分子生物学专业词汇

于临床。 3 DNA复制 (16) 1) replicon 复制子 基因组中DNA 复制的单位，包括复制原点。 2) replisome 复制体 在细菌复制叉上形成的多蛋白质结构，它能完成复制。包括DNA 聚合 酶和其它酶。 3) replication origin 复制起点 基因组中单一DNA复制时的所需要的起始序列。(含AT碱 基对丰富，易解链。真核细胞染色体含有多个起始点，而细菌染色体和质粒中只有一个。) 4) semi-conservation replication DNA 半保留复制 通过亲本DNA双螺旋两链分开，每一 链作为模 板合成新的互补链的复制方式。 5) semi-discontinuous replication 半不连续复制 半不连续复制是指DNA复制时，前导 链上DNA的合成是连续的，后随链上是不连续的，故称为半不连续复制。 6) Okazaki fragment 冈崎片段 在DNA不连续复制过程中， 沿着后随链的模板链合成的新DNA 片段(其长度在真核与原核生物当中存在差别， 真核生物的冈崎片段长度约为100～200核苷 酸残基，而原核生物的为1000～2000核苷酸残基)。 7) transcriptional activation 转录激活 通过染色体结构改变或转录因子直接结合或各 类辅助因子间接作用，而激活基因启动子起始转录的调控作用。 8) RNApol(RNA polymerase) RNA聚合酶 ）:以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5′-三磷 酸合成RNA的酶。是催化以DNA为模板（template）、三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二 酯键而聚合的合成RNA的酶。因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关，所以也称 转录酶。 9) dnaG (primase) 引发酶 一种依赖于DNA的RNA聚合酶，其功能是在DNA复制过程中先合成 一段RNA引物，在这引物上延伸新合成的DNA片段。 10) primosome 引发体 DNA复制时，解旋酶、引发酶等多种蛋白质组成的蛋白质复合体，在 后随链模板上移动，生成短片段RNA引物，用于DNA聚合酶合成冈崎片段。 11) covalence elongation 共价延伸方式 即滚环方式，这是一种单向复制的特殊方式，在 一条断裂的亲本链的3'-OH上不断地发生DNA聚合作用,因而叫共价延伸 12) rolling circle replication 滚环复制 一种复制模式，复制叉沿环形模板复制一定次 数，每个反应中新合成的链将前一反应中合成的链抛出，形成与环状模板链互补的一系列 线性序列。 13) single strand binding protein (SSB) 单链结合蛋白 结合于螺旋酶沿复制叉方向向前 推进产生的单链区， 防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质。 14) lagging strand 后随链 与复制叉移动的方向相反，通过不连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新 的DNA链。 15) nucleosome replication 核小体复制 16) methylation 甲基化 从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上催化其甲基转移到其他 化合物的过程。可形成各种甲基化合物，或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲 基化产物。 4 转录 (20) 1) polycistron 多顺反子 受同一个控制区调控的一组基因。它们前后排列，并一起被转录 和翻译而得到一组功能相关的蛋白质或酶。多见于原核生物。 2) messenger RNA 信使RNA 携带从DNA编码链得到的遗传信息，并以三联体读码方式指导蛋 白质生物合成的RNA，由编码区、上游的5′非编码区和下游的3′非编码区组成。 3) promoter 启动子 结合RNA 聚合酶并起始转录的DNA 区域 4) TATAAT (pribnow Box) TATAAT 盒 该序列是由Pribnow和Schaller发现。位于-10bp左右， 其保守序列为TATAAT，A.T较丰富，所以易于解链。其功能是:(1)RNA pol (RNA 聚合酶)
10)
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13) 14)
部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程。热变性DNA一般经缓慢冷却 后即可复性,此过程称之为annealing)。DNA的复性不仅受温度影响,还受DNA自身特性等其 它因素的影响。 palindromic sequence 回文序列 1)单条核酸序列内以对称点为中心，两侧碱基互补的 核心序列区域。含有该区域的双链DNA从不同方向阅读不同单链时其序列一致，常见于限 制酶的作用位点。(2)具有对称结构的DNA片段，即双链DNA中似发夹的结构，每条链从3' 或5'方向阅读时其核苷酸序列均相同。 C value paradox C 值矛盾 生物体的单倍体基因组所含DNA是恒定的，称为C值（C value） ，是每一物种的一个特征。不同物种C值的差异很大（表12） 。当进化增加了生物体 结构与功能的复杂性时，基因组也相应地增大。在某些生物中，这种规律并不适用。有些 单细胞真核生物的基因组大小并不比原核生物有明显的增加，生物基因组大小同生物在进 化上所处地位的高低没有关系，这种现象就叫C值矛盾（C value paradox） overlapping gene 重叠基因 重叠基因（overlapping gene）是指两个或两个以上的基 因共有一段DNA序列，或是指一段DNA序列成为两个或两个以上基因的组成部分。重叠基因 有多种重叠方式。例如，大基因内包含小基因；前后两个基因首尾重叠一个或两个核苷酸； 几个基因的重叠，几个基因有一段核苷酸序列重叠在一起，等等。重叠基因中不仅有编码 序列也有调控序列，说明基因的重叠不仅是为了节约碱基，能经济和有效地利用DNA遗传信 息量，更重要的可能是参与对基因的调控。 repetitive gene 重复基因 重复基因指染色体上存在多数拷贝基因，重复基因往往 是生命活动最基本，最重要的功能相关的基因。 splitting gene 间隔基因 真核生物结构基因，由若干个编码区和非编码区互相间隔开 但又连续镶嵌而成，去除非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质， 这些基因称为断裂基因
分子生物学重点专业词汇 1 基因的概念 (14) 1) gene 基因 基因（Gene，Mendelian factor） ，也称为遗传因子。基因是DNA分Leabharlann Baidu上具有遗 传效应的特定核苷酸序列的总称，是具有遗传效应的DNA分子片段。基因位于染色体上， 并在染色体上呈线性排列。基因不仅可以通过复制把遗传信息传递给下一代，还可以使遗 传信息得到表达，也就是使遗传信息以一定的方式反映到蛋白质的分子结构上，从而使后 代表现出与亲代相似的性状。 2) cis action element 顺式作用元件 顺式作用元件(cis-actingelement)存在于基因旁侧序 列中能影响基因表达的序列。顺式作用元件包括启动子、增强子、调控序列和可诱导元件 等，它们的作用是参与基因表达的调控。顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一 个作用位点，要与反式作用因子相互作用而起作用 3) trans action factor 反式作用因子 参与基因表达调控的因子, 它们与特异的靶基因的 顺式元件结合起作用。编码反式作用因子的基因与被反式作用因子调控的靶序列(基因)不 在同一染色体上。 反式作用因子有两个重要的功能结构域:DNA结合结构域和转录活化结构 域,它们是其发挥转录调控功能的必需结构。反式作用因子可被诱导合成, 其活性也受多种 因素的调节。 同一类序列特异性的反式作用因子由多基因家族所编码, 它们具有特定的蛋白质结构(如上 述的锌指结构、碱性亮氨酸拉链、螺旋-环-螺旋基元等)和蛋白质结构上的同源性, 因而构 成反式作用因子家族, 如类固醇激素受体家族、AP1家族等 4) central dogma 中心法则 中心法则(genetic central dogma)，是指遗传信息从DNA传递给 RNA，再从RNA传递给蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递 给DNA，即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。在某些病毒 中的RNA自我复制（如烟草花叶病毒等）和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的 过程（某些致癌病毒）是对中心法则的补充。 5) double helix 双螺旋 DNA双螺旋（DNA double helix） ：一种核酸的构象，在该构象中， 两条反向平行的多核甘酸链相互缠绕形成一个右手的双螺旋结构。碱基位于双螺旋内侧， 磷酸与糖基在外侧，通过磷酸二脂键相连，形成核酸的骨架。碱基平面与假象的中心轴垂 直，糖环平面则与轴平行，两条链皆为右手螺旋。双螺旋的直径为2nm，碱基堆积距离为 0.34nm， 两核甘酸之间的夹角是36゜，每对螺旋由10对碱基组成，碱基按A-T，G-C配对 互补，彼此以氢键相联系。维持DNA双螺旋结构的稳定的力主要是碱基堆积力。双螺旋表 面有两条宽窄`深浅不一的一个大沟和一个小沟。 6) major groove 大沟 绕B-DNA双螺旋表面上出现的螺旋槽（沟） ，深的沟（约2.2nm交叉） 称为大沟，浅的沟（约1.2nm交叉）称为小沟。大沟，小沟都、是由于碱基对堆积和糖-磷 酸骨架扭转造成的。 7) DNA denaturation DNA分子变性 DNA变性指DNA分子由稳定的双螺旋结构松解为无 规则线性结构的现象。变性时维持双螺旋稳定性的氢键断裂，碱基间的堆积力遭到 破坏，但不涉及到其一级结构的改变。凡能破坏双螺旋稳定性的因素，如加热、极 端的pH、有机试剂甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等，均可引起核酸分子变性。 变性的 结果DNA的紫外线吸收增加，比旋光度和粘度降低，密度也增加。这种效应叫做增色效应。 8) Tm (melting temperature) 溶解温度 对双链DNA进行加热变性，当温度升高到一定 高度时，DNA溶液在260nm处的吸光度突然明显上升至最高值，随后即使温度继续 升高，吸光度也不再明显变化。若以温度对DNA溶液的紫外吸光率作图，得到的典 型DNA变性曲线呈S型(如下图)。可见DNA变性是在一个很窄的温度范围内发生的。 通常将核酸加热变性过程中， 紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为核酸的解 链温度，由于这一现象和结晶的融解相类似，又称融解温度 9) anneal/renaturation 分子复性 DNA的复性指变性DNA 在适当条件下,二条互补链全部或
2 分子生物学的研究方法（5） 1) vector 载体 载体（vector ）在基因工程重组DNA技术中将DNA片段（目的基因）转移 至受体细胞的一种能自我复制的DNA分子。三种最常用的载体是细菌质粒、噬菌体和动植 物病毒 2) plasmid 质粒 质粒是细菌拟核裸露DNA外的遗传物质，为环形闭合的双股DNA,存在于细胞 质中，质粒编码非细菌生命所必须的某些生物学性状, 如性菌毛、细菌素、毒素和耐药性 等,大小从1-200kb不等，为双链、闭环的DNA分子，并以超螺旋状态存在于宿主细胞中。 质粒具有可自主复制、传给子代、也可丢失及在细菌之间转移等特性，与细菌的遗传变异 有关。 3) report gene 报告基因 报告基因 (reporter gene)是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基 因，也就是说，是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把它的编码序列和基因表达调 节序列相融合形成嵌合基因，或与其它目的基因相融合，在调控序列控制下进行表达，从 而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控，筛选得到转化体。 4) PCR （polymerase chain reaction） 聚合酶链式反应 聚合酶链式反应（PCR)扩增样 品中的DNA量和富集众多DNA分子中的一个特定的DNA序列的一种技术。在该反应中，使 用与目的DNA序列互补的寡核苷酸作为引物，进行多轮的DNA合成。其中包括DNA变性， 引物退火和在TapDNA聚合酶催化下的DNA合成。在分子克隆和DNA分析中有着以下多种 用途： (1)生成双链DNA中的特异序列作为探针；(2)由少量mRNA生成cDNA文库；(3)从 cDNA中克隆某些基因； (4)生成大量DNA以进行序列测定； (5)突变的分析； (6)染色体步移； (7)RAPD、AFLP、RFLP等DNA多态性分析等 5) Taq E Taq 酶 从水生栖热菌（Taq）中分离出的具有热稳定性的DNA 聚合酶，对于PCR 的应用有里程碑的意义，该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活，不需要每个循环加酶， 使PCR技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本，PCR技术得以大量应用，并逐步应用