如何在ImageJ中设置比例尺

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如何在ImageJ中设置比例尺

如何在ImageJ中设置比例尺

如何在ImageJ中设置比例尺
吴旧生(浙江大学,浙江杭州)
前面曾写过利用imageJ进行灰度和长度测量的教程,从浏览和下载的量来看,还是有较多人对此感兴趣,并有部分人来信要求提供比例尺的测量方法。

测量方法如下:
1)打开ImageJ,从文件菜单中打开一要分析的照片或图片(这里假设图片内置比例尺)。

不带比例尺的图片的方法要复杂一些,准备另外撰文说明。

2)利用直线工作点击比例尺的起点,拖动至比例尺的终点松开鼠标。

3)从analysis菜单下选择measure 命令。

取得图片上的内置比例尺的长度(像素值)。

测量结果显示比例的像素值为73.5像素。

4)根据比例尺的像素值和已知长度设置比例尺。

在analysis菜单下选择set scale进行比例尺设置。

在distance in pixels后面填入刚才获得的像素值,在known distance后面填入已知长度(如上图的360,Unit of length后面填上已知长度的单位(上例中是m)。

选定
Global前面的复选框,则比例尺可以多张图像中分享。

设置完毕,点OK搞定。

5)利用比例尺进行长度测量。

选择曲线工具,沿地图上的西湖周边设点,对合后选择analysis菜单下measure命令,结果西湖一周约9407米。

6)。

中的图片添加标尺

中的图片添加标尺

用ImageJ软件给图片添加标尺我们在论文中的拔出的图片由于受到篇幅限制,一般直接拍摄的图片太大需要缩小处理,太小的标尺就会看不清,如图1中所示的红色标尺已经看不清了,此时我们需要在图中添加一个较大的标尺。

如果已知图片拍摄的放大倍数,可以直接使用ImageJ(可点击直接下载)软件进行处理,如果不清楚已知放大倍数,在这里我又用了一个附加的软件小飞尺(可点击直接下载)。

图1下面来具体介绍如添加标尺:首先将需要添加标尺的图片打开(图2、3,这里的放大倍数已知)图2图3如图4、图5,设置相关参数,原图片的实际尺寸及像素可用Photoshop中看出(图5左),像素为1280x960,大小是12.7x9.53cm。

由于对拍摄实物进行了2000倍的放大,计算1280像素对应拍摄实物的实际大小是(12.7X10000/2000μm)。

然后计算单位长度对应的像素数,这里仅给出计算结果,即实物每μm对应的像素数为20.157,因此在图5右中设置值为20.157,其他选项设置如图所示,单击ok。

图4图5然后设置标尺格式,图6、图7。

图7为最后的结果,最后将图片重新保管。

图6图7若不记得放大倍数的图片也可以,用类似的方法得到近似结果:使用ImageJ加标尺的关键是确定单位长度对应的像素数,不清楚放大倍数可以用小飞尺软件来丈量单位长度的像素数。

如图8所示,丈量了图片中微观尺寸20μm对应的像素数约为200,由于图片在这里的显示是50%,所以原始图片微观20μm对应的像素应该是400,即每μm对应约20个像素(和上面计算的20.157有误差)。

结下了的步调和已知放大倍数和宏观大小的方法相同。

图 8。

imagej特定区域黑白比例计算

imagej特定区域黑白比例计算

imagej特定区域黑白比例计算
在ImageJ中,可以使用以下步骤来计算特定区域的黑白比例:
1. 打开ImageJ软件,并加载需要分析的图像。

2. 使用选择工具(如矩形选择工具)选择特定区域。

可以通过拖动选择工具来选择区域,并调整大小和位置。

3. 点击"Analyze"菜单,然后选择"Set Measurements"。

在弹出
的对话框中,选择"Area"和"Mean gray value"选项。

4. 再次点击"Analyze"菜单,然后选择"Measure". ImageJ会显示特定区域的面积和平均灰度值。

5. 计算黑白比例,可以使用以下公式:
黑白比例 = 平均灰度值 / 255
6. 根据计算结果可以得到该特定区域的黑白比例。

如果比例为1,则表示该区域完全为白色;如果比例为0,则表示该区域
完全为黑色;如果比例位于0和1之间,则表示该区域包含一定程度的黑色和白色。

请注意,上述步骤仅适用于灰度图像。

如果图像是彩色图像,需要将其转换为灰度图像,然后才能进行上述计算。

imagej使用教程

imagej使用教程

imagej使用教程ImageJ是一款免费开源的图像处理软件,被广泛应用于生物医学图像的分析和处理中。

本教程将向您介绍如何使用ImageJ进行基本的图像处理。

1. 安装ImageJ首先,您需要从ImageJ的官方网站(https:///ij/)下载并安装ImageJ软件。

根据您的操作系统,选择适合的安装程序进行安装。

2. 打开图像在ImageJ的菜单栏上,选择"File"(文件),然后点击"Open"(打开)。

浏览您的计算机,选择要处理的图像文件并点击"Open"(打开)按钮。

3. 调整图像大小如果您需要调整图像的大小,可以在菜单栏上选择"Image"(图像),然后点击"Adjust Size"(调整尺寸)。

在弹出的对话框中,输入所需的宽度和高度,并选择插值算法。

点击"OK"(确定)按钮应用更改。

4. 调整亮度和对比度您可以在菜单栏上选择"Image"(图像),然后点击"Adjust"(调整)来调整图像的亮度和对比度。

在弹出的对话框中,拖动亮度和对比度滑块,直到您满意为止。

点击"OK"(确定)按钮应用更改。

5. 进行滤镜处理ImageJ提供了多种滤镜工具,以改变图像的外观。

在菜单栏上选择"Process"(处理),然后点击"Filters"(滤镜)来选择所需的滤镜效果。

在弹出的对话框中,您可以调整滤镜的参数,然后点击"OK"(确定)按钮应用更改。

6. 测量图像特征ImageJ允许您测量图像中的各种特征,如面积、长度、角度等。

在菜单栏上选择"Analyze"(分析),然后点击"Measure"(测量)来测量图像的特征。

在弹出的结果窗口中,您可以查看测量结果。

ImageJ给照片加标尺

ImageJ给照片加标尺

用Image J软件给图片加标尺
Set Scale 【设置像素数长度与实际长度的对应关系】设置比例尺
Scale Bar 【沿用Set Scale的比例关系和长度单位】加入标尺
P=aRM
a- 希望标注的实际尺寸大小(如100um)
P- 照片分辨率(尺寸的单位要和a一致)
M- 放大倍数
照片分辨率有的软件提取不正确,需要注意。

怎样确定像素与单位长度的比例关系
在照片上没有刻度的情况下,确定标尺长度与像素的关系你必须至少知道以下信息:
1. 拍摄照片时的实际放大倍率M。

2. 照片的分辨率R (像素/英寸)。

假设在R (像素/英寸)分辨率条件下照片上的标尺长度b(宏观的,毫米或厘米)代表实际大小a(微观的,微米或纳米),那么:M=b/a,
另外,标尺长度b是有P个像素组成的,那么R=P/b, =>P=aRM.根据以上的关系你可以给照片确定一个合适的标尺长度。

注意:计算的过程中量纲要一致。

ImageJ计算创面面积

ImageJ计算创面面积

步骤 3 打开后的效果
步骤 4 选中直线测量工具"Straight",此步骤主要为后面设定比例尺。

步骤 5 打开"Analyze"菜单中的"Set Scale"命令。

(1)"Distance in pixels":距离用像素表示是多少,在上一步骤中已经显示为距离为114.53像素;(2)"Known distance":表明这个距离相当于实际距离多少,在上一步骤中测量的线段长度实际值为1cm,因此此处填1;(3)Pixel aspect ratio:这个是像素的宽高比,默认的是1,我用的数码相机照的,默认的是1,具体比值可以通过"ImageJ->Properties"来查看;(4)Unit of length :单位长度的像素是多少,此处写cm,不写也行,下面的scale显示为114.53 pixels/cm,表示114.53个像素代表1cm。

步骤 6选择"Freehand selections"键,在需要测量的创面上进行勾画。

步骤 7勾画完毕,选择Meansure进行测量
结果如下,面积为2.698
同理,可以测量一下坐标纸的一块面积,小方格100格,就是1cm2,结果显示为0.942cm2,看来有误,其实这个是手动画的,误差肯定存在,并且创面的边缘有时候也确实不太容易判断,最好多测几次。

使用ImageJ给图片加尺度

使用ImageJ给图片加尺度

使用ImageJ给图片加尺度在科学研究和图像处理中,给图片加上尺度是一个常见的任务,这可以帮助我们更好地理解和分析图像中的对象大小。

ImageJ是一款免费的图像处理软件,它提供了丰富的功能和插件,可以轻松地将尺度添加到图片上。

以下是使用ImageJ给图片加尺度的简单步骤:2. 打开图片:启动ImageJ软件后,点击菜单栏中的 "File",然后选择 "Open..." 或 "Import..." 选项来打开你想要加尺度的图片。

你也可以直接拖拽图片到ImageJ的窗口中。

3. 添加尺度:在ImageJ的窗口中,点击菜单栏中的"Analyze",然后选择 "Set Scale..." 选项。

在弹出的对话框中,输入尺度的实际长度(比如1mm)和单位(比如mm),然后点击 "OK"。

你也可以选择其他选项,比如尺度条的样式和位置等。

4. 应用尺度:在 "Set Scale..." 对话框关闭后,选择 "Analyze"菜单中的 "Show Info" 选项。

在图片的左上角,你将看到已经添加了尺度的图片。

你还可以点击图片上方的 "IJ" 按钮,选择 "label",来显示尺度的数值。

5. 保存图片:在进行尺度处理之后,如果需要保存图片,请点击菜单栏中的 "File",然后选择 "Save As..." 或 "Export..." 来保存处理后的图片。

这些是使用ImageJ给图片加尺度的简单步骤。

通过这些步骤,你可以轻松地在你的图片中添加尺度,以帮助你更准确地分析和理解图像的内容。

它对于科学研究、医学影像学、生物学实验等领域都非常有用。

老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)

老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)

老司机带你解锁ImageJ实用技巧(下)今天我们继续来聊一聊ImageJ的高阶使用技巧。

问题三、为什么总是全部圈起来的灰度值,有没有大神指导呢求助!本问题涉及免疫印迹(Western Blot)分析,提问者不能分别得到每个条带的值。

灰度值0为纯黑,255为纯白,灰度值与光密度值(OD值)的关系如下图所示:以灰度来统计WB条带的话,无条带的纯白255左右,条带越黑着色越深灰度值反而越小,这与我们的认知不符。

步骤:1. File -> Open -> 打开需要分析的WB条带。

2. Image –> Type -> 8-bit, 将图像转换为8-bit的灰度图片;Image-> Invert,黑白反转,得到如下图片:3. Analyze -> Calibrate, 校正光密度值Function中选择Uncalibrated OD,左下方Global calibration,勾选表示有多张图片打开时对所有图片进行此操作。

否则只对当前图片进行此操作。

4. 在工具栏中选择矩形工具——Rectangular, 最左边的为矩形工具,选择条带:键盘上按数字1,弹出如下提示框:点Yes,键盘上按数字3,得到如下:5. 工具栏中选择直线工具——Straight,下图最右边的为直线工具,按住Shift键使用直线工具画竖线将步骤4的峰进行分割:6. 选择魔棒工具——Wand tool,分别点击分割好的峰,即可得到结果,保存结果(File -> Save as…)即可:7. WB统计分析一般将对照组标准化为100%或1,上述结果6个条带前3个为对照组。

在Excel中,先计算对照组3个的平均值(AVERAGE(B2:B4)):然后所有B列的数值除以对照组平均值,此时对照组的均值为1:8. 将所得数据放入Graphpad prism绘图即可:拓展:弯曲的WB条带应如何使用ImageJ拉直?1. 使用Segmented line沿着倾斜条带画间断线段:2. 双击Segmented line,设置线段的宽度至包含所有条带:3. 点击菜单栏Edit -> Selection-> Straighten,倾斜的WB条带即可拉直:问题四、如何统计SEM图片小球数量?步骤:1. 打开ImageJ软件,File -> Open打开SEM图片。

ImageJ软件测量微弧氧化膜层表面孔隙率、孔径及其厚度的步骤修改

ImageJ软件测量微弧氧化膜层表面孔隙率、孔径及其厚度的步骤修改

Image J软件测量微弧氧化膜层表面孔隙率、孔径及其厚度的步骤先根据需要测定的照片设定标尺(见附录),后将去除标尺的清晰SEM照片打开,具体步骤:Fil e →Open→打开一、测量表面孔隙率的步骤:1.Analyze→Set Measurements→Area, Area Fraction, Limit toThreshold→OK2.Image→Adjust→Threshold→Apply→OK3.Analyze→Measure→Results4.Results→File →Save As→保存二、测量表面孔径的步骤:1.Analyze→Set Measurements→Area, Circularity, Feret’sDiameter,Limit to Threshold→OK2.Image→Adjust→Threshold→Apply→OK→Results(在设定灰度值的同时可以改变填充时的颜色)3.Analyze→Analyze Particles→Show:Ellipses→OK →Results(检验填充是否合理)4.Results→File →Save As→保存5.Results →Distribution→Parameter →Feret →OK →Feret Distribution(对孔径分布给出具体分析)6.Analyze→Analyze Particles→Show:Ellipses →Size(μm2):0-Infinity →OK →Results(孔径测量中下限值的设定)三、测量膜层厚度的步骤:1. 将图片改为RGB Color格式Image →Type →RGB Color2. 用Pencil Tool在需要测量的膜层厚度处画出直线,直线的宽度可在Pencil Tool工具栏中的Pencil Width中调整,直线的颜色可在Color picker工具栏中选择。

image j 教程

image j 教程

image j 教程
很抱歉,由于我是一个AI语言模型,无法直接为您提供图片
J教程及相应的内容。

以下是一个关于如何使用图片J进行图像处理的简单教程,尽
管没有标题的存在,但仍然可以帮助您理解相关的操作步骤和技巧。

1. 打开图片J软件并导入图像:启动图片J软件,然后使用菜
单栏中的“文件”选项来导入您想要处理的图像文件。

选择图像
并点击打开按钮。

2. 裁剪图像:在图片J的工具栏中,选择裁剪工具(通常是一
个带有剪刀图标的按钮),然后用鼠标拖动来选择您想要裁剪的区域。

一旦区域选择完毕,点击裁剪按钮并保存您的结果。

3. 调整图像大小:如果您需要改变图像的尺寸,可以使用图片J的调整大小工具。

在工具栏中选择该工具,然后输入您想要
的新尺寸数值。

确认后,图片J会自动调整图像大小并保存结果。

4. 图像增强:图片J提供了一系列图像增强的功能,例如亮度
调整、对比度调整、色彩平衡等。

选择您想要修改的图像增强选项,调整相应参数,并保存修改后的图像。

5. 滤镜效果:图片J还提供了多种滤镜效果,例如模糊、锐化、浮雕等。

选择您想要的滤镜效果,调整参数(如果有),并保
存结果。

6. 图像分析:图片J也可以用于图像分析,例如测量距离、计算像素比例等。

通过选择相应的图像分析工具,在图像上点击并标记所需的区域,图片J会自动计算并显示相关结果。

请注意,这里提供的仅是一个简要的图片J教程,实际应用中可能涉及到更多的操作和功能。

您可以自行探索图片J,尝试不同的功能,根据自己的需求进行图像处理。

希望这个简单的教程对您有所帮助!。

imagej用户使用手册第三部分

imagej用户使用手册第三部分

imagej用户使用手册第三部分【原创版】目录1.概述2.图像处理基本操作3.图像处理高级操作4.常见问题与解决方案5.总结正文【概述】本部分将详细介绍 ImageJ 图像处理软件的使用方法。

ImageJ 是一款功能强大的开源图像处理软件,广泛应用于生物医学、化学、物理等多个领域。

在本文中,我们将从基本操作到高级操作,一步一步地为您展示如何使用 ImageJ 进行图像处理。

【图像处理基本操作】1.打开和保存图像- 通过“文件”菜单打开或保存图像- 可以支持的图像格式包括:JPEG、PNG、BMP、TIFF 等2.图像的缩放与裁剪- 通过“图像”菜单下的“缩放”或“裁剪”子菜单进行操作 - 可以自由地调整图像大小和裁剪区域3.图像的旋转与翻转- 通过“图像”菜单下的“旋转”或“翻转”子菜单进行操作- 可以对图像进行任意角度的旋转或翻转【图像处理高级操作】1.区域选择与分割- 通过“选择”菜单下的“区域”子菜单进行操作- 可以使用矩形、椭圆、自由手绘等方法选择图像区域2.图像的亮度和对比度调整- 通过“图像”菜单下的“调整”子菜单进行操作- 可以对图像的亮度、对比度、色调等进行精确调整3.图像的滤波处理- 通过“图像”菜单下的“滤波”子菜单进行操作- 可以使用多种滤波器对图像进行处理,如:模糊、锐化、边缘检测等【常见问题与解决方案】1.问题:打开图像时出现“无法载入图像”的提示解决方案:检查图像文件的路径是否正确,或尝试重新安装ImageJ 软件2.问题:图像处理后保存时出现“保存失败”的提示解决方案:检查保存路径是否正确,或尝试重新安装 ImageJ 软件【总结】本篇文章详细介绍了如何使用 ImageJ 进行图像处理的基本操作和高级操作,以及常见的问题与解决方案。

使用imagej diameterj的技巧

使用imagej diameterj的技巧

使用imagej diameterj的技巧使用ImageJ和DiameterJ的技巧简介ImageJ是一款免费的图像处理和分析软件,它提供了丰富的功能和工具,用于处理和测量图像。

其中一个非常有用的插件是DiameterJ,它可以实现图像中物体的直径测量。

本文将介绍如何使用ImageJ和DiameterJ进行直径测量,并分享一些技巧和注意事项。

一、安装和准备1. 下载并安装ImageJ软件,可以从官方网站()上获取最新版本。

2. 安装完成后,打开ImageJ,然后点击"Plugins" -> "Manage Plugins",在插件列表中搜索"DiameterJ"并安装。

3. 准备要测量的图像,可以从本地文件夹导入,或通过ImageJ的"File"菜单中的"Open"选项打开。

二、测量直径1. 打开要测量的图像,确保图像属于8位灰度图像或32位浮点图像。

如果不是,请使用ImageJ的"Image"菜单中的"Type"选项将其转换为适当的格式。

2. 选择测量工具。

在ImageJ的工具栏中,可以看到不同的测量工具,包括线段、圆形和椭圆等。

根据图像中物体的形状选择适当的测量工具。

3. 在图像上点击并拖动,绘制一个与物体直径或周长相切的线段、圆形或椭圆。

4. 单击"Analyze"菜单,选择"DiameterJ",然后选择"Measure"选项。

DiameterJ将自动测量出物体的直径并显示在结果窗口中。

三、技巧和注意事项1. 精确选择:在绘制测量工具时,要尽量准确地选择与物体相关的区域。

避免选择与其他物体重叠或干扰的区域。

2. 多次测量:如果测量对象有多个直径或周长,可以使用多次测量来获取更准确的平均值。

Image j 基本操作

Image j 基本操作

Image j 基本操作imagej菜单栏列出了ImageJ的所有命令,它包含八个菜单:File:基本的文件操作,包括打开、保存、创建新图片,大多数命令看名字就知道什么意思Edit:编辑和绘制操作,以及全局设定Image:图像显示,包括图像格式的转化、怎样显示等Process:图像处理,包括点操作、过滤器和算术运算Analyze:图像分析,统计测量、直方图绘制和其他与图像分析有关的操作Plugins:创建、编辑和管理插件,列出了用户安装的所有宏、脚本和插件。

Window:已打开的窗口的选择和管理Help:升级,文档资源和版本信息File菜单New新建可以新建的东西有很多:Image:可以指定图片的标题、类型、尺寸、初始填充。

且如果Slices大于1,则创建了一个stackHyperstack:与Image-Hyperstacks-New Hyperstack相同Text Window:创建一个编写宏的文本窗口Internal Clipboard:打开ImageJ内部剪贴板中的内容System Clipboard:打开系统剪贴板中的内容TrakEM2:Fiji中还加入了编写TrakEM2程序Script:Fiji中还加入了新建脚本。

Open打开可以打开的东西也有很多:常见图片,后缀有TIFF、GIF、JPEG、DICOM、BMP、PGM和FITS格式。

也可以通过插件打开额外的后缀的图片ImageJ和NIH的图片查询表,后缀是.lut以制表符分割的表格,后缀是.xls和.csv选区,后缀是.roi和.zip文本文件,后缀是.txt、.ijm、.js和.java其他Open Next打开下一个关闭当前图片,打开目录中的下一个图片(如果有的话)。

按住Alt打开目录中的前一个图片(如果有的话)。

Open Samples打开样例打开ImageJ服务器上的样例图片,可以用来测试宏、脚本、插件等。

Open Recent打开最近文件子菜单会显示最近15个打开的文件,可以选择其中一个。

ImageJ实用技巧——比例尺设置和批量添加(基本功能篇)

ImageJ实用技巧——比例尺设置和批量添加(基本功能篇)

ImageJ实⽤技巧——⽐例尺设置和批量添加(基本功能篇)这篇⽂章是为了解决拍照⽚时的⼀个基本问题——⽐例尺的设置。

ImageJ的默认长度单位是Pixels(像素),所以如果想要测量实际的长度等信息,就必须重新设置长度单位。

⽽这⼀步骤往往需要参考图像⾃带的⽐例尺。

实际拍照过程中,拍照软件可以印⼊⽐例尺。

但如果遇到忘记设置⽐例尺的情况,可以利⽤ImageJ为图像添加合适的⽐例尺。

结合上⼀篇介绍的ImageJ的批处理技巧,这⼀篇就介绍⼀下:1、怎么设置长度单位;2、怎么批量添加⽐例尺。

⼀、设置长度单位1、打开⼀张有⽐例尺的照⽚,利⽤Magnifying Glass放⼤⽐例尺放⼤后的⽐例尺这是可以看出:单位为像素(pixels)。

2、利⽤直线⼯具沿着⽐例尺画线3、设置⽐例尺(Analyze-Set Scale)弹出⽐例尺设置界⾯:Distance in pixels:直线的长度为98 pixelsKnown distance:这条直线的已知长度Unit of length:设置单位Global:对于所有照⽚应⽤这⼀⽐例Tips:如果要给没有⽐例尺的图⽚添加⽐例尺,需要勾选Global。

设置完成后点击OK,可见图⽚的单位变为µm:这时候Measure这条直线,可见长度为50µm:⼆、如果没有⽐例尺,添加⽐例尺(Scale Bar)1、Set Scale后(勾选Global),打开⼀张没有⽐例尺的照⽚注意:⼀定是相同拍照设备,同⼀物镜倍数拍出的照⽚。

2、打开添加⽐例尺⼯具(Analyze-Tools-Scale Bar)弹出初始化界⾯,设置⽐例尺⼤⼩:其他的选择是设置⽐例尺的外观、字体、颜⾊等,可以⾃⼰选择,这⾥选择默认设置。

注意:不要勾选Overlay。

3、保存图⽚(File-Save)三、批量添加⽐例尺⽅法⼀:将所有图像打开成⼀个Stack(File -> Import -> Image Sequence)添加⽐例尺时,勾选Label all slices:⽅法⼆:利⽤Macro实现1、先处理⼀张照⽚,利⽤宏记录器,⽣成宏代码只需要记录⼀⾏代码。

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如何在ImageJ中设置比例尺
吴旧生(浙江大学,浙江杭州)
前面曾写过利用imageJ进行灰度和长度测量的教程,从浏览和下载的量来看,还是有较多人对此感兴趣,并有部分人来信要求提供比例尺的测量方法。

测量方法如下:
1)打开ImageJ,从文件菜单中打开一要分析的照片或图片(这里假设图片内置比例尺)。

不带比例尺的图片的方法要复杂一些,准备另外撰文说明。

2)利用直线工作点击比例尺的起点,拖动至比例尺的终点松开鼠标。

3)从analysis菜单下选择measure 命令。

取得图片上的内置比例尺的长度(像素值)。

测量结果显示比例的像素值为73.5像素。

4)根据比例尺的像素值和已知长度设置比例尺。

在analysis菜单下选择set scale进行比例尺设置。

在distance in pixels后面填入刚才获得的像素值,在known distance后面填入已知长度(如上图的360,Unit of length后面填上已知长度的单位(上例中是m)。

选定
Global前面的复选框,则比例尺可以多张图像中分享。

设置完毕,点OK搞定。

5)利用比例尺进行长度测量。

选择曲线工具,沿地图上的西湖周边设点,对合后选择analysis菜单下measure命令,结果西湖一周约9407米。

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