第18章遗传疾病的诊断-FudanUniversity

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遗传学_复旦大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年

遗传学_复旦大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年

遗传学_复旦大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年1.关于Agouti小鼠,以下描述错误的是?答案:当ASP编码基因的调控元件发生低甲基化,可关闭基因表达,小鼠呈现黑色,并发症减少。

2.有些基因并非与其他基因协作,而是直接影响其他基因的功能,导致表型效应改变,这些基因被称为?答案:修饰基因3.相比正常二倍体,增加了一条染色体的个体(染色体组成为2n+1)称为?答案:三体4.由基因频率和基因型频率推测,以下哪个群体不属于平衡群体?答案:AA(20%); Aa(60%); aa(20%)5.乌龟的性别是由受精卵的孵化温度决定的,这种性别决定方式是属于?答案:环境性别决定6.以下关于关联分析的描述,错误的是?答案:有关联的非等位基因之间一定存在连锁关系。

7.平衡致死系是利用__________片段抑制交换,从而保证杂合状态在世代传递中不发生分离。

答案:倒位8.以下孟德尔遗传模式中,哪一种最符合“双亲表型正常,子女发病率为25%,且没有性别分布差异”这一特点?答案:常染色体隐性遗传9.常染色体上,半同胞婚配的近交系数为?答案:1/810._______指的是具有两个着丝粒的变异染色体。

答案:双着丝粒染色体11.马和驴杂交,得到的骡可育性极低。

这种现象属于?答案:受精后生殖隔离12.缺失造成的弧状结构的内部是______的染色体部分。

答案:正常13.真核生物基因的编码序列在染色体上的排列特点是?答案:不是连续排列的14.已知A与a、B与b、C与c这三对等位基因自由组合,基因型分别为AaBbCc、AabbCc的两个体进行杂交。

下列关于杂交后代的推测,正确的是?答案:表现型有8种,aaBbCc个体的比例为1/1615.在常染色体隐性遗传疾病中,野生型等位基因相对突变基因完全______,杂合子Aa表现为_____型。

答案:显性;野生16.1961年,法国分子生物学家Jacob和Monod提出了________,说明了大肠杆菌在环境因素的调控下,如何在转录水平改变结构基因的表达。

本科生学习手册-FudanUniversity

本科生学习手册-FudanUniversity

复旦大学微电子学院本科生学习手册 ( 2018版)目录第一章. 前言 (3)1.1复旦大学微电子学院简介 (3)1.2微电子学院本科生课程学习手册使用指南 (5)第二章. 微电子学院本科生培养模式 (6)2.1 微电子学院本科生培养目标 (6)2.2微电子学院本科生培养理念 (6)2.3微电子科学与工程专业课程体系概要 (8)2.4本科生导师制 (10)2.5 实践与能力训练 (11)2.6 毕业设计与毕业论文 (11)第三章. 选课指导 (13)3.1 学分要求 (13)3.2通识教育课程 (13)3.3大类基础课 (15)3.4微电子科学与工程专业教育课程体系 (16)3.4.1专业必修课(43学分) (17)3.4.2专业必修课程修读路线图 (18)3.4.3专业选修课程(17学分) (20)第四章. 微电子科学与工程专业课程简介 (21)4.1大类基础课 (21)4.2微电子科学与工程专业必修课程简介 (39)4.3微电子科学与工程专业选修课程简介 (50)4.4任意选修(3学分) (69)微电子科学与工程专业本科生学习手册第一章.前言1.1复旦大学微电子学院简介复旦大学微电子学院具有优秀的办学基础,前身是1958年我国半导体物理学的开拓者之一谢希德教授创办的半导体物理专业。

1984年设立博士点,1988年,“微电子学与固体电子学”被评为国家重点学科。

1992年“专用集成电路与系统”国家重点实验室获批,具备国际一流的软硬件设计环境。

为带动电子信息学科发展,复旦大学积极响应“国家急需,世界一流”号召,2013年4月作为试点单位成立了复旦大学微电子学院。

现有办学面积7.66万平方米,是复旦大学积极发展工科“先行先试”的首个改革试点单位。

学校给予了微电子学院充分的资源保障和有力的支持。

作为2013-2014年复旦大学学科建设的一号工程,聘请了国内外著名专家学者组成了强有力领导核心,组织了国内外知名学者对人才培养、学科发展以及产学合作进行了多次讨论,为示范性微电子学院的建设奠定了坚实基础。

脊髓性肌萎缩症SMN1和SMN2基因拷贝数变异分析

脊髓性肌萎缩症SMN1和SMN2基因拷贝数变异分析

作者单位1复旦大学附属儿科医院神经科上海,201102;2复旦大学生物医学研究院出生缺陷研究中心上海,200032;3共同第一作者通讯作者周水珍,E-mail :szzhou@shmu.edu.cn ·论著·DOI :10.3969/j.issn.1673-5501.2013.03.012脊髓性肌萎缩症SMN1和SMN2基因拷贝数变异分析王佶1,3安宇2,3周水珍1王艺1刘仁超2摘要目的探讨运动神经元存活(SMN )1和SMN2基因拷贝数变异与脊髓性肌萎缩症(SMA )患儿临床表型的关系。

方法以2011年10月至2012年12月在复旦大学附属儿科医院临床诊断SMA 患儿为研究对象,采用基因组DNA 多重连接探针扩增(MLPA )技术进行SMN1基因缺失和SMN2基因拷贝数变异检测,探讨拷贝数变异与SMA 临床分型的关系。

结果41例临床诊断SMA 患儿行基因检测,其中SMN1基因第7和(或)8外显子缺失37例(90.2%)进入分析,男女之比为1ʒ0.8,发病年龄为(7.5ʃ7.0)个月。

Ⅰ型20例(54.1%),Ⅱ型15例(40.5%),Ⅲ型2例(5.4%),发病年龄分别为(2.9ʃ1.8)、(10.7ʃ1.9)和(30.0ʃ8.5)个月。

37例SMN1基因第7和(或)8外显子缺失患儿中,18例SMN2基因第7和8外显子拷贝数为2个,其中13例(72.2%)为Ⅰ型,5例(27.8%)为Ⅱ型;19例SMN2基因第7和8外显子拷贝数增加(拷贝数3或4),其中7例(36.8%)为Ⅰ型,10例(52.6%)为Ⅱ型,2例(10.5%)为Ⅲ型,两组差异有统计学意义。

5例患儿父母行SMN1基因检测,共检出杂合缺失9例,其中4例患儿父母均为SMN1基因第7和8外显子杂合缺失,1例患儿父亲为SMN1基因第7和8外显子杂合缺失,母亲未检测到纯合或杂合缺失。

结论SMN1基因第7和(或)8外显子纯合缺失是SMA 致病主要原因,SMN2基因拷贝数增加与SMA 表型严重程度呈负相关。

18F-FDG_PET图像联合可解释的深度学习影像组学模型对原发性帕金森病和非典型性帕金森综合征的鉴

18F-FDG_PET图像联合可解释的深度学习影像组学模型对原发性帕金森病和非典型性帕金森综合征的鉴

18F-FDG PET图像联合可解释的深度学习影像组学模型对原发性帕金森病和非典型性帕金森综合征的鉴别诊断李晨阳1,王晨涵1,王静2,焦方阳2,徐蒨2,张慧玮2,左传涛2*,蒋皆恢1,3*1.上海大学生命科学学院生物医学工程研究所,上海200444;2.复旦大学附属华山医院PET中心,上海200235;3.核医学与分子影像四川省重点实验室,四川泸州646000;*通信作者蒋皆恢 ;左传涛【基金项目】国家自然科学基金(82272039,82021002,81971641);上海市卫生健康委老龄化和妇儿健康研究专项(2020YJZX0111);核医学与分子影像四川省重点实验室资助(HYX21004)【摘要】目的探究18F-FDG PET图像结合可解释的深度学习影像组学(IDLR)模型在原发性帕金森病(IPD)和非典型性帕金森综合征鉴别诊断中的应用价值。

资料与方法本横断面研究纳入2015年3月—2023年2月复旦大学附属华山医院帕金森病PET成像基准数据库330例帕金森病患者的18F-FDG PET图像,其中IPD 211例、进行性核上性麻痹(PSP)59例、多系统萎缩(MSA)60例;包括2个队列(训练组270例和测试组60例)。

采集所有受试者的18F-FDG PET图像及临床信息并进行比较。

开发一种IDLR提取特征指标,在影像组学特征的监督下从神经网络提取器收集的特征中筛选IDLR特征,并在测试组中构建二分类支持向量机模型,分别计算构建的IDLR模型、传统影像组学模型、标准化摄取值比值模型、深度学习模型在IPD/PSP/MSA组间两两分类的模型性能指标与曲线下面积。

采用100次10折交叉验证在2个队列中进行独立分类与测试。

通过特征映射展示大脑相关感兴趣区,使用梯度加权类激活图突出大脑中最相关的信息并可视化,检查不同疾病组的模型输出热力图,并将其与临床诊断位置进行比较。

结果IDLR模型在不同帕金森综合征患者中分类效果最好,测试组中的曲线下面积(MSA与IPD 0.935 7,MSA与PSP 0.975 4,IPD与PSP 0.982 5)优于其他模型(影像组学模型:Z=1.31~2.96,P均<0.05;标准化摄取值比值模型:Z=1.22~3.23,P均<0.05)。

《遗传病的诊断》PPT课件

《遗传病的诊断》PPT课件
分布
不同类型的遗传病在地理分布上也有 所不同,一些地区或种族的遗传病发 病率可能更高。
REPORT
CATALOG
DATE
ANALYSIS
SUMMAR Y
02
遗传病的诊断方法
临床诊断
总结词
通过观察患者的症状和体征,结合家族史和遗传学知识,对遗传病进行初步判 断。
详细描述
医生通过询问患者的病史、观察患者的症状和体征,了解家族遗传情况,从而 对可能的遗传病进行初步判断。这种方法简单易行,但准确度有限,需要结合 其他诊断方法进行确认。
基因组学技术
液体活检技术
随着基因组学技术的不断进步,未来 遗传病的诊断将更加精准和高效,能 够检测出更多的基因变异和遗传病相 关标记。
随着液体活检技术的发展,未来可能 实现无创、无痛、实时监测遗传病病 情,为患者提供更好的诊疗体验。
人工智能与大数据分析
人工智能和大数据分析的结合将为遗 传病诊断提供更强大的支持,通过深 度学习和模式识别技术,提高诊断的 准确性和效率。
REPORT
《遗传病的诊断》 ppt课件
汇报人:可编辑
2024-01-11
CATALOG
DATE
ANALYSIS
SUMMARY
目录
CONTENTS
• 遗传病概述 • 遗传病的诊断方法 • 常见遗传病的诊断 • 遗传病的预防与治疗 • 展望未来
REPORT
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DATE
ANALYSIS
SUMMAR Y
详细描述
镰状细胞贫血是由血红蛋白β链基因突变导致的疾病,患者可能会出现贫血、黄疸、脾肿大等问题。 诊断主要通过血液检测进行确认。
REPORT
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新编英语语法简明教程第18章

新编英语语法简明教程第18章

第18章数词和量词PRETESTMultiple choice:1)He wrote a _____report to describe the accident in detail.A.10 thousand wordB.10-thousand-wordC.10-thousands-wordD.10-thousands-words答案:B hundred, thousand, million, billion等表示确切的数字时不能用复数形式,由连字符连接的复合形容词当中的名词应该使用单数形式。

2)We are going to learn _____next week.A. Lesson TwelveB. Lesson TwelfthC. Twelfth LessonD. the Lesson Twelfth答案:A 第12课应该是“Lesson Twelve或者the Twelfth Lesson”。

3) The hero of the story is an artist in his_____.A.thirtiethB.thirty'sC.thirtyD. thirties答案:D in one’s thirties表示“在某人三十来岁的时候”。

4)Shortly after the accident, two_____ police were sent to the spot to keep order.A.dozen ofB.dozensC.dozenD. dozens of答案:C dozen和score在表示确切数字的时候后面不加-s,通常也不跟of。

5)Don't all speak at once! _____,please. A. Each at one time B. One by one time C. One for each time D. One at a time答案:D at a time每次,逐一,依次at one time曾经,一度6)He did it _____it took me.A.one-third a timeB.one-third timeC.the one-third timeD.one-third the time答案:D 首先前面应该是分数词,其次后面是特指的时间“the time”。

复旦大学大数据学院本科生课程学习手册-FudanUniversity

复旦大学大数据学院本科生课程学习手册-FudanUniversity

复旦大学大数据学院本科生课程学习手册目录第一章前言 (2)第二章大数据学院本科生培养模式 (3)2.1培养理念 (3)2.2数据科学与大数据技术“2+2”培养模式 (4)第三章课程体系 (4)3.1“2+2”培养体系 (5)3.2卓越计划 (10)第四章主要课程简介 (12)4.1专业必修课程 (12)4.2专业选修课程 (19)第五章未来发展 (25)5.1 未来深造 (25)5.2 就业前景 (27)第一章前言大数据伴随着信息技术革命应运而生, 互联网、物联网、移动通讯、行业企业等数据的大量汇聚使得数据演化为重要的生产力,逐渐成为经济的新资源、发展的新引擎、信息的新矿山、科研的新依据、决策的新源泉。

大数据的存取、交换、分析、应用对相关学科带来了诸多新挑战,在极大程度上改变了计算机科学、统计学和计算数学的内涵与外延:从硬件到软件、从存储到超算、从数据库到数据安全、从网络传输到并行计算、从数据分析到统计建模、从科学计算到优化方法等。

数据科学与大数据技术专业是教育部2015年批准新增设立的本科专业。

数据科学植根于数学、统计学、计算机科学等学科,但是在研究对象、方法论、学科体系等方面又与这些学科有显著不同。

数据科学的内涵包含了两个层次,第一个层次是以来源多样、结构各异、规模巨大、传输高速、应用广泛的大数据为研究对象,解决大数据在获取、处理、分析、展示与应用领域的理论与实践问题,如数据挖掘、机器学习、人工智能、数据库、统计计算等领域;第二个层次则是以大数据为研究手段的数据交叉科学,如生物信息、精准医疗、电子商务、大数据金融、智能电网、智慧城市等领域,大数据分析技术为这些学科提供了新的研究范式、也在解决这些学科计算复杂性问题的过程中获得近一步的发展。

由此可见,数据科学与大数据技术专业的内涵已经超出了传统学科的范畴,而是通过将统计分析、系统计算、交叉科学等有机整合,形成一套面向大数据分析全流程、大数据应用全产业链的完整知识体系,培养大数据复合型人才。

4-24 徐虹 肾脏遗传性疾病

4-24 徐虹 肾脏遗传性疾病

交流提纲
•儿童耐药肾病综合征相关基因 •CAKUT先天肾脏尿路发育畸形
肾病综合征(Nephrotic syndrome,NS)
• 肾小球滤过屏障受损引起的一组症候群 • 大量蛋白尿、低蛋白血症、高脂血症和水肿
– NS的描述可以追溯到15世纪; – 儿童常见的泌尿系统疾病之一; – 儿童年发病率1~3/10万人口,患病率16/ 10万人口; – 决定预后的因素是对激素治疗的反应 – SRNS预后不良
7
N(%)
CAKUT, mainly cause in CKD II-V 264
髓质囊性病变 肾小球疾病 原发性肾小球疾病 -局灶性节段性肾小球硬化 (FSGS) -系膜增生性肾小球肾炎 -膜性肾病 -轻微病变 -硬化性肾炎 -IgA肾病 -未肾穿 继发性肾小球疾病* 遗传性肾病 先天性肾病综合征 Alport综合征 其他综合征** 其他# 不明原因
复旦大学附属儿科医院资料
, ‫﯋‬ 9.76% 늼 ꇐ ꆲ, 43.90% 죏 ‫‬ ꊷ ꎳ , 46.34%
儿科医院CRF病因分析 1990年1月至2003年3月
孙利等 临床儿科杂志 2003 刘海梅等 实用儿科杂志 2 Children’s Hospital of Fudan University
Lancet, 2003, 362(9384):629-639.
NS的分类
• 病因分类 – 原发性肾病综合症(PNS) – 继发性肾病综合征(SNS) • 否有家族史分类 – 散发性肾病综合征(Sporadic NS) – 家族性肾病综合征(Familial NS) • 有无肾外表现分类 – 单纯型肾病综合征(Isolated NS) 发病年龄分类 先天性肾病(0~3个月) 婴儿型NS(4个月~12个月) 儿童早发型(13个月~5岁) 儿童迟发型(5岁~13岁) 青少年型(14岁~18岁) 成人型(>18岁) 激素治疗反应分类 激素敏感型肾病综合征(SSNS)

医学遗传学绪论

医学遗传学绪论
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第三节 医学遗传学的研究方法
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(一)群体筛查法:

通过对比一般群体和特殊群体的发病率(或特 定性状比率),对某一群体进行某种遗传病 (或特定性状)的筛查,获得该群体的发病率 (或特定性状比率)。
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(二)系谱分析法:

尽量全面地收集家族成员某 疾病的发病情况,绘成系谱 (pedigree),用以辨别疾 病是否为遗传病,获得其遗 传方式,开展遗传咨询及产 前诊断,以及探讨遗传异质 性等。
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医学遗传学(medical genetics)
一、定义:是运用遗传学原理和方法研究人类遗传性 状疾病的病因、病理、诊断、预防、治疗等的一门边 缘学科。 1.研究对象:人类有关遗传的疾病,即遗传病。 2.手段目的:通过研究遗传病的发生机制、传递方式、
诊断、治疗、预后、再发风险和预防方法,达到控制
遗传病在一个家庭中的再发,降低它在人群中的危害,
34
二、医学遗传学的兴起



1865,Mendel,现代遗传学创始人 1903,Sutton and Boveri,染色体遗传学说 1908,Hardy,Weinberg,群体遗传学开始 1910,Morgan,《基因论》提出基因概念, 1944,Avery,证明遗传物质是DNA 1953,Watson和Crick,DNA双螺旋结构发现, 开辟了分子生物学新纪元, 1977,Sanger,DNA测序方法建立 2001,NIH和DOE,人类基因组计划
30
第二节 医学遗传学发展简史
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一、遗传病的早期认识



先天性疾病(congenital disease): 出生缺陷(birth defect): 家族性疾病(familial disease):

KMT2D基因致病变异致Kabuki综合征新生儿14例病例系列报告并文献复习

KMT2D基因致病变异致Kabuki综合征新生儿14例病例系列报告并文献复习

基金项目㊀1上海市2020年度 科技创新行动计划 医学创新研究专项:20Z11900600;2申康促进市级医院临床技能与临床创新能力三年行动计划项目:SHDC2020CR6028⁃002作者单位㊀复旦大学附属儿科医院㊀上海,201102;1新生儿科,2内分泌遗传代谢科,3分子生物中心,4共同第一作者通讯作者㊀周文浩,email:zhouwenhao@fudan.edu.cn;杨琳,email:yanglin_fudan@163.com㊃论著㊃DOI:10.3969/j.issn.1673⁃5501.2021.02.011KMT2D基因致病变异致Kabuki综合征新生儿14例病例系列报告并文献复习陈晓青1,4㊀胡黎园1,4㊀王来栓1㊀程国强1㊀曹㊀云1㊀陈㊀超1㊀王慧君3㊀周文浩1㊀杨㊀琳2㊀㊀摘要㊀背景㊀Kabuki综合征(KS)是一种罕见的多发畸形综合征,主要临床表现为特殊面容㊁骨骼异常㊁智力障碍等㊂KMT2D基因致病变异所致KS占75%㊂目前KS诊断标准用于新生儿期诊断较为困难㊂目的㊀提出KMT2D基因突变所致KS在新生儿期的遗传筛查指征㊂设计㊀病例系列报告㊂方法㊀回顾性分析复旦大学附属儿科医院(我院)KMT2D基因突变所致KS新生儿的临床资料,检索2010至2020年报告的相关文献,提取新生儿临床特征㊂主要结局指标㊀KMT2D基因突变位点与新生儿临床表型㊂结果㊀根据455例KMT2D基因突变所致KS新生儿(我院14例,文献复习441例),新生儿期筛查指征包括:肌张力异常㊁骨骼异常㊁喂养困难㊁心脏异常㊁低血糖症和听力异常㊂结论㊀KMT2D基因突变所致KS新生儿期与儿童期临床表型谱差异较大,应建立新生儿期遗传筛查指征㊂关键词㊀KMT2D基因;㊀Kabuki综合征;㊀新生儿14casesofKabukisyndromecausedbyKMT2Dgenemutationinneonates:AcaseseriesreportandliteraturereviewCHENXiaoqing1,4,HULiyuan1,4,WANGLaishuan1,CHENGGuoqiang1,CAOYun1,CHENChao1,WANGHuijun3,ZHOUWenhao1,YANGLin2(Children'sHospitalofFudanUniversity,Shanghai201102,China;1DepartmentofNeonatology,2DepartmentofEndocrinology,GeneticsandMetabolism,3CenterofMolecularBiology,4Co⁃firstauthor)CorrespondingAuthor:ZHOUWenhao,email:zhouwenhao@fudan.edu.cn;YANGLin,email:yanglin_fudan@163.comAbstractBackgroundKabukisyndrome(KS)isararemulti⁃deformitiessyndromewithmajorclinicalmanifestationssuchasfacialabnormalities,skeletalabnormalitiesandmentalretardation.Seventy⁃fivepercentofKSiscausedbyKMT2Dgenepathogenicvariation.AccordingtocurrentdiagnosticcriteriaofKS,itisdifficulttomakediagnosisofKSintheneonatalperiodofpatients.ObjectiveToproposethegeneticscreeningindicationsofKSinneonatalperiodcausedbyKMT2Dgenemutation.DesignCaseseriesreport.MethodsWeextractedclinicalcharacteristicsfrompatients,whowerediagnosedwithKScausedbyKMT2DgenepathogenicvariationinChildren'sHospitalofFudanUniversityandrelevantliteraturereportedfrom2010to2020.MainoutcomemeasuresMutationsitesofKMT2Dgeneandclinicalcharacteristicsofpatientsinneonatalperiod.ResultsAccordingto455casesofKSnewbornscausedbyKMT2Dgenemutation(14casesfromCHFU,441casesfromliterature),theneonatalgeneticscreeningindicationsincludeddystonia,skeletalabnormalities,feedingdifficulties,cardiacabnormalities,hypoglycemiaandhearingabnormalities.ConclusionThephenotypicspectrumofchildrenwithKScausedbyKMT2Dmutationisdifferentbetweenneonatesandchildren,andgeneticscreeningindicationsofneonatesshouldbeestablished.Keywords㊀KMT2Dgene;㊀Kabukisyndrome;㊀Neonate㊀㊀Kabuki综合征(KS,MIM:147920,300867)又称歌舞伎综合征,是一种罕见的多发畸形综合征,发病率为1/32000,1981年由日本学者首次提出[1]㊂该病的主要临床表现为特殊面容㊁骨骼异常㊁皮纹异常㊁智力障碍等,目前已知的遗传性致病原因包括KMT2D基因和KDM6A基因突变,其中KMT2D基因致病变异约占75%,为常染色体显性遗传方式[2]㊂KMT2D基因编码组蛋白H3赖氨酸4(H3K4)甲基转移酶,该酶通过调控转录激活参与调控胚胎生长发育相关基因,从而影响各器官正常生长发育[3]㊂有动物实验表明,KMT2D基因敲除可出现颅面异常[4]㊁心脏结构缺陷[5]㊁代谢异常[6]等表型,造成胚胎发育异常㊂目前该病的诊断主要依靠特征性临床表现,但在新生儿期患儿的面部特征并不明显,智力㊁发育障碍等表型在儿童期才逐渐显现,因此该病在新生儿期的诊断率较低[7]㊂本文回顾性分析复旦大学附属儿科医院(我院)通过高通量测序分析检测的KMT2D基因相关致病变异致Kabuki综合征患儿的临床信息和基因检测结果,并进行文献复习,总结KMT2D基因突变所致Kabuki综合征新生儿期的主要临床表现,并提出遗传筛查指征,以提高该病在新生儿期的诊断率,便于早期干预和疾病管理㊂1㊀方法1.1㊀病例纳入标准㊀我院NICU参与 新生儿基因组计划 ㊁检测到KMT2D基因致病/可疑致病变异且出现已报道Kabuki综合征相关临床表型的患儿㊂㊀㊀ 新生儿基因组计划 于2016年1月启动,通过对NICU患儿进行基因高通量测序分析,构建中国新生儿基因组数据库,建立新生儿遗传病基因检测标准㊂ 新生儿基因组计划 纳入标准为:①NICU新生儿期患儿;②存在多脏器结构畸形或功能缺陷;③常规治疗效果不佳;④存在无法用现有诊断明确解释的症状及体征㊂1.2㊀高通量测序分析㊀本文病例血标本处理㊁测序㊁变异分析和结果解读均参照我院分子诊断中心建立的高通量测序数据分析和临床诊断流程2.0[8]㊂采集外周静脉血,使用天根生化科技(北京)有限公司血液基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取,使用NanoDrop紫外分光光度仪测定其浓度㊂1.3㊀临床资料提取㊀从我院病历系统提取患儿临床信息:性别㊁主诉㊁出生史㊁临床发现㊁基因检测送检年龄㊁诊断等信息㊂1.4㊀文献检索及筛选㊀检索PubMed㊁万方㊁维普和中国知网数据库,以 Kabukisyndrome ㊁ KMT2DORMLL2 为英文关键词,以 Kabuki综合征或歌舞伎综合征 ㊁ KMT2D或MLL2 为中文关键词,检索时间为2010年10月20日至2020年10月20日,通过阅读摘要和全文筛选出KMT2D基因相关Kabuki综合征病例系列报告的文献,以及KMT2D基因相关Kabuki综合征新生儿期病例表型描述的文献㊂1.5㊀文献纳入排除标准㊀①基因检测结果仅为致病或可能致病的KMT2D基因变异的Kabuki综合征,②临床表型描述中包括新生儿期表型㊂1.6㊀文献排除标准㊀基础研究㊁综述㊁指南㊁单表型研究㊁KMT2D基因致肿瘤㊂1.7㊀统计学处理㊀采用SPSS20.0统计学软件进行临床资料的描述性分析㊂正态分布的计量资料以x̄ʃs表示,非正态分布的计量资料以中位数表示㊂计数资料以n(%)表示,使用卡方检验比较发生率的差异,P<0.05为差异有统计学意义㊂2㊀结果2.1㊀基因检测结果㊀符合本文病例纳入标准的新生儿14例,男9例(64.3%),女5例;早产2例㊂其中10例行panel测序,4例行WES测序㊂图1显示,共检测出KMT2D基因的14个变异位点,其中已知致病变异5个,新发致病变异9个;移码突变9个,错义突变2个,无义突变2个,剪接变异1个㊂5例进行了家系验证,均为新发突变㊂图1㊀KMT2D基因致病变异分布注㊀NA:未做2.2㊀临床特征㊀图2显示,14例新生儿中,面容异常9例,包括腭裂2例(例1和10),例4既有小下颌畸形也有前额突出,大耳廓4例(例8㊁9㊁12和14),耳外形畸形2例(例2和7);肌张力异常7例(例3 5㊁7㊁8㊁10和11);听力异常3例(例8㊁11㊁12);肾脏异常6例(例1㊁3㊁4㊁5㊁8和11):多囊肾2例,位置异常2例,左肾偏小1例,马蹄肾1例;心脏异常6例:例1动脉导管未闭(PDA)和卵圆孔未闭(PFO)㊁例3PDA和房间隔缺损(ASD),例4ASD和PDA,例5主动脉缩窄(CoA)和PFO,例8ASD,例13CoA;内分泌异常6例:低血糖症3例(例4 6),低血糖症伴甲状腺功能减退1例;胰岛素水平未测,甲状腺素异常3例(例3㊁5和7);骨骼畸形5例(例7㊁8㊁10㊁11和14);例5喂养困难㊂2.3㊀文献检索结果㊀共检索到KMT2D基因相关Kabuki综图2㊀KMT2D基因相关Kabuki综合征新生儿期表型特征总结合征文献177篇,56篇[1,2,7,9⁃61]进入本文分析㊂㊀㊀新生儿期诊断Kabuki综合征,提取新生儿期出现的所有临床表型;非新生儿期诊断Kabuki综合征,同时提取在新生儿期和非新生儿期发现的临床表型㊂需要说明的是,非新生儿期描述但新生儿期未提及的面容异常㊁耳部外形异常不被统计,但非新生儿期出现的疾病,可以溯源到新生儿期检测即可发现,纳入统计(如先天性心脏病)㊂56篇文献共提取到441例诊断Kabuki综合征患儿的临床表型㊂㊀㊀综合本文总结的病例(455例)临床表型,图2显示,(1)肌张力异常111/127例(80.1%),其中肌张力增高文献汇总中2例,本文病例1例,且均有围生期缺氧缺血病史;(2)骨骼异常196/285例(68.8%),主要表现为先天性髋关节发育不良㊁手指第五指短指畸形㊁关节活动过度和脊柱畸形;(3)面容异常30/44例(68.1%);(4)喂养困难98/150例(65.3%);(5)心脏异常187/383例(48.8%);(6)低血糖症25/56例(44.6%);(7)听力异常56/148例(37.8%);(8)肾脏输尿管异常109/307例(35.5%),主要表现为马蹄肾㊁异位肾㊁小肾畸形㊁输尿管重复畸形和肾发育不全;(9)眼睛异常29/96例(30.2%),主要表现为斜视㊁视神经盘异常㊁先天性白内障和眼眶囊肿,本文病例未记录此表型;(10)甲状腺激素异常19/71例(26.8%),其中甲状腺激素增高文献汇总2例,本文报告1例,余均为甲状腺功能减退;(11)胆道闭锁4/29例(13.8%),本文病例未记录此表型㊂2.4㊀Kabuki综合征诊断标准在新生儿期诊断评估㊀Kabuki综合征2018年国际诊断共识[62]提出:对于任何年龄段的男性或女性患者,患有婴儿性肌张力减退㊁发育迟缓和/或智力低下且符合以下1项或2项指标㊂(1)致病或可能致病的KMT2D或KDM6A基因变异㊂(2)患者任何阶段出现典型面部特征长睑裂伴下眼睑1/3外翻和如下中的ȡ2项表现:①拱形且宽的眉毛伴外1/3缺失或稀疏;②鼻柱短小伴扁鼻尖;③大且突出的杯状耳;④持续性胎儿指垫㊂据此对本文总结的病例(455例)进行评估:肌张力减退符合率77.2%(98/127),文献汇总符合率81.4%(92/113),本文病例符合率42.9%(6/14),新生儿期无法判断诊断标准中的发育迟缓㊁智力低下和持续性胎儿指垫㊂面容异常符合率0.2%(1/441),本文病例无此表现描述,诊断标准中的面容异常在新生儿期难以识别㊂2.5㊀KMT2D相关Kabuki综合征新生儿期筛查指征㊀由于Kabuki综合征2018年国际诊断共识不适用新生儿期Kabuki综合征的诊断,综合本文总结的病例(455例)的临床表型,提出以下遗传筛查指征:①肌张力异常占87.4%;②骨骼异常(关节活动过度/手指第五指短指畸形/先天性髋关节发育不良)占68.8%;③喂养困难占65.3%;④心脏异常占48.8%;⑤低血糖症占44.6%;⑥听力异常占37.8%㊂3㊀讨论㊀㊀KMT2D基因位于12q13.12,全长36.3kb,共包含54个外显子,该基因突变为Kabuki综合征的主要致病原因㊂Kabuki综合征的诊断主要依靠典型的临床特征[62]:以长睑裂伴下眼睑1/3外翻为主要特征的面容异常,生长发育落后,智力障碍,心脏㊁肾脏等器官先天性异常等㊂由于该综合征可识别典型面部特征的出现时间多在3 12岁,早期患儿的面部异常不易识别,青春期下眼睑外翻表型可能消失;发育迟缓表型出现较晚且对患儿造成严重后果,因此总结Kabuki综合征新生儿期表型,提出新生儿期筛查指征对于Kabuki综合征早期诊断和干预尤为重要㊂㊀㊀肌张力异常和喂养困难表型在新生儿期发现比例高,分别为87.4%和65.3%㊂肌张力低下可造成患儿吮吸㊁吞咽功能下降,进而造成喂养困难㊂围生期缺氧缺血也可导致新生儿肌张力异常,需结合病史和影像学检查进一步鉴别诊断㊂Kabuki综合征2018年国际诊断共识中,婴儿期肌张力低下是诊断标准之一,其体征在新生儿期较早出现且易于识别,因此有必要将肌张力异常㊁喂养困难纳入Kabuki综合征新生儿期筛查指征㊂㊀㊀先天性心脏病表型在新生儿期发现比例为48.8%,由于心脏异常在新生儿期较易识别,因此将其纳入Kabuki综合征新生儿期筛查指征㊂患儿心脏异常表型主要为PFO㊁PDA㊁ASD和CoA,也有主动脉瓣反流㊁二尖瓣反流报告,多为心脏听诊和心脏超声检查发现,患儿无呼吸窘迫㊁心脏衰竭等严重先天性心脏病临床表现,但少数患儿存在反复肺部感染㊂早期识别患儿心脏异常有助于早期手术治疗,防止造成不良预后㊂㊀㊀低血糖症在Kabuki综合征新生儿期发现比例为44.6%,常表现为反复发作的低血糖症,伴随胰岛素水平过高,对二氮嗪治疗反应较好,临床诊断为高胰岛素性低血糖症;也有少数报告低血糖症伴随生长激素低下,患儿青春期出现身材矮小等生长激素缺乏临床表现,临床诊断为生长激素缺乏性低血糖症[12]㊂严重的低血糖症患儿可出现反应低下㊁多汗㊁皮肤苍白,持续和反复发作可引起中枢神经㊁视神经损害,造成不良预后㊂因此建议Kabuki综合征患儿进行持续的血糖监测,以便及时识别不易察觉的低血糖并及时治疗,防止持续性低血糖造成的神经系统影响㊂㊀㊀面容异常为Kabuki综合征最典型的临床表现㊂Kabuki综合征2018年国际诊断共识[62]中特别提出睑裂的标准测量方法:检查者与患儿坐于同一水平线,患儿头部保持中立位置,眼睛视向天花板,进而测得内眦到外眦的距离㊂新生儿期面容异常尚未表现或不易识别,因其不影响一般生命体征常被忽略,且新生儿难以配合医师进行标准测量,因此新生儿的长睑裂表型判断困难,不易标准化㊂㊀㊀由于高通量测序分析非新生儿常规检查项目,因此依靠Kabuki综合征2018年国际诊断共识中提出的临床表型在新生儿期完成Kabuki综合征诊断十分困难㊂本文综合总结的455例临床表型,提出Kabuki综合征遗传筛查指征:肌张力异常,骨骼异常:关节活动过度/手指第五指短指畸形/先天性髋关节发育不良,喂养困难,心脏异常,低血糖症,听力异常㊂当出现上述症状和体征时,应高度怀疑KMT2D基因相关Kabuki综合征可能性,进行遗传学评估和干预㊂参考文献1 LIUS HONGX SHENC etal.Kabukisyndrome aChinesecaseseriesandsystematicreviewofthespectrumofmutations.BMCMedGenet 2015 16 26.2 HANNIBALMC BUCKINGHAMKJ NGSB etal.SpectrumofMLL2ALR mutationsin110casesofKabukisyndrome.AmJMedGenetA 2011 155A 7 1511⁃1516.3 FROIMCHUKE JANGY GEK.HistoneH3lysine4methyltransferaseKMT2D.Gene 2017 627 337⁃342.4 VanLAARHOVENPM NEITZELLR QUINTANAAMetal.KabukisyndromegenesKMT2DandKDM6A functionalanalysesdemonstratecriticalrolesincraniofacial heartandbraindevelopment.HumMolGenet 2015 24 15 4443⁃4453.5 ANGSY UEBERSOHNA SPENCERCI etal.KMT2DregulatesspecificprogramsinheartdevelopmentviahistoneH3lysine4di⁃methylation.Development 2016 143 5 810⁃821.6 KIMDH RHEEJC YEOS etal.Crucialrolesofmixed⁃lineageleukemia3and4asepigeneticswitchesofthehepaticcircadianclockcontrollingbileacidhomeostasisinmice.Hepatology 2015 61 3 1012⁃1023.7 DENTICIML DiPEDEA LEPRIFR etal.Kabukisyndrome clinicalandmoleculardiagnosisinthefirstyearoflife.ArchDisChild 2015 100 2 158⁃164.8 杨琳董欣然彭小敏等.复旦大学附属儿科医院高通量测序数据分析流程第二版对遗传疾病候选变异基因筛选用时和准确性分析.中国循证儿科杂志2018 13 2 118⁃123.9 STANGLERHŠ MARCUNVN NKV etal.DenovoKMT2Dheterozygousframeshiftdeletioninanewbornwithacongenitalheartanomaly.BalkanJMedGenet 2020 23 1 83⁃90.10 PIROE SCHIERZI ANTONAV etal.Neonatalhyperinsulinemichypoglycemia casereportofkabukisyndromeduetoanovelKMT2Dsplicing⁃sitemutation.ItalJPediatr 2020 46 1 136.11 MSRLGILM YLDZY AKNO etal.Ararecauseofhyperinsulinemichypoglycemia Kabukisyndrome.JClinResPediatrEndocrinol 2020 doi 10.4274/jcrpe.galenos.2020.2020.0065.12 HOERMANNH EL⁃RIFAIO SCHEBEKM etal.Comparativemeta⁃analysisofKabukisyndromewithandwithouthyperinsulinaemichypoglycaemia.ClinEndocrinolOxf 2020 93 3 346⁃354.13 PHETTHONGT TIM⁃AROONT KHONGKRAPANA etal.Kabukisyndromewithmidgutmalrotationandhyperinsulinemichypoglycemia Arareco⁃occurrencefromThailand.AmJMedGenetA 2020 182 8 1873⁃1876.14 BALDRIDGED SPILLMANNRC WEGNERDJ etal.PhenotypicexpansionofKMT2D⁃relateddisorder BeyondKabukisyndrome.AmJMedGenetA 2020 182 5 1053⁃1065.15 CUVERTINOS HARTILLV COLYERA etal.ArestrictedspectrumofmissenseKMT2DvariantscauseamultiplemalformationsdisorderdistinctfromKabukisyndrome.GenetMed 2020 22 5 867⁃877.16 YAPCS JAMUARSS LAIA etal.IdentificationofKMT2DandKDM6AvariantsbytargetedsequencingfrompatientswithKabukisyndromeandothercongenitaldisorders.Gene 2020 731 144360.17 WANGY LIN SUZ etal.ThephenotypicspectrumofKabukisyndromeinpatientsofChinesedescent Acaseseries.AmJMedGenetA 2020 182 4 640⁃651.18 DALYT ROBERTSA YANGE etal.HoloprosencephalyinKabukisyndrome.AmJMedGenetA 2020 182 3441⁃445.19 LUPERCHIOTR APPLEGATECD BODAMERO etal.HaploinsufficiencyofKMT2DissufficienttocauseKabukisyndromeandiscompatiblewithlife.MolGenetGenomicMed 2020 8 2 e1072.20 AREF⁃ESHGHIE BOURQUEDK KERKHOFJ etal.Genome⁃wideDNAmethylationandRNAanalysesenablereclassificationoftwovariantsofuncertainsignificanceinapatientwithclinicalKabukisyndrome.HumMutat 2019 4010 1684⁃1689.21 GEERSNC THIOHB deKORTW.CapillarymalformationsinachildwithKabukisyndrome Acasereport.JAADCaseRep 2019 5 6 560⁃562.22 LINPA TSENGSH LAIIW etal.Bilateralcongenitalcornealopacitiesasanearly⁃onsetocularfeatureofKabukisyndrome.Cornea 2019 38 9 1182⁃1184.23 ARSOVT SESTANM CEKADAN etal.Systemiclupuserythematosus AnewautoimmunedisorderinKabukisyndrome.EurJMedGenet 2019 62 6 103538.24 MOONJE LEESJ KOCW.AdenovoKMT2DmutationinagirlwithKabukisyndromeassociatedwithendocrinesymptoms acasereport.BMCMedGenet 2018 19 1102.25 TERANISHIH KOGAY NAKASHIMAK etal.CancermanagementinKabukisyndrome ThefirstcaseofWilmstumorandaliteraturereview.JPediatrHematolOncol 2018 40 5 391⁃394.26 SAKATAS OKADAS AOYAMAK etal.IndividualclinicallydiagnosedwithCHARGEsyndromebutwithamutationinKMT2D ageneassociatedwithKabukiSyndrome Acasereport.FrontGenet 2017 8 210.27 LEPRIFR COCCIADIFERROD AUGELLOB etal.ClinicalandneurobehavioralfeaturesofthreenovelKabukisyndromepatientswithmosaicKMT2Dmutationsandareviewofliterature.IntJMolSci 2017 19 1 82.28 TOPAA SAMUELSSONL LOVMARL etal.OnthesignificanceofcraniosynostosisinacaseofKabukisyndromewithaconcomitantKMT2Dmutationand3.2Mbpdenovo10q22.3q23.1deletion.AmJMedGenetA 2017 173 8 2219⁃2225.29 LEHMANN MAZERYAC VISIERA etal.Molecular clinicalandneuropsychologicalstudyin31patientswithKabukisyndromeandKMT2Dmutations.ClinGenet 2017 92 3 298⁃305.30 HAANPÄÄM SCHLECHTH BATRAG etal.Interrupted/bipartiteclavicleasadiagnosticclueinKabukisyndrome.AmJMedGenetA 2017 173 4 1115⁃1118.31 GOLEH CHUKR COMAND.PersistenthyperinsulinisminKabukisyndrome2 Casereportandliteraturereview.ClinPract 2016 6 3 848.32 LUJ MOG LINGY etal.AnovelKMT2DmutationresultinginKabukisyndrome Acasereport.MolMedRep 2016 14 4 3641⁃3645.33 LONGA SINKOVSKAYAES EDMONDSONAC etal.Kabukisyndromeasacauseofnon⁃immunefetalhydrops/ascites.AmJMedGenetA 2016 170 12 3333⁃3337.34 BÖGERSHAUSENN ALTUNOGLUU BELEGGIAF etal.AnunusualpresentationofKabukisyndromewithorbitalcysts microphthalmia andcholestasiswithbileductpaucity.AmJMedGenetA 2016 170 12 3282⁃3288.35 PAD ROV J HOLUBOV A SIMANDLOV M etal.Moleculargeneticanalysisin14CzechKabukisyndromepatientsisconfirmingtheutilityofphenotypicscoring.ClinGenet 2016 90 3 230⁃237.36 ROMAD PALMAP CAPOLINOR etal.SpinalependymomainapatientwithKabukisyndrome acasereport.BMCMedGenet 2015 16 80.37 GOHDAY OKAS MATSUNAGAT etal.NeonatalcaseofnovelKMT2DmutationinKabukisyndromewithseverehypoglycemia.PediatrInt 2015 57 4 726⁃728.38 LINJL LEEWI HUANGJL etal.ImmunologicassessmentandKMT2DmutationdetectioninKabukisyndrome.ClinGenet 2015 88 3 255⁃260.39 CHEONCK SOHNYB KOJM etal.IdentificationofKMT2DandKDM6AmutationsbyexomesequencinginKoreanpatientswithKabukisyndrome.JHumGenet 2014 59 6 321⁃325.40 SCHULZY FREESEL MÄNZJ etal.CHARGEandKabukisyndromes aphenotypicandmolecularlink.HumMolGenet 2014 23 16 4396⁃4405.41 CAPPUCCIOG ROSSIA FONTANAP etal.BronchialisomerisminaKabukisyndromepatientwithanovelmutationinMLL2gene.BMCMedGenet 2014 15 15.42 GIORDANOP LASSANDROG SANGERARDIM etal.AutoimmunehaematologicaldisordersintwoItalianchildrenwithKabukisyndrome.ItalJPediatr 2014 40 10.43 SUBBARAYANA HUSSAINK.HypoglycemiainKabukisyndrome.AmJMedGenetA 2014 164A 2 467⁃471.44 MIYAKEN KOSHIMIZUE OKAMOTON etal.MLL2andKDM6AmutationsinpatientswithKabukisyndrome.AmJMedGenetA 2013 161A 9 2234⁃2243.45 MAKRYTHANASISP vanBONBW STEEHOUWERM etal.MLL2mutationdetectionin86patientswithKabukisyndrome agenotype⁃phenotypestudy.ClinGenet 2013 846 539⁃545.46 BRACKMANNF KRUMBHOLZM LANGERT etal.NovelMLL2mutationinKabukisyndromewithhypogammaglobulinemiaandseverechronicthrombopenia.JPediatrHematolOncol 2013 35 7 e314⁃e316.47 BANKAS HOWARDE BUNSTONES etal.MLL2mosaicmutationsandintragenicdeletion⁃duplicationsinpatientswithKabukisyndrome.ClinGenet 2013 83 5 467⁃471.48 KOKITSU⁃NAKATANM PETRINAL HEARDJP etal.AnalysisofMLL2geneinthefirstBrazilianfamilywithKabukisyndrome.AmJMedGenetA 2012 158A 8 2003⁃2008.49 BANKAS VEERAMACHANENIR REARDONW etal.HowgeneticallyheterogeneousisKabukisyndrome MLL2testingin116patients reviewandanalysesofmutationandphenotypicspectrum.EurJHumGenet 2012 20 4 381⁃388.50 LIY BÖGERSHAUSENN ALANAYY etal.AmutationscreeninpatientswithKabukisyndrome.HumGenet 2011 130 6 715⁃724.51 PAULUSSENAD STEGMANNAP BLOKMJ etal.MLL2mutationspectrumin45patientswithKabukisyndrome.HumMutat 2011 32 2 E2018⁃E2025.52 李洁玲曹洁.Kabuki综合征2例报告.临床儿科杂志2018 36 1 53⁃56.53 张含滋陈倩姬辛娜等.Kabuki综合征伴癫痫2例报告.神经疾病与精神卫生2019 19 1 102⁃105.54 王红梅王晓慧吴沪生等.Kabuki综合征临床和实验室特点及基因诊断.中华儿科杂志2018 56 11 846⁃849.55 陈艳丽陶长忠.KMT2D基因突变所致Kabuki综合征1例报告并文献复习.基层医学论坛2020 24 4 460⁃462.56 杨桂花孙艳芳李慧源等.KMT2D基因新发变异致Kabuki综合征1例报告.临床儿科杂志2020 38 6467⁃471.57 邱士伟袁永一.KMT2D基因致病新变异引起的Kabuki综合征的耳聋表型分析.临床耳鼻咽喉头颈外科杂志2019 33 9 820⁃824.58 陶雪花张士发唐宗生.歌舞伎综合征KMT2D基因型1例.皖南医学院学报2020 39 5 508⁃510.59 上官华坤苏畅巩纯秀等.KMT2D或KDM6A基因突变致歌舞伎综合征4例并文献复习.中华实用儿科临床杂志2019 22 1738⁃1739.60 代晓微郑连文徐影等.一例歌舞伎化妆综合征KabukiSyndrome 患儿的病例及遗传学分析.中国优生与遗传杂志2018 26 2 85⁃86.61 凌晨徐慧刘金荣等.婴儿期歌舞伎脸谱综合征1例.中华实用儿科临床杂志2016 2 156⁃157.62 ADAMMP BANKAS BJORNSSONHT etal.Kabukisyndrome internationalconsensusdiagnosticcriteria.JMedGenet 2019 56 2 89⁃95.(收稿日期:2021⁃01⁃11㊀修回日期:2021⁃04⁃14)(本文编辑:张崇凡)。

儿科学_复旦大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年

儿科学_复旦大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年

儿科学_复旦大学中国大学mooc课后章节答案期末考试题库2023年1.生长突增发生在参考答案:第二性征出现之前2.女性初潮平均年龄为参考答案:12~14岁3.下列哪项检查有助于诊断生长激素缺乏症参考答案:胰岛素刺激试验4.先天性甲状腺功能减低症的最常见原因为参考答案:甲状腺不发育或发育不良5.以下哪点不是小儿低血糖的常见病因参考答案:先天性肾上腺皮质增生症6.唐氏综合征的染色体核型是什么参考答案:21三体7.中毒时催吐的禁忌症为参考答案:昏迷者8.下面哪项提示存在重度休克参考答案:毛细血管充盈时间长于3秒9.重度消瘦的诊断标准是参考答案:其体重低于同性别同身高参照人群值的均数减3个标准差10.有关正常小儿骨化中心的发育下列哪项是错误的:参考答案:婴儿早期腕部骨化中心有4个11.女婴,11个月,其营养需要与成人最主要的不同之处是参考答案:生长发育所需的营养素和热量12.婴儿每日需摄入水份量为参考答案:150ml/kg13.人乳和牛乳相比下列哪项是错误的?参考答案:人乳含钙较多14.轻度肥胖的标准为小儿体重超过同性别同身高正常儿均值的参考答案:20-29%15.在维生素D的代谢中,活性最强的是:参考答案:1,25-二羟胆骨化醇16.佝偻病活动期(激期),主要临床特点是:参考答案:骨骼系统改变17.未结合胆红素进入肝脏后主要通过什么酶的催化作用形成结合胆红素:参考答案:鸟苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶(UDPGT)18.新生儿败血症最常见的并发症是:参考答案:化脓性脑膜炎19.新生儿缺氧缺血性脑病最常见的原因是参考答案:围生期窒息20.以下颅内出血类型哪项最常发生在极低出生体重儿参考答案:脑室周围-脑室内出血21.足月新生儿,生后4天因不吃、不哭、黄疸而入院,检体发现:患儿全身黄染,反应差,呼吸急促,面色灰,两肺闻细湿啰音,心率160次/分,肝肋下4 cm,脾肋下1 cm,质硬,两下肢有硬肿。

最可能的诊断是参考答案:新生儿败血症22.缓解支气管哮喘急性发作的首选治疗方法为:参考答案:吸入短效β2受体激动剂23.可以出现全身各系统临床表现,如溶血性贫血、心肌炎、脑膜炎等的肺炎是参考答案:肺炎支原体肺炎24.易发生脓胸、脓气胸、肺大泡的肺炎是参考答案:金黄色葡萄球菌肺炎25.下列除去哪一项外,均为房间隔缺损的表现?参考答案:主动脉影不缩小26.先天性心血管畸形发生在哪个胚胎发育时期?参考答案:2~8周27.卡介苗的接种方法为参考答案:皮内注射28.婴儿期计划免疫,下列哪项正确?参考答案:2个月开始脊髓灰质炎疫苗29.儿童保健的工作内容包括参考答案:预防疾病_口腔、听力和眼保健_体格生长和神经、精神发育的监测_早期儿童发展和宣教普及科学育儿知识30.幼儿3岁,身高90cm,体重14kg,牙20只,可考虑:参考答案:在正常范围内31.下列小儿生长发育的一般规律中哪一点是错误的:参考答案:由远到近32.11岁女孩,身高132cm,学习成绩好。

福建医科大学医学遗传学选择题题库规范

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1.遗传病特指A.先天性疾病B.家族性疾病C.遗传物质改变引起的疾病D.不可医治的疾病E.既是先天的,也是家族性的疾病2.Down综合症是A单基因病 B. 多基因病 C. 染色体病D. 线粒体病E. 体细胞病3.脆性X综合症是A.单基因病B.多基因病C.染色体病D.线粒体病E.体细胞病4.人类基因组计划物理图研究所用的位标是A.STRB.RFLPC.SNPD.STSE.EST5.遗传密码中的四种碱基一般是指A.AUCGB.ATUCC.AUTGD.ATCGE.ACUG6.结构基因序列中增强子的作用特点为A.有明显的方向性,从5ˊ→3ˊ方向B. 有明显的方向性,从3ˊ→5ˊ方向C.只能在转录基因的上游发生作用D.只能在转录基因的下游发生作用E.具有组织特异性7.引起DNA发生移码突变的因素是A.焦宁类B.羟胺C.甲醛D.亚硝酸E.5—溴尿嘧啶8.染色体结构畸变属于A.移码突变B. 动态突变C. 片段突变D. 转换E. 颠换9.不改变氨基酸编码的基因突变为A.同义突变B.错义突变C. 无义突变D.终止密码突变E.移码突变10.属于颠换的碱基替换为A.G和TB.A和GC.T和CD.C和UE.T和U11.系谱绘制是从家族中第一个就诊或被发现的患病成员开始的,这一个体称A.受累者B.携带者C.患者D.先证者E.以上都不对12.一个女性将常染色体上的某一突变基因传给她孙女的概率是A.1/2B.1/4C. 1/8D. 1/16E.以上都不是13.一个男性将X染色体上的某一突变基因传给她孙女的概率是A.1/2B.1/4C. 1/8D. 1/16E.以上都不是14.一个男性将X染色体上的某一突变基因传给她外孙女的概率是A.1/2B.1/4C. 1/8D. 1/16E.以上都不是15.一个PKU患者(AR)与一表型正常的人结婚后,生有一个PKU患儿,他们再次生育的患病风险是A.0B.12.5%C.25%D.50%E.75%16.在X连锁显性遗传中,患者的基因型最多的是A.XAXAB.XAXaC.XaXaD.YAYE.XaY17.一对表型正常的夫妇,连生了两个苯丙酮尿症患儿。

分子诊断学遗传性疾病的分子诊断

分子诊断学遗传性疾病的分子诊断
高的氧的亲合力,使组织供氧不足导致贫血
1. α地中海贫血的分子机制 α+地贫
缺失型 α0地贫
1)α+地贫: 左侧缺失:α2基因
右侧缺失:α2基因3ˊ端和α1基因5ˊ端构成 融合 基因
2) α0地贫
①缺失α珠蛋白到α1基因5ˊ端缺25kb ②只有ζ基因缺17.4kb ③ζ和Ψζ基因缺17.5kb ④ 缺失α2基因和α1基因5ˊ端缺5.2kb
临床表现:进行性恶化的运动、认知及精神障 碍的三联征。
七.脆性X综合征(fragile X syndrome, FraX)
遗传性智力缺陷疾病 FMR-1基因 分子诊断方法: ① Southern blotting ② PCR法 ③ 微卫星序列分析法
Section 3 产前(包括胚胎植入前)遗传缺陷 的分子诊断
Cystic fibrosis:囊胞性纤维症 heteroduplex:异源双链核酸分子 Hybridization:杂交
6. Huntington’s disease(HD) involves a polymorphic(CAG) repeat sequence located in exon 1 of the IT15 gene at 4p16.3. HD can be accurately confirmed or excluded by PCR-based assay.
2. 片段性突变的检测:指DNA分子中较大范围的 碱基发生突变
方法:Southern blotting、多重PCR
二.基因多态性连锁分析
间接诊断,在家系中进行连锁分析和关联分析 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP),第3代遗传标记
三.基因突变的定量诊断

基因编辑与遗传病治疗

基因编辑与遗传病治疗

基因编辑与遗传病治疗席海瑞卢大儒各种遗传病给人类社会带来巨大困扰基因治疗从概念提出到临床应用.遗传病的基因治疗一直是研究重点慢病毒和腺相关病毒在遗传病的基因治疗上获得一定效果.但对更多遗传病无可奈何基因编辑工具的出现给遗传病治疗带来了新曙光.但在实际应用中需要制定规范、达成国际共识.科学家必须受生物医学伦理道德的约束、十传病是由于遗传物质的改变,包括染色体畸变、染色体匕基因突变•所导致的疾人亠病.它完全或部分由遗传因素决定.通常表现为先天性,也町由后天因素影响导致发生遗传病主要分为因染色体数目或结构改变而引起的染色体病或染色体综合征,如21三体综合征(又称唐氏综合征)、猫叫综合征等;单基因突变引起的单基因病,如B-地中海贫血症、血友病等;多个基因突变引起的多基因病,如脊柱裂、无脑儿等遗传病被发现之前,就已长期困扰着人类.特别是单基因遗传病,已发现的单基因病有6500多种虽然婚前检查及孕后筛查可防止一部分遗传病患儿出生.但是每年还是有相当数凰的患有遗传疾病的婴儿诞生.包括之前因无筛查条件而出生的人群,遗传病给家庭及社会带来了巨大的负担治疗遗传病成为生物医学科研人员的头号难题.基因治疗的曙光与局限从1950年代沃森和克里克证明遗传物质是DNA 开始,科学家就发现人类的很多疾病归因于DNA层面出了问题,特别是各种各样的遗传病:I960年代,莱德伯格(J.Lederberg)提出基因治疗的最初概念:利用正常的外源基因取代患者的变异基因:1970年代.科学家认为遗传病治疗未来面对的主要问题是临床基因治疗〔主要难点是如何精确控制外源DNA进入细胞,并正确进入染色体上的确切位置而行使其功能之后,科席海瑞.博士研究生.;卢大儒.教授:复旦大学生命科学学院.上海200438:drlu@Xi Hairui,Doctoral Candidate;Lu Dalu,Professor:School of Life Sciences,Fudan University,Shanghai200438.学家便投入大量精力研究遗传病的基因治疗.最初的研究策略是利用腺病毒、慢病毒及腺相关病毒,将正常外源基因导入患者体内:1990年首例基因疗法的临床试验开始实施,四岁女孩德席尔瓦(A.DeSilva)患有重度联合免疫缺陷病(severe combined imnlunodeficiency disease, SCID),由于患者体内不能合成腺昔脱氨酶(ADA)导致缺乏正常的免疫力,科研人员从女孩体内获得自体门细胞,在体外利用逆转录病毒载体,将正确编码腺昔脱氨酶的ADA基因插入女孩的白细胞基因组内.再将感染慢病毒的白细胞重新冋输到女孩体内.之后女孩体内的门细胞可以正常合成腺昔脱氨酶且免疫力显著提高。

医学遗传学知到章节答案智慧树2023年湖北科技学院

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医学遗传学知到章节测试答案智慧树2023年最新湖北科技学院第一章测试1.遗传病最主要的特点是()。

参考答案:遗传物质改变2.遗传病中种类最多的是()。

参考答案:单基因遗传病3.表现为母系遗传的遗传病是()。

参考答案:线粒体遗传病4.研究遗传病的诊断、预防、治疗、遗传咨询等内容的遗传学分支学科属于()。

参考答案:临床遗传学5.苯丙酮尿症的发生()。

参考答案:基本上由遗传因素决定发病6.遗传病传递的不是疾病本身,而是疾病的遗传基础。

()参考答案:对7.按照遗传病的概念,有的遗传病是不能从上一代传给下一代的。

()参考答案:错8.遗传病的发病有单由遗传因素决定的,又有由遗传因素与环境因素共决定的,只要从亲代获得了致病基因就一定会发病。

()参考答案:错9.属于多基因遗传病的疾病包括()。

参考答案:冠心病;支气管哮喘;糖尿病;精神分裂症10.属于单基因遗传病的疾病是()。

参考答案:成骨不全;血友病第二章测试1.真核细胞断裂基因的编码序列是()。

参考答案:外显子2.染色质的一级结构单位是()。

参考答案:核小体3.微卫星DNA一般出现在下列()序列中。

参考答案:非编码DNA4.在人类基因组计划中我国承担了()染色体的序列分析工作。

参考答案:3号短臂5.hnRNA的修饰、加工过程包括:()。

参考答案:戴帽(5′端加m7GpppN);切除内含子,拼接外显子;加尾(3′端加PolyA)6.断裂基因的结构包括()。

参考答案:内含子;外显子;增强子;启动子;终止子7.属于串联重复DNA序列的有()。

参考答案:小卫星DNA;微卫星DNA;卫星DNA 、8.基因是决定RNA和蛋白质的DNA序列。

()参考答案:对9.结构基因的结构包括编码序列和调控序列。

()参考答案:对10.基因的主要功能是通过转录和翻译决定生物体的性状。

()参考答案:对第三章测试1.紫外线诱发基因突变的主要形式是()。

参考答案:形成嘧啶二聚体2.化学诱变剂诱发基因突变的类型主要是()。

复旦大学附属儿科医院高通量测序数据分析流程(第二版)对遗传疾病候选变异基因筛选用时和准确性分析

复旦大学附属儿科医院高通量测序数据分析流程(第二版)对遗传疾病候选变异基因筛选用时和准确性分析

基金项目㊀国家重点研发计划精准医学专项:2016YFC0905102;新兴前沿技术联合攻关项目:SHDC12017110;上海市卫计委,上海市儿童健康服务能力建设专项规划高端儿科海外研究团队培养计划:GDEK201701作者单位㊀1复旦大学附属儿科医院临床遗传中心㊀上海,201102;2复旦大学附属儿科医院分子诊断中心㊀上海,201102;3复旦大学附属儿科医院新生儿科㊀上海,201102通讯作者㊀周文浩,E⁃mail:zwhchfu@126.com;卢宇蓝,E⁃mail:yulanlu@fudna.edu.cn㊃论著㊃DOI:10.3969/j.issn.1673⁃5501.2018.02.008复旦大学附属儿科医院高通量测序数据分析流程(第二版)对遗传疾病候选变异基因筛选用时和准确性分析杨㊀琳1㊀董欣然2㊀彭小敏2㊀陈㊀乡3㊀吴冰冰2㊀王慧君2㊀卢宇蓝2㊀周文浩1,2㊀㊀摘要㊀目的㊀本研究旨在比较和分析复旦大学附属儿科医院(我院)分子诊断中心(本中心)2015年建立的高通量测序数据分析和临床诊断流程(复旦流程1.0)及其升级后的流程(复旦流程2.0)的临床应用效果㊂方法㊀以复旦流程1.0和2.0对本中心新生儿重症监护病房送检行二代测序分子诊断的连续样本,进行初步数据分析结果㊁流程用时和准确性的比较和分析,并以典型病例具体说明复旦流程2.0的主要特点㊂结果㊀2017年11月7 14日取得家属的知情同意的㊁行临床外显子检测的112例进入本文分析,初步数据分析结果的比较,进入人工数据审核的变异数量,复旦流程1.0平均210个,复旦流程2.0平均25个;完成112例从样本送达测序完成到初步报告形成时间,复旦流程1.0为78.8h,复旦流程2.0为19.8h;与人工审核后阳性结果判读符合率为63.6%(7/11),阴性结果判读符合率为84.2%(85/101)㊂结论㊀复旦流程2.0可以更加快速㊁准确和自动地进行大样本量的数据分析,可以用于临床大样本量的高通量数据分析及解读㊂关键词㊀高通量数据分析及解读;㊀全外显子组序列分析;㊀临床外显子组序列分析;㊀表型基因型关联性Evaluationofturnaroundtimeanddiagnosticaccuracyofthenextgenerationsequencingdataanalysispipelineversion2ofChildren'sHospitalofFudanUniversityYANGLin,DONGXin⁃ran,PENGXiao⁃min,CHENXiang,WUBing⁃bing,WANGHui⁃jun,LUYu⁃lan,ZHOUWen⁃hao(1ClinicalGeneticCenter,Children'sHospitalofFudanUniversity,Shanghai201102;2TheTranslationalMedicineCenterofChildren'sHospitalofFudanUniversity,Shanghai201102;3DepartmentofNeonatology,Children'sHospitalofFudanUniversity,Shanghai201102)CorrespondingAuthor:ZHOUWen⁃hao,E⁃mail:zwhchfu@126.com;LUYu⁃lan,E⁃mail:yulanlu@fudna.edu.cnAbstractObjectiveWehaveupgradedthedataanalysispipeline(Fudanpipeline1.0)toFudanpipeline2.0forhighthroughputsequencingwhichestablishedin2015.Thepurposeofthisstudyistocomparetheturnaroundtimeandaccuracyofthesetwopipelines.MethodsInthisstudy,112continuoussamplesfromneonatalintensivecareunitwererecruited.BothFudanpipeline1.0and2.0wereusedforthedataanalysis.Wecomparedtheresultsofpreliminaryanalysis,time⁃consuming,andtheaccuracybetweenthesetwopipelines.AndthemainfeaturesoftheFudanpipeline2.0areexplainedindetail.ResultsOnthecomparisonofpreliminarydataanalysisresults,thevariationstomanualanalysisstepofFudanpipeline2.0(anaverageof25variants)wassignificantlylessthanthatofFudanpipeline1.0(anaverageof210variants).Onthecomparisonofefficiency,theturnaroundtimeofFudanpipeline2.0(19.8h)wassignificantlyshorterthanthatofFudanpipeline1.0(78.8h).ThediagnosiscoincidencerateofFudanpipeline2.0is63.6%(7/11)forpositivecases,and84.2%(85/101)fornegativecaseswithmanualreview.ConclusionThisstudyclearlyshowstheefficient,accurateandautomatedofFudanpipeline2.0forgeneticdiagnosiswithlargesamplesize.Keywords㊀dataanalysisforhighthroughputsequencing;㊀whole⁃exomesequencing;㊀medicalexomesequencing;㊀genotype⁃phenotypecorrelation㊀㊀全外显子测序(WES)是指对基因组DNA上所有蛋白质编码序列(外显子)进行序列检测和分析,临床外显子测序是指针对已知致病基因的全部编码区进行序列检测和分析㊂这2项技术均属于高通量测序的范畴㊂随着高通量测序技术在科研及临床的应用,越来越多的医生,认可这项新的技术有益于患儿的诊断及临床决策的制定[1⁃3]㊂㊀㊀高通量测序技术用于临床的主要瓶颈在于快速㊁准确和自动化的数据分析㊂复旦大学附属儿科医院分子诊断中心(本中心)在2015年建立了高通量测序数据分析和临床诊断流程(简称复旦流程1.0)[4,5],应用于临床诊断不明病例,提升了对于遗传性疾病的分子诊断水平㊂随着送检病例的不断增加,本中心内部数据库的不断积累,改进并完善数据分析流程,引入从病例信息直接进行表型提取的系统,根据表型进行候选变异位点的自动分析及评估,形成了目前使用的本中心高通量测序数据分析和临床诊断流程(简称复旦流程2.0)㊂㊀㊀本文以同一批新生儿行分子诊断病例,分别以复旦流程1.0和2.0行针对数据分析结果㊁流程总耗时和准确性的比较和分析,考察复旦流程2.0快速㊁准确和自动的进行大样本量的数据分析的水平㊂1㊀方法1.1㊀病例纳入标准㊀2017年11月7 14日取得家属的知情同意的㊁送本中心进行临床外显子检测的连续病例㊂1.2㊀考察指标㊀以复旦流程1.0和2.0对纳入病例针对数据分析结果㊁流程用时和准确性的比较和分析㊂1.3㊀复旦流程2.0版本㊀图1显示,复旦流程2.0版本的5个功能,①临床关键信息抓取㊁分析和校验(浅黄色),②样本管理㊁测序实验和质控(浅绿色);③表型和测序数据汇总和更新(浅蓝色),④变异位点自动化注释和自动化分级图1㊀复旦流程2.0版本功能示意图系统(浅蓝色),⑤自动报告生成(浅蓝色)㊂1.3.1㊀临床关键信息抓取㊁分析和校验㊀临床信息自动化处理系统包含了3个主要工具模块㊂①分词模块,对原有的中文文本进行分词㊂将临床描述和诊断根据常见停顿符号分为短句和短语;英文的分词,采用UMLS提供的MetaMap软件[6]进行操作㊂②翻译模块,采用有道词典应用程序编程接口(API)的方式,将短语自动翻译为英文或者将英文再翻译回中文并将结果和现有语义库比对,如存在模糊匹配,在输出结果的同时将内容输入更新模块,由临床专家进行判定,如果匹配正确,存入中英文语义库㊂③临床信息自动化提取系统,包含中英文临床语义库和标准语义库(HPO),HPO数据库是将所有遗传相关表型进行标准化命名的网站[7]㊂临床语义库的词条都将和HPO中的术语进行关联,从而转换为结构化HPO术语㊂现有语义库通过专家校验增添中文语义537条,包含英文缩写DDH(HP:0001374先天性髋关节脱位)等,中文缩写甲减(HP:0000851先天性甲状腺功能减退症)等,以及皮肤黄染(HP:0000952黄疸)㊁吃奶差(HP:0011968喂养困难)等对症状的通俗描述㊂通过翻译最终匹配到英文语义库的中文短语也将进行记录,再次处理相同短语时将加快速度,现有此类条目关联共计57667条,由于UMLS数据库比HPO数据库的条目多很多,因此其中48867条并未最终匹配到HPO术语㊂㊀㊀平台模块可以由临床病历提取系统自动触发,也提供了可视化交互界面,方便临床分子遗传学医生对语义库进行增删修改,并且对每个条目进行溯源㊂图2为复旦流程2.0平台模块临床信息自动化提取系统示意图,如原有的语句为 早产气促2天入院 ,系统提取气促和早产2个关键词㊂早产为语义库中已有条目,直接输出对应的HPO术语HP:0001622(早产);气促并未匹配现有术语,但为病历高频词,由专家添加HPO术语HP:0002098(呼吸窘迫)关联至临床中文语义库; 极低出生体重儿 会匹配为HPO术语HP:0001518(足月小样儿)㊂随着语义库的持续定期更新,语义库将逐渐涵盖新生儿场景的所有表型信息㊂1.3.2㊀样本管理㊁测序实验和质控㊀采用QIAGEN公司miniblood全血试剂盒及其标准DNA抽提方法提取基因组DNA(gDNA),用美国Thermofisher公司生产的NanoDrop紫外光分光度仪测定样本的浓度及定量㊂参照ClearSeq捕获试剂盒说明书,基因组DNA经过超声打断㊁末端修复㊁接头连接㊁杂交捕获㊂捕获文库采用IlluminaHiSeq2000平台,进行序列检测㊂原始图像文件经IlluminabasecallingSoftware1.7进行图像识别(Basecalling),去除污染及接头序列处理后㊂Cleanreads采用Burrows⁃WheelerAligner(BWA)软件v.0.5.9⁃r16,以人类基因组hg19(GRCh37)为参考序列进行比对㊂1.3.3㊀表型和测序数据汇总和更新㊀HPO数据库(英文图2㊀复旦流程2.0临床信息自动化提取系统版)可以更好地将基因和临床表型进行关联,有效地记录已有科研发现[5]㊂该数据库包含两个内容:①结构化的临床表型,数据库中每一个表型都对应一个编号㊁一个简短的描述和一段详细的描述㊂以癫发作 表型为例,在HPO数据库中记录为HP:0001250惊厥发作㊂由于表型描述的范围大小不同,不同表型之间可能存在包含关系,因此,不同的HPO术语(HPOterm)之间可能存在关联关系㊂例如,HP:0001392(肝脏异常)与HP:0002012(腹部器官异常)关联,根据表型与表型间的包含关系,所有的HPO术语组成了由上至下的类似树状结构,越靠近根部描述的内容越宽泛,越靠近树叶表型描述的越细致㊂例如,从上到下追溯至HP:0001250(癫发作)的表型包括:HP:0000707(神经系统异常)㊁HP:0012638(神经系统功能异常)㊁HP:0001250(癫发作)㊂②结构化的基因⁃表型关系,对于每一个基因,都根据以往的科研成果和临床发现,确定该基因关联的遗传疾病和临床描述,进而找到与表型描述相符的HPO术语,然后将基因和找到的HPO术语的对应关系记录在HPO数据库中㊂㊀㊀表型和测序数据汇总和更新引入了HPO数据库后,开发了临床信息自动化处理系统,实现了将HIS系统中病例文书的内容进行自动化抽提和分析,进而得到HPO术语(图2)㊂在复旦流程2.0中,抽提的病例文书包含出院小结㊁病程记录和门诊记录等,提取其中的临床诊断和描述,优先级为出院诊断>入院诊断>门诊诊断>病程描述㊂1.3.4㊀变异位点自动化注释和自动化分级系统㊀在复旦流程1.0版基础上精简了筛选评估逻辑,升级拓展了本地人群数据库和公共人群数据库,添加了部分疾病和相关症状的中文描述,并增加了外显率㊁发病年龄和疾病系统㊂包括以下7个主要步骤㊂1.3.4.1㊀质量控制㊀主要核对并解析所输入VCF文件的版本和格式,合并SNV和Indel的结果,临时拆分多态性位点,并精简出后续分析所关注的测序相关质量控制信息㊂关键信息包括变异dbSNP编号㊁变异的覆盖深度㊁符合参考碱基和符合变异碱基的测序片段数目㊁位点的质量得分和分级㊁以及初步的基因型判断(纯合或杂合)㊂这一步视测序质量,实践中一般滤去0 1个位点㊂1.3.4.2㊀捕获测序区域筛选㊀基于捕获的二代测序(如全外显子组测序或基因panel),理论上所检测到的变异应该都位于捕获区域㊂但由于实验或分析方面的误差,以及患儿基因组上的特殊情况,VCF中往往含有捕获区域之外的变异㊂这些变异很可能为实验误差,但也有可能为真实的致病变异㊂考虑到后续分析往往围绕既往报道史和变异对基因功能的影响来展开,这一步筛选将会筛除所有距离外显子区15bp以外的变异,但既往文献报道致病的突变不受影响㊂这一过程与VCF的生成过程有关,实践中一般会滤去约15000个位点㊂1.3.4.3㊀公共人群频率注释筛选㊀引入gnomAD数据库(http://gnomad.broadinstitute.org/),增加公共人群频率参考来源㊂该数据库包含8624份东亚人群的外显子测序数据和811分东亚人群的全基因组测序数据㊂在实际操作过程中,会滤掉7000 10000个位点㊂1.3.4.4㊀本地人群频率注释筛选㊀根据不同的测序捕获技术(WES或各种Panel)建立本地人群子库,更加精确的区分测序平台误差变异和人群高频位点;建立基因 白名单 和 黑名单 系统,保护人群高频的已知致病/功能性多态位点不被筛选(白名单),以及排除因假基因/异常结构导致测序错误的假阳性位点的干扰(黑名单);通过按染色体分表等方式改进数据库查询效率,综合提升分析速度㊂会滤去800⁃1000个位点㊂1.3.4.5㊀危害性注释筛选㊀与复旦流程V1.0并相似,仅对ANNOVAR和VEP的数据库版本进行了更新,并改善了关键信息的提取(比如不同转录本的选择㊁涉及重叠基因时的基因优选等)㊂但由于流程本身涉及人群频率和既往报道史的综合判断,所以整体分析结果得到了进一步改善㊂滤去的位点80 100个㊂1.3.4.6㊀遗传模式优选㊀在复旦流程V1.0的基础上,增加了对外显率不全的考虑,使得家系分析中对于显性基因的判断更为灵活㊂与美国贝勒医学院合作,在OMIM数据库的基础上进一步参考美国贝勒医学院的遗传模式补充记录,丰富已知致病基因可能的遗传模式㊂滤去约20个位点㊂㊀㊀复旦流程2.0的分析系统引入了表型关联分析和临床报告精选2项新的功能㊂表型相关分析基于先验的贝叶斯模型,同时考虑表型的特异度和疾病的表型丰富度,能更好地找出满足关键症状的相关基因(该算法的方法学文章待发表)㊂临床报告精选系统基于ACMG的指导框架,运用机器学习手段综合考虑变异危害程度㊁人群频率㊁既往报道㊁遗传模式等特征值,精选出最需要优先考量的致病位点,大大加快了临床专家对于致病性位点的寻找和判定㊂1.3.4.7㊀变异分级的判断标准㊀对每个病例,系统分析得到的临床精选位点约15个,表型相关位点考虑排名前5的基因㊂若临床精选位点同时也满足表型相关,则列为主要发现候选;若表型关联较弱,则列为其他发现候选;若表型关联较高的位点不满足临床精选的标准,则列为相关发现候选㊂这种变异分级是在ACMG的变异五类分级的基础上,针对具体的临床干预措施而进一步区分㊂从ACMG变异分级指导结果来看,最终纳入报告候选的变异仅包括致病㊁可能致病和意义不明三类位点㊂从报告的可读性和精简性出发,一方面报告中不再罗列良性和可能良性的变异位点;另一方面报告直接结合患儿送检时的临床表型记录,将具有致病潜质的变异进一步分类为主要发现㊁相关发现和其他发现㊂其中,主要发现中列出了符合当前患儿临床表型的明确致病变异㊂这一类变异具有很高的临床诊断价值,应高度重视并参考;相关发现中列出的则是与当前患儿临床表型相符,但致病性不够明确的变异,例如不符合遗传模式或意义未明的错义突变㊂这一类变异应当进一步完善家系数据,确认疾病的遗传模式或是采用其他检测方法进一步挖掘潜在的变异(例如LOH㊁父母生殖细胞嵌合等情况);其他发现中则列出了致病性较为明确或是有既往报道史,但当前患儿并未体现出相关临床症状的变异位点㊂这一类变异建议临床考虑进一步丰富明确患儿症状,或是在未来的随访中高度关注变异相关的表型㊂1.4㊀自动报告生成㊀基因检测报告从内容上不仅仅是罗列致病位点,还需要包含致病位点的解读说明等;从操作上,在形成规范化报告文档的同时需要避免冗余的重复性操作㊂临床快速报告自动化生成系统,选取文档模板,自动从平台数据库抽提患者基本信息形成报告表头;根据位点标注分级结果,给出结论,并将所选位点填入对应表格(主要发现㊁次要发现和补充发现),并且选取HGVS标准化命名㊁自动补充该位点的染色体位置㊁OMIM注释㊁HGMD注释㊁父母来源等信息;根据位点所在基因信息,自动补全对该基因的生物学功能描述,这些描述存在平台内部数据库中,提供了可视化平台对描述进行添加㊁更新等操作㊂在现有数据库平台中,已经包含683条对基因的描述信息,每条描述包含了对该基因关联的OMIM疾病概述㊁基因的致病机制㊁该疾病的主要临床表现以及遗传模式㊁疾病发作时期等信息㊂报告自动化系统的可视化平台还包含了多种辅助功能,可以快速提交Sanger验证㊁多报告汇总㊁报告加密㊁报告归档等请求㊂㊀㊀变异评级标准参考了美国遗传学会的变异评级标准[8],制定本中心变异评级标准㊂㊀㊀致病变异的标准为,①与先证者表型相符;②为已经明确的致病变异㊂㊀㊀可疑致病变异的标准为,①与先证者表型相符;②与已经明确的致病变异有相同的氨基酸改变(不同的碱基改变);有害变异(无义变异,移码变异,典型+/-1或2剪接位点变异,起始密码子变异,单个或多个外显子缺失),且该基因功能缺失为已知的致病机制;③符合该致病基因已知的遗传模式㊂㊀㊀相关变异的标准为,①位点所在基因的相关疾病与目前患儿表型部分相关;②符合显性遗传模式的临床意义不明确的遗传变异;③符合隐性遗传模式,仅发现一个致病/疑似致病的杂合致病变异;④符合隐性遗传模式,发现纯合的或复合杂合的临床意义不明确的变异㊂㊀㊀其他发现的标准为,位点所在基因的相关疾病与目前患儿表型部分不相关;同1.3.3中②;符合该致病基因已知的遗传模式㊂2㊀结果2.1㊀一般情况㊀符合本文纳入标准112例患儿进入分析,男性50例,女性62例㊂年龄在10h至28d㊂复旦流程1.0和2.0,均由生物信息专业资深成员建立及维护,人工审核由经过临床遗传学培训的临床医生完成㊂该团队每年完成超过5000例的高通量测序临床报告的分析及解读㊂2.2㊀结果的比较㊀复旦流程1.0包括获得测序原始数据㊁拼接连接比对㊁获得变异结果㊁变异注释㊁生物信息学筛选㊁人工数据分析及报告书写等7个主要步骤㊂复旦流程2.0,在变异经过生物信息学筛选后,通过病例中提取临床表型,自动表型基因型比对流程,即通过表型对于变异进行逐个评级,将致病变异及相关变异分别列出㊂数据分析结果显示(表1),复旦流程2.0较复旦流程1.0在升级了变异的注释筛选㊁整合了表型进入筛选后,需要人工进行判读的变异数量大幅度的减少㊂使得高通量数据分析的时间得以压缩,提高了数据分析的效率㊂常染色体显性遗传709常染色体隐性遗传734常染色体隐性/显性遗传1410X染色体连锁遗传622.3㊀用时比较㊀复旦流程1.0和2.0完成112例从样本送达到初步报告形成的时间,分别为78.8h和19.8h㊂表2显示,HPO的提取㊁变异的分级和报告的撰写,复旦流程1.0和2.0分别为78.8h(4725min)和19.8h(1186min)㊂HPO提取10minˑ112例2.5min变异注释/筛选245min60min变异分级15minˑ112例2min报告撰写25minˑ112例1.5min整批自动生成每例人工审阅10minˑ112例㊀㊀本文112例样本口头报告时间为13 16d,报告发出的总TAT为20 33d㊂测序环节(从收到样本到DNA提取㊁建库㊁上机测序)2 3周;数据分析到报告撰写环节,利用已经建立好的流程2.0,达到了在测序数据拿到24h内,口头报告阳性病例㊂2.4㊀准确性的比较㊀112例经人工审核,8例检测到致病/可疑变异,12例检测到相关发现,其中3例经家系验证后,升级为致病/可疑变异,阳性率为9.8%(11/112)㊂复旦流程2.0与人工审核结果判读符合率82.1%(92/112),其中与人工审核后阳性结果判读符合率为63.6%(7/11),与人工审核后阴性结果判读符合率84.2%(85/101)㊂2.5㊀典型病例分析㊀图3显示,1例维生素B6依赖性癫患儿,GP,胎龄38+3周,出生体重2.9kg,因窒息复苏后反复抽搐4d入院,入院查体反应差,刺激不哭,肌张力低下㊂目前诊断:①新生儿窒息,②新生儿惊厥,③代谢性酸中毒,④新生儿感染,⑤新生儿贫血㊂住院病史经过提取后,形成的HPOterm为:HP:0001298Encephalopathy(脑病)㊁HP:0001250Seizures(惊厥)㊁HP:0001903图3㊀复旦流程2.0对1例维生素B6依赖性癫患儿致病变异的锁定Anemia(贫血)㊁HP:0001319Neonatalhypotonia(新生儿肌张力低下)㊁HP:0040187Neonatalsepsis(新生儿败血症)㊁HP:0001942Metabolicacidosis(代谢性酸中毒)㊂自动提取,符合患儿主要表型㊂通过HPOterm,系统直接锁定候选基因1001个,共检测到5694个变异㊂经过变异注释及筛选,直接锁定ALDH7A1基因的复合杂合变异(c.241C>T(p.R81X);c.1008+1G>A)为致病变异㊂3㊀讨论3.1㊀NGS数据分析的发展过程㊀目前国际上NGS的大型数据中心有:美国的GenomeCenteratWhiteHead/MIT㊁WashingtonUniversityGenomeCenter㊁GenomeCenteratBaylorMedicalCollage㊁英国的SangerCenter,中国的华大基因研究中心等㊂成规模的数据分析的中心有:BaylorMedicalCollage㊁GeneDex㊁UCLA㊁AmbryGenetics等㊂其中,BaylorMedicalCollage的GenomeCenter成功建立了将基因组水平的变异分析用于临床分子的诊断的经典高通量测序数据分析流程[2,3]㊂㊀㊀StephenFrancisKingsmore教授等所在的美国Children sMercyHospital的儿科基因组学中心及UniversityofMissouri⁃KansasCity医学院,该研究团队通过表型⁃基因型关联数据库(Symptom⁃andsign⁃assistedgenomeanalysiscorrelationtool,SSAGA)㊁HiSeq2500测序㊁基因组序列比对软件㊁变异快速分析解释工具(RapidUnderstandingofNucleotidevariantEffectSoftware,RUNES),可以在50h做到从NICU患者血样DNA的提取到WGS数据分析解释工作全部完成[6],并且有研究报道已经到达了26h㊂㊀㊀上述研究及临床应用,均为高通量测序数据分析流程真正用于临床打下了坚实的基础㊂本中心在2014年,通过与BaylorMedicalCollage的合作,初步形成了复旦流程1.0,并用于临床诊断[9]㊂2014至2015年每周的行高通量测序的样本量10 30例㊂随着NGS成本的不断下降及临床医生对于该项技术的认可度不断提升,现在每周样本量100 200例,需要提供更加快速㊁准确的数据分析流程,用以更大范围的解决临床问题㊂㊀㊀本批次数据中,有2例ALDH7A1基因符合杂合变异导致的维生素B6依赖性癫(Epilepsy,pyridoxine⁃dependent,[MIM:266100])[10,11]㊂2例患儿均生后即出现症状,1例主要表现为生后阵发性四肢抖动,1例则表现为窒息复苏后反复抽搐4d㊂维生素B6依赖性癫为常染色体隐性遗传,临床主要表现为癫,但发作形式异质性高,可见全身性强直阵挛性惊厥㊁肌阵挛性发作㊁及癫持续状态等㊂2例患儿的临床表现差距较大,仅依靠特征性的临床表现在发病早期明确临床诊断有困难㊂维生素B6依赖性癫可通过补充维生素B6有效控制惊厥发作[12,13],尽早明确诊断意义重大,2例快速口头报告时间为13 16d,在明确分子诊断后,立即采用维生素B6治疗,惊厥控制满意㊂突出了早期快速的分子病因的明确,对于临床诊断㊁治疗及预后的重要意义所在㊂3.2㊀复旦流程2.0的主要优势㊀①从病历中自动提取先证者和/或核心家系的临床信息㊂复旦流程1.0中,临床信息的提取完全依靠手工,每个病例从住院病史及门诊病例中,整理需要的相关信息,并从中总结出主要的临床表型,用于下一步的表型基因型关联性分析,每个病例的平均耗时10min㊂复旦流程2.0引入了临床信息自动化处理系统㊂通过分词模块㊁翻译模块,完成临床信息的初步提取,将提取出的信息和语义库进行比对,标注成为标准格式的HPOterm㊂这些HPOterm可以直接用于后续自动化的表型基因型关联性分析㊂②自动化表型基因型比对流程,即根据表型对于变异进行逐个评级,将致病变异及相关变异自动列出㊂这一功能的实现,主要依靠公共数据库中(OMIM㊁HGMD㊁HPO等),已经明确的基因与表型之间的关系,将每个基因对应到相关的多个表型㊂一旦患儿的HPOterm出现该表型,特定的基因便会自动列为候选基因,该基因上的特定类型的变异就作为致病/可疑致病变异㊂③内部数据库的不断扩大,对于致病变异及良性变异的数量成指数级增加㊂本中心高通量基因检测数据库中,已经纳入的样本数超过15000例㊂内部数据库的完善,可以快速明确注释致病变异及良性变异㊂为复旦流程2.0的建立也提供了坚实的基础㊂通过内部数据库的建立,对于表型的常见遗传病因谱及特定基因的热点突变谱,形成了检测人群特异性的数据㊂3.3㊀复旦流程2.0后续的改进方向㊀人工智能使得对于海量数据的整理和管理成为可能㊂基因组水平的数据分析更是需要依靠自动化的 智能 流程,才能实现快速㊁准确㊂复旦流程2.0与人工审核后阳性结果判读符合率为63.6%(7/11),与人工审核后阴性结果判读符合率84.2%(85/101)㊂说明目前还不能完全依靠机器判读,必需结合人工判读,特别是对致病/可疑致病的判读㊂随着数据库的不断丰富和更新,加之引入机器学习来进一步扩充表型基因型的关联性,机器判读不致病/不可疑致病能力会进一步优先提高,同样也会带来对于变异位点的自动判读,尤其对于高度异质性的疾病,自动数据分析准确性的提高㊂随着人工智能技术所占比例的不断增加,表型基因型关联性的建立更加智能,逐渐减少人工数据分析及审核所占的比重㊂㊀㊀目前复旦流程2.0中表型基因型的关联性,主要依靠公共数据库中(OMIM㊁HGMD㊁HPO等)已经明确的基因型与表型之间的关系㊂上述公共数据库中总结的患者表型,包含亚洲人㊁中国人数据相对较少㊂本中心高通量基因检测数据库中,已经纳入的样本数超过15000例㊂通过内部数据库完善,建立内部的表型基因型关联性,使得复旦流程2.0更加适合中国特定人群的数据分析㊂㊀㊀致谢:衷心感谢对本中心高通量基因检测数据库做出贡献的患儿及其家属,这些重要的贡献不仅对中国人群㊁同样对世界人群基因与表型关系都是弥足珍贵的,复旦流程2.0将继续努力不辜负你们的贡献㊂参考文献1 MillerNA FarrowEG GibsonM etal.A26⁃hoursystemofhighlysensitivewholegenomesequencingforemergencymanagementofgeneticdiseases.GenomeMed 2015 7 1002 YangY MuznyDM ReidJG etal.Clinicalwhole⁃exomesequencingforthediagnosisofmendeliandisorders.NEnglJMed 2013 369 16 1502⁃15113 YangY MuznyDM XiaF etal.Molecularfindingsamongpatientsreferredforclinicalwhole⁃exomesequencing.JAMA2014 312 18 1870⁃18794 黎籽秀刘博徐凌丽等.高通量测序数据分析和临床诊断流程的解读.中国循证儿科杂志2015 10 1 19⁃245 黎籽秀刘博杨琳等.高通量测序数据分析和临床诊断流程对新生儿多发畸形候选变异的筛选准确性研究.中国循证儿科杂志2015 10 1 25⁃286 SaundersCJ MillerNA SodenSE etal.Rapidwhole⁃genomesequencingforgeneticdiseasediagnosisinneonatalintensivecareunits.SciTranslMed 2012 4 154 154ra1357 KohlerS VasilevskyNA EngelstadM etal.TheHumanPhenotypeOntologyin2017.NucleicAcidsRes 2017 45D1 D865⁃D8768 RichardsS AzizN BaleS etal.Standardsandguidelinesfortheinterpretationofsequencevariants ajointconsensusrecommendationoftheAmericanCollegeofMedicalGeneticsandGenomicsandtheAssociationforMolecularPathology.GenetMed 2015 17 5 405⁃4249 杨琳黎籽秀梅枚等.全外显子组序列分析新生儿FGFR2基因相关疾病1例.中国循证儿科杂志2015 101 34⁃3910 MillsPB FootittEJ MillsKA etal.Genotypicandphenotypicspectrumofpyridoxine⁃dependentepilepsyALDH7A1deficiency .Brain 2010 133 Pt7 2148⁃215911 BeenJV BokLA WillemsenMA etal.MutationsintheALDH7A1genecausepyridoxine⁃dependentseizures.ArqNeuropsiquiatr 2008 66 2A 288 authorreply288⁃28912 MilhM PopA KanhaiW etal.Atypicalpyridoxine⁃dependentepilepsyduetoapseudoexoninALDH7A1.MolGenetMetab 2012 105 4 684⁃68613 YangZ YangX WuY etal.Clinicaldiagnosis treatmentandALDH7A1mutationsinpyridoxine⁃dependentepilepsyinthreeChineseinfants.PloSone 2014 9 3 e92803(收稿日期:2018⁃01⁃29㊀修回日期:2018⁃03⁃07)(本文编辑:张崇凡)。

疾病的单基因遗传ppt课件

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常染色体显性遗传病的遗传
染色体显性遗传病杂合子患者与正常人婚配图解
常染色体显性遗传病的遗传
成骨不全
常染色体显性遗传病的遗传
短指症
常染色体隐性遗传病的遗传
常染色体隐性遗传典型系谱
常染色体隐性遗传病的遗传
常染色体完全隐性遗传的特征
①由于基因位于常染色体上,所以它的发生与性别无 关,男女发病机会相等;
04 疾病的单基因遗传 Monogenic Inheritance
单基因遗传病
single-gene disorder,monogenic disorder
人类遗传病分类:单基因遗传病 多基因遗传病
单基因遗传病
single-gene disorder,monogenic disorder
单基因遗传病概念:某种疾病的发 生主要受一对等位基因控制,它们 的传递方式遵循孟德尔遗传律。
Y连锁遗传病的遗传
外耳道多毛
影响单基因遗传病分析的因素
• 表现度 • 外显率 • 拟表型 • 基因的多效性 • 遗传异质性 • 遗传早现 • 从性遗传 • 限性遗传
影响单基因遗传病分析的因素
• 遗传印记 • 延迟显性 • X染色体失活 • 不完全显性遗传 • 不规则显性遗传 • 共显性遗传 • 同一基因可产生显性或隐性突变
②系谱中患者的分布往往是散发的,通常看不到连续 传递现象,有时在整个系谱中甚至只有先证者一个患 者;
③患者的双亲表型往往正常,但都是致病基因的携带 者,此时出生患儿的可能性约占1/4,患儿的正常同胞 中有2/3的可能性为携带者;④近亲婚配时,子女中 隐性遗传病的发病率要比非近亲婚配者高得多。这是 由于他们来自共同的祖先,往往具有某种共同的基因。
X连锁隐性遗传病的遗传
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第十八章遗传病的诊断遗传病诊断是一项复杂的工作,需要多学科的密切配合。

遗传病的诊断包括常规诊断和特殊诊断。

常规诊断指与一般疾病相同的诊断方法,特殊诊断是指采用遗传学方法,包括染色体检查,家系分析等,是遗传病确诊的关键。

目前,临床上遗传病诊断包括:临症诊断、症状前诊断(presymptomatic diagnosis)、出生前诊断和植入前诊断。

第一节临症诊断临症诊断(symptomatic diagnosis)是根据患者的各种临床表现进行分析,确诊并判断遗传方式,是遗传病诊断的主要内容。

一、病史、症状和体征(一)病史遗传病大多有家族聚集倾向,因此病史的采集非常重要。

在采集病史时要准确、详尽。

另外还要收集病人的家族史、婚姻史和生育史等相关信息。

遗传病史的采集比其他疾病更重要,因为遗传病的家族聚集性和其传递的规律性决定了病史采集可能会获得更有用的信息,对后续的分析工作可能会有很大的帮助。

病史采集的关键是材料的真实性和完整性。

病史采集,主要是通过采集对象的描述和有关个体的病案查询工作来完成。

实践中还应注意不同个体描述是否可以相互印证,以确定资料的可信度。

对于发病原因、过程、时间、地点、治疗情况等也应详细记录。

(二)症状与体症遗传病除了具有其他疾病相同的体征外,还有特异性征候群,这些都为初步诊断提供线索。

大多遗传病在婴儿和儿童期有相应的体征和症状,如Down综合征患儿的特殊面容和智力低下等,当然还需要通过染色体检查进一步确诊。

二、家系分析根据对患者及家族成员发病情况的调查结果绘制系谱,确定单基因病或多基因病,遗传方式等。

系谱分析时应注意:系谱的完整性和准确性;单基因遗传病的分析非常有用,常染色体显性遗传病、常染色体隐性遗传病,X连锁显性遗传病,X连锁隐性遗传病,Y连锁遗传病。

单基因遗传分析中要注意外显不全,延迟显性,显、隐性的相对性,新的突变产生,遗传印记,动态突变,以及遗传异质性等问题,避免判断上的错误和发病风险的错误估计。

线粒体遗传病通过母系遗传,主要特点是晚发,进行性。

多基因病是一大类常见的疾病,有家族聚集倾向,但不遵循孟德尔分离规律。

以往被认为是多基因病的一些疾病,一部分被证明是遗传异质性所致,即受单个主基因决定,如癫痫,先天性心脏病和先天性巨结肠等。

三、细胞遗传学检查细胞遗传学检查染色体检查或核型分析,是辅助诊断和对染色体病确诊的主要方法。

随着显带技术的应用,特别是高分辨染色体显带技术的发展,能够更准确地发现和确定更多的染色体数目和结构异常,并发现新的微小畸变综合征。

利用染色体显带技术,可以对许多疾病在染色体水平找到原发性改变,如肿瘤,发育缺陷、心血管疾病等,把疾病相关基因确定在一个较小的范围内。

染色体原位杂交是应用标记的DNA片段(探针)与玻片标本上的细胞、染色体,以及间期的DNA或RNA杂交,研究核酸片段的位置、相互关系的技术。

一般用生物素、地高辛等标记探针,原位杂交后,用荧光染料标记的生物素亲和蛋白、抗亲和蛋白的抗体进行免疫检测和杂交信号放大,使探针杂交的区域发出荧光,这种原位杂交称荧光原位杂交(FISH),灵敏度高,特异性强,可以检测染色体微小结构异常,也可应用在基因定位和基因制图等领域。

另外还有双色FISH、多色FISH和染色体涂染等方法,大大提高了染色体畸变的检出率和准确性。

染色体检查标本主要有外周血,羊水中胎儿脱落细胞和胎儿的脐带血,病人的骨髓、胸腹水、手术切除的病理组织,培养细胞等。

染色体检查适应症包括:明显智力发育不全者;生长迟缓或伴有其他先天畸形者;夫妻之一有染色体异常,如平衡异位,嵌合体等;家族中已有染色体异常或先天畸形的个体;多发性流产妇女及其丈夫;原发性闭经和女性不育症;无精子症和不育的男性;两性畸形者;疑为先天愚型的患儿及其父母;原因不明的智力低下并伴有大耳、大睾丸和多动症者;35岁以上的高龄孕妇。

四、生化检查生化检查是遗传病诊断的重要辅助手段,主要是对由于基因突变所引起的酶和蛋白质的定量和定性分析,对单基因病和先天性代谢病进行诊断,包括一般的临床生化检验和针对遗传病的特异检查。

目前已知的多种遗传性代谢病中,大多数为酶缺陷。

可由于基因突变、基因缺失、基因表达异常或翻译后加工修饰缺陷所致。

目前临床主要对酶活性和代谢产物进行检测,以血液和尿液为主要检材,有的可以制成滤纸片和通过显色反应进行检测,随着对遗传病发病机理认识的深入和检测方法的改进,检测将更加简便、快捷。

第二节出生前诊断出生前诊断或称产前诊断(prenatal diagnosis)是采用羊膜穿刺术或绒毛取样等技术,对羊水、羊水细胞和绒毛进行遗传学检验,对胎儿的染色体、基因进行分析诊断,是预防遗传病患儿出生的有效手段,越来越广泛的被应用。

一、出生前诊断对象根据遗传病的危害程度和发病率,可将出生前诊断的对象排列如下:①夫妇之一有染色体畸变,特别是平衡易位携带者,或者夫妇染色体正常,但生育过染色体病患儿的孕妇;②35岁以上的孕妇;③夫妇之一有开放性神经管畸形,或生育过这种畸形患儿的孕妇;④夫妇之一有先天性代谢缺陷,或生育过这种患儿的孕妇;⑤X连锁遗传病致病基因携带者孕妇;⑥有习惯性流产史的孕妇;⑦羊水过多的孕妇;⑧夫妇之一有致畸因素接触史的孕妇;⑨有遗传病家族史,又系近亲结婚的孕妇。

但应当注意,已出现先兆流产、妊娠时间过长、有出血倾向者的孕妇不宜做产前诊断。

二、出生前诊断的方法(一)B超B超是一种安全无创的检测方法,能够详细检查胎儿的外部形态和内部结构,使许多遗传性疾病得到早期诊断。

可以诊断的疾病有,神经管缺陷、脑积水、无脑畸形;唇裂、腭裂,颈部淋巴管肿瘤;先天性心脏病,支气管、肺发育异常、胸腔积液;其他的异常,如先天性单侧肾缺如,先天性幽门狭窄、先天性巨结肠等。

(二)羊膜穿刺羊膜穿刺是在B超的监视下,用消毒的注射器抽取胎儿羊水(图18-1)。

可以对抽取的羊水及其中的胎儿脱落细胞进行细胞培养,分析染色体,以及生化和基因的检测。

如羊水中甲胎蛋白浓度过高时,提示胎儿可能有无脑、开放性脊柱裂、脊髓脊膜膨出和脑积水等异常。

羊膜穿刺一般在妊娠16~20周进行,流产的风险相对较小。

(三)绒毛取样法绒毛取样一般在妊娠7~9周进行,是妊娠早期诊断方法。

也是在B超监视下,用特制的取样器,从阴道经宫颈进入子宫,沿子宫壁到达取样部位,用内管吸取绒毛(图18-2)。

绒毛取样的优点是检查时间早,需要作出选择性流产时,给孕妇带来的损伤和痛苦较小。

缺点是经子宫颈取样标本容易被污染,胎儿和母体感染和操作不便,引起流产的风险是羊膜穿刺的两倍。

羊膜穿刺法和绒毛取样可用来诊断染色体病,遗传代谢病,胎儿性别鉴定,所有可用胚胎或胎儿DNA检测的疾病,另外,开放性神经管缺陷只能采用羊膜穿刺术诊断。

(四)脐带穿刺术脐带穿刺术是在B超的监视下,用细针经腹壁、子宫进入胎儿脐带抽取胎儿血液。

本方法取样最好在妊娠18周,常用于因错过绒毛取样或羊膜穿刺最佳时机或羊水检查失败的补救措施,还可以检测胎儿的血液系统疾病,先天性免疫缺陷,某些单基因病。

(五)胎儿镜检查又称羊膜腔镜或宫腔镜检查,它可在进入羊膜腔后,直接观察胎儿的外形、性别和发育状况,是否有畸形,还可以同时抽取羊水或胎血进行检查,或进行宫内治疗。

因此,理论上这是一种最理想的方法。

但由于操作困难,容易引起多种并发症,目前还不能被广泛采用。

胎儿镜检查的最佳时间是妊娠18~20周,可以诊断大疱性表皮松懈症及某些皮肤病。

(六)分离孕妇外周血中的胎儿细胞目前用于出生前诊断材料的获得对于胎儿和母体都是创伤性的,存在流产和感染等风险。

从20世纪90年代末,开始探索一种无创伤性的出生前诊断方法。

利用妊娠期少量胎儿细胞可以通过胎盘进入母体血液中,采用流式细胞仪分离技术,磁激活细胞分选技术,免疫磁珠法,显微操作分选法,分离胎儿细胞。

用这些方法富集的胎儿细胞很少,需要用高灵敏的技术方法进行下一步分析检测,目前常用的方法是PCR。

(七)植入前诊断随着人工受精,试管婴儿和胚胎移植技术的开展,以及单个细胞基因诊断技术的应用,目前正探索在胚胎植入前诊断(pre-implantation diagnosisi)。

在受精后6天胚胎着床前,通过显微操作技术取出一个细胞,应用PCR,FISH等技术进行特定基因和染色体畸变的检测,将人类的遗传缺陷掌控在最早阶段,这是遗传病产前诊断的重大突破。

第三节基因诊断利用分子生物学的技术,检测体内DNA或RNA结构或表达水平变化,从而对疾病做出诊断的方法,称为基因诊断(gene diagnosis),通常又称为分子诊断(molecular diagnosis)。

基因诊断始于1978年,应用限制性酶切长度多态性(RFLP)技术检测胎儿镰状细胞贫血症。

基因诊断技术已逐步从实验研究进入临床应用,不仅适用于遗传性疾病,而且已扩展到一些感染性疾病、肿瘤的诊断。

基因诊断具有如下特点:以特定基因为目标,检测基因的变化,特异性性强;采用分子杂交技术和PCR技术具有信号放大作用,用微量样品即可进行诊断,灵敏度高;在疾病尚无出现临床表现前,胎儿出生前的产前诊断,以及特定人群的筛查等,应用广泛;检测样品获得便利,不受个体发育阶段性和基因表达组织特异性的限制。

需要说明的是,由于基因突变的类型多种多样,除了缺失、倒位、点突变、动态突变可以进行基因的检测外,大多数基因突变的分析复杂而繁琐,有一定的难度。

一、基因诊断的主要技术方法基因诊断主要采用核酸分子杂交、PCR和DNA序列测定等技术。

(一)核酸分子杂交核酸杂交技术是在基因诊断中,用于检测样品中是否存在相应的基因以及相应基因表达状态等等。

其中Southern印迹法主要用于基因组DNA的分析,Northern印迹法用于检测样品中RNA的种类和含量。

1. 斑点印迹杂交把待检测的核酸样品点在NC膜上,变性后与标记的探针进行结合反应,经过显色和显影后检测杂交信号的强度,与对照样品比较后确定所测核酸量的高低。

根据NC膜上所点核酸样品的种类不同,分为DNA dot blotting和RNA dot blotting。

点样方式如采用狭缝点样器点样,得到的线状杂交信号,称狭线印迹法。

2. 原位杂交把组织或细胞样品经过适当处理,用探针与核酸进行杂交。

这种方法不需要提取核酸,可以确定被检核酸在组织或细胞,以及中期染色体中的定位,具有重要的生物学和病理学意义。

3. PCR-ASO ASO为等位基因特异性寡核苷酸杂交法(allele-specific oligonucleotide,ASO)的简称,是基于核酸杂交的一种方法。

根据已知基因突变位点的碱基序列,设计和制备与野生型或突变型基因序列互补的两种探针,分别与被检测者样品中的DNA分子进行杂交,根据样品与两种探针杂交信号的强弱,确定是否存在基因突变,判断被检者是突变基因的纯合体或杂合体(图18-3)。

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