肿瘤基因检测样本处理PPT

5. 需在邮件或送样信息中注明检测报告接收人，以便最后报告的发送
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常见问题反馈
• 随样本一起来的送检信息单填写不全 • 寄送信息表还是用老版本，未进行更新。临床样本一定要使用新版寄
肿瘤基因检测样本处理
肿瘤产品线
遗传性肿瘤基因检测样本类型及要求
外周血：
DNA：
唾液：
1.EDTA抗凝管采集5mL静脉 1.DNA浓度
（需用配套采集器进行收集）
血。
≥30ng/μL,260/280≈1.8~2.0，总 1.液体与上层泡沫间的分层界面达
2.收集后如即刻寄送，冰袋运 量≥3μg。
到4ml及以上刻度线；
4.为保证石蜡标本DNA提取的成功率，请尽可能 送检1年以内的标本。
5.常温保存、运输。
石蜡样本处理及鉴定
病理鉴定确定癌细 胞含量为70%以上
为减少样本损耗，尽量避免铺到玻片上， 直接放到EP管中。
Oseq-T样本类型及要求
手术新鲜组织：
1.1.样本量大小约 10mm×10mm×4mm，重约 50mg为最佳，需请病理科对该组 织进行免疫组化或HE染色，病灶组 需确保未坏死肿瘤组织比例在70%
输。
2.需提供DNA/RNA提取操作规程。 2．严格按照采集说明书进行采集。
3.冻存新鲜外周血， -80 ℃保 3. -80℃保存，干冰/液氮运输。 3.常温运输
存。
（注：需用配套采集器进行收集）
样本采集管
EDTA采血管
可送检项目： 化疗12项， 遗传性肿瘤 Oseq-T对照
EP管（装石蜡切片及DNA）
可送检项目： 靶向，化疗 遗传性肿瘤 Oseq-T
唾液采集管
可送检项目： 遗传性肿瘤
唾液采集说明
唾液采集管外观
唾液采集说明
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唾液采集说明
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肿瘤常规用药指导基因检测样本类型及要求
1. 化疗检测：
外周血： 1.EDTA抗凝管采集3mL静脉血。 2.收集后如即刻寄送，冰袋运输。 3.冻存新鲜外周血，-80 ℃保存。
5.常温保存、运输。
穿刺样本：
1.穿刺组织：不少于3针 2.1.5mlEP管收集标本，半小时内置
入液氮内，完全冷冻保存1小时。 3.用-80℃保存或干冰寄送。
外周血：
1.EDTA抗凝管采集5mL静脉血。 2.收集后如即刻寄送，冰袋运输。 3.冻存新鲜外周血，-80℃保存。
DNA： 1.DNA浓度≥30ng/μL,260/280≈1.8~2.0，总量≥3μg。2.需提供DNA提取操作规程。 3.-80℃保存，干冰/液氮运输。
DNA： 1.DNA浓度≥30ng/μL,260/280≈1.8~2.0，总量 ≥3μg。 2.-80℃保存，干冰/液氮运输。 3.需提供DNA提取操作规程。
肿瘤常规用药指导基因检测样本类型及要求
2. 靶向检测：
新鲜组织标本：
石蜡切片：
DNA：
Байду номын сангаас
1. 样 本 量 大 小 约 1.切片数量要求不少于10片;切片厚度5~10μm 1.DNA
2. 该检测因需要外周血作为参照，必须癌组织样本和外周血样本一起 寄送
3. 填写电子版的送样信息表时，以下为必填项，包括样本类型，样本 数量（如石蜡切片样本要写清楚几片）、样本采集时间、癌肿类型 等。对于电子版的送样信息表没有填写完整的样本，我们将不予检 测！
4. 在样品寄送的同时，市场销售人员需将电子版的送检信息表发至样 本中心公共邮箱：P_tjhc_SC@。电子版的送样信息表， 请务必在样本到达之前发送，以便生产中心安排生产，避免延误样 本检测
注：手术新鲜组织样本、石蜡包埋/切片组织、穿刺样本，以上三类样本选一种寄送 外周血为对照样本，必须同时寄送
BGI实验室内部质控
PCR实验室
PCR实验室整体面积为1752平米，共22个功能分区；
全面的内部质量管理
要素管理
➢人员培训 ➢试剂、耗材的质控 ➢仪器设备的质控 ➢实验室环境监测 ➢投诉处理 ➢文件和记录的管理
以上，且坏死组织比例少于10%。 2.2.收集后半小时内立即置入液氮内， 完全冷冻1小时后，再用-80℃保存 或干冰寄送。
石蜡包埋/切片组织： 1.切片数量要求不少于10片;切片厚度5~10μm（面积 ﹥25mm×25mm），如果肿瘤组织切片面积较小，请按比 例增加切片的数量。
2.确保所切层面中肿瘤组织占70%以上，且坏死组织比例少于 10%。 3.切片结束后，不必进行铺片和贴片处理，直接用干净的镊子将 组织切片转移至干净的1.5mL离心管中。 4.为保证石蜡标本DNA提取的成功率，请尽可能送检1年以内的 标本。
过程管理
➢ 检测前:样本的采集、 包装运输、接收、保 存
➢ 检测中:样品的提取、 检测、分析
➢ 检测后:告发送、客户 咨询、投诉处理
样本采集
➢ 制定样本采集手册及SOP ➢ 统一配置样本采集材料 ➢ 对采集人员进行培训，培训合格后方可上岗。
样本包装运输
➢ 温度要求：根据样本类型确定运输温度； ➢ 包装要求：按照SOP进行样本包装，并配置专门的包装箱 ➢ 运输要求：选择专业物流运输公司，并对人员进行培训
肿瘤组织比例在70%以上，且坏死组织 组织比例少于10%。
作规程。
比例少于10%。
3.切片结束后，不必进行铺片和贴片处理，直接用 3. -80℃保存，干冰/
2.收集后半小时内立即置入液氮内，完 干净的镊子将组织切片转移至干净的1.5mL离心 液氮运输。
全冷冻1小时后，再用-80℃保存或干 管中。
冰寄送。
浓
度
10mm×10mm×4mm ， 重 约 50mg （面积﹥25mm×25mm），如果肿瘤组织切片 ≥30ng/μL,260/280≈
为最佳，需请病理科对该组织进行免疫 面积较小，请按比例增加切片的数量。
1.8~2.0，总量≥3μg。
组化或HE染色，病灶组需确保未坏死 2.确保所切层面中肿瘤组织占70%以上，且坏死 2.需提供DNA提取操
样品的接收与保存
样本接收
➢ 统一的接收标准 ➢ 标准sop指导 ➢ 条码化管理，编号唯一
样本保存
➢ 自动定位 ➢ 可视化的温度实时监控
Oseq送样必知
1. 样本寄送至——地址：天津东丽空港经济区商务院东区E3楼；收件 人，陈潇；电话：13920800817。样本寄送时，需同时发送电子版 送检信息单至天津样本中心公邮：P_tjhc_SC@及天津 生产公邮p_tjhc_ycb@