医学15遗传性疾病的分子诊断
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2 G 2 2 A
2
2
G
2
ζ2Aγ2
南方百度文库科大学
分子诊断学
血红蛋白类型
南方医科大学
分子诊断学
血红蛋白病 hemoglobinopathy
结构异常血红蛋白病 镰刀状细胞贫血; 不稳定血红蛋白病 血红蛋白M病 氧亲和力改变 地中海贫血, 珠蛋白的合成降低或消失
南方医科大学
1、镰刀形红细胞贫血
分子诊断学
11p15.5
南方医科大学
分子诊断学
血红蛋白的类型
成人Hb :Hb A 22 97~98% Hb A2 22 2~3 % 胎儿Hb: Hb F 2 2 α γ α γ 胚胎Hb: Hb GowerⅠ 22 ζ γ (妊娠12周内) Hb Gower Ⅱ 22 Hb Portland 2 2
GTG CAT CTG ACT CCT GTG GAG N-val · his · leu · thr · pro · val · glu · · · · ·C(146) HbS β 肽链
南方医科大学
分子诊断学
分子诊断方法
限制性内切酶法(RE) ASO ARMS、 跨越断裂点的PCR (裂口PCR、gap-PCR)
南方医科大学
RE法 (Southern Blot)
1.15 kb 0.2 kb
分子诊断学
Aβ肽链
ACT CCT GAG GAG
1.35 kb
难点遗传性疾病的分子机制。
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分子诊断学
本章目录
第一节 遗传性疾病分子诊断的策略*** 第二节 遗传病的分子诊断 第三节 产前(包括胚胎植入前)遗传缺 陷的分子诊断****
南方医科大学
分子诊断学
第一节 遗传性疾病分子诊断的策略*
一、直接诊断策略 二、基因多态性连锁分析 三、基因突变的定量(dosage)诊断
南方医科大学
分子诊断学
(二)片段性突变的检测
片段性突变是指DNA分子较大范围发生突变, 碱基的缺失、插入、扩增和重组。 (1)少数核苷酸缺失或插入
检测点突变的方法
(2)大的片段突变
Southern印迹技术、多重PCR技术。
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分子诊断学
二、基因多态性连锁分析
检测原理:多态性连锁分析、关联分析
分子诊断学
镰刀状贫血病—
血液中大量出现
镰刀红细胞,其
正常细胞 镰刀形细胞
携带氧的功能只
有正常红细胞的
一半,患者常因
此缺氧窒息。
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分子诊断学
镰刀状细胞贫血分子机制
HbA β 肽 链 N-val · his · leu · thr · pro · glu · glu · · · · ·C(146) GTG CAT CTG ACT CCT GAG GAG
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分子诊断学
一、血红蛋白病
血红蛋白具有4个亚 基组成的四级结构,每 个亚基可结合1个血红素 并携带1分子氧。 Hb 亚 基 之 间 通 过 8 对盐键,使4个亚基紧密 结合而形成亲水的球状 蛋白。
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分子诊断学
珠蛋白基因簇
16p13.33-p13.11
南方医科大学
珠蛋白基因簇:
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MAPH 微卫星PCR 差异PCR 竞争PCR Real-time PCR
不确定 1 x 102 1 x 102 1 x 102 1 x 102
长片段 PCR
1 x 102
分子诊断学
第二节 遗传病的分子诊断
一、血红蛋白病 二、血友病 三、肌营养不良症 四、苯丙酮尿症 五、囊性纤维化 六、亨廷顿病 七、脆性X综合征
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分子诊断学
2、基因背景未知的点突变
单链构象多态性(single-strand conformational polymorphism, SSCP) 变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE) 异源双链分析(heteroduplex analysis, HA) DNA序列测定 蛋白截短测试(protein truncation test, PTT)
检测前提:致病基因尚未被定位和阐明 基因太大 突变种类太多 检测方法:RFLP,VNTR,STR,SNP
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分子诊断学
三、基因突变的定量诊断
检测内容:大范围的重复、缺失 检测方法:细胞分裂中期染色体检测 固相杂交 PCR 扩增
南方医科大学
分子诊断学 方法 细胞分裂中期染色体检 测 CGH FISH 阵列CGH 分辨率(碱基数) 染色体 5 x 106 5 x 104 5 x 104 说明 常规细胞培养至细胞分裂期染色; 细胞分裂中期染色体作为探针来检测和控制 不同的杂交; 用修饰(如纤维探针)来增强分辨率; 使用阵列化的细菌人工染色体载体(Bacterial artificial chromosomes,BACs)而非细胞 分裂中期染色体作为探针; 将探针与基因组DNA杂交,然后再扩增探针; 取决于缺失区已知的微卫星; 要求精心控制起始DNA的质和量,结果为相 对量,是一种半定量方法; 准确,结果为摩尔数,是一种绝对定量方法; 成本较高,可有多种方法如Taqman法或分子 信标法的SYBR Green染料或探针,应用 越来越广泛; 检测基因内缺失比重复更有效,可以确定突 变的性质。
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分子诊断学
一、直接诊断策略
定义:直接检测导致遗传性疾病的各种基因突变
类型:点突变 缺失 插入 倍增 前提:基因已经克隆,序列和结构清楚
南方医科大学
分子诊断学
(一)点突变的诊断
1、 基因背景清楚的点突变
等位基因特异性寡核苷酸杂交(allele specific oligonucleotide, ASO) PCR-ELISA 等位基因特异性扩增(allele specific amplification, ASA PCR-RFLP 测序 基因芯片技术等进行诊断
分子诊断学
教学目的与要求
了解遗传性疾病分子诊断的方法学评价及产前
(包括胚胎植入前)遗传缺陷分子诊断的适应症。
熟悉遗传性疾病的分子机制及分子诊断的标准化。 掌握遗传性疾病及产前(包括胚胎植入前)遗传
缺陷的经典检测方法及临床意义。
重点遗传性疾病及产前(包括胚胎植入前)遗传
缺陷的经典检测方法及临床意义。
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血红蛋白类型
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分子诊断学
血红蛋白病 hemoglobinopathy
结构异常血红蛋白病 镰刀状细胞贫血; 不稳定血红蛋白病 血红蛋白M病 氧亲和力改变 地中海贫血, 珠蛋白的合成降低或消失
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1、镰刀形红细胞贫血
分子诊断学
11p15.5
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分子诊断学
血红蛋白的类型
成人Hb :Hb A 22 97~98% Hb A2 22 2~3 % 胎儿Hb: Hb F 2 2 α γ α γ 胚胎Hb: Hb GowerⅠ 22 ζ γ (妊娠12周内) Hb Gower Ⅱ 22 Hb Portland 2 2
GTG CAT CTG ACT CCT GTG GAG N-val · his · leu · thr · pro · val · glu · · · · ·C(146) HbS β 肽链
南方医科大学
分子诊断学
分子诊断方法
限制性内切酶法(RE) ASO ARMS、 跨越断裂点的PCR (裂口PCR、gap-PCR)
南方医科大学
RE法 (Southern Blot)
1.15 kb 0.2 kb
分子诊断学
Aβ肽链
ACT CCT GAG GAG
1.35 kb
难点遗传性疾病的分子机制。
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分子诊断学
本章目录
第一节 遗传性疾病分子诊断的策略*** 第二节 遗传病的分子诊断 第三节 产前(包括胚胎植入前)遗传缺 陷的分子诊断****
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分子诊断学
第一节 遗传性疾病分子诊断的策略*
一、直接诊断策略 二、基因多态性连锁分析 三、基因突变的定量(dosage)诊断
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分子诊断学
(二)片段性突变的检测
片段性突变是指DNA分子较大范围发生突变, 碱基的缺失、插入、扩增和重组。 (1)少数核苷酸缺失或插入
检测点突变的方法
(2)大的片段突变
Southern印迹技术、多重PCR技术。
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分子诊断学
二、基因多态性连锁分析
检测原理:多态性连锁分析、关联分析
分子诊断学
镰刀状贫血病—
血液中大量出现
镰刀红细胞,其
正常细胞 镰刀形细胞
携带氧的功能只
有正常红细胞的
一半,患者常因
此缺氧窒息。
南方医科大学
分子诊断学
镰刀状细胞贫血分子机制
HbA β 肽 链 N-val · his · leu · thr · pro · glu · glu · · · · ·C(146) GTG CAT CTG ACT CCT GAG GAG
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分子诊断学
一、血红蛋白病
血红蛋白具有4个亚 基组成的四级结构,每 个亚基可结合1个血红素 并携带1分子氧。 Hb 亚 基 之 间 通 过 8 对盐键,使4个亚基紧密 结合而形成亲水的球状 蛋白。
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分子诊断学
珠蛋白基因簇
16p13.33-p13.11
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珠蛋白基因簇:
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MAPH 微卫星PCR 差异PCR 竞争PCR Real-time PCR
不确定 1 x 102 1 x 102 1 x 102 1 x 102
长片段 PCR
1 x 102
分子诊断学
第二节 遗传病的分子诊断
一、血红蛋白病 二、血友病 三、肌营养不良症 四、苯丙酮尿症 五、囊性纤维化 六、亨廷顿病 七、脆性X综合征
南方医科大学
分子诊断学
2、基因背景未知的点突变
单链构象多态性(single-strand conformational polymorphism, SSCP) 变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE) 异源双链分析(heteroduplex analysis, HA) DNA序列测定 蛋白截短测试(protein truncation test, PTT)
检测前提:致病基因尚未被定位和阐明 基因太大 突变种类太多 检测方法:RFLP,VNTR,STR,SNP
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分子诊断学
三、基因突变的定量诊断
检测内容:大范围的重复、缺失 检测方法:细胞分裂中期染色体检测 固相杂交 PCR 扩增
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分子诊断学 方法 细胞分裂中期染色体检 测 CGH FISH 阵列CGH 分辨率(碱基数) 染色体 5 x 106 5 x 104 5 x 104 说明 常规细胞培养至细胞分裂期染色; 细胞分裂中期染色体作为探针来检测和控制 不同的杂交; 用修饰(如纤维探针)来增强分辨率; 使用阵列化的细菌人工染色体载体(Bacterial artificial chromosomes,BACs)而非细胞 分裂中期染色体作为探针; 将探针与基因组DNA杂交,然后再扩增探针; 取决于缺失区已知的微卫星; 要求精心控制起始DNA的质和量,结果为相 对量,是一种半定量方法; 准确,结果为摩尔数,是一种绝对定量方法; 成本较高,可有多种方法如Taqman法或分子 信标法的SYBR Green染料或探针,应用 越来越广泛; 检测基因内缺失比重复更有效,可以确定突 变的性质。
南方医科大学
分子诊断学
一、直接诊断策略
定义:直接检测导致遗传性疾病的各种基因突变
类型:点突变 缺失 插入 倍增 前提:基因已经克隆,序列和结构清楚
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分子诊断学
(一)点突变的诊断
1、 基因背景清楚的点突变
等位基因特异性寡核苷酸杂交(allele specific oligonucleotide, ASO) PCR-ELISA 等位基因特异性扩增(allele specific amplification, ASA PCR-RFLP 测序 基因芯片技术等进行诊断
分子诊断学
教学目的与要求
了解遗传性疾病分子诊断的方法学评价及产前
(包括胚胎植入前)遗传缺陷分子诊断的适应症。
熟悉遗传性疾病的分子机制及分子诊断的标准化。 掌握遗传性疾病及产前(包括胚胎植入前)遗传
缺陷的经典检测方法及临床意义。
重点遗传性疾病及产前(包括胚胎植入前)遗传
缺陷的经典检测方法及临床意义。