一株腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)培 养基优化
一例鲤、鲫暴发性出血病的诊治
一、基本情况1.养殖情况本次发病区域位于成都市新津区集中连片养殖池塘，发病池塘主要养殖品种为鲤、鲫，养殖池塘水域面积大小不一，集中连片区域池塘总面积1000余亩。
本次选取发病较为严重的1个养殖户池塘，兼顾周边养殖场。
该养殖户的养殖池塘面积为40亩，水源为自然降水、地下水以及湿地沉降水。
通过现场观察，池塘水体较为清澈，无漂浮物，在饵料台附近可见少许漂浮油膜，水面散在性漂浮病死鱼；增氧机处于常开状态。
2.水质检测水质检测时间为14时左右，使用采水器取水面下15厘米水体。
池塘水温10.3℃、溶氧8.8毫克/升、pH8.04、氨氮1.2毫克/升、亚硝酸盐0.05毫克/升，氨氮和亚硝酸盐含量偏高。
3.发病情况该养殖区域从2021年12月起陆续出现发病情况，最初以鲤鱼为主，后期扩散至鲫鱼养殖池塘。
根据部分养殖户反馈，最早发现的病例在成都市蒲江县流水养殖池塘。
据了解，本区域内养殖鲤、鲫苗种均购自蒲江一带苗种繁育场，草鱼购自广东一带苗种繁育场。
该养殖户主要养殖品种为鲤、鲫，搭配鲢、鳙和草鱼。
鲤、鲫均为当年苗种，购自蒲江一带苗种繁育场，放养大规格苗种5000尾/亩。
2022年1月底该养殖户进行了1次拉网捕鱼，拉网后池塘未进行消毒和采取其他措施。
2月初池鱼开始发病，初期每天死亡几尾，后期发展至10～15千克，发病最高期日死亡量达150千克左右。
发病个体大小不一，死亡个体鲤均重在600克左右、鲫在400克左右，发病趋势呈现出典型的“急、快、广、高”。
在进出水口附近可观察到病死鱼沉在池底，部分浅水区域可见病鱼在池底呆滞不动或漂浮于水体中，对惊吓不敏感。
二、解剖学观察选取典型发病鲤、鲫进行观察，鲤体表多见散在充血、出血(图1a)，鳃盖前段出现1个较大创口，边缘溃疡发白，鳃盖充血、出血(图1b)，鳍条及基部充血、出血(图1c)，腹部可见大范围充血、出血(图1d)，肛门红肿，鳞基部充血、出血、松动易落，有竖鳞现象(图1e)，鳃丝严重充血(图1f)，血液凝固性变差，易溶血；鲫的口部周围严重充血、出血，并伴有吻部溃烂(图1g)，鳃盖周边可见散在分布溃疡灶，体表偶见充血、出血点位，鳃丝严重充血(图1h)，鳞松动易落。
腐败西瓦氏细菌的特性及用途
腐败西瓦氏细菌的特性及用途摘要：在当今时代，科技发达越来越快，污染也变得越来越严重，水是生命资源，人类活动离不开水，但是由于工业发达和生活用水的处理不当，导致很多河流已经丧失了原本的面目，人类现在生活在天不在蓝，海不再蓝的自然里，污水处理就变得异常严峻，污水处理的方法有很多，物理，生物，化学方法都存在，本文主要是讨论利用生物方法处理污水，众所周知，细菌存在于我们周围，而且细菌的繁殖生长能力很强，所以选择利用希瓦氏细菌来分解和降解污水中有机物和一些有害物质是一个很好的方法。
希瓦式菌属（Shewanella）于革兰氏阴性细菌，,黑色菌落, 革兰氏阴性杆菌。
它能够降解和稳定代谢导致污水腐臭的氧化三甲胺。
还具有还原三价铁、锰、铀等重金属，液化明胶、Tween40和tween80，产生H2S的能力。
在乳酸钠存在的条件下，能还原硝酸盐、亚硝酸盐、铁氧化物和硫代硫酸钠。
关键词：希瓦氏细菌污水处理氧化三甲胺代谢细菌无处不在，但是并不是所有的细菌都是有害细菌，有的细菌对人类有益，有的细菌对人类有害，而有的细菌即对人类有害也有益。
例如希瓦氏细菌可以腐败鱼虾等海产品，但它也可以用于污水处理。
在用希瓦氏细菌处理污水之前，我们得了解它的特性及处理污水的原理。
腐败希瓦氏具有以下特点：1、噬菌体裂解性好，能够在4-5h内使腐败希瓦氏菌菌悬液变澄清，经双层平板法检测得到清晰透明的噬菌斑。
对该噬菌体的生理特性研究可知该噬菌体核酸类型为DNA，其形态符合长尾噬菌体科的基本特征，为蝌蚪形，具有宽度约为50nm的正多边形头部和长约150nm 的尾部。
该噬菌体的最佳感染复数为10，一步生长曲线显示噬菌体感染宿主菌潜伏期为10min，爆发期为20min，裂解量为98。
2、对腐败希瓦氏菌噬菌体Spp001进行抑菌实验，以培养基和鱼肉汤为基质时，噬菌体Spp001均能抑制腐败希瓦氏菌Sp225的生长，保持基质澄清。
温度大于70℃噬菌体失去裂解活性。
铁还原菌希瓦氏菌菌株
铁还原菌希瓦氏菌菌株全文共四篇示例，供读者参考第一篇示例：铁还原菌希瓦氏菌菌株是一种特殊的细菌，它具有强大的还原能力，可以利用铁离子作为电子受体进行代谢活动。
这种细菌在地下矿物资源的富集和回收中发挥着重要作用，被广泛应用于生物矿山和生物浸出等领域。
本文将介绍铁还原菌希瓦氏菌菌株的特点、分类、应用及未来研究方向，以便更好地了解这一有益的微生物。
一、希瓦氏菌菌株的特点希瓦氏菌菌株是一类铁还原细菌，通常生长在缺氧环境下，其代表菌株是Shewanella oneidensis MR-1。
这种菌株能够利用铁离子还原为可溶性铁(II)，从而在缺乏氧气的环境中进行呼吸作用。
希瓦氏菌菌株还具有良好的电子传递能力，可以与电极产生直接接触，并进行电催化反应。
希瓦氏菌菌株的生长速度较快，适应性强，对环境条件的变化具有一定的耐受性。
这使得它在各种复杂环境中都能够生存并发挥作用。
希瓦氏菌菌株能够利用多种底物进行代谢活动，包括酸性物质、有机物质等，具有较强的适应性和生物多样性。
希瓦氏菌菌株可以根据其代谢特点、生长条件、形态结构等特征进行分类和鉴定。
通过这些分类方法，可以更好地了解和研究希瓦氏菌菌株的生物学特性和应用潜力。
希瓦氏菌菌株还可以应用于生物还原电解池、生物燃料电池等领域。
它们具有良好的电子传递能力，可以作为电极与环境中的底物直接接触，实现电催化反应。
这种特点使得希瓦氏菌菌株在清洁能源的生产和环境修复中具有潜在的应用价值。
1.生物矿山和生物浸出技术的优化和应用。
通过研究希瓦氏菌菌株的代谢途径和调控机制，优化其在金属矿石的浸出和尾矿资源的回收中的应用效果，提高生产效率和矿产资源回收率。
2.生物还原电解池和生物燃料电池的研究与应用。
探索希瓦氏菌菌株在电催化反应中的作用机制，优化其在清洁能源生产和环境修复中的应用效果，推动生物电化学技术的发展和应用。
3.希瓦氏菌菌株的遗传改造和基因工程研究。
通过遗传改造和基因工程技术，改良希瓦氏菌菌株的代谢途径和电子传递能力，提高其在矿物资源利用和能源生产中的应用效果，实现其在工业生产中的广泛应用。
腐殖质呼吸作用及其生态学意义
第２９卷第３期生态学报Ｖ０１．２９，Ｎｏ．３２００９年３月ＡＣＴＡＥＣＯＬＯＧＩＣＡＳＩＮＩＣＡＭａｒ．，２００９腐殖质呼吸作用及其生态学意义武春媛１”，李芳柏２，周顺桂２’＋（１．中国科学院广州地球化学研究所，广州５１０６４０；２．广东省生态环境与土壤研究所，广东省农业环境综合治理重点实验室广州５１０６５０）摘要：腐殖质呼吸是厌氧环境中普遍存在的一种微生物呼吸代谢模式。
自１９９６年发现以来，日益成为生态学与环境科学领域的研究热点。
在厌氧条件下，一些微牛物能以腐殖质作为唯一电子受体，氧化环境中的有机质或者甲苯等环境有毒物质，产生ＣＯ：，参与碳循环；同时，腐殖质呼吸作用产生的还原态腐殖质可以还原环境中的一些氧化态物质，如Ｆｅ（ＩＩＩ）、Ｍｎ（ｉｖ）、Ｃｒ（ＶＩ）、ｕ（Ｖ１）、硝基芳香化合物和多卤代污染物。
因此，腐殖质呼吸能够影响环境中Ｃ、Ｎ、Ｆｅ、Ｍｎ以及一些痕量金属元素的生物地球化学循环，并且能够促进重金属以及有机污染物的脱毒，在水体自净、污染土壤原位修复、污水处理等方面具有积极作用。
关键词：腐殖质呼吸；腐殖质还原菌；电子穿梭体；生态学意义文章编号：１０００．０９３３（２００９）０３．１５３５．０８中图分类号：Ｑ１４３文献标识码：ＡＨｕｍｕｓｒｅｓｐｉｒａｔｉｏｎａｎｄｉｔｓｅｃｏｌｏｇｉｃａｌｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅＷＵＣｈｕｎ－Ｙｕａｎｌ，－。
ＬＩＦａｎｇ．Ｂａｉ２．ＺＨＯＵＳｈｕｎ．Ｇｕｉ２，’１ＧｕａｎｇｚｈｏｕＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＧ“日ｈｍ矗打ｙ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙｏｆ＆ｉｅｌｌｃｅ￥，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ，５１０６４０，Ｃｈｉｎａ２Ｇｕａｎｇｄｏｎｇ研Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆ—ｇ，妇删ＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔＰｏｌｌｕｔｉｏｎＩｎｔｅｇｒａｔｅｄＣｏｎｔｒｏｌ，ＧｎａｎｇｄｏｎｇｌｎｓｔｉｔｔａｅｏｆＥｃｏ—ＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｎｄＳｏｉｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ，５１０６５０，ＣｈｉｎａＡｃｔａＥｃｏｌｏｇｉｃａＳｉｎｉｃａ，２００９，２９（３）：１５３５—１５４２．Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｈｕｍｕｓｉｓｕｂｉｑｕｉｔｏｕｓｃｏｍｐｏｎｅｎｔｉｎｔｈｅｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｎｄｃａｎｂｅｒｅａｄｉｌｙｉｓｏｌａｔｅｄｆｒｏｍｎｅａｒｌｙａｌｌｓｏｉｌｓ，ｗａｔｅｒｓ，ａｎｄｓｅｄｉｍｅｎｔｓ．Ｈｕｍｕｓｂｉｅｄｅｇｒａｕｄｅｓｐｏｏｒｌｙａｎｄｉｓｆｏｒｍｅｄｆｒｏｍｔｈｅｄｅｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｏｆｐｌａｎｔ，ａｎｉｍａｌ，ａｎｄｍｉｃｒｏｂｉａｌｃｅｌｌｓｉｎｓｏｉｌｓａｎｄｓｅｄｉｍｅｎｔｓ．Ｔｈｅｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｇｒｏｕｐｓｏｆｈｕｍｕｓ，ｗｈｉｃｈｄｅｔｅｒｍｉｎｅｔｈｅｐｈｙｓｉｃａｌａｎｄｃｈｅｍｉｃａｌｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ，ｖａｒｙｄｅｐｅｎｄｉｎｇｏｎｔｈｅｏｒｉｇｉｎａｎｄａｇｅｏｆｔｈｅｍａｔｅｒｉａｌ．Ａｎｉｎ—ｄｅｐｔｈｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇｏｆｔｈｅｒｅａｃｔｉｏｎｃｈｅｍｉｓｔｒｙｏｆｈｕｍｕｓａｎｄｔｈｅｒｏｌｅｐｌａｙｅｄｂｙｔｈｅｓｅｃｏｍｐｏｕｎｄｓｉｎｇｅｏｃｈｅｌＩｌｉｃａｌｃｙｃｌｅｓｈａｓｂｅｅｎｍａｊｏｒｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃｆｏｃｕｓｆｏｒｃｅｎｔｕｒｙ．Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｔｈｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓｂｅｔｗｅｅｎｔｈｅｓｅｃｏｍｐｏｕｎｄｓａｎｄｍｉｃｒｏｂｉａｌｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓｈａｖｅｏｎｌｙｒｅｃｅｎｔｌｙｇａｉｎｅｄｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃａｔｔｅｎｔｉｏｎ．Ｉｔｉｓｎｏｗｋｎｏｗｎｔｈａｔｈｕｍｉｃｓｕｂｓｔａｎｃｅｓｍａｙｐｌａｙｉｍｐｏｒｔａｎｔｒｏｌｅｉｎｔｈｅａｎａｅｒｏｂｉｃｂｉｏｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎａｎｄｂｉｏｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎｏｆｏｒｇａｎｉｃａｓｗｅｌｌａｓｉｎｏｒｇａｎｉｃｃｏｍｐｏｕｎｄｓ．Ｈｕｍｕｓｃａｎｂｅｕｔｉｌｉｚｅｄｂｙｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓｅｆｆｅｃｔｉｖｅｅｌｅｃｔｒｏｎａｃｃｅｐｔｏｒｓｆｏｒｔｈｅｏｘｉｄａｔｉｖｅｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎｏｆｏｒｇａｎｉｃｃａｒｂｏｎｉｎａｎａｅｒｏｂｉｃｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ．Ａｌｔｅｒｎａｔｉｖｅｌｙ，ｒｅｄｕｃｅｄｈｕｍｉｃｓｕｂｓｔａｎｃｅｓＣａｎｂｅｕｔｉｌｉｚｅｄｂｙｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓａｓｅｌｅｃｔｒｏｎｄｏｎｏｒｓｆｏｒｔｈｅａｓｓｉｍｉｌａｔｉｏｎｏｆｏｒｇａｎｉｃｃａｒｂｏｎｃｏｕｐｌｅｄｔｏｄｅｎｉｔｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ．Ｍｉｃｒｏｂｉａｌｌｙｒｅｄｕｃｅｄｈｕｍｕｓｃａｎａｃｔ鹅ｓｏｌｕｂｌｅｅｌｅｃｔｒｏｎｃａｒｒｉｅｒｓｂｅｔｗｅｅｎｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓａｎｄｍｅｔａｌｏｘｉｄｅｓｓｕｃｈａｓＦｅ（ＩＩＩ）ｏｘｉｄｅｓ，ａｌｌｏｗｉｎｇｆｏｒｔｈｅｒｅｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｏｆｈｕｍｕｓｔｏｔｈｅｏｘｉｄｉｚｅｄｆｏｒｍ．Ｔｈｕｓ，ｅｖｅｎｓｕｂ—ｓｔｏｉｃｈｉｏｍｅｔｒｉｃｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎｓｏｆｈｕｍｕｓｃａｎｍｅｄｉａｔｅｂｏｔｈａｎａｅｒｏｂｉｃｓｕｂｓｔｒａｔｅｏｘｉｄａｔｉｏｎａｎｄｍｅｔａｌｏｘｉｄｅｒｅｄｕｃｔｉｏｎ．Ａｄｄｉｔｉｏｎａｌｌｙ，ｈｕｍｕｓＣａｎａｓｅｌｅｃｔｒｏｎｓｈｕｔｔｌｅｓ，ａｂｉｏｔｉｃａｌｌｙｔｒａｎｓｆｅｒｒｉｎｇｅｌｅｃｔｒｏｎｓｆｒｏｍａｎｅｘｔｅｒｎａｌｅｌｅｃｔｒｏｎｄｏｎｏｒｔｏｐｒｉｏｒｉｔｙｐｏｌｌｕｔａｎｔｓ，ｗｈｉｃｈｓｕｓｃｅｐｔｉｂｌｅｔｏｒｅｄｕｃｔｉｖｅｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎｓ（ｅ．ｇ．，ｎｉｔｒｏａｒｏｍａｔｉｃｓ，ａｇｏｄｙｅｓａｎｄｐｏｌｙｈａｌｏｇｅｎａｔｅｄｃｏｍｐｏｕｎｄｓ）．Ｔｈｅｓｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓｍａｙｈａｖｅｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｉｍｐａｃｔｏｎｔｈｅｆａｔｅａｎｄｔｒａｎｓｐｏｒｔｏｆｏｒｇａｎｉｃａｎｄｉｎｏｒｇａｎｉｃｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌｐｏｌｌｕｔａｎｔｓ．Ａｎｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇｏｆｔｈｅｓｅｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓｍａｙｉｍｐｒｏｖｅｓｔｒａｔｅｇｉｅｓｆｏｒｂｉｏｒｅｍｅｄｉａｔｉｏｎｏｆｐａｒｔｉｃｕｌａｒｐｏｌｌｕｔａｎｔｓ．Ｌｉｋｅｗｉｓｅ，ｐｒｅｄｉｃｔｉｎｇｔｈｅｂｅｈａｖｉｏｒａｎｄｌｏｎｇｅｖｉｔｙｏｆｐｏｌｌｕｔａｎｔｓｗｉｔｈｉｎｔｈｅｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｍａｙｂｅｂｅｔｔｅｒｍｏｄｅｌｅｄ，ｒｅｓｕｌｔｉｎｇｉｎｉｍｐｒｏｖｅｄｄｅｓｉｇｎｓｔｒａｔｅｇｉｅｓｆｏｒ基金项目：国家自然科学基金资助项目（４０６０１０４３，２０７７７０１３）收稿日期：２００７－１０－１２；修订日期：２００８·０３－１３·通讯作者Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ．Ｅ·ｍａｉｌ：ｓｇｚｈｏｕ＠ｓｏｉｌ．耐．ｃｎ１５３６生态学报２９卷ｂｉｏｒｅｍｅｄｉａｔｉｖｅｐｒｏｃｅｓｓｅｓ．Ｔｈｉｓｐａｐｅｒｐｒｅｓｅｎｔｅｄｒｅｖｉｅｗｈｕｍｕｓｒｅｓｐｉｒａｔｉｏｎｗｈｉｃｈｈａｓｏｎｌｙｒｅｃｅｎｔｌｙｂｅｅｎｒｅｃｏｇｎｉｚｅｄｎｏｖｅ｜ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙｐａｔｈｗａｙｆｏｒｄｉｖｅｒｓｅｃｏｍｍｕｎｉｔｙｏｆｈｕｍｕｓ—ｒｅｄｕｃｉｎｇｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ．Ｌｉｋｅｗｉｓｅ，ｔｈｅｒｏｌｅｏｆｈｕｍｉｃｓｕｂｓｔａｎｃｅｓｔｈｅｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎｏｆｐｒｉｏｒｉｔｙｐｏｌｌｕｔａｎｔｓＷａｓｄｉｓｃｕｓｓｅｄｉｎｔｈｉｓｐａｐｅｒ．ＫｅｙＷｏｒｄｓ：ｈｕｍｕｓｒｅｓｐｉｒａｔｉｏｎ；ｈｕｍｕｓ－ｒｅｄｕｃｉｎｇｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ；ｅｌｅｃｔｒｏｎｓｈｕｔｔｌｅ；ｅｃｏｌｏｇｉｃａｌｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｃｅ腐殖质（Ｈｕｍｉｃｓｕｂｓｔａｎｃｅｓ，ＨＳ）是由动、植物及微生物残体经生物酶分解、氧化以及微生物合成等过程逐步演化而形成的一类高分子芳香族醌类聚合物，广泛存在于土壤、沉积物和水生环境中。
【国家自然科学基金】_有机酸盐_基金支持热词逐年推荐_【万方软件创新助手】_20140731
推荐指数 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1
2011年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50
2012年 序号 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38
科研热词 推荐指数 高氯酸盐 1 铁炉渣 1 钨钴酸盐 1 钨磷酸盐 1 重金属 1 蒽醌2磺酸钠（aqs） 1 自然来源 1 腐败希瓦氏菌 1 胡敏酸钠 1 羟基自由基 1 稻田 1 稳定性 1 硫酸盐 1 环境背景值 1 玉米 1 橙黄ⅳ 1 有毒有机物 1 有机硅取代 1 改性活性炭 1 形成机制 1 归趋行为 1 土壤水 1 吸收速率 1 启动方式 1 同位素示踪技术 1 合成与表征 1 养分 1 催化氧化 1 一体式a/o反应器 1 u（ⅵ） 1 u（vi） 1 toxic organic compounds 1 shewanella putrefaciens 1 keggin结构 1 heavy metal 1 anthraquinone-2-sulfonate（aqs） 1 90sr 1 137cs 1
科研热词 铝硅酸盐矿物 骨 饱和溶解度 静切力 镁锂合金 镀镍 钠化 酮 配住剂 辛基胍 超压顶面 药物临界相对湿度 脂 累托石 紫外滤波器 紫外光谱 碳酸盐胶结作用 碳酸盐 碳同位素 碱性地层 硫代硫酸盐 真空减压 甲烷 生理研究新模式 生物矿化 牙釉 热演化 溶解度 浸锌 浮游有孔虫 流变性 流体-岩石相互作用 泡沫浮选 水分配系数 次生溶蚀孔隙 柱撑改性 染料 有机酸盐药物 有机酸盐 有机盐加重剂 有机改性 日盲紫外滤波器 无氰镀铜 工艺 室温 失活途径 天然气水合物 塑性黏度 吸附等温线 吸附机理 吸附 南海
AQDS和腐植酸对微生物介导铁还原过程的影响
牛丹妮，弓晓峰，李远航，等.AQDS 和腐植酸对微生物介导铁还原过程的影响[J].农业环境科学学报,2021,40（12）：2733-2741.NIU D N,GONG X F,LI Y H,et al.Effects of AQDS and humic acids on the iron reduction process mediated by microorganisms[J].Journal of Agro-Environment Science ,2021,40（12）：2733-2741.开放科学OSIDAQDS 和腐植酸对微生物介导铁还原过程的影响牛丹妮，弓晓峰*，李远航，孙玉恒，舒瑶，曾慧卿（南昌大学资源环境与化工学院，鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室，南昌330031）Effects of AQDS and humic acids on the iron reduction process mediated by microorganismsNIU Danni,GONG Xiaofeng *,LI Yuanhang,SUN Yuheng,SHU Yao,ZENG Huiqing（School of Resources,Environmental and Chemical Engineering,Nanchang University,Key Laboratory of Poyang Lake Environment and Resource Utilization,Ministry of Education,Nanchang 330031,China ）Abstract ：To explore the effects of electron transport on alienated iron reduction,the effects of humic acids and the humus kinoidanthraquione-2,6-disulfonate （AQDS ）on the reduction of dissimilated iron under the anaerobic condition was studied under the mediation of Shewanella putrefaciens （Shewanella ）,and fitting of the logistic equation was performed.Moreover,elemental analysis,UV –visiblespectroscopy,and Fourier transform infrared spectroscopy of humic acids from different sources were carried out.The results showed that收稿日期：2021-04-27录用日期：2021-07-05作者简介：牛丹妮（1997—），女，广西柳州人，硕士研究生，主要从事生物修复研究。
水产品腐败变质及其控制措施
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⑤ 抗氧涂层
抗菌涂膜是指在可食涂膜中添加抑菌剂，通过抑菌剂的缓释作用来达到抑菌、保鲜 效果的一种保鲜膜。抑菌剂通过缓释作用从涂膜中释放作用于食品表面，从而持久地抑制
或防止腐败微生物的生长。抑菌剂在凃膜中的扩散越慢，保鲜膜的抗菌效果越好。
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水产品腐败变质的检测方法
常规鉴定
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PCR技术
水产品腐败 变质的检测 方法
基因芯片技术
酶联免疫吸附技术
变性梯度凝胶电泳法
常规鉴定
最传统的方法，也是最常用的方法，目前在很多研究中仍在应用
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常规鉴定是通过微生物培养和分离纯化
① 首先观察菌株的形态特征(形状、大小、有无鞭毛等)、生理生化特征(营 养类型、最适生长温度和范围等) ② 然后查阅细菌鉴定手册(《常见细菌鉴定手册》、《伯杰氏细菌鉴定手册》 等)
温度、湿度、阳光与空 气(紫外线和氧)
水产品腐败变质
环境因素
水产品腐败变质的机理
蛋白质的分解
蛋白质在微生物的作用下，首先分解为肽，再分解为氨基 酸。氨基酸在相应酶的作用下，进一步分解成有机胺、硫 化氛、硫醇、吲哚、粪臭素和醛等物质，具有恶臭味
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碳水化合物分解 脂肪的酸败
酸败是由于动植物组织中或微生物所产生的酶 或由于紫外线和氧、水分所引起的，食品中的 中性脂肪分解为甘油和脂肪酸。脂肪酸进一步 主要以碳水化合物在微生物或动植物组织中 酶的作用下，经过产生双糖、单糖、有机酸、 醇、醛等一系列变化，最后分解成二氧化碳 和水
⑤ 水产动物富含不饱和脂肪 酸，易于氧化，生成小分 子的醛、酮、酸类物质， 产生令人难以接受的酸败 味
导致水产品腐败变质的因素
电活性生物膜形成、表征及应用
电活性生物膜：形成、表征及应用*唐家桓1, 2, 3刘毅4周顺桂2袁勇2**1中国科学院广州地球化学研究所 广州 5106402广东省生态环境与土壤研究所 广州 5106503中国科学院大学 北京 1000494湖南农业大学生物科学技术学院 长沙 410128要电活性生物膜（Electrochemically active biofi lms，EABs）是一类能够直接与胞外固态载体（铁氧化物、腐殖质及电极等）进行电子交换的生物膜. EABs的电子传递特性，赋予了它在环境、能源和化工等领域的 广泛应用前景，已成为 当前国际研究热点. 本文以革兰氏染色法为依据，分别介绍了腐败希瓦氏菌（Shewanella putrefaciens）、硫还原地杆菌（Geobacter sulfurreducens）和丁酸梭菌（Clostridium butyricum EG3）为代表的阴性和阳性电活性微生物；在普通生物膜的形成基础 上，讨论了EABs的两种主要培养方法；分别从EABs输出电子与接受电子的角度，详细论述了电活性微 生物与胞外载体的电子传递机制；重点阐述了利 用电化学、光谱学、电子显微镜、分子生态学等多技术手段表征单个电活性微生物和整个EABs的形态、结构，以及所揭示的胞 外电子传递机制和相关影响因子；对EABs在电能输出、污染物治 理、有价品合成等方面应用作了详细介绍. 最后，建议对EABs的研究建立一个统一、标准的表征方法，同时应重点研究EABs接受电子的传递机制. 对这些机理的深入了解，可使得EABs在污染物治理以及有机物的电合成等方面应用早日实现规模化、产业化生产. 图4 表1 参64关键词 电活性生物膜；电活性微生物；胞外电子传递；生物电化学系统；微生物电合成CLC Q939.9 : O646.54Electrochemically active biofi lms: formation, characterization and application* TANG Jiahuan1, 2, 3, LIU Yi4, ZHOU Shungui2 & YUAN Yong2**1Guangzhou Institute of Geochemistry, Chinese Academy of Sciences, Guangzhou 510640, China2Guangdong Institute of Eco-Environmental and Soil Sciences, Guangzhou 510650, China3University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China4College of Bioscience and Biotechnology, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, ChinaM icroorganisms commonly form biofi lms in order to strengthen their functions or survival in harsh environments. Electrochemically active biofi lms (EABs) are special because they can donate electrons to, or accept electrons from, electrodes or natural analogs of electrodes such as Fe(Ⅲ) oxides and humid acids. Numerous promising applications can be developed based on EABs, including bio-remediation of polluted soils or water, electricity generation from waste materials, biosensors to monitor microbial metabolic activities, and biosynthesis of desirable products. This paper is organized as follows. Section 1 describes some Gram negative and Gram positive electroactive microbes，including Shewanella putrefaciens, Geobacter sulfurreducens and Clostridium butyricum EG3. Section 2 presents two principal approaches for EABs cultivation after describing the development of common biofi lms that are not electroactive. Section 3 introduces the major electron-exchange mechanism, including how microorganisms get electrons from electrodes and how electrons from the decomposition of organic materials by mi c roorganisms are conducted to electrode. Section 4 introduces e lectrochemical, spectroscopic, microscopic and molecular ecological techniques used to characterize the morphology and structure of a single microorganism or EABs to reveal the electron transfer mechanisms and infl uencing factors. Applications of EABs, which include energy production, wastewater and soil pollution remediation, and chemicals electrosynthesis, are introduced. Finally, we conclude that a uniform and standard method should be built up, more efforts should be put in revealing the electron-exchange mechanism between the microorganisms and the supporters, especially about how EABs accept electrons from electrodes. More understanding of the收稿日期 Received: 2014-03-17 接受日期 Accepted: 2014-05-26*国家自然科学基金项目（21277035，41222006）、广东省科学院优秀人才基金项目（rcjj201101）和广东省科技攻关项目（2012B030800008）资助 Supported by the National Natural Science Foundation of China (21277035, 41222006), the Guangdong Provincial Key Science Foundation for Outstanding Young Talent (rcjj201101), and the Ministry of Major Science & Technology of Guangdong (2012B030800008) **通讯作者 Corresponding author (E-mail: yuanyong@)109720卷 唐家桓等在自然界中，绝大多数微生物是附着在有生命或无生命物体的表面，以群体即生物膜（Biofilms ）的方式生长，而不是以浮游（Planktonic ）状态生长. 与单细胞浮游态不同，微生物群体在整体上表现出一系列新的生物学特征：（1）更强的外界适应能力；（2）膜内微生物代谢低、存活期长；（3）在载体表面生长可诱导表达与浮游状态不同的基因等. 长期以来，对生物膜的研究要远落后于浮游微生物. 近年来随着生物膜学（Biofilmology ）的兴起，人们逐渐认识到与浮游微生物相比，生物膜有更复杂的结构、更广泛的信息交流及更精密的调控机制，并且更紧密地影响着人类生活. 目前，生物膜学已成为医药、食品、环境等领域的研究热点. 然而直到现在，生物膜还是一个“黑箱”，膜内物质循环、群落结构和功能等有待探索. 2004年，Logan 等发现从废水中富集形成的生物膜吸附在固体电极上的电子传递效率是浮游微生物的数百倍[1]. 这种可直接与胞外固态载体（铁氧化物、腐殖质及电极等）进行电子交换的生物膜，被称为电活性生物膜（Electrochemically active bio films ，EABs ）. 与传统生物膜相比，EABs 的最大特点是生物膜与胞外固态载体（铁氧化物、腐殖质及电极等）存在直接的电子交换过程.EABs 的发现改变了生物膜与接触界面相互作用的传统认识，为深入理解生物膜的结构和功能提供了全新视角. 目前，EABs 的形成及其电子传递机制已成为环境领域关注的热点. 本文从EABs 的形成入手，阐述EABs 胞外电子交换途径、重要电活性微生物种类，总结EABs 的研究方法，并对其应用前景进行详细介绍.1 电活性生物膜的形成1.1 EABs 的形成过程与普通生物膜相比，电活性生物膜（EABs ）既可“输出”微生物氧化有机物过程产生的电子，也可“接受”环境中的胞外电子. 因此，电子交换能力成为EABs 挂膜成与否和电活性高低的重要指标. 目前，培养高效的EABs 主要依赖以下两种装置：（1）生物电化学系统（Bioelectrochemical systems ，BES ），主要是微生物燃料电池（Microbial fuel cell ，MFC ），以及以MFC 为基础经改进或新组装的生物电化学系统，比较典型的有微生物电解池（Microbial electrolysis cell ，MEC ）[3]、微生物脱盐燃料电池（Microbial desalination cell ，MDC ）[4]、微生物太阳能电池（Microbial solar cell ，MSC ）[5] 等；（2）电化学工作站，该方法是利用电化学工作站的工作电极作为微生物的载体，利用恒定电位[6]、电位阶跃技术[7]、恒电流[8]等方法培养EABs.1.2 电活性微生物的种类电活性微生物是EABs 研究的核心要素. 根据电子在电活性微生物与载体间的传递方向，可将EABs 划分为阳极电活性生物膜（输出电子）和阴极电活性生物膜（接受电子）.从Kim 发现和分离Shewanella putrefaciens IR-1至今，研究者已经分离、鉴定出了近50 株电化学活性菌[9]. 对阳极EABs 的研究发现，其微生物种类具有高度的多样性，几乎遍及所有的细菌门，尤以变形杆菌门（Pro teobacteria ）和硬壁菌门（Firmicutes ）最为常见. 其中，地杆菌属的Geobacter sulfurreducens 和希瓦氏菌属的Shewanella oneidensis MR-1是研究得最多的模式菌株，目前已完成全基因组测序. 这些电活性微生物大多为不形成芽孢的革兰氏阴性菌，关于革兰氏阳性菌产出电子的研究较少. 从能量代谢角度分析，革兰氏阳性菌的细胞壁含有大量肽聚糖，其厚度远大于阴性菌，阻隔电子的传导，因而一般认为革兰氏阳性菌的电化学活性不明显. 典型的革兰氏阴性电活性微生物主要有：腐败希瓦氏菌（Shewanella putrefaciens ）[10]、硫还原地杆菌electron-transfer mechanism and its controlling factor, shall further promote the industrial application of EABs.Keywords electrochemically active biofilms; electromicrobiology; extracellular electron transfer; bioelectrochemicalsystems; microbial electrosynthesis1098应用与环境生物学报 Chin J Appl Environ Biol /电活性生物膜：形成、表征及应用 6期盐还原[25]，Geobacter metallireducens 能将硝酸盐还原为亚硝酸盐[26]，Hlamydomonas reinhardtii 能够捕获太阳能，同时在阴极产氧和催化氧气还原[27]，Sporomusa ovata 能还原CO 2成乙酸和丁酸[28].1.3 电活性生物膜电子传递机制1.3.1 阳极EABs 电子传递机制 阳极EABs 电子由微生物传递到最终电子受体主要有以下4种机制（图2）：（1）直接接触机制：利用外膜上的Cyt-c 直接将电子传递至受体. （2）纳米导线机制：利用细胞表面可导电的纤毛或菌毛（微生物纳米导线）将电子传递至受体. （3）电子穿梭体机制：利用外源介体或内生介体（自身分泌的代谢产物）将电子转移至电子受体. 外源介体有硫堇、可溶性醌、Fe(III)-EDTA 、甲基紫精、中性红等. 内生介体包括微生物的初级代谢物（如H 2、H 2S 和氨等）和次级代谢物（如吩嗪类色素和核黄素）. （4）应电运动机制（Electrokinesis ）：微生物将氧化底物产生的电子储存在细胞表面，形成一个带电体，利用鞭毛运动快速撞击受体表面即离开的方式释放电子，然后重新氧化有机物参与下个循环. 上述几种电子传递方式不是孤立存在的. 在电子受体有限的自然环境中，微生物常运用上述4种机制，协同完成胞外电子传递.图2 阳极EABs 电子传递机制[29]. （A ）直接接触；（B ）纳米导线；（C ）电子穿梭；（D ）应电运动.Fig. 2 Schematics of anode EABs electron transfer mechanism [29]. (A) Direct contact through outer-membrane cytochrome; (B) Electron transfer through “nanowires”; (C) via exogenous or endogenous mediators; (D) via electrokinesis.1.3.2 阴极EABs 电子传递机制 关于电子从微生物传递至固态电子受体的机制已经进行了大量研究. 但是，其相反过程，即电子如何从电极等传递至微生物胞内，目前相关研究比较缺乏，主要存在以下几种方式（图3）：（1）直接电子传递. 在MES 系统中，最重要的电子传递方式是直接电子传递. 研究者们从Geobacter metallireducens 催化还原硝酸盐[26]、Sporomusa ovata 还原CO 2成乙酸和丁酸[28]等试验中，证实了电子可以不经过任何介体直接从电极传递至胞内. （2）H 2介导的电子传递. 在MES 系统中，很容易在阴极产生氢气，氢气可以在不影响微生物完整性情况下驱动微生物的代谢[30]. （3）电子穿梭体介导的电子传递. 与阳极电子传递过程相似，电子穿梭体也可以有效地将电子从固体电极传递至微生物胞内. 跟H 2介导的电子传递相比，电子穿梭体往往水溶性比较好，因而可以更加有效传递电子. （4）中间产物介导电子传递. 在以上电子传递基础上，微生物从电极获取了大量电子，合成一定量的甲酸或乙酸，这些小分量有机酸可以被体系中的其他微生物利用，用于产生分子量更大的产物[31].图3 阴极EABs 电子传递机制示意图[32]. （A ）直接接触；（B ）H 2介导的电子传递；（C ）电子穿梭体介导的电子传递；（D ）中间产物介导电子传递.F ig. 3 Mechan i sms for elec t ron t ransfer from elec t rode s to microorganisms [32]. (A) Direct contact; (B) H 2 as electron shuttle; (C) common electron shuttle; (D) middle products as electron shuttle.2 电活性生物膜的表征生物膜是个复杂的结构，其模型主要有以下几种：（1）平面二维同质结构, 并具有相对恒定的厚度；（2）“异质镶嵌”结构，众多微生物借助胞外聚合物的作用聚集形成许多小的叠状体，叠状体再进一步地联结形成宏观可见的柱状物；（3）“蘑菇或郁金香”结构，由类似蘑菇或郁金香形状的微菌落组成，膜底比膜顶窄，外形类似蘑菇或郁金香的结构. 生物膜结构与其功能密切相关，因而生物膜结构表征，有利于对生物膜功能的深入理解. 对EABs 结构的表征可从4个层面进行：（1）整个生物膜，（2）处于生物膜中的单个细胞，（3）分离的独立单个细胞，（4）细胞膜蛋白以及基因等[33]. 其表征技术多种多样，比较常用的EABs 表征技术见表1.全面了解EABs 的结构、特性、功能须结合电化学、光谱学、显微镜、分子生态学等多种表征技术. 其中电化学方法是研究EABs 电活性最直接、有效的方法，以伏安法、电化学阻抗谱、塔菲尔曲线等较为常见. 电化学方法（如伏安法）能表征EABs 中参与电子转移过程的关键电活性组分性质（氧化还原性质、电子转移可逆性等）. 光谱电化学是基于电化学技术改进的方法，它能对生物膜进行活体、原位检测，已成为近年来得到极大发展的EABs 表征技术. 其中，紫外/可见光谱是最简便的一种. 在微观技术方面，扫描电镜和激光共聚焦荧光显微镜是目前常用的直接观察分析生物膜结构的技术. 通过扫描电镜可对细菌形貌和结构、生物膜厚度、有无纳米导线等更加清晰的了解. 激光共聚焦荧光显微镜可在微观尺度实现对生物膜中有机物和微生物种类的组成及其空间分布进行原位、非破坏性表征. 在分子层面上，DNA/RNA 、功能基因和蛋白质组学等比较常用的分子生物技术是研究微生物种类、群落结构、电子传递途径分子机制的重要工具.3 电活性生物膜的应用一直以来，对EABs 的研究大多数是采用MFC 装置，涉及产电和污水处理等方面. 近几年来，EABs 的更多应用逐渐被人们发现，比如物质电合成、贵金属还原、CO 2还原等（图4）. 3.1 阳极生物膜的应用（1）污水处理：从简单的小分子有机酸到复杂的木质109920卷 唐家桓等/ Chin J Appl Environ Biol 应用与环境生物学报表1 电活性生物膜的常用表征技术Table 1 Common analysis methods for electrochemically active bio films1100应用与环境生物学报 Chin J Appl Environ Biol /电活性生物膜：形成、表征及应用 6期图4 电活性生物膜的应用示意图.Fig. 4 Schematic representation of applications of EABs.续表1 Table 1 (Continued)纤维素都可作为被EABs 利用，因此，EABs 可处理各种类型的废水，从低浓度的生活污水到高浓度养殖废水[46-47]、皮革废水[48]、难生物降解的污水[49]等. （2）电源供应：EABs 的最基本特征是产生电能，虽然目前的产电规模还未能达到商业利用，但是用于传感器等耗电较低的仪器当做电源还是足够的. 特别是为偏远地区和极端环境下的远程环境监测提供了电源[50-51]. （3）传感器应用：根据EABs 与溶液中物质的种类、浓度、有毒离子等的关系，可用作底物含量的测定、制作各种生物传感器，如BOD 传感器、毒性传感器等[52-53]. （4）土壤原位修复：生物修复通过活性微生物将有害物质分解、脱毒，采用这种简单易行、环境友好和低成本的方法替代物理化学治理已经得到普遍认可. 研究表明G. sulfurreducens 能利用电极作为电子供体将U(Ⅵ)还原为U(Ⅳ)，生成不溶性沥青铀矿，然后将电极从受污染的地区拔出，从而实现铀沉积物的回收，使得污染土壤得到修复[54].3.2 阴极生物膜的应用（1）难降解污染物处理：在体系中存在Fe 2+的情况下，利用氧气作为阴极EABs 的电子受体，可构造生物电 Fenton 体系，从而可对RhB 等物质进行脱色处理[55]. 近年来，发现EABs 生物膜可以通过电子穿梭机制直接或间接接受电子，从110120卷 唐家桓等/ Chin J Appl Environ Biol 应用与环境生物学报而还原难降解有机物，如高氯酸[56]和氯取代基有机物[57]等，这为土壤污染治理和原位生物修复提供了一条新途径. （2）绿色能源生产：在外加电源的作用下，阳极EAs 微生物氧化有机物，输出的电子经外电路到达阴极，产生的质子通过质子膜扩散到阴极，两者在阴极产生氢气[58]. 与传统制氢技术相比，EABs 制氢具有：基质利用率高、纯度高等优势[59]. （3）贵金属还原：EABs 还原贵金属是一种低成本、环境友好、快速可控方法. 利用Cu 2+、Au +、Pd 2+接受EABs 氧化有机物释放的电子，实现金属离子的还原回收[60-62]. EABs 介导合成的金属和金属-半导体纳米复合材料有望为纳米材料合成提供一种新途径. （4）有机品电合成：“微生物电合成（Microbial electrosynthesis ）”这一概念最早由Lovley 研究组于2010提出. 研究发现，电活性微生物可以接受电极的电子，将CO 2还原为乙酸以及少量的2-羰基丁酸[28]. 另外，通过EABs 系统富集产甲烷古菌，也可以而将CO 2转化为甲烷[63]. 在自然条件下，产乙酸菌通过Wood-Ljungdahl 路径利用H 2作为电子受体将CO 2还原成乙酸[64]. 这些发现为解决能源危机提供新思路. 它不但提供一种捕获温室气体CO 2的新方法，也提供一种将CO 2转化为能源的新途径.4 研究展望目前，对于EABs 的了解极其有限，并且缺乏一个统一的、标准的表征方法. 对它的组成、电子传递机制和功能的认识还有很多疑问，特别是阴极EABs 的种类、电子传递机制等还处于起步阶段. 因此，需结合电化学、微电极、蛋白组学等技术对其电子传递途径进行进一步的探索. 在应用方面，虽然已经证实EABs 有广泛的应用，而且有一些已经用于实际生活，比如，利用EABs 的产电能力为海上分析检测设备、气象学浮标提供电源. 但是，要将这些应用规模化、产业化，要使得EABs 生物传感器适应实际污水，并且稳定运行，要使得EABs 真正原位修复污染土壤，还面临极大的挑战. 因此这些问题的解决将是今后研究的主题之一. 另一方面，阴极EABs 可还原贵金属、电合成有价品等应用的发现，给我们的研究工作带来极大的鼓舞，特别是利用EABs 还原CO 2制甲烷，不但提供了一种捕获温室气体CO 2的新方法，也提供了一种将CO 2转化为能源的新途径. 这个发现将给人类的生存、生产带来重要的影响，未来有望缓解全球范围内日益严峻的能源问题. 由于这些探索还处于起步阶段，如何降低能耗并提高产甲烷效率、提高EABs 制氢系统的稳定性等，尚有待深入研究.参考文献 [References]1 Liu H, Ramnarayanan R, Logan BE. Production of electricity duringwastewater treatment using a single chamber microbial fuel cell [J]. 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Environ Microbiol Re p , 2010, 2 (2): 289-29458Wang A, Sun D, Cao G, Wang H, Ren N, Wu W-M, Logan BE. Integrated hydrogen production process from cellulose by combining dark fermentation, microbial fuel cells, and a microbial electrolysis cell [J]. Bioresour Technol , 2011, 102 ( 5): 4137-414359 Cheng S, Logan BE. Sustainable and ef fi cient biohydrogen productionvia electrohydrogenesis [J]. Proc Natl Acad Sci USA , 2007, 104 (47): 18871-1887360 Bunge M, Søbjerg LS. Formation of palladium (0) nanoparticles atmicrobial surfaces [J]. Biotechnol Bioeng , 2010, 107 (2): 206-21561 Khan MM, Lee J, Cho MH. Electrochemically active bio fi lm mediatedbio-hydrogen production catalyzed by positively charged gold nanoparticles [J]. Int J Hydrogen Energy , 2013, 38 (13): 5243-525062 Tao HC, Z hang LJ, Gao ZY, Wu WM. Copper reduction in a pilot-scalemembrane-free bioelectrochemical reactor [J]. Bioresour Technol , 2011, 102 (22): 10334-1033963 Jiang Y, Su M, Z hang Y, Zhan G, Tao Y, Li D. 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希瓦氏菌Shewanella algae CCU101高效降解甲基橙
希瓦氏菌Shewanella algae CCU101高效降解甲基橙张书頔;欧阳雨农;程园园【期刊名称】《高校化学工程学报》【年(卷),期】2022(36)2【摘要】为了评估Shewanella algae CCU101降解甲基橙的性能,研究甲基橙初始质量浓度、乳酸钠浓度、菌液吸光度和金属离子浓度4种因素对S.algae CCU101降解甲基橙能力的影响。
结果表明,S.algae CCU101降解甲基橙呈一级反应,最大降解速率常数为1.0122 h^(−1)。
在甲基橙初始质量浓度为300mg×L^(−1)时,S.algae CCU101降解甲基橙的速度比Shewanella oneidensis MR^(−1)高2.13倍。
推测S.algae CCU101高效降解甲基橙的能力源于S.algae CCU101具有高生长速率及高团聚成膜能力。
由于S.algae CCU101与模式菌株S.oneidensis MR^(−1)相比,具有更高的甲基橙降解速率,可作为染料降解的潜在工程菌株。
【总页数】6页(P287-292)【作者】张书頔;欧阳雨农;程园园【作者单位】安徽大学生命科学学院;安徽大学文典学院【正文语种】中文【中图分类】Q81【相关文献】1.一个降解染料的希瓦氏菌新种--中国希瓦氏菌2.一株腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)培养基优化3.深海嗜冷希瓦氏菌Shewanella psychrophila WP2的基因组学分析4.深海嗜冷希瓦氏菌Shewanella psychrophila WP2的基因组学分析5.纳米四氧化三铁强化海藻酸钠包埋希瓦氏菌MR-1的甲基橙脱色性能因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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毕业论⽂⽬录摘要 (1)Abstract (2)第⼀章绪论 (3)1.1研究背景 (3)1.2国内外研究现状及研究意义 (3)1.3 研究内容 (5)第⼆章Shewanella puterfaciens CN32及测试指标标线 (5) 2.1 CN32菌准备 (5)2.1.1 收菌⽅法 (5)2.1.2测收菌后OD值 (6)2.1.3接菌 (6)2.2铁标线 (6)2.3菌体⽣长标准曲线 (7)2.4 SMP蛋⽩标准曲线 (8)第三章不同铁源及电材料对Fe(III)的还原效果的影响 (9) 3.1引⾔ (9)3.2材料与⽅法 (10)3.2.1 培养基准备 (10)3.2.2 实验材料 (11)3.2.3仪器 (12)3.3 实验设计 (12)3.3.1 数据处理 (13)3.3.2 测定周期 (13)3.4实验分析⽅法 (13)3.4.1分析指标 (13)3.4.2 Fe(II)浓度 (13)3.4.3黄素 (14)3.5 结果与讨论 (14)3.5.1 针铁矿及电材料对Fe(III)的还原效果的影响 (14)3.5.1.1 溶解态Fe(II) (14)3.5.2 NTA-Fe及电材料对Fe(III)的还原效果的影响 (19) 3.5.2.1 溶解态Fe(II) (19)3.6 本章⼩结 (24)第四章不同条件下细菌分泌蛋⽩的差异 (26)4.1引⾔ (26)4.2材料与⽅法 (26)4.2.1 培养基准备 (26)4.2.2 实验材料 (27)4.2.3仪器 (27)4.3 实验设计 (28)4.3.1 数据处理 (29)4.3.2 测定周期 (29)4.4 实验分析 (29)4.4.1分析指标 (29)4.4.2菌体⽣长情况 (29)4.4.3分泌蛋⽩浓度 (30)4.5结果与讨论 (30)4.5.1 菌体⽣长 (30)4.5.2 细菌分泌蛋⽩ (32)第五章结论与展望 (34)5.1结论 (34)5.2展望 (34)第六章致谢 (35)不同铁源及导电材料的添加对Shewanllaputerfaciens CN32铁还原过程的影响摘要：异化铁还原菌还原Fe(III)是铁循环及能量流动的重要环节，在微⽣物的氧化还原反应中，铁氧化物充当电⼦载体，能够有效的加快微⽣物对有机物的降解。
冷却猪肉中特定腐败菌的靶向筛选_赵丽珺_谢晶_乔丽君-网络优先出版
网络出版时间：2013-10-28 16:18网络出版地址：/kcms/detail/11.2206.TS.20131028.1618.018.html2013-10-24冷却猪肉中特定腐败菌的靶向筛选赵丽珺，谢晶*，乔丽君（上海海洋大学食品学院，上海，201306）摘要：食品腐败与群体感应（quorum sensing，QS）密切相关，抑制群体感应已经成为食品保鲜的新靶点。
根据有氧包装冷却猪肉中特定腐败菌的种类特点和致腐特性，以假单胞菌（Pseudomonas sp.）和肠杆菌科菌（Enterobacteriaceae）为目标菌建立筛选模型，同时结合简单的生理生化鉴定确保筛选方向。
以托盘包装冷却猪肉贮藏末期腐败菌为菌源，用铬天青（Chromeazurol S，CAS）嗜铁素检测平板法，从假单胞菌CFC选择性培养基上分离的116株菌中筛选到86株产嗜铁素的腐败菌；用氨基酸脱羧酶检测管从双层VRBDA平板上分离的66株菌中筛选到21株产氨基酸脱羧酶腐败菌。
采用根癌农杆菌（Agrobacterium tumefaciens）为报告菌再从上述腐败菌中筛选出产N-酰基高丝氨酸内酯（N-acyl homoserine lactones，N-AHLs）的菌株（产嗜铁素的51株，产氨基酸脱羧酶的19株）。
根据实验需要，选取其中部分菌进行16SrDNA鉴定，最后得到产嗜铁素和AHLs的假单胞菌7株，产氨基酸脱羧酶和AHLs的肠杆菌科菌4株，为靶向抑菌防腐提供了研究基础。
关键词：冷却猪肉；假单胞菌；肠杆菌科菌；N-酰基高丝氨酸内酯；嗜铁素；氨基酸脱羧酶Targeted screen specific spoilage organisms in chilled porkZHAO Li-jun，XIE Jing*，QIAO Li-jun（College of Food Science and Technology, Shanghai Ocean University, Shanghai, 201306, China）Abstract：Many evidence showed that quorum sensing(QS)was involved in food spoilage. Inhibition of QS became a newtargeted preservation procedure. Set up the screening model based on the spoilage potential and the characteristic of specificspoilage organisms in chilled pork. Several biochemical and physiological tests were applied to exclude undesired strains.Eighty six strains with siderophere production capability were isolated from 116 strains picked up from Pseudomonas CFCmediun with CAS agar assay. Twenty one starins with decarboxylase production capability were isolated from 66 strainspicked up from double-layer VRBDA plate with decarboxylase-detected vial assay. Furthermore, the AHLs productioncapability of these isolates(86 siderohere+ and 21 decarboxylase+) was evaluated with a biosensor strain (Agrobacteriumtumefaciens). It was found that 51 siderosphere+ strains and 19 decarboxylase+ strains can produce AHLs. Identification of 11isolates base on 16SrDNA was done. Seven strains of Pseudomonas sp. with siderophere and AHLs production capability,four stains of Enterobacteriaceae with decarboxylase and AHLs production capability were isolated from chilled pork withtray package. Those strains would be useful in the further study for targeted preservation.Key words：chilled pork; Pseudomonas; Enterobacteriaceae; N-acyl homoserine lactones; siderophere; decarboxylase中图分类号：TS2 献标识码：A 文章编号：冷却肉逐渐成为我国居民肉品消费主流，但是货架期短始终制约着冷却肉的发展。
大黄鱼冷藏过程中的鲜度变化
中国水产科学Journal of Fishery Sciences of China第16卷第3期2009年5月Vol.16 No.3M a y 2009收稿日期：2008-10-15； 修订日期：2009-01-15.基金项目：国家自然科学基金资助项目（30771675）；科技部农业科技成果转化基金资助项目（2007GB23260281）；中央级公益性科研院所基本科研业务费专项基金（中国水产科学研究院东海水产研究所）资助项目（2007M05）.作者简介：李学英（1983- ），女，硕士研究生，从事食品微生物安全的研究.通讯作者：杨宪时. Tel： 021- 65678984；E -mail： xianshiyang@大黄鱼冷藏过程中的鲜度变化李学英1，2，许钟1，郭全友1，杨宪时1（1.中国水产科学研究院 东海水产研究所，上海 200090； 2.上海海洋大学 食品学院，上海 200090）摘要：研究了大黄鱼（Pseudosciaena crocea ）贮藏于0 ℃（冰藏）、3 ℃、7 ℃和10 ℃过程中，在感官、化学和微生物品质方面的变化特性，并对其货架期进行分析，探讨了菌落总数、嗜冷菌、假单胞菌、产H 2S菌、TVBN和TMA与感官评价的一致程度。
结果表明，大黄鱼是海水鱼中鲜度下降较慢的种类，在0 ℃、3 ℃、7 ℃、10 ℃的贮藏过程中，大黄鱼的高品质期分别为330 h、208 h、114 h和87 h，货架期分别为523 h、368 h、197 h和150 h。
各温度高品质期终点和货架期终点时菌落总数（CFU ）/g的对数平均值分别为6.10±0.30和6.67±0.35，产H 2S菌数（CFU/g ）的对数平均值分别为5.82±0.33和6.37±0.22，TVBN均值分别为（14.77±0.5）mg/（100 g ） 和（28.02±1.19）mg/（100 g ）；TMA均值分别为 （2.55±0.62）mg/（100 g ）和（9.84±1.28）mg/（100 g ），各温度下高品质期终点和货架期终点时各指标均值均无显著差异（P ＞0.05），表明菌落总数、产H 2S菌数和TVBN值作为大黄鱼低温贮藏的鲜度指标与感官鲜度评价有较好的一致性。
API及API各试剂条鉴定细菌目录
细菌鉴定国际金标准 - API
无需专用仪器，标准化手工方法完成细菌的生化鉴定，为低成本替代传统手工细菌生化鉴定的最佳产品。
产品特点：
1、完整的鉴定谱：15种试条，可鉴定的细菌多于550种。
2、简单方便：标准化方法。
3、快速结果：4-24小时。
4、成本低廉。
5、判读结果简单。
以下为API系列中应用比较广的几个产品：
API 20E 肠道菌鉴定试剂条－24小时内鉴定革兰氏阴性杆菌
1、覆盖临床常见的几乎所有细菌
2、可作为其他鉴定系统的参考标准（文献超过600篇）
3、快速，操作简便：只需一个菌落配成菌悬液，加入试剂条指定位置的小杯中，孵育后观察颜色的变化，软件辅助解释鉴定结果。
4、有效期较长
阴性结果
阳性结果
API 20 NE 非肠道菌鉴定－24-28小时内鉴定非肠道革兰氏阴性杆菌
1、本系列适合日益增加的引起院内感染的细菌的鉴定（由于这些细菌对抗生素越来越耐药，必须准确鉴定）
2、标准的生化试验与同化实验相结合，完全适合这类细菌的非发酵代谢特点：这两种实验是这些细菌的检测标准。
3、配置标准浓度的菌悬液及标准化的操作方法（0.5个麦氏单位）保证了结果的可靠性，避免了混合培养和传代。
阴性结果
阳性结果
API微生物系统能鉴定的细菌目录
1999.01.。
预制调理食品中的常见微生物及其防控
预制调理食品中的常见微生物及其防控随着我国工业化、农业现代化、信息化、城镇化和绿色化“五化”同步进程的快速推进，以及全球化深入发展和公众生活节奏的不断加快，国民对饮食的需求已开始发生深刻的变化，正孕育着重大的“饮食方式的变革”。
开袋即食的传统风味食品和预制调理食品、微波即食食品（成品化中式菜肴）、冷冻主副食品（传统米面制品和即制菜肴）与洁净蔬菜、脱水蔬菜（即食汤）、保鲜净菜、工业化营养配餐等方便快捷的预制调理食品快速发展。
预计2015年，我国上述方便食品总产值达到5000亿元，年均增速超过30%［1］。
现代食品的成品化、便捷化、营养化、工业化、信息化和社区网络配送已成为全球食品产业发展的新趋势和热点，并在我国悄然推动着一场“家庭厨房革命”和餐饮制作模式的“变革”，预制调理食品成为食品产业快速增长的热点。
然而，影响预制调理制品产品品质的因素非常多，原料来源、加工方法、工厂卫生条件、包装方式、贮存环境等都会影响其质量安全。
特别是由于杀菌不彻底，冷链系统不完备等，部分不经过高温程序或需要低温贮藏的预制调理食品就容易被微生物污染，食用后易造成食源性疾病的流行。
2007年，我国多个品牌速冻水饺接连被检出存在金黄色葡萄球菌污染，造成公众极大的恐慌，厂家立即召回问题水饺；美国疾病控防中心数据显示，2007年11月，由于怀疑被大肠杆菌O157∶H7污染，美国召回500万份冷冻披萨饼，该事件造成美国10个州21人患病；2014年6月，北京市食品药品监督管理局通报，在某公司生产的速冻牛排中检出沙门氏菌，该批次产品被紧急召回并销毁。
预制调理食品安全事件层出不穷，对预制调理食品中病原微生物进行检测、溯源和防控显得尤为重要。
1 预制调理食品的概况预制调理食品一般是指以农、畜、禽、水产品为原料，经适当加工（分切、搅拌、成型、调理等），以包装或散装形式于冷冻、冷藏或常温的条件下储存、流通和售卖，可直接食用或食用前经简单加工（微波加热、简单蒸煮等）的产品［2］。
复合生物保鲜剂对腐败希瓦氏菌的抑菌机理
复合生物保鲜剂对腐败希瓦氏菌的抑菌机理蓝蔚青;谢晶;侯伟峰;汪聪【摘要】To study the antibacterial effect of composite biological preservative against predominant spoilage bacterium ( Shewanella putrefaciens) on refrigerated Trichiurus haumela, minimal inhibitory concentration ( MIC) and minimial bactericidal concentration (MBC) of composite biological preservative against Shewanella putrefaciens were determined by oxford plate assay, and the antibacterial kinetics, the growth curve, the cell membrane integrity, the stability of cell and ultra microstructure of Shewanella putrefaciens treated with composite biological preservative were studied. The MIC and MBC of composite biological preservative against Shewanella putrefaciens were 1. 6 mg/ml and 3. 3 mg/ml. With the extension of treating time, the effect of different concentrations of composite biological preservative against Shewanella putrefaciens were getting significant. After treated with two times-MBC composite biological preservative, the bacteria did not have the logarithm growth period, its absorbance value at 260 nm was greater than that of contrail, and the integrity of cell membranewas destroyed. Meanwhile, the content of alkaline phosphatase ( AKP) of bacteria cells were increased, the membrane permeability was amplified, the electrical conductivity was increased and the cell membrane stability of Shewanella putrefaciens undermined. The ultra microstruc-tural observation showed that bacteria treated with composite biological preservative appeared to shrink anddistort, with cell surface rough and covered with bubbles, and cell walls collapsing and so on. In conclusion, composite biological preservative could destroy the stability of bacteria intracellu-lar environment and cell membrane, and inhibit the growth of bacteria. It could influence the absorption of nutrients and excretion of metabolites, leading to the deathof the cell.%为了研究复合生物保鲜剂对冷藏带鱼优势腐败菌(腐败希瓦氏菌)的抑菌作用机理,通过牛津杯法测定了复合生物保鲜剂对腐败希瓦氏菌的最小抑菌浓度(MIC)和最小杀菌浓度(MBC),并测定了复合生物保鲜剂对腐败希瓦氏菌的抑菌活力、细菌生长曲线、细胞膜完整性和细胞的稳定性,对细菌超微结构进行了观察.结果显示:复合生物保鲜剂对腐败希瓦氏菌的MIC与MBC分别为1.6mg/ml与3.3mg/ml,且随着作用时间的延长,复合生物保鲜剂对腐败希瓦氏菌的生长有明显抑制作用；尤其经2倍最小杀菌浓度的复合生物保鲜剂处理后,细菌未出现对数生长期；菌液在260 nm处的吸光值明显升高,菌体细胞膜完整性受到破坏；菌体细胞中的碱性磷酸酶升高,菌体细胞壁通透性增大；菌悬液的电导率值明显增大,细胞膜稳定性受损.细菌超微结构观察发现,复合生物保鲜剂作用于菌体细胞后,菌体细胞开始出现皱缩、扭曲变形、表面粗糙和布满泡状物及细胞壁塌陷等现象.表明复合生物保鲜剂可以破坏细菌的细胞内环境和细胞膜稳定性,影响了细菌的正常生长；并且通过影响细菌对营养物质的吸收和代谢物的排出,最终导致菌体死亡.【期刊名称】《江苏农业学报》【年(卷),期】2012(028)001【总页数】7页(P186-192)【关键词】复合保鲜剂;抑菌机理;壳聚糖;溶菌酶;茶多酚;腐败希瓦氏菌【作者】蓝蔚青;谢晶;侯伟峰;汪聪【作者单位】上海海洋大学食品学院,上海201306;上海海洋大学食品学院,上海201306;上海海洋大学食品学院,上海201306;上海海洋大学食品学院,上海201306【正文语种】中文【中图分类】Q93-33随着保鲜技术水平的提高，生物保鲜剂在水产品保鲜中的应用越来越广泛，而且保鲜效果显著。
海水希瓦氏菌(Shewanella aquimarina)PCR检测方法
中 图分 类 号 ： ￥ ９ １ ７ ． ３
文献标识码 ： Ａ
文章编号 ： １ ０ ０ ８ － ０ ８ ６ ４ （ ２ ０ １ ３ ） ０ ２ ０１ － ６ ８ － ０ ５
ＰＣＲ Ｄｅ ｔ ｅ ｃ ｔ ｉ ｏ ｎ Ｍｅ ｔ ｈｏ ｄ ｏ ｆ Ｓｈ ｅ ｗａ ｎｅ ｌ ｌ ａ ａ ｑ ｕｉ ｍａ ｒ ｉ ｎ ａ
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（ Ｋｅ ｙ Ｌａ ｂ ｏ ｒ ａ ｔ ｏ ｒ ｙ ｏ ｆ Ｍａ ｒ ｉ ｃ ｕ ｈｕ ｒ ｅ＆ Ｓ ｔ ｏ ｃ ｋ Ｅｎ ｈ ａ ｎ ｃ ｅ ｍｅ ｎ ｔ ｉ ｎ Ｎｏ Ａ ｈ Ｃｈ ｉ ｎ ａ ’ ｓ Ｓ ｅ ａ，Ｍｉ ｎ ｉ ｓ ｔ ｙ ｒ ｏ ｆ Ａｇ ｒ ｉ ｃ ｕ ｌ ｔ ｕ ｒ ｅ，
度高 。另外 以该方法对海胆及其生境样 品进行初步检测 ， 发 现健 康海胆 、 养殖海水及投 喂海 带为 阴性 ， 而 自然
海域 的海 水具 有一定量 的海水希瓦氏菌。 关键词 ： 海水希瓦 氏菌 ； ｇ ｙ ｒ Ｂ基因 ； Ｐ Ｃ Ｒ； 特异性 ； 灵敏度
ｄ ｏ ｉ ： １ ０ ． ３ ９ ６ ９ ／ ｊ ． ｉ ｓ ｓ ｎ ． １ ０ ０ ８ － ０ ８ ６ ４ ． ２ ０ １ ３ ． ０ ２ ． ２ ６
速检测方法 ， 根据海水 希瓦氏菌 ｇ ｙ ｒ Ｂ基 因的高变 区序列设 计 ３对引物 ， 随后 进行 了其特异 性和灵 敏度分 析。 结果 显示 引物 Ｓ Ａ － ９可扩 增 出片段大 小为 ８ １ ５ ｂ ｐ的海 水希 瓦 氏菌特异 片段 。引物 可检测 的最低 细菌 量为
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Water Pollution and Treatment 水污染及处理, 2018, 6(2), 103-109Published Online April 2018 in Hans. /journal/wpthttps:///10.12677/wpt.2018.62013Medium (CM0847) Optimization ofShewanella putrefaciensJuan Cheng, Lei Wang, Yuwei Tao, Wenjuan Yuan, Jian Zhao, Su Feng*Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences,Sichuan University, Chengdu SichuanReceived: Mar. 22nd, 2018; accepted: Apr. 10th, 2018; published: Apr. 18th, 2018AbstractAim: The culture medium of Shewanella putrefaciens was optimized and its growth was promoted.Methods: Single factor and orthogonal design experiment were conducted to determine the op-timal medium of Shewanella putrefaciens by measured cell density (under 600 nm) and cell weight.Results: Compared with medium CM0847, when the initial pH was 7.5, the glucose, beef extract and sodium chloride added at 10%, 30% and 30%, respectively, the cell density and cell weight were the highest. Conclusion: Cultivated Shewanella putrefaciens in the optimum medium and CM0847 culture medium, the cells weight was improved by 11.1168 g/L.KeywordsShewanella putrefaciens, Optimization, Medium, Orthogonal一株腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)培养基优化成娟，王磊，陶榆伟，袁文娟，赵建，冯甦*四川大学生命科学学院资源微生物及生物技术重点实验室，四川成都收稿日期：2018年3月22日；录用日期：2018年4月10日；发布日期：2018年4月18日*通讯作者。
成娟 等摘要目的：对发酵培养基(CM0847)进行优化促进腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens )生长。
方法：通过测定菌体在600 nm 处的吸光值和菌体干重，采用单因子试验结合正交试验对培养基(CM0847)进行优化。
结果：当pH 为7.5，在原培养基的基础上葡萄糖、牛肉膏、氯化钠分别以10%、30%及30%的添加量，菌体密度及菌体干重最高。
结论：腐败希瓦氏菌在优化后的培养基中培养，其菌体干重较原培养基(CM0847)增加了11.1168 g/L 。
关键词Shewanella putrefaciens ，优化，培养基，正交Copyright © 2018 by authors and Hans Publishers Inc.This work is licensed under the Creative Commons Attribution International License (CC BY). /licenses/by/4.0/1. 引言在21世纪这个科技发展迅速的时代，居民生活和工业发展都会造成一定的环境污染，其中包括一些生产生活中带来的水质金属污染，特别是重金属污染。
这些广泛存在的重金属污染物可通过皮肤、呼吸、消化道等多种途径进入人体，从而严重威胁人类健康和生态环境。
目前，重金属污染的污水治理困难，且需要的费用普遍偏高，生物方法因其经济、安全、有效，是一种效率极高的治理办法[1] [2]，由微生物菌体所分泌的胞外聚合物(Extracellular polymeric substance, EPS)因具有生物活性、结构疏松等特点，能够与环境中的重金属结合，有效去除水体及土壤环境中的重金属，减轻环境污染，从而间接降低重金属对人体的危害。
希瓦氏菌属(Shewanella sp)属于弧菌科(Vibrionaceae)，由MacDonell 和Colwell 于1985年正式命名。
腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens )作为希瓦氏菌属的模式菌种于1931年由Derby 和Hammer 首次分离得到，属于革兰氏阴性杆菌，呈弯曲的短杆状，菌落酪黄色、较小，边缘规整，略凸起，是一种好氧细菌[3] [4]。
菌体对于重金属污染的生物治理主要通过吸附、还原等机制[5] [6]，由希瓦氏菌生物合成的一种纳米材料可以催化罗丹明的降解[7]，EPS 具有还原污水中重金属离子的能力，在自然界EPS 对重金属具有良好的富集作用[8]，因此运用EPS 处理重金属污染是一个更加新颖的生物治理方案，本文属首次对腐败希瓦氏菌发酵培养基(成分：胰蛋白胨15.0 g ，大豆蛋白胨5.0 g ，氯化钠5.0 g ，蒸馏水1.0 L ，pH 7.3 ± 0.2， 35℃，转速150 rpm/min)进行优化，主要通过添加不同浓度梯度的营养物质至培养基CM0847中来考察碳源、氮源、无机盐对腐败希瓦氏菌生长的影响，以期为腐败希瓦氏菌的发酵培养和EPS 的生产奠定基础。
2. 材料与方法在腐败希瓦氏菌培养过程中，培养方法及装置设备流程图如图1所示。
2.1. 材料2.1.1. 供试菌种腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens )，购买于中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)，菌种编号：成娟 等Figure 1. Cultivating flowchart of Shewanella putrefaciens 图1. 腐败希瓦氏菌培养流程图CICC 22940。
2.1.2. 仪器台式回旋恒温振荡器(DDHZ-300，苏州市培英实验设备有限公司)；高速冷冻离心机(Thermo 赛默飞世尔，Biofuge Primo R)；岛津UV-2450紫外分光光度计；石英比色皿等。
2.1.3. 试剂胰蛋白胨、大豆蛋白胨(北京奥博星生物技术有限公司)、葡萄糖、半乳糖、鼠李糖、乳糖、麦芽糖、D-山梨醇、酵母提取物、牛肉膏、硫氨酸、尿素、醋酸铵、七水合硫酸、磷酸二氢钾、磷酸氢二钾、氯化钠、氯化钾、氯化钙、盐酸、氢氧化钠、无水乙醇，以上试剂均为化学分析纯。
2.1.4. 培养基以CM0847培养基为基础发酵培养基。
成分：胰蛋白胨15.0 g ，大豆蛋白胨5.0 g ，氯化钠5.0 g ，琼脂13.0 g ，蒸馏水1.0 L ，pH 7.3 ± 0.2。
2.2. 方法2.2.1. 腐败希瓦氏菌的活化取−20℃甘油保存菌种接种到CM0847液体培养基上，按预实验条件(温度为35℃，摇床转速150 r/min ，接种量4%)培养45 h 后连续转接2次，所得活化菌种作为实验用菌种。
菌种经鉴定确定为腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens )。
2.2.2. 腐败希瓦氏菌生长最适pH 值的确定以CM0847培养基为空白对照，配制pH 值分别为6.5、7.0、7.5、8.0、8.5的CM0847液体培养基，按预实验条件培养后测定菌体密度，每组设置3个平行。
2.2.3. 培养基组分的优化以CM0847培养基为空白对照，分别以10% (w/v)的含量替代CM0847培养基中的碳源、氮源、无机盐。
碳源：葡萄糖、乳糖、半乳糖、麦芽糖、鼠李糖、D-山梨醇。
氮源：酵母提取物、牛肉膏、硫氨酸、尿素、醋酸铵。
无机盐：七水合硫酸、氯化钾、磷酸氢二钾、氯化钙、磷酸二氢钾。
按预实验条件培养后测定菌体密度，每组设置3个平行。
2.2.4. 培养基各组分浓度梯度的筛选以CM0847培养基为空白对照，用筛选出来的最优碳源、氮源、无机盐分别以10%、20%、30%、40%、50%的浓度梯度添加至CM0847培养基中。
按预实验条件培养后测定菌体密度，每组设置3个平行。
培养基配置培养基分装及接种菌体35℃，150 rpm/min 摇床培养600 nm 处菌体密度测定成娟等2.2.5. 发酵培养基的正交优化以筛选出的三个最优浓度梯度替代CM0847培养基中的碳源、氮源、无机盐，确定正交试验时的浓度。
设置3因素3水平L9 (33)正交实验，按预实验条件培养后测定菌体密度(OD600)和菌体干重[9]研究腐败希瓦氏菌的最适生长条件[10]，每组设置3个平行。
3. 结果与分析3.1. 培养基pH值对腐败希瓦氏菌生长的影响由图2可看出，随着pH的升高菌体密度呈现先升高后降低的趋势，在pH值为7.5时最高。
说明腐败希瓦氏菌适宜在弱碱性条件下生长，而不适宜在过酸或过碱性的环境中生长。
因此在后期实验中，在pH值为7.5的条件下培养腐败希瓦氏菌。
3.2. 不同种类的碳源对腐败希瓦氏菌生长的影响如图3，与对照组相比L-鼠李糖组的菌体密度显著降低，而麦芽糖、D-山梨醇、D-乳糖组与对照组相比菌体密度差异不大，葡萄糖、D-半乳糖组与对照组相比菌体密度显著提高，且葡萄糖组菌体密度最高，说明葡萄糖最有利于腐败希瓦氏菌的生长。
在日常生活中，由于葡萄糖应用广泛，且经济易得，所以后期实验选定葡萄糖作为碳源添加物。
3.3. 不同种类的氮源对腐败希瓦氏菌生长的影响由图4可知，与对照组相比牛肉膏、醋酸铵、硫氨酸对菌体密度的提高显著，牛肉膏组菌体密度相对于其他组最高，因此后期正交实验选用牛肉膏作为氮源添加物。
酵母提取物、尿素组与对照组相比在菌体密度上差异不明显，其中尿素组菌体密度低于对照组说明腐败希瓦氏菌不适宜在此环境中生长。
3.4. 不同无机盐对腐败希瓦氏菌生长的影响最优无机盐筛选结果由图5可知，七水合硫酸、氯化钾、磷酸氢二钾、氯化钙、磷酸二氢钾组菌体密度均低于对照组，其中磷酸二氢钾组的菌体密度显著低于对照组，说明腐败希瓦氏菌不擅于利用此种无机盐，而氯化钠组菌体密度显著高于其他各组，说明氯化钠最有利于腐败希瓦氏菌的生长。