数量遗传学基础

合集下载

《数量遗传学基础》课件

《数量遗传学基础》课件

03
人类健康与疾病研 究
利用数量遗传学方法研究人类复 杂疾病的发生机制,为疾病预防 和治疗提供新的思路和方法。
THANKS
感谢观看
3
疾病抵抗力增强
通过研究动物的疾病抗性基因,提高动物的疾病 抵抗力,降低养殖成本和动物疾病发生率。
人类遗传学研究
疾病预测与预防
利用数量遗传学方法,研究人类遗传性疾病的发病风险相关基因 ,为疾病的预测和预防提供科学依据。
个体差异研究
通过研究人类的数量性状基因,了解个体差异的遗传基础,为个性 化医疗和健康管理提供支持。
《数量遗传学基础》ppt课件
• 数量遗传学概述 • 数量遗传学的基本概念 • 数量性状的遗传模型 • 数量遗传学的研究方法 • 数量遗传学的应用 • 展望与未来发展
01
数量遗传学概述
定义与特点
定义
数量遗传学是研究生物群体中数量性状遗传规律的科学。
特点
数量性状是受多基因控制的,其遗传变异规律比质量性状复 杂。
04
数量遗传学的研究方法
统计分析方法
统计分析方法
QTL分析
关联分析
元分析
这是数量遗传学中最为常见和 基础的研究方法。通过统计分 析,可以对遗传数据进行分析 和解释,探究遗传变异的来源 、分布和作用机制。
数量性状位点(QTL)分析是 利用统计学方法定位控制数量 性状的基因位点,分析基因位 点对表型变异的贡献。
表型组学研究
结合新一代测序技术和成像技术,对动植物表型组进行深入研究, 以揭示表型变异与遗传变异之间的关系。
未来发展方向与挑战
01
跨物种比较研究
比较不同物种间的遗传差异,以 揭示物种进化的机制和规律,为 生物多样性保护提供科学依据。

动物遗传学-第九章 数量遗传学基础

动物遗传学-第九章  数量遗传学基础
遗传力的真值难于真正得到,一般我们查阅的遗传力都有一 定的范围。
根据特定资料估计的遗传力,只能作为一个估计值看待。
n
P
P1 P2 Pn
Pii 1nn Nhomakorabea同理可得:
n
Gi
G i
,
n
n
Ei
E i n
若E与G之间相互独立,在一个随机交配的大群体中
n
Ei 0 P G
i
群体均值能否代表群体基因型均值取决于群体大小,群 体越大,代表性愈强。
一、遗传力(heritability):
(一)概念: 亲代传递其遗传特性的能力。 或指性状的遗传方差在总方差(表型方差)中 所占的比率。
二、简单性状和复杂性状
简单(遗传)性状 (simply-inherited trait) 受很少数基因的控制,而且几乎不受环境变化的影响。
如孟德尔豌豆试验中所列举的性状都是简单(遗传)性 状。
复杂性状 (complex trait) 受多个基因的作用,而且易受遗传或非遗传因素的影
响。多在医学上使用。如糖尿病。
(二)对遗传力的理解注意事项:
遗传力是描述性状的一个特征量,遗传力大说 明受到遗传的影响大,遗传力低则环境的作用大。 性状遗传力的高低并不表示性状的好坏与畜群 的好坏。
0<h2 <1
(三)若干性状的遗传力
性状 初生重 断奶重 成年体重 椎骨数 乳头数 背膘厚 眼肌面积
表1 表猪1 一猪一些些性性状状的遗遗传传力 力
第九章 数量遗传学基础
一、质量性状和数量性状
质量性状(qualitative trait) —遗传基础是单个或少数几个基因的作用,它的 表型变异是间断的。如牛的无角与有角,兔的白 化与有色。

数量遗传学基础

数量遗传学基础



2 D


2
2 AA

2
2 DD


2 AD


1
1 2
1 4 1 8 1 4
1 2
1 4 1 4

24
第四节 数量性状参数分析
25
定量描述数量性状遗传规律有三个最基本的遗传参数: 重复力、遗传力和遗传相关
重复力(repeatability)
是衡量一个数量性状在同一个体多次度量值之间的相关 程度的指标。 对性状的终身表现产生的影响有:
遗传力概念和估计原理
广义遗传力 指数量性状基因型方差占表型方 差的比例,它反映了一个性状受遗传效应影响 有多大,受环境效应影响多大。 实现遗传力 指对数量性状进行选择时,通过 亲代获得的选择效果,在子代能得到的选择反 应大小所占的比值,这一概念反映了遗传力的 实质。
4
数量性状的特征
数量性状在个体间的差异体现在量上或程度 上,一般很难描述,需要度量; 在一个群体中,数量性状变异呈连续性; 数量性状受多基因控制; 数量性状对环境影响敏感。
5
第二节 数量性状遗传的多基因假说
6
微效多基因假说(Nilsson-Ehle)
主要论点如下: 数量性状是由许多效应微小的基因控制; 这些微效基因的效应相等且相加,故又称累加基因, 在世代相传中服从孟德尔原理,即分离规律和自由组 合规律,以及连锁互换规律; 这些基因间一般没有显隐性区别; 数量性状同时受到基因型和环境的作用,而且数量性 状的表现对环境影响相当敏感。
CovG
(X,
Y)



2 A
(2.11)
因此,如果忽略基因的上位效应和显性效应,

数量遗传学的基础 第一节 性状的分类

数量遗传学的基础  第一节 性状的分类
对性状必须进行度量而不是进行简单的区分; 必须应用生物统计的方法进行分析归纳,方能了解数量
性状遗传变异的动态; 必须以群体为研究对象。
数量性状的特点
变异的连续性 对环境的敏感性 分布的正态性 多基因作用的微效性
数量性状的特征
对质量性状而言: • 不易受环境的影响而发生变异 • F1有显隐性之分 • F2代可明显分组,不会出现超亲遗传的现象
对数量性状而言:
玉米穗长(表)
• 易受环境的影响而发生变异 • 两个纯合的亲本杂交,F1代一般是双亲的中间类型,但有时
人的身ห้องสมุดไป่ตู้(图)
遗传特征:两个有差异的亲本杂交
1. F1为双亲中值,但有时会偏向某一亲本; 2. F2均值、F1均值、双亲中值相近 3. F2变幅增大,但是变异程度远远超过F1 4.易受环境条件影响 5.有超亲遗传的现象:当杂交的亲本不是极端类型的时候,杂 交后代中有可能会出现高于高值亲本或低于低值亲本的类型
质量性状与数量性状的关系
1 由于区分的着眼点不同 2由于杂交亲本的差别基因对数不同。数量性状一般由微效 多基因控制,但在某些情况下,也可由单一的主基因控制。 3 一因多效,一个基因可以同时控制质量性状和数量性状, 控制数量性状的基因与控制质量性状的基因可能连锁。
三、 阈性状
可以用等级或分类表示的性状,如猪肉 颜色分为5级;蛋黄颜色分为9级。
第十四章 数量遗传学基础
一、数量遗传学(quantitative genetics)
1.概念 “是遗传学原理与统计学方法相结合,研究
群体数量性状的遗传学分支科学。” 遗传学 统计学 群体 数量性状
动物生产中需要改良的性状大多是数量性状。
第一节 性状的分类

数量遗传学基础

数量遗传学基础

基本概念-数量性状基因座(QTL)
对数量性状有较大影响的基因座称为数量 性状基因座(quantitative trait locus,QTL),它 是影响数量性状的一个染色体片段,而不一定是 一个单基因座。
有限的基因如何控制众多的数量性状?
一般可以归结为下列三个原因: 1、基因仅仅是性状表现的遗传基础,它与性状的关系并非
位基因久间性一的环定上的境位随效机效应性应,和(一暂般e时p均i将性st它a环们t境i归c 并效e到f应f环ec境t效)。应偏差值中,统称
为剩余值 ,记为 R。
控制数量性状基因具有各种效应,主要有:
加性效应(additive effect,A):等位基因 (allele)的累加效应;
显性效应(dominance effect,D):等位基因之 间的互作效应。
群体遗传结构影响因素——迁移
迁移(migration):不同群体间由于个体转移 引起的基因流动过程
在家畜育种实践中,迁移主要体现为引种,即 引入优良基因加快群体的遗传改良,是提高育 种效率的有效途径。
群体遗传结构影响因素—选择
选择(selection):群体内个体参与繁殖的机会不均等, 从而导致不同个体对后代的贡献不一致。造成这种繁殖机 会不均等的原因主要有个体适应性和生活力的差异、个体 繁殖力不同及人为的选择,前两者是自然选择的主要因素, 而人工选择是动物育种改良最重要的手段。
上位效应(epitasis effect,I):非等位基因之 间的相互作用。
基因型值是各种基因效应的总和。 G=A+D+I ,
表现型值������ P=A+D+I+E
基因效应和育种值
考察一个具有等位基因A1和A2的基因座,假 设纯合子A1A1的基因型值为+a,A2A2的基因型值 为-a,杂合子A1A2的基因型值为d,它取决于基因 的显性程度大小,无显性时d=0,完全显性时

动物育种学-第二章-数量遗传学基础-PPT精品

动物育种学-第二章-数量遗传学基础-PPT精品

阈性状(threshold trait):表现型呈非连续变
异,与质量性状类似,但不是由单基因决定,性状 具有一个潜在的连续型变量分布,遗传基础是多基 因控制的,与数量性状类似。
数量性状的特征
区分性状的依据:
性状是描述性的,还是可以度量的; 性状是呈间断性分布,还是连续性分布; 性状的表现是否容易受到环境的影响; 控制性状的遗传基础是单基因还是多基因。
假定基因型效应、永久性环境效应和暂时性环境效应之间
都不存在相关,可以将表型方差( V P )剖分为:
VPVGVEPVET
故重复力 re 可定义为:
reVGV P VEP
VGVEP VGVEP VET
重复力的作用
重复力可用于验证遗传力估计的正确性 重复力可用于确定性状需要度量的次数
若定义A1和A2基因的平均效应值分别为 1
和, 2 则有:
1 2 p p [ q d (q d [ (p p ) q ] ) 2 p]q q [d d (q p )] (2.8)
基因的平均效应 是指该基因随机地与群体
第三节 亲属间相关分析
亲属相关,有两类概念:一是亲属间的遗传相关 二是亲属间的表型相关。
亲属间的遗传相关 是从整体而言的,用亲属
个体的基因来自共同祖先的概率计算,描述亲属间 整体上的亲缘相关程度,与具体的性状没有关系。
亲属间的表型相关 是描述亲属间性状表型值
间的相关系数,由于只有特定的数量性状才有表型 值,因此这种相关在不同性状、不同群体都是有所 不同的。
假设一个个体度量了 k 次,用这些度量值的平
均数作为该个体的平均表型值,记为 Pk ,可以得到 多次度量均值方差与单次度量值方差的关系为:

动物遗传学-数量遗传学基础

动物遗传学-数量遗传学基础
15
3 数量性状表型值的剖分
16
由于D和I带有一定的随机性,一般将它们与环境偏 差合并,统称为剩余效应。
17
第二节 通径理论
18
1. 概念
自然界任何两个或多个事物之间的关系不外乎两种情况:一 种是平行关系;另一种是因果关系。 所谓平行关系是指事物间不分因果,只是互为因果或两者具 有共同原因以致相互关联。 例如:猪的瘦肉率部分决定于臀肉率,部分决定于腰肉率。 臀肉率与腰肉率有一定关系,但在它们之间很难确定哪个是 “因”,哪个是“果”。
2 同一个纯系,甚至是同一个植株所结种子,重量差异更大,变 化范围20-70mg,但这种差异在相继世代是不能遗传的,纯系 内的差异是由于环境条件造成的,在纯系内选择是无效的。
例如,在他的第15个纯系中选出重量为20mg和60mg的种子种植, 其后代平均种子重量分别为46.9mg和45.6mg,均接近该纯系群体 的平均种子重量45.0mg。
44
将控制一个数量性状的所有基因座上基因的 加性效应总和称为基因的加性效应值,它可以 通过育种改良稳定改进。个体加性效应值的高 低反映了它在育种上的贡献大小,因此也将这 部分效应称为育种值。
45
一、遗传力
数量性状的表现既受到个体遗传基础的控制, 同时又受到所处环境条件的影响,而且这两种不同 的效应又可以作进一步的剖分。应该如何从量的角 度来推断出影响一个数量性状表现的遗传效应有多 大?环境效应有多大?
13
3.控制数量性状的微效基因(Minor effect polygenes)与控制质 量性状的宏效基因(Major gene)都处于细胞核的染色体上, 多基因的遗传行为同样符合遗传基本规律,具有复制、分离和 重组、连锁和交换的特性。
4.由于微效基因的效应微小,多基因(Polygenes)并不能予以 个别辨认,只能按性状的表现在一起研究,对所涉及的基因对 数做粗略的估计。

数量遗传学基础

数量遗传学基础
• 性质 • 在二倍体遗传平衡群体中, 杂合子频率值永
远不会超出0.5。 • 杂合子频率是两个纯合子频率乘积平方根2
倍, 即H=2√(DR)
数量遗传学基础
第6页
哈代 - 温伯格定律应用
• 计算基因频率
– 共显性及不完全显性
• 基因型与表型一致
– 完全显性
• 杂合子与显性纯合子表型相同;隐性纯合子基因型 与表型一致。
能够度量 呈连续变异 易受环境影响 多基因控制
数量遗传学基础
第13页
表9-1 质量性状与数量性状比较
质量性状
数量性状
性状主要类型 遗传基础
变异表现方式 考查方式 环境影响 研究水平 研究方法
品种特征、外貌特征 少数主基因控制 遗传关系简单 间断型 描述 不敏感 家庭
系谱分析、概率论
生产、生长性状 微效多基因 复杂 连续型 度量 敏感 群体
数量遗传学基础
第24页
设有n组数据,每组有k个数据:
组别 第一组 第二组 X..
……. … 第n组
变量取值 X11 X12 … X21 X22 …


Xn1 Xn2 …
组均数 总均数
X 1k
X1..
X 2k
X2.


X nk.
Xn.
数量遗传学基础
第25页
三、重复率预计
重复率就是以个体分组, 以个体度量值 为组内组员, 计算得到组内相关系数。这 时组间方差就是个体间方差, 组内方差就 是个体内度量间方差。
• 随机交配、平衡群体
数量遗传学基础
第1页
基因频率与基因型频率之间关系
• 设群体某一基因座位上存在两个等位基因A和a, 各自基因频率分别设为p和q; 群体内个体在该基 因座位上含有三种基因型,即AA, Aa, aa,各自 概率分别设为D.H、R; 则存在以下等式:

育种学-第二章 数量遗传学基础

育种学-第二章 数量遗传学基础

第二章数量遗传学基础第一节群体遗传结构群体(population):指在一定的时间和空间范围内,具有特定的共同特征和特性的个体集群。

可以是一个种、亚种、变种、品种或品系等。

孟德尔群体(Mendelian population):个体间可以通过交配进行基因交流的有性繁殖群体。

因此,最大的孟德尔群体应该是一个种。

基因频率和基因型频率基因频率(gene frequency)概念:一个群体中某一等位基因的数量占同一基因座所有等位基因总数的比例。

取值范围:0~1,通常用小数表示;表示方法:小写字母,如p、q、r等;性质:全部等位基因频率之和等于1。

基因型频率(genotype frequency)定义:某一基因座特定基因型占全部基因型的比例。

取值范围:0~1,用小数表示表示方法:大写字母,如D、H、R等。

性质:同一基因座所有基因型之和等于1。

基因频率和基因型频率的关系p=D+1/2H q=R+1/2HHardy—weinberg定律在随机交配的大群体中,若没其它因素的影响,基因频率始终保持不变。

任何一个大群体,无论基因频率如何,只要经过一代随机交配;一对常染色体基因的基因型频率就达到平衡状态;若无其它因素影响,以后一代一代随机交配下去,这种平衡状态始终保持不变。

平衡状态下,D=p2 H=2pq R=q2HW定律的推广复等位基因K个等位基因A1、A2……Ak,其基因频率分别为p1、p2 ……pk,可形成k种纯合基因型和k(k-1)/2种杂合基因型。

遗传平衡状态下,基因频率和基因型频率的关系为: (∑pi)2= ∑pi2+2 ∑pipj其中,∑pi2表示纯合子的频率,∑pipj表示杂合子的频率。

多基因座达到遗传平衡的速度主要取决于各基因座间的连锁程度;连锁越紧密,达到平衡所需世代数越多。

连锁不平衡(linkage disequilibrium)实际观察的基因型频率偏离理论平衡频率的现象。

也叫配子相不平衡(gametic phase disequilibrium)。

2数量遗传学基础-文档资料62页

2数量遗传学基础-文档资料62页

1 2
0
14A2 116A2A
1 4
0 81A2 614A2A
1 8
1 16
1 4A 2 1 16 D 2 1 16 A 2 A2 15D 26 D 6 14 A 2 D
1 4
0
12A2 14A2A
1 2
0
14A2 116A2A
10
数量性状数学模型
数量性状表型值剖分
数量性状表型值(P)线性剖分为基因型值 (G)和环境效应值(E)两个部分,即:
P=G+E+IGE
(2.5)
IGE是基因型与环境的互作偏差效应值
假设 E 0 ,则在同一固定环境条件下可认


P G
影响数量性状表型值的环境效应,又可分为
系统性环境效应(或称固定环境效应)和随机环
若定义A1和A2基因的平均效应值分别为 1
和, 2 则有:
1 2 p p [ q d (q d [ (p p ) q ] ) 2 p]q q [d d (q p )] (2.8)
14
基因的平均效应 是指该基因随机地与群体
所有的基因效应 持久性环境效应 指时间上持久或空间上非局部效应
的环境因素对个体性状表现所产生的影响。
暂时性环境效应 一些暂时的或局部的特殊环境因素
对个体性状的某次度量值产生影响
26
重复力估计原理
从效应剖分看,可将环境效应( E)剖分为持久性环境效
应( E P ) 暂时性环境效应( E T )两部分 EEPET ,因此 P G E G E P E T
一般情况 Φ Φ '
1 A 2 A 2 D 2 D 2 2A 2 A 2 A A 2D 2 D 2D D A 2A 2 D D 1

七章节数量遗传学基础

七章节数量遗传学基础
子代平均值
hR2
R S
PO PP
P P
全群平均值 种畜平均值
2024/9/28
40
概念:遗传力旳几种表述
遗传力是育种值对表型值旳决定系数
h2 = dP.A = VA/VP
遗传力是育种值对表型值旳回归系数 遗传力是育种值和表型值旳有关系数
2024/9/28
41
遗传力估计旳原理和措施
遗传力估计旳原理
2024/9/28
20
通径系数旳性质(三)
共同原因
ry1y2 = P2 P2(左) ry1y2 = rx2x3 P2 P3(中) ry1y2 = P2 P 2 + P3 P 3(右)
2024/9/28
21
通径系数旳性质(四)
ryx1 = P1 + r12 P2 + r13 P3 dy.x1 + dy.x2 + dy.x3 = 1
2024/9/28
22
通径系数旳性质(五)
ry1y2 = P2 P2 + P3 P 3 + P2 r23 P 3 + P3 r23 P 2
2024/9/28
23
三、通径链旳追溯规则
1. 通径方向,只能“先退后进” 2. 一条通径链最多只能变化一次方向 3. 经过一条有关线等于一次方向变化
i1
j 1 n
ki
742
1722
1332
14492
621.6633
5 10
8 101
i 1
SSW SST SSb 2812.8713 621.6633 2191.2080
2024/9/28
31
例题
n

第九章 数量遗传学基础.

第九章 数量遗传学基础.

第九章数量遗传学基础概述一、质量性状和数量性状的遗传动物的遗传性状,按其表现特征和遗传机制的差异,可分为三大类:一类叫质量性状(Qualitative trait ), 一类叫数量性状(Quantitative trait ), 再一类叫门阈性状(Threshold trait)。

动物的经济性状(Economic trait)大多是数量性状。

因此,研究数量性状的遗传方式及其机制,对于指导动物的育种实践,提高动物生产水平具有重要意义。

质量性状:是指那些在类型间有明显界限,变异呈不连续的性状。

例如,牛的无角与有角,鸡的芦花毛色与非芦花毛色,等等。

这些性状由一对或少数几对基因控制,它不易受环境条件的影响,相对性状间大多有显隐性的区别,它的遗传表现完全服从于三大遗传定律。

数量性状:是指那些在类型间没有明显界限,具有连续性变异的性状,如产奶量、产卵量、产毛量、日增重、饲料利用率等。

门阈性状:是指由微效多基因控制的,呈现不连续变异的性状。

这类性状具有潜在的连续分布遗传基础,但其表型特征却能够明显的区分,例如,产子数,成活或死亡,精子形态正常或畸形,这类性状的基因效应是累积的,只有达到阈值水平才能表现出来。

二、数量性状的一般特征数量性状表现特点表明,数量性状受环境因素影响大,因此其表型变异是连续的,一般呈现正态分布(Normal distribution),很难分划成少数几个界限明显的类型。

例如,乳牛的产奶量性状,在群体中往往从3000kg至7000kg范围内,各种产量的个体都有。

由于数量性状具有这样的特点,所以对其遗传变异的研究,首要的任务是对性状的变异进行剖分,估计出数量性状变异的遗传作用和环境的影响程度。

具体地说,对数量性状遗传的研究必须做到以下几点:第一,要以群体为研究对象;第二,数量性状是可以度量的,研究过程要对数量性状进行准确的度量;第三,必须应用生物统计方法进行分析;第四,在统计分析基础上,弄清性状的遗传力以及性状间的相互关系。

7数量遗传学基础

7数量遗传学基础

=
VG 基因型方差 = × 100% ×100% 表现型方差 VP
3. 狭义遗传力(heritability in the narrow sense,h2) 定义为加性遗传方差占表现型方差的比率。
V 育种值方差 = × 100% A × 100% h = 表现型方差 VP
1. 表型方差及分量
表型由遗传因素和环境因素共同决定, 即:P=G+E 各种变异可用方差来表示,表型变异用VP表示,遗 传变异用VG表示,环境变异用VE表示 。 则:VP=VG+VE a.若G和E相关:VP=VG+VE+2coυGE
b.若G和E无相关:VP=VG+VE=VA+VD+VI+VE 其中VA加性方差——可稳定遗传; VD显性方差、VI互作方差——不能稳定遗传。
二、数量性状表型值的剖分
1. 个体的表型值: P=G +E
(P表型值; G基因型值; E环境效应)
2. 群体的表型值:
∑P= ∑G +∑E (其中∑E=0)
两边各除以N, ∴P(均值)=G(均值)
3. 对基因型值进一步剖分: G=A+D+I (A累加效应; D显性效应; I上位效应)
●累加效应(A)
二、估计遗传力的原理和方法(了解)
1. 遗传力估计的原理
2. 遗传力估计的方法
(1)公畜内女母回归或相关法 (2)半同胞相关法 (3)全同胞相关法(系统分组方差分析)
三、遗传力的显著性检验(了解)
第五节 遗传相关
一、性状间相关原因的剖分
二、遗传相关的估计方法(了解)
三、遗传相关的显著性检验(了解)
某性状Hb2=70%,表示在后代的总变异(总

七章节动物数量遗传学基础课件

七章节动物数量遗传学基础课件
h²=2r(FS)
r(FS)——全同胞组内相关系数
第30页,共54页。
3.4 遗传力的应用
如前所述,遗传率可作为杂种后代性状选择指标的指
标,其高低反映:性状传递给子代的能力、选择结果的 可靠性、育种选择的效率; 通常认为遗传率:
>50%高; =20~50%中; <20%低. 畜禽主要经济性状的遗传力大小
基因型值 genetypic ~
遗传方差 genetypic ~
加性效应 additive effect
加性方差 additive ~
显性效应 dominance effect
上位性效应 epitasis effect
显性方差 dominance ~
上位性方差 epitasis ~
非加性 non-
additive
4、数量性状表型值的剖分
4.1 表型值分解
表型值的效应分解:性状表现由遗传因素决定、并受环境 影响,可得:
表型值 = 基因型值+环境偏差
P = G + E.
P 为个体表现型值(phenotypic value)(也即性状观察值);
G 为个体基因型(效应)值(genetic value),也称遗传效应值;
异表现在量上或程度上
第7页,共54页。
研究数量性状的方法的特点
必须进行度量
必须应用统计方法进行分析归纳
研究数量性状以群体为对象才有意义
第8页,共54页。
2、阈性状
2.1 定义
在众多的生物性状中,还有一类特殊的性状,不完 全等同于数量性状或质量性状,它们具有一定的 生物学意义或经济价值,其表现呈非连续型变异, 与质量性状类似,但是又不服从孟德尔遗传规律。 一般认为这类性状具有一个潜在的连续型变量分 布,其遗传基础是多基因控制的,与数量性状类 似。通常称这类性状为阈性状(threshold trait)。

第九章 数量遗传学基础

第九章  数量遗传学基础
• p0=D+1/2H=0.38+0.06=0.44 q0=R+1/2H=0.5+0.06=0.56
• 因为一个稳定的群体在遗传的时候,基因 频率不变,所以达到平衡时p=p0; q=q0 而在平衡群体中,D=p2, H=2pq, R=q02 所以 D=p2=p02=0.1936 H=2pq=2p0q0=0.4928 R=q2=q02=精品0课.件3136
–特定基因座位上某个等位基因占该座位全部等位基因 总数的比率
–特定等位基因在群体内出现的概率 –同一基因座位全部基因频率之和等于1
• 随机交配、平衡群体 精品课件
基因频率与基因型频率之间的关系
• 设群体的某一基因座位上存在两个等位基因A和a, 各自的基因频率分别设为p和q; 群体内的个体在 该基因座位上具有三种基因型,即AA, Aa, aa, 各自的概率分别设为D、H、R; 则存在以下等式:
E.g2. 已知牛角的有无由一对常染色体基因控 制,无角(P)为显性,有角(p)为隐性。计算一
个无角个体占78%的平衡群体的基因频率。
• 因为无角个体是显性纯合子与杂合子共有的 表型,占了78%,则隐性纯合个体占 1-78%=22%。
• 设无角(P)等位基因频率为a,有角(p)等位 基因频率为b, 在平衡群体中:
D= p2,H=2pq , R= q2
精品课件
哈代-温伯格定律的证明
频率
A1A1 D0
基因型 A1A2 H0
A2A2 R0
基因
在一个随机交配
A1 p0
A2 q0
的大群体内,群
体的基因频率代
雄配子及其频率
雌配子及 其频率
A1(p0) A2(q0)
A1(p0) A1 A1(p02) A1 A2(p0q0)

第七章 数量遗传学 基础

第七章 数量遗传学 基础

这一点在育种中很重要,所以A又叫做育 种值。
3.环境离差的剖分
E = Eg + Es Eg:一般环境效应 Es:特殊环境效应
一般环境效应又称永久性的环境效应, 能长期甚至是终身影响个体的表型值; 特殊环境效应又称暂时性的环境效应, 只影响个体某个阶段的表型值。
这样 P= G + E = A+D+I+Eg+Es =A+R P:表型值 A:育种值 R:剩余值
这是一对无显隐性关系(共显性)基因控制 的性状,子1代为中间性,子2代以1:2:1的表型 比例分离。
第二类杂交试验:
P F1 F2 红色籽粒 x 白色籽粒
中等红色 15红色 :1白色
经仔细观察,红色中还存在不同等级。
1/16深红:4/16次深红:6/16中等红:4/16浅红:1/16白
第三类杂交试验:
3、显性离差 d= 12-10=2g
2.基因型值的平均数 有了基因型值,再与基因型频率 结合起来就可以计算群体基因型值的 平均数。
设在随机交配的群体中基因A和a 的频率分别为p和q,且p+q=1。则AA、 Aa和aa三种基因型的频率分别为p2、 2pq和q2。群体平均数可由表13算出。
表8-1 群体基因型值平均数的估计
二、对数量性状的新认识

控制数量性状的基因除了微效基因,也 可以有主效基因(Major gene); 决定数量性状的基因有加性效应,也有 显性效应和上位效应,更多的情况是几 种基因效应同时存在; 应用现代生物技术和统计方法,可以对 控制数量性状的基因从整体到局部进行 研究,如QTL。


第三节
数量性状遗传分析的统计学方法
由 μ= α(p-q)+2pqd 可以看出,任何 基因座上的基因,对群体平均数的贡 献可以分为两部分:

第七章-数量遗传学-基础资料

第七章-数量遗传学-基础资料

例:
有一种侏儒型小鼠(pg pg)六周龄平均体重为6g, 正常型小鼠纯合子(Pg Pg)六周龄平均体重为 14g,杂合子(Pg pg) 同龄的平均体重为12g。 设饲养管理条件相同,试计算m,α和d。 1、亲本均值(中亲值)m= (14+6)/2=10g
2、基因的加性效应 α= 或 α=
可以用等级或分类表示的性状,如猪肉 颜色分为5级;蛋黄颜色分为9级。 这类性状的遗传基础是多基因,表型变 异是间断的。 最极端的阈性状是“两者居一”性状,又 称“全或无”(all or none)性状。如发病与不发 病,存活与死亡等只有一个阈的性状。
问题:
1、有没有遗传基础是单基因,表型 是连续的性状? 2、如有,应叫做什么性状?
二、 群体基因型的值及其平均数
1. 基因型的值
考虑一对基因A, a所构成的三种基因型AA,Aa, 和aa,设A对性状有增效作用,a对性状有减效作用, 三种基因型定义值分别为+α, d, - α。如图8-1所示。
aa 0 Aa AA d ———————————————— -α +α
图8-1 一对基因的加性显性效应
P 红色籽粒 x 白色籽粒
F1
中等红色
F2 中白色比例极少,约1/64。 F2中红色也有程度上的不同,经仔细分类, 可得到: 1/64极深红,6/64深红,15/64次深红, 20/64中等红,15/64粉红,6/64浅红,1/64白。
设 小麦籽粒颜色受三对基因控制。籽粒红色程度与 决定红色的基因数目有关。 大写字母为对红色有效基因,小写字母为对红色无效 基因,
第二节 数量性状的遗传特点 一、 多基因假说 (polygene hypothesis)
假说的提出 瑞典植物遗传学家Nilsson-Ehle (1908) 通过对小麦籽粒颜色的遗传研究发现有三对不 同的基因控制着小麦籽粒的红色与白色。

第八章 数量遗传学的基础

第八章 数量遗传学的基础

幻灯片1幻灯片2数量遗传学基础幻灯片3第一节性状的分类一、质量性状能够从表型明显区别的性状,如牛、羊的有角、无角;猪、鸡的黑色、白色。

性状之间差异明显,变异不连续。

这类性状的遗传基础为单基因,表型变异是间断的。

幻灯片4二、数量性状可以计数和度量的性状,如牛奶的产量、猪的日增重。

性状之间没有严格的界限,表现出连续变异,量的变化才引起质的变化,且须用度、量、衡单位来表示。

这类性状的遗传基础是多基因,表型变异是连续的。

幻灯片5数量性状的特征●对质量性状而言:●不易受环境的影响而发生变异●F1有显隐性之分●F2代可明显分组,不会出现超亲遗传的现象幻灯片6●对数量性状而言:●易受环境的影响而发生变异●两个纯合的亲本杂交,F1代一般是双亲的中间类型,但有时会偏向某一亲本。

●F2代的表型平均值与F1代相近,但是变异程度远远超过F1●有超亲遗传的现象:当杂交的亲本不是极端类型的时候,杂交后代中有可能会出现高于高值亲本或低于低值亲本的类型幻灯片7玉米穗长(表)幻灯片8玉米穗长(柱形图)幻灯片9人的身高(图)幻灯片10遗传特征:●两个有差异的亲本杂交:● 1. F1为双亲中值;● 2. F2均值、F1均值、双亲中值相近● 3. F2变幅增大● 4.易受环境条件影响幻灯片11质量性状与数量性状的关系● 1 由于区分的着眼点不同●2由于杂交亲本的差别基因对数不同。

数量性状一般由微效多基因控制,但在某些情况下,也可由单一的主基因控制。

● 3 一因多效,一个基因可以同时控制质量性状和数量性状,控制数量性状的基因与控制质量性状的基因可能连锁。

幻灯片12三、阈性状可以用等级或分类表示的性状,如猪肉颜色分为5级;蛋黄颜色分为9级。

这类性状的遗传基础是多基因,表型变异是间断的。

最极端的阈性状是“两者居一”性状,又称“全或无”(all or none)性状。

如发病与不发病,存活与死亡等只有一个阈的性状。

幻灯片13问题:1、有没有遗传基础是单基因,表型是连续的性状?2、如有,应叫做什么性状?幻灯片14第二节数量性状的遗传特点一、多基因假说(polygene hypothesis)假说的提出瑞典植物遗传学家Nilsson-Ehle (1908)通过对小麦籽粒颜色的遗传研究发现有三对不同的基因控制着小麦籽粒的红色与白色。

  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

第九章数量遗传学基础概述一、质量性状和数量性状的遗传动物的遗传性状,按其表现特征和遗传机制的差异,可分为三大类:一类叫质量性状(Qualitative trait ), 一类叫数量性状(Quantitative trait ), 再一类叫门阈性状(Threshold trait)。

动物的经济性状(Economic trait)大多是数量性状。

因此,研究数量性状的遗传方式及其机制,对于指导动物的育种实践,提高动物生产水平具有重要意义。

质量性状:是指那些在类型间有明显界限,变异呈不连续的性状。

例如,牛的无角与有角,鸡的芦花毛色与非芦花毛色,等等。

这些性状由一对或少数几对基因控制,它不易受环境条件的影响,相对性状间大多有显隐性的区别,它的遗传表现完全服从于三大遗传定律。

数量性状:是指那些在类型间没有明显界限,具有连续性变异的性状,如产奶量、产卵量、产毛量、日增重、饲料利用率等。

门阈性状:是指由微效多基因控制的,呈现不连续变异的性状。

这类性状具有潜在的连续分布遗传基础,但其表型特征却能够明显的区分,例如,产子数,成活或死亡,精子形态正常或畸形,这类性状的基因效应是累积的,只有达到阈值水平才能表现出来。

二、数量性状的一般特征数量性状表现特点表明,数量性状受环境因素影响大,因此其表型变异是连续的,一般呈现正态分布(Normal distribution),很难分划成少数几个界限明显的类型。

例如,乳牛的产奶量性状,在群体中往往从3000kg至7000kg范围内,各种产量的个体都有。

由于数量性状具有这样的特点,所以对其遗传变异的研究,首要的任务是对性状的变异进行剖分,估计出数量性状变异的遗传作用和环境的影响程度。

具体地说,对数量性状遗传的研究必须做到以下几点:第一,要以群体为研究对象;第二,数量性状是可以度量的,研究过程要对数量性状进行准确的度量;第三,必须应用生物统计方法进行分析;第四,在统计分析基础上,弄清性状的遗传力以及性状间的相互关系。

对数量性状遗传的深入研究,可为动物品质的改良提高提供可靠数据,为选种和杂交育种找出正确而有效的方法,从而可以加速育种进程。

三、数量性状的遗传方式数量性状的遗传有以下几种表现方式:(一)中间型遗传在一定条件下,两个不同品种杂交,其杂种一代的平均表型值介于两亲本的平均表型值之间,群体足够大时,个体性状的表现呈正态分布。

子二代的平均表型与子一代平均表型值相近,但变异范围比子一代增大了。

(二)杂种优势杂种优势是数量性状遗传中的一种常见遗传现象。

它是指两个遗传组成不同的亲本杂交的子一代,在产量、繁殖力、抗病力等方面都超过双亲的平均值,甚至比两个亲本各自的水平都高。

但是,子二代的平均值向两个亲本的平均值回归,杂种优势下降。

以后各代杂种优势逐渐趋于消失。

(三)越亲遗传两个品种或品系杂交,一代杂种表现为中间类型,而在以后世代中,可能出现超过原始亲本的个体,这种现象叫做越亲遗传。

例如,在鸡中有两个品种,一种叫新汉县鸡,体格很大,另一种叫希氏赖特观赏鸡,体格很小,两者杂交产生出小于希氏赖特鸡和大于新汉夏鸡的杂种。

由此,可能培育出更大或更小类型的品种。

第一节数量性状的遗传机制一、多基因假说数量性状也是由基因决定的,但它具有与质量性状不同的遗传机制。

数量性状为什么会呈现连续的变异并出现中间型遗传现象呢?瑞典遗传家尼尔逊·埃尔(Nilsson Ehle)通过对小麦籽粒颜色的遗传研究,于1908年提出了数量性状遗传的多基因假说(Multiple-factor hypothesis)。

尼尔逊·埃尔以深红色的小麦品种与白色品种杂交,F1结出中等红色的种子。

F2中有15/16是红色,1/16是白色。

进一步观察,他发现F2的红粒中又呈现各种程度的差异:有的深红,有的中深红,有的中红,有的淡红;其中,深红色的最少,约占F2总数的1/16,大多数是不同程度的中间红色。

尼尔逊·埃尔提出,在这个例子中,小麦种子颜色由二对基因R1(r1)和R2(r2)决定。

这二对基因的作用是累加的,大写的R对小写的r并不是简单的显性关系,红的程度取决于R因子的数目。

因此,含有4个R的最红,3个R者次之,2个R者更次之,1个R者为淡色,没有R的(都是r)是白色。

设R1r1及R2r2为两对决定种皮颜色的基因,以大写R表示增效,小写r表示减效,在此没有显隐性关系。

其杂交模式如图9—1所示。

图9—1 两对基因的杂交模式图这里,F2的预期表型有五种:白色、淡红、粉红、中深红、深红,它们的比例为1∶4∶6∶4∶1。

推而广之,如果某个数量性状由n对基因决定,表型比例就是(1∶2∶1)n展开式(n=基因的对数)。

尼尔逊·埃尔的多基因假说的要点是:1.1.数量性状是许多微效基因(Minor effect polygenes)的联合效应造成的,它们的效应相等可累加,所以微效基因又称加性基因(Additive gene )。

2.2.微效基因之间大多数缺乏显隐性(Dominant-recessive effect)。

虽然可用大小写字母表示等位基因,但大写基因并不掩盖小写基因的表现,大写只代表表示增效,小写表示减效。

3.3.控制数量性状的微效基因(Minor effect polygenes)与控制质量性状的宏效基因(Major gene)都处于细胞核的染色体上,多基因的遗传行为同样符合遗传基本规律,具有对偶、复制、分离和重组、连锁和交换的特性。

4.4.由于微效基因的效应微小,多基因(Polygenes)并不能予以个别辨认,只能按性状的表现在一起研究,对所涉及的基因对子数做粗略的估计。

但是屠代(Thoday)对果蝇刚毛数的研究证明,有时多基因也可予以个别辨认,识别数量性状的主效基因(Major effect genes)。

二、基因的非加性效应与杂种优势多基因假说认为控制数量性状的各个基因的效应是累加的。

即是说,基因对某一性状的共同效应是每个基因对该性状单独效应的总和。

由于基因的加性效应,就使杂种个体表现为中间遗传现象。

但是,进一步研究表明,基因除具有加性效应外,还有非加性效应。

基因的非加性效应是造成杂种优势的原因。

它包括显性效应和上位效应。

由等位基因间相互作用产生的效应叫做显性效应。

例如,有两对基因,A1,A2的效应各为15cm,a1、a2的效应各为8cm,理论上讲,杂合基因型A1A2a1a2按加性效应计算其总效应为46cm。

而实际效果则是,在杂合状态下(A1a1A2a2)同样为两个A和两个a,其总效应可能是56cm,这多产生的10cm效应是由于A1与a1,A2与a2间互作引起的,这就是显性效应,由非等位基因之间相互作用产生的效应,叫做上位效应或互作效应。

例如,A1A1的效应是30cm,A2A2的效应也是30cm,而A1A1A2A2的总效应则可能是70cm,这多产生的10cm效应是由这两对基因间相互作用所引起的,这叫上位效应。

一般认为,杂种优势与基因的非加性效应有关。

目前,对产生杂种优势的机制有两种学说,即显性说和超显性说。

显性说认为,杂种优势是由于双亲的显性基因在杂种中起互补作用,显性基因遮盖了不良(或低值)基因的作用的结果,而超显性说,则认为杂种优势并非显性基因间的互补,而是由于等位基因的异质状态优于纯合状态,等位基因相互作用可超过任一杂交亲本,从而产生超显性效应。

现在多数认为,这两种观点并不矛盾。

对于大多数杂种优势现象来说,显性基因互补和等位基因的杂合效应可能都在起着作用。

三、越亲遗传现象的解释产生越亲遗传与产生杂种优势的原因并不相同。

前者主要是基因重组,而后者则是基因间互作的结果。

譬如,有两个杂交亲本品种,其基因型是纯合的,等位基因无显隐性关系,设一个亲本基因型为A1A1A2A2a3a3,另一个亲本为a1a1a2a2A3A3,一代杂种基因型为A1a1A2a2A3a3,介于两个亲本之间,而杂种一代再杂交,在二代杂种中就可能出现大于亲本的个体A1A1A2A2A3A3和小于亲本的个体a1a1a2a2a3a3,越亲遗传产生的越亲个体,可以通过选择保持下来成为培育高产品种的原始材料。

第二节数量性状遗传分析的数学模型和遗传模型一、数量性状表型值的剖分性状的表现型是基因型与环境条件共同作用的结果。

不仅是基因型还是环境条件发生改变,都会引起表型值的变异。

因此,数量性状的表型值可按其变异原因剖分为两部分:由基因型控制的能遗传的部分,叫做遗传值,或基因型值(以G表示);由环境影响造成的不遗传的部分,叫做环境偏差(以E表示)。

写成公式:P+=GE二、基因型值的分解进一步分析基因型值,还可根据基因作用类型的不同,再剖分为:加性效应值(Additive effect,以A表示)、显性效应值(Dominance deviation,以D表示)和互作或上位效应值(Interaction or Epistatic deviation ,以I 表示),则I D A G ++=代入上式得:E I D A P +++=式中的D 和I 虽然包括在遗传值内,但都属于基因的非加性效应值,不能确定遗传,只有基因的加性效应值(A )能得到固定。

因此,把基因的加性效应值叫作育种值,把D 和I 以及环境偏差(E )合并,统称剩余值(Residual value ,以R 表示),则E I D R ++=。

这样,表型值的剖分就可写成:R A P +=三、群体基因型值的平均数与基因平均效应(一)基因型值的标准尺度以一对基因为例加以说明。

设A 和a 为一对等位基因,A 对性状有增效作用,a 对性状有减效作用,两个纯合类型之间的差数可用2 a 表示,两者之间的中点可用O 表示(中文用M 表示),三种基因型(AA 、Aa 和aa )的理论效应值分别为a, d 和-a ,两种纯合基因型值为M+ a ,M- a 。

显然,两种纯合子的中亲值M 在[a+(-a )]/2=0点上,如图9—2所示:AA M Aa aa图9—2 一对基因的加性、显性效应模型其中a 表示距离中亲值正向或负向的基因型加性效应理论值,d 表示由显性效应引起的与中亲值的离差。

d 的大小决定于显性程度。

如果无显性存在,d=0;如果A 为显性时,d >0 为正值;如果a 为显性时,d <0 为负值;当完全显性时,d=±a ,杂合子与纯合子之一完全相同;存在超显性时d=>a 或d <-a 。

例如有一种小型猪(aa )6月龄体重为10kg ,正常纯合体(AA )猪6月龄体重平均为90kg ,杂合子(Aa )的平均体重为70 kg 。

这些猪饲养在相同条件下。

试计算中亲值m ,基因加性效应a 和显性离差d 。

平均体重的表型值可以当做体重的基因型值,由此可得: m=(10+90)/2=50(kg ) a=90-50=40(kg ) d=70-50=20(kg )(二)群体基因型值的平均数有了基因型值,就可将基因型频率结合计算群体基因型值的平均数。

相关文档
最新文档