并不是所有的记录都能被MEDLINE 收录。 出版商也可能还会提供一些期刊发行前的一些数据,这些记录会被 标记为:[Epub ahead of print]。
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MEDLARS
1964年NLM建立了MEDLARS(MEDical Literature Analysis and Retrieval System),MEDLARS是计 算机化的医学文献分析与检索系统,实现了文献加 工、检索与编制的计算机化。报道时差仅2-3个月。
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MEDLINE(Medical Literature Analysis and Retrieval System Online)
记录标注为:[PubMed - in process]
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PUBMED收录范围(3)
MEDLINE Citations:是美国国立医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)首要的生物医学文献数据库, MEDLINE最明显的特征就是用Medical Subject Headings(MeSH)作了标引,内容涉及医学学科的各个领域。
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Index Medics(IM)
Index Medicus 60年代初收录期刊仅1800余种,80 年代增至2800余种,90年代上升至3000余种。2004 年,Index Medicus收录约3 700种期刊。收录的期 刊以生物医学为主,对非生物医学期刊(在引用刊 名字顺表中刊名前标有“S”),仅选录其中与生 物医学有关的文献。收录内容包括被收录期刊中的 各类文献,如原始论文、综述、编辑部社论、著名 人物传记、通信及具有实质内容的讣告等。其特点 是收集文献种类多,报道速度快。
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PUBMED
由美国国立医学图书馆(NLM)所属国家生物技术 信息中心(NCBI) 建立。
PUBMED是NCBI’s Entrez retrieval system众多数 据库之一。
PUBMED目前收录的文献记录超过1900多万篇。 PUBMED提供全文链接。
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PUBMED
(是NCBI的Entrez系统中的数据库之一)
MEDLINE是Index Medicus的联机检索版。MEDLINE 中增加了500种护理和口腔类刊物,由护理和口腔专 业学会负责选择。MEDLINE光盘储存了1949年到现 在全部MEDLINE数据库中的内容,其中包括三种重 要的索引:《医学索引》(Index Medicus)、《牙 科文献索引》(Index to Dental Literature)、 《国际护理索引》(International Nursing Index)。
检索入口: /sites/entrez/
National Center for Biotechnology Information, NCBI(美国国立生物技术信息中心)
National Library of Medicine, NLM(美国国立 医学图书馆)
1971年建成联机数据库MEDLINE(MEDLARS online)。 20世纪80年代,MEDLINE光盘问世。 1997年6月26日,MEDLINE的网络版PubMed向
Internet用户免费开放。
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Index Medics(IM)
《医学索引》(Index Medicus, IM)由美国国立 医学图书馆(National Library of Medicine, NLM)编辑出版。NLM的宗旨是搜集覆盖全世界多种 语言的医学刊物,为美国和世界的读者服务。《医 学索引》创刊于1879年,其刊名、编辑形式及出版 机构,几经变更,至1960年才定型为Index Medicus。
记录标注为:[PubMed - as supplied by publisher]
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PUBMED收录范围(2)
In Process Citations:没有完成MeSH标引、加入到 MEDLINE之前的数据,是一个临时性医学文献数据库。它每天 都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文 摘,其文献条目在标引和加工后向MEDLINE移交(周二到周 六)。
National Institutes of Health, NIH(美国国 立卫生研究院)
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Entrez
Entrez是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)主持 的一个数据库检索系统,它包括PubMed, Nucleotide and Protein Sequences, Protein Structures, Complete Genomes, Taxonomy, 等数 据库。
Index Medicus(IM)、MEDLINE、 PubMed
汕大医学院图书馆 2009.11
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发展历史
MEDLINE的由来最早可追溯到1879年NLM出版的 INDEX MEDICUS(IM)。
1964年开发MEDLARS(Medical Literature Analysis and Retrieval System, 医学文献分析 与检索系统)。