磷脂脂肪酸微生物鉴定系统 ppt课件

Sherlock® microbe methods and libraries
MIS 软件选择
汽化管和标准品
GC谱图
Report
Result Summaries
Instrument Throughput
short preparation autosampler
Single Tower: 45 samples Dual Tower: 90 samples $ 1. 0 per sample (inc. reagents, gases, calibration
...over DNA-Based Identification
Bioterrorism list:
• Bacillus anthracis (Anthrax) • Brucella melitensis (Brucellosis) • Burkholderia mallei (Glanders) • Burkholderia pseudomallei (Melioidosis) • Francisella tularensis (Tularemia) • Yersinia pestis (Plague) • 15 challenge organisms
该软件可以操控Agilent公司的6850、7890型气相色谱，通 过对气相色谱获得的短链脂肪酸的种类和含量的图谱进行 比对，从而快速准确地对微生物种类进行鉴定。
生物标记物 Biomarker
• 不饱和脂肪酸
• 蛋白质
• 核酸
• 类脂
• 磷脂
• 多糖 • etc.
生物标记物在不同细菌中的分布 谱不同鉴定细菌
MIDI
pattern recognition software
GC 硬件选择
6890 目前6890升级为7890。
6850
微生物菌种库
噬氧菌 厌氧菌 酵母
大于1500种菌种，其中450种来自临床 大于800种菌种 300种，放线菌库亦包含其内。
迄今为止微生物鉴定系统中最大的菌库 并细分为超过100,000个株型，一步直接鉴定到株型，这是传统方法做不到的
全自动微生物鉴定系统 Sherlock® Microbial Identification Systems
2010.4
目录
产品原理介绍 配置介绍 产品优势 应用领域
Sherlock® Microbial Identification System 全自动微生物鉴定系统
——细胞脂肪酸图谱鉴定
standards, glassware, and culture media)
目录
产品原理及介绍 配置介绍 产品优势 应用领域
...over Biochemical Tests
• 脂肪酸成分在细菌中结构、含量十分稳定 • 样品需求量少 • 脂肪酸分析基于种的数据库，定性判断准确。 • 实验周期短，获取结果快。 • 成本低，0.80 USD/样本 • 库容量大 • the strain level versus the species level
Sherlock ® MIS为美国MIDI公司依据自20世纪60年代以来对微 生物细胞脂肪酸的研究经验，开发的一套根据微生物中特定短链 脂肪酸（C9-C20）的种类和含量进行鉴定和分析的软件。
权威
分获美国CDC、国土安全局和FDA认证
独一无二
➢ 唯一脂肪酸微生物鉴定系统产品 ➢ 唯一采用氢气做载气的脂肪酸分析系统
2. Sherlock利用样品的前处理过程和气相色谱分析 (Gas Chromatography)去产生定性及定量脂肪酸再 现性成份描述.
3. 从未知的微生物中萃取出脂肪酸而后自动化的被定量 且利用Sherlock的软件来鉴定检测出脂肪酸的成份.
脂肪酸鉴定与传统微生物鉴定比较的优势：
操作过程
消耗品 人为判断
MIS系统应用领域
灭菌控制 (Sterility Control) 饮用水及废水 (Drinking/Waste Water) 环境学 (Environmental) 植物及土壤 (Plant and Soil) 生态学（bionomics） 医学/临床 (Medical/Clinical) 工厂 (Industrial) 食物 (Food) 兽医学 (Veterinary)
生物标记物—脂肪酸
➢ 细菌细胞内有300多种脂肪酸成分
➢ 细菌脂肪酸成分相对稳定
➢ Plasmid loss or gain, mutations have no effect on fatty acid composition
➢ 细菌脂肪酸易于提取，定性和定量
操作方法
1. MIS主要用来分析及鉴定在人工培养基中纯化培养的 微生物.
脂肪酸鉴定方法
传统方法
Байду номын сангаас
将菌分为嗜氧，厌氧及酵母在 对应培养条件下培养一定时间 （24-48h），通过2小时的脂肪 酸抽提工作后，进行气相色谱， 全自动分析，得到结果。操作 简单。
普通试剂，易保存
需先将菌分为革兰氏阳性及 阴性，并判断球、杆菌，在分 型培养后，需多耗一天时间进 行培养来得到菌的碳源利用率。 操作复杂
用量大,价格贵,不易保存
鉴定过程无需人为判断
容易误判
操作流程
细菌培养
皂化、甲基化
萃取
气相分析
鉴定报告
目录
产品原理及介绍 配置介绍 产品优势 应用领域
MIS系统构成
Agilent Technologies
gas chromatographs(GC)
MIDI
microbial databases
经典案例：
1.2001年11月在美国成功鉴定炭疽（Bacillus anthracis
）病例
2.2004年获得AOAC Official Methods of AnalysisSM（美
国分析化学家组织官方分析法）
3.美国联邦调查局（FBI）和美国国家环保署(EPA)用
目标
产品优势
最大的 菌库
独创21 种细菌 武器数 据库
检测成 本低
操作简 便
微量样 品
速度快、 精度高
➢ 采取了其它方法进行验证
➢ DNA-based identification
➢ 菌株溯源
➢ 2-D Plot clustering ➢ Dendrogram clustering
目录
产品原理及介绍 配置介绍 产品优势 应用领域