最新基因组研究进展

• 约有一半种类的鳞状细胞肺癌使用为其他癌症开发的药物 迚行治疗
2013.05.01
• 《Nature》 发表子宫内膜癌研究 病例近400例 子宫内膜癌是美国女性中最常见的妇科癌症， 每年有近5万 人发病，死亜约8000人 • 《 New England Journal of Medicine 》 发表了关于急性髓系白血病研究 病例近200例 急性髓系白血病是最常见的成人急性白血病，在美国有约 14,000人患病，死亜约10,000人
• 诱人的可能性
这三种致命的癌症可能会对同一种药物起反应
急性髓细胞性白血病基因组
• AML是成年人中最为常见的急性白血病类型，美国每年有 1.4万人罹患此病，1万人因此死亜 • 癌症细胞在AML患者中平均有13个基因发生了突变 • 通过研究大量的AML病例，研究人员认为这些几乎就是 AML所有的突变基因
新发现，新希望
郑大二附院肿瘤科 巩天晓
关键计划
• 美国国家卫生研究院(National Institutes of Health) 施行
• 调查常见癌症中的DNA突变
• 提供有说服力的证据，证明癌症越来越被视为一种主要是 由其基因图谱而不是由其发病器官决定的疾病
研究背景
• 在过去的数年间，作为该计划的一部分，研究者们报告了 乳腺癌、结肠癌和肺癌中与其他癌症有关的惊人的基因变 化 • 一种乳腺癌被认为与卵巢癌非常相似 • 结肠癌中的一种基因变化常常在乳腺癌中发现
子宫内膜癌基因组
• 子宫内膜癌（Endometrial Carcinoma）是发生于子宫内 膜的一组上皮性恶性肿瘤，好发于围绝经期和绝经后女性， 是最常见的女性生殖系统肿瘤Βιβλιοθήκη Baidu一
• 子宫内膜癌的遗传学研究在很大程度上还是空白
子宫内膜癌基因组
• 子宫内膜癌病例中出现了只在结肠癌中出现过的基因突变
• 破坏了DNA损伤修复系统，其引发的突变次数是癌细胞通 常突变次数的100倍
• 发生了这一突变的子宫内膜癌病例情况较好，这可能是因 为累积起来的DNA损伤大大破坏了癌细胞
子宫内膜癌基因组
• 两种子宫内膜癌肿瘤亚型： 子宫浆液性癌（uterine serous tumor） 高分级卵巢子宫内膜样肿瘤（endometrioid tumor） • 共同具有几种遗传突变
子宫内膜癌基因组
• 大约25%的分类为高分级卵巢子宫内膜样肿瘤的肿瘤，实 际上具有与子宫浆液性癌相似的遗传特征 TP53基因广泛的拷贝数变异和频繁突变 • 子宫浆液性癌还与卵巢浆液性癌和基底细胞样乳腺癌共有 一些遗传特征
• 这可能会改变子宫内膜癌的分类方式，幵为罹患这种癌症 的患者提供机会测试新的治疗方案
子宫内膜癌基因组
急性髓细胞性白血病基因组
• 根据基因的功能和涉及的信号通路将这些突变分成了9个 类别 • 肿瘤抑制基因，信号基因和表观遗传学的修饰基因 • 表观遗传学修饰基因是最常见的突变种类 表观遗传学的改变将会影响基因的开启和关闭，但不影响 DNA的排列序列 在确定的基因及基因组之间，存在基因合作模式及互相排斥 模式 结合三个基因突变-FLT3，NPM1和DNMT3A-可能代表一个 AML的独特亚型
新模式
• 对肿瘤迚行更精确分类的基因畸变模式
• 根据这一基因分析法，大约有10%按照老的检查方法可以 轻易治疗的肿瘤如今似乎更具致命性，因而需要化疗
下一步
基因突变
好的？
坏的？
AML genomes have fewer mutations than most other adult cancers, with an average of only 13 mutations found in genes. Of these, an average of 5 are in genes that are recurrently mutated in AML. A total of 23 genes were significantly mutated, and another 237 were mutated in two or more samples. Nearly all samples had at least 1 nonsynonymous mutation in one of nine categories of genes that are almost certainly relevant for pathogenesis
未来
是光明的！
transcription-factor fusions (18% of cases) the gene encoding nucleophosmin (NPM1) (27%) tumor-suppressor genes (16%), DNA-methylation–related genes (44%), signaling genes (59%),chromatinmodifying genes (30%), myeloid transcription-factor genes (22%) cohesin-complex genes (13%), spliceosome-complex genes (14%). Patterns of cooperation and mutual exclusivity suggested strong biologic relationships among several of the genes and categories