遗传力的估算及应用
动物数量遗传学9
重点提示:本章重点阐述遗传力的概念及其推广, 遗传力的估计原理,估计途径和估计方法,遗传力 的显著性检验,影响遗传力估计的主要因素,遗传 力的用途,减少遗传力估计误差的措施。
内
容
第一节 遗传力的概念及其推广 第二节 遗传力估计原理
第三节 遗传力估计途径
第四节 遗传力估计方法
第五节 遗传力的显著性检验
遗 传 力 估 计 方 法
常规方法
改进方法
2、单元内全同胞相关法
子女表型值对一个亲本的 回归估计或相关估计
a. 子女对一个亲本的回归系数为:
b. 子女与一个亲本的相关系数为:
子女表型值对双亲均值的 回归估计或相关估计
a. 子女表型值对双亲均值的回归系数为:
b. 子女表型值与双亲均值的相关系数为:
…
2
┆
X S1nS1 X S 2nS2
nS1 n S2
┆
XS2.
┆
XS..
DS
X X SDS 1 X SDS…… SDS nSDS 2
nSDS
X SDS .
单元内半同胞相关法
相关系数和遗传力估计值分别为:
遗传力估计值的显著性检验可近似 为:
单元内全同胞相关法
遗传力估计值为:
例
题
4个奶牛场部分母牛泌乳记录列于表8-5(各数
第六节 影响遗传力估计的因素
第七节 遗传力的用途
第八节 减少遗传力估计误差的措施
第一节 遗传力的概念及其推广
量 性 状 的 表 型 值 (P)
育种值(A)
遗传值/基因型值(G)
显性偏差(D) 上位偏差/互作偏差(I)
环境偏差(E)
P=G+E=A+D+I+E=A+R
3-2遗传力
基因型变量可以用下式表示: V G= V A + V D+ V I 于是,表现型变量的公式可以表示为:
VP= VA + VD十VI十VE= VA十VNA十VE
基因型变量占表现型变量的比值,是广义遗传力(H²),包括 加性效应和非加性效应两类遗传变量。即
VG VA VNA H VP VA VNA VE
2 环境:同一类苗木,在不同环境条件下,如一批生长在温室, 另一批生长在大田,在温室内因环境方差小,遗传力会比大田 的高。 3 估算方法:计算不同,所得遗传力估值也不同。
表 8809组16年生生长性状遗传力及遗传增益
性状 树高 胸径 遗传方差 1.513 3.334
3.448E-04
环境方差 2.65 6.533
0.235 0.467 0.165 0.204
0.0000174 0.0000006 0.0000272
0.345 0.363
注:遗传增益是按50%入选率(I=0.80)计算的。
4 林分年龄:年龄不同,控制性状表现的基因会改变, 遗传力的估值也有不同。
图
图 杉木41个家系2-13年生家系遗传力
表 不同年龄长白落叶松性状的方差分析
基因型变量分解为三个组成部分。即基因加性效应变量 (VA )、显性变量(VD)和上位变量(VI)。
基因加性效应变量:是指等位基因和非等位基因间
累加作用引起的变量; 显性变量:是指等位基因间相互作用引起的变量;
上位变量:是指非等位基因间相互作用引起的变量。
后两部分变量统称为非加性遗传变量 (VNA)。
2
基因加性效应变量占表现型变量的比值,是狭义遗传力(h²), 即
VA VA h VP VA VNA VE
遗传病的遗传力遗传率与遗传效应
遗传病的遗传力遗传率与遗传效应遗传病是由遗传物质(基因)突变引起的疾病,具有种系遗传特征,通常在家族成员中传播。
遗传学家通常关注三个重要的遗传概念:遗传力、遗传率和遗传效应。
本文将深入探讨这些概念,并解释它们与遗传病之间的关系。
遗传力遗传力是指个体表现出遗传特征的程度。
它取决于基因的显性或隐性状态。
基因有两种状态:显性和隐性。
显性基因只需要存在于一个等位基因中就可以表现出遗传特征;而隐性基因必须存在于两个等位基因中才能表现出遗传特征。
假设表现出某种遗传特征的个体数目为A,这一特征在这个种群中的共同基因型数目为B,则这种遗传特征表现的频率就是A/B。
基于这个频率,我们可以计算出遗传力。
遗传率遗传率是指基因传递给后代的概率。
基因在传递时通常以搭配的方式出现。
基因有两种状态:等位基因和基因型。
将一个基因从一个祖先传递给后代需要两个等位基因。
每个等位基因都可以有不同的基因型。
因此,基因由一个基因型组成。
例如,普通病的等位基因可能为A和a,基因型可能为AA、Aa和aa。
基因的传递是随机的,因此,遗传率可以作为概率或百分比来衡量。
遗传效应遗传效应指的是一个基因对于一个特定特征的表现方式。
它可以是显性和隐性效应。
显性效应指一个基因的表现方式是明显的;而隐性效应指一个基因的表现方式不明显。
遗传学家在研究种系遗传疾病时,必须同时考虑遗传力、遗传率和遗传效应。
根据这些概念,科学家可以预测一个疾病在一个家族中的传播方式和患病率。
通过了解基因突变的影响,这些预测可以帮助家庭成员采取措施来减少或避免遗传病。
总的来说,遗传力、遗传率和遗传效应是种系遗传学的三个最重要的概念。
研究这些概念和遗传病之间的关系是了解和控制遗传疾病传播的关键。
遗传学课件
S2a=1/2a2=2S2F2-( S2gb1+S2gb2)
b1、b2分别为F1与P1、P2回交一代 狭义遗传力
hn2=S2a/S2F2=〔2S2F2-( S2gb1+S2gb2 )〕/S2F2×100%
例:小麦抽穗期的狭义遗传率计算
这种分解适用于广义遗传率(H2)和狭义遗传率(h2)。
3.遗传率的组成
广义遗传率(H2)的组成: H2 = HG2 + HGE2
其中
HG2是普通广义遗传率(general heritability in broad sense), 定义为遗传方差占表现型方差的比率,HG2=VG/VP;
HGE2是互作广义遗传率(interaction heritability in broad sense), 是基因型×环境互作方差占表现型方差的比率 (HGE2=VGE/VP);
狭义遗传率的优缺点
➢ 优点 ➢ 因其只考虑加性方差,使结果更准确 ➢ 对自花授粉退化的植物可用此法计算遗传率 ➢ 无需用p1 P2和F1来估算F2的环境方差 ➢ 缺点 ➢ 需要两次回交,工作量增大 ➢ 当基因间存在连锁和互作时,估算值会偏高,甚
至大于广义遗传率 ➢ 不能去掉上位作用和基因与环境的互作影响
➢ 遗传率越高,即基因型方差所占的比重越 大,选择越可靠
➢ 通过对不同动植物的遗传率进行估算所得 的结果已开始应用,并取得了较好的成效
➢ 凡遗传率的形状,在早代选择效果好,反 之,晚代较好
➢ 遗传率低的复杂性状,可通过与遗传率高 的简单性状的相关性来选择
12.4 遗传力
一、遗传率的概念 二、遗传率的估算
三、遗传率在育种上的应用
遗传力遗传增益和选择方式
表6-1
一些树种高、木材比重和干形的狭义遗传力估值
(三)影响遗传力的因素
1 群体:估算出来的遗传力只适用于在特定时间和空间下用于 估算遗传力的那个群体。群体不同,估算出来的遗传力不会 完全相同。 2 环境:同一类苗木,在不同环境条件下,如一批生长在温室, 另一批生长在大田,在温室内因环境方差小,遗传力会比大 田的高。 3 林分年龄:年龄不同,控制性状表现的基因会改变,遗传力 的估值也有不同。 4 估算方法:计算不同,所得遗传力估值也不同。 总之,遗传力的估算会受供试材料的性质、群体大小、取样 方法、估算方法、试验条件等等影响,它是一个方差,不是 固定值。因此,由遗传力估算出来的改良效果,在应用时是 有条件的,估算值在多数情况下只表示相对的大小,不可能 确切须步改良效果。
第六章 遗传力、遗传增益和选择方式
1.教学目的和要求
重点掌握自由授粉子代遗传力和遗传增益的 估算方法,一般了解用无性系、亲本与子代关 系估算遗传力的方法。
2.教学内容和要点
遗传力的概念、估算遗传力的三种方法(无性 系、亲本与子代关系、自由授粉子代),影响 遗传力的因素,几种常用选择方式遗传增益的 分析。 要点:遗传力和遗传增益的估算方法。
2 G
(二)由亲一子关系估算狭义遗传力
.由子代与一个亲本的回归系数估算遗传力 回归系数可按下式计算
b
xy x y / N x x / N
2 2
式中:X ——亲本性状观测值 Y ——子代性状观测值 在用回归系数估算遗传力时应当注意下列各点: (1)亲子代的树龄必须一致或相近; (2)亲子代应处于相同或相似的环境条件下; (3)测量亲子代性状的单位应相同。
四、几种选择方式的分析
(一)、混合选择和单株选择
名词解释遗传力
名词解释遗传力
遗传力是指遗传因素对个体某一特征或性状表现的影响程度。
它衡量了遗传因素在个体多
样性中所占的比重,即描述了基因与环境之间相互作用的程度。
遗传力是通过研究家族、
双生子和采用研究等方法来估计的。
举例来说,如果某项特征的遗传力为0.7,意味着该特征的表现中有70%可以归因于遗传因素,剩下的30%则归因于环境因素。
这说明遗传因素对该特征起到了很大的影响。
例如,
身高在许多研究中被发现具有较高的遗传力,这意味着子女的身高往往与父母的身高有较
高的相关性。
然而,环境因素如营养状况、生活条件等也会对身高产生一定的影响。
因此,遗传力只是解释个体差异的一部分,不能完全决定个体特征的表现。
新美系种猪生产性能的遗传力估计
遗传 力是重要参 数 , 它反 映数量性状 的遗传 规 表 l 表型变量组成 的方差分析 律, 对育种值估计 、 制定和优化育种方案 以及探 讨选 育效果具有重要指导意义 。尽管生产性状 的遗传 参 数是畜禽 品种重要 的特性指标 ,具有通用性和相似 性 的一 面 , 但随着 品种 、 畜群 、 饲养 条件 的不 同也 有 所差异 , 具有“ 不稳定 ’ 象 。 目前 , 现 有许 多对各 品种 注 :N S D 分 别 为后代 个体 总数 、 、、 公猪 亲本 数 、 母猪 亲 本数 ; K、 ( 群 体遗传参 数 的研 究报 道[] 系) 1, - 对动物 的育种 工 3 K2 为母猪亲本的后代数 目, 为每个公猪亲本的后代数 目; 为 作起到 了很大 的作用 。本研 究通过 收集湖 南美神 育 父 系半 同胞 方 差 ,' 为母 系半 同胞 方 差 ,e为 全 同胞 个体 间方差 。 O2 D c2 r 种有限公司 2 0 0 9年 3月至 2 1 年 3月 出生新美 系 1 遗传力估计及其显著性检验 01 . 4 种猪 的测定数据 ,采 用方差 分析法 估算杜 洛克 、 长 根据半 同胞资料作二因系统分组方差分析可以 白、 白猪 校 正到 14k 校 正天 数 、 膘 厚和眼 肌 得到 3 遗传力估计 值 , 大 1 g 背 个 半同胞估计 的狭义遗 传 面积 的遗传力 , 为湖南美 神种猪 的持续选 育提供 必 力为半 同胞组 内相关系数 的 4倍, 即: 要的基础数据和技术参数 。 父系半 同胞 h = x ' (# o + e , s 4 o /o + d o2 Z # r r r) 1 材 料与方法 母系半同胞 h24 o /O + D{ e 。 o  ̄  ̄ (# O 2 2 = r r r- ) - 盯
遗传度名词解释
遗传度名词解释遗传度,又称遗传力,是育种学和遗传学使用的一种统计量,用来估计某一性状在群体中有多大比例的变异是遗传因素决定的,测得变异也因环境因素效应变化(含测量误差)。
根据是否是受到成长家庭影响,人类的环境因素常分为“共享环境因素”和“非共享环境因素”。
遗传度通过对群体中遗传相关个体的表现型变异进行估计。
遗传度是定量遗传学的重要概念,主要用于育种和行为遗传学领域(如双生子研究)。
遗传度反映的是,可以归结于遗传变异的表现型变异幅度。
这不是在说,个体的某一性状有多少是遗传导致的。
因为即使未发生任何遗传改变,环境导致变异增加时,遗传性也可以改变。
以智商为例:遗传和环境都可以影响智商,如果遗传变异增加,致使个体表现型变异上升,那么遗传度就会上升;如果环境变异下降,致使个体表现型变异下降,那么遗传度也会上升。
因此,遗传度的大小关键在于遗传的相对贡献幅度。
遗传度是因特定群体、特定环境而异的。
表现型受到环境的效应幅度也可能与所涉基因相关。
基因对表现型的渠限化使得遗传度更加复杂,让其表达在所有环境中进行。
基因型相同的个体也可能由于表型可塑性表现出不同的表现型,让有些情况下遗传度更难测量。
随着近年来分子生物学的发展,使得我们可以估计环境改变对个体基因转录活动变化的影响。
然而,很多基因的转录也是不受环境影响的。
人们应用统计学估计遗传度的大小。
由于遗传度与方差有关,它是对群体中个体变异的一种测量。
遗传度可以是单变量的(单独研究一个性状),也可以是多变量的(同时研究多个性状)。
这也允许对不同性状(如发色和眼睛色彩)之间的共享遗传因素的比例进行测定。
环境和遗传是相互作用的,通过遗传分析可以测试并研究这些互作。
遗传度分析的前提是:群体中存在相关变异。
群体倘若不存在变异(每个个体都有或都没有),则不会存在遗传度。
而实际上,所有的人类行为性状都存在变异,且几乎都存在一定的遗传度。
遗传评估过程
猪场
个体
父亲
母亲
达100kg日龄
1
1
—
—
140
1
2
—
—
152
1
3
1
—
135
2
4
1
2
143
2
5
3
2
160
23
计算个体育种值
根据资料性质,可对种猪达100kg日龄写出如下动物模型:
yij hi a j eij
yij是第 i 猪场,第 个j 体的观测值
hi 是第 i 猪场的效应 a j第 j个体的育种值 eij是随机残差
12
遗传评估过程
什么是 BLUP
BLUP 是最佳线性无偏预测 它是用于预测个体育种值的方法
13
遗传评估过程
什么是 BLUP
最佳
估计误差最小 估计与真实育种值相关最大
线性
估计是基于线性模型 假设个体性能是遗传和非遗传效应的总和
14
遗传评估过程
什么是 BLUP
无偏
估计过程中估计值是无偏的 估计与真实育种值间平均差为零. 即所有可能估计 值的平均值等于真实育种值.
b = 2ph2 / [ 4 + (p-1) h2] = 2 x 5 x .3 / [ 4 + (5-1) .3] = .577
A = b(P-m) = .577 ( 140 - 170 ) = -17.1
11
遗传评估过程
多个亲属资料
A = b1X1 + b2X2 + b3X3 ….. bnXn
b 取决于 纪录数 后裔数 遗传力 重复率 相关
aˆ4 aˆ5
第四节 遗传力的估算及其应用
—
—
—
表型方差 VP=〔Σ (P-P)2〕/n = Σ(G-G)2〕/n+〔Σ(E-E)2〕/n+2〔Σ(G-G) (E-E)〕
/n =VG+VE+2COVEG
其中 VG 为遗传方差,VE 为环境方差,VEG 为协方差(为环境与遗传 的相互作用,当环境与遗传独立时,其值为 0)。
VP= VG+VE VP、VG、VE 分别表示表现型方差、基因型方差、(遗传方差)和环境方差。
∴ VF2= VGF2+ VF1 h2B= VGF2/ VF1×100%= (VF2- VF1)/ VF2×100%
对自花授粉作物,环境方差的估算还可以用以下几种方法:
1. VE=(VF1+ VP1+ VP2)/3
2. VE=(VP1+ VP2)/2
3.
VE=(VF1
VP1
V )1/3 P2
(二)狭义遗传力的估算
=(a-d)2/4=(a2-2ad+d2)/4
B 2 的遗传方差为:(∑fx2-((∑fx)2/n))/n=(a2+d2)/2-(a-d)2/4 =(a+d)2/4=(a2+2ad+d2)/4
以上可以看出:B 1 、B 2 的遗传方差都包含 a、d 不能分割的问题,为
了消除这个问题,将二者合并,则
(a-d)2/4+(a+d)2/4=(a2+d2)/2
E 是 G 偏离 P 的部分。G 是上代对下代的期望值,反映了上代对下代
要求的具体的基础。
———
—
——
—
—
推论到群体中,P=G+E,P=G+E,P-P=(G+E)-(G+E)=(G-G)+(E-E)
林木育种学——第四章遗传力、遗传增益
几种选择方式的分析
遗传力、遗传增 益、选择方式
几种选择方式的分析
(二)家系选择、家系内选择和配合选择 家系选择就是对入选优树的自由授粉或控
制授粉子代分别作子代测定,并根据各优树子 代性状的平均值,挑选优良家系,淘汰低劣家 系的过程,对选出家系不再作个体的选择。在 家系内挑选优良植株,称家系内选择。在优良 家系中再挑选优良单株,称配合选择 。
遗传力、遗传增
遗传力的概念
益、选择方式 一些树种高、木材比重和干形的
狭义遗传力的估算
遗传力、遗传增 益、选择方式
遗传力的概念
林木性状的遗传力有如下趋势: (1)不易受环境影响性壮的遗传力 较易受环境影响的性状要高; (2)变异系数小的性状的遗传力较 变异系数大的性状高; (3)质量性状(经树量化处理)的 遗传力较树量性状的高。
遗传力、遗传增 益、选择方式
几种选择方式的分析
(四)多性状选择 林业上需要的优良品种一般都需
具有多种优良性状。选择性状的多少, 影响到选种的效果。一般来说,改良一 个性状取得的效果要比多个性状大,也 比多个性状快,随着选择性状数目的增 多,就对单个性状的改良效果来说是极 为不利的,但据现有不少研究表明,许 多性状是独立遗传的,因此,由增加选 择性状造成的不利影响并不一定如理论 计算的那样严重。
第四章
遗传力、遗传增益、 选择方式
遗传力、遗传增 益、选择方式
一、遗传力的概念
遗传力、遗传增 益、选择方式
遗传力的概念
遗传力是选择育种中的一个重要
参数。对于树木个体数量性状的表现 型值(P)是其基因型值(G)和环境 (E)共同作用的结果。P=G+E 在基 因型与环境没有互作的前提下,一个 群体的表型值变量=基因型值变量加 环境变量。
遗传力
参数估计的基本设计遗传力我们关注遗传力的原因在于它能够确定父母与子女的相似程度,而这种相似性又依次决定了选择的反应。
尤其说明的是后代回归的斜率是h²=V A/V P.为什么用h²代替h?学生们经常会问为什么我们使用h²代替h来衡量遗传力,对于这点我们可以归咎于休厄尔赖特,因为他使用h表示一个个体的育种值和表型值的相互关系,再看相关系数的平方是变异的总百分数,通过一个变量来表示未予说明的部分,这导致了h²的普遍使用。
的确,我们谈论遗传力的时候,我们指的是h²而不是h。
再看h的确是一个个体的繁殖和表型值的相互关系,式子(5.1)为相关系数的定义遗传力是一个种群函数由于遗传力是一个基因和环境变化的函数,它是一个种群严格的性质,不同的种群,即使密切相关,也会有不同的遗传力。
自从遗传力成为一个种群的持续遗传变异的量度,零遗传力并不意味着一个特征是遗传决定的。
例如,一个自交家系会显示出结构性特点,这些特点相对于其他家系是明显的遗传差异的结果。
不管怎么样,后来没有假设的近亲种群遗传力的变异,h²是零。
遗传力的增加记录显示σ²p显性变化的增加导致h²的减少。
所以,如果能减少环境变量(例如更仔细测量一个特征,或使用更统一的环境)就能增加遗传力。
其中注意谨慎行事。
遗传力不仅仅是一个种群的基因性质,还是种群经历环境变化的分布。
因此,在实验室中测出的一个种群的遗传力测量值肯定是不同于同一种群在更广阔的自然环境下的测量值。
对于饲养员和实验员来说,基因型与环境相互作用很小不是一个严重的问题。
随着环境变化更普遍,显著的GxE被提出,它能够改变基因的价值和以后的任何适当的遗传方差。
这个问题特别关注的是植物育种,就环境价值的分布来说甚至略有不同的种植区域可能有细微但是一致的差异。
遗传力与育种值的预测h²代表总变异量的比例应占育种值的差异,此外,h²是给一个个体表型值给出的预测育种值的回归斜率,此根据回归斜率而得。
广义遗传力的计算公式
广义遗传力的计算公式广义遗传力是衡量遗传因素对表型变异影响程度的重要指标。
咱们先来说说广义遗传力的计算公式,它的公式是:H² = VG / VP 。
这里的 VG 代表遗传方差,VP 代表表型方差。
那啥是遗传方差和表型方差呢?咱们来慢慢捋一捋。
遗传方差就是由于遗传因素引起的变异,表型方差呢,则是观测到的个体表现出来的所有变异。
给您举个例子吧,就说种庄稼。
我之前在农村老家,就发现同一种小麦,在不同的田地里,长得不太一样。
有一块田的小麦,麦穗都特别饱满,颗粒也大。
而另一块田的小麦,麦穗就相对小一些,颗粒也不那么饱满。
这时候咱就来分析分析,为啥会这样呢?经过仔细观察和了解,发现第一块田,农民伯伯选的种子都是往年收成特别好的那些小麦留下来的,而且施肥、浇水啥的管理也特别到位。
而第二块田呢,种子来源比较杂,管理也没那么精心。
这就体现出遗传因素和环境因素对小麦生长的影响啦。
回到咱们说的广义遗传力,通过计算它,就能知道遗传因素在造成这种差异里到底起了多大作用。
如果广义遗传力高,那就说明遗传因素对这种小麦的生长表现影响大;要是广义遗传力低,那可能环境因素在其中的作用就更突出。
在实际的研究和应用中,计算广义遗传力可不是一件简单的事儿。
得先把各种数据收集好,比如不同个体的表现型数据,还有它们的亲缘关系等等。
然后再通过复杂的统计分析,才能得出比较准确的结果。
就像咱们研究人的身高,有些人个子高,有些人个子矮。
通过计算广义遗传力,就能知道遗传在决定身高上的重要程度。
要是遗传力高,那可能父母个子高,孩子大概率也不会矮;要是遗传力低,那后天的营养、运动啥的环境因素对身高的影响就更大。
所以说,广义遗传力的计算公式虽然看起来简单,就是 H² = VG /VP ,但背后涉及的东西可多着呢。
得认真去收集数据、分析数据,才能真正搞清楚遗传和环境对各种性状的影响。
总之,广义遗传力的计算公式是我们研究遗传和变异的重要工具,能帮助我们更好地理解生物的各种性状是怎么形成和遗传的。
9林木遗传参数的估算精品文档28页
特殊配合力的估算:
SCA E×A=9+13-11-13=-2; SCA E×D=14+13-14-13=0; SCA G×B=20+13-17-14=2; SCA H×C=6+13-10-13=-4;
4.3 配合Leabharlann 的应用• 一般配合力高的亲本,可作为无性 系种子园的建园材料;
• 特殊配合力高的组合,可用于建立 杂交种子园或杂交亲本。
考试重点
※基本概念; ※基本原理; ※遗传数据分析; ※常用育种方法,理论与手段; ※良种繁育方式及具体实施环节; ※常用遗传参数估算方法。
考试题型
※名词解释; ※填空题; ※判断题; ※简答题; ※计算题; ※综合问答题。
总 算 结 束 了 !
总评成绩=平时成绩× 30%+考试成绩× 70%
I was very happy to be the course instructor of “Forest Genetics & Tree Breeding”.Thanks for co-operation!
• 特殊配合力(special combining ability, SCA):指某些特定的组合减 去双亲一般配合后所呈现的表型偏 差。
4.2 配合力估算方法
例:假设有8株中选的优树要测定其配合 力大小,以4个为父本,4个作母本进行 杂交组配,得到16个杂交组合,其F1子 代生长量数据(组合平均值)见下表,请 估算各亲本的一般配合力及各组合的特 殊配合力?
母,父
A
B
C
D 平均 GCA
E
9 17 12 14 13 0
F 10 16 12 10 12 -1
G 11 20 10 15 14 1
重复力遗传力ppt课件
re
MSB MSW MSB (k0 1)MSW
5.56 1.450 0.586 5.56 (2 1)1.45
17
三、主要的用途
作为遗传力的上限
re
VG VEg VP
H2
2 G
VG
2 P
VG VE
h2
2 A 2 P
VA VP
广义遗传力 狭义遗传力
18
三、主要的用途
确定一个性状需要度量的次数
图 不同重复力时多次度量相对准确度(Q)的变化曲线
19
三、主要的用途
确定一个性状需要度量的次数
— 当重复力为0.75时,需要度量次数2~3次 —当重复力为0.5时,需要度量次数4~5次 —当重复力为0.25时,需要度量次数6~7次
20
三、主要的用途
精神 分裂 症
高血 压
冠状 动脉 病
0.34 0.12 0.45 0.53 0.75 0.80 0.62 0.65
35
36
鱼类遗传力的大小大致可以分为三个等级:遗传 力在0.4以上属高遗传力,在0.2-0.4之间属中遗 传力,小于0.2的属低遗传力。
37
38
《鱼类育种学》 p133
39
测量性状 1. 全长 2. 体长 3. 体高 4. 尾柄高 5. 尾柄长
E = Eg + Es
E ~ g General environmental
value
E ~ s Special environmental value
9
一、概念
P=G+E
Environmental value Genotypic value Phenotypic value
贝类遗传育种分析评估系统功能介绍及使用说明-欢迎莅临贝类遗传育种
贝类遗传育种分析评估系统功能介绍及使用说明1、系统功能概述本系统主要功能是记录贝类生长性状及遗传信息,并对其进行遗传评估,最终选择适当个体制定选种配种方案以指导选种。
系统通过网站公告、综合查询、信息维护和网络育种四个模块来实现上述功能。
用户可在登陆后通过点击横向导航按钮进入具体的模块进行使用。
(注:本系统所有功能都只能在登陆后使用,用户名和密码需通过E-mail方式向系统管理员申请)2、具体功能详细介绍1.网站公告本功能实质为系统日志,用户可以通过察看日志了解系统更新动态以及数据上传情况。
数据上传成功后系统会自动记录上传时间并在公告中公布,方便日后用户整理和区分已提交数据和未提交数据。
2.信息维护登记个体、家系或群体的基本档案和养殖环境档案个体档案包括:个体信息、生长性能、繁殖性能家系/群体档案包括:家系/群体抗逆性状、家系/群体苗期性状、家系/群体遗传信息养殖环境包括:养殖设施和条件本模块为用户提供2种数据上传形式:数据批量上传和数据表单提交。
批量上传的文件必须是只包含数据的纯文本文件,上传成功后数据自动存入数据库;表单提交数据应注意带星号的数据为必填数据。
上传的数据都要求采用统一的单位和格式,详见第四部分数据提交规范。
记录养殖环境主要目的是作为育种评估是的固定效应水平。
3.综合查询实现对系统输入数据的查询,包括:A.个体信息查询B.家系信息查询C.核心种质资源库查询用户可以通过各种关键词对数据库中的信息进行查询,关键词包括:数据的名称、数据数值的大小范围、数据的提交日期、种类名称、家系编号等。
4.网络育种本模块包含2大功能:遗传参数的估计和育种值的估计。
A.遗传参数估计(1)近交系数的计算系统调用mtdfreml对近交系数进行计算,可以进行单个个体的近交系数和家系的近交系数。
数据一旦录入系统,系统将自动计算近交系数并存入数据库,用户可直接点击链接进入查询页面查询相应的近交系数。
(2)表型性状相关性分析对贝类的壳性状(活体时可测量的性状)和软体性状(宰杀后才能测量的性状)进行相关分析和回归分析,得到相应的回归系数,以便通过壳性状推测软体性状。
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(二)狭义遗传率的估算
• 遗传方差的分解:VG=VA+VD+VI • VA:表示等位基因和非等位基因的累加效应所 引起的变异量,可以稳定遗传。 • VD:表示等位基因间的显隐性关系所引起的 变异量,不能稳定遗传。 • VI:表示非等位基因互作所引起的变异量, 随着基因组合的变化而变化,不能稳定遗传, 有的为了问题的简化,忽略不计。故: • VG=VA+VD 。
表1 B1的平均基因型理论值及遗传方差的估算 f x fx fx2
AA
Aa 合计
1/2
1/2 n=1
a
d
a/2
d/2 (a+d)/2
a2/2
d2/2 (a2+d2)/2
表2 B2的平均基因型理论值及遗传方差的估算 f Aa aa 合计 1/2 1/2 n=1 x d -a fx d/2 -a/2 (d-a)/2 fx2 d2/2 a2/2 (a2+d2)/2
• Aa×AA→ B 1 → AA Aa • Aa×aa→ B 2 → Aa aa • B 1的遗传方差为:(∑fx2-((∑fx)2/n))/n =(a2+d2)/2-(a+d)2/4 =(a-d)2/4=(a2-2ad+d2)/4 • B 2的遗传方差为:(∑fx2-((∑fx)2/n))/n =(a2+d2)/2-(a-d)2/4 = (a+d)2/4=(a2+2ad+d2)/4 • 将二者合并,则 • (a-d)2/4+(a+d)2/4=(a2+d2)/2
Vp、VG、VE分别表示表现型方差、基因型方差、 (遗传方差)和环境方差
。
二、遗传率的估算原理和方法
• 遗传率(heritability),又称遗传力,是 指一群体中某性状遗传方差与表现型总 方差的比值,通常以百分数表示。 • (一)广义遗传力的估算 • 广义遗传率(broad-sense heritability)是指 遗传方差占表型总方差的比值。 • h2B= VG/VP ×100%
第三节 遗传力的估算及其itability),又称遗传力,是 指一群体中某性状遗传方差与表现型总 方差的比值,通常以百分数表示。 • 某性状的表现型的数值,称为表现型值, 以P表示;其中由基因型所决定的数值, 称为基因型值,以G表示,表现型值与基 因型值之差就是环境条件引起的变异, 以E表示。三者的数量关系可用下式表示: • P=G+E
采用回交群体估算狭义遗传力 的方法
• V B 1+ V B 2= VA/2+ VD/2+2 VE (1) 前面我们已知: • VF2= VA/2+VD/4+VE (2) • (2)×2-(1)得: • 2VF2- (V B 1+ V B 2)= VA+ VD/2+2 VE(VA/2+ VD/2+2 VE)= VA/2 • 所以F2的狭义遗传力: • h2N= (VA/2)/ VF2 = 2VF2- V B 1+ V B 2) / VF2
• 狭义遗传率(narrow - sense heritability)定 义为加性方差占表型总方差的比值,通 常用百分数表示,记为h2N ,用公式表 示为: h2N = VA/VP ×100% = VA/(VA+VD+VI+ VE) ×100%
或h2N = VA/(VA+VD+ VE) ×100%
• 大家知道控制生物数量性状的基因是很 多的,假定为k对基因的话,则有: • VgF2=(a21/2+d21/4+a22/2+d22/4+…+a2k/2+d2 k/4) • 由于基因a1, a2,… ak的效应是相同, d1 , d2… dk的效应也是相同的。所以 • VgF2=∑a2/2+∑d2/4 令:∑a2=VA ∑d2= , 则有VgF2= VA/2+VD/4 • 如果考虑到环境:VF2= VA/2+VD/4+VE
三、遗传率的应用
• 遗传力与选择方法 遗传力低的性状早期 分离的世代采用系谱法选择效果差,应 采用混合法进行选择;遗传力高的性状 可采用质量性状育种的方法-系谱法进行 选择。 • 遗传力与选择世代 遗传力高的性状可在 杂种分离的早期世代进行选择;遗传力 低的性状选择,根据遗传力随着自交世 代的推移,遗传力逐渐提高,因此遗传 力的性状宜在杂种的高世代进行选择。
采用回交群体估算狭义遗传力
• 2.一对基因的遗传模式 • Aa杂合体自交,后代分离为AA、Aa和aa 三种基因型,假定三种基因型对数量性 状的平均效应分别为:a 、 d 、 -a 。图解 为:
• V= ( ∑ fx2-((∑fx)2/n) ) /n=a2/2+d2/2d2/4=a2/2+d2/4