关于医学文献检索及论文写作课件
合集下载
医学文献检索PPT课件
• 数据库→文档→记录→字段（由大到小）
医学文献检索
文献数据库的类型
➢书目数据库 ➢事实数据库 ➢数值型数据库 ➢全文型数据库 ➢图像数据库
医学文献检索
书目数据库（Bibliographic Database）
• 主要指二次文献数据库，包括各种机读版的题 文摘、目录等形式的数据库，仅提供原始文献 索或简要的内容，指引用户去查原始文献。
• 提供数值性的信息，包括各种统计数据，科学 数据、人口数据、化学品理化参数等。
• 例如美国国立医学图书馆编制的化学物质毒性 库RTECS，包含了10万多种化学物质的急、慢 试验数据。
医学文献检索
全文数据库（Full Text Database）
• 存储的是原始文献的全文，有的是印刷版的 有的则是纯电子出版物
• 《中国学术期刊全文数据库（CNKI）》
医学文献检索
图像数据库(Image Database, Atlas online)
• 是以图像信息为主，适当配以简短的文字说明 • 如人体解剖图谱、心脏病图谱、眼科图谱、手
谱、CT图谱、血液学图谱、中草药图谱等等。 图谱一般都可在因特网上免费查到。
医学文献检索
根据来源分类：信息分为自然信息、生物信息 信息和社会信息四大类。
信息无时不在，无处不有，充斥着整个宇宙。 人们将信息视同与物质、能源一样重要的三大资源
医学文献检索
知识（knowledge）：知识是人类对客观事 的认识、实践经验的总结，它来源于信息。 • 知识是一种特定的人类信息，它是对信 进行提炼和深化的结果。知识经过不断提高 深化，形成较为完整的科学知识体系。
• 二次文献——将一次文献收集整理加工著录其特征（著
者、篇名、分类、主题等）并按一定顺序加以编排而成的 检索工具。目录、索引、文摘、相应数据库；Yahoo、 Google等 二次文献是供读者检索所需一次文献线索的新的文献形式
医学文献检索
文献数据库的类型
➢书目数据库 ➢事实数据库 ➢数值型数据库 ➢全文型数据库 ➢图像数据库
医学文献检索
书目数据库（Bibliographic Database）
• 主要指二次文献数据库，包括各种机读版的题 文摘、目录等形式的数据库，仅提供原始文献 索或简要的内容，指引用户去查原始文献。
• 提供数值性的信息，包括各种统计数据，科学 数据、人口数据、化学品理化参数等。
• 例如美国国立医学图书馆编制的化学物质毒性 库RTECS，包含了10万多种化学物质的急、慢 试验数据。
医学文献检索
全文数据库（Full Text Database）
• 存储的是原始文献的全文，有的是印刷版的 有的则是纯电子出版物
• 《中国学术期刊全文数据库（CNKI）》
医学文献检索
图像数据库(Image Database, Atlas online)
• 是以图像信息为主，适当配以简短的文字说明 • 如人体解剖图谱、心脏病图谱、眼科图谱、手
谱、CT图谱、血液学图谱、中草药图谱等等。 图谱一般都可在因特网上免费查到。
医学文献检索
根据来源分类：信息分为自然信息、生物信息 信息和社会信息四大类。
信息无时不在，无处不有，充斥着整个宇宙。 人们将信息视同与物质、能源一样重要的三大资源
医学文献检索
知识（knowledge）：知识是人类对客观事 的认识、实践经验的总结，它来源于信息。 • 知识是一种特定的人类信息，它是对信 进行提炼和深化的结果。知识经过不断提高 深化，形成较为完整的科学知识体系。
• 二次文献——将一次文献收集整理加工著录其特征（著
者、篇名、分类、主题等）并按一定顺序加以编排而成的 检索工具。目录、索引、文摘、相应数据库；Yahoo、 Google等 二次文献是供读者检索所需一次文献线索的新的文献形式
如何进行医学文献检索ppt参考课件
•2020/4/28
•34
全文数据库
• 中文全文数据库：中国知网CNKI、中文ngerLink、Proquest、Wiley、 ScienceDirect、OVID。
•2020/4/28
•35
题录
• 篇名、著者、出处这三 个字段构成题录。
• 例：黄伟，金远平. 形 式概念分析在本体构建 中的应用.微机发展， 2005(2): 28-31
•36
三、文献信息数据库的检索途径
1. 自由词检索 2. 主题词检索 3. 分类检索 4. 著者检索 5. 题名检索
6. 引文检索 7. 机构检索 8. 刊名检索 9. 序号检索
•2020/4/28
• 如专著、期刊论文、科技报告、学位论文等。
• 特点：所记录的是著者的最新发现或发明，以及新的见 解、新的理论、新的方法等新颖，具体而详尽的知识， 但由于其信息量大、分散而无序，给读者的查找与利用 带来极大的不便。
•2020/4/28
•24
2.文献的类型
• 二次文献（Secondary Document）就是将大量无序、 分散的一次文献收集、整理、加工、著录其特征如著者、 篇名、分类、主题、出处等，并按一定的顺序加以编排， 形成供读者检索所需一次文献线索的新的文献的形式
•2020/4/28
•20
2.文献的类型
• 按出版形式： • 图书：教科书、专著、参考工具书 • 期刊 • WHO出版物 • 会议文献 • 学位论文:学士、硕士和博士学位论文 • 科技报告 • 专利文献
•2020/4/28
•21
2.文献的类型
• 按获取的难易程度： • 白色文献：完全公开 • 黑色文献：完全不公开 • 灰色文献：内部交流
医学文献检索PPT课件
36
索引词检索
5 、索取原始文献
医学PPT
29
六、医学数据库使用简介
中国生物医学文献数据库（CBMdisc)
中国生物医学文献光盘数据库（CBMdisc）是 由中国医学科学院医学信息研究所开发研制的 综合性医学文摘型数据库。
收录范围：1978年-至今、涵盖《中目》（医 药卫生）和CMCC 1000多种中国生物医学刊 物、近340万篇文献；约26万篇/年；文献类型 有期刊、汇编、会议文献等。
备注：[二次检索]是指在最后一个检索式检索结果的范围内进行进一步 查询。 选择检索字段： 缺省字段：TI、AB、AU、MH、TG、TW、TA 全部字段：ALL 特定字段：仅在某一指定字段内检索
精确检索 au=xx 非精确检索 xx in au 特殊字符或标点的检索 例如，MH=“肝炎, 病毒性, 人”；“1004-616X” IN ISSN
医学PPT
12
邻近度算符Near#
其中“#”代表一个常数，检索式“A near# B” 表示检索词A和检索词B之间有0~#个单词的文献 （A和B在同一记录、同一字段里）。在near后加 一个数字，指定两个词的邻近程度，且不论语 序。
如：information near2 retrieval表示检索词
例：《IM》的Subject Index；《CA》的CS、GS； 《中目》的分类目次
非规范化语言：它对检索用语中的各种同义词、 多义词、近义词、同形异义词等不加处理，所 以也叫自然语言，如关键词。
例：《CA》Keyword Index
医学PPT
6
文献特征 文献标识
目录或索引
---------------------------------------------------------------------------------------------------
第一讲医学文献检索 ppt课件 共132页
---- 美国科学基金会 NSF (National Science Foundation)
检索误区
1.文献检索即是能看到全文
研究人员时间有限
“首先必需认识到，科研工作者都十分宝贵自己的时间，除极少数和自 己工作关系十分密切的论文以外，绝大多数读者都不会阅读全文。”
—— 著名生物化学家 邹承鲁院士 “我的院培养的博士、硕士研究生学位论文， 学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业，内容前沿、丰 富,可在线浏览全文。每季更新。
系统特色
涵盖资源丰富，中西兼有：用户可根据自身需要随意 搭配；
数据加工深度、规范：主题标引和分类标引等规范化 加工处理使得文献内容的揭示更加全面、准确；
涵盖资源
• 中国生物医学文献数据库（CBM）、 • 中国医学、 • 日文生物医学文献数据库、 • 俄文生物医学文献数据库、 • 英文会议文摘数据库 • 英文文集汇编文摘数据库。
我校订购资源
• 中国生物医学文献数据库（CBM）：
收录1978以来1800多种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文 献题录600余万篇，全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工 处理。年增文献50余万篇，双周更新。
• 中国医学科普文献数据库：
收录1985年以来国内出版的医学科普期刊近百种，重点突显养生保 健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营 养等与医学健康有关的内容。双周更新。
3. BIOSIS Previews：由美国生物科学信息服务社 (BIOSIS)出版，是世 界上最大的关于生命科学的文摘索引数据库。该库包括生物学文摘 (Biological Abstracts(R))所收录期刊以及(Biological Abstracts /RRM(R))所收录的会议、报告、评论、图书、专论等多种文献。
检索误区
1.文献检索即是能看到全文
研究人员时间有限
“首先必需认识到，科研工作者都十分宝贵自己的时间，除极少数和自 己工作关系十分密切的论文以外，绝大多数读者都不会阅读全文。”
—— 著名生物化学家 邹承鲁院士 “我的院培养的博士、硕士研究生学位论文， 学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业，内容前沿、丰 富,可在线浏览全文。每季更新。
系统特色
涵盖资源丰富，中西兼有：用户可根据自身需要随意 搭配；
数据加工深度、规范：主题标引和分类标引等规范化 加工处理使得文献内容的揭示更加全面、准确；
涵盖资源
• 中国生物医学文献数据库（CBM）、 • 中国医学、 • 日文生物医学文献数据库、 • 俄文生物医学文献数据库、 • 英文会议文摘数据库 • 英文文集汇编文摘数据库。
我校订购资源
• 中国生物医学文献数据库（CBM）：
收录1978以来1800多种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文 献题录600余万篇，全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工 处理。年增文献50余万篇，双周更新。
• 中国医学科普文献数据库：
收录1985年以来国内出版的医学科普期刊近百种，重点突显养生保 健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营 养等与医学健康有关的内容。双周更新。
3. BIOSIS Previews：由美国生物科学信息服务社 (BIOSIS)出版，是世 界上最大的关于生命科学的文摘索引数据库。该库包括生物学文摘 (Biological Abstracts(R))所收录期刊以及(Biological Abstracts /RRM(R))所收录的会议、报告、评论、图书、专论等多种文献。
最新医学文献检索绪论(详细)PPT课件
提出问题：该地区甲状腺 肿发病的原因是什么？
当地的粮、油、盐均来自不缺乏碘 的外地，当地的食谱也与发病不高的邻 近地区相同。
该地区存在影响碘吸收的物 质-高钙饮水
进一步查阅文献和思考发现：
（1）钙离子和碘离子可以在小肠中结合形成不溶性沉 淀，使碘不能被吸收；
（2）摄入高钙时，氯的再吸收率也增加，导致碘排出 量增大；
在王进喜的事迹报道中有这样一段话： “王进喜一到马家窑看到大片荒野说： ‘好大的油海！我们要把石油工业落后 的帽子丢到太平洋去。’”
于是日本情报机构从伪满旧地图上查到： “马家窑是位于黑龙江海伦县东南的一 个村子，在北安铁路上一个小车站东边 十多公里处。”就这样，日本情报机构 终于得到了大庆油田位置的准确情报。
倘若研究人员具有较好的专利情报意识， 一开始就检索有关工艺的专利文献，就 可避免损失。
低水平重复：医疗器械研制
上海手术器械厂用20年时间试制成功一 种硬质合金镶片持针钳。
申请发明专利的检索中发现，国外在 1952年取得发明专利。
成功经验：日本人摸大庆——魔鬼
出自细节
20世纪60年代，日本出于战略上的需要， 非常重视中国石油的发展，于是把摸大 庆油田的情况，作为情报工作的主攻方 向。
（4）通过王进喜参加中央委员会的报道， 推论大庆已经大量出油。
（5）根据《人民日报》一幅照片上钻台手 柄的架势，计算出了油井的直径。
（6）根据中国国务院的工作报告推算， 把全国石油产量减去原来的石油产量， 剩下的就是大庆的产量。
大庆给日本带来了什么机遇？
根据大庆油田出油能力与炼油厂有限的 炼油能力，日本人推论：中国将在最近 几年必然因为炼油设备不足，会考虑买 日本的轻油裂解设备。
科研人员从事科研项目的时间分配
医学文献检索概论精品PPT课件
• 磷酸化JNK在小鼠腹水型肝癌高、低淋巴道转移株中表达 的研究 .张宇虹; 唐建武; 王绍清; 李玲; 孙成荣; 王波; 王梅.中国实验诊断学，2008（11）：1347-1349
• 文摘:Chemical Abstracts, Biological Abstracts
磷酸化JNK在小鼠腹水型肝癌高、低淋巴道转移株中表达的研 究 .张宇虹; 唐建武; 王绍清; 李玲; 孙成荣; 王波; 王梅. 中国实验诊断学，2008（11）：1347-1349
•
R54 心脏、血管疾病
•
R541 心脏疾病
•
R541.7心律不齐
•
R541.71 心动过速
•
R541.72 心动过缓
• ……
主题检索语言
• 关键词语言：文献中直接抽取，按字顺排 列—关键词索引– 自由词检索、关键词检索
• 叙词语言：经过规范化处理，有组配性能， 又称为主题词。副主题词：用于修饰限定 一个主题的不同方面，起到增强主题词专 指性的作用称副主题词。
方法 • 是改善知识结构、终身学习的重要治学
方法
学习目标
• 掌握常用医学检索工具和数据库 • 掌握基本检索方法、检索策略和技巧 • 培养鉴别、评估和综合信息的能力
学习文献检索的方法
• 学习基本知识和基本原理要耐心 • 多实践
医学文献 的基本 知识
文献
• 记录知识的载体
医学文献的特点
• 类型复杂，数量庞大 • 增长急剧，文种繁多 • 内容交叉重复，出版分散 • 由传统的纸质印刷型迅速地向电子化、网络化、
主题词的特点
• 规范化的名词术语，直接性好，查找方便 • 参照系统提示主题词之间的关系 • 进行概念组配，专指性好 • 同一篇文献可用多个主题词检索，检索点多 • 主题词的增订和修定的速度快，及时性强 • 可进行族性检索
• 文摘:Chemical Abstracts, Biological Abstracts
磷酸化JNK在小鼠腹水型肝癌高、低淋巴道转移株中表达的研 究 .张宇虹; 唐建武; 王绍清; 李玲; 孙成荣; 王波; 王梅. 中国实验诊断学，2008（11）：1347-1349
•
R54 心脏、血管疾病
•
R541 心脏疾病
•
R541.7心律不齐
•
R541.71 心动过速
•
R541.72 心动过缓
• ……
主题检索语言
• 关键词语言：文献中直接抽取，按字顺排 列—关键词索引– 自由词检索、关键词检索
• 叙词语言：经过规范化处理，有组配性能， 又称为主题词。副主题词：用于修饰限定 一个主题的不同方面，起到增强主题词专 指性的作用称副主题词。
方法 • 是改善知识结构、终身学习的重要治学
方法
学习目标
• 掌握常用医学检索工具和数据库 • 掌握基本检索方法、检索策略和技巧 • 培养鉴别、评估和综合信息的能力
学习文献检索的方法
• 学习基本知识和基本原理要耐心 • 多实践
医学文献 的基本 知识
文献
• 记录知识的载体
医学文献的特点
• 类型复杂，数量庞大 • 增长急剧，文种繁多 • 内容交叉重复，出版分散 • 由传统的纸质印刷型迅速地向电子化、网络化、
主题词的特点
• 规范化的名词术语，直接性好，查找方便 • 参照系统提示主题词之间的关系 • 进行概念组配，专指性好 • 同一篇文献可用多个主题词检索，检索点多 • 主题词的增订和修定的速度快，及时性强 • 可进行族性检索
医学文献检索ppt课件
10
2）选择数据库时应注意的问题
① 学科专业范围是否适用； ② 收录的文献资料是否齐全； ③ 提供的检索途径是否多全； ④ 报道的时间是否迅速； ⑤ 使用的语种是否熟悉。等等。
11
3）数据库的结构
数据库的基本结构主要由记录和字段构成。 ● 记录（Record）：是构成数据库的一个完整的 信息单元。它由若干个字段构成。 ● 字段（Field）：是构成记录的基本信息单元。
1、 图书（Book）： 包括教科书、专著、参考工具书等。
2、期刊（periodical，journal，magazine）
主要刊载原始论文、综述性文章等
3、资料（materials）
包括科技报道、会议论文、专利文献和学位论文等.
7
（二）选择检索方式与数据库
1、检索方式（机检）
1）脱机检索（Off-line Retrieval） 2）联机检索（On-line Retrieval） 3）光盘检索（Optical disc Retrieval） 4）网络检索（Network Retrieval）
国 外： OVID PubMed
16
（三）确定检索词与检索途径
● 不同学科、不同类型的检索工具采用不同的文献特征 来标引文献，形成不同的检索语言（检索词）而提供不同 的检索途径.
文献特征
检索语言 检索途径 （检索词）
17
1、文献检索语言
检索语言（Document language）是描述文献特征 和表达检索提问的一种专门语言。
TG
特征词
TI
篇名
13
《中文科技期刊数据库》的一条记录
题 名 碱性成纤维细胞生长因子对鼠视网膜缺血再灌注… 作 者 牛庸均 赵岩松 高云霞 机 构 青岛大学医学院附属医院眼科 266003 刊 名 中华眼科杂志. 2003，39(11).-664-668 ISSN号 0412-4081 C N号 11-2142 关键词 碱性成纤维细胞生长因子 视网膜缺血 再灌注损伤 分类号 R774 文 摘 目的 探讨碱性成纤维细胞生长因子 （bFGF）在
2）选择数据库时应注意的问题
① 学科专业范围是否适用； ② 收录的文献资料是否齐全； ③ 提供的检索途径是否多全； ④ 报道的时间是否迅速； ⑤ 使用的语种是否熟悉。等等。
11
3）数据库的结构
数据库的基本结构主要由记录和字段构成。 ● 记录（Record）：是构成数据库的一个完整的 信息单元。它由若干个字段构成。 ● 字段（Field）：是构成记录的基本信息单元。
1、 图书（Book）： 包括教科书、专著、参考工具书等。
2、期刊（periodical，journal，magazine）
主要刊载原始论文、综述性文章等
3、资料（materials）
包括科技报道、会议论文、专利文献和学位论文等.
7
（二）选择检索方式与数据库
1、检索方式（机检）
1）脱机检索（Off-line Retrieval） 2）联机检索（On-line Retrieval） 3）光盘检索（Optical disc Retrieval） 4）网络检索（Network Retrieval）
国 外： OVID PubMed
16
（三）确定检索词与检索途径
● 不同学科、不同类型的检索工具采用不同的文献特征 来标引文献，形成不同的检索语言（检索词）而提供不同 的检索途径.
文献特征
检索语言 检索途径 （检索词）
17
1、文献检索语言
检索语言（Document language）是描述文献特征 和表达检索提问的一种专门语言。
TG
特征词
TI
篇名
13
《中文科技期刊数据库》的一条记录
题 名 碱性成纤维细胞生长因子对鼠视网膜缺血再灌注… 作 者 牛庸均 赵岩松 高云霞 机 构 青岛大学医学院附属医院眼科 266003 刊 名 中华眼科杂志. 2003，39(11).-664-668 ISSN号 0412-4081 C N号 11-2142 关键词 碱性成纤维细胞生长因子 视网膜缺血 再灌注损伤 分类号 R774 文 摘 目的 探讨碱性成纤维细胞生长因子 （bFGF）在
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
文献检索类型
• 书目检索（Medline、CBM-Sinomed） • 全文检索（CHKD、万方、维普等） • 数据检索（clinical trials） • 事实检索（指南、名录、大事记等）
四、检索途径
• 1.从文献的外表特征分：
• 著者 • 题名 • 刊名 • 地址 • 基金 • 号码 • 其他
SinoMed系统
（查新专用数据库）
• 由中国医学科学院医学信息研究所/图书馆开发研制。 • 集检索、免费获取、个性化定题服务、全文传递服务
于一体的生物医学中外文整合文献服务系统。
检索界面
著者检索（方法一）
检索策略
检索结果
高级检索（方法二）
高级检索 （布尔逻辑运算and、or、not）
关于医学文献检索 及论文写作
第一部分
医学文献检索
Contents
文献基础知识 文献检索定义 检索工具类型 检索途径方法
一、文献
• 指记录人类知识的一切载体。
文献层级（3个）
• 一次文献（论文、专题著述、科技报告、专利等） • 二次文献（目录、 题录、 文摘、 索引等） • 三次文献（年鉴、进展、述评、手册、指南等） • 重点：文献检索也就是通过二次文献查找一次文献的过程
期刊
分类
主题：查询
检索案例一
（SinoMed）
例1：主题：静脉内，输注（检索结果不满意 非主题词）
拆分查找 结果满意
主题检索
例2：主题：肝肿瘤；输注，静脉内；
第一步
第二步
检索历史（布尔逻辑运算运用案例）
第三步
结果（360篇）
检索案例二
（SinoMed）
检索策略的制定
主题词检索结果
检索步骤
• 明确检索要求 • 选择检索工具 • 确定检索途径 • 查找文献线索 • 找到原始文献
计算机文献检索注意事项
• 布尔逻辑运算符
• 布尔逻辑运算符有3种类型， 即逻辑“或”、逻 辑“与”和逻辑“非”，分别用OR、AND和NOT表 示。如图：
•
典型案例
（SinoMed）
HOW TO USE?
结果浏览方式（题录、文摘等）
文摘格式
排序方式
检索结果统计方式
检索结果统计方式
检索结果统计方式
傻瓜式检索
胸外 功能 恢复 护理
空格= and
注意：限定检索
CBM实现了与维普数 据库的全文链接，点 击“PDF”图标，链 接维普中文全文。
其他中文数据库
万方数据医药信息系统 中华医学会全文期刊
多途径组配
总结
• 在检索过程中需不断地调整检索策略 • 1)根据实际扩大、缩小检索范围 • 2)从已找到的文章中查找新的检索线索 • 3)考虑多种检索途径，不要一条道跑到黑
• 说明：检索式、检索策略的制定依据个人的 检索目的、检索经验及检索习惯等来最终决 定，没有固定的模式，大家应灵活掌握，“ 不论黑猫白猫抓住老鼠就是好猫”。
中国医院数字图书馆 博硕士论文全文数据库(CHKD)
文献分类
• 按载体形式分类（5种） • 书写型、印刷型、缩微型、视听型 • 机读型（电子书、刊、数据库等） • 按出版形式分类（3种） • 图书、期刊、资料
二、文献检索定义
• 指利用检索工具或检索系统查找出特定需 要的医学文献的过程。
三、文献检索工具
• 目录（Catalogue） • 索引（Index）--SCI • 文摘（Abstract）
• 2.从文献的内容特征分：•Biblioteka 分类•主题
•
关键词
•主题• 词又称叙其词他，在标引和检索中用以表达文献主
题的规范化的词或词组 。
• 与“关键词检索”相比，“主题检索”能有效提高
查全率和查准率。
检索方法
• 顺查法（时间顺序由远及近-漏检率低） • 倒查法（由近及远-近期课题进展水平和动向） • 抽查法（抽出发表文献比较集中的时间段） • 追溯法（参考文献-文献漏检率高）