反转录pcr原理及应用
反转录的原理及应用(1)
技术应用——RT-PCR
问题4:为什么选dT引物? 答:真核生物的mRNA都有个 PolyA的尾端,dT引物能识别这个 尾端并且结合上去。
技术应用——RT-PCR
反转录的生物学意义
(1)对分子生物学的中心法则进行了修正和补充 (2)在致癌病毒的研究中发现了癌基因,在人类一些癌细胞如膀胱癌、 小细胞肺癌等细胞中,也分离出与病毒癌基因相同的碱基序列,称为细 胞癌基因或原癌基因。癌基因的发现为肿瘤发病机理的研究提供了很有 前途的线索。 (3)在实际工作中有助于基因工程的实施。由于目的基因的转录产物易 于制备,可将mRNA反向转录形成cDNA用以获得目的基因。
RNA反转录过程
反转录酶(RDDP)的活性
以RNA为录酶
RNase H活性
RNase H从RNA5′端水解掉RNA分子
以反转录合成的第一条cDNA单链为模板,再合 成第二条cDNA分子
问题2:反转录酶能不能现在进行生物体外技术合成? 答:反转录酶是生物中提取的。还不能自主合成。
PCR仪
技术应用——RT-PCR
注 意 事 项
1. 在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在 总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。 2. 防止DNA的污染,采用DNA酶处理RNA样品。 3. 防止蛋白质的污染
技术应用扩展——QPCR
在PCR反应体系中加入荧光基团, 利用荧光信号累积实现了实时监测 整个PCR进程,对起始模板进行定 量分析的方法。
RNA反转录原理
[注]:反转录与逆转录不等同。反转录是进行基因工程过程中,人为地提取出所需要的目的基因的信使 RNA,并以之为模板人工合成DNA的过程;逆转录是RNA类病毒自主行为,在整合到宿主细胞内以RNA为 模板形成DNA的过程。二者虽同为RNA→DNA的过程,但地点不同,相对性的来说,反转录在体外,逆转 录在体内。
rt-pcr的原理应用
RT-PCR的原理应用什么是RT-PCRRT-PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)是一种基因检测技术,广泛应用于分子生物学和医学领域。
它可以在样本中检测到特定的RNA序列,并且是定量检测RNA的一种常用方法。
RT-PCR结合了反转录(Reverse Transcription)和聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction)两个步骤。
RT-PCR的原理RT-PCR首先将RNA反转录为互补的DNA模板,然后通过聚合酶链反应增加DNA模板的数量。
整个过程分为三个主要步骤:反转录、PCR扩增和检测。
1.反转录:RNA在反转录过程中被逆转录酶(reverse transcriptase)转录成DNA。
这个过程使用一些反向引物(reverse primer)和dNTPs(脱氧核苷三磷酸)来帮助反转录酶合成DNA链。
最常用的反转录酶是M-MLV(Moloney Murine Leukemia Virus)逆转录酶。
2.PCR扩增:在反转录完成后,使用特定的引物(primer)将目标DNA序列扩增。
引物是一小段DNA片段,它可以与目标DNA序列的两端序列互补,并作为DNA聚合酶合成新的DNA链的起始物。
PCR过程包括循环加热和降温的步骤,以便在每个循环中将DNA复制一次。
通过PCR扩增,可以快速扩增目标DNA序列的数量。
3.检测:扩增的DNA可以通过凝胶电泳、荧光染料或实时荧光PCR等方法进行检测。
凝胶电泳是一种常用的检测方法,可以通过电泳将DNA片段分离并可视化。
荧光染料可以与DNA结合,通过荧光信号来检测DNA的存在。
实时荧光PCR可以实时监测扩增反应的进行,并通过荧光信号的变化来测量样本中特定序列的数量。
RT-PCR的应用RT-PCR广泛应用于生物医学领域,尤其是在病毒检测、基因表达分析和研究等方面起着重要作用。
1.病毒检测:RT-PCR可以用于检测病毒的存在和定量分析。
普通PCR、原位PCR、反向PCR和反转录PCR的基本原理和操作步骤
普通PCR、原位PCR、反向PCR和反转录PCR的基本原理和操作步骤普通PCR1概述聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段。
可看作生物体外的特殊DNA复制。
DNA聚合酶(DNA polymerase I)最早于1955年发现,而较具有实验价值及实用性的Klenow fragment of E. Coli 则是于70年代的初期由Dr. H. Klenow 所发现,但由于此酶不耐高温,高温能使之变性, 因此不符合使用高温变性的聚合酶链式反应。
现今所使用的酶(简称Taq polymerase), 则是于1976年从温泉中的细菌(Thermus aquaticus)分离出来的。
它的特性就在于能耐高温,是一个很理想的酶,但它被广泛运用则于80年代之后。
PCR最初的原始雏形概念是类似基因修复复制,它是于1971年由Dr. Kjell Kleppe 提出。
他发表了第一个单纯且短暂性基因复制(类似PCR前两个周期反应)的实验。
而现今所发展出来的PCR则于1983由Dr. Kary B. Mullis发展出的,Dr. Mullis当年服务于PE公司,因此PE公司在PCR界有着特殊的地位。
Dr. Mullis 并于1985年与Saiki 等人正式发表了第一篇相关的论文。
此后,PCR的运用一日千里,相关的论文发表质量可以说是令众多其它研究方法难望其项背。
随后PCR技术在生物科研和临床应用中得以广泛应用,成为分子生物学研究的最重要技术。
Mullis也因此获得了1993年诺贝尔化学奖。
2 PCR原理PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链,重复循环变性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。
反转录荧光定量pcr
反转录荧光定量pcr反转录荧光定量PCR(qRT-PCR)是一种广泛应用于生物学实验室的技术,用于快速、准确地检测和量化RNA的表达水平。
它结合了反转录和聚合酶链式反应(PCR)的过程,使研究人员能够测量目标基因的mRNA含量并进行定量分析。
本文将分步骤介绍反转录荧光定量PCR的原理、方法和应用。
1. 反转录RNA反转录是将RNA转化成DNA的过程。
反转录荧光定量PCR需要先用逆转录酶反转录RNA。
将RNA和逆转录酶一起处理,产生与RNA相对应的DNA互补物(cDNA)。
cDNA是qRT-PCR的起始材料。
2. 选择探针和引物选择适当的探针和引物可以确保qRT-PCR测量目标RNA序列的准确度和灵敏度。
探针是一种DNA片段,可以与目标RNA序列互补并标记荧光。
引物是一对短DNA片段,用于扩增目标RNA序列,并且必须具有一定的特异性,以确保只扩增目标序列而不影响其他RNA。
3.PCR扩增PCR扩增是qRT-PCR的最后一步。
将反转录后的cDNA与选择好的引物和探针混合,并加入PCR反应液,触发PCR扩增反应。
PCR扩增反应产生的PCR产物量与cDNA中的目标RNA含量成比例。
4. 数据分析最后一步是数据分析。
qRT-PCR产生的数据通常是光信号的定量值,需要进行标准化,以便比较目标RNA在不同样本之间的表达水平。
标准化通常使用一个参考基因作为内部对照。
对标准化后的数据进行分析,可以研究目标基因在不同生理状态下的表达量的变化,并确定其功能。
反转录荧光定量PCR在生物学研究中的应用越来越广泛。
它可以帮助研究人员了解许多生物过程,包括发育、免疫应答和疾病机理等。
它还被广泛用于药物筛选,毒性测试和诊断测试。
总之,反转录荧光定量PCR是一个强大的工具,可以为许多生命科学领域的研究提供解决方案。
逆转录pcr的原理及主要过程
逆转录pcr的原理及主要过程逆转录PCR是一种常用的分子生物学技术,其主要作用是将RNA翻译为与特定目的蛋白质相关的DNA序列。
本文将为大家介绍逆转录PCR的原理及主要过程,以及其在生物医学研究中的应用。
1. 原理逆转录PCR的原理是将RNA转录为DNA。
正常情况下,DNA作为一个模板用于生成RNA分子。
然而,在逆转录PCR中,我们需要将RNA 反转化为DNA的过程,从而将RNA信息存储为可被PCR扩增的DNA序列。
逆转录PCR需要使用逆转录酶转录RNA,从而将其转化为DNA的complementary DNA(cDNA)。
转录后,我们可以使用PCR技术扩增cDNA,从而得到RNA的DNA拷贝。
2. 主要过程逆转录PCR的主要步骤包括:(1) 提取RNA:从细胞或组织中提取RNA,通常使用酚/氯仿方法或商用RNA提取试剂进行提取。
(2) 反转录:使用逆转录酶将RNA转录为cDNA。
首先将RNA与反向引物(reverse primer)混合,再加入逆转录酶以形成RNA-cDNA杂交物。
此时,逆转录酶开始合成cDNA链。
逆转录酶使用的是iTaq™ Reverse Transcription Supermix,其具有高反转录效率和准确性的优点。
(3) 库制备:将cDNA库制备到PCRElectrophoresis上,并进行PCR扩增。
PCR反应的反向引物也是用于逆转录反应的反向引物,以确保扩增的是RNA源。
(4) 分离和纯化:对PCR产物进行分离和纯化,如琼脂糖凝胶电泳。
(5) 序列分析:对PCR产物进行测序。
3. 应用逆转录PCR是一种非常有用的技术,已在许多生物医学研究中得到应用。
以下是一些应用实例:(1) 基因表达分析:逆转录PCR可用于分析不同组织和细胞类型中的基因表达情况。
(2) 病毒和细胞炎症研究:逆转录PCR技术可用于检测RNA病毒的存在以及细胞炎症相关基因表达的变化。
(3) 癌症研究:逆转录PCR技术可用于研究癌细胞中基因的表达变化以及潜在靶点的筛选。
反转录的原理及应用
2016年11月 吴思思
RNA反转录
本实
验所
用的
酶
技术
原 理
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过 程
页码
意注意Biblioteka 义事项RNA反转录原理
反转录是以RNA为模板,通过反转录酶 (Reversetranscripatase),合成DNA的过程, 是DNA生物合成的一种特殊方式。
问题1:反转录酶是指代哪些?是特定的一个还是多个酶共同作用? 答:反转录酶有两种,一种是来源于哺乳动物,另一种来源于鸟类。哺乳类的反转录酶都是一条多肽 链;鸟类的反转录酶则由两上亚基结构。所以反转录酶是特定的一个酶,但是它具有多种活性,在反 转录不同阶段中发挥不同的作用。
步骤2 反应结束后在冰上急速冷却,并加入以下试剂:
得到cDNA
引物 RNA 酶抑制剂 反转录酶 处理过RNA酶的水
技术应用——RT-PCR
PCR仪
1、按 PCR 仪正面左下角电源开关,启动 PCR 仪。 2、放 PCR 离心管。 3、反向重复第二步骤将顶盖板向后拉,盖 好顶盖。
4、按 F2“Create”新建一个扩增的 PCR 程序。 5、按控制台面右方上下左右方向键,可随
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RNA反转录原理
[注]:反转录与逆转录不等同。反转录是进行基因工程过程中,人为地提取出所需要的目的基因的信使 RNA,并以之为模板人工合成DNA的过程;逆转录是RNA类病毒自主行为,在整合到宿主细胞内以RNA为 模板形成DNA的过程。二者虽同为RNA→DNA的过程,但地点不同,相对性的来说,反转录在体外,逆转 录在体内。
意移动编辑位置,输入需要的温度、时间、 循环数等。
rtpcr步骤及原理
rtpcr步骤及原理RTPCR步骤及原理摘要:反转录聚合酶链反应(RTPCR)是一种常用的分子生物学技术,用于定量检测RNA或DNA中特定序列的数量。
本文将介绍RTPCR的步骤和原理,包括反转录、PCR扩增和结果分析等方面。
同时也会讨论RTPCR的优点、限制和在科研和临床中的应用。
引言在生物医学研究和临床实践中,准确测定RNA或DNA中特定基因或序列的表达水平或存在数量是非常重要的。
反转录聚合酶链反应(RTPCR)是一种被广泛应用的技术,能够对目标序列进行定量和扩增。
一、反转录反转录是RTPCR的第一步,也是从RNA到cDNA的转录过程。
这一步骤利用反转录酶将RNA模板转录成互补的cDNA。
反转录的关键是一条RNA模板和逆转录酶的结合,逆转录酶能够将RNA依据其互补碱基配对的原则合成cDNA。
反转录需要一些关键的试剂,如RNA模板、逆转录酶、引物和dNTPs等。
RNA模板是目标序列的来源,逆转录酶则是反转录的关键酶。
引物是用于使逆转录酶能够开始合成cDNA运输链的小片段,而dNTPs则是逆转录酶用来合成cDNA的原料。
二、PCR扩增PCR扩增是RTPCR的第二步,也是从cDNA扩增目标序列的过程。
PCR扩增是利用聚合酶将靶DNA序列经过多次循环扩增成数量可检测的水平。
PCR扩增需要两个引物,一个用于标记出序列的起始点,一个用于标记出序列的终止点。
PCR扩增需要通过一系列的循环反应来不断扩增目标序列。
每个循环有三个关键步骤:变性、退火和延伸。
变性是通过高温来使DNA 的两个链分离,退火是通过低温使引物与靶序列结合,延伸则是通过温度合适的聚合酶来合成新的DNA链。
三、结果分析RTPCR的结果分析可以通过几种不同的方法进行,最常见的是凝胶电泳和实时定量PCR。
凝胶电泳是一种常见的分离DNA片段的方法,可以将PCR扩增的产物根据大小分离成不同的带状,在凝胶上的迁移速率还可以推测出片段的大小,并对扩增的特定基因进行定性和定量分析。
反转录pcr原理
反转录pcr原理反转录聚合酶链式反应(reverse transcriptase PCR, RT-PCR)是一种广泛应用于分子生物学和遗传学领域中的实验技术。
反转录PCR是通过利用酶的催化作用将RNA转录成为cDNA,再对其进行PCR扩增,得到想要检测的基因或mRNA的技术。
PCR扩增过程中需要模板,而RNA不是PCR的良好模板,因此转录成cDNA可以克服RNA的不足。
同时,cDNA的合成是由反转录酶引导完成的,反转录酶还可以分解RNA的二级结构,从而使RNA模板更容易转录成cDNA,同时反转录酶还可以进行链延伸,从而形成单链cDNA,便于进一步的PCR扩增。
反转录PCR的优势1. 可以利用非常少量的RNA样本来检测目标基因或mRNA,异常表达的RNA,例如,在肿瘤细胞或某些医学检测中,只需要一些组织样本或血液检测样本即可。
2. 反转录过程中可以对RNA进行过滤,去除其中的DNA,而且可以对花粉孢子,原虫和肠道微生物的RNA进行转录。
3. cDNA是双链结构,可以使用两个引物同时扩增目标基因,PCR效率高,容易检测出关键的目标信息。
4. cDNA对PCR的稳定性更高,可以稳定地保存很长时间,从而方便后续实验操作。
反转录PCR的基本步骤1. 反转录:需要选用适当的反转录酶、引物和反转录缓冲液将RNA反转录为cDNA。
2. PCR扩增:根据目标基因的特点和反转录产物的质量,设计合适的引物,进行PCR扩增,通常采用热启动PCR反应,提高反应的特异性和积极性。
3. 产品检测:用凝胶电泳或者Real-time PCR等技术来鉴定扩增产物的数量、大小、纯度和特异性等。
可见反转录PCR技术不仅可以来检测细胞内RNA的表达,而且还可以检测病毒、细胞质RNA的表达状况,因此是目前用于发现和检测RNA的最好方法之一。
然而,反转录PCR虽然在分子生物学和遗传学研究中被广泛应用,但其有一定的不适应性,需要注意以下几个问题:1. 只能从RNA模板转录到cDNA,不能转录其他类型的RNA 或DNA。
rtpcr的原理实验步骤及应用
RTPCR的原理实验步骤及应用概述逆转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,简称RT-PCR),是一种常用的分子生物学实验技术,用于检测和定量分析RNA分子在细胞中的表达水平。
本文将介绍RT-PCR的原理、实验步骤及应用。
原理RTPCR利用逆转录酶(Reverse Transcriptase,简称RT)将RNA模板逆转录为cDNA(complementary DNA),然后通过聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)对cDNA进行扩增,最终得到大量的目标DNA片段。
RT-PCR的基本原理如下:1.逆转录:反转录酶RT利用RNA模板合成与之互补的cDNA。
在逆转录过程中,需要引入一条逆转录引物(反向互补RNA链)作为反转录的起始点。
2.PCR扩增:将逆转录合成的cDNA作为模板,引入一对特异性引物,通过PCR反应进行DNA扩增。
PCR反应分为三个步骤:变性、退火和扩增。
3.变性:将反应温度升高至95°C,使DNA双链变性为两条单链。
4.退火:将反应温度降低至特异性引物的退火温度,使引物与模板序列互相结合。
5.扩增:将反应温度升高至适合DNA聚合酶的活性温度,使DNA聚合酶逆反应合成DNA。
通过多轮的PCR反应,可以扩增出大量的目标DNA片段,其数量呈指数级增长。
实验步骤1. 样品处理首先需要从待检测的样品中提取总RNA,常用的提取方法有酚氯仿法和柱式纯化法。
提取得到的总RNA需要通过比色法或者用分光光度计进行测量,确保样品的质量和浓度。
2. 逆转录反应逆转录反应是将RNA模板转录为cDNA的过程。
需要准备逆转录试剂盒,主要包括逆转录酶、随机引物、dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)和逆转录缓冲液。
按照试剂盒说明书的配方,将总RNA与逆转录试剂混合,进行逆转录反应。
反应结束后,需要进行热灭活,以停止反应。
反转录pcr程序
反转录pcr程序反转录聚合酶链反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,简称RT-PCR)是一种用于合成cDNA的分子生物学技术。
它结合了反转录和聚合酶链反应(PCR),可从RNA模板合成对应的cDNA。
该技术在分子生物学中被广泛应用,特别是在基因表达分析、病毒检测和疾病诊断等方面。
以下是关于反转录PCR的相关内容。
一、反转录PCR原理反转录PCR的主要原理是利用病毒逆转录酶(Reverse Transcriptase)将RNA模板反转录合成对应的cDNA。
逆转录酶可合成一条cDNA链,作为PCR反应的起始物。
接下来,使用DNA聚合酶进行PCR扩增,即将cDNA扩增为足够数量的DNA分子。
最终通过PCR产物的检测和分析,可以获得RNA模板的相关信息。
二、反转录PCR技术步骤1. 提取RNA:从样品中提取所需的RNA,如细胞、组织、血液等。
2. 反转录反应:将RNA通过逆转录酶转录为cDNA,需要使用引物(primers)和反转录酶。
3. 酶反应停止:用高温杀死逆转录酶。
4. PCR扩增:使用DNA聚合酶进行PCR反应,通过引物特异性扩增cDNA。
5. 检测分析:通过电泳、荧光定量、实时荧光PCR或基因测序等技术对PCR产物进行分析,获得所需信息。
三、应用领域反转录PCR被广泛应用于各个领域,以下是一些常见的应用:1. 基因表达分析:通过检测RNA的表达,可以了解特定基因的转录水平,揭示基因在生理或病理过程中的功能。
2. 病毒检测:可通过反转录PCR检测病毒RNA,如HIV、乙肝病毒等,并进行病毒分类和定量分析。
3. 诊断疾病:反转录PCR在疾病的早期诊断中有重要应用,例如检测癌症标志物、感染病原体等。
4. 揭示基因调控机制:通过分析RNA转录的变化,可以了解特定基因的转录起始位点、剪接异构体和可变剪接等。
四、RT-PCR与PCR的区别RT-PCR是从RNA模板合成cDNA,然后进行PCR扩增。
RT-PCR反转录原理及方法
准备包括 DNA 模板、引物、酶等必备物
质的 PCR 反应体系。
3
扩增过程
通过 PCR 仪对 DNA 进行多轮循环扩增, 以放大目标基因片段。
PCR 的条件优化及设计
1 温度
2 引物设计
优化反应温度,包括退火 温度和扩增温度,以提高 PCR 反应的特异性和效率。
设计合适的引物,包括引 物序列的选择和引物之间 的匹配程度。
不同之处
qPCR 可以实时监测 PCR 反应过程中产生的 DNA 数量, 而 RT-PCR 只能得到最终结果。
RT-PCR在研究领域的应用
1
免疫学研究
检测细胞因子、免疫相关基因的表达水
疾病诊断
2
平。
检测病原体、肿瘤标志物等与疾病相关
的基因。
3
基因表达研究
研究基因在各个发育阶段和组织类型中
生物学研究
PCR 检测方法
凝胶电泳
将扩增产物通过电泳分离,根 据大小和电荷差异进行检测。
实时荧光定量 PCR
利用荧光探针在 PCR 反应过程 中实时监测产物的累积量。
测序
通过 Sanger 测序或二代测序技 术对 PCR 产物进行基因序列的 确定。
RT-PCR 与 qPCR 的区别与联系
相同之处
都是通过增加 DNA 拷贝数来检测特定基因序列。
3 核酸模板浓度
优化核酸模板的浓度以获 得最佳的 PCR 反应结果。
PCR 模板的种类
基因组 DNA
从细胞中提取的全基因组 DNA,用于检测基因组上特 定的基因。
cDNA
通过 RT-PCR 将 RNA 反转录 而成的 DNA,用于检测特定 的 RNA 序列。
合成 DNA
反转录pcr原理
反转录pcr原理
反转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription PCR, RT-PCR)是一种基于PCR技术的分子生物学方法,主要用于将RNA转录成cDNA,从而实现对RNA进行定量和检测。
其基本原理如下:
1. 首先,需要提取待分析样品中的总RNA。
2. 然后,利用反转录酶(Reverse Transcriptase)将RNA转录成cDNA。
反转录酶是一种特殊的RNA依赖性DNA聚合酶,可以使用RNA作为模板合成DNA,同时具有核糖核酸酶(RNase H)活性,在合成过程中不断降解RNA模板。
3. 反转录酶通常需要加入适当的引物(primers)以启动反应,引物可以是随机引物或特定序列的引物。
此外,还需要加入反转录缓冲液,其中包含有助于酶反应的离子、酶的辅因子和其他化学试剂。
4. 接下来,cDNA通过PCR扩增。
PCR扩增时,需要加入符合引物序列的引物和PCR反应体系所需的其他组分。
反应条件(温度、时间等)根据引物设计和目标DNA片段长度等因素进行优化。
5. 最终,通过凝胶电泳等方法分析PCR扩增产物,从而确定RNA 样品中目标基因的表达情况。
总之,反转录聚合酶链式反应是一种将RNA转录成cDNA并扩增的技术,通过PCR法实现对RNA进行定量和检测的方法。
反转录PCR原理步骤小结
反转录PCR原理步骤小结反转录聚合酶链反应(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)是一种将RNA转录成DNA并进行扩增的技术。
它可以用于检测和量化RNA,以及研究基因表达和调控等生物学过程。
下面是RT-PCR的原理和步骤的详细介绍。
一、反转录(Reverse Transcription)反转录是将RNA模板转录成相应的DNA。
在RT-PCR中,一个逆转录酶(Reverse Transcriptase)会被加入到已经提取出的RNA样本中,与RNA模板反应,合成相应的cDNA。
逆转录酶主要包括逆转录病毒逆转录酶(如Moloney Murine Leukemia Virus Reverse Transcriptase,M-MLV RT)和热稳定的逆转录酶(如Thermus thermophilus Reverse Transcriptase,Tth RT)等。
反转录步骤:1. 准备反应体系:将RNA样本、逆转录酶和逆转录引物(一般为Oligo(dT)或随机引物)混合。
2.反转录反应:将反应体系加热至逆转录酶适宜的工作温度(一般在37-55°C),进行反应。
反转录反应时间和温度取决于所用的逆转录酶和引物。
二、热变性(Denaturation)热变性步骤是将反转录反应产生的cDNA与RNA酶降解,以保证后续PCR扩增的特异性。
加热会使cDNA和RNA解开双链结构,而RNA酶被失活。
热变性步骤:1.准备反应体系:将热变性缓冲液和反转录反应产物混合。
2.热变性反应:将反应体系加热至95°C,保持一段时间(一般为2-5分钟)。
三、PCR扩增(Polymerase Chain Reaction)PCR扩增是将cDNA模板通过DNA聚合酶(DNA Polymerase)进行连续的循环扩增,以产生大量的DNA。
PCR包含三个关键步骤:变性、退火和扩增。
RT-PCR反转录原理及方法
DEPC 5g Trizol 100ml/1瓶 Invitrogen -- 4℃ Marker: 10μg 0.2μg/ml TIANGEN
精选20引物合成 1、β-actin:
正义:5′-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3′ 反义:5′-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3′ 2、par-4: 正义:5′-GGGACCTCGGAACTCAAC-3′ 反义:5′-TGTATCTGCCTGGGACTG-3′ 3、退火温度计算 2(A+T)+4(G+C) 正反义平均数,再上下波动度(±4℃,或±5℃) 4、引物各合成5OD,每OD一瓶分装好 5.引物稀释: 加DEPC水量为(μl) = ? nmol / OD × 管上所标OD数×100 是为10pmol / μl 浓度的引物溶液
2.上样缓冲液:
0.25%溴酚蓝
0.25%二甲苯青FF
30%甘油
6×缓冲液,4℃保存
精选2021版课件
14
所需材料及试剂
五、琼脂糖凝胶的配制: 1、1.0%: 1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液,微波炉中火30秒 至沸腾,熔化的琼脂物冷却至60℃时加入10mg/ml 溴化乙锭(Golden View) 5μl,充分混匀,将温 热的凝胶倒入已置好梳子的胶膜中,在室温下放 置30-45min后进行电泳。 2.1.5%:
PCR引物的设计 PCR反应条件的摸索
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所需材料及试剂
四、几种缓冲液的配制:
1、电泳缓冲液: Tris 54g 硼酸 27.5g 0.5M EDTA 20ml? pH8.0 蒸溜水 1000ml 5×TBE (贮存液) 再将5×TBE稀释10倍成0.5TBE就可以在电泳时使用(即工 作液浓度),如取50ml贮存液+450ml水--→500ml工作缓 冲液
反转录荧光定量pcr
反转录荧光定量pcr
反转录荧光定量PCR(RT-qPCR)是一种广泛应用于生物学研究的技术,它可以用于检测RNA的表达水平。
这种技术结合了反转录和荧光定量PCR的原理,可以快速、准确地测量RNA的数量。
RT-qPCR的原理是将RNA转录成cDNA,然后使用荧光探针检测cDNA的数量。
荧光探针是一种特殊的DNA分子,它可以与cDNA 结合并发出荧光信号。
荧光信号的强度与cDNA的数量成正比,因此可以用荧光信号来测量RNA的表达水平。
RT-qPCR的优点是快速、准确、灵敏和可靠。
它可以在短时间内测量RNA的表达水平,而且可以检测非常低浓度的RNA。
此外,RT-qPCR还可以同时测量多个RNA分子的表达水平,因此可以用于研究基因调控网络和信号通路。
RT-qPCR的应用非常广泛,包括基因表达分析、病毒检测、细胞分析和药物筛选等。
例如,在癌症研究中,RT-qPCR可以用于检测癌细胞中的基因表达水平,从而确定癌症的类型和严重程度。
在药物研究中,RT-qPCR可以用于评估药物对基因表达的影响,从而确定药物的疗效和安全性。
RT-qPCR是一种非常有用的技术,可以用于研究RNA的表达水平和基因调控网络。
它的快速、准确、灵敏和可靠的特点使其成为生物学研究中不可或缺的工具。
pcr的种类原理应用
PCR的种类、原理与应用1. 引言PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种重要的分子生物学技术,它通过不断的循环反应,在体外快速而特异性地扩增DNA序列。
PCR技术在许多领域都有广泛的应用,包括基因工程、医学诊断、犯罪侦查等。
本文将介绍PCR的不同种类、原理和应用。
2. PCR的基本原理PCR的基本原理是将DNA模板与引物、dNTPs和聚合酶等核酸合成相关物质混合,通过不断的循环反应,在适当的温度下进行DNA的扩增。
PCR通常包括三个步骤:变性、退火和延伸。
•变性:将DNA的双链解链,使DNA的两个链分开,产生单链DNA。
•退火:将退火温度降低,使引物与DNA模板能够结合。
•延伸:在延伸温度下,通过聚合酶酶活性,在引物的作用下合成新的DNA链。
通过不断地重复这三个步骤,可以扩增出大量的目标DNA序列。
3. PCR的不同种类PCR有许多衍生技术和方法,下面介绍几种常见的PCR种类:3.1. 实时定量PCR(qPCR)实时定量PCR是一种可以实时监测PCR反应产物的技术。
它通过引入荧光探针,可以在PCR过程中不断监测扩增产品的累积量,可以 quantification定量PCR的结果。
实时定量PCR在基因表达分析、病原体检测和基因突变分析等领域有广泛应用。
3.2. 简并度PCR简并度PCR是一种可以扩增目标序列中存在扩增特异性的多个变体的技术。
它可以通过引入含有多个碱基的引物,扩增出不同的突变体。
简并度PCR在突变分析和基因多态性研究中有重要应用。
3.3. 反转录PCR(RT-PCR)反转录PCR是一种将RNA转录成互补为DNA的技术。
通过引入反转录酶,可以将RNA转录成cDNA,然后再进行PCR扩增。
RT-PCR在基因表达分析和病毒感染研究中有广泛应用。
3.4. 数字PCR(dPCR)数字PCR是一种可以精确计数PCR产物数量的技术。
它通过将反应混合物均匀分成大量微小反应体积,并在多个反应中独立扩增,再通过检测阳性和阴性结果的比例来计算出初始DNA模板的拷贝数目。
逆转录pcr的原理和应用
逆转录PCR的原理和应用1. 什么是逆转录PCR逆转录PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) 是一种常用的分子生物学技术,它结合了逆转录和聚合酶链反应两个步骤,用于将RNA模板转录成DNA,并扩增目标DNA序列。
逆转录PCR主要由三个步骤组成:逆转录、热变性、扩增。
2. 逆转录PCR的原理逆转录PCR的原理基于反转录酶的特性。
在逆转录反应中,反转录酶 (reverse transcriptase) 将RNA作为模板,合成其互补的cDNA (complementary DNA)。
随后,PCR反应使用cDNA作为模板,在存在引物和酶的条件下进行。
逆转录PCR的步骤如下:•逆转录步骤:首先,反转录酶结合在RNA模板的末端,开始合成第一链cDNA。
反转录酶能够以RNA为模板,合成cDNA的互补链。
此过程在逆转录酶的逆转录活性作用下进行。
•热变性步骤:加入一组热变性,使RNA-cDNA复合物解开,得到单链cDNA。
这是逆转录PCR和常规PCR的一个重要的区别之一。
•扩增步骤:采用PCR方法进行DNA扩增。
引物特异性地结合在cDNA的两端,并通过聚合酶链反应增加cDNA的数量。
在PCR反应中,交替进行高温变性和低温退火,使DNA链得以分离和扩增。
3. 逆转录PCR的应用逆转录PCR技术在分子生物学研究中有广泛的应用,下面是一些主要的应用领域:•基因表达分析:逆转录PCR可用于研究基因的转录水平。
通过将RNA转录成cDNA,可以扩增并测量目标基因的表达量。
这使得研究人员能够发现不同组织、生物样本或不同条件下的基因表达差异。
•病毒感染研究:逆转录PCR可以检测和监测病毒感染。
通过转录和扩增病毒RNA,可以快速诊断病毒感染,对疾病的监测和预防提供支持。
•分子克隆:逆转录PCR可以用于克隆特定基因的cDNA。
通过引物的选择,可以扩增和克隆目标基因的cDNA。
反转录pcr的原理
反转录pcr的原理
反转录PCR是一种常用的分子生物学技术,用于将RNA转录为DNA,并进行扩增。
其原理如下:
1. 反转录:首先,使用反转录酶将RNA转录为互补的单链cDNA。
反转录酶通常使用逆转录酶,它能够识别RNA模板,并合成与其互补的DNA链。
这一过程使得RNA的信息得以
保留,同时便于后续的PCR扩增。
2. 降解RNA:在反转录完成后,通过加入碱性条件,可使用
碱性条件迅速将RNA降解为单核苷酸。
这样可以消除RNA
的干扰,并保证后续PCR反应中只扩增转录的cDNA。
3. PCR扩增:接下来,通过PCR反应对cDNA进行扩增。
PCR反应由两个反向引物(与目标序列的两个互补区域匹配)和一种DNA聚合酶组成。
在PCR的不断循环中,DNA的两
个链会被解开,并在每个引物的配对下合成新的DNA链。
这
样就实现了对目标序列的扩增。
4. 分析:最后,可以通过凝胶电泳或其他方法对PCR产物进
行分析和检测。
通过分析PCR产物的大小和数量,可以确定
目标RNA在起始样本中的相对表达水平。
通过反转录PCR技术,可以将RNA转录为稳定的DNA,便
于后续的分子生物学研究。
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反转录pcr原理及应用
反转录PCR(RT-PCR)是一种将RNA转化为DNA并进行扩增的技术。
它利用酶逆转录酶(reverse transcriptase)将RNA逆转录为互补的cDNA,然后通过聚合酶链式反应(PCR)扩增cDNA,从而实现对RNA表达的定量分析。
RT-PCR技术在分子生物学和医学领域中广泛应用,主要有以下几个方面:
1. 定量分析RNA表达:因为RT-PCR技术可以将RNA表达量转化为cDNA扩增的数量,所以它可以用来定量分析基因在不同组织或条件下的表达。
2. 检测RNA病毒感染:RT-PCR技术可以用来检测病毒引起的RNA感染,如新冠病毒、HIV等。
3. 分析组织学标本:RT-PCR技术可以用于分析组织学标本中的RNA表达,如肿瘤组织中的癌基因表达等。
4. 检测基因突变:因为RT-PCR技术可以扩增含有突变的cDNA序列,所以它可以用来检测和鉴定基因突变。
5. RNA测序:RT-PCR技术可以用来预制RNA靶点,供后续RNA测序实验使用。
RT-PCR技术有多种不同的类型,它们的原理和应用有所不同。
以下介绍几种常见的RT-PCR技术:
1. 实时荧光定量PCR(qPCR):qPCR采用荧光探针实时检测PCR反应过程中扩增产物的数量,从而实现对RNA表达量的准确量化。
2. 反向转录-定量PCR(RT-qPCR):RT-qPCR在RT-PCR的基础上,加入了荧光定量的测量方法,可以准确检测低浓度RNA样品中的表达情况。
3. 等温扩增RT-PCR:等温扩增RT-PCR是一种在恒定温度下进行的扩增,不需要特殊的PCR仪器,适合于在野外等条件下进行分析。
4. 数字PCR(dPCR):dPCR是一种基于液滴PCR技术的扩增方法,可以用来检测少量RNA样品中的寡核苷酸序列。
虽然RT-PCR技术在RNA表达分析及临床应用方面有很多优势,但是这项技术也存在一些潜在的问题。
例如,使用PCR扩增技术时,可能会出现非特异性扩增产物,或者PCR抑制效应,这些都会影响数据分析的准确性。
总之,RT-PCR技术的应用范围非常广泛,在医疗、农业、环境等领域都有重要的应用价值,不断改进和创新RT-PCR技术,将对人类健康和生态健康的研究发
挥重要作用。