分子生物学-武汉大学

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2020年(生物科技行业)考研武汉大学分子生物学名词

2020年(生物科技行业)考研武汉大学分子生物学名词

(生物科技行业)考研武汉大学分子生物学名词ModificationofDNAorRNA(DNA或RNA修饰):在最初合成聚核苷酸链之后核苷酸上所做的任何改变。

Modifiedbases(修饰碱基):除通常在DNA(T、C、G、A)和RNA(U、C、G、A)四种碱基以外的碱基,通常是在核酸合成后发生改变。

Molecularchaperone(分子伴侣):协助壹些蛋白质装配或者恰当折叠所需的蛋白质,但这种蛋白质且不是靶复合物的成分。

MonocistronicmRNA(单顺反子mRNA):编码壹个蛋白质的mRNA。

Monolayer(单细胞层):指真核细胞在培养基上生长,只能形成壹个细胞深度的壹层。

Morphogen(形态发生因子):诱导特别细胞型以依赖其浓度形式发育的因子。

MPF(促成熟因子):是二聚体激酶,包括p34催化亚基和周期蛋白调控亚基,其激活能引发有丝分裂进行。

MtDNA:线粒体DNA。

MTOC:见微管组织中心。

Multicopyplasmids(多拷贝质粒):以大于壹个拷贝出当下细菌中的质粒。

Multiforkedchromosome(多叉染色体):在细菌中,有壹个之上复制叉,因为在第壹个复制循环结束之前第二个就已开始。

Multimericprotein(多亚基蛋白质):由壹个之上亚基组成的蛋白质。

Mutagens(诱变剂):通过诱导DNA上的突变增加突变率的物质。

Mutation(突变):指基因组DNA序列上的任何改变。

Mutationfrequency(突变频率):在种群中某个突变被发现的频率。

Mutationrate(突变率):某个突变发生的速率,通常用每个基因每代出现的次数表示。

Myeloma(骨髓瘤细胞):起源淋于巴细胞的壹个肿瘤细胞株,通常产生壹种免疫球蛋白质。

NNegativecomplementation(负互补):当等位基因间互补允许多亚基蛋白质中突变亚基抑制野生型亚基的活性时发生。

(武汉大学)分子生物学考研名词汇总

(武汉大学)分子生物学考研名词汇总

(武汉大学)分子生物学考研名词汇总●base flipping 碱基翻出●denaturation 变性DNA双链的氢键断裂,最后完全变成单链的过程●renaturation 复性热变性的DNA经缓慢冷却,从单链恢复成双链的过程●hybridization 杂交●hyperchromicity 增色效应●ribozyme 核酶一类具有催化活性的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中磷酸二酯键的断裂,特异性地剪切底物RNA分子,从而阻断基因的表达●homolog 同源染色体●transposable element 转座因子●transposition 转座遗传信息从一个基因座转移至另一个基因座的现象成为基因转座,是由转座因子介导的遗传物质重排●kinetochore 动粒●telomerase 端粒酶●histone chaperone 组蛋白伴侣●proofreading 校正阅读●polymerase switching 聚合酶转换●replication folk 复制叉刚分开的模板链与双链DNA的连接区●leading strand 前导链在DNA复制过程中,与复制叉运动方向相同,以5’-3’方向连续合成的链被称为前导链●lagging strand 后随链在DNA复制过程中,与复制叉运动方向相反的,不连续延伸的DNA链被称为后随链●Okazaki fragment 冈崎片段●primase 引物酶依赖于DNA的RNA聚合酶,其功能是在DNA复制过程中合成RNA引物●primer 引物是指一段较短的单链RNA或DNA,它能与DNA的一条链配对提供游离的3’-OH末端以作为DNA聚合酶合成脱氧核苷酸链的起始点●DNA helicase DNA解旋酶●single-strand DNA binding protein, SSB 单链DNA结合蛋白●cooperative binding 协同结合●sliding DNA clamp DNA滑动夹●sliding clamp loader 滑动夹装载器●replisome 复制体●replicon 复制子单独复制的一个DNA单元称为一个复制子,一个复制子在一个细胞周期内仅复制一次●replicator 复制器●initiator protein 起始子蛋白●end replication problem 末端复制问题●homologous recombination 同源重组●strand invasion 链侵入●Holliday junction Holliday联结体●branch migration 分支移位●joint molecule 连接分子●synthesis-dependent strand annealing, SDSA 合成依赖性链退火●gene conversion 基因转变●conservative site-specific recombination, CSSR 保守性位点特异性重组●recombination site 重组位点●recombinase recognition sequence 重组酶识别序列●crossover region 交换区●serine recombinase 丝氨酸重组酶●tyrosine recombinase 酪氨酸重组酶●lysogenic state 溶原状态●lytic growth 裂解生长●transposon 转座子能够在没有序列相关性的情况下独立插入基因组新位点上的一段DNA序列,是存在与染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位。

武大分子生物学考研题库

武大分子生物学考研题库

武大分子生物学考研题库武大分子生物学考研题库分子生物学是现代生物学研究的重要分支,它研究的是生命的最基本单位——分子。

作为生物学考研的重要科目之一,分子生物学的题库对于考生来说是必备的学习资料。

下面将介绍一些武大分子生物学考研题库的内容和特点。

一、基础知识题1. DNA的结构是怎样的?请简要描述。

2. RNA的种类有哪些?它们分别在细胞中扮演什么角色?3. 请解释DNA复制的过程。

4. 什么是基因突变?请举例说明。

5. 请简述转录和翻译的过程。

这些基础知识题是考生必须掌握的内容,它们涵盖了DNA、RNA的结构和功能,以及基因突变、转录和翻译等基本概念。

考生需要通过深入学习和思考,掌握这些知识点,并能够灵活运用于解答题目。

二、实验设计题1. 请设计一种实验方法,用于检测某个基因在不同组织中的表达水平。

2. 请设计一种实验方法,用于检测某个蛋白质的亚细胞定位。

3. 请设计一种实验方法,用于研究某个基因在不同发育阶段的表达模式。

这些实验设计题旨在考察考生对实验设计的能力和创新思维。

考生需要结合自己的实验经验和理论知识,提出合理的实验方案,并能够解释实验的原理和预期结果。

三、综合应用题1. 请解释PCR技术的原理和应用。

2. 请简述RNA干扰技术的原理和应用。

3. 请简要介绍基因编辑技术CRISPR-Cas9的原理和应用。

这些综合应用题是将分子生物学的知识应用到实际问题中的考察。

考生需要综合运用所学的知识,理解和解释相关技术的原理和应用,并能够分析和讨论其优缺点及未来发展方向。

四、综合分析题1. 请分析某个基因在不同物种中的序列差异,并解释其可能的功能变化。

2. 请分析某个基因的突变与某种疾病的关联性,并提出可能的治疗策略。

这些综合分析题要求考生能够综合运用所学的知识,分析和解释实际问题,并提出合理的解决方案。

考生需要具备较强的分析思维和判断能力,能够将分子生物学的知识应用到实际问题中。

综上所述,武大分子生物学考研题库涵盖了基础知识题、实验设计题、综合应用题和综合分析题等多个方面。

武汉大学考研分子生物学名词

武汉大学考研分子生物学名词

分子生物学名词解释1、gel electrophoresis(凝胶电泳)2、restriction endonuclease(限制性内切酶)3、hybridization(杂交)4、probe(探针)5、Autoradiogram(放射自显影)6、DNA cloning7、DNA ligase(DNA连接酶)10、transformants(转化子)11、copy DNA(cDNA)12、DNA library13、colony hybridization(菌落杂交)14、oligonucleotide(寡聚核苷酸)15、site-directed mutagenesis(定位突变)16、shotgun sequencing(鸟枪法测序)17、contig(叠连群)18、annotation(注释)19、transcriptome(转录组)20、BLAST(基本局部比对搜索工具)(11.7.2015)21、tandem mass spectrometry(MS-串联质谱)22、interactome(互作组)23、DNA foot printing(DNA足迹)24、insulator(绝缘子)25、homeodomain(同源结构域)26、mediator(中介蛋白)27、bromodomain(同源调节域)28、chromodomain(染色质结构域)29、locus control region-LCR(位点控制区域)30、heterochromatin(异染色质)(11.10.2015)31、euchromatin(常染色质)32、epigenetic regulation(表观遗传调控)33、constitutive expression(组成型表达)34、operator(操作子)35、operon(操纵子)36、CTD(c端结构域)37、lysogenically(溶源生长)38、lytically(裂解)39、prophage(原噬菌体)40、antitermination(抗终止作用)41、retroregulation(逆向调控)(11.11.2015)42、C value:C值指一种生物单倍体基因组的DNA总量;Satellite DNA-卫星DNA,又称串联重复序列,由2~6个核苷酸组成的重复单位组成的串联重复。

武汉大学分子生物学名词解释

武汉大学分子生物学名词解释

Modification of DNA or RNA (DNA或RNA修饰):在最初合成聚核苷酸链之后核苷酸上所做的任何改变。

Modified bases (修饰碱基):除通常在DNA( T、C、G、A) 和RNA( U、C、G、A)四种碱基以外的碱基,通常是在核酸合成后发生改变。

Molecular chaperone (分子伴侣):协助一些蛋白质装配或者恰当折叠所需的蛋白质,但这种蛋白质并不是靶复合物的成分。

Monocistronic mRNA (单顺反子mRNA):编码一个蛋白质的mRNA。

Monolayer (单细胞层):指真核细胞在培养基上生长,只能形成一个细胞深度的一层。

Morphogen (形态发生因子):诱导特别细胞型以依赖其浓度形式发育的因子。

MPF(促成熟因子):是二聚体激酶,包括p34 催化亚基和周期蛋白调控亚基,其激活能引发有丝分裂进行。

MtDNA:线粒体DNA。

MTOC:见微管组织中心。

Multicopy plasmids (多拷贝质粒):以大于一个拷贝出现在细菌中的质粒。

Multiforked chromosome (多叉染色体):在细菌中,有一个以上复制叉,因为在第一个复制循环结束之前第二个就已开始。

Multimeric protein (多亚基蛋白质):由一个以上亚基组成的蛋白质。

Mutagens (诱变剂):通过诱导DNA 上的突变增加突变率的物质。

Mutation (突变):指基因组DNA 序列上的任何改变。

Mutation frequency (突变频率):在种群中某个突变被发现的频率。

Mutation rate (突变率):某个突变发生的速率,通常用每个基因每代出现的次数表示。

Myeloma (骨髓瘤细胞):起源淋于巴细胞的一个肿瘤细胞株,通常产生一种免疫球蛋白质。

NNegative complementation (负互补):当等位基因间互补允许多亚基蛋白质中突变亚基抑制野生型亚基的活性时发生。

分子生物学-武汉大学

分子生物学-武汉大学
分子生物学
刘青珍 武汉大学生命科学学院Biblioteka 第16章 原核生物的基因调控
本章内容
1. 本章概要 2. 转录调控的原理 3. 转录起始的调控:细菌中的实例 4. 实例 - λ 噬菌体的调控
3. 转录起始的调控:细菌中的实例
第三个例子 NtrC 和MerR: 通过变构而非招募起作用的激活子
在变构激活中 RNA聚合酶可以结合启动子 但形成的复合物没有转录活性 激活子引发复合物变构并激活转录
NtrC 有ATPase 活性 且从距基因较远处起作用
NtrC 控制参与氮代谢的基因表达 如 glnA 基因 有独立的激活域和DNA 结合域 只在氮水平低时与DNA 结合 诱导RNA聚合酶构象改变 引发从闭合式复合物向开放式复合物的转变
低氮水平- 信号 NtrC 磷酸化和构象改变 暴露DNA 结合区 NtrC 结合DNA 与结合在glnA 启动子上的 RNA聚合酶的54 直接互作 激活NtrC ATPase 活性,为 其聚合酶构象改变提供能量 转录开始
噬菌体Φ29 的P4 蛋白 抑制启动子的逃离 (在不同启动子中作用不同) 结合到强启动子PA2c:抑制 结合到弱启动子PA3:激活
抑制子以多种方式作用
抑制RNA 聚合酶与启动子结合:Lac 抑制子 抑制从闭合式复合物到开放的复合物的转变 E.coli Gal 抑制子 抑制启动子逃离 噬菌体Φ 29 P4 蛋白(在不同启动子中作用不同)
MerR 通过扭曲DNA 激活转录
MerR 控制merT 基因 它编码一种抗汞酶 在汞的存在下 MerR 结合到merT 启动子的﹣10 和﹣35 序列之间 的一段序列上 通过改变DNA 构象激活merT 表达
没有DNA 结合区和激活区的区分 结合与激活紧密相关

武汉大学分子生物学真题2001-2014汇总.

武汉大学分子生物学真题2001-2014汇总.

一.解释概念(20分,每个4分)卫星DNA 复制体逆转座子反式激活因子衰减子与衰减作用三、问答题(50分)1. 说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。

(15分)2. 简述增强子的特点和性质及作用机制。

(10分)3. 简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始(15分)4. DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶,它是在大肠杆菌(E.coli)R株中发现的,它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。

pUC质粒是常用克隆载体之一,它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。

假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DN**段克隆到pUC质粒中,并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增,已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶,你设计如何做才能确保成功?为什么?(10分)武汉大学2002分子生物学三.问答:1.简述(或绘图说明)真核细胞RNA聚合酶II转录的起始需要哪些基本转录因子及其装配过程(15分)2.简述(或绘图说明)色氨酸操纵子弱化的机制(15分)3.在讨论基因家庭时经常提到胚胎、胎儿和成体形成的蛋白质,这些述语是指什么现象?可用什么术语来描述这一类基因家族(5分)4. 你正在进行Southern blot分析,并刚刚完成凝胶电泳部分,下一步是将胶浸泡在NaOH溶液中使DNA变性为单链,为了节约时间,你跳过这一步,直接把DNA 从胶上转到硝酸纤维素膜上,你将标记好的探针与膜杂交,却发现放射自显影结果是一片空白,哪里错了呢?(5分)一、下列名词翻译成中文,并简要解释1、Domains and motifs2、Alternative splicing3、Reporter genes4、The PCR cycle5、Restriction mapping6、Multiple cloning sites7、DNA libraries8、Proteomics9、Replicon10、Semi-conservative replication二、简答题(共5题,每题8分,共40分)1、请列举三种以上蛋白质纯化技术,并说明不同纯化技术的简单原理。

武大分子生物学考研历年真题

武大分子生物学考研历年真题

武大分子生物学考研历年真题对于许多立志在生物学领域深造的学子来说,报考武汉大学分子生物学专业的研究生是一个极具吸引力的选择。

而深入研究历年真题,无疑是备考过程中的关键环节。

武大分子生物学考研真题涵盖了丰富多样的知识点和题型。

从细胞生物学基础,到分子遗传学的原理,再到基因表达调控等诸多方面,都有深入且细致的考查。

在细胞生物学基础部分,真题常常涉及细胞的结构与功能、细胞的信号转导通路等内容。

例如,会要求考生阐述细胞膜的组成成分和结构特点,以及它们如何影响细胞内外物质交换和信息传递。

又或者,详细描述细胞内各种细胞器的功能,以及它们之间是如何协同工作以维持细胞正常生理活动的。

分子遗传学原理方面,真题可能会聚焦于 DNA 复制、转录、翻译的过程和机制。

比如,让考生解释 DNA 聚合酶在复制过程中的作用和特点,或者描述 RNA 聚合酶如何识别启动子并启动转录。

基因表达调控更是重点中的重点。

这部分真题可能会让考生分析不同层次的基因表达调控机制,包括转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平的调控。

例如,要求阐述转录因子如何结合到 DNA 上调控基因的表达,或者解释 microRNA 是如何通过影响 mRNA 的稳定性来调节基因表达的。

真题的题型也多种多样。

常见的有选择题,考查考生对基本概念和知识点的理解和记忆。

判断题则侧重于考察考生对一些易混淆概念的辨析能力。

简答题要求考生能够简洁明了地回答问题,展现对知识点的准确把握和概括能力。

论述题通常是综合性较强的题目,需要考生将多个相关知识点串联起来,进行深入的分析和阐述,以展现其对知识的系统理解和运用能力。

通过对历年真题的分析,可以发现一些出题的规律和趋势。

一方面,重点知识点会反复出现,只是考查的角度和形式可能有所不同。

另一方面,随着学科的发展和研究的深入,真题也会逐渐融入一些新的研究成果和前沿知识。

例如,近年来,随着基因编辑技术的迅速发展,真题中可能会出现与CRISPRCas 系统相关的题目,要求考生了解其原理和应用。

《分子生物学》课程教学大纲

《分子生物学》课程教学大纲

武汉大学《分子生物学》课程教学大纲课程英文名称:Molecular Biology 课程类别:必修课程学分数:3 课程学时数:54授课对象:本院生物类所有本科生本课程的前导课程:生物化学一、教学目的.本课程主要是从生物大分子的角度来阐述基因组的复制和基因组的表达机制(DNA→ RNA→蛋白质),以及基因调控机制。

通过与实验课结合,将系统介绍基本的分子生物学技术,包括后基因组技术。

本课程是英语教学试验课,旨在使学生习惯使用英语进行“听、想、叙述”分子生物学相关内容,为学生进入研究生学习和进入日趋国际化的工作岗位奠定基础。

二、教学要求1.重点掌握“原核生物和真核生物复制和表达其遗传信息,以及基因表达调控的分子机制:包括发生过程,主导和参与各过程的酶和因子(反式作用因子和顺式作用元件)”。

2.掌握“常规分子生物学技术,包括基因克隆和表达的技术,研究生物大分子相互作用的技术,模式生物和后基因组分子生物学技术。

”3.熟悉“在基因组保持,表达和基因调控中主要酶和蛋白质的结构和作用机制;以及基因调控与发育和疾病的关系。

分子生物学技术在鉴定、诊断和治疗中的作用。

”三.课程内容与学时分配第一章课程简介与分子生物学发展史(教材第1至第5章)第一节课程介绍-教学目标和方法第二节课程介绍-教学内容和安排第三节分子生物学发展史1-蒙德尔的生物观重点:从名人的研究经历学法则、长智慧第四节分子生物学发展史2-核酸承载遗传信息重点:从重大发现学法则、开思路第五节化学弱相互作用与强相互作用决定大分子的结构第二章核酸结构(教材第6章)第一节 DNA的结构与拓扑异构酶重点:DNA的双螺旋结构与DNA的功能和复制之间的关系,以及DNA拓扑异构酶在解决细胞中DNA拓扑结构中的重要性第二节 RNA的结构与核酶重点:RNA可以折叠成高级结构的机制,不同核酶的结构与功能第三章 DNA复制(教材第8章)第一节 DNA复制的化学本质和DNA聚合酶的催化机制重点:DNA复制的化学反应,聚合酶的结构与催化第二节 DNA复制的过程-原核重点:不同蛋白因子是如何顺序性在复制过程中起作用的,先导链和滞后链复制的异同,不同DNA聚合酶的作用第三节 DNA复制的过程-真核重点:不同蛋白因子和聚合酶是如何顺序性在复制过程中起作用的,先导链和滞后链复制的异同第四节同一复制叉中先导链和滞后链同时被复制的机制重点:Sliding clamps和Clamp loader的作用,Trombone复制模型第五节 DNA复制起始的调控-普遍机制和原核机制重点:Replicator-initiator互作模型;E. coli的OriC,DnaA-ATP 水平,SeqA蛋白的作用第六节 DNA复制起始的调控-真核重点:Pre-RC (复制前复合物)的形成和调控第七节 DNA复制起始的结束重点:原核-II型拓扑异构酶的作用;真核-染色体复制的末端问题以及端粒酶的作用第四章基因表达1-转录(教材第12章)第一节 RNA聚合酶与转录循环内容:RNA聚合酶的种类和特征,RNA聚合酶催化的转录步骤,转录复合物在转录过程中的结构改变第二节细菌的转录循环1-启动子和因子第三节细菌的转录循环2-转录的起始,延伸和终止第四节真核转录1-RNA聚合酶II及其介导的前体mRNA转录起始重点:核心启动子的结构,以及普通转录因子组装起始复合物的过程其他内容:因为染色体高级结构的原因,体内转录需要Mediator复合物的作用第五节真核转录2-RNA聚合酶II转录的延伸重点:RNA聚合酶II CTD结构域所结合蛋白因子的顺序置换与前体mRNA的5'加帽,内含子剪接,3'加尾和转录终止第六节真核转录3-RNA聚合酶I和III转录rRNA和tRNA,小RNA的机制第五章基因组表达2-RNA剪接(教材第13章)第一节不同类型内含子分布和RNA剪接的化学性质第二节 I型和II型内含子核酶的剪接机制重点:结构和催化的化学反应第三节真核生物蛋白编码基因内含子的剪接-剪接体的组装,重排和催化重点:剪接体的组分(snRNPs);剪接体的组装、重派和催化之间的关系第四节可变剪接重点:生物学意义,调控机制第五节其他加工过程内容:选择性剪接体包含不同的snRNPs,RNA编辑,mRNA转运第六章基因组表达3-翻译与遗传密码(教材第14-15章)第一节 mRNA的功能内容:开放阅读框决定多肽序列,原核和真核mRNA上的翻译元件第二节转运RNA的功能,结构,以及氨基酸装载过程重点:氨基酸装载的识别功能第三节核糖内容:核糖体(翻译机器)组装与循环,翻译的化学特性,核糖体的催化功能。

武汉大学历年分子生物学考研真题

武汉大学历年分子生物学考研真题

武汉大学分子生物学历年考研真题 (2001年-2013年)武汉大学2001 年攻读硕士学位研究生入学考试试题科目名称:分子生物学科目代码: 477注意:所有答题内容必须写在答题纸上,凡写在试题和草稿纸上的一律无效。

一、解释概念 (20 分,每个4分)1. 卫星 DNA2. 复制体3. 逆转座子4. 反式激活因子5. 衰减子与衰减作用二:填空(30 分,每空 1 分,请将答案写在答卷上)1.从病毒到高等生物的研究表明,遗传物质是。

2.冈崎片段的发现证实了双链 DNA的复制,在复制过程中,一条新生链的合成是的,称为链;而另一条链的合成是的,称为链。

3.大肠菌中有三种DNA聚合酶,其中的polI的作用是 ,而pol III的作用是。

pol I和pol III都有的三种活性是、、。

4.由于真核细胞染色体DNA的复制要有一段RNA为引物,因此线状的DNA复制后必须存在着5’端缩短的问题。

已发现有一种端粒蛋白称为 ,它由构成,可以使单链DNA的5’延长。

5.对DNA 损伤有几种修复系统 ,其中只有修复系统可以造成DNA变异,与这一系统有关的一套基因平时受到一称为的抑制蛋白所抑制,它发挥抑制作用是结合在一段约20bp长的称为的DNA序列上,当DNA损伤时,另一种蛋白质称为。

把这种抑制蛋白水解后,修复系统的基因才会被激活。

6.真核细胞中有三种依赖于DNA的RNA聚合酶分别合成不同的RNA,RNA pol I 负责合成,RNA pol II 负责合成,RNA pol III负责合成。

7.大分子互相作用是分子生物学的重要内容,包括蛋白质之间、蛋白质与DNA或RNA之间的互相作用,蛋白质有四种重要的结构花式与大分子互相作用有关, 这些结构花式是 , , 。

8.NO 是气体小分子信号,它可由脱氨产生,它的作用方式是直接与酶作用使产生cGMP(环式GMP)。

9.真核mRNA的5’端通常有帽子结构,3’端有 polyA。

在polyA上游有一保守序列称为polyA 信号,其序列为。

武汉大学分子生物学全部课程3

武汉大学分子生物学全部课程3
武汉大学分子生物学全 部课程3
2020年7月18日星期六
•Molecular Biology of the Gene, 5/E --- Watson et al. (2004)
•Part I: Chemistry and Genetics •Part II: Maintenance of the Genome •Part III: Expression of the Genome •Part IV: Regulation •Part V: Methods
•Linking number is the number of times one strand have to be passed through the other strand in order for the two strands to be entirely separated from each other.
•Function (1): DNA in cells is negatively supercoiled; nucleosomes introduces negative supercoiling in eukaryotes
•Negative supercoils serve as a store of free energy that aids in processes that require strand separation, such as DNA
•It is a simple consequence of the geometry of the base pair.
•(See the Structural Tutorial of this chapter for details)

武汉大学分子生物学_chapter11 DNA的重组和转座

武汉大学分子生物学_chapter11 DNA的重组和转座

•Molecular Biology Course
Chapter 11 Site-Specific Recombination & Transposition of DNA
Although DNA replication, repair, homologous recombination occur with high fidelity to ensure the genome identity between generations,
This mechanistic feature contributes the “conservative” to the CSSR name, because every DNA bond that is broken during the reaction is resealed by the recombinase without consuming any external energy.
The general themes of site-specific recombination
1. All reactions depend critically on the assembly of the recombinase protein on the DNA and bring together of the two recombination sites
2. Some recombination requires only the recombinase and its recognition sequence for such an assembly; some requires accessory proteins including Architectural Proteins that bind specific DNA sequences and bend the DNA.

武大分子生物学课件CHAPTER 20

武大分子生物学课件CHAPTER 20
6
Electrophoresis
1. Gel electrophoresis separates DNA and RNA molecules according to size, shape and topological properties
Gel matrix is an inserted, jello-like porous material that support and allows macromolecules to move through. Agarose and polyacrylamide are two different gel matrices

10
Electrophoresis
pulsed-field gel electrophoresis
Switching between two orientations: the larger the DNA is, the longer it takes to reorient
11
Restriction digestion
7
Electrophoresis DNA and RNA molecules are negatively charged, thus move in the gel matrix toward the positive pole (+) Linear DNA molecules are separated according to size The mobility of circular DNA molecules is affected by their topological structures. The mobility of the same molecular weight DNA molecule with different shapes is: supercoiled> linear> nicked or relaxed

武汉大学研究生院生科院招收研究生专业

武汉大学研究生院生科院招收研究生专业

分子生物学第一章绪论1分子生物学:是研究核酸、蛋白质等所有生物大分子的形态、结构特点及其重要性、规律性和彼此关系的科学。

2基因组;3结构分子生物学:确实是研究生物大分子特定的空间结构及结构的运动转变与其生物学功能关系的科学。

4限制性核酸内切酶:能够识别DNA上的特定碱基序列并从那个位点切开DNA分子。

5中心法那么:描述信息由DNA到蛋白质传递的大体规律,遗传信息通过DNA的自我复制传给子代,通过转录翻译形成蛋白质,部份RNA病毒能够自我复制,部份逆转录病毒能够由RNA反转录形成DNA。

6基因工程:是指在体外将核酸分子插入病毒、质粒或其他载体分子,组成遗传物质的新组合。

简答1列出最先证明遗传物质是DNA(或RNA)而不是蛋白质的一些依据答:在1952年Hershey和Chase所作的噬菌体浸染细菌的实验是最先证明遗传物质是DNA 而不是蛋白质的实验。

该实验利用噬菌体侵染细菌的性质,该进程包括①噬菌体尾部吸附在细菌表面②噬菌体将DNA注入细菌细胞内,蛋白质外壳留在外面;③噬菌体DNA注入细菌细胞中以后,利用细菌的生命进程合成自身的DNA和蛋白质;④新合成的DNA和pro组装成许多与亲代完全相同的噬菌体;⑤子代噬菌体由于细菌破裂而被释放出来,再去侵染其他细胞,该进程中DNA 发挥了重要作用。

当细菌培育基中含有35S和32P标记的AA或核苷酸时,子代噬菌体中就应含有35S或32P标记的pro或核酸,别离用这些噬菌体去侵染没有标记的细菌,通过1--2个DNA复制周期后发觉,子代噬菌体中几乎不含35S标记的pro但含有30%以上的32P标记,说明在噬菌体的传代进程中发挥作用的是DNA而不是pro。

2简述分子生物学的要紧研究内容答:分子生物学是研究核酸、蛋白质等所有生物大分子的形态、结构特点及其重要性、规律性和彼此关系的科学,它所研究的内容要紧包括以下4个方面:①DNA重组技术②基因表达调控研究③生物大分子的结构功能研究④基因组、功能基因组与生物信息学研究3列举DNA重组技术史上的要紧事件①Berg在1972年利用DNA重组技术取得了编码哺乳动物激素基因的工程菌株②美国陆军研究进展和工程中心从织网蜘蛛中分离出合成蜘蛛丝的基因,并利用该基因在实验室中生产蜘蛛丝③利用发觉了癌农杆菌发明了植物基因的轰击转化法,用转基因模式大规模改良农作物的抗病、抗逆、抗虫性,提高产量,改善质量或用传统的农作物产生特种资源以成为世界进展的潮流第二章C值:咱们把一种生物单倍体基因组DNA的总量称为C值C值反常现象:又称C值谬误,它是指C值往往与种系进化复杂程度不一致,某些低等生物具有较大C值。

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a. ICR 结合CTCF:阻断增强子对Igf2 的作用 b. ICR 和H19 启动子甲基化:CTCF 不能结合ICR,转 录机器不结合 H19 启动子,增强子激活Igf2。 H19 的进一步抑制:DNA 甲基化 - MeCP2 结合甲基 化ICR - 招募去乙酰化酶 - 抑制H19 启动子
通过DNA 甲基化和随后的组蛋白修饰关闭基因
DNA 甲基化与印记 印记
在二倍体细胞中 来自父亲或母亲的等位基因中 一方的基因表达 另一方的基因沉默的现象

例子:
人类H19 基因和胰岛素样生长因子2 (Igf2)基因
增强子 可激活其中任何一个基因
ICR 印记控制区 位于基因Igf2 和H19之间 绝缘子 调控关键:ICR 和它的甲基化状态
绝缘子阻止沉默的扩散 其他类型组蛋白修饰抑制SIR2结合终止扩散
组蛋白H3 尾巴的甲基化被相信起了这个作用
DNA 甲基化与哺乳动物基因沉默相关
有些哺乳动物基因由于 其邻近DNA序列的甲基化而处于沉默状态
哺乳动物基因组上大段区域被甲基化DNA 标记 DNA 甲基化通常出现在异染色质区 甲基化DNA序列常被 招募组蛋白去乙酰化酶和组蛋白甲基化酶的 DNA 结合蛋白(如MeCP2)识别 进而修饰邻近的染色质 因此,DNA 甲基化标记异染色质将要形成的位置
7. 组蛋白与DNA修饰导致的 基因“沉默”
调控蛋白调控 靶基因、特异性效应、局部的
基因“沉默”- 一种位置效应
基因由于它所处的位置而沉默 不是对特定环境信号的反应 沉默效应可在大段DNA 序列上扩散 “沉默”多个基因 包括离起始事件距离较远的基因
最常见的沉默与异染色质有关 异染色质通常与染色体的特殊区域相关 如端粒和着丝粒
分子生物学
刘青珍 武汉大学生命科学学院
第17章
真核生物的基因调控
本章内容
1. 本章概要 2. 从酵母到哺乳动物转录调控的保守机制 3. 真核生物活化子募集蛋白复合物到基因上 4. 信号整合与组合调控 5. 转录抑制子 6. 信号转导与转录调控蛋白的控制 7. 组蛋白与DNA 修饰导致的基因“沉默” 8. 基因的表观遗传调控
哺乳动物细胞中 约50%的基因组以异染色质形式存在
转录沉默常与核小体修饰有关 改变基因对转录机器和其他调控蛋白的可接近性 DNA 甲基化也可沉默转录 (DNA 甲基化酶) 沉默相关的修饰酶包括 去乙酰化酶和DNA 甲基化酶
酵母基因沉默 由组蛋白去乙酰化和甲基化介导
在酿酒酵母中的“沉默” 区域 端粒、沉默的交配型基因座和rDNA 以端粒为例: 染色体末端1-5 kb,紧密结构,乙酰化程度低 插入此区域的基因常被沉默
三个编码沉默调控蛋白的基因:SIR2, 3, 4 (SIR:沉默信息调控子) SIR2-SIR3-SIR4:复合物 SIR2:去乙酰化酶
酵母端粒的沉默
识别端粒重复序列的DNA 结合蛋白Rap1 招募SIR 复合物至端粒 SIR2使临近的核小体去乙酰化 去乙酰化的尾巴与SIR3 及SIR4 结合招募更多SIR 复合物 SIR2 作用于更多核小体 沉默的特异性是被Rap1 蛋白质决定的 这个端粒DNA 结合蛋白确定了SIR 复合物形成的位置
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