Blast本地化安装图解

Blast本地化：window平台下blast软件的安装boyun发表于 2009-07-09 17:08 | 阅读 1 views

1.对于windows 2000/xp 用户，下载blast-

2.2.18-ia32-win32.exe安装文件

ftp:///blast/executables/LATEST/blast-

2.2.18-ia32-win32.exe

2.创建一个新目录，例如C:\blast，将下载的文件blast-2.2.18-ia32-win32.exe复制到该目录，双击这个文件，自解压产生bin、data、doc 三个目录，bin是程序目录，data是程序使用数据的目录，doc是文档目录。

表：bin目录中的程序

程序说明

bl2seq.exe进行两条序列比对

blastall.exe做普通的blast比对

blastclust.exe

blastpgp.exe

copymat.exe

fastacmd.exe通过gi号，接收号等，在数据库中检索序

列

formatdb.exe格式化数据库

formatrpsdb.exe

impala.exe

makemat.exe

megablast.exe megablast程序

rpsblast.exe

seedtop.exe

3.用文本编辑器创建一个ncbi.ini文件，文件包含下面内容：[NCBI]

Data="C:\blast\data\"

将ncbi.ini文件存放到系统的Windows 或者 WINNT目录。

4.将”C:\blast\bin”目录添加路径中（该步骤非必须，但会给以后的操作带来方便），方法：

1）右击我的电脑选择属性，选择高级，点击环境变量，

设置环境变量

2）系统变量中，选择Path，点击“编辑”，在变量值的后面添加“; C:\blast\bin”，点击确定

将安装路径添加到path

5.测试，打开dos窗口（点击开始，选择运行，打开的输入框中输

入“cmd”，确定），键入“blastall”，回车，如果安装正确，将显示blastall的所有参数说明。

安装测试

注意：

如果报错：“‘blastall’不是内部或外部命令，也不是可

运行的程序或批处理文件。”，请检查环境变量设置，或者

切换到安装目录的bin目录下，再执行。

如果报错：“FATAL ERROR: FindPath failed.”，请检查

ncbi.ini文件