《化学信息学》读书笔记

《化学信息学》读书笔记

诺伯特·维纳对信息的著名定义：“信息就是信息，不是物质也不是能量。不承认这一点的唯物论，在今天就不能存在下去。”这句话深刻揭示了信息的重要地位，信息与物质、能量是客观世界的三大构成要素。信息：事物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。从产生信息的客体的性质来分，可分为自然信息（声、光、热、电、天气变化、地壳运动、天体演化等）、生物信息（如遗传信息、生物体内信息交流、动物种群内的信息交流）、机器信息（自动控制系统）和（人类）社会信息。以信息所依附的载体为依据，可分为文献信息、口头信息、电子信息、生物信息等。

信息与知识和文献之间的区别信息（Information）：通过信号带来的消息。知识（knowledge）：人类社会实践经验的总结，是信息的一部分，需要通过信息使用归纳、演绎的方法得到。文献（document）：是用文字、图形、符号、声频、视频等技术手段记录人类知识的一种载体，或理解为固化在一定物质载体上的知识和信息。情报（information，intelligence）：激活了的知识。性质有知识性、传递性及效用性。经过传递的文献才是情报，资料是文献的通俗说法。

化学信息概论

一.化学信息学的产生和发展：

信息：实物的存在方式和运动状态的记录，它精确地描述物体或事件，并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。

化学信息学：是应用信息学方法解决化学问题的学科。（化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。）

二.化学信息学的研究领域：

应用现代信息技术构建信息处理系统，处理长期积累的大量化学信息资源，帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据，正确地预测化学物质的性质，开发新化合物、材料和方法。

应用计算机科学方法或信息学解决化学问题，对化学信息进行有效的存储、操作和处理，使化学信息合理地提升为化学知识。

研究内容：化学、化工文献学；化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输；化学图形学；化学信息的解析与处理；化学知识的计算机推演；化学教育与教学的现代技术与远程信息资源。

三.信息资源检索的意义与作用：

1.启迪创新：科研工作具有继承和创新两重性，要求科研人员在探索未知进行创新之前，应该尽可能地继承和利用与之相关的信息。

2.拓宽视野：21世纪信息与知识的积累日新月异，出现了大量的边缘科学和交叉科学。面对知识频繁更新的世界，需要接受终身教育，在不断的教育中更新知识，适应环境的变化。

3.培养能力：现代教育不单纯是知识的传授，更重要是要大力进行各种能力的培养，其中包括自学能力、思维能力、研究能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力和收集处理信息的能力。

4.提高素质：信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现的综合能力，它是进入信息社会赖以生存的通行证。

四.化学信息学的课程内容：

化学信息的产生和获取：利用检索工具、通过实验方法

化学信息的表达、存储和管理：化学运筹学、数据整理可视化、数据库管理技术

化学信息的加工和处理：化学计量学、化学软件、目的是获取更多的信息化学信息的深化：计算机模拟设计、化学结构的可视化以图形的方式对化学信息进行描述

五.电子信息和数据库

（一）电子信息：指通过计算机等设备以数字信号传递的数字信息资源组成的数据库。

1.联机信息资源，如：Dialog、STN、OCLC数据库

2.光盘信息资源，包括单机版、网络版、联机版

3.Internet网络信息资源

（二）数据库：数据库是以特定方式合理地组织相互关联的数据集合。

1.数据库的结构：

（1）记录型文献数据结构

常用的字段：标题、作者、地址、期刊名、学科、文件类型、语种和摘要。

2.记录的排序和索引：

（1）顺排文档：按记录号顺序排列；

（2）倒排文档：各个记录按照某一字段的值进行排列。

六.信息检索的方法和步骤

（一）信息检索的评价

1.评价指标：查全率、查准率、漏检率、误检率、响应时间、用户负担、输出

形式等。

2.查全率和查准率：

（1）查全率（R）：检索出的相关信息量（w）与该系统信息库中存储的相关信息量（x）的比率称为查全率，R=w/x ×100 %。

（2）查准率（P）：检出的相关信息量（w）与检出信息总量（m）的比率称为查准率，P= w/m ×100 %。两者之间存在互逆关系，即查全率高时，查准率较低，反之亦然。

（3）漏检率（O）：O = 1 – R = 1- w/x × 100 % 。

（4）误检率（N）：N = 1 - P = 1-w/m × 100 % 。

如果一个检索系统中与某一课题相关的信息共250条。检索操作后，实际

检出了400条信息，其中相关信息为200条，此次检索效率可计算为：R = [200 /250] × 100 %=80% O = 1-80% = 20%

P = [200/400] × 100%=50% N = 1-50%= 50%

3.位置检索：

(1)With（W、nW），表示算符两侧的检索词按此前后衔接的顺序排列，词序不可颠倒。

(2)Near（N、nN）表示算符两侧的检索词必须紧密相连，两词词序可变。

(3)Subfield （S）表示算符两侧的检索词必须同时出现在文献记录的同一字段（句子、短语）。

(4)Field（F）表示算符两侧的检索词必须同时出现在同一个字段中。

(5)Citation（C）表示算符两侧的检索词必须同时出现在一条文献的记录中。

(6)Link（L）表示算符两侧的检索词之间有一定的从属关系。

4.限词检索：

基本检索字段：题名、文摘、主题词、标识词；

辅助检索字段：作者、语种、出版年代、期刊名称和文献类型。

基本检索字段主要有题名（TI）、文摘（AB）、主题词（DE）和标识词（ID），适用于各种数据库。辅助检索字段主要有作者（AU）、语种（LA）、出版年代（PY）、期刊名称（JN）和文献类型（DT）等字段。一般说来，数据库的提供的字段越多，其检索方式就越多，可以使用多字段构建复杂的检索表达式，进行高级检索。

七.信息检索步骤

1.实施检索操作，获取检索信息；评估检索结果。为了减少滥检、漏检和缺检，可进行检索策略的调整，主要分为缩检和扩检二种。

2.缩检主要方法有：主题细化；选择更专指的检索词；运用逻辑算符AND 、NOT；运用位置算符WITH、NEAR；减少字段检索；对检索结果进行二次检索。

3.扩检主要方法有：对己确定的检索词进行其同义词、同义的相关词、缩写和全称检索；利用数据库提供的词表输入规范词；使用运算符OR 等。

4.数据库的选择：

(1)数据库的类型。例如，书目数据库、事实数据库结构数据库；文摘数据库或全文数据库。

(2)数据库所收集的数据内容所涵盖的学科领域和收录范围。

(3)数据库的现状，包括数据库收录的文件类型、据量、存储年限、更新周期、语种、媒体介质和辅助工具。

(4)数据库的检索质量、权威性和检索速度。

(5)数据库提供的系统功能和检索方式。

(6)数据库的使用权和检索费用。

印刷类化学文献信息

一.图书分类法简介

（一）图书馆的重要地位和作用