现代分子生物学技术
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☎将蛋白质从电泳凝胶中转移到硝酸纤维素滤膜上, 然后同放射性同位素125I标记的特定蛋白质之抗体 进行反应。 主要步骤:
蛋白质样品的制备 SDS-聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳 蛋白质的电转移:硝酸纤维素滤膜 靶蛋白的免疫学检测
Step 1.靶蛋白于第一抗体(一抗)反应
Step
2.与
聚丙烯酰胺凝胶电泳
☎聚丙烯酰胺凝胶分辨范围为1到1000个碱基对之间
☻凝胶浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强;反之浓 度降低,孔隙就增大,其分辨能力也就随之减弱。
凝胶类型及浓度 0.3%琼脂糖 0.7%琼脂糖 1.4%琼脂糖 4.0%聚丙烯酰胺 10.0%聚丙烯酰胺 20.0%聚丙烯酰胺
分离DNA片段的大小范围(bp) 50 000~1 000 20 000~1 000 6 000~300 1 000~100 500~25 50~1
分子生物学研究方法
基因操作
DNA分子的切割与连接 核酸分子杂交
凝胶电泳
细胞转化 核酸序列分析 基因的人工合成 基因的定点突变 PCR扩增等
核心技术
一、发展历程及基础
(一)三大成就 :
1、 40年代确定了遗传信息的携带者,即基 因的分子载体是DNA而不是蛋白质,解决了遗 传的物质基础问题;
2. 50年代揭示了DNA分子的双螺旋结构模型和半保留复 制机制,解决了基因的自我复制和世代交替问题;
☻在紫外线的照射下 结合溴化乙锭(简称 EtBr)的DNA分子发 出荧光,每条DNA带中
仅含有0.05μg的微
量DNA也可以被清晰 地检测出来。
电泳操作基本程序
称样
溶解
加热
制板来自百度文库
倒胶
取样 电泳
点样 检测
结果分析
(二) 核酸的分子杂交
将带有互补的特定核苷酸序 列的单链DNA或RNA混合在一 起,其相应的同源区段就会 退火形成双链结构。如果退 火的核酸来自不同的生物有 机体,所形成的双链分子就 被称为杂种核酸分子。
据是否使用放射性标记物的与否,可分为放射性标记探针和非 放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探 针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记 探针。
标记物:核素标记物(同位素标记):32P、35S、3H等
非核素标记物(非同位素标记):生物素、地高辛、荧光素
(1)双链DNA探针 缺口平移法
能准确反映组织细胞的相互关系及功能状态
核酸原位杂交的基本步骤
☻细胞或组织的固定:载玻片 ☻组织细胞杂交前的预处理: 用去垢剂或蛋白酶除
去核酸表面蛋白质
☻探针的选择和标记 ☻杂交 ☻杂交结果检测
检测重组体克隆的菌落杂交技术
5、探针的标记
探针的种类:根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根
Rosalind Franklin
X-ray 光源
DNA
成像
Maurice Wilkins 1953- Franklin & Wilkins
3. 50年代末至60年代,相继提出了"中心法则"和操纵子学说, 成功地破译了遗传密码,充分认识了遗传信息的流动和表达。
Jacob and Monod
(二)两大技术保证:
☻ 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合 酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3‘羟基末端。
☻ 同时该酶具有从5‘→3’的核酸外切酶活性,能从切口的5‘端 除去核苷酸。
☻ 由于在切去核苷酸的同时又在切口的3‘端补上核苷酸,从 而使切口沿着DNA链移动,用放射性核苷酸代替原先无放 射性的核苷酸,将放射性同位素掺入到合成新链中。
☻常用 的荧光 染料: C5、C3 等
2.Northern blotting (RNA印迹技术)
是将RNA分子从电泳凝胶 转移到硝酸纤维素滤膜或 其他化学修饰的活性滤纸 上,进行核酸杂交的一种 实验方法。
分离的 mRNA (不同长度)
探针 DNA结合
3.Western blotting(蛋白质杂交技术)
阴极
DNA加样孔
阳极
大分子量的DNA 移动的慢
小分子量的DNA 移动的快
电泳缓冲液
DNA和RNA被称为多聚阴离子(polyanions),核酸分子放
置在电场当中,会向正电极的方向迁移。在一定的电场强
度下,DNA分子的迁移率,取决于核酸分子本身的大小和
构型。
琼脂糖凝胶电泳
☎琼脂糖凝胶分辨DNA片段的范围为0.2~50kb之间
标记
的第
二抗
体(
Ste p 3. 显
酶标 二抗 )反 应
色
反
应
:
酶
促
反
应
4、原位杂交(in situ hybridization )
DNA的定位
RNA定位
将标记的核酸探针与细胞或组织中的核酸进 行杂交,称为原位杂交。
特点:
能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究 不需从组织或细胞中提取核酸,对含量极低的 靶序列灵敏度高
DNA/DNA 或DNA/RNA
不同 温度 下DNA 的构 型变 化
在大多数核酸杂交反应中,经过凝胶电 泳分离的DNA或RNA分子,都必须通过毛细管 或电导作用被转移到滤膜上,而且是按其在 凝胶中的位置原封不动地“吸印”上去的, 因此,核酸杂交也被称为“印迹杂交”。
材料:尼龙滤膜 、硝酸纤维素滤膜 、二乙氨基乙基纤维素滤
1.DNA的体外切割和连接
1962年Arber 发现限制性核酸内切酶,1967Gellert发现了 DNA 连接酶
限制性酶 连接酶
2. DNA的核苷酸序列分析技术
二、 DNA操作技术
(一) 核酸的凝胶电泳
基本原理:一种分子被放置到电场中,它就会以一 定的速度移向适当的电极,这种电泳分子在电场作用 下的迁移速度,叫做电泳的迁移率,它与电场强度和 电泳分子本身所携带的净电荷数成正比,与分子的摩 擦系数成反比
膜(DEAE)
步骤:
第一,将分离的核酸样品转移到固体支持物滤膜上-核酸印 迹转移、电泳凝胶核酸印迹法、斑点和狭线印迹法、菌落和 噬菌斑印迹法;
第二,是将具有核酸印迹的滤膜与带有放射性或其它标记的 DNA或RNA探针进行杂交
1、Southern Blotting(DNA印迹技术)
Southern Blotting的过程 (1)碱变性的琼脂糖凝胶电泳分离的DNA (2)通过电泳液的移动转移胶中的DNA (3)固定胶中的DNA (4)预杂交和杂交(放射性和荧光检测) (5)结果检测
蛋白质样品的制备 SDS-聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳 蛋白质的电转移:硝酸纤维素滤膜 靶蛋白的免疫学检测
Step 1.靶蛋白于第一抗体(一抗)反应
Step
2.与
聚丙烯酰胺凝胶电泳
☎聚丙烯酰胺凝胶分辨范围为1到1000个碱基对之间
☻凝胶浓度越高,孔隙越小,其分辨能力就越强;反之浓 度降低,孔隙就增大,其分辨能力也就随之减弱。
凝胶类型及浓度 0.3%琼脂糖 0.7%琼脂糖 1.4%琼脂糖 4.0%聚丙烯酰胺 10.0%聚丙烯酰胺 20.0%聚丙烯酰胺
分离DNA片段的大小范围(bp) 50 000~1 000 20 000~1 000 6 000~300 1 000~100 500~25 50~1
分子生物学研究方法
基因操作
DNA分子的切割与连接 核酸分子杂交
凝胶电泳
细胞转化 核酸序列分析 基因的人工合成 基因的定点突变 PCR扩增等
核心技术
一、发展历程及基础
(一)三大成就 :
1、 40年代确定了遗传信息的携带者,即基 因的分子载体是DNA而不是蛋白质,解决了遗 传的物质基础问题;
2. 50年代揭示了DNA分子的双螺旋结构模型和半保留复 制机制,解决了基因的自我复制和世代交替问题;
☻在紫外线的照射下 结合溴化乙锭(简称 EtBr)的DNA分子发 出荧光,每条DNA带中
仅含有0.05μg的微
量DNA也可以被清晰 地检测出来。
电泳操作基本程序
称样
溶解
加热
制板来自百度文库
倒胶
取样 电泳
点样 检测
结果分析
(二) 核酸的分子杂交
将带有互补的特定核苷酸序 列的单链DNA或RNA混合在一 起,其相应的同源区段就会 退火形成双链结构。如果退 火的核酸来自不同的生物有 机体,所形成的双链分子就 被称为杂种核酸分子。
据是否使用放射性标记物的与否,可分为放射性标记探针和非 放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探 针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记 探针。
标记物:核素标记物(同位素标记):32P、35S、3H等
非核素标记物(非同位素标记):生物素、地高辛、荧光素
(1)双链DNA探针 缺口平移法
能准确反映组织细胞的相互关系及功能状态
核酸原位杂交的基本步骤
☻细胞或组织的固定:载玻片 ☻组织细胞杂交前的预处理: 用去垢剂或蛋白酶除
去核酸表面蛋白质
☻探针的选择和标记 ☻杂交 ☻杂交结果检测
检测重组体克隆的菌落杂交技术
5、探针的标记
探针的种类:根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根
Rosalind Franklin
X-ray 光源
DNA
成像
Maurice Wilkins 1953- Franklin & Wilkins
3. 50年代末至60年代,相继提出了"中心法则"和操纵子学说, 成功地破译了遗传密码,充分认识了遗传信息的流动和表达。
Jacob and Monod
(二)两大技术保证:
☻ 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合 酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3‘羟基末端。
☻ 同时该酶具有从5‘→3’的核酸外切酶活性,能从切口的5‘端 除去核苷酸。
☻ 由于在切去核苷酸的同时又在切口的3‘端补上核苷酸,从 而使切口沿着DNA链移动,用放射性核苷酸代替原先无放 射性的核苷酸,将放射性同位素掺入到合成新链中。
☻常用 的荧光 染料: C5、C3 等
2.Northern blotting (RNA印迹技术)
是将RNA分子从电泳凝胶 转移到硝酸纤维素滤膜或 其他化学修饰的活性滤纸 上,进行核酸杂交的一种 实验方法。
分离的 mRNA (不同长度)
探针 DNA结合
3.Western blotting(蛋白质杂交技术)
阴极
DNA加样孔
阳极
大分子量的DNA 移动的慢
小分子量的DNA 移动的快
电泳缓冲液
DNA和RNA被称为多聚阴离子(polyanions),核酸分子放
置在电场当中,会向正电极的方向迁移。在一定的电场强
度下,DNA分子的迁移率,取决于核酸分子本身的大小和
构型。
琼脂糖凝胶电泳
☎琼脂糖凝胶分辨DNA片段的范围为0.2~50kb之间
标记
的第
二抗
体(
Ste p 3. 显
酶标 二抗 )反 应
色
反
应
:
酶
促
反
应
4、原位杂交(in situ hybridization )
DNA的定位
RNA定位
将标记的核酸探针与细胞或组织中的核酸进 行杂交,称为原位杂交。
特点:
能在成分复杂的组织中进行单一细胞的研究 不需从组织或细胞中提取核酸,对含量极低的 靶序列灵敏度高
DNA/DNA 或DNA/RNA
不同 温度 下DNA 的构 型变 化
在大多数核酸杂交反应中,经过凝胶电 泳分离的DNA或RNA分子,都必须通过毛细管 或电导作用被转移到滤膜上,而且是按其在 凝胶中的位置原封不动地“吸印”上去的, 因此,核酸杂交也被称为“印迹杂交”。
材料:尼龙滤膜 、硝酸纤维素滤膜 、二乙氨基乙基纤维素滤
1.DNA的体外切割和连接
1962年Arber 发现限制性核酸内切酶,1967Gellert发现了 DNA 连接酶
限制性酶 连接酶
2. DNA的核苷酸序列分析技术
二、 DNA操作技术
(一) 核酸的凝胶电泳
基本原理:一种分子被放置到电场中,它就会以一 定的速度移向适当的电极,这种电泳分子在电场作用 下的迁移速度,叫做电泳的迁移率,它与电场强度和 电泳分子本身所携带的净电荷数成正比,与分子的摩 擦系数成反比
膜(DEAE)
步骤:
第一,将分离的核酸样品转移到固体支持物滤膜上-核酸印 迹转移、电泳凝胶核酸印迹法、斑点和狭线印迹法、菌落和 噬菌斑印迹法;
第二,是将具有核酸印迹的滤膜与带有放射性或其它标记的 DNA或RNA探针进行杂交
1、Southern Blotting(DNA印迹技术)
Southern Blotting的过程 (1)碱变性的琼脂糖凝胶电泳分离的DNA (2)通过电泳液的移动转移胶中的DNA (3)固定胶中的DNA (4)预杂交和杂交(放射性和荧光检测) (5)结果检测